Common name: Cow
Latin name: Bos taurus
Genome assembly: UMD3.1
All retrocopies: 1784
Parental genes: 959

Summary: Number of retrocopies :
Conserved ORF: 561 ORF 1223 ORF
Expressed retrocopies (RNA-Seq): 365 RNA-Seq 1419 RNA-Seq
Expressed retrocopies (EST): 48 EST 1736 EST

# RetrogeneDB ID Identity Coverage ORF conservation Expression evidence
1. retro_btau_1 87.54 % 98.57 % ORF EST RNA-Seq
2. retro_btau_2 94.55 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
3. retro_btau_3 97.69 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
4. retro_btau_4 98.37 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
5. retro_btau_5 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
6. retro_btau_6 96.04 % 93.81 % ORF EST RNA-Seq
7. retro_btau_7 96.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
8. retro_btau_8 99.36 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
9. retro_btau_9 93.44 % 97.60 % ORF EST RNA-Seq
10. retro_btau_10 96.93 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
11. retro_btau_11 54.36 % 70.65 % ORF EST RNA-Seq
12. retro_btau_12 93.06 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
13. retro_btau_13 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
14. retro_btau_14 98.46 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
15. retro_btau_15 73.82 % 95.24 % ORF EST RNA-Seq
16. retro_btau_16 97.56 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
17. retro_btau_17 85.59 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
18. retro_btau_18 95.87 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
19. retro_btau_19 74.56 % 98.82 % ORF EST RNA-Seq
20. retro_btau_20 92.06 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
21. retro_btau_21 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
22. retro_btau_22 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
23. retro_btau_23 99.40 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
24. retro_btau_24 64.76 % 83.96 % ORF EST RNA-Seq
25. retro_btau_25 73.68 % 99.13 % ORF EST RNA-Seq
26. retro_btau_26 69.36 % 95.58 % ORF EST RNA-Seq
27. retro_btau_27 92.09 % 82.41 % ORF EST RNA-Seq
28. retro_btau_28 67.12 % 56.43 % ORF EST RNA-Seq
29. retro_btau_29 99.15 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
30. retro_btau_30 100.00 % 85.57 % ORF EST RNA-Seq
31. retro_btau_31 81.76 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
32. retro_btau_32 80.48 % 91.11 % ORF EST RNA-Seq
33. retro_btau_33 99.24 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
34. retro_btau_34 96.52 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
35. retro_btau_35 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
36. retro_btau_36 73.43 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
37. retro_btau_37 86.96 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
38. retro_btau_38 98.39 % 93.00 % ORF EST RNA-Seq
39. retro_btau_39 96.75 % 99.35 % ORF EST RNA-Seq
40. retro_btau_40 97.37 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
41. retro_btau_41 52.77 % 66.24 % ORF EST RNA-Seq
42. retro_btau_42 85.89 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
43. retro_btau_43 68.37 % 89.91 % ORF EST RNA-Seq
44. retro_btau_44 92.50 % 93.59 % ORF EST RNA-Seq
45. retro_btau_45 98.65 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
46. retro_btau_46 98.67 % 99.34 % ORF EST RNA-Seq
47. retro_btau_47 98.53 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
48. retro_btau_48 69.03 % 95.00 % ORF EST RNA-Seq
49. retro_btau_49 77.37 % 97.90 % ORF EST RNA-Seq
50. retro_btau_50 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
51. retro_btau_51 97.40 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
52. retro_btau_52 93.53 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
53. retro_btau_53 97.52 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
54. retro_btau_54 89.81 % 93.91 % ORF EST RNA-Seq
55. retro_btau_55 95.72 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
56. retro_btau_56 95.58 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
57. retro_btau_57 97.69 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
58. retro_btau_58 98.94 % 89.95 % ORF EST RNA-Seq
59. retro_btau_59 95.06 % 95.29 % ORF EST RNA-Seq
60. retro_btau_60 92.50 % 86.49 % ORF EST RNA-Seq
61. retro_btau_61 98.15 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
62. retro_btau_62 98.25 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
63. retro_btau_63 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
64. retro_btau_64 64.27 % 89.15 % ORF EST RNA-Seq
65. retro_btau_65 90.15 % 94.29 % ORF EST RNA-Seq
66. retro_btau_66 50.16 % 95.86 % ORF EST RNA-Seq
67. retro_btau_67 95.29 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
