Common name: Chimpanzee
Latin name: Pan troglodytes
Genome assembly: CHIMP2.1.4
All retrocopies: 3285
Parental genes: 1268

Summary: Number of retrocopies :
Conserved ORF: 680 ORF 2605 ORF
Expressed retrocopies (RNA-Seq): 456 RNA-Seq 2829 RNA-Seq
Expressed retrocopies (EST): 11 EST 3274 EST

# RetrogeneDB ID Identity Coverage ORF conservation Expression evidence
1. retro_ptro_1 65.97 % 56.25 % ORF EST RNA-Seq
2. retro_ptro_2 85.61 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
3. retro_ptro_3 71.85 % 96.33 % ORF EST RNA-Seq
4. retro_ptro_4 69.51 % 99.39 % ORF EST RNA-Seq
5. retro_ptro_5 70.83 % 92.82 % ORF EST RNA-Seq
6. retro_ptro_6 60.19 % 97.78 % ORF EST RNA-Seq
7. retro_ptro_7 71.81 % 71.63 % ORF EST RNA-Seq
8. retro_ptro_8 81.93 % 59.55 % ORF EST RNA-Seq
9. retro_ptro_9 96.65 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
10. retro_ptro_10 85.34 % 98.96 % ORF EST RNA-Seq
11. retro_ptro_11 73.22 % 69.48 % ORF EST RNA-Seq
12. retro_ptro_12 72.50 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
13. retro_ptro_13 93.06 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
14. retro_ptro_14 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
15. retro_ptro_15 75.48 % 70.45 % ORF EST RNA-Seq
16. retro_ptro_16 78.61 % 74.60 % ORF EST RNA-Seq
17. retro_ptro_17 72.88 % 93.44 % ORF EST RNA-Seq
18. retro_ptro_18 86.15 % 97.31 % ORF EST RNA-Seq
19. retro_ptro_19 80.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
20. retro_ptro_20 98.54 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
21. retro_ptro_21 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
22. retro_ptro_22 83.70 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
23. retro_ptro_23 82.13 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
24. retro_ptro_24 88.73 % 90.45 % ORF EST RNA-Seq
25. retro_ptro_25 93.93 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
26. retro_ptro_26 95.92 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
27. retro_ptro_27 97.73 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
28. retro_ptro_28 66.23 % 98.05 % ORF EST RNA-Seq
29. retro_ptro_29 98.83 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
30. retro_ptro_30 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
31. retro_ptro_31 99.01 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
32. retro_ptro_32 99.36 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
33. retro_ptro_33 97.95 % 99.32 % ORF EST RNA-Seq
34. retro_ptro_34 100.00 % 84.21 % ORF EST RNA-Seq
35. retro_ptro_35 61.28 % 96.14 % ORF EST RNA-Seq
36. retro_ptro_36 70.31 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
37. retro_ptro_37 58.56 % 86.38 % ORF EST RNA-Seq
38. retro_ptro_38 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
39. retro_ptro_39 88.50 % 76.61 % ORF EST RNA-Seq
40. retro_ptro_40 56.85 % 98.80 % ORF EST RNA-Seq
41. retro_ptro_41 93.14 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
42. retro_ptro_42 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
43. retro_ptro_43 93.75 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
44. retro_ptro_44 73.96 % 75.00 % ORF EST RNA-Seq
45. retro_ptro_45 67.45 % 65.23 % ORF EST RNA-Seq
46. retro_ptro_46 77.27 % 79.80 % ORF EST RNA-Seq
47. retro_ptro_47 80.66 % 67.13 % ORF EST RNA-Seq
48. retro_ptro_48 97.79 % 72.73 % ORF EST RNA-Seq
49. retro_ptro_49 80.06 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
50. retro_ptro_50 54.79 % 50.68 % ORF EST RNA-Seq
51. retro_ptro_51 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
52. retro_ptro_52 78.99 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
53. retro_ptro_53 91.98 % 99.73 % ORF EST RNA-Seq
54. retro_ptro_54 97.25 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
