Common name: Dog
Latin name: Canis familiaris
Genome assembly: CanFam3.1
All retrocopies: 2089
Parental genes: 939

Summary: Number of retrocopies :
Conserved ORF: 510 ORF 1579 ORF
Expressed retrocopies (RNA-Seq): 279 RNA-Seq 1810 RNA-Seq
Expressed retrocopies (EST): 22 EST 2067 EST

# RetrogeneDB ID Identity Coverage ORF conservation Expression evidence
1. retro_cfam_1 99.39 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
2. retro_cfam_2 91.30 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
3. retro_cfam_3 94.55 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
4. retro_cfam_4 88.65 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
5. retro_cfam_5 71.94 % 98.58 % ORF EST RNA-Seq
6. retro_cfam_6 89.53 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
7. retro_cfam_7 98.18 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
8. retro_cfam_8 72.53 % 70.43 % ORF EST RNA-Seq
9. retro_cfam_9 95.72 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
10. retro_cfam_10 95.51 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
11. retro_cfam_11 98.31 % 87.68 % ORF EST RNA-Seq
12. retro_cfam_12 94.05 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
13. retro_cfam_13 95.64 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
14. retro_cfam_14 100.00 % 98.67 % ORF EST RNA-Seq
15. retro_cfam_15 71.75 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
16. retro_cfam_16 60.93 % 98.37 % ORF EST RNA-Seq
17. retro_cfam_17 98.20 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
18. retro_cfam_18 92.17 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
19. retro_cfam_19 85.11 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
20. retro_cfam_20 79.42 % 67.13 % ORF EST RNA-Seq
21. retro_cfam_21 93.85 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
22. retro_cfam_22 93.29 % 50.68 % ORF EST RNA-Seq
23. retro_cfam_23 78.23 % 69.27 % ORF EST RNA-Seq
24. retro_cfam_24 98.46 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
25. retro_cfam_25 53.89 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
26. retro_cfam_26 55.35 % 58.73 % ORF EST RNA-Seq
27. retro_cfam_27 83.09 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
28. retro_cfam_28 93.98 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
29. retro_cfam_29 96.08 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
30. retro_cfam_30 100.00 % 91.94 % ORF EST RNA-Seq
31. retro_cfam_31 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
32. retro_cfam_32 97.48 % 74.38 % ORF EST RNA-Seq
33. retro_cfam_33 99.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
34. retro_cfam_34 98.37 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
35. retro_cfam_35 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
36. retro_cfam_36 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
37. retro_cfam_37 88.82 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
38. retro_cfam_38 80.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
39. retro_cfam_39 86.43 % 50.72 % ORF EST RNA-Seq
40. retro_cfam_40 93.64 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
41. retro_cfam_41 99.11 % 99.70 % ORF EST RNA-Seq
42. retro_cfam_42 96.09 % 65.98 % ORF EST RNA-Seq
43. retro_cfam_43 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
44. retro_cfam_44 51.92 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
45. retro_cfam_45 67.12 % 57.69 % ORF EST RNA-Seq
46. retro_cfam_46 96.19 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
47. retro_cfam_47 82.61 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
48. retro_cfam_48 98.80 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
49. retro_cfam_49 98.07 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
50. retro_cfam_50 94.60 % 85.85 % ORF EST RNA-Seq
51. retro_cfam_51 99.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
52. retro_cfam_52 98.15 % 98.63 % ORF EST RNA-Seq
53. retro_cfam_53 95.88 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
54. retro_cfam_54 87.37 % 58.31 % ORF EST RNA-Seq
55. retro_cfam_55 63.37 % 99.02 % ORF EST RNA-Seq
56. retro_cfam_56 93.20 % 74.24 % ORF EST RNA-Seq
57. retro_cfam_57 56.86 % 79.69 % ORF EST RNA-Seq
58. retro_cfam_58 76.44 % 96.92 % ORF EST RNA-Seq
59. retro_cfam_59 75.55 % 87.02 % ORF EST RNA-Seq
60. retro_cfam_60 93.18 % 97.78 % ORF EST RNA-Seq
61. retro_cfam_61 96.97 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
62. retro_cfam_62 63.38 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
63. retro_cfam_63 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
64. retro_cfam_64 98.84 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
65. retro_cfam_65 54.84 % 79.37 % ORF EST RNA-Seq
66. retro_cfam_66 97.13 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
67. retro_cfam_67 88.81 % 86.14 % ORF EST RNA-Seq
68. retro_cfam_68 98.66 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
69. retro_cfam_69 91.72 % 95.39 % ORF EST RNA-Seq
70. retro_cfam_70 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
71. retro_cfam_71 89.25 % 94.90 % ORF EST RNA-Seq
72. retro_cfam_72 99.76 % 99.76 % ORF EST RNA-Seq
73. retro_cfam_73 77.23 % 99.12 % ORF EST RNA-Seq
74. retro_cfam_74 95.97 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
75. retro_cfam_75 52.68 % 74.28 % ORF EST RNA-Seq
76. retro_cfam_76 93.94 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
