Common name: Marmoset
Latin name: Callithrix jacchus
Genome assembly: C_jacchus3.2.1
All retrocopies: 3912
Parental genes: 1648

Summary: Number of retrocopies :
Conserved ORF: 886 ORF 3026 ORF
Expressed retrocopies (RNA-Seq): 553 RNA-Seq 3359 RNA-Seq
Expressed retrocopies (EST): 8 EST 3904 EST

# RetrogeneDB ID Identity Coverage ORF conservation Expression evidence
1. retro_cjac_1 85.23 % 97.31 % ORF EST RNA-Seq
2. retro_cjac_2 94.32 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
3. retro_cjac_3 100.00 % 92.36 % ORF EST RNA-Seq
4. retro_cjac_4 98.67 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
5. retro_cjac_5 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
6. retro_cjac_6 97.12 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
7. retro_cjac_7 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
8. retro_cjac_8 95.80 % 82.64 % ORF EST RNA-Seq
9. retro_cjac_9 98.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
10. retro_cjac_10 98.61 % 99.54 % ORF EST RNA-Seq
11. retro_cjac_11 78.44 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
12. retro_cjac_12 95.96 % 77.27 % ORF EST RNA-Seq
13. retro_cjac_13 88.61 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
14. retro_cjac_14 99.13 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
15. retro_cjac_15 91.59 % 95.54 % ORF EST RNA-Seq
16. retro_cjac_16 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
17. retro_cjac_17 50.96 % 65.61 % ORF EST RNA-Seq
18. retro_cjac_18 98.39 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
19. retro_cjac_19 98.10 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
20. retro_cjac_20 99.36 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
21. retro_cjac_21 96.59 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
22. retro_cjac_22 96.05 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
23. retro_cjac_23 79.03 % 89.86 % ORF EST RNA-Seq
24. retro_cjac_24 96.49 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
25. retro_cjac_25 59.15 % 91.61 % ORF EST RNA-Seq
26. retro_cjac_26 61.64 % 98.39 % ORF EST RNA-Seq
27. retro_cjac_27 83.51 % 99.23 % ORF EST RNA-Seq
28. retro_cjac_28 99.32 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
29. retro_cjac_29 98.11 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
30. retro_cjac_30 98.04 % 98.08 % ORF EST RNA-Seq
31. retro_cjac_31 71.85 % 96.33 % ORF EST RNA-Seq
32. retro_cjac_32 99.49 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
33. retro_cjac_33 90.91 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
34. retro_cjac_34 97.51 % 78.14 % ORF EST RNA-Seq
35. retro_cjac_35 54.68 % 75.75 % ORF EST RNA-Seq
36. retro_cjac_36 81.71 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
37. retro_cjac_37 80.41 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
38. retro_cjac_38 100.00 % 60.28 % ORF EST RNA-Seq
39. retro_cjac_39 99.56 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
40. retro_cjac_40 99.24 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
41. retro_cjac_41 96.38 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
42. retro_cjac_42 100.00 % 55.84 % ORF EST RNA-Seq
43. retro_cjac_43 89.22 % 98.24 % ORF EST RNA-Seq
44. retro_cjac_44 89.24 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
45. retro_cjac_45 97.09 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
46. retro_cjac_46 91.61 % 99.36 % ORF EST RNA-Seq
47. retro_cjac_47 80.53 % 99.71 % ORF EST RNA-Seq
48. retro_cjac_48 73.33 % 91.03 % ORF EST RNA-Seq
49. retro_cjac_49 86.74 % 99.25 % ORF EST RNA-Seq
50. retro_cjac_50 99.71 % 86.77 % ORF EST RNA-Seq
51. retro_cjac_51 90.00 % 79.37 % ORF EST RNA-Seq
52. retro_cjac_52 79.61 % 98.10 % ORF EST RNA-Seq
53. retro_cjac_53 90.37 % 90.85 % ORF EST RNA-Seq
54. retro_cjac_54 99.02 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
55. retro_cjac_55 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
56. retro_cjac_56 98.30 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
57. retro_cjac_57 91.14 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
58. retro_cjac_58 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
59. retro_cjac_59 99.20 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
60. retro_cjac_60 78.29 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
61. retro_cjac_61 99.07 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
62. retro_cjac_62 95.69 % 99.15 % ORF EST RNA-Seq
63. retro_cjac_63 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
64. retro_cjac_64 98.47 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
65. retro_cjac_65 99.14 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
66. retro_cjac_66 96.53 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
67. retro_cjac_67 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
68. retro_cjac_68 95.59 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
69. retro_cjac_69 94.17 % 98.10 % ORF EST RNA-Seq
70. retro_cjac_70 97.45 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
71. retro_cjac_71 99.16 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
72. retro_cjac_72 93.40 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
73. retro_cjac_73 91.19 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
74. retro_cjac_74 98.72 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
75. retro_cjac_75 99.28 % 97.54 % ORF EST RNA-Seq
76. retro_cjac_76 93.22 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
77. retro_cjac_77 82.54 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
