Common name: Mouse
Latin name: Mus musculus
Genome assembly: GRCm38
All retrocopies: 4148
Parental genes: 1307

Summary: Number of retrocopies :
Conserved ORF: 1200 ORF 2948 ORF
Expressed retrocopies (RNA-Seq): 423 RNA-Seq 3725 RNA-Seq
Expressed retrocopies (EST): 113 EST 4035 EST
ChIP-Seq validated retrocopies: 140 ChIP-Seq 4008 ChIP-Seq
TSS validated retrocopies: 796 TSS 3352 TSS
Experimentally validated retrocopies: 11 Lab 4137 Lab

# RetrogeneDB ID Identity Coverage ORF conservation Expression evidence
1. retro_mmus_1 80.13 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
2. retro_mmus_2 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
3. retro_mmus_3 95.58 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
4. retro_mmus_4 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
5. retro_mmus_5 98.18 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
6. retro_mmus_6 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
7. retro_mmus_7 98.25 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
8. retro_mmus_8 93.97 % 97.55 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
9. retro_mmus_9 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
10. retro_mmus_10 99.78 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
11. retro_mmus_11 93.56 % 99.52 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
12. retro_mmus_12 74.64 % 69.70 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
13. retro_mmus_13 70.49 % 93.13 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
14. retro_mmus_14 99.68 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
15. retro_mmus_15 93.50 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
16. retro_mmus_16 72.93 % 87.02 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
17. retro_mmus_17 91.45 % 73.12 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
18. retro_mmus_18 100.00 % 99.62 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
19. retro_mmus_19 95.28 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
20. retro_mmus_20 92.61 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
21. retro_mmus_21 99.19 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
22. retro_mmus_22 63.50 % 76.95 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
23. retro_mmus_23 93.07 % 98.30 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
24. retro_mmus_24 99.84 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
25. retro_mmus_25 95.26 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
26. retro_mmus_26 86.72 % 96.44 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
27. retro_mmus_27 92.52 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
28. retro_mmus_28 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
29. retro_mmus_29 83.69 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
30. retro_mmus_30 75.66 % 99.32 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
31. retro_mmus_31 98.44 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
32. retro_mmus_32 77.06 % 96.40 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
33. retro_mmus_33 99.69 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
34. retro_mmus_34 99.25 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
35. retro_mmus_35 95.41 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
36. retro_mmus_36 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
37. retro_mmus_37 85.85 % 87.01 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
38. retro_mmus_38 98.10 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
39. retro_mmus_39 68.37 % 94.23 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
40. retro_mmus_40 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
41. retro_mmus_41 94.63 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
42. retro_mmus_42 93.08 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
43. retro_mmus_43 87.97 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
44. retro_mmus_44 64.51 % 78.75 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
45. retro_mmus_45 82.56 % 94.51 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
46. retro_mmus_46 95.12 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
47. retro_mmus_47 99.70 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
48. retro_mmus_48 99.40 % 92.76 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
49. retro_mmus_49 73.16 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
50. retro_mmus_50 87.25 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
51. retro_mmus_51 69.31 % 98.93 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
52. retro_mmus_52 98.34 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
53. retro_mmus_53 98.44 % 98.97 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
54. retro_mmus_54 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
55. retro_mmus_55 83.00 % 88.29 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
56. retro_mmus_56 91.75 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
57. retro_mmus_57 98.68 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
58. retro_mmus_58 84.48 % 98.31 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
59. retro_mmus_59 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
60. retro_mmus_60 99.44 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
61. retro_mmus_61 89.33 % 80.21 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
62. retro_mmus_62 89.60 % 98.68 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
63. retro_mmus_63 76.73 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
64. retro_mmus_64 87.42 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
65. retro_mmus_65 98.50 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
66. retro_mmus_66 99.30 % 94.08 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
67. retro_mmus_67 76.67 % 67.42 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
68. retro_mmus_68 76.12 % 57.02 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
69. retro_mmus_69 93.92 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
70. retro_mmus_70 96.11 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
71. retro_mmus_71 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
72. retro_mmus_72 60.22 % 78.13 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
73. retro_mmus_73 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
74. retro_mmus_74 96.17 % 74.87 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
75. retro_mmus_75 74.34 % 88.04 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
76. retro_mmus_76 96.13 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
77. retro_mmus_77 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
78. retro_mmus_78 99.44 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
79. retro_mmus_79 54.36 % 91.99 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
80. retro_mmus_80 67.77 % 88.81 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
81. retro_mmus_81 91.35 % 54.17 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
82. retro_mmus_82 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
83. retro_mmus_83 73.71 % 66.67 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
84. retro_mmus_84 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
85. retro_mmus_85 62.68 % 55.85 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
86. retro_mmus_86 88.44 % 89.38 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
87. retro_mmus_87 88.39 % 98.73 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
88. retro_mmus_88 99.32 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
89. retro_mmus_89 79.37 % 96.02 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
90. retro_mmus_90 94.78 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
91. retro_mmus_91 98.55 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
92. retro_mmus_92 93.49 % 99.24 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
93. retro_mmus_93 98.12 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
94. retro_mmus_94 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
95. retro_mmus_95 63.64 % 63.46 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
96. retro_mmus_96 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
97. retro_mmus_97 82.88 % 99.28 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
98. retro_mmus_98 97.26 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
99. retro_mmus_99 70.18 % 96.61 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
