sp|Q9ZR40|U2A2B_NICPL ----> Splicing factor U2af large subunit B
Intron 1 GTGATTTTAT ... TCTTTTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.69 | 190.3 | 38.1 | 25.9 |
| A2 | 19.43 | 189.3 | 45.6 | 13.6 |
| A3 | 19.89 | 177.7 | 44.1 | 6.4 |
| A4 | 16.63 | 125.1 | 24.9 | 10.1 |
| A5 | 26.67 | 61.7 | 22.4 | 5.4 |
| A6 | 15.62 | 217.1 | 40 | 6.3 |
| A7 | 17.02 | 458.1 | 93.7 | 19.1 |
| A8 | 13.65 | 239.7 | 37.7 | 12.1 |
| A9 | 20.6 | 370 | 95.4 | 4.9 |
| A10 | 15.57 | 454.7 | 83.9 | 20.9 |
>TRINITY_DN117926_c1_g6_i2 from sample A1 / Example spliced isoformCACCGGCAGTTTCAAATCTATTTTGTTTGTTAGTTTTTTCCTGTTTGCTTTGTCAGTAGTCTTTTGTGTTCTAAACAGTGAATAACTTCCTTCAGTATTTTTTTAAGTTTTGAATTAGACACTACAAAATATTCGAAGTCTTCTACATCGTGATGTATGCTGTGGTTATGATTTCTTGCTATTTTGAATTGCATTGCAGC
ATTCCTTGCGTGATTCAGAAAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAGGGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGT
GACAGAGAGAGAAGGCACAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGGTCTGCATAAAGGCTTCTCTTTAAAATTATTGCACTA
TACATTTAATTTAGGGTTAGACTGGCAACAATAATAGTTAAGAGTTTTTCTGAGAAGCTGTTGAATAGAAGTTTAAATTTGAACCATTGCTTCTATTTTATTGTGGAGTATTGGTAAATCATAATGAAGACTCGGTAAAATAACTTGATTTTGTACATTATTTATGGGCAATTCAGTTTAATTGGTAGTTTCATACTGAA
ACTGAAAACAATTGTTTGCTTGTTTGCTTGTTGTGTTCTGGTTGGTTGTTTGTGGTTGTTTTTATTTTTTTGTGATAAGGCAATATGGGGGTACATGTCCCTCTGTGCTACCAATGGGCGTGGCCACTGTAGCTTTTATGTACAACGAGGAATCAATGCACCGGTTTTGATGGATCCTTGTTCGTCTTCAACCGGCAACT
ATTGCCTTTTTGGTAGTTTTACATAAATTTCCTTCAATATTTGTAATAACAAATTAGTTTCTTTTTAGTTAATTCATTTAATAGGGAGGGAAATGAAATAAATAAATTTGATATTATGTTGTGGCTCAAAAAGCTGGTTCAAAACAATAATATTCCCCAGTTGCAAATTTTCAACAACTCATTTAATTATGTCTGACTGA
TGATGTGGAATTGTTTTTTATTTTATTTTATTAAAACATTCAGGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTCCCTTTGGGAATGCACAGGTGATAGTGAAAAATTACATCCTTCCTTGTAACATATACATTTCCTCTTTACAACTTGATCATATAAAGTTGCCAACAGAATCTGC
AGGTTTCTATTTCAAATTTTATTTTATTGTTTAGCTCTAGAGTCTGACTAACAGATGATATACATTGGGACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGTACCCTTCGCTTGCCTTCCCACCCCTGTAAGTTGGTGAACGATAAATGAAACCCATATGAATAACTATTTCTCATATAGTA
GTCTGACACATAATAGTACTATTTGGTCCTTTGTGTTTGTTATATTAATCATTTGATATTTGTAATGATTATGTTCTGTTATTTTCTTGGATTGCTTTTCTGTGTTGATTTGTTGTCTTTTGTTGATTTGCAGCTTTAATACCCAATGTGAAATCCATTTTTGATTAAAAACCAGAAAATATGTAAGAGTTATCTAGCTG
GTCTGTGGCAATGGAAACCAGAACAACTACAAAACTATTGTTTATCTTTGGTCAGCAACAAAAGTCTGCTGTGACTGTCTGTGAAAACCCAGGCTACAGCCTTTCTAACTATACAGAGATAACAAACATAACTGGAAATAAAACCAGTATAACCGGTGATAGAAAGAAACATAGCAGGGAAATATATACTGGGAAGGCTC
ATAATCTGAAATAGGGATAATTGGCACTTCTTGAATCAGAGCAGGAAACTGATTCAGCTGGAACAAAATTCGTTTTTGCTTCTCTCGGCTGTAAGAGTGTCTATCCCAACAGGGTTTTCATATGCCAAAAGAGACTAACAATCTACATGTATTCTGTTTCCCACAAGCGATTGTTCCTGCCATCAGGAACCCATGACCCT
ACCTCCTGCACCGTTTAACCCATGACCCTACCTCCTGCACCATTTCTTCTTCTGCCATGACTTCCTGTTCCTGATGCACTTAGCATAGACCTGAGGCCTGTGGCTGGAGCCACTGCCTTGCCTCCCCTTTCTCCCTTGGCCCC
>TRINITY_DN117926_c1_g6_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:GGAGAATTCACAACTCTTGTTAATGTTAGTCCAGAAAAAAGTTAGATATTGGGTCTGTTGATTGTGTGAGGATTGTCTTTGTCCATATGCTTGTGCTAAAATTCTTTTGTTCATCTGAAGACAATTTTTTGTGTTAATTTCAAGTTGCTGCTTTAGAAAGCTTGATTAACATAAGTGTGATGATAAATTCAGGCACAGAG
ATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGCACAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGgtgattttatcttgttaactgcataatctttcacattgttttgtccgggtttgttctgtcttgcattcacaccgtttcatattactgttgtagc
ttctaactttggttgaaagagatttcaatattttacatattcatattttatatatctcacttttttttcaggatacattaagtgcatatgtaaaatatcgattatattttgtttgcaagacttctgcgctgttaaatatagttttctgtattaagtgcatatgtaaaatatctattgtattttgtttgcaagacttctgc
gctgttaaatttagttttctgtatgtgattgaatgcttacctctctgcttcttttacagCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGGTCTGCATAAAGGCTTCTCTTTAAAATTATTGCACTATACATTTAATTTAGGGTTAGACTGGCAACAATAATA
GTTAAGAGTTTTTCTGAGAAGCTGTTGAATAGAAGTTTAAATTTGAACCATTGCTTCTATTTTATTGTGGAGTATTGGTAAATCATAATGAAGACTCGGTAAAATAACTTGATTTTGTACATTATTTATGGGCAATTCAGTTTAATTGGTAGTTTCATACTGAAACTGAAAACAATTGTTTGCTTGTTTGCTTGTTGTGT
TCTGGTTGGTTGTTTGTGGTTGTTTTTATTTTTTTGTGATAAGGCAATATGGGGGTACATGTCCCTCTGTGCTACCAATGGGCGTGGCCACTGTAGCTTTTATGTACAACGAGGAATCAATGCACCGGTTTTGATGGATCCTTGTTCGTCTTCAACCGGCAACTATTGCCTTTTTGGTAGTTTTACATAAATTTCCTTCA
ATATTTGTAATAACAAATTAGTTTCTTTTTAGTTAATTCATTTAATAGGGAGGGAAATGAAATAAATAAATTTGATATTATGTTGTGGCTCAAAAAGCTGGTTCAAAACAATAATATTCCCCAGTTGCAAATTTTCAACAACTCATTTAATTATGTCTGACTGATGATGTGGAATTGTTTTTTATTTTATTTTATTAAAA
CATTCAGGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTCCCTTTGGGAATGCACAGGTGATAGTGAAAAATTACATCCTTCCTTGTAACATATACATTTCCTCTTTACAACTTGATCATATAAAGTTGCCAACAGAATCTGCAGGTTTCTATTTCAAATTTTATTTTATTGTTTAGCT
CTAGAGTCTGACTAACAGATGATATACATTGGGACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGTACCCTTCGCTTGCCTTCCCACCCCTGTAAGTTGGTGAACGATAAATGAAACCCATATGAATAACTATTTCTCATATAGTAGTCTGACACATAATAGTACTATTTGGTCCTTTGTGT
TTGTTATATTAATCATTTGATATTTGTAATGATTATGTTCTGTTATTTTCTTGGATTGCTTTTCTGTGTTGATTTGTTGTCTTTTGTTGATTTGCAGCTTTAATACCCAATGTGAAATCCATTTTTGATTAAAAACCAGAAAATATGTAAGAGTTATCTAGCTGGTCTGTGGCAATGGAAACCAGAACAACTACAAAACT
ATTGTTTATCTTTGGTCAGCAACAAAAGTCTGCTGTGACTGTCTGTGAAAACCCAGGCTACAGCCTTTCTAACTATACAGAGATAACAAACATAACTGGAAATAAAACCAGTATAACCGGTGATAGAAAGAAACATAGCAGGGAAATATATACTGGGAAGGCTCATAATCTGAAATAGGGATAATTGGCACTTCTTGAAT
CAGAGCAGGAAACTGATTCAGCTGGAACAAAATTCGTTTTTGCTTCTCTCGGCTGTAAGAGTGTCTATCCCAACAGGGTTTTCATATGCCAAAAGAGACTAACAATCTACATGTATTCTGTTTCCCACAAGCGATTGTTCCTGCCATCAGGAACCCATGACCCTACCTCCTGCACCGTTTAACCCATGACCCTACCTCCT
GCACCATTTCTTCTTCTGCCATGACTTCCTGTTCCTGATGCACTTAGCATAGACCTGAGGCCTGTGGCTGGAGCCACTGCCTTGCCTCCCCTTTCTCCCTTGGCCCC
Intron 2 GTCTGCATAA ... TTGTGATAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 51.71 | 78 | 90 | 48 |
| A2 | 50.69 | 71 | 79.3 | 17 |
| A3 | 46.45 | 53 | 53.8 | 34 |
| A4 | 48.31 | 50 | 50.3 | 35 |
| A5 | 59.97 | 18 | 29 | 15 |
| A6 | 40.49 | 106 | 86.3 | 16 |
| A7 | 43.06 | 188 | 167.3 | 40 |
| A8 | 44.59 | 103 | 95.3 | 32 |
| A9 | 35.93 | 157 | 107 | 22 |
| A10 | 45.21 | 164 | 156.8 | 26 |
>TRINITY_DN110878_c0_g1_i8 from sample A2 / Example spliced isoformTATAAATTCTCCTATCTCCTATAACCTTTCCTAGCATATGACCGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCGGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTT
CATGGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTCTATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGA
TAAAATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGATCTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTC
AGAAAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAGGGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGC
ACAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGGCAATATGGGGGTACATGTCCCTCTGTGCTACCAATGGGCGTGGCCACTGTAG
CTTTTATGTACAACGAGGAATCAATGCACCGGTTTTGATGGATCCTTGTTCGTCTTCAACCGGCAACTATTGCCTTTTTGGTAGTTTTACATAAATTTCCTTCAATATTTGTAATAACAAATTAGTTTCTTTTTAGTTAATTCATTTAATAGGGAGGGAAATGAAATAAATAAATTTGATATTTTGTTGTGGCTCAAAAA
GCTGGTTCAAAACAATAATATTCCCCAGTTGCAAATTTTCAACAACTCATTTAATTATGTCTGACTGATGATGTGGAATTGTTTTTTATTTTATTTTATTAAAACATTCAGGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTCCCTTTGGGAATGCACAGGTGATAGTGAAAAATTAC
ATCCTTCCTTGTAACATATACATTTCCTCTTTACAACTTGATCATATAAAGTTGCCAACAGAATCTGCAGGTTTCTATTTCAAATTTTATTTTATTGTTTAGCTCTAGAGTCTGACTAACAGATGATATACATTGGGACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGTACCCTTCGCTTG
CCTTCCCACCCCTGTAAGTTGGTGAACGATAAATGAAACCCATATGAATAACTATTTCTCATATAGTAGTCTGACACATAATAGTACTATCTGGTCCTTTGTGTTTGTTATATTAATCATTTGATATTTGTAATGATTATGTTCTGTTATTTTCTTGGATTGCTTTTCTGTGTTGATTTGTTGTCTTTTGTTGATTTGCA
