NA ----> NA
Intron 1 GTACAATTTA ... TGTGGTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 59.35 | 20.9 | 41 | 20 |
| A2 | 52.41 | 22.3 | 12 | 37 |
| A3 | 47.55 | 30.9 | 30 | 26 |
| A4 | 51.11 | 27.3 | 21 | 36 |
| A5 | 49.01 | 9.9 | 6 | 13 |
| A6 | 49.35 | 179.7 | 138 | 212 |
| A7 | 51.07 | 155.2 | 137 | 187 |
| A8 | 48.08 | 146.9 | 116 | 156 |
| A9 | 52.04 | 132.8 | 134 | 154 |
| A10 | 50.28 | 134.7 | 141 | 131 |
>TRINITY_DN70601_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoformGCAAGAACTAAATTGAAGACCACTGAAGGGACTGTTATCCCCTTATCATCACCTTATGCTTGATCTCCGTTCGTTTTTAATTTCATTTGAATTGATTCGATTGGAAAACCAGCGGTAGCACATTTCACCTATGGTGGTAGATATTCTCCATGGCATCAAGTCTTTCATGTCCCTTGGCCTTCTTTTCTAATTATACAAAG
CTTTCTTCATCTCGAATCTCTGATCAATTCTGCCCCAAAAACTACACTCAAGCCTCCAAATATTCACAAAATGTATACAAGGAACCAGAAAATCATCCTACAATCAGTGCAATTAACAAGTCTACTGAATCTAAGATCTGGAGCACATTAACTTGTGTAGAGACTCACAGGATCCTTGGTCTTGGGGTAGGGACTGCCAC
ATTATTTACGCTAGCTTTAGCAGGAGACGCTTTTGCAGTTGTGCTTGAATCCCAATGGGAATCTGCAAAAGCTCTGATTGCACAGGAACCCAAGAATGCTTTGTCTTTACCCACATGGGTCATTCATGTTTCCAGTGTTGTGGAATGGATGGTGGCCATGGCTTTGGTTTGGCAGTATGGGGATAAGCCAGGATGCCAAG
CTTGGAAAGGACTCTCCTGGGGTATGGTACCTCTCCTCGGAGGAGCATTGTGTGCATGTACATGGCATTTCTTCTATAATGCTGAATCACTCGAGATTCTGGTGGCAGTGCAAGCTGCATTGACTCTGGTTGGTAATTTTACAATGTTGGTGGCTGCGTTTCGCATTTATGATTCAACTAAAGGAGGATCTGAGACTCCT
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CCTCGCCATCTCCAAATCTAATAATGTTTTAATTTGCTTCCTTTGAGTGGTTGTGTGAATTCAAATGATAATATTTTGATTTGCTTCCTTTGAATTATTGTCTTAATTCGAATGGATTTATTCCTTCTCAATAATGCAGAGGTGCTTTGTACTTCTCTGCTTTAGCCTCATTCATATTATTTTTACTGGTAAAGAGCCTG
CAAAGATATTTCTTATTCCACGTGGACCCGCT
>TRINITY_DN70601_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:GCAAGAACTAAATTGAAGACCACTGAAGGGACTGTTATCCCCTTATCATCACCTTATGCTTGATCTCCGTTCGTTTTTAATTTCATTTGAATTGATTCGATTGGAAAACCAGCGGTAGCACATTTCACCTATGGTGGTAGATATTCTCCATGGCATCAAGTCTTTCATGTCCCTTGGCCTTCTTTTCTAATTATACAAAG
CTTTCTTCATCTCGAATCTCTGATCAATTCTGCCCCAAAAACTACACTCAAGCCTCCAAATATTCACAAAATGTATACAAGGAACCAGAAAATCATCCTACAATCAGTGCAATTAACAAGTCTACTGAATCTAAGATCTGGAGCACATTAACTTGTGTAGAGACTCACAGGATCCTTGGTCTTGGGGTAGGGACTGCCAC
ATTATTTACGCTAGCTTTAGCAGGAGACGCTTTTGCAGTTGTGCTTGAATCCCAATGGGAATCTGCAAAAGCTCTGATTGCACAGGAACCCAAGAATGCTTTGTCTTTACCCACATGGGTCATTCATGTTTCCAGTGTTGTGGAATGgtacaatttattatcagcttcattcattcatacatataaatttatagccgaaa
ttagtatggatgtagttgtaagaggcagcgcggccttgtgggtattgggataatgtggtgcagGATGGTGGCCATGGCTTTGGTTTGGCAGTATGGGGATAAGCCAGGATGCCAAGCTTGGAAAGGACTCTCCTGGGGTATGGTACCTCTCCTCGGAGGAGCATTGTGTGCATGTACATGGCATTTCTTCTATAATGCTG
AATCACTCGAGATTCTGGTGGCAGTGCAAGCTGCATTGACTCTGGTTGGTAATTTTACAATGTTGGTGGCTGCGTTTCGCATTTATGATTCAACTAAAGGAGGATCTGAGACTCCTTGAATGGCTATATTTTCCATCAAATCACTTATATTTTTGTAGCCTTTTATACAAAAAAATGCAGGAGACTCTAATACCATTGGT
GGAATTATAAATGTAGTAGTCAACAAAGCTCATTCTCTTTGACAATTCATGATAATAATGAAAACCAAGCATCACAACTATTTGACTTTCCTGTTGGATGCTTGTGCATTTCAGTTCCTCGCCATCTCCAAATCTAATAATGTTTTAATTTGCTTCCTTTGAGTGGTTGTGTGAATTCAAATGATAATATTTTGATTTGC
TTCCTTTGAATTATTGTCTTAATTCGAATGGATTTATTCCTTCTCAATAATGCAGAGGTGCTTTGTACTTCTCTGCTTTAGCCTCATTCATATTATTTTTACTGGTAAAGAGCCTGCAAAGATATTTCTTATTCCACGTGGACCCGCT