sp|P0C031|RUB2_ORYSJ ----> Ubiquitin-NEDD8-like protein RUB2
Intron 1 GTAGGCAGTG ... AATGTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 47.67 | 450 | 410 | 49 |
| A2 | 49.09 | 475 | 458 | 36 |
| A3 | 47.5 | 547 | 495 | 34 |
| A4 | 49.41 | 300 | 293 | 26 |
| A5 | 49.22 | 228 | 221 | 11 |
| A6 | 47.27 | 3079 | 2760 | 47 |
| A7 | 47.68 | 5176 | 4717 | 66 |
| A8 | 47.21 | 4882 | 4366 | 57 |
| A9 | 47.56 | 5269 | 4779 | 53 |
| A10 | 48.08 | 4994 | 4624 | 53 |
>TRINITY_DN121789_c1_g1_i4 from sample A2 / Example spliced isoformGATTCTTCAACTTCTCCCGTGGTAGAACTCTTGGTGCTCTTTAGGGGTCCGATGTAGATTTGGAGGTATAATATCTTTCAAGTTTTGGGCTTCCTTTTGGTATCAAATTCTTTCAAAATTGCCTTTCTGTTTGGGATTCTTCCTTTCTTGGCATATCAAACGTCATCTTCTTCTATCTTTTTATATGGCGGTCCAAGATC
GCTTCTATGTATCTACTCCCTTCTTAGCAAACTACATTTTGAGAGAGGCTGCTGCGTTGGTCTCCACAACTCCCACAACCCTTAAATCCAGGCTGTATTTGCCCCAACTCGGAGAGGCTTTGTGGAGGTTCAGTGACATTTGCAGGCCGAGATGCAGATATTCGTCAAGACTCTCACAGGGAAGACAATAGCCCTTGATG
TTGAAAGCAGCGATACCATTGATAATGTCAAGATCAAAATCCAGGACAAAGAGGGTATTCCACCAGGTCAGCAGCGCTTAATATTTGCTGGAAAACAATTAGAAGATGGGCGTACACTAGCAGATTATAATATTCAGAAGGAATCAACTCTTCACTTGGTGTTGCGGTTAAGGGGAGGTATTTCTATCAAGGTGAAGACC
CTTACCGGAAAAGAAGTCGAGATAGATATTGAACCCAATGATACAATTGAGCGAATTAAGCAGCGAGTTGAGGAAAAGGAAGGAATACCTCCTATACAGCAAAGCACTGAGCTTTTCCAACTCAAATCAATGTTGCATTAGCATCAGCCACAAGGATTTTGTTCAGAGTTCTGTACTTATTTGGGTTTTTAAGTAGCTGG
CTTATCTATGGAGGAAAACAGATGAATGATGAAAAGACAGCCCGTGAATACAATATTGAGGGAGGTTCTGTTCTTCATCTCGTGCTGGCTTTGCGTGGTGGTTGCTAGTGGGATGGCTGGGAAATGTTTTCTGCCACTGCTATGGGTTCTTCATCTCATGAAACTAGAGAAATTTGGAGTCTGGACTCAACATTTTTTAT
ATATTGTTTAGATGCTTAATGTCAATGAATGAGTGAGTGATATTTAATGCCCCATGTTTGTATTTTTACTTTAAGCTTGTATGTTTCTGATTGACGAATTGAAATATACTTTAACCAATAGTCGTTAAGAGTTGGATGAATCTCTCTATCAGTTTTAAGTAAATGATGAAGAATATGGATGTCCGGTTGTCACTAAAATA
ACTCCAAACGGAATATGTGTACAGTCAATGGTCTTATTTTTTTACATTTAGTGTTCTTTTTTTGTTTGGTCTCCACAGTATACCATTCTGAAACTCTTTCGAAGATATAGGTGATATCGAGTGATTGTTTTTTGGAATTGTAATGCTAGGTCTTTGCCTCTGATGGCCTAGAGTGAACTTGATTAATAGTTTGAACTTTT
TTATGGTGCTTCCATAATAATACCCGTCATGATCTCTGATCTAAGTCAAGGATATCTGTCTTATGTAGCAGTACTTTAGGGTTATTTCTAAGAATTTTTTAGACTCTGTT
