sp|Q40255|ALDH_LINUS ----> Probable aldehyde dehydrogenase

Intron 1 GTGTCACACT ... TTTTGCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	60.92	51	73	86
A2	59.12	37	44	63
A3	75.32	19	60	56
A4	65.62	22	44	40
A5	63.86	15	22	31
A6	65.08	33	54	69
A7	66.67	43	83	89
A8	69.7	25	49	66
A9	71.53	39	88	108
A10	64.1	49	80	95

>TRINITY_DN101434_c0_g1_i3 from sample A4 / Example spliced isoform

CCTGTATGCATCGAACAGAAAAGGACCCAAATTAAAAATTTAAATGCCCTGTGACGCGGATAACCGAGCGATTTCAGATGCAGCTGCCACGATTGTCCAAATTATCTTCGTACAAAGAGACGAGGGATTAATTGGGCCCTCTTCCCAATCGCGCAGGTTGGAGCTCAGATTTGATTCTGATAGATGGCTTAGTAAATATC
ATAATAATTAAAGTATTTCCACATTATTATCATCAACACACTATATATTGGTTCGTTTCATCTTGTTCTATCACGCTGTATATCTCATCTCATCTGCAGCAGACCCGCCTCTGTAAGAAAATATGCATCGGTTTGTTGGCACCCGAGTCTTAAGCGGACATGCGAAACGCATGTTTATCAGAGATTGCAGAGGCCATGCT
TTCAGCAACAGGGCTTCTCATTCACTTGCTTTTCGCACTTTGGATGCTGAAGAAGTATCAGGTTCACAGAGCACAGAAGTTCTCAATTTAGTGCAGGGAGAATGGAAAGGTACCTCGAGGTGGAGTGAGATTGTAGACCCTTTGAATGGACAGAAATTCATTGCGATACCGGATCCTTCTGCAGATGAGATCAAACCATT
TGTTGAGAGCTTGCACTCATGCCCCAAGTCTGGCTTGCATAACCCATTAAAAAATCCCGAGAGATATGTTATGTATGGAGATATTTCTGCAAGGGCTGCTGCTGTATTGAAACAACCTGAGGCTCTTGGTGAGGTCAATGTTACACAAACGTTTTTGGAGAACTTTTCTGGTGACCAGGTTCGCTTTTTGGCTCGATCAT
TTGCAGTACCAGGAAATCATCTTGGACAGCAAAGCAGTGGCTTTCGATGGCCCTATGGTTCTGTGGCAATCATAACACCATTCAATTTTCCGTTGGAGATACCTCTCCTCCAGCTTATGGGTGCCCTCTATATGGGCAACAAGCCACTCTTAAAAGTTGATAGCAAGGTCAGCATAGTAATGGAGCAAATGTTAAGGCTT
CTTCATCAGTGTGCAATGCCTCTTGGAGATGTAGATTTTGTCAACTGTGATGGTAGCACTATGAATAAAATTTTGCTAGAGGGAGATCCACGCATGACCCTTTTCACAGGAAGTTCAAGGGTTGCCGAGAAACTTGCAGTTGATCTGAAAGGGCGAGTGAAATTAGAAGATGCAGGGTTTGATTGGAAAATTCTTGGCCC
TGATGTTCAGGAGGTTGATTATGTTGCATGGGTTTGCGACCAGGATGCTTATGCATGTAGTGGACAAAAATGCTCTGGACAATCAATATTGTTTGTGCACGAGAATTGGAACTCTACCAATCTTGTATCCAAGTTGAAAGCTCTTGCTGAGAGA

>TRINITY_DN101434_c0_g1_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:

