sp|Q9SB00|PHR_ARATH ----> Deoxyribodipyrimidine photo-lyase


Intron 1 GTAAGTTGAT ... TCTTTCTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A121.941914
A220.752147
A318.521132
A420.552969
A5201224
A619.73591118
A720.21771524
A820.431112235
A918.1863919
A1012.595989



>TRINITY_DN132230_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform
CACGACTGTAAACTCCAATTATGGCGGTCTATACAACGTTGATGTATCGTCCATCACTTGTTTTGGCAGCTCAGCTTTTGTCCAAAGAGACTTCACTATTTATTCAACACAATCACTGCCAATGCTTACGAGGGAAACTCTCGGAGCTTTGTTCCCTGCTCAAAGTTTATCAGAGTTGAATAGATTAAAGAAGTATCCAA
TCATAGTCTTCATTAACCAGACTGCTGCACAATCCCCTTGGCTGTTTTTGAAGATTTTTGGGTATGTAGGTATCAGTGGAAATTGCCTTTTCAGACCTTTAAACTTAATAATTTCTCACAGTGCAAGGAACTTGCATATGGCTTCGGTTAAAAAACCAGTTCATGGGAGAGTTGAAGACGACAATAATATTTCTTCTACG
AAGAAGAAATTGAAGTTGAAGGATAGCGGCGTGGCAGCCATTGAGGTGAAGGTTGAAGGTGTGAGCAAAGTCCAGCAAGGAAGAGTTAGGGTTTTGAAAGCTGGAATCGAGGGGGAAAATGTGGGGCCTGTTGTGTATTGGATGTCTAGAGACCAGAGGTCAAGAGACAACTGGGCTCTCTTGTATGCAGTCGAGCAGGC
TACCAAAATGAAGACTTCAGTTGCGGTGGCTTTTAATTTGGTTGACGATTTCTTGGAAGCGAGAGCTCGCCATTTCGGTTTCATGCTCAGGGGATTGCGAGTAGTGGAAAGCAATCTCAAGTCTATGGGGATTCCATTCTTTTTGTTTCAGGGCAAAGCAGAGGAGAACATTCCCGATTTTTTGGTAAGATGTTGTGCTT
CTCTTCTGGTGATGGACTTCTCTCCTTTACGAATTGGTCGATTATGGAGGGAAAACATTTGCAAACGAGTAGCTGAGGTTACTGCTGTTCATGAGGTGGATGCTCATAACATTGTGCCAGTATGGAAAGCATCTGCTAAACTGGAGTACAGTGCACGTACTATAAGAACTAAGATTCAAAAGCAGCTTGATGAGTACCTT
GTACAGTTTCATGATGTCAAAATACCTTATCAGAATTGGCTTGCTGATGCACCAGTAGATATAGACTGGGATGCTCTCCTTGGTACTGTTCTCAGGAAGGGTGCAGAAGTTCCAGAAATTCATTGGTGTGAACCTGGAGAGGATGCAGCCAAGGAAGTATTGCTTGGGACAAAGAATGGCTTTTTGACAGCCAGACTGAA
AAATTATGCTGATGATAGGAATGATCCTTCAAAGCTTATGGGTTTATCTGGACTTTCTCCTTACTTGCATTATGGCCAGATTTCTGCACAACGATGTGCTCTGGAGGCCCTCGCCTTTCGGAAAACTCATCCAAAGTCTGTAGATACTTTTGTCGAAGAGCTGGTTATAAGGAGGGAACTTGCAGACAATTTCTGCTTCT
ACCAGCCACATTATGATACTCTACAAGGTGCATGGGAATGGGCTCGCAAAACCTTGATGGATCATGCGTCTGACAAGCGGGAACATAACTACACGAGGGAACAACTTGAAAAAGCAAAAACAACTGATCCTCTTTGGAATGCTGCTCAGTTGGAGATGGTTCACCACGGCAAAATGCATGGTTTCATGCGAATGTATTGG
GCTAAAAAGATCCTTGAATGGACAAGAGGACCGGAAGAAGCTCTTGCGATAGCTATATATTTAAATGACAAGTATGAGATTGATGGGAGAGATCCAAATGGATATGTTGGTTGCATGTGGTCTATATGTGGTGTCCATGATCAGGGTTGGCAAGAGCGTCCAGTCTTTGGGAAAGTAAGGTATATGAACTATGCAGGTTG
CAAGCGAAAATTTAATGTTGATGGATACATCATGTATGTTAATCGACTGGTGGCTGAAATCAAGAAGCAAGCAAAAGCTAGCACAGTGGCAACCACAAGCTGAAGAATCTCGAATATAACGTATGTTTATGCTGGATTTTCTCAGCTTTGCCAGGGTTTTTATCCGAGTTCTGAAAAATCTCAAAGGAATAAAATATTGC
GGGGTCAATATATTCAATATGAACGTGGTCCTCTTTAGGGCTGCCTGGTCACAACCATTTTAGTCACGATGTTAAAATTGGGGATGTATGGGGTTACAAAAACGTTGCAAATTTTTGTTGAAGGTTTTAAACATGTATTCATTTTGACACACTGCTATATGCTCATTGAATGATGATGTCAACTTTTCAAGCGG