>TRINITY_DN121789_c1_g1_i5 from sample A2 / Example unspliced isoform:CGAAAATTTGGTTTGTCTTGACGAATTGTTCGGTTTGGTTCGGTTCGCTGTTCCATCTAATTTCAAATTCCGTCCACTTCAATTCTGGTTTGGCATTGGCTTTGTTGGGCAGTTGAAGCTCCCTTGCCTTGCTTGCTTTCTCCCTTGGATAAGGGCTCAATCCCCCTTCCTCTATAATCATATAGTAGAGAGAGGTTTGG
ATCCATCTGACCCTCAGCATACTGTATCATAGCTAGCAGCAGATACAGAGCCATTATTTCACCTAGGAGTAAAGCGAAAGGTGGGGTGCAGCTGCATAAGTAACTATAAACTATCAGGTGCTGAGTTGGACCGGATTTCTCTATTGAAACATGCCACTCTTAGCACTCAACCTGCTGTCTATAACAATAATTACCAATAA
ATCCAAAACACCAATCACTGGAAGGTCATATTGCTATCCACAGACTGAACGAATCCAGTTGAATTACCTGTTCATTAAGATGTTCTGGTCGAGTTTTCTATCTTGGGACCTTGTGGTTATGGGATTGCATTGTGCCACATTGATGGTCCACCACCTCACCTCTGAGGCAAATTACTATCAAACTTCCTTTGTGTACAACT
ACTGTGTAAATGCAGTCCCTTTTTTCATCTTTTACATAGCCTGTTATCAGGCAGGTCCTTTTTTTCTGTTTTAACACAGCCTGTTCTCAGGTGGGTCACGTTCACTGGGGCTTAAACTTGGGTCATCATGTTGCCACAGCCCAGAAGACTCCTAAAATTTGGCAAGTCTTAATGAGAACATAGGGATGGGGATGTACTCA
TCTCCAGGCGACACAAGTTCTATAAGTTCAACCCCTACCTCCAGTGACCTCCCACAATTACCTTTAAGGACATGGAAATAGAACTTTAGGCCAATATTGTGAAATCCCTGTTCCCGAGCTCTTAAGGAGAACATGGGGGTGGGCTTCGGTCATTAATACGTGCACCTGGTATTCATCTCCATGTGTCTTTAGTTTGACGG
TTGACCCCTACCTCCAAGTGTCAGGGAAGCTTGTGGGGATGAAACCCTGGCAGATGCCAGGGAACTTCTTGCTCCCCACTGTTACTCCCAATCCCATCAGGTGTCCAAAATTTGATTATTAGCACTGTATAATACTTGCTGATAGCCTTTTAAATCATTTGCAAATTTTTAAGGGTTTGCATTGCATTTGAGGTTTAAGC
ACCGTTTTTAGTGAGTATTTTGTCTATTTTTTAAAGTACAATTTTAGTTTTTCTATAATTATGCCTGTTATTTTTTGTTGTTATGAAAGGACAAAGAGGGTATTCCACCAGGTCAGCAGCGCTTAATATTTGCTGGAAAACAATTAGAAGATGGGCGTACACTAGCAGATTATAATATTCAGAAGGAATCAACTCTTCAC
TTGGTGTTGCGGTTAAGGGGAGGTATTTCTATCAAGGTGAAGACCCTTACCGGAAAAGAAGTCGAGATAGATATTGAACCCAATGATACAATTGAGCGAATTAAGCAGCGAGTTGAGGAAAAGGAAGGAATACCTCCTATACAGCAAAGgtaggcagtgctcttagacttctgtggaggtatattggtgagcctttttta
atatagtttagttcctttatagtatgatttcattgtgtaagtgattgtgtattttctaagaaacagtaatatatgattttctggttttcataggtgttaacatttagcaactactagttggtcatgtatgaaattgtacaaggttagaccataacgattgaaaatcaatgttgcagCACTGAGCTTTTCCAACTCAAATC
AATGTTGCATTAGCATCAGCCACAAGGATTTTGTTCAGAGTTCTGTACTTATTTGGGTTTTTAAGTAGCTGACTACATAGCAGATTGCCTTCT
