Parental gene: | DLD, ENSSTOG00000007445 |
| Aliases: | None |
| Description: | dihydrolipoamide dehydrogenase [Source:HGNC Symbol;Acc:2898] |
| Organism: | Squirrel (Ictidomys tridecemlineatus) |
| Coordinates: | JH393289.1:16248123..16271481(-) |
>ENSSTOG00000007445
ATGCAGAGTTGGAGTCGTGTGTACTGCTCCTTGGCCAAGAGAGGCCATTTCAATCGAATATGCCATGGCCTACAGGGAGT
TTCTGCAGTGCCTCTGAGAACTTATGCTGATCAGTCAATTGATGCTGATATAACAGTGATAGGTTCTGGTCCTGGAGGAT
ATGTTGCTGCCATTAAAGCTGCCCAGTTAGGCTTTAAGACAGTGTGCATTGAGAAAAATGAAACACTTGGTGGAACTTGC
TTGAATGTTGGTTGTATTCCTTCTAAGGCTTTGTTGAATAATTCTCACTATTACCATATGGCCCATGGAAAAGATTTTGC
ATCTCGGGGAATTGAAATGTCTGAAGTTCGTTTGAATTTAGAGAAGATGATGGAGCAGAAGAGTACTGCAGTAAAAGCTT
TAACAGGTGGAATTGCCCACTTATTCAAGCAAAATAAGGTTGTTCACGTCAATGGATATGGAAAGATAACTGGCAAGAAT
CAGGTCACAGCTACGAAAGCCGATGGCAGCACTCAGGTTGTTGATACAAAGAACATTCTTATAGCTACAGGTTCAGAAGT
TACTCCTTTTCCTGGAATCACGATTGATGAAGATACAATAGTGTCATCTACAGGTGCTTTATCTTTAAAAAAAGTTCCAG
AAAAGATGGTTGTTATTGGTGCAGGAGTAATTGGTGTAGAATTGGGTTCAGTTTGGCAACGACTAGGTGCAGATGTGACA
GCAGTTGAATTTTTGGGTCATGTTGGTGGAGTCGGAATTGATATGGAGGTATCTAAAAACTTTCAACGCATCCTTCAAAA
GCAAGGATTTAAATTTAAATTGAATACAAAGGTTACTGGTGCTACCAAAAAGTCAGATGGAAAAATTGATGTTTCTATTG
AAGCTGCTTCTGGTGGTAAAGCTGAAGTTATCACTTGTGATGTACTCTTGGTTTGCATTGGTCGACGACCCTTTACTCAG
AATTTGGGACTAGAAGATCTTGGAATTGAATTAGATCCTAGAGGTAGAATTCCAGTCAATACCAGATTCCAAACAAAAAT
ACCAAATATCTATGCTATTGGTGATGTGGTTGCTGGTCCAATGCTGGCTCACAAAGCAGAGGATGAAGGCATTATCTGTG
TTGAAGGAATAGCTGGTGGTGCTGTGCACATTGACTACAATTGCGTTCCATCAGTGATTTACACACACCCCGAAGTTGCT
TGGGTTGGCAAGTCTGAAGAGCAGTTGAAGGAAGAGGGTATTGAGTATAAAGTTGGAAAATTTCCCTTTGCTGCTAATAG
CAGAGCTAAGACAAATGCTGACACAGATGGCATGGTGAAGATTCTTGGGCAGAAATCAACAGACCGAGTACTGGGAGCAC
ATATTCTAGGACCAGGTGCTGGAGAAATGGTAAATGAAGCTGCTCTGGCTTTGGAATATGGAGCCTCCTGTGAAGATATA
GCTAGAGTCTGCCATGCACATCCGACCTTATCAGAAGCTTTAGAGAAGCAAACCTGGCTGCATCATTTGGCAAATCAATC
AATTTTT
ATGCAGAGTTGGAGTCGTGTGTACTGCTCCTTGGCCAAGAGAGGCCATTTCAATCGAATATGCCATGGCCTACAGGGAGT
TTCTGCAGTGCCTCTGAGAACTTATGCTGATCAGTCAATTGATGCTGATATAACAGTGATAGGTTCTGGTCCTGGAGGAT
ATGTTGCTGCCATTAAAGCTGCCCAGTTAGGCTTTAAGACAGTGTGCATTGAGAAAAATGAAACACTTGGTGGAACTTGC
