Parental gene:

ENSCJAG00000035420

Aliases:None
Description:None
Organism:Marmoset (Callithrix jacchus)
Coordinates:15:25009265..25026105(+)


>ENSCJAG00000035420
TTTTTTGAGAAGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGAGTGCTGGAGTGCAGTGGGGCCATCTCAGCTCACTGCGATCT
TTGCCGCCCAGGTTCAAATTATTCTCCTGCCTCAGCCTGCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCACCCACCATGGCACCCAAC
TACTTTTTTGTACTTTAGTAAAGATGGGTTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTTCTGACCTCAGCTGATCCG
CCCACCTCAGCCTCCCAAATGGTGGGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCCCAGCCATTTTTGTATTTTGTATTTTTAGT
AGAGGCGGGGTTTTTCCATGTTGATCAGGCGGGTCTCAAACTCCCAACCTCAGGTAATCCGCCAACCTCAGCCTCCCAAA
GTGCAGGGATTACAGGTGTGAGCCAC

Library Parental gene expression (RPM)
SRP051959_spleen 0 .74 RPM
SRP051959_skeletal_muscle 0 .24 RPM
SRP051959_lymph_node 1 .10 RPM
SRP051959_lung 0 .60 RPM
SRP051959_liver 0 .32 RPM
SRP051959_kidney 0 .51 RPM
SRP051959_heart 0 .40 RPM
SRP051959_colon 0 .55 RPM



Species Parental gene accession Homology type Retrogenes number
Callithrix jacchus ENSCJAG00000008153 within_species_paralog 10 retrogenes
retro_cjac_3418, retro_cjac_3455, retro_cjac_3485, retro_cjac_3512, retro_cjac_3661, retro_cjac_3690, retro_cjac_3761, retro_cjac_3768, retro_cjac_3792, retro_cjac_3794,
Callithrix jacchus ENSCJAG00000018676 within_species_paralog 1 retrogene
retro_cjac_3468,
Callithrix jacchus ENSCJAG00000031577 within_species_paralog 1 retrogene
retro_cjac_3697,
Callithrix jacchus ENSCJAG00000031826 within_species_paralog 24 retrogenes
retro_cjac_3352, retro_cjac_3353, retro_cjac_3357, retro_cjac_3370, retro_cjac_3379, retro_cjac_3384, retro_cjac_3388, retro_cjac_3480, retro_cjac_3493, retro_cjac_3511, retro_cjac_3513, retro_cjac_3517, retro_cjac_3557, retro_cjac_3560, retro_cjac_3567, retro_cjac_3582, retro_cjac_3605, retro_cjac_3634, retro_cjac_3643, retro_cjac_3681, retro_cjac_3729, retro_cjac_3751, retro_cjac_3759, retro_cjac_3784,
Callithrix jacchus ENSCJAG00000032572 within_species_paralog 2 retrogenes
retro_cjac_3443, retro_cjac_3779,
Callithrix jacchus ENSCJAG00000033038 within_species_paralog 1 retrogene
retro_cjac_3439,
Callithrix jacchus ENSCJAG00000035758 within_species_paralog 34 retrogenes
retro_cjac_286, retro_cjac_3341, retro_cjac_3380, retro_cjac_3385, retro_cjac_3409, retro_cjac_3426, retro_cjac_3427, retro_cjac_3444, retro_cjac_3448, retro_cjac_3450, retro_cjac_3494, retro_cjac_3510, retro_cjac_3533, retro_cjac_3534, retro_cjac_3552, retro_cjac_3562, retro_cjac_3579, retro_cjac_3629, retro_cjac_3632, retro_cjac_3650, retro_cjac_3673, retro_cjac_3683, retro_cjac_3695, retro_cjac_3702, retro_cjac_3716, retro_cjac_3738, retro_cjac_3748, retro_cjac_3749, retro_cjac_3752, retro_cjac_3758, retro_cjac_3769, retro_cjac_3773, retro_cjac_3785, retro_cjac_3797,
Callithrix jacchus ENSCJAG00000036542 within_species_paralog 13 retrogenes
retro_cjac_3360, retro_cjac_3431, retro_cjac_3440, retro_cjac_3459, retro_cjac_3538, retro_cjac_3558, retro_cjac_3576, retro_cjac_3615, retro_cjac_3636, retro_cjac_3665, retro_cjac_3691, retro_cjac_3721, retro_cjac_3803,
Callithrix jacchus ENSCJAG00000037288 within_species_paralog 16 retrogenes
retro_cjac_3393, retro_cjac_3447, retro_cjac_3475, retro_cjac_3499, retro_cjac_3518, retro_cjac_3519, retro_cjac_3535, retro_cjac_3561, retro_cjac_3603, retro_cjac_3662, retro_cjac_3667, retro_cjac_3703, retro_cjac_3710, retro_cjac_3715, retro_cjac_3727, retro_cjac_3793,
Callithrix jacchus ENSCJAG00000037961 within_species_paralog 5 retrogenes
retro_cjac_3573, retro_cjac_3711, retro_cjac_3723, retro_cjac_3766, retro_cjac_3778,

# RetrogeneDB ID Identity (%) Coverage (%) ORF conservation Expression evidence RDV
1. retro_cjac_3386 65.66 69.72
Please wait, loading
Please wait, loading
Please wait, loading
2. retro_cjac_3407 60.00 59.15
Please wait, loading
Please wait, loading
Please wait, loading
3. retro_cjac_3449 61.90 72.54
Please wait, loading
Please wait, loading
Please wait, loading
4. retro_cjac_3457 56.38 64.08
Please wait, loading
Please wait, loading
Please wait, loading
5. retro_cjac_3509 61.07 90.14
Please wait, loading
Please wait, loading
Please wait, loading
6. retro_cjac_3531 66.04 72.54
Please wait, loading
Please wait, loading
Please wait, loading
7. retro_cjac_3580 58.14 90.14
Please wait, loading
Please wait, loading
Please wait, loading
8. retro_cjac_3594 57.45 64.79
Please wait, loading
Please wait, loading
Please wait, loading
9. retro_cjac_3635 58.99 95.07
Please wait, loading
Please wait, loading
Please wait, loading
10. retro_cjac_3645 56.38 64.08
Please wait, loading
Please wait, loading
Please wait, loading
11. retro_cjac_3652 64.56 55.63
Please wait, loading
Please wait, loading
Please wait, loading
12. retro_cjac_3657 56.32 60.56
Please wait, loading
Please wait, loading
Please wait, loading
13. retro_cjac_3685 53.06 67.61
Please wait, loading
Please wait, loading
Please wait, loading
14. retro_cjac_3755 55.22 92.25
Please wait, loading
Please wait, loading
Please wait, loading
15. retro_cjac_3760 56.00 86.62
Please wait, loading
Please wait, loading
Please wait, loading
16. retro_cjac_3804 61.96 63.38
Please wait, loading
Please wait, loading
Please wait, loading
Download FASTA sequences of all ENSCJAG00000035420 retrocopies