Intron 2 GTAGGCAGTG ... AATGTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 47.64 | 450 | 409.5 | 51 |
| A2 | 48.98 | 475 | 456 | 36 |
| A3 | 47.42 | 547 | 493.5 | 39 |
| A4 | 49.36 | 300 | 292.5 | 30 |
| A5 | 49.22 | 228 | 221 | 13 |
| A6 | 47.24 | 3079 | 2756.5 | 58 |
| A7 | 47.64 | 5176 | 4709 | 82 |
| A8 | 47.19 | 4882 | 4361.5 | 85 |
| A9 | 47.53 | 5269 | 4773 | 65 |
| A10 | 48.07 | 4994 | 4622.5 | 55 |
>TRINITY_DN121789_c1_g1_i4 from sample A2 / Example spliced isoformGATTCTTCAACTTCTCCCGTGGTAGAACTCTTGGTGCTCTTTAGGGGTCCGATGTAGATTTGGAGGTATAATATCTTTCAAGTTTTGGGCTTCCTTTTGGTATCAAATTCTTTCAAAATTGCCTTTCTGTTTGGGATTCTTCCTTTCTTGGCATATCAAACGTCATCTTCTTCTATCTTTTTATATGGCGGTCCAAGATC
GCTTCTATGTATCTACTCCCTTCTTAGCAAACTACATTTTGAGAGAGGCTGCTGCGTTGGTCTCCACAACTCCCACAACCCTTAAATCCAGGCTGTATTTGCCCCAACTCGGAGAGGCTTTGTGGAGGTTCAGTGACATTTGCAGGCCGAGATGCAGATATTCGTCAAGACTCTCACAGGGAAGACAATAGCCCTTGATG
TTGAAAGCAGCGATACCATTGATAATGTCAAGATCAAAATCCAGGACAAAGAGGGTATTCCACCAGGTCAGCAGCGCTTAATATTTGCTGGAAAACAATTAGAAGATGGGCGTACACTAGCAGATTATAATATTCAGAAGGAATCAACTCTTCACTTGGTGTTGCGGTTAAGGGGAGGTATTTCTATCAAGGTGAAGACC
CTTACCGGAAAAGAAGTCGAGATAGATATTGAACCCAATGATACAATTGAGCGAATTAAGCAGCGAGTTGAGGAAAAGGAAGGAATACCTCCTATACAGCAAAGCACTGAGCTTTTCCAACTCAAATCAATGTTGCATTAGCATCAGCCACAAGGATTTTGTTCAGAGTTCTGTACTTATTTGGGTTTTTAAGTAGCTGG
CTTATCTATGGAGGAAAACAGATGAATGATGAAAAGACAGCCCGTGAATACAATATTGAGGGAGGTTCTGTTCTTCATCTCGTGCTGGCTTTGCGTGGTGGTTGCTAGTGGGATGGCTGGGAAATGTTTTCTGCCACTGCTATGGGTTCTTCATCTCATGAAACTAGAGAAATTTGGAGTCTGGACTCAACATTTTTTAT
ATATTGTTTAGATGCTTAATGTCAATGAATGAGTGAGTGATATTTAATGCCCCATGTTTGTATTTTTACTTTAAGCTTGTATGTTTCTGATTGACGAATTGAAATATACTTTAACCAATAGTCGTTAAGAGTTGGATGAATCTCTCTATCAGTTTTAAGTAAATGATGAAGAATATGGATGTCCGGTTGTCACTAAAATA
ACTCCAAACGGAATATGTGTACAGTCAATGGTCTTATTTTTTTACATTTAGTGTTCTTTTTTTGTTTGGTCTCCACAGTATACCATTCTGAAACTCTTTCGAAGATATAGGTGATATCGAGTGATTGTTTTTTGGAATTGTAATGCTAGGTCTTTGCCTCTGATGGCCTAGAGTGAACTTGATTAATAGTTTGAACTTTT
TTATGGTGCTTCCATAATAATACCCGTCATGATCTCTGATCTAAGTCAAGGATATCTGTCTTATGTAGCAGTACTTTAGGGTTATTTCTAAGAATTTTTTAGACTCTGTT
