Common name: Barley
Latin name: Hordeum vulgare
Genome assembly: 082214v1
All retrocopies: 96
Parental genes: 81

Summary: Number of retrocopies :
Conserved ORF: 83 ORF 13 ORF

# RetrogeneDB ID Identity Coverage ORF conservation
1. retro_hvul_1 80.28 % 74.59 % ORF
2. retro_hvul_2 81.13 % 100.00 % ORF
3. retro_hvul_3 57.26 % 86.73 % ORF
4. retro_hvul_4 79.72 % 97.45 % ORF
5. retro_hvul_5 63.70 % 69.07 % ORF
6. retro_hvul_6 54.57 % 66.72 % ORF
7. retro_hvul_7 95.34 % 100.00 % ORF
8. retro_hvul_8 89.92 % 100.00 % ORF
9. retro_hvul_9 55.03 % 76.85 % ORF
10. retro_hvul_10 71.00 % 82.43 % ORF
11. retro_hvul_11 51.33 % 78.72 % ORF
12. retro_hvul_12 63.90 % 99.05 % ORF
13. retro_hvul_13 72.42 % 99.76 % ORF
14. retro_hvul_14 67.24 % 95.59 % ORF
15. retro_hvul_15 69.00 % 56.88 % ORF
16. retro_hvul_16 67.27 % 55.00 % ORF
17. retro_hvul_17 61.44 % 50.67 % ORF
18. retro_hvul_18 54.17 % 54.27 % ORF
19. retro_hvul_19 52.63 % 52.52 % ORF
20. retro_hvul_20 55.00 % 94.55 % ORF
21. retro_hvul_21 53.83 % 94.63 % ORF
22. retro_hvul_22 56.02 % 89.08 % ORF
23. retro_hvul_23 65.12 % 93.15 % ORF
24. retro_hvul_24 72.38 % 99.55 % ORF
25. retro_hvul_25 65.09 % 92.17 % ORF
26. retro_hvul_26 86.81 % 83.26 % ORF
27. retro_hvul_27 54.01 % 97.83 % ORF
28. retro_hvul_28 57.55 % 85.28 % ORF
29. retro_hvul_29 62.50 % 86.72 % ORF
30. retro_hvul_30 57.60 % 91.06 % ORF
31. retro_hvul_31 54.79 % 69.52 % ORF
32. retro_hvul_32 64.66 % 63.39 % ORF
33. retro_hvul_33 82.10 % 99.24 % ORF
34. retro_hvul_34 58.88 % 65.44 % ORF
35. retro_hvul_35 65.89 % 92.87 % ORF
36. retro_hvul_36 72.77 % 97.09 % ORF
37. retro_hvul_37 81.82 % 91.16 % ORF
38. retro_hvul_38 93.24 % 99.20 % ORF
39. retro_hvul_39 54.61 % 68.87 % ORF
40. retro_hvul_40 96.56 % 78.91 % ORF
41. retro_hvul_41 83.48 % 83.10 % ORF
42. retro_hvul_42 79.02 % 81.27 % ORF
43. retro_hvul_43 83.23 % 63.12 % ORF
44. retro_hvul_45 54.95 % 63.46 % ORF
45. retro_hvul_46 59.46 % 57.64 % ORF
46. retro_hvul_47 55.00 % 58.25 % ORF
47. retro_hvul_48 54.08 % 56.07 % ORF
48. retro_hvul_49 59.33 % 83.94 % ORF
49. retro_hvul_50 50.18 % 76.01 % ORF
50. retro_hvul_51 86.21 % 90.83 % ORF
51. retro_hvul_52 56.25 % 56.18 % ORF
52. retro_hvul_55 69.11 % 85.28 % ORF
53. retro_hvul_56 69.74 % 84.56 % ORF
54. retro_hvul_57 58.19 % 77.96 % ORF
55. retro_hvul_58 71.29 % 65.47 % ORF
56. retro_hvul_59 84.95 % 66.45 % ORF
57. retro_hvul_61 54.21 % 73.43 % ORF
58. retro_hvul_62 50.47 % 73.43 % ORF
59. retro_hvul_63 72.87 % 73.70 % ORF
60. retro_hvul_65 57.04 % 80.30 % ORF
61. retro_hvul_66 61.03 % 95.56 % ORF
62. retro_hvul_68 56.92 % 52.88 % ORF
63. retro_hvul_69 54.40 % 62.85 % ORF
64. retro_hvul_70 78.28 % 70.13 % ORF
65. retro_hvul_71 58.03 % 83.77 % ORF
66. retro_hvul_72 87.59 % 52.77 % ORF
67. retro_hvul_73 61.54 % 91.18 % ORF