77. retro_cfam_77 96.59 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
78. retro_cfam_78 87.39 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
79. retro_cfam_79 96.71 % 88.37 % ORF EST RNA-Seq
80. retro_cfam_80 94.54 % 94.82 % ORF EST RNA-Seq
81. retro_cfam_81 97.44 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
82. retro_cfam_82 92.97 % 95.52 % ORF EST RNA-Seq
83. retro_cfam_83 96.58 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
84. retro_cfam_84 68.86 % 89.60 % ORF EST RNA-Seq
85. retro_cfam_85 99.55 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
86. retro_cfam_86 89.58 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
87. retro_cfam_87 93.17 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
88. retro_cfam_88 92.15 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
89. retro_cfam_89 97.41 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
90. retro_cfam_90 99.05 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
91. retro_cfam_91 93.77 % 89.42 % ORF EST RNA-Seq
92. retro_cfam_92 99.39 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
93. retro_cfam_93 96.71 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
94. retro_cfam_94 97.79 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
95. retro_cfam_95 98.98 % 99.49 % ORF EST RNA-Seq
96. retro_cfam_96 94.74 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
97. retro_cfam_97 99.75 % 99.75 % ORF EST RNA-Seq
98. retro_cfam_98 98.72 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
99. retro_cfam_99 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
100. retro_cfam_100 97.04 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
101. retro_cfam_101 90.55 % 99.22 % ORF EST RNA-Seq
102. retro_cfam_102 96.20 % 99.46 % ORF EST RNA-Seq
103. retro_cfam_103 98.86 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
104. retro_cfam_104 99.31 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
105. retro_cfam_105 77.55 % 51.60 % ORF EST RNA-Seq
106. retro_cfam_106 94.60 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
107. retro_cfam_107 94.07 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
108. retro_cfam_108 70.30 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
109. retro_cfam_109 56.11 % 94.15 % ORF EST RNA-Seq
110. retro_cfam_110 94.05 % 75.68 % ORF EST RNA-Seq
111. retro_cfam_111 95.26 % 63.17 % ORF EST RNA-Seq
112. retro_cfam_112 97.32 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
113. retro_cfam_113 91.07 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
114. retro_cfam_114 98.21 % 70.89 % ORF EST RNA-Seq
115. retro_cfam_115 75.51 % 85.96 % ORF EST RNA-Seq
116. retro_cfam_116 97.57 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
117. retro_cfam_117 95.39 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
118. retro_cfam_118 99.29 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
119. retro_cfam_119 69.54 % 96.13 % ORF EST RNA-Seq
120. retro_cfam_120 98.83 % 91.47 % ORF EST RNA-Seq
121. retro_cfam_121 55.70 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
122. retro_cfam_122 98.48 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
123. retro_cfam_123 99.34 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
124. retro_cfam_124 78.18 % 76.04 % ORF EST RNA-Seq
125. retro_cfam_125 84.09 % 84.08 % ORF EST RNA-Seq
126. retro_cfam_126 96.84 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
127. retro_cfam_127 96.12 % 99.23 % ORF EST RNA-Seq
128. retro_cfam_128 86.20 % 97.60 % ORF EST RNA-Seq
129. retro_cfam_129 95.69 % 99.52 % ORF EST RNA-Seq
130. retro_cfam_130 70.24 % 95.30 % ORF EST RNA-Seq
131. retro_cfam_131 52.63 % 96.02 % ORF EST RNA-Seq
132. retro_cfam_132 97.73 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
133. retro_cfam_133 75.74 % 69.00 % ORF EST RNA-Seq
134. retro_cfam_134 55.95 % 96.55 % ORF EST RNA-Seq
135. retro_cfam_135 96.10 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
136. retro_cfam_136 98.99 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
137. retro_cfam_137 97.73 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
138. retro_cfam_138 100.00 % 91.53 % ORF EST RNA-Seq
139. retro_cfam_139 73.27 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
140. retro_cfam_140 86.39 % 97.52 % ORF EST RNA-Seq
141. retro_cfam_141 97.78 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
142. retro_cfam_142 96.95 % 99.49 % ORF EST RNA-Seq
143. retro_cfam_143 97.13 % 99.52 % ORF EST RNA-Seq
144. retro_cfam_144 71.77 % 90.51 % ORF EST RNA-Seq
145. retro_cfam_145 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
146. retro_cfam_146 97.73 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
147. retro_cfam_147 61.54 % 80.97 % ORF EST RNA-Seq
148. retro_cfam_148 94.93 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
149. retro_cfam_149 92.41 % 94.77 % ORF EST RNA-Seq
150. retro_cfam_150 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
151. retro_cfam_151 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
152. retro_cfam_152 70.47 % 95.51 % ORF EST RNA-Seq
153. retro_cfam_153 74.52 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
154. retro_cfam_154 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
155. retro_cfam_155 62.50 % 75.61 % ORF EST RNA-Seq
156. retro_cfam_156 72.96 % 95.30 % ORF EST RNA-Seq
157. retro_cfam_157 52.36 % 81.58 % ORF EST RNA-Seq
158. retro_cfam_158 99.18 % 99.18 % ORF EST RNA-Seq