>TRINITY_DN132230_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CACGACTGTAAACTCCAATTATGGCGGTCTATACAACGTTGATGTATCGTCCATCACTTGTTTTGGCAGCTCAGCTTTTGTCCAAAGAGACTTCACTATTTATTCAACACAATCACTGCCAATGCTTACGAGGGAAACTCTCGGAGCTTTGTTCCCTGCTCAAAGTTTATCAGAGTTGAATAGATTAAAGAAGTATCCAA
TCATAGTCTTCATTAACCAGACTGCTGCACAATCCCCTTGGCTGTTTTTGAAGATTTTTGGGTATGTAGGTATCAGTGGAAATTGCCTTTTCAGACCTTTAAACTTAATAATTTCTCACAGTGCAAGGAACTTGCATATGGCTTCGGTTAAAAAACCAGTTCATGGGAGAGTTGAAGACGACAATAATATTTCTTCTACG
AAGAAGAAATTGAAGTTGAAGGATAGCGGCGTGGCAGCCATTGAGGTGAAGGTTGAAGGTGTGAGCAAAGTCCAGCAAGGAAGAGTTAGGGTTTTGAAAGCTGGAATCGAGGGGGAAAATGTGGGGCCTGTTGTGTATTGGATGTCTAGAGACCAGAGGTCAAGAGACAACTGGGCTCTCTTGTATGCAGTCGAGCAGGC
TACCAAAATGAAGACTTCAGTTGCGGTGGCTTTTAATTTGGTTGACGATTTCTTGGAAGCGAGAGCTCGCCATTTCGGTTTCATGCTCAGGGGATTGCGAGTAGTGGAAAGCAATCTCAAGTCTATGGGGATTCCATTCTTTTTGTTTCAGGGCAAAGCAGAGGAGAACATTCCCGATTTTTTGGTAAGATGTTGTGCTT
CTCTTCTGGTGATGGACTTCTCTCCTTTACGAATTGGTCGATTATGGAGGGAAAACATTTGCAAACGAGTAGCTGAGGTTACTGCTGTTCATGAGGTGGATGCTCATAACATTGTGCCAGTATGGAAAGCATCTGCTAAACTGGAGTACAGTGCACGTACTATAAGAACTAAGATTCAAAAGCAGCTTGATGAGTACCTT
GTACAGTTTCATGATGTCAAAATACCTTATCAGAATTGGCTTGCTGATGCACCAGTAGATATAGACTGGGATGCTCTCCTTGGTACTGTTCTCAGGAAGGGTGCAGAAGTTCCAGAAATTCATTGGTGTGAACCTGGAGAGGATGCAGCCAAGGAAGTATTGCTTGGGACAAAGAATGGCTTTTTGACAGCCAGACTGAA
AAATTATGCTGATGATAGGAATGATCCTTCAAAGCTTATGGGTTTATCTGGACTTTCTCCTTACTTGCATTATGGCCAGATTTCTGCACAACGATGTGCTCTGGAGGCCCTCGCCTTTCGGAAAACTCATCCAAAGTCTGTAGATACTTTTGTCGAAGAGCTGGTTATAAGGAGGGAACTTGCAGACAATTTCTGCTTCT
ACCAGCCACATTATGATACTCTACAAGGTGCATGGGAATGGGCTCGCAAAACCTTGATGGATCATGCGTCTGACAAGCGGGAACATAACTACACGAGGGAACAACTTGAAAAAGCAAAAACAACTGATCCTgtaagttgattagaaattggtctgtttgaattttgagtgtgaaagttattaataattatggtccatggt
attataattattttatgtttttttaacttaatgtagtagttgttaaacaaggtgaaattattatctaatttgttttctgtgattctgagaagtagtcaatggccagacccattgatttctggcatttgacaacattcacacacaaatatggtcagtgttgttataatcatagttttctctgatatctgccgtactatttg
tatgctatttggggtgttgaatgcctatagcttcactgctcaatcaagagcttaaatccttggaacaaaatttgttaatttgtttaaccacacaggttgtgtgggtccatctttgtaaatgtttggtatcagcttgtccttgttcaaggaataattttcccaagactattccttggtaaattgtcttttcatttatattt
ctgaacatcacttaatcagttctttctcag
CTTTGGAATGCTGCTCAGTTGGAGATGGTTCACCACGGCAAAATGCATGGTTTCATGCGAATGTATTGGGCTAAAAAGATCCTTGAATGGACAAGAGGACCGGAAGAAGCTCTTGCGATAGCTATATATTTAAATGACAAGTATGAGATTGATGGGAGAGATCCAAATGG
ATATGTTGGTTGCATGTGGTCTATATGTGGTGTCCATGATCAGGGTTGGCAAGAGCGTCCAGTCTTTGGGAAAGTAAGGTATATGAACTATGCAGGTTGCAAGCGAAAATTTAATGTTGATGGATACATCATGTATGTTAATCGACTGGTGGCTGAAATCAAGAAGCAAGCAAAAGCTAGCACAGTGGCAACCACAAGCT
GAAGAATCTCGAATATAACGTATGTTTATGCTGGATTTTCTCAGCTTTGCCAGGGTTTTTATCCGAGTTCTGAAAAATCTCAAAGGAATAAAATATTGCGGGGTCAATATATTCAATATGAACGTGGTCCTCTTTAGGGCTGCCTGGTCACAACCATTTTAGTCACGATGTTAAAATTGGGGATGTATGGGGTTACAAAA
ACGTTGCAAATTTTTGTTGAAGGTTTTAAACATGTATTCATTTTGACACACTGCTATATGCTCATTGAATGATGATGTCAACTTTTCAAGCGG