68. retro_hvul_74 58.86 % 71.49 % ORF
69. retro_hvul_75 66.87 % 54.36 % ORF
70. retro_hvul_76 76.36 % 100.00 % ORF
71. retro_hvul_77 56.67 % 58.25 % ORF
72. retro_hvul_78 70.44 % 71.95 % ORF
73. retro_hvul_79 73.12 % 71.95 % ORF
74. retro_hvul_80 74.95 % 93.74 % ORF
75. retro_hvul_81 71.70 % 69.80 % ORF
76. retro_hvul_82 62.08 % 63.54 % ORF
77. retro_hvul_83 81.25 % 69.13 % ORF
78. retro_hvul_85 54.22 % 91.01 % ORF
79. retro_hvul_86 70.81 % 95.34 % ORF
80. retro_hvul_87 70.10 % 100.00 % ORF
81. retro_hvul_88 81.93 % 76.83 % ORF
82. retro_hvul_89 50.55 % 98.88 % ORF
83. retro_hvul_90 54.26 % 77.75 % ORF
84. retro_hvul_91 62.50 % 83.97 % ORF
85. retro_hvul_92 59.46 % 67.48 % ORF
86. retro_hvul_93 80.37 % 65.59 % ORF
87. retro_hvul_94 71.13 % 50.45 % ORF
88. retro_hvul_95 70.21 % 62.67 % ORF
89. retro_hvul_96 59.47 % 65.59 % ORF
90. retro_hvul_97 61.25 % 88.76 % ORF
91. retro_hvul_98 66.29 % 75.21 % ORF
92. retro_hvul_99 51.88 % 78.75 % ORF
93. retro_hvul_100 53.94 % 89.40 % ORF
94. retro_hvul_101 89.82 % 63.12 % ORF
95. retro_hvul_102 89.82 % 63.12 % ORF
96. retro_hvul_103 71.64 % 56.37 % ORF
# Ensembl ID Symbol Description
1. MLOC_10092
2. MLOC_34672
3. MLOC_14907
4. MLOC_81876
5. MLOC_27966
6. MLOC_80447
7. MLOC_7761 Ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic chain [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:M0Z5U6]
8. MLOC_60985
9. MLOC_73076
10. MLOC_74069
11. MLOC_76906
12. MLOC_54206
13. MLOC_56180
14. MLOC_65248
15. MLOC_58863 cyclophilin 59 [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT1G53720) TAIR;Acc:AT1G53720]
16. MLOC_58639
17. MLOC_10647
18. MLOC_27126
19. MLOC_10618
20. MLOC_58322
21. MLOC_34709
22. MLOC_73033
23. MLOC_37833
24. MLOC_68498 ammonium transporter 2 [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT2G38290) TAIR;Acc:AT2G38290]
25. MLOC_11567
26. MLOC_5075
27. MLOC_74301
28. MLOC_12954
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30. MLOC_81233
31. MLOC_9844
32. MLOC_54046 Putative lysine/histidine transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:J7QBN1]
33. MLOC_65439 serine carboxypeptidase-like 34 [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT5G23210) TAIR;Acc:AT5G23210]
34. MLOC_65044
35. MLOC_51268
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46. MLOC_76287
47. MLOC_20645
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54. MLOC_59997
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69. MLOC_23439
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80. MLOC_76416
81. MLOC_56431 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT5G21990) TAIR;Acc:AT5G21990]
Retrogenes FASTA BED
TSV (download all or selected columns from MySQL table)
Parental genes FASTA BED
TSV (download all or selected columns from MySQL table)