100. retro_mmus_100 95.73 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
101. retro_mmus_101 96.00 % 97.66 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
102. retro_mmus_102 80.35 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
103. retro_mmus_103 79.06 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
104. retro_mmus_104 71.24 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
105. retro_mmus_105 90.00 % 98.04 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
106. retro_mmus_106 68.61 % 80.55 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
107. retro_mmus_107 81.40 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
108. retro_mmus_108 57.14 % 70.60 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
109. retro_mmus_109 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
110. retro_mmus_110 99.29 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
111. retro_mmus_111 65.00 % 81.22 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
112. retro_mmus_112 75.22 % 87.79 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
113. retro_mmus_113 68.31 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
114. retro_mmus_114 99.23 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
115. retro_mmus_115 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
116. retro_mmus_116 96.04 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
117. retro_mmus_117 58.52 % 94.12 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
118. retro_mmus_118 99.51 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
119. retro_mmus_119 83.64 % 99.46 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
120. retro_mmus_120 98.12 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
121. retro_mmus_121 89.23 % 94.44 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
122. retro_mmus_122 71.43 % 99.12 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
123. retro_mmus_123 98.04 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
124. retro_mmus_124 78.10 % 93.79 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
125. retro_mmus_125 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
126. retro_mmus_126 91.03 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
127. retro_mmus_127 85.98 % 90.68 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
128. retro_mmus_128 64.86 % 85.60 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
129. retro_mmus_129 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
130. retro_mmus_130 99.36 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
131. retro_mmus_131 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
132. retro_mmus_132 81.79 % 93.71 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
133. retro_mmus_133 96.36 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
134. retro_mmus_134 69.83 % 91.09 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
135. retro_mmus_135 99.51 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
136. retro_mmus_136 94.36 % 92.76 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
137. retro_mmus_137 97.70 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
138. retro_mmus_138 79.14 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
139. retro_mmus_139 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
140. retro_mmus_140 97.95 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
141. retro_mmus_141 96.18 % 98.50 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
142. retro_mmus_142 95.55 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
143. retro_mmus_143 99.05 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
144. retro_mmus_144 96.07 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
145. retro_mmus_145 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
146. retro_mmus_146 98.88 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
147. retro_mmus_147 69.54 % 96.13 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
148. retro_mmus_148 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
149. retro_mmus_149 88.48 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
150. retro_mmus_150 87.80 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
151. retro_mmus_151 93.20 % 98.10 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
152. retro_mmus_152 99.07 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
153. retro_mmus_153 99.38 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
154. retro_mmus_154 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
155. retro_mmus_155 85.86 % 89.74 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
156. retro_mmus_156 70.93 % 99.21 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
157. retro_mmus_157 63.05 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
158. retro_mmus_158 98.20 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
159. retro_mmus_159 97.43 % 72.73 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
160. retro_mmus_160 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
161. retro_mmus_161 75.59 % 99.20 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
162. retro_mmus_162 82.50 % 87.59 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
163. retro_mmus_163 72.27 % 96.33 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
164. retro_mmus_164 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
165. retro_mmus_165 99.62 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
166. retro_mmus_166 92.13 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
167. retro_mmus_167 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
168. retro_mmus_168 90.06 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
169. retro_mmus_169 65.99 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
170. retro_mmus_170 75.13 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
171. retro_mmus_171 59.68 % 67.95 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
172. retro_mmus_172 89.59 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
173. retro_mmus_173 99.65 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
174. retro_mmus_174 92.20 % 99.61 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
175. retro_mmus_175 99.25 % 71.89 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
176. retro_mmus_176 86.51 % 59.39 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
177. retro_mmus_177 95.28 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
178. retro_mmus_178 85.34 % 98.96 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
179. retro_mmus_179 67.61 % 99.30 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
180. retro_mmus_180 87.83 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
181. retro_mmus_181 86.16 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
182. retro_mmus_182 93.98 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
183. retro_mmus_183 58.16 % 89.76 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
184. retro_mmus_184 99.36 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
185. retro_mmus_185 51.80 % 95.87 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
186. retro_mmus_186 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
187. retro_mmus_187 96.42 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
188. retro_mmus_188 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
189. retro_mmus_189 86.21 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
190. retro_mmus_190 70.00 % 60.39 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
191. retro_mmus_191 83.85 % 99.48 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
192. retro_mmus_192 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
193. retro_mmus_193 98.06 % 98.10 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
194. retro_mmus_194 50.50 % 70.58 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
195. retro_mmus_195 50.63 % 97.50 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
196. retro_mmus_196 82.93 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
197. retro_mmus_197 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
198. retro_mmus_198 95.71 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
199. retro_mmus_199 57.14 % 85.71 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
200. retro_mmus_200 51.76 % 80.30 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
201. retro_mmus_201 80.91 % 59.78 % ORF EST RNA-Seq ChIP-Seq TSS Lab
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