159. retro_cfam_159 87.25 % 98.29 % ORF EST RNA-Seq
160. retro_cfam_160 86.96 % 96.70 % ORF EST RNA-Seq
161. retro_cfam_161 93.29 % 89.62 % ORF EST RNA-Seq
162. retro_cfam_162 85.06 % 91.78 % ORF EST RNA-Seq
163. retro_cfam_163 84.85 % 99.40 % ORF EST RNA-Seq
164. retro_cfam_164 95.80 % 95.97 % ORF EST RNA-Seq
165. retro_cfam_165 99.24 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
166. retro_cfam_166 92.44 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
167. retro_cfam_167 82.13 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
168. retro_cfam_168 94.85 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
169. retro_cfam_169 97.35 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
170. retro_cfam_170 96.20 % 99.62 % ORF EST RNA-Seq
171. retro_cfam_171 98.91 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
172. retro_cfam_172 77.78 % 93.51 % ORF EST RNA-Seq
173. retro_cfam_173 99.21 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
174. retro_cfam_174 94.61 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
175. retro_cfam_175 76.97 % 96.74 % ORF EST RNA-Seq
176. retro_cfam_176 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
177. retro_cfam_177 96.30 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
178. retro_cfam_178 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
179. retro_cfam_179 98.86 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
180. retro_cfam_180 98.75 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
181. retro_cfam_181 69.70 % 93.26 % ORF EST RNA-Seq
182. retro_cfam_182 94.14 % 85.80 % ORF EST RNA-Seq
183. retro_cfam_183 98.14 % 94.71 % ORF EST RNA-Seq
184. retro_cfam_184 93.57 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
185. retro_cfam_185 93.81 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
186. retro_cfam_186 85.34 % 98.96 % ORF EST RNA-Seq
187. retro_cfam_187 89.54 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
188. retro_cfam_188 90.67 % 55.56 % ORF EST RNA-Seq
189. retro_cfam_189 95.65 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
190. retro_cfam_190 96.70 % 51.93 % ORF EST RNA-Seq
191. retro_cfam_191 99.07 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
192. retro_cfam_192 78.87 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
193. retro_cfam_193 79.56 % 68.42 % ORF EST RNA-Seq
194. retro_cfam_194 94.68 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
195. retro_cfam_195 99.44 % 99.25 % ORF EST RNA-Seq
196. retro_cfam_196 86.86 % 89.54 % ORF EST RNA-Seq
197. retro_cfam_197 93.57 % 98.59 % ORF EST RNA-Seq
198. retro_cfam_198 82.02 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
199. retro_cfam_199 84.88 % 84.31 % ORF EST RNA-Seq
200. retro_cfam_200 92.36 % 95.44 % ORF EST RNA-Seq
201. retro_cfam_201 61.37 % 70.43 % ORF EST RNA-Seq
202. retro_cfam_202 92.28 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
203. retro_cfam_203 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
204. retro_cfam_204 94.81 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
205. retro_cfam_205 93.91 % 99.49 % ORF EST RNA-Seq
206. retro_cfam_206 80.35 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
207. retro_cfam_207 90.10 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
208. retro_cfam_208 98.02 % 99.02 % ORF EST RNA-Seq
209. retro_cfam_209 62.37 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
210. retro_cfam_210 97.27 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
211. retro_cfam_211 84.05 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
212. retro_cfam_212 95.76 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
213. retro_cfam_213 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
214. retro_cfam_214 93.94 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
215. retro_cfam_215 99.24 % 91.67 % ORF EST RNA-Seq
216. retro_cfam_216 89.26 % 98.03 % ORF EST RNA-Seq
217. retro_cfam_217 73.98 % 91.79 % ORF EST RNA-Seq
218. retro_cfam_218 59.51 % 99.81 % ORF EST RNA-Seq
219. retro_cfam_219 93.63 % 97.67 % ORF EST RNA-Seq
220. retro_cfam_220 97.20 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
221. retro_cfam_221 53.22 % 96.18 % ORF EST RNA-Seq
222. retro_cfam_222 92.05 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
223. retro_cfam_223 81.21 % 83.05 % ORF EST RNA-Seq
224. retro_cfam_224 93.38 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
225. retro_cfam_225 97.32 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
226. retro_cfam_226 70.19 % 85.49 % ORF EST RNA-Seq
227. retro_cfam_227 55.60 % 77.51 % ORF EST RNA-Seq
228. retro_cfam_228 95.45 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
229. retro_cfam_229 90.67 % 55.56 % ORF EST RNA-Seq
230. retro_cfam_230 75.06 % 93.39 % ORF EST RNA-Seq
231. retro_cfam_231 98.86 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
232. retro_cfam_232 99.84 % 96.14 % ORF EST RNA-Seq
233. retro_cfam_233 72.69 % 96.33 % ORF EST RNA-Seq
234. retro_cfam_234 97.04 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
235. retro_cfam_235 97.75 % 98.67 % ORF EST RNA-Seq
236. retro_cfam_236 78.49 % 85.23 % ORF EST RNA-Seq
237. retro_cfam_237 97.12 % 99.59 % ORF EST RNA-Seq
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239. retro_cfam_239 98.91 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
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1340.