CCTGTATGCATCGAACAGAAAAGGACCCAAATTAAAAATTTAAATGCCCTGTGACGCGGATAACCGAGCGATTTCAGATGCAGCTGCCACGATTGTCCAAATTATCTTCGTACAAAGAGACGAGGGATTAATTGGGCCCTCTTCCCAATCGCGCAGGTTGGAGCTCAGATTTGATTCTGATAGATGGCTTAGTAAATATC
ATAATAATTAAAGTATTTCCACATTATTATCATCAACACACTATATATTGGTTCGTTTCATCTTGTTCTATCACGCTGTATATCTCATCTCATCTGCAGCAGACCCGCCTCTGTAAGAAAATATGCATCGGTTTGTTGGCACCCGAGTCTTAAGCGGACATGCGAAACGCATGTTTATCAGAGATTGCAGAGGCCATGCT
TTCAGCAACAGGGCTTCTCATTCACTTGCTTTTCGCACTTTGGATGCTGAAGAAGTATCAGGTTCACAGAGCACAGAAGTTCTCAATTTAGTGCAGGGAGAATGGAAAGGTACCTCGAGGTGGAGTGAGATTGTAGACCCTTTGAATGGACAGAAATTCATTGCGATACCGGATCCTTCTGCAGATGAGATCAAACCATT
TGTTGAGAGCTTGCACTCATGCCCCAAGTCTGGCTTGCATAACCCATTAAAAAATCCCGAGAGATATGTTATGTATGGAGATATTTCTGCAAGGGCTGCTGCTGTATTGAAACAACCTGAGgtgtcacacttttttgcaaaattgatacaacgtgtgtccccgaagagttttgctcagGCTCTTGGTGAGGTCAATGTTA
CACAAACGTTTTTGGAGAACTTTTCTGGTGACCAGGTTCGCTTTTTGGCTCGATCATTTGCAGTACCAGGAAATCATCTTGGACAGCAAAGCAGTGGCTTTCGATGGCCCTATGGTTCTGTGGCAATCATAACACCATTCAATTTTCCGTTGGAGATACCTCTCCTCCAGCTTATGGGTGCCCTCTATATGGGCAACAAG
CCACTCTTAAAAGTTGATAGCAAGGTCAGCATAGTAATGGAGCAAATGTTAAGGCTTCTTCATCAGTGTGCAATGCCTCTTGGAGATGTAGATTTTGTCAACTGTGATGGTAGCACTATGAATAAAATTTTGCTAGAGGGAGATCCACGCATGACCCTTTTCACAGGAAGTTCAAGGGTTGCCGAGAAACTTGCAGTTGA
TCTGAAAGGGCGAGTGAAATTAGAAGATGCAGGGTTTGATTGGAAAATTCTTGGCCCTGATGTTCAGGAGGTTGATTATGTTGCATGGGTTTGCGACCAGGATGCTTATGCATGTAGTGGACAAAAATGCTCTGGACAATCAATATTGTTTGTGCACGAGAATTGGAACTCTACCAATCTTGTATCCAAGTTGAAAGCTC
TTGCTGAGAGA

Intron 2 GTTGGAGCTC ... TCATCTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	55.34	59.7	5.7	73.9
A2	50.91	37.7	0.7	39
A3	58.19	33	6	45.9
A4	52.94	45	4	50.7
A5	56.63	36	11	47
A6	50.82	25	7	25.8
A7	45.88	56.4	12.7	47.8
A8	57.56	19.9	4	27
A9	50.14	46.5	13.6	46.7
A10	53.36	57.7	8.7	66

