RetrogeneDB - Browse organism: Chimpanzee, Pan troglodytes

Common name:	Chimpanzee
Latin name:	Pan troglodytes
Genome assembly:	CHIMP2.1.4
All retrocopies:	3285
Parental genes:	1268

Summary:	Number of retrocopies :
Conserved ORF:	680 ORF	2605 ORF
Expressed retrocopies (RNA-Seq):	456 RNA-Seq	2829 RNA-Seq
Expressed retrocopies (EST):	11 EST	3274 EST

#	RetrogeneDB ID	Identity	Coverage	ORF conservation	Expression evidence
1.	retro_ptro_1	65.97 %	56.25 %	ORF	EST RNA-Seq
2.	retro_ptro_2	85.61 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
3.	retro_ptro_3	71.85 %	96.33 %	ORF	EST RNA-Seq
4.	retro_ptro_4	69.51 %	99.39 %	ORF	EST RNA-Seq
5.	retro_ptro_5	70.83 %	92.82 %	ORF	EST RNA-Seq
6.	retro_ptro_6	60.19 %	97.78 %	ORF	EST RNA-Seq
7.	retro_ptro_7	71.81 %	71.63 %	ORF	EST RNA-Seq
8.	retro_ptro_8	81.93 %	59.55 %	ORF	EST RNA-Seq
9.	retro_ptro_9	96.65 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
10.	retro_ptro_10	85.34 %	98.96 %	ORF	EST RNA-Seq
11.	retro_ptro_11	73.22 %	69.48 %	ORF	EST RNA-Seq
12.	retro_ptro_12	72.50 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
13.	retro_ptro_13	93.06 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
14.	retro_ptro_14	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
15.	retro_ptro_15	75.48 %	70.45 %	ORF	EST RNA-Seq
16.	retro_ptro_16	78.61 %	74.60 %	ORF	EST RNA-Seq
17.	retro_ptro_17	72.88 %	93.44 %	ORF	EST RNA-Seq
18.	retro_ptro_18	86.15 %	97.31 %	ORF	EST RNA-Seq
19.	retro_ptro_19	80.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
20.	retro_ptro_20	98.54 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
21.	retro_ptro_21	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
22.	retro_ptro_22	83.70 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
23.	retro_ptro_23	82.13 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
24.	retro_ptro_24	88.73 %	90.45 %	ORF	EST RNA-Seq
25.	retro_ptro_25	93.93 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
26.	retro_ptro_26	95.92 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
27.	retro_ptro_27	97.73 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
28.	retro_ptro_28	66.23 %	98.05 %	ORF	EST RNA-Seq
29.	retro_ptro_29	98.83 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
30.	retro_ptro_30	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
31.	retro_ptro_31	99.01 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
32.	retro_ptro_32	99.36 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
33.	retro_ptro_33	97.95 %	99.32 %	ORF	EST RNA-Seq
34.	retro_ptro_34	100.00 %	84.21 %	ORF	EST RNA-Seq
35.	retro_ptro_35	61.28 %	96.14 %	ORF	EST RNA-Seq
36.	retro_ptro_36	70.31 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
37.	retro_ptro_37	58.56 %	86.38 %	ORF	EST RNA-Seq
38.	retro_ptro_38	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
39.	retro_ptro_39	88.50 %	76.61 %	ORF	EST RNA-Seq
40.	retro_ptro_40	56.85 %	98.80 %	ORF	EST RNA-Seq
41.	retro_ptro_41	93.14 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
42.	retro_ptro_42	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
43.	retro_ptro_43	93.75 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
44.	retro_ptro_44	73.96 %	75.00 %	ORF	EST RNA-Seq
45.	retro_ptro_45	67.45 %	65.23 %	ORF	EST RNA-Seq
46.	retro_ptro_46	77.27 %	79.80 %	ORF	EST RNA-Seq
47.	retro_ptro_47	80.66 %	67.13 %	ORF	EST RNA-Seq
48.	retro_ptro_48	97.79 %	72.73 %	ORF	EST RNA-Seq
49.	retro_ptro_49	80.06 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