TTGAATGTTGGTTGTATTCCTTCTAAGGCTTTGTTGAATAATTCTCACTATTACCATATGGCCCATGGAAAAGATTTTGC
ATCTCGGGGAATTGAAATGTCTGAAGTTCGTTTGAATTTAGAGAAGATGATGGAGCAGAAGAGTACTGCAGTAAAAGCTT
TAACAGGTGGAATTGCCCACTTATTCAAGCAAAATAAGGTTGTTCACGTCAATGGATATGGAAAGATAACTGGCAAGAAT
CAGGTCACAGCTACGAAAGCCGATGGCAGCACTCAGGTTGTTGATACAAAGAACATTCTTATAGCTACAGGTTCAGAAGT
TACTCCTTTTCCTGGAATCACGATTGATGAAGATACAATAGTGTCATCTACAGGTGCTTTATCTTTAAAAAAAGTTCCAG
AAAAGATGGTTGTTATTGGTGCAGGAGTAATTGGTGTAGAATTGGGTTCAGTTTGGCAACGACTAGGTGCAGATGTGACA
GCAGTTGAATTTTTGGGTCATGTTGGTGGAGTCGGAATTGATATGGAGGTATCTAAAAACTTTCAACGCATCCTTCAAAA
GCAAGGATTTAAATTTAAATTGAATACAAAGGTTACTGGTGCTACCAAAAAGTCAGATGGAAAAATTGATGTTTCTATTG
AAGCTGCTTCTGGTGGTAAAGCTGAAGTTATCACTTGTGATGTACTCTTGGTTTGCATTGGTCGACGACCCTTTACTCAG
AATTTGGGACTAGAAGATCTTGGAATTGAATTAGATCCTAGAGGTAGAATTCCAGTCAATACCAGATTCCAAACAAAAAT
ACCAAATATCTATGCTATTGGTGATGTGGTTGCTGGTCCAATGCTGGCTCACAAAGCAGAGGATGAAGGCATTATCTGTG
TTGAAGGAATAGCTGGTGGTGCTGTGCACATTGACTACAATTGCGTTCCATCAGTGATTTACACACACCCCGAAGTTGCT
TGGGTTGGCAAGTCTGAAGAGCAGTTGAAGGAAGAGGGTATTGAGTATAAAGTTGGAAAATTTCCCTTTGCTGCTAATAG
CAGAGCTAAGACAAATGCTGACACAGATGGCATGGTGAAGATTCTTGGGCAGAAATCAACAGACCGAGTACTGGGAGCAC
ATATTCTAGGACCAGGTGCTGGAGAAATGGTAAATGAAGCTGCTCTGGCTTTGGAATATGGAGCCTCCTGTGAAGATATA
GCTAGAGTCTGCCATGCACATCCGACCTTATCAGAAGCTTTAGAGAAGCAAACCTGGCTGCATCATTTGGCAAATCAATC
AATTTTT
| Species | Parental gene accession | Homology type | Retrogenes number | |
|---|---|---|---|---|
| Cavia porcellus | ENSCPOG00000005312 | ortholog_one2one | 1 retrogene | |
| Monodelphis domestica | ENSMODG00000016316 | ortholog_one2one | 2 retrogenes | |
| Oryctolagus cuniculus | ENSOCUG00000014667 | ortholog_one2one | 1 retrogene | |
| Tursiops truncatus | ENSTTRG00000003989 | ortholog_one2one | 1 retrogene |
| # | RetrogeneDB ID | Identity (%) | Coverage (%) | ORF conservation | Expression evidence | RDV |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. | retro_itri_1226 | 76.05 | 50.88 | Please wait, loading  | Please wait, loading | Please wait, loading |
Download FASTA sequences of all ENSSTOG00000007445 retrocopies