>TRINITY_DN121789_c1_g1_i2 from sample A2 / Example unspliced isoform:GGAAATAGAACCTTAGGCCAATATTGTGAAATTCCCTGTTCCCGAGCTCTTAAGGAGAACATGGGGGTGGGCTTCGGTCATTAATACGTGCACCTGGTATTCATCTCCATGTGTCTTTAGTTTGACGGTTGACCCCTACCTCCAAGTGTCAGGGAAGCTTGTGGGGATGAAACCCTGGCAGATGCCAGGGAACTTCTTGC
TCCCCACTGTTACTCCCAATCCCATCAGGTGTCCAAAATTTGATTATTAGCACTGTATAATACTTGCTGATAGCCTTTTAAATCATTTGCAAATTTTTAAGGGTTTGCATTGCATTTGAGGTTTAAGCACCGTTTTTAGTGAGTATTTTGTCTATTTTTTAAAGTACAATTTTAGTTTTTCTATAATTATGCCTGTTATT
TTTTGTTGTTATGAAAGGACAAAGAGGGTATTCCACCAGGTCAGCAGCGCTTAATATTTGCTGGAAAACAATTAGAAGATGGGCGTACACTAGCAGATTATAATATTCAGAAGGAATCAACTCTTCACTTGGTGTTGCGGTTAAGGGGAGGTATTTCTATCAAGGTGAAGACCCTTACCGGAAAAGAAGTCGAGATAGAT
ATTGAACCCAATGATACAATTGAGCGAATTAAGCAGCGAGTTGAGGAAAAGGAAGGAATACCTCCTATACAGCAAAGgtaggcagtgctcttagacttctgtggaggtatattggtgagccttttttaatatagtttagttcctttatagtatgatttcattgtgtaagtgattgtgtatttttctaagaaacagtaata
tatgattttctggttttcataggtgttaacatttagcaactactagttggtcatgtatgaaattgtacaaggttagaccataacgattgaaaatcaatgttgcagCACTGAGCTTTTCCAACTCAAATCAATGTTGCATTAGCATCAGCCACAAGGATTTTGTTCAGAGTTCTGTACTTATTTGGGTTTTTAAGTAGCTG
GTATGTTGCATGTTTCCGTTAGGTAGGGAATATTTTTCAATTTTCTATTGTAGATGAAAGACATGGGAGATATGTGCCATTTTCTGTTCTTATAGTTTTCTTCAGAATAAAAACGTTTGAGGTTTCTGTCCTTATAGTTGTCTCTGGAAGTTTGATAACTTGTGTTTTAACTGCTTCACGAAGACTACATAGCAGATTGC
CTTCTAAGCAGGGAAGCTTTCTGGTATCAAATTGTGAATTTTAAATTTGCTTCTCAACCAGATTCTGCTATATATCTTGCTTATCTATGGAGGAAAACAGATGAATGATGAAAAGACAGCCCGTGAATACAATATTGAGGGAGGTTCTGTTCTTCATCTCGTGCTGGCTTTGCGTGGTGGTTGCTAGTGGGATGGCTGGG
AAATGTTTTCTGCCACTGCTATGGGTTCTTCATCTCATGAAACTAGAGAAATTTGGAGTCTGGACTCAACATTTTTTATATATTGTTTAGATGCTTAATGTCAATGAATGAGTGAGTGATATTTAATGCCCCATGTTTGTATTTTTACTTTAAGCTTGTATGTTTCTGATTGACGAATTGAAATATACTTTAACCAATAG
TCGTTAAGAGTTGGATGAATCTCTCTATCAGTTTTAAGTAAATGATGAAGAATATGGATGTCCGGTTGTCACTAAAATAACTCCAAACGGAATATGTGTACAGTCAATGGTCTTATTTTTTTACATTTAGTGTTCTTTTTTTGTTTGGTCTCCACAGTATACCATTCTGAAACTCTTTCGAAGATATAGGTGATATCGAG
TGATTGTTTTTTGGAATTGTAATGCTAGGTCTTTGCCTCTGATGGCCTAGAGTGAACTTGATTAATAGTTTGAACTTTTTTATGGTGCTTCCATAATAATACCCGTCATGATCTCTGATCTAAGTCAAGGATATCTGTCTTATGTAGCAGTACTTTAGGGTTATTTCTAAGAATTTTTTAGACTCTGTT