68. retro_btau_68 98.37 % 50.20 % ORF EST RNA-Seq
69. retro_btau_69 87.77 % 85.80 % ORF EST RNA-Seq
70. retro_btau_70 96.45 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
71. retro_btau_71 84.62 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
72. retro_btau_72 54.65 % 70.64 % ORF EST RNA-Seq
73. retro_btau_73 68.55 % 81.58 % ORF EST RNA-Seq
74. retro_btau_74 74.23 % 95.10 % ORF EST RNA-Seq
75. retro_btau_75 94.37 % 77.17 % ORF EST RNA-Seq
76. retro_btau_76 98.86 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
77. retro_btau_77 97.93 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
78. retro_btau_78 97.66 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
79. retro_btau_79 80.61 % 51.99 % ORF EST RNA-Seq
80. retro_btau_80 99.24 % 92.31 % ORF EST RNA-Seq
81. retro_btau_81 77.14 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
82. retro_btau_82 84.09 % 77.04 % ORF EST RNA-Seq
83. retro_btau_83 96.38 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
84. retro_btau_84 96.64 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
85. retro_btau_85 60.94 % 83.93 % ORF EST RNA-Seq
86. retro_btau_86 72.27 % 96.33 % ORF EST RNA-Seq
87. retro_btau_87 97.70 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
88. retro_btau_88 94.20 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
89. retro_btau_89 77.50 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
90. retro_btau_90 96.49 % 82.37 % ORF EST RNA-Seq
91. retro_btau_91 61.29 % 54.07 % ORF EST RNA-Seq
92. retro_btau_92 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
93. retro_btau_93 98.12 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
94. retro_btau_94 92.16 % 88.44 % ORF EST RNA-Seq
95. retro_btau_95 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
96. retro_btau_96 96.11 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
97. retro_btau_97 72.45 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
98. retro_btau_98 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
99. retro_btau_99 98.13 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
100. retro_btau_100 87.98 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
101. retro_btau_101 95.97 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
102. retro_btau_102 98.18 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
103. retro_btau_103 72.25 % 83.13 % ORF EST RNA-Seq
104. retro_btau_104 76.90 % 65.14 % ORF EST RNA-Seq
105. retro_btau_105 98.06 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
106. retro_btau_106 84.85 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
107. retro_btau_107 66.33 % 54.75 % ORF EST RNA-Seq
108. retro_btau_108 76.99 % 99.07 % ORF EST RNA-Seq
109. retro_btau_109 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
110. retro_btau_110 98.02 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
111. retro_btau_111 97.98 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
112. retro_btau_112 96.04 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
113. retro_btau_113 55.78 % 98.66 % ORF EST RNA-Seq
114. retro_btau_114 97.19 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
115. retro_btau_115 94.59 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
116. retro_btau_116 96.13 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
117. retro_btau_117 90.43 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
118. retro_btau_118 75.91 % 96.48 % ORF EST RNA-Seq
119. retro_btau_119 98.48 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
120. retro_btau_120 98.65 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
121. retro_btau_121 76.84 % 97.78 % ORF EST RNA-Seq
122. retro_btau_122 90.59 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
123. retro_btau_123 84.40 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
124. retro_btau_124 96.97 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
125. retro_btau_125 96.20 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
126. retro_btau_126 99.32 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
127. retro_btau_127 96.55 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
128. retro_btau_128 91.67 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
129. retro_btau_129 72.44 % 93.38 % ORF EST RNA-Seq
130. retro_btau_130 94.84 % 94.49 % ORF EST RNA-Seq
131. retro_btau_131 98.39 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
132. retro_btau_132 98.72 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
133. retro_btau_133 94.16 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
134. retro_btau_134 98.38 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
135. retro_btau_135 98.66 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