55. retro_ptro_55 98.40 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
56. retro_ptro_56 97.06 % 99.27 % ORF EST RNA-Seq
57. retro_ptro_57 96.91 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
58. retro_ptro_58 97.94 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
59. retro_ptro_59 86.67 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
60. retro_ptro_60 84.48 % 99.15 % ORF EST RNA-Seq
61. retro_ptro_61 97.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
62. retro_ptro_62 82.53 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
63. retro_ptro_63 98.40 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
64. retro_ptro_64 98.64 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
65. retro_ptro_65 96.81 % 98.95 % ORF EST RNA-Seq
66. retro_ptro_66 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
67. retro_ptro_67 52.74 % 59.06 % ORF EST RNA-Seq
68. retro_ptro_68 78.12 % 99.48 % ORF EST RNA-Seq
69. retro_ptro_69 86.88 % 80.03 % ORF EST RNA-Seq
70. retro_ptro_70 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
71. retro_ptro_71 99.35 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
72. retro_ptro_72 100.00 % 80.46 % ORF EST RNA-Seq
73. retro_ptro_73 97.24 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
74. retro_ptro_74 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
75. retro_ptro_75 62.80 % 60.58 % ORF EST RNA-Seq
76. retro_ptro_76 99.23 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
77. retro_ptro_77 98.55 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
78. retro_ptro_78 76.07 % 95.89 % ORF EST RNA-Seq
79. retro_ptro_79 85.57 % 99.23 % ORF EST RNA-Seq
80. retro_ptro_80 84.52 % 97.96 % ORF EST RNA-Seq
81. retro_ptro_81 97.66 % 98.84 % ORF EST RNA-Seq
82. retro_ptro_82 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
83. retro_ptro_83 84.56 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
84. retro_ptro_84 74.56 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
85. retro_ptro_85 99.36 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
86. retro_ptro_86 56.76 % 76.52 % ORF EST RNA-Seq
87. retro_ptro_87 95.85 % 84.56 % ORF EST RNA-Seq
88. retro_ptro_88 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
89. retro_ptro_89 100.00 % 92.52 % ORF EST RNA-Seq
90. retro_ptro_90 99.11 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
91. retro_ptro_91 82.12 % 99.34 % ORF EST RNA-Seq
92. retro_ptro_92 50.17 % 98.96 % ORF EST RNA-Seq
93. retro_ptro_93 78.88 % 85.20 % ORF EST RNA-Seq
94. retro_ptro_94 58.22 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
95. retro_ptro_95 75.98 % 87.02 % ORF EST RNA-Seq
96. retro_ptro_96 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
97. retro_ptro_97 55.90 % 70.65 % ORF EST RNA-Seq
98. retro_ptro_98 95.43 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
99. retro_ptro_99 99.38 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
100. retro_ptro_100 62.77 % 84.16 % ORF EST RNA-Seq
101. retro_ptro_101 66.58 % 55.15 % ORF EST RNA-Seq
102. retro_ptro_102 54.71 % 97.48 % ORF EST RNA-Seq
103. retro_ptro_103 99.60 % 76.39 % ORF EST RNA-Seq
104. retro_ptro_104 94.62 % 84.55 % ORF EST RNA-Seq
105. retro_ptro_105 67.04 % 59.03 % ORF EST RNA-Seq
106. retro_ptro_106 50.93 % 70.39 % ORF EST RNA-Seq
107. retro_ptro_107 97.71 % 99.67 % ORF EST RNA-Seq
108. retro_ptro_108 85.47 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
109. retro_ptro_109 91.76 % 97.33 % ORF EST RNA-Seq
110. retro_ptro_110 50.67 % 77.72 % ORF EST RNA-Seq
111. retro_ptro_111 98.95 % 86.96 % ORF EST RNA-Seq
112. retro_ptro_112 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
113. retro_ptro_113 86.45 % 58.20 % ORF EST RNA-Seq
114. retro_ptro_114 98.09 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
115. retro_ptro_115 53.98 % 96.17 % ORF EST RNA-Seq