50.	retro_ptro_50	54.79 %	50.68 %	ORF	EST RNA-Seq
51.	retro_ptro_51	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
52.	retro_ptro_52	78.99 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
53.	retro_ptro_53	91.98 %	99.73 %	ORF	EST RNA-Seq
54.	retro_ptro_54	97.25 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
55.	retro_ptro_55	98.40 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
56.	retro_ptro_56	97.06 %	99.27 %	ORF	EST RNA-Seq
57.	retro_ptro_57	96.91 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
58.	retro_ptro_58	97.94 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
59.	retro_ptro_59	86.67 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
60.	retro_ptro_60	84.48 %	99.15 %	ORF	EST RNA-Seq
61.	retro_ptro_61	97.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
62.	retro_ptro_62	82.53 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
63.	retro_ptro_63	98.40 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
64.	retro_ptro_64	98.64 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
65.	retro_ptro_65	96.81 %	98.95 %	ORF	EST RNA-Seq
66.	retro_ptro_66	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
67.	retro_ptro_67	52.74 %	59.06 %	ORF	EST RNA-Seq
68.	retro_ptro_68	78.12 %	99.48 %	ORF	EST RNA-Seq
69.	retro_ptro_69	86.88 %	80.03 %	ORF	EST RNA-Seq
70.	retro_ptro_70	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
71.	retro_ptro_71	99.35 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
72.	retro_ptro_72	100.00 %	80.46 %	ORF	EST RNA-Seq
73.	retro_ptro_73	97.24 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
74.	retro_ptro_74	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
75.	retro_ptro_75	62.80 %	60.58 %	ORF	EST RNA-Seq
76.	retro_ptro_76	99.23 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
77.	retro_ptro_77	98.55 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
78.	retro_ptro_78	76.07 %	95.89 %	ORF	EST RNA-Seq
79.	retro_ptro_79	85.57 %	99.23 %	ORF	EST RNA-Seq
80.	retro_ptro_80	84.52 %	97.96 %	ORF	EST RNA-Seq
81.	retro_ptro_81	97.66 %	98.84 %	ORF	EST RNA-Seq
82.	retro_ptro_82	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
83.	retro_ptro_83	84.56 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
84.	retro_ptro_84	74.56 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
85.	retro_ptro_85	99.36 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
86.	retro_ptro_86	56.76 %	76.52 %	ORF	EST RNA-Seq
87.	retro_ptro_87	95.85 %	84.56 %	ORF	EST RNA-Seq
88.	retro_ptro_88	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
89.	retro_ptro_89	100.00 %	92.52 %	ORF	EST RNA-Seq
90.	retro_ptro_90	99.11 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
91.	retro_ptro_91	82.12 %	99.34 %	ORF	EST RNA-Seq
92.	retro_ptro_92	50.17 %	98.96 %	ORF	EST RNA-Seq
93.	retro_ptro_93	78.88 %	85.20 %	ORF	EST RNA-Seq
94.	retro_ptro_94	58.22 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
95.	retro_ptro_95	75.98 %	87.02 %	ORF	EST RNA-Seq
96.	retro_ptro_96	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
97.	retro_ptro_97	55.90 %	70.65 %	ORF	EST RNA-Seq
98.	retro_ptro_98	95.43 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
99.	retro_ptro_99	99.38 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
100.	retro_ptro_100	62.77 %	84.16 %	ORF	EST RNA-Seq
101.	retro_ptro_101	66.58 %	55.15 %	ORF	EST RNA-Seq
102.	retro_ptro_102	54.71 %	97.48 %	ORF	EST RNA-Seq
103.	retro_ptro_103	99.60 %	76.39 %	ORF	EST RNA-Seq