GCTTTAATACCCAATGTGAAATCCATTTTTGATTAAAAACCAGAAAATATGTAAGAGTTATCTAGCTGGTCTGTGGCAATGGAAACCAGAACAACTACAAAACTATTGTTTATCTTTGGTCAGCAACAAAAGTCTGCTGTGACTGTCTGTGAAAACCCAGGCTACAGCCTTTCTAACTATACAGAGATAACAAACATAAC
TGGAAATAAAACCAGTATAACCGGTGATAGAAAGAAACATAGCAGGGAAATATATACTGGGAAGGCTCATAATCTGAAATAGGGATAATTGGCACTTCTTGAATCAGAGCAGGAAACTGATTCAGCTGGAACAAAATTCGTTTTTGCTTCTCTCGGCTGTAAGAGTGTCTATCCCAACAGGGTTTTCATATGCCAAAAGA
GACTAACAATCTACATGTATTCTGTTTCCCACAAGCGATTGTTCCTGCCATCAGGAACCCATGACCCTACCTCCTGCACCGTTTAACCCATGACCCTACCTCCTGCACCGTTTAACCCATGACCCTACCTCCTGCACCATTTCTTCTTCTGCCATGACTTCCTGTTCCTGATGCACTTAGCATAGACCTGAGGCCTGTGG
CTGGAGCCACTGCCTTGCCTCCCCTTTCTCCCTTGGCCCCTTCCTGCCATACCTTCGCTGCACTAGCCTTTTCCCAACCGGTTCTGCTTTTCAGTTGGCTGAATTATCGGATGGAGGAATTTATTCCAATCTATTTGCACTGTGTTCAATCCCCACACCAGAACACCCAACAACAGTGGAAATGGTGCCACTACCCTCAG
AGAGCTTTTGCTGCTTACCAAAAACCGAATGTCCTAAAACCAATTGAGACTGCCAACCTATCGAAACATCATGGAAATGCTTACTGGTCTGCATCAGCCAATCTCCATCATTTGCATTCTGCAGCGTATCACCCTTGTTCTTATTTTAGAAATGATGATTTACTCATCAGCCTCTAATCTCATTACTGTCTGTTTGTTTA
ATATATCAAAGCCCTGGACCATATGTGTTTTAAGGAATAGAATATAGCTAGAATTCAATGAGGAAAAGATGGAAATAAGTCTGAAGACTTAGCACTGCTGCAAAACTTCATAAATATAAAACACTTCAATAACGAAAAAGCACCATTGTAAAGGAATGACTCACTATATAAAAAATGTTGTGGAAATATATGCAGCCTCA
GTTGTTGCTGAGTGGCCACCATCCAAGGTTTGCTAGTCTTACTTGCAAGGAGTAGAATAAGCTCATGGCCTTTGTGGCATGTAAAAGTAATTTTTCTGTCTTAAAATTATTATAATTTTATTTCATAAAACAAAAGCACATTTTACAAATGCTACCAGCATAGATCCATCTTAAAGAGGATCTACCAAGATCCTAGAGGG
ATCAAATCTCTCGAAGTGCAAACCCCTTTTTTGAATGCAAGTGTTGAGGAAGCATTTTAATTTATCTAATTTGTGTAGCTTTATATATATGCCGTTGTAAATGTTTTAAATAGCCAACATGTTATTTTTTATAATATTTTATTAATTTTTAAAAAGGACATGTGTCATCTAGGATAAGCACGGAAGGAGTTACACATCCC
CCCCTACTGGGCTGTAGATTGCGCCTCTTCAGCGCAATAACCTCCTGAGGGATGAAACTGCATCTAAGAGCATGAACAGCACATACTAAATCCTTCAGGTCTGACCAATAGCAATAAGCCATATGAACCAGAATTAACAGAAAGAAGGGTGGACGAATTCAGAAGATTGTCCATGGTCATCTTCTTGGATGATCCATTGT
CTACTATCTAAATGTAAACCTTCCTTAGATAATTCATCAGTAACCATGTTCATTTCCCTGTACATATGCTGAAAATAATTTCTGTTGAAAACAGGAATGATGCCCTTGATTTCATTAAGTACATTCCTCCTTCATCCATTTTATCATAAGCAGATAATCCTCAAAGATTTATCTGCTTATGATGCTAGAGTGGATCATAT
ATAAAGTCATCTGTGCTGCAAATTTGTCTGAACCCTGTTCTAAATCCCACTTTAAATTTCAGATTGTGTATTCTTCAGGAAAAGTATTCCCCAGCTCCCAGTATTGTGGGTCTCCCTGAGAAGCTTTATCAAATTAGGCCCAAGTATTGGAAGACTTGGTATTTTGAATTTTCCAAGGCTATTTGTATAGCAGGCTTTAG
AATACTAATCCCTTGGGATGCACAATGTAGAGGGGGTATAAAATTTATCATCAAAAAGACTAGCATTTCTTGCTAGCTAAATGCTCCATGCTAAAATCATAGGGCATAATCAGTAATGCTCTCTATCCCCCTCTAGACCTCCCTAAAGTAAGCACAGGGCATAATAAGACGAGTGTTTATTTCTTCATTATCTTTACATA
AAGAACCTTCCAGGTCCATAGGTCCATATTTGTTTCTTTTTAGAATCCCAAGTAAGAGCTTGTTATTGAGTAACAACCACATAAAAAAG
>TRINITY_DN110878_c0_g1_i23 from sample A2 / Example unspliced isoform:TATAAATTCTCCTATCTCCTATAACCTTTCCTAGCATATGACCGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCGGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTT
CATGGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTCTATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGA
TAAAATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGATCTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTC
AGAAAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAGGGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGC
ACAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGgtctgcataaaggcttctctttaaaattattgcactatacatttaatttaggg
ttagactggcaacaataatagttaagagtttttctgagaagctgttgaatagaagtttaaatttgaaccattgcttctattttattgtggagtattggtaaatcataatgaagactcggtaaaataacttgattttgtacattatttatgggcaattcagtttaattggtagtttcatactgaaactgaaaacaattgtt
tgcttgtttgcttgttgtgttctggttggttgtttgtggttgtttttatttttttgtgataagGCAATATGGGGGTACATGTCCCTCTGTGCTACCAATGGGCGTGGCCACTGTAGCTTTTATGTACAACGAGGAATCAATGCACCGGTTTTGATGGATCCTTGTTCGTCTTCAACCGGCAACTATTGCCTTTTTGGTAG
TTTTACATAAATTTCCTTCAATATTTGTAATAACAAATTAGTTTCTTTTTAGTTAATTCATTTAATAGGGAGGGAAATGAAATAAATAAATTTGATATTTTGTTGTGGCTCAAAAAGCTGGTTCAAAACAATAATATTCCCCAGTTGCAAATTTTCAACAACTCATTTAATTATGTCTGACTGATGATGTGGAATTGTTT
TTTATTTTATTTTATTAAAACATTCAGGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTCCCTTTGGGAATGCACAGGTGATAGTGAAAAATTACATCCTTCCTTGTAACATATACATTTCCTCTTTACAACTTGATCATATAAAGTTGCCAACAGAATCTGCAGGTTTCTATTTCAAA
TTTTATTTTATTGTTTAGCTCTAGAGTCTGACTAACAGATGATATACATTGGGACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGCTACACGTCATGCACGGCGTGTATATGTCGGTGGTCTTCCTCCAATGGCTAATGAGCAGACAATTGCGACATATTTTAGTCGTGTTATGGCTGCTAT
AGGAGGAAATACTGCTGGGCCAGGTGATGCTGTTGTTAATGTCTATATTAATCATGAAAAGAAGTTTGCATTTGTGGAGATGCGCACGGTTGAAGAGGCCAGCAATGCAATGGCTCTTGATGGTATCATGTTTGAGGGGGTTTCTGTGAGAGTAAGGAGACCAAGTGATTACAATCCGTCATTGGCAGCAGCACTTGGCC
CAAGCCAGCCCAGTCCCCACCTTAATTTAGCTGCTGTTGGTCTCACACCAGGTGCTGTTGGAGGAGCCGAGGGACCTGATCGAATATTTGTTGGTGGCTTACCATATTACTTCACAGAAGCACAGATAAGAGAACTGCTTGAATCCTTTGGGCCTCTTCGTGGATTTGATCTTGTTAAAGATAGAGATACAGGTAATTCG
AAGGGCTATGGCTTTTGCGTTTATCAGGATCCAGCTGTGACAGATATTGCATGTGCTGCCCTTAATGGGCTTAAAATGGGGGATAAGACTTTGACTGTACGTCGAGCTACTGCCAGTGGTCAGCCAAAACCAGACCAGGAGAATGTCTTAGCACAAGCCCAACAACATATAGCATTACAGAAGCTTGCACTGCAAGTTGG
ATCTGGTGTAACTGGTTTGTTTACTAGTGTTCTTGGCCCAACAGAAACAGCTACAAAAGTTGTTTCCTTGACACAGGTTGTGTCACCAGATGAGCTGAGAGATGATGAAGAGTACGAAGAAATACTAGAAGACATGAGAGAAGAATGTGGAAAATATGGATCAATAGTAAATCTTGTTATTCCACGTCCTGATCCAAGTG
GAGAATTACGTCCTGGGGTTGGAAAGGTGTTTGTGGAATTTTCAGATACTGATAGTTCAGGCAAGGCAAAAGCTGCACTACATGGAAGGAAGTTCGGTGGAAATACTGTTGTTGCAGTATATTACCCGGAAGACAAATTCTCTTTGGGTGAATATGATTGAAGAGAAGGAAACACTCATATTTGTTGGATATTAATTAAT
TTAACAGCACATTTTCGGCCTGTTACCCTTCTTTCTGTATATTATGGATTTGCTTAATGATGATGAGATGATTAAGAGCAGTTTTGTATATTAACGCTTTCATGTTTGACAGAATATTTTATGCTTCACTTATTGCATGCC
Intron 3 GTGAGGCTTT ... TATGCTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 15.15 | 294 | 44 | 61 |
| A2 | 13.5 | 237 | 30 | 44 |
| A3 | 13.6 | 286 | 39 | 51 |
| A4 | 11.44 | 240 | 25 | 37 |
| A5 | 14.45 | 74 | 8 | 17 |
| A6 | 15.46 | 845 | 124 | 185 |
| A7 | 16.74 | 1189 | 168 | 310 |
| A8 | 16.43 | 1179.7 | 171 | 293 |
| A9 | 15.25 | 1025 | 129 | 240 |
| A10 | 15.13 | 822 | 126 | 167 |
>TRINITY_DN44606_c0_g2_i1 from sample A8 / Example spliced isoformAAATTCTCCTATCTCCTATAACCTTTCCTAGCATATGACCGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCGGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTTCAT
GGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTCTATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGATAA
AATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGATCTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTCAGA
AAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAGGGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGCACA
GGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGGTCTGCATAAAGGCTTCTCTTTAAAATTATTGCACTATACATTTAATTTAGGGTTA
GACTGGCAACAATAATAGTTAAGAGTTTTTCTGAGAAGCTGTTGAATAGAAGTTTAAATTTGAACCATTGCTTCTATTTTATTGTGGAGTATTGGTAAATCATAATGAAGACTCGGTAAAATAACTTGATTTTGTACATTATTTATGGGCAATTCAGTTTAATTGGTAGTTTCATACTGAAACTGAAAACAATTGTTTGC
TTGTTTGCTTGTTGTGTTCTGGTTGGTTGTTTGTGGTTGTTTTTATTTTTTTGTGATAAGGCAATATGGGGGTACATGTCCCTCTGTGCTACCAATGGGCGTGGCCACTGTAGCTTTTATGTACAACGAGGAATCAATGCACCGGTTTTGATGGATCCTTGTTCGTCTTCAACCGGCAACTATTGCCTTTTTGGTAGTTT
TACATAAATTTCCTTCAATATTTGTAATAACAAATTAGTTTCTTTTTAGTTAATTCATTTAATAGGGAGGGAAATGAAATAAATAAATTTGATATTTTGTTGTGGCTCAAAAAGCTGGTTCAAAACAATAATATTCCCCAGTTGCAAATTTTCAACAACTCATTTAATTATGTCTGACTGATGATGTGGAATTGTTTTTT
ATTTTATTTTATTAAAACATTCAGGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTCCCTTTGGGAATGCACAGGTGATAGTGAAAAATTACATCCTTCCTTGTAACATATACATTTCCTCTTTACAACTTGATCATATAAAGTTGCCAACAGAATCTGCAGGTTTCTATTTCAAATTT
TATTTTATTGTTTAGCTCTAGAGTCTGACTAACAGATGATATACATTGGGACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGCTACACGTCATGCACGGCGTGTATATGTCGGTGGTCTTCCTCCAATGGCTAATGAGCAGACAATTGCGACATATTTTAGTCGTGTTATGGCTGCTATAGG
AGGAAATACTGCTGGGCCAGGTGATGCTGTTGTTAATGTCTATATTAATCATGAAAAGAAGTTTGCATTTGTGGAGATGCGCACGGTTGAAGAGGCCAGCAATGCAATGGCTCTTGATGGTATCATGTTTGAGGGGGTTTCTGTGAGAGTAAGGAGACCAAGTGATTACAATCCGTCATTGGCAGCAGCACTTGGCCCAA
GCCAGCCCAGTCCCCACCTTAATTTAGCTGCTGTTGGTCTCACACCAGGTGCTGTTGGAGGAGCCGAGGGACCTGATCGAATATTTGTTGGTGGCTTACCATATTACTTCACAGAAGCACAGATAAGAGAACTGCTTGAATCCTTTGGGCCTCTTCGTGGATTTGATCTTGTTAAAGATAGAGATACAGGTAATTCGAAG
GGCTATGGCTTTTGCGTTTATCAGGATCCAGCTGTGACAGATATTGCATGTGCTGCCCTTAATGGGCTTAAAATGGGGGATAAGACTTTGACTGTACGTCGAGCTACTGCCAGTGGTCAGCCAAAACCAGACCAGGAGAATGTCTTAGCACAAGCCCAACAACATATAGCATTACAGAAGCTTGCACTGCAAGTTGGATC
TGGTGTAACTGGTTTGTTTACTAGTGTTCTTGGCCCAACAGAAACAGCTACAAAAGTTGTTTCCTTGACACAGGTTGTGTCACCAGATGAGCTGAGAGATGATGAAGAGTACGAAGAAATACTAGAAGACATGAGAGAAGAATGTGGAAAATATGGA
>TRINITY_DN44606_c0_g2_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:AAATTCTCCTATCTCCTATAACCTTTCCTAGCATATGACCGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCGGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTTCAT
GGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTCTATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGATAA
AATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGATCTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTCAGA
AAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAGGGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGCACA
GGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGGTCTGCATAAAGGCTTCTCTTTAAAATTATTGCACTATACATTTAATTTAGGGTTA
GACTGGCAACAATAATAGTTAAGAGTTTTTCTGAGAAGCTGTTGAATAGAAGTTTAAATTTGAACCATTGCTTCTATTTTATTGTGGAGTATTGGTAAATCATAATGAAGACTCGGTAAAATAACTTGATTTTGTACATTATTTATGGGCAATTCAGTTTAATTGGTAGTTTCATACTGAAACTGAAAACAATTGTTTGC
TTGTTTGCTTGTTGTGTTCTGGTTGGTTGTTTGTGGTTGTTTTTATTTTTTTGTGATAAGGCAATATGGGGGTACATGTCCCTCTGTGCTACCAATGGGCGTGGCCACTGTAGCTTTTATGTACAACGAGGAATCAATGCACCGGTTTTGATGGATCCTTGTTCGTCTTCAACCGGCAACTATTGCCTTTTTGGTAGTTT
TACATAAATTTCCTTCAATATTTGTAATAACAAATTAGTTTCTTTTTAGTTAATTCATTTAATAGGGAGGGAAATGAAATAAATAAATTTGATATTTTGTTGTGGCTCAAAAAGCTGGTTCAAAACAATAATATTCCCCAGTTGCAAATTTTCAACAACTCATTTAATTATGTCTGACTGATGATGTGGAATTGTTTTTT
ATTTTATTTTATTAAAACATTCAGGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTCCCTTTGGGAATGCACAGGTGATAGTGAAAAATTACATCCTTCCTTGTAACATATACATTTCCTCTTTACAACTTGATCATATAAAGTTGCCAACAGAATCTGCAGGTTTCTATTTCAAATTT
TATTTTATTGTTTAGCTCTAGAGTCTGACTAACAGATGATATACATTGGGACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGCTACACGTCATGCACGGCGTGTATATGTCGGTGGTCTTCCTCCAATGGCTAATGAGCAGACAATTGCGACATATTTTAGTCGTGTTATGGCTGCTATAGG
AGGAAATACTGCTGGGCCAGGTGATGCTGTTGTTAATGTCTATATTAATCATGAAAAGAAGTTTGCATTTGTGGAGATGCGCACGGTTGAAGAGGCCAGCAATGCAATGGCTCTTGATGGTATCATGTTTGAGGGGGTTTCTGTGAGAGTAAGGAGACCAAGTGATTACAATCCGTCATTGGCAGCAGCACTTGGCCCAA
GCCAGCCCAGTCCCCACCTTAATTTAGCTGCTGTTGGTCTCACACCAGGCCATGGCAGCAGTGCTGTTGGAGGAGCCGAGGGACCTGATCGAATATTTGTTGGTGGCTTACCATATTACTTCACAGAAGCACAGATAAGAGAACTGCTTGAATCCTTTGGGCCTCTTCGTGGATTTGATCTTGTTAAAGATAGAGATACA
GGTAATTCGAAGGGCTATGGCTTTTGCGTTTATCAGGATCCAGCTGTGACAGATATTGCATGTGCTGCCCTTAATGGGCTTAAAATGGGGGATAAGACTTTGACTGTACGTCGAGCTACTGCCAGCAGTGGTCAGCCAAAACCAGACCAGGAGAATGTCTTAGCACAAGCCCAACAACATATAGCATTACAGgtgaggct
tttgcagttatcacaagttctcttaatttaaaagtaattggtgttttttcaactttgttcttgtttcttgtttgtgtgatatatcattttctatgctgcagAAGCTTGCACTGCAAGTTGGATCTGGTGTAACTGGTTTGTTTACTAGTGTTCTTGGCCCAACAGAAACAGCTACAAAAGTTGTTTCCTTGACACAGGTT
GTGTCACCAGATGAGCTGAGAGATGATGAAGAGTACGAAGAAATACTAGAAGACATGAGAGAAGAATGTGGAAAATATGGA
Intron 4 GTGATAGTGA ... ATTGGGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 17.84 | 173.6 | 34.9 | 36.2 |
| A2 | 21.42 | 90.6 | 26.9 | 18.9 |
| A3 | 14.43 | 167.6 | 21 | 30.6 |
| A4 | 15 | 152.4 | 33.8 | 17.7 |
| A5 | 25.06 | 57.3 | 23.9 | 11.3 |
| A6 | 8.86 | 189.5 | 7 | 23.9 |
| A7 | 10.16 | 356 | 22.9 | 46.9 |
| A8 | 13.5 | 229.6 | 28.9 | 33.8 |
| A9 | 6.48 | 293.7 | 8 | 26.9 |
| A10 | 9.16 | 358.5 | 12.9 | 51.6 |
>TRINITY_DN117926_c1_g6_i5 from sample A1 / Example spliced isoformATAAATTCTCCTATCTCCTATAACCTTTCCTAGCATATGACCGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCGGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTTC
ATGGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTCTATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGAT
AAAATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGATCTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTCA
GAAAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAGGGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGCA
CAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTC
CCTTTGGGAATGCACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGCTACACGTCATGCACGGCGTGTATATGTCGGTGGTCTTCCTCCAATGGCTAATGAGCAGACAATTGCGACATATTTTAGTCGTGTTATGGCTGCTATAGGAGGAAATACTGCTGGGCCAGGTGATGCTGTTGTTAAT
GTCTATATTAATCATGAAAAGAAGTTTGCATTTGTGG
>TRINITY_DN117926_c1_g6_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATAAATTCTCCTATCTCCTATAACCTTTCCTAGCATATGACCGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCGGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTTC
ATGGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTCTATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGAT
AAAATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGATCTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTCA
GAAAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAGGGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGCA
CAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGGTGATTTTATCTTGTTAACTGCATAATCTTTCACATTGTTTTGTCCGGGTTTGTTCTGTCTTGCATTCACACCGTTTCATATTACTGTTGTAGCTTCTAACTTTGGTTGAAAGAGATTTCAA
TATTTTACATATTCATATTTTATATATCTCACTTTTTTTTCAGGATACATTAAGTGCATATGTAAAATATCGATTATATTTTGTTTGCAAGACTTCTGCGCTGTTAAATATAGTTTTCTGTATTAAGTGCATATGTAAAATATCTATTGTATTTTGTTTGCAAGACTTCTGCGCTGTTAAATTTAGTTTTCTGTATGTGA
TTGAATGCTTACCTCTCTGCTTCTTTTACAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGGTCTGCATAAAGGCTTCTCTTTAAAATTATTGCACTATACATTTAATTTAGGGTTAGACTGGCAACAATAATAGTTAAGAGTTTTTCTGAGAAGCTGTTGA
ATAGAAGTTTAAATTTGAACCATTGCTTCTATTTTATTGTGGAGTATTGGTAAATCATAATGAAGACTCGGTAAAATAACTTGATTTTGTACATTATTTATGGGCAATTCAGTTTAATTGGTAGTTTCATACTGAAACTGAAAACAATTGTTTGCTTGTTTGCTTGTTGTGTTCTGGTTGGTTGTTTGTGGTTGTTTTTA
TTTTTTTGTGATAAGGCAATATGGGGGTACATGTCCCTCTGTGCTACCAATGGGCGTGGCCACTGTAGCTTTTATGTACAACGAGGAATCAATGCACCGGTTTTGATGGATCCTTGTTCGTCTTCAACCGGCAACTATTGCCTTTTTGGTAGTTTTACATAAATTTCCTTCAATATTTGTAATAACAAATTAGTTTCTTT
TTAGTTAATTCATTTAATAGGGAGGGAAATGAAATAAATAAATTTGATATTATGTTGTGGCTCAAAAAGCTGGTTCAAAACAATAATATTCCCCAGTTGCAAATTTTCAACAACTCATTTAATTATGTCTGACTGATGATGTGGAATTGTTTTTTATTTTATTTTATTAAAACATTCAGGTCAAACCACAGGAATAACAC
AGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTCCCTTTGGGAATGCACAGgtgatagtgaaaaattacatccttccttgtaacatatacatttcctctttacaacttgatcatataaagttgccaacagaatctgcaggtttctatttcaaattttattttattgtttagctctagagtctgactaacagatgatataca
ttgggacagTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGTACCCTTCGCTTGCCTTCCCACCCCTGTAAGTTGGTGAACGATAAATGAAACCCATATGAATAACTATTTCTCATATAGTAGTCTGACACATAATAGTACTATTTGGTCCTTTGTGTTTGTTATATTAATCATTTGATATTTGTA