Intron 3 GTACTATGAA ... TGTGGTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 43.98 | 170.3 | 110 | 154 |
| A2 | 47.73 | 171.2 | 149.8 | 159 |
| A3 | 49.39 | 145.9 | 118.4 | 164 |
| A4 | 46.94 | 143.9 | 113 | 138 |
| A5 | 47.03 | 73.8 | 64.4 | 65 |
| A6 | 50.07 | 2643.2 | 2164.8 | 3098 |
| A7 | 49.3 | 1790.5 | 1521.4 | 1927.5 |
| A8 | 49.53 | 2244.9 | 1676.1 | 2705 |
| A9 | 49.16 | 2056.3 | 1582.9 | 2364 |
| A10 | 50.63 | 1195.3 | 1029.8 | 1403 |
>TRINITY_DN108126_c0_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformAGCTTCCACATGGTCTGTAATGGTAAACATTCCGTGTCTTGTCGATCTCTTTATTTTGGTGCTAAATATTATTGGATGTATACTCACCGTATATATTATTGGGCACGGCTGAGTTTTGGTGGAGTGCGCCTGCCTGTAGGGTGAGGAAGAAGAGAACAACACAGGGAATGGAGATTGAGGGTGCTAAGAATTTCAAAACT
TGCAAGCGCTGCAAGACTTCATATGATCCATCGTCCAATTCCTCCTCCTGTAGATTCCATCCATCCTTCTTTGTTTCTCGCAGGCACGATGATCAGAAGAGAAGAACAAGAAGCAATAGGTTGTATGACATCATTCCATATTTCATATGATGATGCGTGACATCAATCATGTTCAACTTTAGATTTTATGTTTTGTATGT
AAACAATATTGGTCTCACTCTATTCTAGGCTTTATACACTAGTTTCAATTTTACAATTTAAATTTGTAAATTGCCAAATACTATGATTTGGTTATATACTTGTATTCTCTATTAGGTTAGAGATGATAGATAATAAAGAAATCACGTTTTTCATAAATTTAAGATAACATAATATTATTATAAATCATAACATGGTTTAT
TGTAATTATCTCATCAAAA
>TRINITY_DN108126_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:AGCTTCCACATGGTCTGTAATGGTAAACATTCCGTGTCTTGTCGATCTCTTTATTTTGGTGCTAAATATTATTGGATGTATACTCACCGTATATATTATTGGGCACGGCTGAGTTTTGGTGGAGTGCGCCTGCCTGTAGGGTGAGGAAGAAGAGAACAACACAGGGAATGGAGATTGAGGGTGCTAAGAATTTCAAAACT
TGCAAGCGCTGCAAGACTTCATATGATCCATCGTCCAATTCCTCCTCCTCCTGTAGATTCCATCCATCCTTCTTTGTTTCTCGCAGGCACGATGATCAGAAGAGgtactatgaattgggtcctaatgatcctccatatgctgctaaattctatgattgttgtggtgcagAAGAACAAGAAGCAATAGGTTGTATGACATC
ATTCCATATTTCATATGATGATGCGTGACATCAATCATGTTCAACTTTAGATTTTATGTTTTGTATGTAAACAATATTGGTCTCACTCTATTCTAGGCTTTATACACTAGTTTCAATTTTACAATTTAAATTTGTAAATTGCCAAATACTATGATTTGGTTATATACTTGTATTCTCTATTAGGTTAGAGATGATAGATA
ATAAAGAAATCACGTTTTTCATAAATTTAAGATAACATAATATTATTATAAATCATAACATGGTTTATTGTAATTATCTCATCAAAA
Intron 4 GTATGTTGCA ... CTTCACGAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 83.64 | 9 | 46 | 14 |