116. retro_ptro_116 73.76 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
117. retro_ptro_117 73.96 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
118. retro_ptro_118 66.87 % 96.14 % ORF EST RNA-Seq
119. retro_ptro_119 82.29 % 65.75 % ORF EST RNA-Seq
120. retro_ptro_120 96.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
121. retro_ptro_121 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
122. retro_ptro_122 97.93 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
123. retro_ptro_123 99.31 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
124. retro_ptro_124 99.39 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
125. retro_ptro_125 57.58 % 83.54 % ORF EST RNA-Seq
126. retro_ptro_126 67.75 % 98.15 % ORF EST RNA-Seq
127. retro_ptro_127 76.06 % 51.47 % ORF EST RNA-Seq
128. retro_ptro_128 91.21 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
129. retro_ptro_129 94.59 % 98.01 % ORF EST RNA-Seq
130. retro_ptro_130 90.79 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
131. retro_ptro_131 75.89 % 84.03 % ORF EST RNA-Seq
132. retro_ptro_132 65.56 % 73.55 % ORF EST RNA-Seq
133. retro_ptro_133 78.81 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
134. retro_ptro_134 94.59 % 79.35 % ORF EST RNA-Seq
135. retro_ptro_135 77.97 % 62.11 % ORF EST RNA-Seq
136. retro_ptro_136 98.44 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
137. retro_ptro_137 83.33 % 58.54 % ORF EST RNA-Seq
138. retro_ptro_138 50.62 % 91.12 % ORF EST RNA-Seq
139. retro_ptro_139 87.25 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
140. retro_ptro_140 74.42 % 99.81 % ORF EST RNA-Seq
141. retro_ptro_141 93.46 % 51.44 % ORF EST RNA-Seq
142. retro_ptro_142 78.17 % 64.52 % ORF EST RNA-Seq
143. retro_ptro_143 69.79 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
144. retro_ptro_144 75.49 % 68.01 % ORF EST RNA-Seq
145. retro_ptro_145 72.94 % 67.20 % ORF EST RNA-Seq
146. retro_ptro_146 63.20 % 83.16 % ORF EST RNA-Seq
147. retro_ptro_147 75.28 % 52.05 % ORF EST RNA-Seq
148. retro_ptro_148 52.77 % 96.68 % ORF EST RNA-Seq
149. retro_ptro_149 90.79 % 82.16 % ORF EST RNA-Seq
150. retro_ptro_150 90.62 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
151. retro_ptro_151 79.07 % 67.57 % ORF EST RNA-Seq
152. retro_ptro_152 71.13 % 98.97 % ORF EST RNA-Seq
153. retro_ptro_153 83.75 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
154. retro_ptro_154 89.71 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
155. retro_ptro_155 86.14 % 58.38 % ORF EST RNA-Seq
156. retro_ptro_156 64.29 % 61.39 % ORF EST RNA-Seq
157. retro_ptro_157 66.38 % 63.13 % ORF EST RNA-Seq
158. retro_ptro_158 66.48 % 55.16 % ORF EST RNA-Seq
159. retro_ptro_159 83.84 % 60.74 % ORF EST RNA-Seq
160. retro_ptro_160 96.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
161. retro_ptro_161 98.37 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
162. retro_ptro_162 83.17 % 72.40 % ORF EST RNA-Seq
163. retro_ptro_163 91.44 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
164. retro_ptro_164 64.34 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
165. retro_ptro_165 86.38 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
166. retro_ptro_166 86.74 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
167. retro_ptro_167 81.35 % 88.94 % ORF EST RNA-Seq
168. retro_ptro_168 67.74 % 80.60 % ORF EST RNA-Seq
169. retro_ptro_169 86.78 % 81.14 % ORF EST RNA-Seq
170. retro_ptro_170 88.33 % 56.29 % ORF EST RNA-Seq
171. retro_ptro_171 60.57 % 82.72 % ORF EST RNA-Seq
172. retro_ptro_172 80.16 % 66.14 % ORF EST RNA-Seq
173. retro_ptro_173 70.63 % 79.40 % ORF EST RNA-Seq
174. retro_ptro_174 82.73 % 69.00 % ORF EST RNA-Seq
175. retro_ptro_176 87.96 % 76.06 % ORF EST RNA-Seq
176. retro_ptro_177 74.22 % 56.17 % ORF EST RNA-Seq