>TRINITY_DN125515_c3_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

TGTCATACCATACCAACACCTGTATGCATCGAACAGAAAAGGACCCAAATTAAAAATTTAAATGCCCTGTGACGCGGATAACCGAGCGATTTCAGATGCAGCTGCCACGATTGTCCAAATTATCTTCGTACAAAGAGACGAGGGATTAATTGGGCCCTCTTCCCAATCGCGCAGCAGACCCGCCTCTGTAAGAAAATATG
CATCGGTTTGTTGGCACCCGAGTCTTAAGCGGACATGCGAAACGCATGTTTATCAGAGATTGCAGAGGCCATGCTTTCAGCAACAGGGCTTCTCATTCACTTGCTTTTCGCACTTTGGATGCTGAAGAAGTATCAGGTTCACAGAGCACAGAAGTTCTCAATTTAGTGCAGGGAGAATGGAAAGGTACCTCGAGGTGGAG
TGAGATTGTAGACCCTTTGAATGGACAGAAATTCATTGCGATACCGGATCCTTCTGCAGATGAGATCAAACCATTTGTTGAGAGCTTGCACTCATGCCCCAAGTCTGGCTTGCATAACCCATTAAAAAATCCCGAGAGATATGTTATGTATGGAGATATTTCTGCAAGGGCTGCTGCTGTATTGAAACAACCTGAGGTGT
CACACTTTTTTGCAAAATTGATACAACGTGTGTCCCCGAAGAGTTTTGCTCAGGCTCTTGGTGAGGTCAATGTTACACAAACGTTTTTGGAGAACTTTTCTGGTGACCAGGTTCGCTTTTTGGCTCGATCATTTGCAGTACCAGGAAATCATCTTGGACAGCAAAGCAGTGGCTTTCGATGGCCCTATGGTTCTGTGGCA
ATCATAACACCATTCAATTTTCCGTTGGAGATACCTCTCCTCCAGCTTATGGGTGCCCTCTATATGGGCAACAAGCCACTCTTAAAAGTTGATAGCAAGGTCAGCATAGTAATGGAGCAAATGTTAAGGCTTCTTCATCAGTGTGCAATGCCTCTTGGAGATGTAGATTTTGTCAACTGTGATGGTAGCACTATGAATAA
AATTTTGCTAGAGGGAGATCCACGCATGACCCTTTTCACAGGAAGTTCAAGGGTTGCCGAGAAACTTGCAGTTGATCTGAAAGGGCGAGTGAAATTAGAAGATGCAGGGTTTGATTGGAAAATTCTTGGCCCTGATGTTCAGGAGGTTGATTATGTTGCATGGGTTTGCGACCAGGATGCTTATGCATGTAGTGGACAAA
AATGCTCTGGACAATCAATATTGTTTGTGCACGAGAATTGGAACTCTACCAATCTTGTATCCAAGTTGAAAGCTCTTGCTGAGAGAAGGAAATTAGAAGATTTAACAGTCGGCCCCGTTCTTACTGTGACAACAAAATGCATGCTAGCACATGTGAAAAGGCTACTTGAGATTCCAGGAGCAAAATTGCTGTTTGGTGGA
GAGCCTTTGGAGAACCATAGTATCCCAGAAATATATGGTGCTGTGAAGCCGACAGCCATTTTTGTACCACTTGATGAAATATTGAAAGACACAAATTTTGATGTGGTGACAACTGAAATTTTTGGCCCCTTCCAGATTATAACCAATTACAGGCATGATCAACTTCCAATGGTCCTGGATGCATGTGAACGAATGCATGC
CCATTTAACAGCAGCGGTTGTTTCAAATGATATCAAGTTTTTACAGGATGTTCTGGGAAGATCAGTAAATGGGACAACATATGCTGGTATCCGTGCACGAACAACAGGAGCTCCTCAGAATCACTGGTTTGGGCCAGCTGGAGATCCAAGAGGAGCAGGCATCGGCACACCAGAAGCAATCAAGTTGGTTTGGTCATGCC
ACAGAGAGATTATTTATGACGTTGGCCCTGTGCCGAATGAGTGGACTCTTCCGGCTTGCACATGATGAATTTTGCTTGATTGCAGATGATTCTTCAGGCTGTAATATTAATTTATGAATGGAAGGATTATTTGAATGTCATGTGCCTACCAGTTTTGACTTTTATTAAAAAATAATTCTGCCTTTTTACTCGTCAGATAC
CTGCTTAACTGGATAGCATTACTTAGTGGTTTGGTGTTCTGGGAACACCAGTGAATTGATGTAACCCTTTTCAAATATGATCTACTAATGCGCTGTTCAAGTAGTGTTAGTGGTTGCACAATTTCTCCTTTGTATGGTATAAATTGTCTTGTTTCTGTTTTTCTAAAAGCTAGTACACAAAGAACTTGAGGTAGATATAG
CACACTTATGTATAAATAGAGTGGAATATGCTTTTCAAAACAGATGATACTTATTGTGTTTG