104.	retro_ptro_104	94.62 %	84.55 %	ORF	EST RNA-Seq
105.	retro_ptro_105	67.04 %	59.03 %	ORF	EST RNA-Seq
106.	retro_ptro_106	50.93 %	70.39 %	ORF	EST RNA-Seq
107.	retro_ptro_107	97.71 %	99.67 %	ORF	EST RNA-Seq
108.	retro_ptro_108	85.47 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
109.	retro_ptro_109	91.76 %	97.33 %	ORF	EST RNA-Seq
110.	retro_ptro_110	50.67 %	77.72 %	ORF	EST RNA-Seq
111.	retro_ptro_111	98.95 %	86.96 %	ORF	EST RNA-Seq
112.	retro_ptro_112	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
113.	retro_ptro_113	86.45 %	58.20 %	ORF	EST RNA-Seq
114.	retro_ptro_114	98.09 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
115.	retro_ptro_115	53.98 %	96.17 %	ORF	EST RNA-Seq
116.	retro_ptro_116	73.76 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
117.	retro_ptro_117	73.96 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
118.	retro_ptro_118	66.87 %	96.14 %	ORF	EST RNA-Seq
119.	retro_ptro_119	82.29 %	65.75 %	ORF	EST RNA-Seq
120.	retro_ptro_120	96.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
121.	retro_ptro_121	100.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
122.	retro_ptro_122	97.93 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
123.	retro_ptro_123	99.31 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
124.	retro_ptro_124	99.39 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
125.	retro_ptro_125	57.58 %	83.54 %	ORF	EST RNA-Seq
126.	retro_ptro_126	67.75 %	98.15 %	ORF	EST RNA-Seq
127.	retro_ptro_127	76.06 %	51.47 %	ORF	EST RNA-Seq
128.	retro_ptro_128	91.21 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
129.	retro_ptro_129	94.59 %	98.01 %	ORF	EST RNA-Seq
130.	retro_ptro_130	90.79 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
131.	retro_ptro_131	75.89 %	84.03 %	ORF	EST RNA-Seq
132.	retro_ptro_132	65.56 %	73.55 %	ORF	EST RNA-Seq
133.	retro_ptro_133	78.81 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
134.	retro_ptro_134	94.59 %	79.35 %	ORF	EST RNA-Seq
135.	retro_ptro_135	77.97 %	62.11 %	ORF	EST RNA-Seq
136.	retro_ptro_136	98.44 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
137.	retro_ptro_137	83.33 %	58.54 %	ORF	EST RNA-Seq
138.	retro_ptro_138	50.62 %	91.12 %	ORF	EST RNA-Seq
139.	retro_ptro_139	87.25 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
140.	retro_ptro_140	74.42 %	99.81 %	ORF	EST RNA-Seq
141.	retro_ptro_141	93.46 %	51.44 %	ORF	EST RNA-Seq
142.	retro_ptro_142	78.17 %	64.52 %	ORF	EST RNA-Seq
143.	retro_ptro_143	69.79 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
144.	retro_ptro_144	75.49 %	68.01 %	ORF	EST RNA-Seq
145.	retro_ptro_145	72.94 %	67.20 %	ORF	EST RNA-Seq
146.	retro_ptro_146	63.20 %	83.16 %	ORF	EST RNA-Seq
147.	retro_ptro_147	75.28 %	52.05 %	ORF	EST RNA-Seq
148.	retro_ptro_148	52.77 %	96.68 %	ORF	EST RNA-Seq
149.	retro_ptro_149	90.79 %	82.16 %	ORF	EST RNA-Seq
150.	retro_ptro_150	90.62 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
151.	retro_ptro_151	79.07 %	67.57 %	ORF	EST RNA-Seq
152.	retro_ptro_152	71.13 %	98.97 %	ORF	EST RNA-Seq
153.	retro_ptro_153	83.75 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
154.	retro_ptro_154	89.71 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
155.	retro_ptro_155	86.14 %	58.38 %	ORF	EST RNA-Seq
156.	retro_ptro_156	64.29 %	61.39 %	ORF	EST RNA-Seq
157.	retro_ptro_157	66.38 %	63.13 %	ORF	EST RNA-Seq
158.	retro_ptro_158	66.48 %	55.16 %	ORF	EST RNA-Seq
159.	retro_ptro_159	83.84 %	60.74 %	ORF	EST RNA-Seq
160.	retro_ptro_160	96.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