78. retro_cjac_78 99.62 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
79. retro_cjac_79 91.40 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
80. retro_cjac_80 92.31 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
81. retro_cjac_81 89.06 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
82. retro_cjac_82 92.77 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
83. retro_cjac_83 93.16 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
84. retro_cjac_84 96.46 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
85. retro_cjac_85 90.09 % 94.87 % ORF EST RNA-Seq
86. retro_cjac_86 71.03 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
87. retro_cjac_87 94.44 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
88. retro_cjac_88 95.51 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
89. retro_cjac_89 91.33 % 99.34 % ORF EST RNA-Seq
90. retro_cjac_90 98.78 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
91. retro_cjac_91 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
92. retro_cjac_92 96.43 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
93. retro_cjac_93 97.64 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
94. retro_cjac_94 70.83 % 67.61 % ORF EST RNA-Seq
95. retro_cjac_95 95.83 % 75.47 % ORF EST RNA-Seq
96. retro_cjac_96 95.60 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
97. retro_cjac_97 98.48 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
98. retro_cjac_98 76.26 % 70.20 % ORF EST RNA-Seq
99. retro_cjac_99 83.62 % 99.15 % ORF EST RNA-Seq
100. retro_cjac_100 86.23 % 98.41 % ORF EST RNA-Seq
101. retro_cjac_101 76.40 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
102. retro_cjac_102 88.99 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
103. retro_cjac_103 97.92 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
104. retro_cjac_104 50.43 % 69.02 % ORF EST RNA-Seq
105. retro_cjac_105 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
106. retro_cjac_106 94.74 % 99.42 % ORF EST RNA-Seq
107. retro_cjac_107 79.38 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
108. retro_cjac_108 92.61 % 99.57 % ORF EST RNA-Seq
109. retro_cjac_109 90.18 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
110. retro_cjac_110 98.62 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
111. retro_cjac_111 95.88 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
112. retro_cjac_112 95.36 % 94.38 % ORF EST RNA-Seq
113. retro_cjac_113 95.95 % 98.67 % ORF EST RNA-Seq
114. retro_cjac_114 93.52 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
115. retro_cjac_115 96.31 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
116. retro_cjac_116 98.85 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
117. retro_cjac_117 97.76 % 90.46 % ORF EST RNA-Seq
118. retro_cjac_118 97.44 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
119. retro_cjac_119 88.97 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
120. retro_cjac_120 88.37 % 99.23 % ORF EST RNA-Seq
121. retro_cjac_121 82.55 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
122. retro_cjac_122 90.71 % 99.46 % ORF EST RNA-Seq
123. retro_cjac_123 99.17 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
124. retro_cjac_124 99.39 % 97.81 % ORF EST RNA-Seq
125. retro_cjac_125 88.61 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
126. retro_cjac_126 83.92 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
127. retro_cjac_127 75.06 % 91.31 % ORF EST RNA-Seq
128. retro_cjac_128 99.23 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
129. retro_cjac_129 97.74 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
130. retro_cjac_130 72.73 % 84.62 % ORF EST RNA-Seq
131. retro_cjac_131 99.49 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
132. retro_cjac_132 80.85 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
133. retro_cjac_133 97.17 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
134. retro_cjac_134 92.62 % 96.83 % ORF EST RNA-Seq
135. retro_cjac_135 82.64 % 90.57 % ORF EST RNA-Seq
136. retro_cjac_136 99.22 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
137. retro_cjac_137 86.81 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
138. retro_cjac_138 87.86 % 81.87 % ORF EST RNA-Seq
139. retro_cjac_139 98.13 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
140. retro_cjac_140 98.25 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
141. retro_cjac_141 94.74 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
142. retro_cjac_142 98.41 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
143. retro_cjac_143 75.00 % 96.55 % ORF EST RNA-Seq
144. retro_cjac_144 97.29 % 99.25 % ORF EST RNA-Seq
145. retro_cjac_145 99.26 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
146. retro_cjac_146 99.15 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
147. retro_cjac_147 95.73 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
148. retro_cjac_148 96.80 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
149. retro_cjac_149 96.05 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
150. retro_cjac_150 98.02 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
151. retro_cjac_151 73.61 % 99.31 % ORF EST RNA-Seq
152. retro_cjac_152 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
153. retro_cjac_153 97.34 % 98.05 % ORF EST RNA-Seq
154. retro_cjac_154 99.36 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
155. retro_cjac_155 91.04 % 60.09 % ORF EST RNA-Seq
156. retro_cjac_156 99.07 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