136. retro_btau_136 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
137. retro_btau_137 85.65 % 72.97 % ORF EST RNA-Seq
138. retro_btau_138 97.70 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
139. retro_btau_139 93.33 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
140. retro_btau_140 99.53 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
141. retro_btau_141 98.57 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
142. retro_btau_142 94.87 % 99.15 % ORF EST RNA-Seq
143. retro_btau_143 96.36 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
144. retro_btau_144 96.52 % 96.64 % ORF EST RNA-Seq
145. retro_btau_145 90.21 % 81.25 % ORF EST RNA-Seq
146. retro_btau_146 95.06 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
147. retro_btau_147 91.58 % 79.17 % ORF EST RNA-Seq
148. retro_btau_148 66.10 % 95.68 % ORF EST RNA-Seq
149. retro_btau_149 92.19 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
150. retro_btau_150 82.45 % 93.21 % ORF EST RNA-Seq
151. retro_btau_151 98.90 % 91.92 % ORF EST RNA-Seq
152. retro_btau_152 99.51 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
153. retro_btau_153 91.28 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
154. retro_btau_154 57.83 % 95.40 % ORF EST RNA-Seq
155. retro_btau_155 93.90 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
156. retro_btau_156 94.12 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
157. retro_btau_157 91.17 % 99.69 % ORF EST RNA-Seq
158. retro_btau_158 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
159. retro_btau_159 98.08 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
160. retro_btau_160 88.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
161. retro_btau_161 50.72 % 81.55 % ORF EST RNA-Seq
162. retro_btau_162 91.74 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
163. retro_btau_163 66.81 % 95.87 % ORF EST RNA-Seq
164. retro_btau_164 91.21 % 98.91 % ORF EST RNA-Seq
165. retro_btau_165 98.37 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
166. retro_btau_166 77.02 % 86.10 % ORF EST RNA-Seq
167. retro_btau_167 97.95 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
168. retro_btau_168 95.78 % 98.34 % ORF EST RNA-Seq
169. retro_btau_169 95.51 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
170. retro_btau_170 83.14 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
171. retro_btau_171 98.46 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
172. retro_btau_172 81.11 % 85.04 % ORF EST RNA-Seq
173. retro_btau_173 99.30 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
174. retro_btau_174 86.75 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
175. retro_btau_175 84.58 % 59.89 % ORF EST RNA-Seq
176. retro_btau_176 67.75 % 97.91 % ORF EST RNA-Seq
177. retro_btau_177 51.06 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
178. retro_btau_178 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
179. retro_btau_179 92.54 % 61.47 % ORF EST RNA-Seq
180. retro_btau_180 73.20 % 61.06 % ORF EST RNA-Seq
181. retro_btau_181 97.94 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
182. retro_btau_182 56.07 % 58.85 % ORF EST RNA-Seq
183. retro_btau_183 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
184. retro_btau_184 91.47 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
185. retro_btau_185 98.37 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
186. retro_btau_186 98.25 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
187. retro_btau_187 75.55 % 87.02 % ORF EST RNA-Seq
188. retro_btau_188 78.88 % 85.23 % ORF EST RNA-Seq
189. retro_btau_189 60.44 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
190. retro_btau_190 80.63 % 95.50 % ORF EST RNA-Seq
191. retro_btau_191 96.49 % 99.13 % ORF EST RNA-Seq
192. retro_btau_192 99.13 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
193. retro_btau_193 73.26 % 99.71 % ORF EST RNA-Seq
194. retro_btau_194 74.83 % 91.88 % ORF EST RNA-Seq
195. retro_btau_195 97.45 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
196. retro_btau_196 80.86 % 95.83 % ORF EST RNA-Seq
197. retro_btau_197 78.16 % 91.58 % ORF EST RNA-Seq
198. retro_btau_198 74.90 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
199. retro_btau_199 93.17 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
200. retro_btau_200 97.40 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
201. retro_btau_201 99.51 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
202. retro_btau_202 100.00 % 80.00 % ORF EST RNA-Seq
203. retro_btau_203 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
204. retro_btau_204 96.32 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
205. retro_btau_205 95.10 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