ATGATTATGTTCTGTTATTTTCTTGGATTGCTTTTCTGTGTTGATTTGTTGTCTTTTGTTGATTTGCAGCTTTAATACCCAATGTGAAATCCATTTTTGATTAAAAACCAGAAAATATGTAAGAGTTATCTAGCTGGTCTGTGGCAATGGAAACCAGAACAACTACAAAACTATTGTTTATCTTTGGTCAGCAACAAAAG
TCTGCTGTGACTGTCTGTGAAAACCCAGGCTACAGCCTTTCTAACTATACAGAGATAACAAACATAACTGGAAATAAAACCAGTATAACCGGTGATAGAAAGAAACATAGCAGGGAAATATATACTGGGAAGGCTCATAATCTGAAATAGGGATAATTGGCACTTCTTGAATCAGAGCAGGAAACTGATTCAGCTGGAAC
AAAATTCGTTTTTGCTTCTCTCGGCTGTAAGAGTGTCTATCCCAACAGGGTTTTCATATGCCAAAAGAGACTAACAATCTACATGTATTCTGTTTCCCACAAGCGATTGTTCCTGCCATCAGGAACCCATGACCCTACCTCCTGCACCGTTTAACCCATGACCCTACCTCCTGCACCATTTCTTCTTCTGCCATGACTTC
CTGTTCCTGATGCACTTAGCATAGACCTGAGGCCTGTGGCTGGAGCCACTGCCTTGCCTCCCCTTTCTCCCTTGGCCCC
Intron 5 GCAATATGGG ... AAACATTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 27.11 | 199 | 74 | 41 |
| A2 | 30.77 | 153 | 68 | 36 |
| A3 | 21.49 | 179 | 49 | 24 |
| A4 | 21.26 | 163 | 44 | 39 |
| A5 | 20.51 | 62 | 16 | 20 |
| A6 | 27.98 | 260 | 101 | 13 |
| A7 | 24.89 | 531 | 176 | 36 |
| A8 | 24.3 | 296 | 95 | 47 |
| A9 | 25.22 | 424 | 143 | 18 |
| A10 | 24.5 | 490 | 159 | 20 |
>TRINITY_DN45734_c0_g2_i3 from sample A10 / Example spliced isoformTATAAATTCTCCTATCTCCTATAACCTTTCCTAGCATATGACCGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCCGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTT
CATGGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTCTATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGA
TAAAATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGATCTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTC
AGAAAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAGGGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGC
ACAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTT
CCCTTTGGGAATGCACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGCTACACGTCATGCACGGCGTGTATATGTCGGTGGTCTTCCTCCAATGGCTAATGAGCAGACAATTGCGACATATTTTAGTCGTGTTATGGCTGCTATAGGAGGAAATACTGCTGGGCCAGGTGATGCTGTTGTTAA
TGTCTATATTAATCATGAAAAGAAGTTTGCATTTGTGGAGATGCGCACGGTTGAAGAGGCCAGCAATGCAATGGCTCTTGATGGTATCATGTTTGAGGGGGTTTCTGTGAGAGTAAGGAGACCAAGTGATTACAATCCGTCATTGGCAGCAGCACTTGGCCCAAGCCAGCCCAGTCCCCACCTTAATTTAGCTGCTGTTG
GTCTCACACCAGGCCATGGCAGCAGTGCTGTTGGAGGAGCCGAGGGACCTGATCGAATATTTGTTGGTGGCTTACCATATTACTTCACAGAAGCACAGATAAGAGAACTGCTTGAATCCTTTGGGCCTCTTCGTGGATTTGATCTTGTTAAAGATAGAGATACAGGTAATTCGAAGGGCTATGGCTTTTGCGTTTATCAG
GATCCAGCTGTGACAGATATTGCATGTGCTGCCCTTAATGGGCTTAAAATGGGGGATAAGACTTTGACTGTACGTCGAGCTACTGCCAGTGGTCAGCCAAAACCAGACCAGGAGAATGTCTTAGCACAAGCCCAACAACATATAGCATTACAGAAGCTTGCACTGCAAGTTGGATCTGGTGTAACTGGTTTGTTTACTAG
TGTTCTTGGCCCAACAGAAACAGCTACAAAAGTTGTTTCCTTGACACAGGTTGTGTCACCAGATGAGCTGAGAGATGATGAAGAGTACGAAGAAATACTAGAAGACATGAGAGAAGAATGTGGAAAATATGGATCAATAGTAAATCTTGTTATTCCACGTCCTGATCCAAGTGGAGAATTACGTCCTGGGGTTGGAAAGG
TGTTTGTGGAATTTTCAGATACTGATAGTTCAGGCAAGGCAAAAGCTGCACTACATGGAAGGAAGTTCGGTGGAAATACTGTTGTTGCAGTATATTACCCGGAAGACAAATTCTCTTTGGGTGAATATGATTGAAGAGAAGGAAACACTCATATTTGTTGGATATTAATTAATTTAACAGCACATTTTCGGCCTGTTACC
CTTCTTTCTGTATATTATGGATTTGCTTAATGATGATGAGATGATTAAGAGCAGTTTTGTATATTAACGCTTTCATGTTTGACAGAATATTTTATGCTTCACTTATTGCATGCAATATTTTATCTTGTAGTATCCTGTATAAGACAAAAATTAGGTTTTTTGGATACATACCGATGGTTTGGATTATTTCATATCCAATA
ATCATTCTTCTCAAATTTGTGGAAGCTATGTTCTTTTTCAGGAAATGAAAGTCGTCT
>TRINITY_DN45734_c0_g2_i8 from sample A10 / Example unspliced isoform:TATAAATTCTCCTATCTCCTATAACCTTTCCTAGCATATGACCGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCCGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTT
CATGGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTCTATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGA
TAAAATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGATCTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTC
AGAAAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAGGGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGC
ACAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGgcaatatgggggtacatgtccctctgtgctaccaatgggcgtggccactgtag
cttttatgtacatgtccctctgtgctaccaatgggcgtggccactgtagcttttatgtacaacgaggaatcaatgcaccggttttgatggatccttgttcgtcttcaaccggcaactattgcctttttggtagttttacataaatttccttcaatatttgtaataacaaattagtttctttttagttaattcatttaata
gggagggaaatgaaataaataaatttgatattatgttgtggctcaaaaagctggttcaaaacaataatattccccagttgcaaattttcaacaactcatttaattatgtctgactgatgatgtggaattgttttttattttattttattaaaacattcagGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTT
TCCTAACATGTTTCCCTTTGGGAATGCACAGGTGATAGTGAAAAATTACATCCTTCCTTGTAACATATACATTTCCTCTTTACAACTTGATCATATAAAGTTGCCAACAGAATCTGCAGGTTTCTATTTCAAATTTTATTTTATTGTTTAGCTCTAGAGTCTGACTAACAGATGATATACATTGGGACAGTTTGGAGGTC
TTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGCTACACGTCATGCACGGCGTGTATATGTCGGTGGTCTTCCTCCAATGGCTAATGAGCAGACAATTGCGACATATTTTAGTCGTGTTATGGCTGCTATAGGAGGAAATACTGCTGGGCCAGGTGATGCTGTTGTTAATGTCTATATTAATCATGAAAAGAAGTTT
GCATTTGTGGAGATGCGCACGGTTGAAGAGGCCAGCAATGCAATGGCTCTTGATGGTATCATGTTTGAGGGGGTTTCTGTGAGAGTAAGGAGACCAAGTGATTACAATCCGTCATTGGCAGCAGCACTTGGCCCAAGCCAGCCCAGTCCCCACCTTAATTTAGCTGCTGTTGGTCTCACACCAGGTGCTGTTGGAGGAGC
CGAGGGACCTGATCGAATATTTGTTGGTGGCTTACCATATTACTTCACAGAAGCACAGATAAGAGAACTGCTTGAATCCTTTGGGCCTCTTCGTGGATTTGATCTTGTTAAAGATAGAGATACAGGTAATTCGAAGGGCTATGGCTTTTGCGTTTATCAGGATCCAGCTGTGACAGATATTGCATGTGCTGCCCTTAATG
GGCTTAAAATGGGGGATAAGACTTTGACTGTACGTCGAGCTACTGCCAGTGGTCAGCCAAAACCAGACCAGGAGAATGTCTTAGCACAAGCCCAACAACATATAGCATTACAGAAGCTTGCACTGCAAGTTGGATCTGGTGTAACTGGTTTGTTTACTAGTGTTCTTGGCCCAACAGAAACAGCTACAAAAGTTGTTTCC
TTGACACAGGTTGTGTCACCAGATGAGCTGAGAGATGATGAAGAGTACGAAGAAATACTAGAAGACATGAGAGAAGAATGTGGAAAATATGGATCAATAGTAAATCTTGTTATTCCACGTCCTGATCCAAGTGGAGAATTACGTCCTGGGGTTGGAAAGGTGTTTGTGGAATTTTCAGATACTGATAGTTCAGGCAAGGC
AAAAGCTGCACTACATGGAAGGAAGTTCGGTGGAAATACTGTTGTTGCAGTATATTACCCGGAAGACAAATTCTCTTTGGGTGAATATGATTGAAGAGAAGGAAACACTCATATTTGTTGGATATTAATTAATTTAACAGCACATTTTCGGCCTGTTACCCTTCTTTCTGTATATTATGGATTTGCTTAATGATGATGAG
ATGATTAAGAGCAGTTTTGTATATTAACGCTTTCATGTTTGACAGAATATTTTATGCTTCACTTATTGCATGCAATATTTTATCTTGTAGTATCCTGTATAAGACAAAAATTAGGTTTTTTGGATACATACCGATGGTTTGGATTATTTCATATCCAATAATCATTCTTCTCAAATTTGTGGAAGCTATGTTCTTTTTCA
GGAAATGAAAGTCGTCT
Intron 6 GTAAGTTATG ... ATGGCAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 15.47 | 306 | 2 | 56 |
| A2 | 13.53 | 230 | 0 | 36 |
| A3 | 13.71 | 277 | 2 | 44 |
| A4 | 14.37 | 292 | 2 | 49 |
| A5 | 10.4 | 112 | 0 | 13 |
| A6 | 15.06 | 592 | 1 | 105 |
| A7 | 12.96 | 907 | 0 | 135 |
| A8 | 15.04 | 802 | 0 | 142 |
| A9 | 14.92 | 753 | 0 | 132 |
| A10 | 12.63 | 740 | 0 | 107 |
>TRINITY_DN110819_c0_g2_i7 from sample A3 / Example spliced isoformCTTTGAACTTTTTCATTTTTGCAAACTACTATTGGTAAATGCTTGATTTCAAATTTGAACATATAATATATTTCTATTTCTGAAACTGAGCAGGTATGAAGGAAAAGAAGTTTTAACCATGCATACTTCCCTTCATAATAAGACTACAAATTAGTAAGCTTTTTCAATGTAATACTTTTGGAACCTAGTTTACATATTGG
TAGGTATTGTGGAGCTGTTTCATTACTGAGAAAACATGGCAATTCTCTTTGATACATTTCTATTGGTCTGTAAGAGACAATATATGATGGGTTTGATTTCATTCAAGTTGGATGCCTTTTATTTTGCATGATACCTGGATGAGATCTTAGGAATAACCTGTTATTTTCATGATTTTGAAACAGGCTACACGTCATGCACG
GCGTGTATATGTCGGTGGTCTTCCTCCAATGGCTAATGAGCAGACAATTGCGACATATTTTAGTCGTGTTATGGCTGCTATAGGAGGAAATACTGCTGGGCCAGGTGATGCTGTTGTTAATGTCTATATTAATCATGAAAAGAAGTTTGCATTTGTGGAGATGCGCACGGTTGAAGAGGCCAGCAATGCAATGGCTCTTG
ATGGTATCATGTTTGAGGGGGTTTCTGTGAGAGTAAGGAGACCAAGTGATTACAATCCGTCATTGGCAGCAGCACTTGGCCCAAGCCAGCCCAGTCCCCACCTTAATTTAGCTGCTGTTGGTCTCACACCAGGTGCTGTTGGAGGAGCCGAGGGACCTGATCGAATATTTGTTGGTGGCTTACCATATTACTTCACAGAA