161.	retro_ptro_161	98.37 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
162.	retro_ptro_162	83.17 %	72.40 %	ORF	EST RNA-Seq
163.	retro_ptro_163	91.44 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
164.	retro_ptro_164	64.34 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
165.	retro_ptro_165	86.38 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
166.	retro_ptro_166	86.74 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
167.	retro_ptro_167	81.35 %	88.94 %	ORF	EST RNA-Seq
168.	retro_ptro_168	67.74 %	80.60 %	ORF	EST RNA-Seq
169.	retro_ptro_169	86.78 %	81.14 %	ORF	EST RNA-Seq
170.	retro_ptro_170	88.33 %	56.29 %	ORF	EST RNA-Seq
171.	retro_ptro_171	60.57 %	82.72 %	ORF	EST RNA-Seq
172.	retro_ptro_172	80.16 %	66.14 %	ORF	EST RNA-Seq
173.	retro_ptro_173	70.63 %	79.40 %	ORF	EST RNA-Seq
174.	retro_ptro_174	82.73 %	69.00 %	ORF	EST RNA-Seq
175.	retro_ptro_176	87.96 %	76.06 %	ORF	EST RNA-Seq
176.	retro_ptro_177	74.22 %	56.17 %	ORF	EST RNA-Seq
177.	retro_ptro_178	77.13 %	67.47 %	ORF	EST RNA-Seq
178.	retro_ptro_179	88.74 %	62.76 %	ORF	EST RNA-Seq
179.	retro_ptro_180	76.47 %	50.17 %	ORF	EST RNA-Seq
180.	retro_ptro_181	90.40 %	69.66 %	ORF	EST RNA-Seq
181.	retro_ptro_182	92.59 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
182.	retro_ptro_183	98.37 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
183.	retro_ptro_185	75.38 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
184.	retro_ptro_186	70.38 %	92.24 %	ORF	EST RNA-Seq
185.	retro_ptro_187	68.31 %	54.33 %	ORF	EST RNA-Seq
186.	retro_ptro_188	73.28 %	73.13 %	ORF	EST RNA-Seq
187.	retro_ptro_189	76.33 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
188.	retro_ptro_190	71.71 %	60.30 %	ORF	EST RNA-Seq
189.	retro_ptro_191	81.85 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
190.	retro_ptro_192	87.55 %	61.60 %	ORF	EST RNA-Seq
191.	retro_ptro_193	83.15 %	63.26 %	ORF	EST RNA-Seq
192.	retro_ptro_194	94.86 %	74.56 %	ORF	EST RNA-Seq
193.	retro_ptro_195	86.50 %	98.79 %	ORF	EST RNA-Seq
194.	retro_ptro_196	67.86 %	85.38 %	ORF	EST RNA-Seq
195.	retro_ptro_197	83.33 %	53.19 %	ORF	EST RNA-Seq
196.	retro_ptro_198	80.00 %	81.15 %	ORF	EST RNA-Seq
197.	retro_ptro_199	88.31 %	88.37 %	ORF	EST RNA-Seq
198.	retro_ptro_200	69.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
199.	retro_ptro_201	84.29 %	59.83 %	ORF	EST RNA-Seq
200.	retro_ptro_202	57.94 %	53.61 %	ORF	EST RNA-Seq
201.	retro_ptro_203	91.21 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
202.	retro_ptro_204	96.28 %	66.94 %	ORF	EST RNA-Seq
203.	retro_ptro_205	75.60 %	89.81 %	ORF	EST RNA-Seq
204.	retro_ptro_206	88.82 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
205.	retro_ptro_207	83.37 %	61.26 %	ORF	EST RNA-Seq
206.	retro_ptro_208	75.00 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
207.	retro_ptro_209	76.19 %	71.38 %	ORF	EST RNA-Seq
208.	retro_ptro_210	75.00 %	99.39 %	ORF	EST RNA-Seq
209.	retro_ptro_211	85.32 %	53.38 %	ORF	EST RNA-Seq
210.	retro_ptro_212	64.63 %	57.87 %	ORF	EST RNA-Seq
211.	retro_ptro_213	93.82 %	88.00 %	ORF	EST RNA-Seq
212.	retro_ptro_214	88.49 %	82.49 %	ORF	EST RNA-Seq
213.	retro_ptro_215	57.29 %	58.05 %	ORF	EST RNA-Seq
214.	retro_ptro_216	67.11 %	58.33 %	ORF	EST RNA-Seq
215.	retro_ptro_217	76.38 %	77.61 %	ORF	EST RNA-Seq
216.	retro_ptro_218	87.18 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
217.	retro_ptro_219	69.05 %	100.00 %	ORF	EST RNA-Seq
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