206. retro_btau_206 85.34 % 98.96 % ORF EST RNA-Seq
207. retro_btau_207 100.00 % 95.24 % ORF EST RNA-Seq
208. retro_btau_208 67.90 % 97.59 % ORF EST RNA-Seq
209. retro_btau_209 94.38 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
210. retro_btau_210 90.32 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
211. retro_btau_211 82.33 % 80.85 % ORF EST RNA-Seq
212. retro_btau_212 53.62 % 78.42 % ORF EST RNA-Seq
213. retro_btau_213 92.25 % 82.17 % ORF EST RNA-Seq
214. retro_btau_214 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
215. retro_btau_215 92.92 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
216. retro_btau_216 58.46 % 80.33 % ORF EST RNA-Seq
217. retro_btau_217 73.97 % 98.98 % ORF EST RNA-Seq
218. retro_btau_218 55.96 % 90.95 % ORF EST RNA-Seq
219. retro_btau_219 95.77 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
220. retro_btau_220 97.35 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
221. retro_btau_221 94.57 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
222. retro_btau_222 64.05 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
223. retro_btau_223 96.23 % 53.81 % ORF EST RNA-Seq
224. retro_btau_224 98.60 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
225. retro_btau_225 91.10 % 90.68 % ORF EST RNA-Seq
226. retro_btau_226 52.93 % 91.52 % ORF EST RNA-Seq
227. retro_btau_227 67.65 % 99.02 % ORF EST RNA-Seq
228. retro_btau_228 68.82 % 99.71 % ORF EST RNA-Seq
229. retro_btau_229 96.33 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
230. retro_btau_230 98.62 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
231. retro_btau_231 98.44 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
232. retro_btau_232 62.75 % 65.45 % ORF EST RNA-Seq
233. retro_btau_233 98.48 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
234. retro_btau_234 63.83 % 99.16 % ORF EST RNA-Seq
235. retro_btau_235 97.67 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
236. retro_btau_236 53.05 % 55.63 % ORF EST RNA-Seq
237. retro_btau_237 100.00 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
238. retro_btau_238 89.42 % 99.05 % ORF EST RNA-Seq
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474. retro_btau_487 93.91 % 60.85 % ORF EST RNA-Seq
475. retro_btau_488 74.68 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
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477. retro_btau_490 95.60 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
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662. retro_btau_684 99.07 % 58.15 % ORF EST RNA-Seq
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668. retro_btau_690 73.09 % 91.16 % ORF EST RNA-Seq
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675. retro_btau_698 91.33 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
676. retro_btau_699 60.23 % 72.30 % ORF EST RNA-Seq
677. retro_btau_700 69.23 % 95.59 % ORF EST RNA-Seq
678. retro_btau_701 72.41 % 54.81 % ORF EST RNA-Seq
679. retro_btau_702 75.75 % 87.87 % ORF EST RNA-Seq
680. retro_btau_703 78.40 % 69.70 % ORF EST RNA-Seq
681. retro_btau_704 99.03 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
682. retro_btau_705 94.12 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
683. retro_btau_706 75.63 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
684. retro_btau_707 93.91 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
685. retro_btau_708 86.48 % 56.88 % ORF EST RNA-Seq
686. retro_btau_709 88.38 % 97.57 % ORF EST RNA-Seq
687. retro_btau_710 68.92 % 62.54 % ORF EST RNA-Seq
688. retro_btau_711 72.58 % 81.58 % ORF EST RNA-Seq
689. retro_btau_712 87.20 % 96.09 % ORF EST RNA-Seq
690. retro_btau_713 79.56 % 63.68 % ORF EST RNA-Seq
691. retro_btau_714 91.40 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
692. retro_btau_715 80.98 % 57.19 % ORF EST RNA-Seq
693. retro_btau_716 92.38 % 71.67 % ORF EST RNA-Seq
694. retro_btau_717 59.06 % 68.48 % ORF EST RNA-Seq
695. retro_btau_718 59.26 % 50.49 % ORF EST RNA-Seq
696. retro_btau_719 70.00 % 64.04 % ORF EST RNA-Seq
697. retro_btau_720 85.02 % 54.05 % ORF EST RNA-Seq
698. retro_btau_721 80.63 % 99.54 % ORF EST RNA-Seq
699. retro_btau_722 94.96 % 82.07 % ORF EST RNA-Seq
700. retro_btau_723 89.30 % 59.37 % ORF EST RNA-Seq
701. retro_btau_724 91.30 % 100.00 % ORF EST RNA-Seq
702. retro_btau_725 63.77 % 56.43 % ORF EST RNA-Seq
703. retro_btau_726 62.32 % 56.43 % ORF EST RNA-Seq
704. retro_btau_727 60.26 % 63.90 % ORF EST RNA-Seq
705. retro_btau_728 60.26 % 63.90 % ORF EST RNA-Seq
706. retro_btau_729 83.76 % 64.82 % ORF EST RNA-Seq
707. retro_btau_730 89.44 % 56.85 % ORF EST RNA-Seq
708. retro_btau_731 65.65 % 95.56 % ORF EST RNA-Seq
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