GCACAGATAAGAGAACTGCTTGAATCCTTTGGGCCTCTTCGTGGATTTGATCTTGTTAAAGATAGAGATACAGGTAATTCGAAGGGCTATGGCTTTTGCGTTTATCAGG
>TRINITY_DN110819_c0_g2_i17 from sample A3 / Example unspliced isoform:TGTTGGTCTCACACCAGGgtaagttatgtaatgcaacatttgtatttcaatcgctatgaaggaattcaaatgttctattttgtgtgcttgtgttttgtttctagtccaacatgaaaattatatttttgatatgctatatacaaatatttcacccagatatatcctaatataacattgctaacttatatagccatggcagc
agTGCTGTTGGAGGAGCCGAGGGACCTGATCGAATATTTGTTGGTGGCTTACCATATTACTTCACAGAAGCACAGATAAGAGAACTGCTTGAATCCTTTGGGCCTCTTCGTGGATTTGATCTTGTTAAAGATAGAGATACAGGTAATTCGAAGGGCTATGGCTTTTGCGTTTATCAGG
Intron 7 GTATGTTTCA ... AATGTTATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 18.09 | 252 | 50.8 | 58.2 |
| A2 | 21.7 | 271 | 40.5 | 78.6 |
| A3 | 15.38 | 295 | 55.4 | 56.1 |
| A4 | 17.73 | 215 | 37.4 | 48.5 |
| A5 | 15.12 | 84 | 22.4 | 15.4 |
| A6 | 14.14 | 673 | 130.5 | 115.5 |
| A7 | 14.87 | 968 | 174.8 | 177.3 |
| A8 | 18.26 | 861.3 | 142.6 | 202.7 |
| A9 | 14.7 | 898.3 | 155.5 | 163.1 |
| A10 | 14.18 | 732 | 127.3 | 126.8 |
>TRINITY_DN110878_c0_g1_i21 from sample A2 / Example spliced isoformATAAAAAAGTATGAGATTTTGAGGGATGTTTAAACTTCCAAAACTTCTTCCACCATCACATGTATATCCTCCCTAAAACTAAGAACTTTGTATTATGCCTTGAGTGTAATCTCCTGTTGGATTCTTTGATCAGATAAGACTGTTATCCTCCTTTATTCTAGTATGACTTGATCTTAGTCTAGCAATAGAAGCTATCCGTA
GAAAAGCTTCCTTCCCTCTGAAACCTAAATCACCTGCAGTAATCCACTCTTGACTATAGATCAAGGAAAGATCAGGATCAGCTACCTGACGTAGATATAAAAGTCATTTCAAGGTTGGAAGGCACATGTTCCTGTCCATCCTAAGATGTTGCTGTAGAAATTGCTGTTGGACATCCAACCTGTACTACAGTCTAAACATC
TTTGGCATAAAAATTAAATAATCAACTAAGACCTTCCATTTTCTCTGTTTGCTGTGCTTTTTGCTTGAGATTGAAGTGCAAAATGCAGATTCCCTTCTTTTGGTTTGAACTTACAATTGCTGATGACTGGAGTATAGAAAGATGAGTTATTGTTGAGTTTCGGGAAAGGTGGTGCCCAACAATATGAATATGAGAATGGG
ATTCTGTGGAACTCACGGTTAGAGAGAAAGACTTTGAACTTTTTCATATATTTGCAAACTACTATTGGTAAATGCTTGATTTCAAATTTGAACATATAATATATTTCTATTTCTGAAACTGAGCAGGTATGAAGGAAAAGAAGTTTTAACCATGCATACTTCCCTTCATAATAAGACTACAAATTAGTAAGCTTTTTCAA
TGTAATACTTTTGGAACCTAGTTTACATATTGGTAGGTATTGTGGAGCTGTTTCATTACTGAGAAAACATGGCAATTCTCTTTGATACATTTCTATTGGTCTGTAAGAGACAATATATGATGGGTTTGATTTCATTCAAGTTGGATGCCTTTTATTTTGCATGATACCTGGATGAGATCTTAGGAATAACCTGTTATTTT
CATGATTTTGAAACAGGCTACACGTCATGCACGGCGTGTATATGTCGGTGGTCTTCCTCCAATGGCTAATGAGCAGACAATTGCGACATATTTTAGTCGTGTTATGGCTGCTATAGGAGGAAATACTGCTGGGCCAGGTGATGCTGTTGTTAATGTCTATATTAATCATGAAAAGAAGTTTGCATTTGTGGAGATGCGCA
CGGTTGAAGAGGCCAGCAATGCAATGGCTCTTGATGGTATCATGTTTGAGGGGGTTTCTGTGAGAGTAAGGAGACCAAGTGATTACAATCCGTCATTGGCAGCAGCACTTGGCCCAAGCCAGCCCAGTCCCCACCTTAATTTAGCTGCTGTTGGTCTCACACCAGGCCATGGCAGCAGTGCTGTTGGAGGAGCCGAGGGA
CCTGATCGAATATTTGTTGGTGGCTTACCATATTACTTCACAGAAGCACAGATAAGAGAACTGCTTGAATCCTTTGGGCCTCTTCGTGGATTTGATCTTGTTAAAGATAGAGATACAGGTAATTCGAAGGGCTATGGCTTTTGCGTTTATCAGGATCCAGCTGTGACAGATATTGCATGTGCTGCCCTTAATGGGCTTAA
AATGGGGGATAAGACTTTGACTGTACGTCGAGCTACTGCCAGTGGTCAGCCAAAACCAGACCAGGAGAATGTCTTAGCACAAGCCCAACAACATATAGCATTACAGAAGCTTGCACTGCAAGTTGGATCTGGTGTAACTGGTTTGTTTACTAGTGTTCTTGGCCCAACAGAAACAGCTACAAAAGTTGTTTCCTTGACAC
AGGTTGTGTCACCAGATGAGCTGAGAGATGATGAAGAGTACGAAGAAATACTAGAAGACATGAGAGAAGAATGTGGAAAATATGGATCAATAGTAAATCTTGTTATTCCACGTCCTGATCCAAGTGGAGAATTACGTCCTGGGGTTGGAAAGGTGTTTGTGGAATTTTCAGATACTGATAGTTCAGGCAAGGCAAAAGCT
GCACTACATGGAAGGAAGTTCGGTGGAAATACTGTTGTTGCAGTATATTACCCGGAAGACAAATTCTCTTTGGGTGAATATGATTGAAGAGAAGGAAACACTCATATTTGTTGGATATTAATTAATTTAACAGCACATTTTCGGCCTGTTACCCTTCTTTCTGTATATTATGGATTTGCTTAATGATGATGAGATGATTA
AGAGCAGTTTTGTATATTAACGCTTTCATGTTTGACAGAATATTTTATGCTTCACTTATTGCATGCC
>TRINITY_DN110878_c0_g1_i6 from sample A2 / Example unspliced isoform:CTATGGCTTTTGCGTTTATCAGgtatgtttcatctgtgtgctgatattttgtacatgaataactagtctgttttagaattctattttaatgatccccaaggcatcgttttaacttcctgttatgttcaagatgcaagctaattgcatttgtcaatgttatagGATCCAGCTGTGACAGATATTGCATGTGCTGCCCTTAA
TGGGCTTAAAATGGGGGATAAGACTTTGACTGTACGTCGAGCTACTGCCAGTGGTCAGCCAAAACCAGACCAGGAGAATGTCTTAGCACAAGCCCAACAACATATAGCATTACAGAAGCTTGCACTGCAAGTTGGATCTGGTGTAACTGGTTTGTTTACTAGTGTTCTTGGCCCAACAGAAACAGCTACAAAAGTTGTTT
CCTTGACACAGGT
Intron 8 GTATGCATAT ... TCTGTTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 6.69 | 286.9 | 21.2 | 23.4 |
| A2 | 5.29 | 205.7 | 12.2 | 15.4 |
| A3 | 5.74 | 223.1 | 14.4 | 15.8 |
| A4 | 6.1 | 159.3 | 11.6 | 9.4 |
| A5 | 4.06 | 61.6 | 2.8 | 4.8 |
| A6 | 2.9 | 1057.2 | 32.8 | 88 |
| A7 | 2.97 | 1055.7 | 33.6 | 85 |
| A8 | 2.96 | 1644.4 | 52 | 129.6 |
| A9 | 3.88 | 1155.7 | 48.6 | 90.2 |
| A10 | 4.15 | 739.7 | 34.2 | 56.6 |
>TRINITY_DN41480_c0_g1_i3 from sample A6 / Example spliced isoformAAATTCTCCTATCTCCTATAACCTTTCCTAGCATATGACCGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCCGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTTCAT
GGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTCTATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGATAA
AATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGATCTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTCAGA
AAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAGGGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGCACA
GGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTCCC
TTTGGGAATGCACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGCTACACGTCATGCACGGCGTGTATATGTCGGTGGTCTTCCTCCAATGGCTAATGAGCAGACAATTGCGACATATTTTAGTCGTGTTATGGCTGCTATAGGAGGAAATACTGCTGGGCCAGGTGATGCTGTTGTTAATGT
CTATATTAATCATGAAAAGAAGTTTGCATTTGTGGAGATGCGCACGGTTGAAGAGGCCAGCAATGCAATGGCTCTTGATGGTATCATGTTTGAGGGGGTTTCTGTGAGAGTAAGGAGACCAAGTGATTACAATCCGTCATTGGCAGCAGCACTTGGCCCAAGCCAGCCCAGTCCCCACCTTAATTTAGCTGCTGTTGGTC
TCACACCAGGTGCTGTTGGAGGAGCCGAGGGACCTGATCGAATATTTGTTGGTGGCTTACCATATTACTTCACAGAAGCACAGATAAGAGAACTGCTTGAATCCTTTGGGCCTCTTCGTGGATTTGATCTTGTTAAAGATAGAGATACAGGTAATTCGAAGGGCTATGGCTTTTGCGTTTATCAGGATCCAGCTGTGACA
GATATTGCATGTGCTGCCCTTAATGGGCTTAAAATGGGGGATAAGACTTTGACTGTACGTCGAGCTACTGCCAGTGGTCAGCCAAAACCAGACCAGGAGAATGTCTTAGCACAAGCCCAACAACATATAGCATTACAGAAGCTTGCACTGCAAGTTGGATCTGGTGTAACTGGTTTGTTTACTAGTGTTCTTGGCCCAAC
AGAAACAGCTACAAAAGTTGTTTCCTTGACACAGGTTGTGTCACCAGATGAGCTGAGAGATGATGAAGAGTACGAAGAAATACTAGAAGACATGAGAGAAGAATGTGGAAAATATGGATCAATAGTAAATCTTGTTATTCCACGTCCTGATCCAAGTGGAGAATTACGTCCTGGGGTTGGAAAGGTGTTTGTGGAATTTT
CAGATACTGATAGTTCAGGCAAGGCAAAAGCTGCACTACATGGAAGGAAGTTCGGTGGAAATACTGTTGTTGCAGTATATTACCCGGAAGACAAATTCTCTTTGGGTGAATATGATTGAAGAGAAGGAAACACTCATATTTGTTGGATATTAATTAATTTAACAGCACATTTTCGGCCTGTTACCCTTCTTTCTGTATAT
TATGGATTTGCTTAATGATGATGAGATGATTAAGAGCAGTTTTGTATATTAACGCTTTCATGTTTGACAGAATATTTTATGCTTCACTTATTGCATGCAATATTTTATCTTGTAGTATCCTGTATAAGACAAAAATTAGGTTTTTTGGATACATACCGATGGTTTGGATTATTTCATATCCAATAATCATTCTTCTCAAA
TTTGTGGAAGCTATGTTCTTTTTCAGGAAATGAAAGTCGTCGATTCTTTAAAAAA
>TRINITY_DN41480_c0_g1_i5 from sample A6 / Example unspliced isoform:AGAGAAGAATGTGGAAAATATGgtatgcatatgttaatgtcatgtctgaaactatataagttataatttgagaagaaaatactgaatcctattgttatctgttccagGATCAATAGTAAATCTTGTTATTCCACGTCCTGATCCAAGTGGAGAATTACGTCCTGGGGTTGGAAAGGTGTTTGTGGAATTTTCAGATACTG
ATAGTTCAGGCAAGGCAAAAGCTGCACTACATGGAAGGAAGTTCGGTGGAAATACTGTTGTTGCAGTATATTACCCGGAAGACAAATTCTCTTTGGGTGAATATGATTGAAGAGAAGGAAACACTCATATTTGTTGGATATTAATTAATTTAACAGCACATTTTCGGCCTGTTACCCTTCTTTCTGTATATTATGGATTT
GCTTAATGATGATGAGATGATTAAGAGCAGTTTTGTATATTAACGCTTTCATGTTTGACAGAATATTTTATGCTTCACTTATTGCATGCAATATTTTATCTTGTAGTATCCTGTATAAGACAAAAATTAGGTTTTTTGGATACATACCGATGGTTTGGATTATTTCATATCCAATAATCATTCTTCTCAAATTTGTGGAA
GCTATGTTCTTTTTCAGGAAATGAAAGTCGTCGATTCTTTAAAAAA