177. retro_ptro_178 77.13 % 67.47 % ORF EST RNA-Seq
178. retro_ptro_179 88.74 % 62.76 % ORF EST RNA-Seq
179. retro_ptro_180 76.47 % 50.17 % ORF EST RNA-Seq
180. retro_ptro_181 90.40 % 69.66 % ORF EST RNA-Seq
181. retro_ptro_182 92.59 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
182. retro_ptro_183 98.37 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
183. retro_ptro_185 75.38 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
184. retro_ptro_186 70.38 % 92.24 % ORF EST RNA-Seq
185. retro_ptro_187 68.31 % 54.33 % ORF EST RNA-Seq
186. retro_ptro_188 73.28 % 73.13 % ORF EST RNA-Seq
187. retro_ptro_189 76.33 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
188. retro_ptro_190 71.71 % 60.30 % ORF EST RNA-Seq
189. retro_ptro_191 81.85 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
190. retro_ptro_192 87.55 % 61.60 % ORF EST RNA-Seq
191. retro_ptro_193 83.15 % 63.26 % ORF EST RNA-Seq
192. retro_ptro_194 94.86 % 74.56 % ORF EST RNA-Seq
193. retro_ptro_195 86.50 % 98.79 % ORF EST RNA-Seq
194. retro_ptro_196 67.86 % 85.38 % ORF EST RNA-Seq
195. retro_ptro_197 83.33 % 53.19 % ORF EST RNA-Seq
196. retro_ptro_198 80.00 % 81.15 % ORF EST RNA-Seq
197. retro_ptro_199 88.31 % 88.37 % ORF EST RNA-Seq
198. retro_ptro_200 69.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
199. retro_ptro_201 84.29 % 59.83 % ORF EST RNA-Seq
200. retro_ptro_202 57.94 % 53.61 % ORF EST RNA-Seq
201. retro_ptro_203 91.21 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
202. retro_ptro_204 96.28 % 66.94 % ORF EST RNA-Seq
203. retro_ptro_205 75.60 % 89.81 % ORF EST RNA-Seq
204. retro_ptro_206 88.82 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
205. retro_ptro_207 83.37 % 61.26 % ORF EST RNA-Seq
206. retro_ptro_208 75.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
207. retro_ptro_209 76.19 % 71.38 % ORF EST RNA-Seq
208. retro_ptro_210 75.00 % 99.39 % ORF EST RNA-Seq
209. retro_ptro_211 85.32 % 53.38 % ORF EST RNA-Seq
210. retro_ptro_212 64.63 % 57.87 % ORF EST RNA-Seq
211. retro_ptro_213 93.82 % 88.00 % ORF EST RNA-Seq
212. retro_ptro_214 88.49 % 82.49 % ORF EST RNA-Seq
213. retro_ptro_215 57.29 % 58.05 % ORF EST RNA-Seq
214. retro_ptro_216 67.11 % 58.33 % ORF EST RNA-Seq
215. retro_ptro_217 76.38 % 77.61 % ORF EST RNA-Seq
216. retro_ptro_218 87.18 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
217. retro_ptro_219 69.05 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
218. retro_ptro_220 89.07 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
219. retro_ptro_221 64.90 % 75.65 % ORF EST RNA-Seq
220. retro_ptro_222 78.48 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
221. retro_ptro_223 91.81 % 92.43 % ORF EST RNA-Seq
222. retro_ptro_224 84.56 % 87.42 % ORF EST RNA-Seq
223. retro_ptro_225 78.33 % 81.72 % ORF EST RNA-Seq
224. retro_ptro_226 62.39 % 83.72 % ORF EST RNA-Seq
225. retro_ptro_227 94.59 % 98.23 % ORF EST RNA-Seq
226. retro_ptro_228 76.75 % 70.44 % ORF EST RNA-Seq
227. retro_ptro_229 74.71 % 95.56 % ORF EST RNA-Seq
228. retro_ptro_230 67.77 % 69.94 % ORF EST RNA-Seq
229. retro_ptro_231 79.13 % 57.50 % ORF EST RNA-Seq
230. retro_ptro_232 65.47 % 80.12 % ORF EST RNA-Seq
231. retro_ptro_233 85.88 % 97.98 % ORF EST RNA-Seq
232. retro_ptro_234 80.00 % 58.39 % ORF EST RNA-Seq
233. retro_ptro_235 72.73 % 93.83 % ORF EST RNA-Seq
234. retro_ptro_236 64.52 % 90.36 % ORF EST RNA-Seq
235. retro_ptro_237 88.60 % 97.44 % ORF EST RNA-Seq
236. retro_ptro_238 79.61 % 59.30 % ORF EST RNA-Seq
237. retro_ptro_239 61.72 % 60.12 % ORF EST RNA-Seq
238. retro_ptro_240 60.43 % 74.59 % ORF EST RNA-Seq
239. retro_ptro_241 66.94 % 70.41 % ORF EST RNA-Seq
240. retro_ptro_242 80.39 % 82.07 % ORF EST RNA-Seq
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1340. retro_ptro_1351