| A2 | 68.52 | 17 | 37 | 8.5 |
| A3 | 80 | 9 | 36 | 17.5 |
| A4 | 80.85 | 9 | 38 | 15 |
| A5 | 93.33 | 1 | 14 | 9 |
| A6 | 81.74 | 21 | 94 | 33 |
| A7 | 85.95 | 17 | 104 | 26.5 |
| A8 | 85.17 | 31 | 178 | 47.5 |
| A9 | 86.26 | 18 | 113 | 46.5 |
| A10 | 75.47 | 26 | 80 | 33.5 |
>TRINITY_DN121789_c1_g1_i5 from sample A2 / Example spliced isoformCGAAAATTTGGTTTGTCTTGACGAATTGTTCGGTTTGGTTCGGTTCGCTGTTCCATCTAATTTCAAATTCCGTCCACTTCAATTCTGGTTTGGCATTGGCTTTGTTGGGCAGTTGAAGCTCCCTTGCCTTGCTTGCTTTCTCCCTTGGATAAGGGCTCAATCCCCCTTCCTCTATAATCATATAGTAGAGAGAGGTTTGG
ATCCATCTGACCCTCAGCATACTGTATCATAGCTAGCAGCAGATACAGAGCCATTATTTCACCTAGGAGTAAAGCGAAAGGTGGGGTGCAGCTGCATAAGTAACTATAAACTATCAGGTGCTGAGTTGGACCGGATTTCTCTATTGAAACATGCCACTCTTAGCACTCAACCTGCTGTCTATAACAATAATTACCAATAA
ATCCAAAACACCAATCACTGGAAGGTCATATTGCTATCCACAGACTGAACGAATCCAGTTGAATTACCTGTTCATTAAGATGTTCTGGTCGAGTTTTCTATCTTGGGACCTTGTGGTTATGGGATTGCATTGTGCCACATTGATGGTCCACCACCTCACCTCTGAGGCAAATTACTATCAAACTTCCTTTGTGTACAACT
ACTGTGTAAATGCAGTCCCTTTTTTCATCTTTTACATAGCCTGTTATCAGGCAGGTCCTTTTTTTCTGTTTTAACACAGCCTGTTCTCAGGTGGGTCACGTTCACTGGGGCTTAAACTTGGGTCATCATGTTGCCACAGCCCAGAAGACTCCTAAAATTTGGCAAGTCTTAATGAGAACATAGGGATGGGGATGTACTCA
TCTCCAGGCGACACAAGTTCTATAAGTTCAACCCCTACCTCCAGTGACCTCCCACAATTACCTTTAAGGACATGGAAATAGAACTTTAGGCCAATATTGTGAAATCCCTGTTCCCGAGCTCTTAAGGAGAACATGGGGGTGGGCTTCGGTCATTAATACGTGCACCTGGTATTCATCTCCATGTGTCTTTAGTTTGACGG
TTGACCCCTACCTCCAAGTGTCAGGGAAGCTTGTGGGGATGAAACCCTGGCAGATGCCAGGGAACTTCTTGCTCCCCACTGTTACTCCCAATCCCATCAGGTGTCCAAAATTTGATTATTAGCACTGTATAATACTTGCTGATAGCCTTTTAAATCATTTGCAAATTTTTAAGGGTTTGCATTGCATTTGAGGTTTAAGC
ACCGTTTTTAGTGAGTATTTTGTCTATTTTTTAAAGTACAATTTTAGTTTTTCTATAATTATGCCTGTTATTTTTTGTTGTTATGAAAGGACAAAGAGGGTATTCCACCAGGTCAGCAGCGCTTAATATTTGCTGGAAAACAATTAGAAGATGGGCGTACACTAGCAGATTATAATATTCAGAAGGAATCAACTCTTCAC
TTGGTGTTGCGGTTAAGGGGAGGTATTTCTATCAAGGTGAAGACCCTTACCGGAAAAGAAGTCGAGATAGATATTGAACCCAATGATACAATTGAGCGAATTAAGCAGCGAGTTGAGGAAAAGGAAGGAATACCTCCTATACAGCAAAGGTAGGCAGTGCTCTTAGACTTCTGTGGAGGTATATTGGTGAGCCTTTTTTA