Intron 9 GTTAGTGTGT ... TCTTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 14.86 | 275 | 34.5 | 48 |
| A2 | 20.63 | 238.5 | 24 | 62 |
| A3 | 17.96 | 233 | 21.5 | 51 |
| A4 | 13.76 | 163 | 21.5 | 26 |
| A5 | 15.49 | 60 | 5 | 11 |
| A6 | 21.01 | 1316 | 89.5 | 350 |
| A7 | 20.85 | 1268 | 95 | 334 |
| A8 | 19.64 | 2020.5 | 143.5 | 494 |
| A9 | 20.35 | 1358 | 92 | 347 |
| A10 | 21.01 | 857 | 68.5 | 228 |
>TRINITY_DN110819_c0_g2_i23 from sample A3 / Example spliced isoformCGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCGGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTTCATGGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTC
TATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGATAAAATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGAT
CTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTCAGAAAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAG
GGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGCACAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGC
ATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTCCCTTTGGGAATGCACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCA
GTGCAAGCAATGACACAACAGGCTACACGTCATGCACGGCGTGTATATGTCGGTGGTCTTCCTCCAATGGCTAATGAGCAGACAATTGCGACATATTTTAGTCGTGTTATGGCTGCTATAGGAGGAAATACTGCTGGGCCAGGTGATGCTGTTGTTAATGTCTATATTAATCATGAAAAGAAGTTTGCATTTGTGGAGAT
GCGCACGGTTGAAGAGGCCAGCAATGCAATGGCTCTTGATGGTATCATGTTTGAGGGGGTTTCTGTGAGAGTAAGGAGACCAAGTGATTACAATCCGTCATTGGCAGCAGCACTTGGCCCAAGCCAGCCCAGTCCCCACCTTAATTTAGCTGCTGTTGGTCTCACACCAGGCCATGGCAGCAGTGCTGTTGGAGGAGCCG
AGGGACCTGATCGAATATTTGTTGGTGGCTTACCATATTACTTCACAGAAGCACAGATAAGAGAACTGCTTGAATCCTTTGGGCCTCTTCGTGGATTTGATCTTGTTAAAGATAGAGATACAGGTAATTCGAAGGGCTATGGCTTTTGCGTTTATCAGGATCCAGCTGTGACAGATATTGCATGTGCTGCCCTTAATGGG
CTTAAAATGGGGGATAAGACTTTGACTGTACGTCGAGCTACTGCCAGTGGTCAGCCAAAACCAGACCAGGAGAATGTCTTAGCACAAGCCCAACAACATATAGCATTACAGAAGCTTGCACTGCAAGTTGGATCTGGTGTAACTGGTTTGTTTACTAGTGTTCTTGGCCCAACAGAAACAGCTACAAAAGTTGTTTCCTT
GACACAGGTTGTGTCACCAGATGAGCTGAGAGATGATGAAGAGTACGAAGAAATACTAGAAGACATGAGAGAAGAATGTGGAAAATATGGATCAATAGTAAATCTTGTTATTCCACGTCCTGATCCAAGTGGAGAATTACGTCCTGGGGTTGGAAAGGTGTTTGTGGAATTTTCAGATACTGATAGTTCAGGCAAGGCAA
AAGCTGCACTGCATGGAAGGAAGTTCGGTGGAAATACTGTTGTTGCAGTATATTACCCGGAAGACAAATTCTCTTTGGGTGAATATGATTGAAGAGAAGGAAACACTCATATTTGTTGGATATTAATTAATTTAACAGCACATTTTCGGCCTGTTACCCTTCTTTCTGTATATTATGGATTTGCTTAATGATGATGAGAT
GATTAAGAGCAGTTTTGTATATTAACGCTTTCATGTTTGACAGAATATTTTATGCTTCACTTATTGCATGCAATATTTTAT
>TRINITY_DN110819_c0_g2_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:CGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCGGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTTCATGGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTC
TATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGATAAAATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGAT
CTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTCAGAAAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAG
GGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGCACAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGC
ATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTCCCTTTGGGAATGCACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCA
GTGCAAGCAATGACACAACAGGCTACACGTCATGCACGGCGTGTATATGTCGGTGGTCTTCCTCCAATGGCTAATGAGCAGACAATTGCGACATATTTTAGTCGTGTTATGGCTGCTATAGGAGGAAATACTGCTGGGCCAGGTGATGCTGTTGTTAATGTCTATATTAATCATGAAAAGAAGTTTGCATTTGTGGAGAT
GCGCACGGTTGAAGAGGCCAGCAATGCAATGGCTCTTGATGGTATCATGTTTGAGGGGGTTTCTGTGAGAGTAAGGAGACCAAGTGATTACAATCCGTCATTGGCAGCAGCACTTGGCCCAAGCCAGCCCAGTCCCCACCTTAATTTAGCTGCTGTTGGTCTCACACCAGGCCATGGCAGCAGTGCTGTTGGAGGAGCCG
AGGGACCTGATCGAATATTTGTTGGTGGCTTACCATATTACTTCACAGAAGCACAGATAAGAGAACTGCTTGAATCCTTTGGGCCTCTTCGTGGATTTGATCTTGTTAAAGATAGAGATACAGGTAATTCGAAGGGCTATGGCTTTTGCGTTTATCAGGATCCAGCTGTGACAGATATTGCATGTGCTGCCCTTAATGGG
CTTAAAATGGGGGATAAGACTTTGACTGTACGTCGAGCTACTGCCAGTGGTCAGCCAAAACCAGACCAGGAGAATGTCTTAGCACAAGCCCAACAACATATAGCATTACAGAAGCTTGCACTGCAAGTTGGATCTGGTGTAACTGGTTTGTTTACTAGTGTTCTTGGCCCAACAGAAACAGCTACAAAAGTTGTTTCCTT
GACACAGGTTGTGTCACCAGATGAGCTGAGAGATGATGAAGAGTACGAAGAAATACTAGAAGACATGAGAGAAGAATGTGGAAAATATGGATCAATAGTAAATCTTGTTATTCCACGTCCTGATCCAAGTGGAGAATTACGTCCTGGGGTTGGAAAGgttagtgtgtacattatgttttcgtatatagcatctatttcct
tgaattttgtacattcttaaatgtaacaaccacaggattaatacgatatatcactagacacaatcttttgctttatccatttagtttgccttgttcttttgcagGTGTTTGTGGAATTTTCAGATACTGATAGTTCAGGCAAGGCAAAAGCTGCACTGCATGGAAGGAAGTTCGGTGGAAATACTGTTGTTGCAGTATAT
TACCCGGAAGACAAATTCTCTTTGGGTGAATATGATTGAAGAGAAGGAAACACTCATATTTGTTGGATATTAATTAATTTAACAGCACATTTTCGGCCTGTTACCCTTCTTTCTGTATATTATGGATTTGCTTAATGATGATGAGATGATTAAGAGCAGTTTTGTATATTAACGCTTTCATGTTTGACAGAATATTTTAT
GCTTCACTTATTGCATGCAATATTTTAT
Intron 10 GTAAGTTATG ... ACTTATATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 11.66 | 288 | 2 | 38 |
| A2 | 6.64 | 211 | 0 | 15 |
| A3 | 9.54 | 256 | 2 | 27 |
| A4 | 12.15 | 282 | 2 | 39 |
| A5 | 6.78 | 110 | 0 | 8 |
| A6 | 9.12 | 538 | 1 | 54 |
| A7 | 6.83 | 832 | 0 | 61 |
| A8 | 8.97 | 731 | 0 | 72 |
| A9 | 8.34 | 681 | 0 | 62 |
| A10 | 6.25 | 675 | 0 | 45 |
>TRINITY_DN110819_c0_g2_i2 from sample A3 / Example spliced isoformCGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCGGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTTCATGGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTC
TATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGATAAAATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGAT
CTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTCAGAAAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAG
GGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGCACAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGC
ATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTCCCTTTGGGAATGCACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCA
GTGCAAGCAATGACACAACAGGCTACACGTCATGCACGGCGTGTATATGTCGGTGGTCTTCCTCCAATGGCTAATGAGCAGACAATTGCGACATATTTTAGTCGTGTTATGGCTGCTATAGGAGGAAATACTGCTGGGCCAGGTGATGCTGTTGTTAATGTCTATATTAATCATGAAAAGAAGTTTGCATTTGTGGAGAT
GCGCACGGTTGAAGAGGCCAGCAATGCAATGGCTCTTGATGGTATCATGTTTGAGGGGGTTTCTGTGAGAGTAAGGAGACCAAGTGATTACAATCCGTCATTGGCAGCAGCACTTGGCCCAAGCCAGCCCAGTCCCCACCTTAATTTAGCTGCTGTTGGTCTCACACCAGGCCATGGCAGCAGTGCTGTTGGAGGAGCCG
AGGGACCTGATCGAATATTTGTTGGTGGCTTACCATATTACTTCACAGAAGCACAGATAAGAGAACTGCTTGAATCCTTTGGGCCTCTTCGTGGATTTGATCTTGTTAAAGATAGAGATACAGGTAATTCGAAGGGCTATGGCTTTTGCGTTTATCAGGATCCAGCTGTGACAGATATTGCATGTGCTGCCCTTAATGGG
CTTAAAATGGGGGATAAGACTTTGACTGTACGTCGAGCTACTGCCAGTGGTCAGCCAAAACCAGACCAGGAGAATGTCTTAGCACAAGCCCAACAACATATAGCATTACAGAAGCTTGCACTGCAAGTTGGATCTGGTGTAACTGGTTTGTTTACTAGTGTTCTTGGCCCAACAGAAACAGCTACAAAAGTTGTTTCCTT
GACACAGGTTGTGTCACCAGATGAGCTGAGAGATGATGAAGAGTACGAAGAAATACTAGAAGACATGAGAGAAGAATGTGGAAAATATGGATCAATAGTAAATCTTGTTATTCCACGTCCTGATCCAAGTGGAGAATTACGTCCTGGGGTTGGAAAGGTTAGTGTGTACATTATGTTTTCGTATATAGCATCTATTTCCT
TGAATTTTGTACATTCTTAAATGTAACAACCACAGGATTAATACGATATATCACTAGACACAATCTTTTGCTTTATCCATTTAGTTTGCCTTGTTCTTTTGCAGGTGTTTGTGGAATTTTCAGATACTGATAGTTCAGGCAAGGCAAAAGCTGCACTGCATGGAAGGAAGTTCGGTGGAAATACTGTTGTTGCAGTATAT
TACCCGGAAGACAAATTCTCTTTGGGTGAATATGATTGAAGAGAAGGAAACACTCATATTTGTTGGATATTAATTAATTTAACAGCACATTTTCGGCCTGTTACCCTTCTTTCTGTATATTATGGATTTGCTTAATGATGATGAGATGATTAAGAGCAGTTTTGTATATTAACGCTTTCATGTTTGACAGAATATTTTAT
GCTTCACTTATTGCATGCAATATTTTAT
