RetrogeneDB - Browse organism: Rat, Rattus norvegicus

Common name:	Rat
Latin name:	Rattus norvegicus
Genome assembly:	Rnor_5.0
All retrocopies:	2826
Parental genes:	1176

Summary:	Number of retrocopies :
Conserved ORF:	769 ORF	2057 ORF
Expressed retrocopies (RNA-Seq):	179 RNA-Seq	2647 RNA-Seq
Expressed retrocopies (EST):	52 EST	2774 EST

#	RetrogeneDB ID	Identity	Coverage	ORF conservation	Expression evidence
1.	retro_rnor_1	89.19 %	96.52 %	ORF	EST RNA-Seq
2.	retro_rnor_2	97.76 %	90.46 %	ORF	EST RNA-Seq
3.	retro_rnor_3	84.41 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
4.	retro_rnor_4	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
5.	retro_rnor_5	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
6.	retro_rnor_6	88.57 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
7.	retro_rnor_7	97.39 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
8.	retro_rnor_8	88.29 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
9.	retro_rnor_9	77.56 %	97.85 %	ORF	EST RNA-Seq
10.	retro_rnor_10	88.64 %	90.41 %	ORF	EST RNA-Seq
11.	retro_rnor_11	99.06 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
12.	retro_rnor_12	94.03 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
13.	retro_rnor_13	98.47 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
14.	retro_rnor_14	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
15.	retro_rnor_15	92.83 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
16.	retro_rnor_16	93.42 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
17.	retro_rnor_17	98.10 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
18.	retro_rnor_18	89.40 %	99.67 %	ORF	EST RNA-Seq
19.	retro_rnor_19	88.15 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
20.	retro_rnor_20	56.32 %	97.20 %	ORF	EST RNA-Seq
21.	retro_rnor_21	91.57 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
22.	retro_rnor_22	96.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
23.	retro_rnor_23	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
24.	retro_rnor_24	98.61 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
25.	retro_rnor_25	69.82 %	88.95 %	ORF	EST RNA-Seq
26.	retro_rnor_26	82.46 %	99.63 %	ORF	EST RNA-Seq
27.	retro_rnor_27	91.11 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
28.	retro_rnor_28	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
29.	retro_rnor_29	98.68 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
30.	retro_rnor_30	81.25 %	90.72 %	ORF	EST RNA-Seq
31.	retro_rnor_31	66.97 %	93.91 %	ORF	EST RNA-Seq
32.	retro_rnor_32	98.54 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
33.	retro_rnor_33	98.25 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
34.	retro_rnor_34	84.07 %	99.43 %	ORF	EST RNA-Seq
35.	retro_rnor_35	97.44 %	99.15 %	ORF	EST RNA-Seq
36.	retro_rnor_36	90.32 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
37.	retro_rnor_37	89.42 %	95.85 %	ORF	EST RNA-Seq
38.	retro_rnor_38	94.16 %	95.65 %	ORF	EST RNA-Seq
39.	retro_rnor_39	85.05 %	55.15 %	ORF	EST RNA-Seq
40.	retro_rnor_40	98.72 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
41.	retro_rnor_41	75.84 %	99.32 %	ORF	EST RNA-Seq
42.	retro_rnor_42	99.81 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
43.	retro_rnor_43	97.70 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
44.	retro_rnor_44	95.93 %	90.44 %	ORF	EST RNA-Seq
45.	retro_rnor_45	87.61 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
46.	retro_rnor_46	79.68 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
47.	retro_rnor_47	70.44 %	63.64 %	ORF	EST RNA-Seq
48.	retro_rnor_48	93.88 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
49.	retro_rnor_49	97.51 %	95.26 %	ORF	EST RNA-Seq
50.	retro_rnor_50	93.57 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
51.	retro_rnor_51	99.31 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
52.	retro_rnor_52	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
53.	retro_rnor_53	94.21 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
54.	retro_rnor_54	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
55.	retro_rnor_55	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
56.	retro_rnor_56	99.58 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
57.	retro_rnor_57	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
58.	retro_rnor_58	99.16 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq