Common name: Guinea Pig
Latin name: Cavia porcellus
Genome assembly: cavPor3
All retrocopies: 1469
Parental genes: 772

Summary: Number of retrocopies :
Conserved ORF: 198 ORF 1271 ORF
Expressed retrocopies (RNA-Seq): 146 RNA-Seq 1323 RNA-Seq
Expressed retrocopies (EST): 2 EST 1467 EST

# RetrogeneDB ID Identity Coverage ORF conservation Expression evidence
1. retro_cpor_1 88.89 % 83.08 % ORF EST RNA-Seq
2. retro_cpor_2 98.76 % 98.17 % ORF EST RNA-Seq
3. retro_cpor_3 80.23 % 61.72 % ORF EST RNA-Seq
4. retro_cpor_4 59.18 % 97.03 % ORF EST RNA-Seq
5. retro_cpor_5 87.68 % 97.43 % ORF EST RNA-Seq
6. retro_cpor_6 77.85 % 95.07 % ORF EST RNA-Seq
7. retro_cpor_7 89.84 % 99.64 % ORF EST RNA-Seq
8. retro_cpor_8 97.71 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
9. retro_cpor_9 83.47 % 96.80 % ORF EST RNA-Seq
10. retro_cpor_10 74.49 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
11. retro_cpor_11 82.79 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
12. retro_cpor_12 84.66 % 93.71 % ORF EST RNA-Seq
13. retro_cpor_13 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
14. retro_cpor_14 90.98 % 91.04 % ORF EST RNA-Seq
15. retro_cpor_15 71.02 % 96.70 % ORF EST RNA-Seq
16. retro_cpor_16 91.82 % 96.66 % ORF EST RNA-Seq
17. retro_cpor_17 76.07 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
18. retro_cpor_18 70.16 % 99.48 % ORF EST RNA-Seq
19. retro_cpor_19 91.34 % 83.39 % ORF EST RNA-Seq
20. retro_cpor_20 88.02 % 99.82 % ORF EST RNA-Seq
21. retro_cpor_21 84.80 % 99.42 % ORF EST RNA-Seq
22. retro_cpor_22 96.79 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
23. retro_cpor_23 80.66 % 98.10 % ORF EST RNA-Seq
24. retro_cpor_24 73.33 % 98.68 % ORF EST RNA-Seq
25. retro_cpor_25 94.15 % 98.95 % ORF EST RNA-Seq
26. retro_cpor_26 96.27 % 98.17 % ORF EST RNA-Seq
27. retro_cpor_27 96.94 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
28. retro_cpor_28 94.08 % 55.41 % ORF EST RNA-Seq
29. retro_cpor_29 73.53 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
30. retro_cpor_30 99.66 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
31. retro_cpor_31 98.47 % 99.62 % ORF EST RNA-Seq
32. retro_cpor_32 92.31 % 97.74 % ORF EST RNA-Seq
33. retro_cpor_33 96.34 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
34. retro_cpor_34 96.97 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
35. retro_cpor_35 66.18 % 99.13 % ORF EST RNA-Seq
36. retro_cpor_36 97.86 % 94.74 % ORF EST RNA-Seq
37. retro_cpor_37 96.83 % 99.21 % ORF EST RNA-Seq
38. retro_cpor_38 59.74 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
39. retro_cpor_39 61.16 % 86.43 % ORF EST RNA-Seq
40. retro_cpor_40 71.55 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
41. retro_cpor_41 90.48 % 76.83 % ORF EST RNA-Seq
42. retro_cpor_42 97.35 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
43. retro_cpor_43 98.53 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
44. retro_cpor_44 89.38 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
45. retro_cpor_45 66.00 % 99.50 % ORF EST RNA-Seq
46. retro_cpor_46 99.62 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
47. retro_cpor_47 99.49 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
48. retro_cpor_48 54.65 % 74.78 % ORF EST RNA-Seq
49. retro_cpor_49 75.25 % 96.19 % ORF EST RNA-Seq
50. retro_cpor_50 100.00 % 75.94 % ORF EST RNA-Seq
51. retro_cpor_51 99.08 % 55.33 % ORF EST RNA-Seq
52. retro_cpor_52 92.02 % 97.41 % ORF EST RNA-Seq
53. retro_cpor_53 88.89 % 99.85 % ORF EST RNA-Seq
54. retro_cpor_54 99.05 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
55. retro_cpor_55 93.33 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
56. retro_cpor_56 99.36 % 99.79 % ORF EST RNA-Seq
57. retro_cpor_57 77.65 % 63.80 % ORF EST RNA-Seq
58. retro_cpor_58 83.24 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
59. retro_cpor_59 55.00 % 95.24 % ORF EST RNA-Seq
60. retro_cpor_60 93.33 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
61. retro_cpor_61 61.70 % 91.26 % ORF EST RNA-Seq
62. retro_cpor_62 64.29 % 97.78 % ORF EST RNA-Seq
63. retro_cpor_63 66.39 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
64. retro_cpor_64 92.09 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
65. retro_cpor_65 94.42 % 66.36 % ORF EST RNA-Seq
66. retro_cpor_66 93.05 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
67. retro_cpor_67 98.74 % 97.94 % ORF EST RNA-Seq
68. retro_cpor_68 93.71 % 92.90 % ORF EST RNA-Seq
69. retro_cpor_69 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
70. retro_cpor_70 77.41 % 94.50 % ORF EST RNA-Seq
71. retro_cpor_71 100.00 % 91.95 % ORF EST RNA-Seq
72. retro_cpor_72 72.39 % 56.66 % ORF EST RNA-Seq
73. retro_cpor_73 87.48 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
74. retro_cpor_74 59.62 % 99.05 % ORF EST RNA-Seq
75. retro_cpor_75 68.42 % 99.12 % ORF EST RNA-Seq
76. retro_cpor_76 77.23 % 99.12 % ORF EST RNA-Seq
77. retro_cpor_77 65.29 % 54.85 % ORF EST RNA-Seq
78. retro_cpor_78 97.48 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
79. retro_cpor_79 68.22 % 61.05 % ORF EST RNA-Seq
80. retro_cpor_80 66.02 % 91.07 % ORF EST RNA-Seq
81. retro_cpor_81 100.00 % 78.64 % ORF EST RNA-Seq
82. retro_cpor_82 51.74 % 83.90 % ORF EST RNA-Seq
83. retro_cpor_83 91.79 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
84. retro_cpor_84 84.57 % 67.59 % ORF EST RNA-Seq
85. retro_cpor_85 93.48 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
86. retro_cpor_86 95.57 % 72.46 % ORF EST RNA-Seq
87. retro_cpor_87 86.49 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
88. retro_cpor_88 77.29 % 73.91 % ORF EST RNA-Seq
89. retro_cpor_89 95.27 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
90. retro_cpor_90 96.33 % 83.85 % ORF EST RNA-Seq
91. retro_cpor_91 81.74 % 99.14 % ORF EST RNA-Seq
92. retro_cpor_92 69.54 % 96.13 % ORF EST RNA-Seq
93. retro_cpor_93 51.18 % 83.55 % ORF EST RNA-Seq
94. retro_cpor_94 69.39 % 83.05 % ORF EST RNA-Seq
95. retro_cpor_95 65.44 % 51.92 % ORF EST RNA-Seq
96. retro_cpor_96 93.92 % 98.45 % ORF EST RNA-Seq
97. retro_cpor_97 84.58 % 56.03 % ORF EST RNA-Seq
98. retro_cpor_98 98.59 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
99. retro_cpor_99 53.95 % 66.30 % ORF EST RNA-Seq
100. retro_cpor_100 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
101. retro_cpor_101 55.50 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
102. retro_cpor_102 88.52 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
103. retro_cpor_103 51.90 % 52.33 % ORF EST RNA-Seq
104. retro_cpor_104 87.60 % 98.47 % ORF EST RNA-Seq
105. retro_cpor_105 99.34 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
106. retro_cpor_106 90.82 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
107. retro_cpor_107 78.74 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
108. retro_cpor_108 57.28 % 97.77 % ORF EST RNA-Seq
109. retro_cpor_109 79.50 % 74.35 % ORF EST RNA-Seq
110. retro_cpor_110 90.00 % 57.22 % ORF EST RNA-Seq
111. retro_cpor_111 99.31 % 95.36 % ORF EST RNA-Seq
112. retro_cpor_112 90.76 % 95.97 % ORF EST RNA-Seq
113. retro_cpor_113 77.34 % 85.23 % ORF EST RNA-Seq
114. retro_cpor_114 88.37 % 59.39 % ORF EST RNA-Seq
115. retro_cpor_115 89.47 % 99.13 % ORF EST RNA-Seq
116. retro_cpor_116 85.37 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
117. retro_cpor_117 61.25 % 98.75 % ORF EST RNA-Seq
118. retro_cpor_118 96.22 % 99.87 % ORF EST RNA-Seq
119. retro_cpor_119 82.22 % 91.84 % ORF EST RNA-Seq
120. retro_cpor_120 79.52 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
121. retro_cpor_121 75.00 % 91.09 % ORF EST RNA-Seq
122. retro_cpor_122 93.02 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
123. retro_cpor_123 72.93 % 99.13 % ORF EST RNA-Seq
124. retro_cpor_124 58.86 % 80.76 % ORF EST RNA-Seq
125. retro_cpor_125 99.10 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
126. retro_cpor_126 87.10 % 72.09 % ORF EST RNA-Seq
127. retro_cpor_127 82.61 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
128. retro_cpor_128 79.40 % 92.48 % ORF EST RNA-Seq
129. retro_cpor_129 52.46 % 65.73 % ORF EST RNA-Seq
130. retro_cpor_130 60.80 % 80.26 % ORF EST RNA-Seq
131. retro_cpor_131 72.53 % 89.66 % ORF EST RNA-Seq
132. retro_cpor_132 76.88 % 91.01 % ORF EST RNA-Seq
133. retro_cpor_133 95.14 % 92.42 % ORF EST RNA-Seq
134. retro_cpor_134 57.39 % 97.39 % ORF EST RNA-Seq
135. retro_cpor_135 62.32 % 56.36 % ORF EST RNA-Seq
136. retro_cpor_136 67.86 % 56.97 % ORF EST RNA-Seq
137. retro_cpor_137 71.43 % 58.23 % ORF EST RNA-Seq
138. retro_cpor_138 77.00 % 88.39 % ORF EST RNA-Seq
139. retro_cpor_139 79.41 % 57.26 % ORF EST RNA-Seq
140. retro_cpor_140 78.29 % 76.92 % ORF EST RNA-Seq
141. retro_cpor_141 78.12 % 96.92 % ORF EST RNA-Seq
142. retro_cpor_142 68.80 % 59.42 % ORF EST RNA-Seq
143. retro_cpor_143 72.52 % 92.14 % ORF EST RNA-Seq
144. retro_cpor_144 89.38 % 61.17 % ORF EST RNA-Seq
145. retro_cpor_145 78.67 % 98.68 % ORF EST RNA-Seq
146. retro_cpor_146 77.10 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
147. retro_cpor_147 87.67 % 73.74 % ORF EST RNA-Seq
148. retro_cpor_148 66.46 % 65.70 % ORF EST RNA-Seq
149. retro_cpor_149 57.59 % 72.00 % ORF EST RNA-Seq
150. retro_cpor_150 72.10 % 93.15 % ORF EST RNA-Seq
151. retro_cpor_151 75.81 % 87.19 % ORF EST RNA-Seq
152. retro_cpor_152 62.89 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
153. retro_cpor_153 63.06 % 98.08 % ORF EST RNA-Seq
154. retro_cpor_154 87.44 % 51.76 % ORF EST RNA-Seq
155. retro_cpor_156 80.62 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
156. retro_cpor_157 59.82 % 60.44 % ORF EST RNA-Seq
157. retro_cpor_158 73.48 % 89.76 % ORF EST RNA-Seq
158. retro_cpor_159 50.83 % 61.50 % ORF EST RNA-Seq
159. retro_cpor_160 71.82 % 75.89 % ORF EST RNA-Seq
160. retro_cpor_161 69.19 % 50.89 % ORF EST RNA-Seq
161. retro_cpor_162 73.71 % 85.19 % ORF EST RNA-Seq
162. retro_cpor_165 77.11 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
163. retro_cpor_166 84.10 % 88.01 % ORF EST RNA-Seq
164. retro_cpor_167 85.61 % 90.34 % ORF EST RNA-Seq
165. retro_cpor_168 73.40 % 72.66 % ORF EST RNA-Seq
166. retro_cpor_169 88.97 % 62.21 % ORF EST RNA-Seq
167. retro_cpor_170 64.29 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
168. retro_cpor_171 93.22 % 59.43 % ORF EST RNA-Seq
169. retro_cpor_172 91.63 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
170. retro_cpor_173 70.64 % 94.78 % ORF EST RNA-Seq
171. retro_cpor_174 74.75 % 59.76 % ORF EST RNA-Seq
172. retro_cpor_175 72.87 % 54.78 % ORF EST RNA-Seq
173. retro_cpor_176 65.22 % 98.55 % ORF EST RNA-Seq
174. retro_cpor_177 73.08 % 73.65 % ORF EST RNA-Seq
175. retro_cpor_178 52.70 % 50.69 % ORF EST RNA-Seq
176. retro_cpor_179 72.10 % 98.68 % ORF EST RNA-Seq