157. retro_cjac_157 99.43 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
158. retro_cjac_158 97.61 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
159. retro_cjac_159 97.80 % 98.91 % ORF EST RNA-Seq
160. retro_cjac_160 98.11 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
161. retro_cjac_161 79.41 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
162. retro_cjac_162 99.44 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
163. retro_cjac_163 98.70 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
164. retro_cjac_164 78.61 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
165. retro_cjac_165 98.36 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
166. retro_cjac_166 96.08 % 65.05 % ORF EST RNA-Seq
167. retro_cjac_167 96.34 % 97.81 % ORF EST RNA-Seq
168. retro_cjac_168 70.86 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
169. retro_cjac_169 97.94 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
170. retro_cjac_170 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
171. retro_cjac_171 91.94 % 91.18 % ORF EST RNA-Seq
172. retro_cjac_172 91.27 % 99.13 % ORF EST RNA-Seq
173. retro_cjac_173 93.43 % 95.65 % ORF EST RNA-Seq
174. retro_cjac_174 94.39 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
175. retro_cjac_175 97.40 % 91.30 % ORF EST RNA-Seq
176. retro_cjac_176 99.11 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
177. retro_cjac_177 97.47 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
178. retro_cjac_178 52.33 % 91.81 % ORF EST RNA-Seq
179. retro_cjac_179 64.38 % 98.17 % ORF EST RNA-Seq
180. retro_cjac_180 97.99 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
181. retro_cjac_181 98.08 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
182. retro_cjac_182 62.39 % 53.69 % ORF EST RNA-Seq
183. retro_cjac_183 88.16 % 65.79 % ORF EST RNA-Seq
184. retro_cjac_184 95.54 % 55.65 % ORF EST RNA-Seq
185. retro_cjac_185 95.93 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
186. retro_cjac_186 93.78 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
187. retro_cjac_187 95.44 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
188. retro_cjac_188 83.33 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
189. retro_cjac_189 90.34 % 95.83 % ORF EST RNA-Seq
190. retro_cjac_190 97.99 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
191. retro_cjac_191 95.77 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
192. retro_cjac_192 98.87 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
193. retro_cjac_193 75.97 % 99.03 % ORF EST RNA-Seq
194. retro_cjac_194 99.32 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
195. retro_cjac_195 82.54 % 91.30 % ORF EST RNA-Seq
196. retro_cjac_196 74.33 % 65.16 % ORF EST RNA-Seq
197. retro_cjac_197 97.89 % 69.95 % ORF EST RNA-Seq
198. retro_cjac_198 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
199. retro_cjac_199 99.62 % 99.62 % ORF EST RNA-Seq
200. retro_cjac_200 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
201. retro_cjac_201 98.53 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
202. retro_cjac_202 98.19 % 55.11 % ORF EST RNA-Seq
203. retro_cjac_203 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
204. retro_cjac_204 97.72 % 98.01 % ORF EST RNA-Seq
205. retro_cjac_205 96.30 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
206. retro_cjac_206 62.81 % 96.10 % ORF EST RNA-Seq
207. retro_cjac_207 89.06 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
208. retro_cjac_208 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
209. retro_cjac_209 90.29 % 99.04 % ORF EST RNA-Seq
210. retro_cjac_210 62.80 % 77.25 % ORF EST RNA-Seq
211. retro_cjac_211 98.65 % 99.33 % ORF EST RNA-Seq
212. retro_cjac_212 98.39 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
213. retro_cjac_213 59.89 % 58.38 % ORF EST RNA-Seq
214. retro_cjac_214 73.70 % 55.05 % ORF EST RNA-Seq
215. retro_cjac_215 98.18 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
216. retro_cjac_216 98.17 % 97.81 % ORF EST RNA-Seq
217. retro_cjac_217 88.97 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
218. retro_cjac_218 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
219. retro_cjac_219 98.03 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
220. retro_cjac_220 98.98 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
221. retro_cjac_221 92.18 % 92.75 % ORF EST RNA-Seq
222. retro_cjac_222 99.12 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
223. retro_cjac_223 94.74 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
224. retro_cjac_224 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
225. retro_cjac_225 99.26 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
226. retro_cjac_226 89.70 % 95.93 % ORF EST RNA-Seq
227. retro_cjac_227 78.21 % 97.71 % ORF EST RNA-Seq
228. retro_cjac_228 100.00 % 98.57 % ORF EST RNA-Seq
229. retro_cjac_229 99.36 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
230. retro_cjac_230 97.18 % 96.72 % ORF EST RNA-Seq
231. retro_cjac_231 90.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
232. retro_cjac_232 59.56 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
233. retro_cjac_233 91.21 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
234. retro_cjac_234 86.75 % 57.64 % ORF EST RNA-Seq
235. retro_cjac_235 98.53 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
236. retro_cjac_236 99.44 % 99.62 % ORF EST RNA-Seq
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