>TRINITY_DN125515_c3_g1_i29 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TGTCATACCATACCAACACCTGTATGCATCGAACAGAAAAGGACCCAAATTAAAAATTTAAATGCCCTGTGACGCGGATAACCGAGCGATTTCAGATGCAGCTGCCACGATTGTCCAAATTATCTTCGTACAAAGAGACGAGGGATTAATTGGGCCCTCTTCCCAATCGCGCAGgttggagctcagatttgattctgata
gatggcttagtaaatatcataataattaaagtatttccacattattatcatcaacacactatatattggttcgtttcatcttgttctatcacgctgtatatctcatctcatctgcagCAGACCCGCCTCTGTAAGAAAATATGCATCGGTTTGTTGGCACCCGAGTCTTAAGCGGACATGCGAAACGCATGTTTATCAGA
GATTGCAGAGGCCATGCTTTCAGCAACAGGGCTTCTCATTCACTTGCTTTTCGCACTTTGGATGCTGAAGAAGTATCAGGTTCACAGAGCACAGAAGTTCTCAATTTAGTGCAGGGAGAATGGAAAGGTACCTCGAGGTGGAGTGAGATTGTAGACCCTTTGAATGGACAGAAATTCATTGCGATACCGGATCCTTCTGC
AGATGAGATCAAACCATTTGTTGAGAGCTTGCACTCATGCCCCAAGTCTGGCTTGCATAACCCATTAAAAAATCCCGAGAGATATGTTATGTATGGAGATATTTCTGCAAGGGCTGCTGCTGTATTGAAACAACCTGAGGTGTCACACTTTTTTGCAAAATTGATACAACGTGTGTCCCCGAAGAGTTTTGCTCAGGCTC
TTGGTGAGGTCAATGTTACACAAACGTTTTTGGAGAACTTTTCTGGTGACCAGGTATGCTTATTTCTTTGAAGATTCCATATTTTCCTAATTTAATTTGATTGTTATCATTTTATGATTGTTATGTTAGAAATTGCAATTGCCTTGGCGTTTCTTCA

Intron 3 GTTGGAGCTC ... TCTGCAGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	55.8	61	5	77
A2	51.32	37	0	39
A3	57.83	35	6	48
A4	53.06	46	4	52
A5	54.43	36	11	43
A6	53.06	23	6	26
A7	46.53	54	12	47
A8	57.45	20	4	27
A9	52.33	41	11	45
A10	54.62	54	8	65

>TRINITY_DN108429_c1_g2_i6 from sample A3 / Example spliced isoform

TTTCAGATGCAGCTGCCACGATTGTCCAAATTATCTTCGTACAAAGAGACGAGGGATTAATTGGGCCCTCTTCCCAATCGCGCAGACCCGCCTCTGTAAGAAAATATGCATCGGTTTGTTGGCACCCGAGTCTTAAGCGGACATGCGAAACGCATGTTTATCAGAGATTGCAGAGGCCATGCTTTCAGCAACAGGGCTTC
TCATTCACTTGCTTTTCGCACTTTGGATGCTGAAGAAGTATCAGGTTCACAGAGCACAGAAGTTCTCAATTTAGTGCAGGGAGAATGGAAAGGTACCTCGAGGTGGAGTGAGATTGTAGACCCTTTGAATGGACAGAAATTCATTGCGATACCGGATCCTTCTGCAGATGAGATCAAACCATTTGTTGAGAGCTTGCACT
CATGCCCCAAGTCTGGCTTGCATAACCCATTAAAAAATCCCGAGAGATATGTTATGTATGGAGATATTTCTGCAAGGGCTGCTGCTGTATTGAAACAACCTGAGGTGTCACACTTTTTTGCAAAATTGATACAACGTGTGTCCCCGAAGAGTTTTGCTCAGGCTCTTGGTGAGGTCAATGTTACACAAACGTTTTTGGAG
AACTTTTCTGGTGACCAGGTTCGCTTTTTGGCTCGATCATTTGCAGTACCAGGAAATCATCTTGGACAGCAAAGCAGTGGCTTTCGATGGCCCTATGGTTCTGTGGCAATCATAACACCATTCAATTTTCCGTTGGAGATACCTCTCCTCCAGCTTATGGGTGCCCTCTATATGGGCAACAAGCCACTCTTAAAAGTTGA
TAGCAAGGTCAGCATAGTAATGGAGCAAATGTTAAGGCTTCTTCATCAGTGTGCAATGCCTCTTGGAGATGTAGATTTTGTCAACTGTGATGGTAGCACTATGAATAAAATTTTGCTAGAGGGAGATCCACGCATGACCCTTTTCACAGGAAGTTCAAGGGTTGCCGAGAAACTTGCAGTTGATCTGAAAGGGCGAGTGA
AATTAGAAGATGCAGGGTTTGATTGGAAAATTCTTGGCCCTGATGTTCAGGAGGTTGATTATGTTGCATGGGTTTGCGACCAGGATGCTTATGCATGTAGTGGACAAAAATGCTCTGGACAATCAATATTGTTTGTGCACGAGAATTGGAACTCTACCAATCTTGTATCCAAGTTGAAAGCTCTTGCTGAGAGAAGGAAA
TTAGAAGATTTAACAGTCGGCCCCGTTCTTACTGTGACAACAAAATGCATGCTAGCACATGTGAAAAGGCTACTTGAGATTCCAGGAGCAAAATTGCTGTTTGGTGGAGAGCCTTTGGAGAACCATAGTATCCCAGAAATATATGGTGCTGTGAAGCCGACAGCCATTTTTGTACCACTTGATGAAATATTGAAAGACAC
AAATTTTGATGTGGTGACAACTGAAATTTTTGGCCCCTTCCAGATTATAACCAATTACAGGCATGATCAACTTCCAATGGTCCTGGATGCATGTGAACGAATGCATGCCCATTTAACAGCAGCGGTTGTTTCAAATGATATCAAGTTTTTACAGGATGTTCTGGGAAGATCAGTAAATGGGACAACATATGCTGGTATCC
GTGCACGAACAACAGGAGCTCCTCAGAATCACTGGTTTGGGCCAGCTGGAGATCCAAGAGGAGCAGGCATCGGCACACCAGAAGCAATCAAGTTGGTTTGGTCATGCCACAGAGAGATTATTTATGACGTTGGCCCTGTGCCGAATGAGTGGACTCTTCCGGCTTGCACATGATGAATTTTGCTTGATTGCAGATGATTC
TTCAGGCTGTAATATTAATTTATGAATGGAAGGATTATTTGAATGTCATGTGCCTACCAGTTTTGACTTTTATTAAAAAATAATTCTGCCTTTTTACTCGTCAGATACCTGCTTAACTGGATAGCATTACTTAGTGGTTTGGTGTTCTGGGAACACCAGTGAATTGATGTAACCCTTTTCAAATATGATCTACTAATGCG
CTGTTCAAGTAGTGTTAGTGGTTGCACAATTTCTCCTTTGTATGGTATAAATTGTCTTGTTTCTGTTTTTCTAAAAGCTAGTACACAAAGAACTTGAGGTAGATATAGCACACTTATGTATAAATAGAGTGGCC