>TRINITY_DN110819_c0_g2_i17 from sample A3 / Example unspliced isoform:TGTTGGTCTCACACCAGGgtaagttatgtaatgcaacatttgtatttcaatcgctatgaaggaattcaaatgttctattttgtgtgcttgtgttttgtttctagtccaacatgaaaattatatttttgatatgctatatacaaatatttcacccagatatatcctaatataacattgctaacttatatagCCATGGCAGC
AGTGCTGTTGGAGGAGCCGAGGGACCTGATCGAATATTTGTTGGTGGCTTACCATATTACTTCACAGAAGCACAGATAAGAGAACTGCTTGAATCCTTTGGGCCTCTTCGTGGATTTGATCTTGTTAAAGATAGAGATACAGGTAATTCGAAGGGCTATGGCTTTTGCGTTTATCAGG
Intron 11 GTCTGCATAA ... AAACATTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 32.39 | 195.4 | 95.5 | 46.1 |
| A2 | 35.54 | 149.5 | 84.3 | 36 |
| A3 | 24.24 | 176.3 | 58.4 | 27.4 |
| A4 | 24.65 | 160.7 | 53.4 | 43.6 |
| A5 | 33 | 61 | 30.6 | 21.3 |
| A6 | 26.24 | 254.5 | 94.6 | 18.5 |
| A7 | 25.23 | 520.9 | 182.4 | 47.8 |
| A8 | 25.63 | 290.5 | 103.2 | 51.9 |
| A9 | 21.49 | 415.5 | 118.3 | 27.2 |
| A10 | 25.51 | 480.9 | 170.1 | 32.7 |
>TRINITY_DN117926_c1_g6_i5 from sample A1 / Example spliced isoformATAAATTCTCCTATCTCCTATAACCTTTCCTAGCATATGACCGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCGGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTTC
ATGGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTCTATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGAT
AAAATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGATCTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTCA
GAAAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAGGGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGCA
CAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTC
CCTTTGGGAATGCACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGCTACACGTCATGCACGGCGTGTATATGTCGGTGGTCTTCCTCCAATGGCTAATGAGCAGACAATTGCGACATATTTTAGTCGTGTTATGGCTGCTATAGGAGGAAATACTGCTGGGCCAGGTGATGCTGTTGTTAAT
GTCTATATTAATCATGAAAAGAAGTTTGCATTTGTGG
>TRINITY_DN117926_c1_g6_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATAAATTCTCCTATCTCCTATAACCTTTCCTAGCATATGACCGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCGGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTTC
ATGGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTCTATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGAT
AAAATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGATCTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTCA
GAAAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAGGGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGCA
CAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGgtctgcataaaggcttctctttaaaattattgcactatacatttaatttagggt
tagactggcaacaataatagttaagagtttttctgagaagctgttgaatagaagtttaaatttgaaccattgcttctattttattgtggagtattggtaaatcataatgaagactcggtaaaataacttgattttgtacattatttatgggcaattcagtttaattggtagtttcatactgaaactgaaaacaattgttt
gcttgtttgcttgttgtgttctggttggttgtttgtggttgtttttatttttttgtgataaggcaatatgggggtacatgtccctctgtgctaccaatgggcgtggccactgtagcttttatgtacaacgaggaatcaatgcaccggttttgatggatccttgttcgtcttcaaccggcaactattgcctttttggtagt
tttacataaatttccttcaatatttgtaataacaaattagtttctttttagttaattcatttaatagggagggaaatgaaataaataaatttgatattatgttgtggctcaaaaagctggttcaaaacaataatattccccagttgcaaattttcaacaactcatttaattatgtctgactgatgatgtggaattgtttt
ttattttattttattaaaacattcagGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTCCCTTTGGGAATGCACAGGTGATAGTGAAAAATTACATCCTTCCTTGTAACATATACATTTCCTCTTTACAACTTGATCATATAAAGTTGCCAACAGAATCTGCAGGTTTCTATTTCAAAT
TTTATTTTATTGTTTAGCTCTAGAGTCTGACTAACAGATGATATACATTGGGACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGTACCCTTCGCTTGCCTTCCCACCCCTGTAAGTTGGTGAACGATAAATGAAACCCATATGAATAACTATTTCTCATATAGTAGTCTGACACATAATAGT
ACTATTTGGTCCTTTGTGTTTGTTATATTAATCATTTGATATTTGTAATGATTATGTTCTGTTATTTTCTTGGATTGCTTTTCTGTGTTGATTTGTTGTCTTTTGTTGATTTGCAGCTTTAATACCCAATGTGAAATCCATTTTTGATTAAAAACCAGAAAATATGTAAGAGTTATCTAGCTGGTCTGTGGCAATGGAAA
CCAGAACAACTACAAAACTATTGTTTATCTTTGGTCAGCAACAAAAGTCTGCTGTGACTGTCTGTGAAAACCCAGGCTACAGCCTTTCTAACTATACAGAGATAACAAACATAACTGGAAATAAAACCAGTATAACCGGTGATAGAAAGAAACATAGCAGGGAAATATATACTGGGAAGGCTCATAATCTGAAATAGGGA
TAATTGGCACTTCTTGAATCAGAGCAGGAAACTGATTCAGCTGGAACAAAATTCGTTTTTGCTTCTCTCGGCTGTAAGAGTGTCTATCCCAACAGGGTTTTCATATGCCAAAAGAGACTAACAATCTACATGTATTCTGTTTCCCACAAGCGATTGTTCCTGCCATCAGGAACCCATGACCCTACCTCCTGCACCGTTTA
ACCCATGACCCTACCTCCTGCACCATTTCTTCTTCTGCCATGACTTCCTGTTCCTGATGCACTTAGCATAGACCTGAGGCCTGTGGCTGGAGCCACTGCCTTGCCTCCCCTTTCTCCCTTGGCCCC
Intron 12 GTAGTTTTAC ... AAACATTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 44.72 | 47.1 | 19 | 45.1 |
| A2 | 58.54 | 20.2 | 18 | 36 |
| A3 | 43.23 | 38.3 | 25 | 26.7 |
| A4 | 51.26 | 41.1 | 34 | 42.7 |
| A5 | 60.66 | 14.8 | 21 | 21 |
| A6 | 29.74 | 39 | 11 | 17.4 |
| A7 | 40.39 | 84.5 | 55 | 45.4 |
| A8 | 50.65 | 44.1 | 32 | 51 |
| A9 | 31.73 | 61.9 | 20 | 25.4 |
| A10 | 40.46 | 62.6 | 22 | 30.2 |
>TRINITY_DN117926_c1_g6_i8 from sample A1 / Example spliced isoformATAAATTCTCCTATCTCCTATAACCTTTCCTAGCATATGACCGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCGGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTTC
ATGGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTCTATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGAT
AAAATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGATCTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTCA
GAAAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAGGGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGCA
CAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGGTCTGCATAAAGGCTTCTCTTTAAAATTATTGCACTATACATTTAATTTAGGGT
TAGACTGGCAACAATAATAGTTAAGAGTTTTTCTGAGAAGCTGTTGAATAGAAGTTTAAATTTGAACCATTGCTTCTATTTTATTGTGGAGTATTGGTAAATCATAATGAAGACTCGGTAAAATAACTTGATTTTGTACATTATTTATGGGCAATTCAGTTTAATTGGTAGTTTCATACTGAAACTGAAAACAATTGTTT
GCTTGTTTGCTTGTTGTGTTCTGGTTGGTTGTTTGTGGTTGTTTTTATTTTTTTGTGATAAGGCAATATGGGGGTACATGTCCCTCTGTGCTACCAATGGGCGTGGCCACTGTAGCTTTTATGTACAACGAGGAATCAATGCACCGGTTTTGATGGATCCTTGTTCGTCTTCAACCGGCAACTATTGCCTTTTTGGTCAA
ACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTCCCTTTGGGAATGCACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGCTACACGTCATGCACGGCGTGTATATGTCGGTGGTCTTCCTCCAATGGCTAATGAGCAGACAATTGCGACATATTTTAGTCGTGTTAT
GGCTGCTATAGGAGGAAATACTGCTGGGCCAGGTGATGCTGTTGTTAATGTCTATATTAATCATGAAAAGAAGTTTGCATTTGTGG
>TRINITY_DN117926_c1_g6_i9 from sample A1 / Example unspliced isoform:GGAGAATTCACAACTCTTGTTAATGTTAGTCCAGAAAAAAGTTAGATATTGGGTCTGTTGATTGTGTGAGGATTGTCTTTGTCCATATGCTTGTGCTAAAATTCTTTTGTTCATCTGAAGACAATTTTTTGTGTTAATTTCAAGTTGCTGCTTTAGAAAGCTTGATTAACATAAGTGTGATGATAAATTCAGGCACAGAG
ATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGCACAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGGTGATTTTATCTTGTTAACTGCATAATCTTTCACATTGTTTTGTCCGGGTTTGTTCTGTCTTGCATTCACACCGTTTCATATTACTGTTGTAGC
TTCTAACTTTGGTTGAAAGAGATTTCAATATTTTACATATTCATATTTTATATATCTCACTTTTTTTTCAGGATACATTAAGTGCATATGTAAAATATCGATTATATTTTGTTTGCAAGACTTCTGCGCTGTTAAATATAGTTTTCTGTATTAAGTGCATATGTAAAATATCTATTGTATTTTGTTTGCAAGACTTCTGC
GCTGTTAAATTTAGTTTTCTGTATGTGATTGAATGCTTACCTCTCTGCTTCTTTTACAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGGTCTGCATAAAGGCTTCTCTTTAAAATTATTGCACTATACATTTAATTTAGGGTTAGACTGGCAACAATAATA
GTTAAGAGTTTTTCTGAGAAGCTGTTGAATAGAAGTTTAAATTTGAACCATTGCTTCTATTTTATTGTGGAGTATTGGTAAATCATAATGAAGACTCGGTAAAATAACTTGATTTTGTACATTATTTATGGGCAATTCAGTTTAATTGGTAGTTTCATACTGAAACTGAAAACAATTGTTTGCTTGTTTGCTTGTTGTGT
TCTGGTTGGTTGTTTGTGGTTGTTTTTATTTTTTTGTGATAAGGCAATATGGGGGTACATGTCCCTCTGTGCTACCAATGGGCGTGGCCACTGTAGCTTTTATGTACAACGAGGAATCAATGCACCGGTTTTGATGGATCCTTGTTCGTCTTCAACCGGCAACTATTGCCTTTTTGgtagttttacataaatttccttca