177. retro_cpor_180 76.42 % 69.59 % ORF EST RNA-Seq
178. retro_cpor_181 67.31 % 92.64 % ORF EST RNA-Seq
179. retro_cpor_182 73.87 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
180. retro_cpor_183 56.25 % 61.44 % ORF EST RNA-Seq
181. retro_cpor_184 65.75 % 69.76 % ORF EST RNA-Seq
182. retro_cpor_185 83.83 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
183. retro_cpor_186 68.70 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
184. retro_cpor_187 69.35 % 59.90 % ORF EST RNA-Seq
185. retro_cpor_188 72.33 % 58.89 % ORF EST RNA-Seq
186. retro_cpor_189 78.34 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
187. retro_cpor_190 65.87 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
188. retro_cpor_192 62.96 % 64.85 % ORF EST RNA-Seq
189. retro_cpor_193 76.53 % 52.01 % ORF EST RNA-Seq
190. retro_cpor_194 69.93 % 52.61 % ORF EST RNA-Seq
191. retro_cpor_195 74.49 % 57.66 % ORF EST RNA-Seq
192. retro_cpor_196 56.34 % 55.42 % ORF EST RNA-Seq
193. retro_cpor_197 93.86 % 92.42 % ORF EST RNA-Seq
194. retro_cpor_198 58.75 % 68.26 % ORF EST RNA-Seq
195. retro_cpor_199 69.23 % 98.46 % ORF EST RNA-Seq
196. retro_cpor_200 83.56 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
197. retro_cpor_201 79.01 % 81.00 % ORF EST RNA-Seq
198. retro_cpor_202 57.81 % 66.32 % ORF EST RNA-Seq
199. retro_cpor_203 69.64 % 66.87 % ORF EST RNA-Seq
200. retro_cpor_204 80.34 % 97.44 % ORF EST RNA-Seq
201. retro_cpor_205 87.50 % 98.92 % ORF EST RNA-Seq
202. retro_cpor_206 71.25 % 91.18 % ORF EST RNA-Seq
203. retro_cpor_207 52.46 % 65.73 % ORF EST RNA-Seq
204. retro_cpor_208 52.81 % 69.35 % ORF EST RNA-Seq
205. retro_cpor_209 56.96 % 75.36 % ORF EST RNA-Seq
206. retro_cpor_210 78.06 % 73.86 % ORF EST RNA-Seq
207. retro_cpor_211 61.96 % 50.28 % ORF EST RNA-Seq
208. retro_cpor_212 65.45 % 82.23 % ORF EST RNA-Seq
209. retro_cpor_213 77.78 % 77.01 % ORF EST RNA-Seq
210. retro_cpor_214 63.53 % 61.76 % ORF EST RNA-Seq
211. retro_cpor_215 62.14 % 86.71 % ORF EST RNA-Seq
212. retro_cpor_216 54.40 % 60.61 % ORF EST RNA-Seq
213. retro_cpor_217 73.24 % 83.43 % ORF EST RNA-Seq
214. retro_cpor_218 69.31 % 71.59 % ORF EST RNA-Seq
215. retro_cpor_219 65.84 % 73.61 % ORF EST RNA-Seq
216. retro_cpor_220 68.89 % 72.24 % ORF EST RNA-Seq
217. retro_cpor_221 57.89 % 88.28 % ORF EST RNA-Seq
218. retro_cpor_222 54.79 % 51.97 % ORF EST RNA-Seq
219. retro_cpor_223 67.02 % 58.02 % ORF EST RNA-Seq
220. retro_cpor_225 67.55 % 83.38 % ORF EST RNA-Seq
221. retro_cpor_227 99.49 % 98.33 % ORF EST RNA-Seq
222. retro_cpor_229 65.71 % 50.95 % ORF EST RNA-Seq
223. retro_cpor_230 74.66 % 93.42 % ORF EST RNA-Seq
224. retro_cpor_231 65.24 % 82.19 % ORF EST RNA-Seq
225. retro_cpor_232 54.43 % 65.81 % ORF EST RNA-Seq
226. retro_cpor_233 56.48 % 61.60 % ORF EST RNA-Seq
227. retro_cpor_234 69.53 % 89.86 % ORF EST RNA-Seq
228. retro_cpor_235 69.88 % 61.83 % ORF EST RNA-Seq
229. retro_cpor_237 77.84 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
230. retro_cpor_238 89.42 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
231. retro_cpor_239 72.55 % 58.20 % ORF EST RNA-Seq
232. retro_cpor_240 59.18 % 94.04 % ORF EST RNA-Seq
233. retro_cpor_242 55.15 % 77.86 % ORF EST RNA-Seq
234. retro_cpor_243 50.48 % 62.96 % ORF EST RNA-Seq
235. retro_cpor_244 80.58 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
236. retro_cpor_245 65.27 % 77.78 % ORF EST RNA-Seq
237. retro_cpor_246 61.94 % 93.33 % ORF EST RNA-Seq
238. retro_cpor_247 85.97 % 63.48 % ORF EST RNA-Seq
239. retro_cpor_248 61.59 % 86.47 % ORF EST RNA-Seq
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