ATATAGTTTAGTTCCTTTATAGTATGATTTCATTGTGTAAGTGATTGTGTATTTTCTAAGAAACAGTAATATATGATTTTCTGGTTTTCATAGGTGTTAACATTTAGCAACTACTAGTTGGTCATGTATGAAATTGTACAAGGTTAGACCATAACGATTGAAAATCAATGTTGCAGCACTGAGCTTTTCCAACTCAAATC
AATGTTGCATTAGCATCAGCCACAAGGATTTTGTTCAGAGTTCTGTACTTATTTGGGTTTTTAAGTAGCTGACTACATAGCAGATTGCCTTCT
>TRINITY_DN121789_c1_g1_i9 from sample A2 / Example unspliced isoform:GATTCTTCAACTTCTCCCGTGGTAGAACTCTTGGTGCTCTTTAGGGGTCCGATGTAGATTTGGAGGTATAATATCTTTCAAGTTTTGGGCTTCCTTTTGGTATCAAATTCTTTCAAAATTGCCTTTCTGTTTGGGATTCTTCCTTTCTTGGCATATCAAACGTCATCTTCTTCTATCTTTTTATATGGCGGTCCAAGATC
GCTTCTATGTATCTACTCCCTTCTTAGCAAACTACATTTTGAGAGAGGCTGCTGCGTTGGTCTCCACAACTCCCACAACCCTTAAATCCAGGCTGTATTTGCCCCAACTCGGAGAGGCTTTGTGGAGGTTCAGTGACATTTGCAGGCCGAGATGCAGATATTCGTCAAGACTCTCACAGGGAAGACAATAGCCCTTGATG
TTGAAAGCAGCGATACCATTGATAATGTCAAGATCAAAATCCAGGACAAAGAGGGTATTCCACCAGGTCAGCAGCGCTTAATATTTGCTGGAAAACAATTAGAAGATGGGCGTACACTAGCAGATTATAATATTCAGAAGGAATCAACTCTTCACTTGGTGTTGCGGTTAAGGGGAGGTATTTCTATCAAGGTGAAGACC
CTTACCGGAAAAGAAGTCGAGATAGATATTGAACCCAATGATACAATTGAGCGAATTAAGCAGCGAGTTGAGGAAAAGGAAGGAATACCTCCTATACAGCAAAGGTAGGCAGTGCTCTTAGACTTCTGTGGAGGTATATTGGTGAGCCTTTTTTAATATAGTTTAGTTCCTTTATAGTATGATTTCATTGTGTAAGTGAT
TGTGTATTTTTCTAAGAAACAGTAATATATGATTTTCTGGTTTTCATAGGTGTTAACATTTAGCAACTACTAGTTGGTCATGTATGAAATTGTACAAGGTTAGACCATAACGATTGAAAATCAATGTTGCAGCACTGAGCTTTTCCAACTCAAATCAATGTTGCATTAGCATCAGCCACAAGGATTTTGTTCAGAGTTCT
GTACTTATTTGGGTTTTTAAGTAGCTGgtatgttgcatgtttccgttaggtagggaatatttttcaattttctattgtagatgaaagacatgggagatatgtgccattttctgttcttatagttttcttcagaataaaaacgtttgaggtttctgtccttatagttgtctctggaagtttgataacttgtgttttaactg
cttcacgaagACTACATAGCAGATTGCCTTCTAAGCAGGGAAGCTTTCTGGTATCAAATTGTGAATTTTAAATTTGCTTGCTACTCAACCAAATTCTGCTATATATCTTGTGAGTTATTATTACTTGAATTCTAAATTTGATCATATTTCTCAAGTTCTAGTGTACAATAATAGAACTTAAAACTTTGTTTTATTGTAAA
CTCATCTATAATGGATGTAATTTTGCATTTTATAAATTCAAAAGAGATTTGCCAGTTCTGCTGTATGGCTGTACTAGAGCTATTTTTAGCTAGTTCTCCTTCTTCTTAACTCTACAAATTCCTTACACTAAAATGCCTTTTGACAAAGGTTTCTGCATTTTCTACACTCTAAAACGAATTTTAAGAATATCAGAATACAC
ATGGCCTCTTGGGCACATTCTAGTAATTACGCCTTGACTAGGTAGATTTATCATAGCTATAGGAAGTATCTATACTTCTATGTTTATGTCAAACAATATGGTTGTTCCCAAGATAATATAAAAGATTAT