atatttgtaataacaaattagtttctttttagttaattcatttaatagggagggaaatgaaataaataaatttgatattatgttgtggctcaaaaagctggttcaaaacaataatattccccagttgcaaattttcaacaactcatttaattatgtctgactgatgatgtggaattgttttttattttattttattaaaa
cattcagGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTCCCTTTGGGAATGCACAGGTGATAGTGAAAAATTACATCCTTCCTTGTAACATATACATTTCCTCTTTACAACTTGATCATATAAAGTTGCCAACAGAATCTGCAGGTTTCTATTTCAAATTTTATTTTATTGTTTAGCT
CTAGAGTCTGACTAACAGATGATATACATTGGGACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGCTACACGTCATGCACGGCGTGTATATGTCGGTGGTCTTCCTCCAATGGCTAATGAGCAGACAATTGCGACATATTTTAGTCGTGTTATGGCTGCTATAGGAGGAAATACTGCTGGGC
CAGGTGATGCTGTTGTTAATGTCTATATTAATCATGAAAAGAAGTTTGCATTTGTGG
Intron 13 GCAATATGGG ... AAACATTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 28.16 | 199 | 78 | 41 |
| A2 | 31.7 | 153 | 71 | 36 |
| A3 | 22.84 | 179 | 53 | 24 |
| A4 | 23.47 | 163 | 50 | 39 |
| A5 | 22.5 | 62 | 18 | 20 |
| A6 | 28.96 | 260 | 106 | 13 |
| A7 | 26.15 | 531 | 188 | 36 |
| A8 | 25.81 | 296 | 103 | 47 |
| A9 | 27.02 | 424 | 157 | 18 |
| A10 | 25.08 | 490 | 164 | 20 |
>TRINITY_DN110878_c0_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoformTATAAATTCTCCTATCTCCTATAACCTTTCCTAGCATATGACCGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCGGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTT
CATGGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTCTATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGA
TAAAATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGATCTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTC
AGAAAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAGGGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGC
ACAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTT
CCCTTTGGGAATGCACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGCTACACGTCATGCACGGCGTGTATATGTCGGTGGTCTTCCTCCAATGGCTAATGAGCAGACAATTGCGACATATTTTAGTCGTGTTATGGCTGCTATAGGAGGAAATACTGCTGGGCCAGGTGATGCTGTTGTTAA
TGTCTATATTAATCATGAAAAGAAGTTTGCATTTGTGGAGATGCGCACGGTTGAAGAGGCCAGCAATGCAATGGCTCTTGATGGTATCATGTTTGAGGGGGTTTCTGTGAGAGTAAGGAGACCAAGTGATTACAATCCGTCATTGGCAGCAGCACTTGGCCCAAGCCAGCCCAGTCCCCACCTTAATTTAGCTGCTGTTG
GTCTCACACCAGGCCATGGCAGCAGTGCTGTTGGAGGAGCCGAGGGACCTGATCGAATATTTGTTGGTGGCTTACCATATTACTTCACAGAAGCACAGATAAGAGAACTGCTTGAATCCTTTGGGCCTCTTCGTGGATTTGATCTTGTTAAAGATAGAGATACAGGTAATTCGAAGGGCTATGGCTTTTGCGTTTATCAG
GATCCAGCTGTGACAGATATTGCATGTGCTGCCCTTAATGGGCTTAAAATGGGGGATAAGACTTTGACTGTACGTCGAGCTACTGCCAGTGGTCAGCCAAAACCAGACCAGGAGAATGTCTTAGCACAAGCCCAACAACATATAGCATTACAGAAGCTTGCACTGCAAGTTGGATCTGGTGTAACTGGTTTGTTTACTAG
TGTTCTTGGCCCAACAGAAACAGCTACAAAAGTTGTTTCCTTGACACAGGTATGTATCCTTAATCTCCTTTAGCAAGAGTACAGCTAACCATGAATTGTCGTTGGGCCTAGAAAGAGGCATGCTTACTGGTGTTGGTATCATTTGGGCAAAAATAGATTTCCACATAATTACACATCTCTTAATTGCGCCGAGAGGCGCT
CTACAGCCCAGTATGGGGGAGATCTTGTTAGTCGAGTGTTTGGTGTTTGTCGAGTAACAAAATAATAC
>TRINITY_DN110878_c0_g1_i8 from sample A2 / Example unspliced isoform:TATAAATTCTCCTATCTCCTATAACCTTTCCTAGCATATGACCGATACGGTAAAACAACCGAACCCATCTGACGCCCTCGACTGCCCTTTTCGTCGGACCTTTTGTGTAAACGAGACACTCCCGTCAAGGCTTAGGGTTTGTACTCAGTCGCGGCTGGATAGATAAATGGACACATAGTTATTTTTTCGCTGTGTATTTT
CATGGCGGCAAGTCCATGAAAGCCACGATCACGCCCGTTTTCTATTCACAAATCTCATACTCAGTTGCTTCCTTGCAAGTGGCCTGCTTCTGCATTCGACTCAGCCAAGGGTTTTGAATTTTACGGTGACAGAAACTTCGATTTCCGTGGAATCGAGCAAGTTCACGCAGTTTTTAGTAGATTTTCTCAGCGAAGGCAGA
TAAAATAAGTATAGATTGGTTTAGTAGGGGAAATTTCAGGATCTAAAAATGTCGGGATACGACGGAAGGTATGAAGGAAACGGTGCGGGTTACGATGAATGGGGTTCTTCTCCTCGTACCAAAGAAGAATACCGGGAACCTTCTCCATACGATGCTTTTGAAGACAGAGACACGCAACGCCAGCATTCCTTGCGTGATTC
AGAAAGAGAACGCCCAAGGAGCAAAGAAAAGGACCGGGACAGGGAAAGAGAAAGGGACAGGGATCGTCATCACAGAGATCACTATAGAGACAGAAGTGAGAGGGATGATAGGGGTAGAGGGCGAACTGAAGATCGTGAGCGGCATAGAAGTCATGATTATGACAGGCACAGAGATCATGATCGTGACAGAGAGAGAAGGC
ACAGGCACAGATCACGCTCTCCTTCAAGGGGTAAATCAAGGCATCACTCGAAGTCTCGTTCACGCTCACGCTCTAGAAGCAAAAGGACAAGTGGTTTTGACATGGCACCCCCTGGTGCTGCCATGATAGCTGGGACGACTGTAGCAGgcaatatgggggtacatgtccctctgtgctaccaatgggcgtggccactgtag
cttttatgtacaacgaggaatcaatgcaccggttttgatggatccttgttcgtcttcaaccggcaactattgcctttttggtagttttacataaatttccttcaatatttgtaataacaaattagtttctttttagttaattcatttaatagggagggaaatgaaataaataaatttgatattttgttgtggctcaaaaa
gctggttcaaaacaataatattccccagttgcaaattttcaacaactcatttaattatgtctgactgatgatgtggaattgttttttattttattttattaaaacattcagGTCAAACCACAGGAATAACACAGGCAATGCCGGGAATGTTTCCTAACATGTTTCCCTTTGGGAATGCACAGGTGATAGTGAAAAATTAC
ATCCTTCCTTGTAACATATACATTTCCTCTTTACAACTTGATCATATAAAGTTGCCAACAGAATCTGCAGGTTTCTATTTCAAATTTTATTTTATTGTTTAGCTCTAGAGTCTGACTAACAGATGATATACATTGGGACAGTTTGGAGGTCTTCCAGTGATGCCAGTGCAAGCAATGACACAACAGGTACCCTTCGCTTG
CCTTCCCACCCCTGTAAGTTGGTGAACGATAAATGAAACCCATATGAATAACTATTTCTCATATAGTAGTCTGACACATAATAGTACTATCTGGTCCTTTGTGTTTGTTATATTAATCATTTGATATTTGTAATGATTATGTTCTGTTATTTTCTTGGATTGCTTTTCTGTGTTGATTTGTTGTCTTTTGTTGATTTGCA
GCTTTAATACCCAATGTGAAATCCATTTTTGATTAAAAACCAGAAAATATGTAAGAGTTATCTAGCTGGTCTGTGGCAATGGAAACCAGAACAACTACAAAACTATTGTTTATCTTTGGTCAGCAACAAAAGTCTGCTGTGACTGTCTGTGAAAACCCAGGCTACAGCCTTTCTAACTATACAGAGATAACAAACATAAC
TGGAAATAAAACCAGTATAACCGGTGATAGAAAGAAACATAGCAGGGAAATATATACTGGGAAGGCTCATAATCTGAAATAGGGATAATTGGCACTTCTTGAATCAGAGCAGGAAACTGATTCAGCTGGAACAAAATTCGTTTTTGCTTCTCTCGGCTGTAAGAGTGTCTATCCCAACAGGGTTTTCATATGCCAAAAGA
GACTAACAATCTACATGTATTCTGTTTCCCACAAGCGATTGTTCCTGCCATCAGGAACCCATGACCCTACCTCCTGCACCGTTTAACCCATGACCCTACCTCCTGCACCGTTTAACCCATGACCCTACCTCCTGCACCATTTCTTCTTCTGCCATGACTTCCTGTTCCTGATGCACTTAGCATAGACCTGAGGCCTGTGG
CTGGAGCCACTGCCTTGCCTCCCCTTTCTCCCTTGGCCCCTTCCTGCCATACCTTCGCTGCACTAGCCTTTTCCCAACCGGTTCTGCTTTTCAGTTGGCTGAATTATCGGATGGAGGAATTTATTCCAATCTATTTGCACTGTGTTCAATCCCCACACCAGAACACCCAACAACAGTGGAAATGGTGCCACTACCCTCAG
AGAGCTTTTGCTGCTTACCAAAAACCGAATGTCCTAAAACCAATTGAGACTGCCAACCTATCGAAACATCATGGAAATGCTTACTGGTCTGCATCAGCCAATCTCCATCATTTGCATTCTGCAGCGTATCACCCTTGTTCTTATTTTAGAAATGATGATTTACTCATCAGCCTCTAATCTCATTACTGTCTGTTTGTTTA
ATATATCAAAGCCCTGGACCATATGTGTTTTAAGGAATAGAATATAGCTAGAATTCAATGAGGAAAAGATGGAAATAAGTCTGAAGACTTAGCACTGCTGCAAAACTTCATAAATATAAAACACTTCAATAACGAAAAAGCACCATTGTAAAGGAATGACTCACTATATAAAAAATGTTGTGGAAATATATGCAGCCTCA
GTTGTTGCTGAGTGGCCACCATCCAAGGTTTGCTAGTCTTACTTGCAAGGAGTAGAATAAGCTCATGGCCTTTGTGGCATGTAAAAGTAATTTTTCTGTCTTAAAATTATTATAATTTTATTTCATAAAACAAAAGCACATTTTACAAATGCTACCAGCATAGATCCATCTTAAAGAGGATCTACCAAGATCCTAGAGGG
ATCAAATCTCTCGAAGTGCAAACCCCTTTTTTGAATGCAAGTGTTGAGGAAGCATTTTAATTTATCTAATTTGTGTAGCTTTATATATATGCCGTTGTAAATGTTTTAAATAGCCAACATGTTATTTTTTATAATATTTTATTAATTTTTAAAAAGGACATGTGTCATCTAGGATAAGCACGGAAGGAGTTACACATCCC
CCCCTACTGGGCTGTAGATTGCGCCTCTTCAGCGCAATAACCTCCTGAGGGATGAAACTGCATCTAAGAGCATGAACAGCACATACTAAATCCTTCAGGTCTGACCAATAGCAATAAGCCATATGAACCAGAATTAACAGAAAGAAGGGTGGACGAATTCAGAAGATTGTCCATGGTCATCTTCTTGGATGATCCATTGT
CTACTATCTAAATGTAAACCTTCCTTAGATAATTCATCAGTAACCATGTTCATTTCCCTGTACATATGCTGAAAATAATTTCTGTTGAAAACAGGAATGATGCCCTTGATTTCATTAAGTACATTCCTCCTTCATCCATTTTATCATAAGCAGATAATCCTCAAAGATTTATCTGCTTATGATGCTAGAGTGGATCATAT
ATAAAGTCATCTGTGCTGCAAATTTGTCTGAACCCTGTTCTAAATCCCACTTTAAATTTCAGATTGTGTATTCTTCAGGAAAAGTATTCCCCAGCTCCCAGTATTGTGGGTCTCCCTGAGAAGCTTTATCAAATTAGGCCCAAGTATTGGAAGACTTGGTATTTTGAATTTTCCAAGGCTATTTGTATAGCAGGCTTTAG
AATACTAATCCCTTGGGATGCACAATGTAGAGGGGGTATAAAATTTATCATCAAAAAGACTAGCATTTCTTGCTAGCTAAATGCTCCATGCTAAAATCATAGGGCATAATCAGTAATGCTCTCTATCCCCCTCTAGACCTCCCTAAAGTAAGCACAGGGCATAATAAGACGAGTGTTTATTTCTTCATTATCTTTACATA
AAGAACCTTCCAGGTCCATAGGTCCATATTTGTTTCTTTTTAGAATCCCAAGTAAGAGCTTGTTATTGAGTAACAACCACATAAAAAAG