>TRINITY_DN108429_c1_g2_i5 from sample A3 / Example unspliced isoform:

TTTCAGATGCAGCTGCCACGATTGTCCAAATTATCTTCGTACAAAGAGACGAGGGATTAATTGGGCCCTCTTCCCAATCGCGCAGgttggagctcagatttgattctgatagatggcttagtaaatatcataataattaaagtatttccacattattatcatcaacacactatatattggttcgtttcatcttgttctat
cacgctgtatatctcatctcatctgcagcagACCCGCCTCTGTAAGAAAATATGCATCGGTTTGTTGGCACCCGAGTCTTAAGCGGACATGCGAAACGCATGTTTATCAGAGATTGCAGAGGCCATGCTTTCAGCAACAGGGCTTCTCATTCACTTGCTTTTCGCACTTTGGATGCTGAAGAAGTATCAGGTTCACAGAG
CACAGAAGTTCTCAATTTAGTGCAGGGAGAATGGAAAGGTACCTCGAGGTGGAGTGAGATTGTAGACCCTTTGAATGGACAGAAATTCATTGCGATACCGGATCCTTCTGCAGATGAGATCAAACCATTTGTTGAGAGCTTGCACTCATGCCCCAAGTCTGGCTTGCATAACCCATTAAAAAATCCCGAGAGATATGTTA
TGTATGGAGATATTTCTGCAAGGGCTGCTGCTGTATTGAAACAACCTGAGGTGTCACACTTTTTTGCAAAATTGATACAACGTGTGTCCCCGAAGAGTTTTGCTCAGGCTCTTGGTGAGGTCAATGTTACACAAACGTTTTTGGAGAACTTTTCTGGTGACCAGGTTCGCTTTTTGGCTCGATCATTTGCAGTACCAGGA
AATCATCTTGGACAGCAAAGCAGTGGCTTTCGATGGCCCTATGGTTCTGTGAGTTTTCTTTTAATGAAAATGCATGGTAGGGATGTGTTTTTGTCTTTTGGACTATAGTAGGAAAATAAAAACGTAATCCAACAAATGGGACAGTTAATCTAAATTTCAA