sp|Q43531|CCAMK_LILLO ----> Calcium and calcium/calmodulin-dependent serine/threonine-protein kinase

Intron 1 GTAGTTGCTG ... TGCCAAAGAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	84.16	16	85	17
A2	92.65	5	63	15
A3	92.21	6	71	14
A4	83.33	11	55	4
A5	88.37	5	38	4
A6	93.21	56	769	149
A7	91.02	43	436	82
A8	90.22	87	803	158
A9	94.44	30	510	107
A10	95.03	15	287	56

>TRINITY_DN113713_c0_g7_i3 from sample A3 / Example spliced isoform

TCGTAATATTTCTAATACACAAATACCTCTCCATTCCAAAAACAAACACATTCCACAGCGCTGAGCAAAATCCCTTGCCAAAAGTAAATTAATTTCCAAATGTTTAACACTATTCAATTAATACCGTGCCGTTCCTGGGACGTCAACAAACCCTTCCAGAATATTACACTCAGATACGAAGCCAAAAAACCAATTATTTA
CAATATGTATAATTTTTAATTAGATTACAGAGCCTATGCATCAAAATGGATCCTTCCGCACTTACTCAACCACGGCTGCTTCATATTCGGCGGTGAGTATCGAATTCTCCGCTTTTCCTAGGTTTTTGCGCGGATCTGATGCCGTATTCGTCTCTGTCGCTCTCGAAATACTTGGATAGGGTAAGGTTTGAACTCAGACA
AACGTTCTATGGCTTCCATGAAGTTTTATTCATAATCTGCAATATTTAGAGCTAGCAATATCAGTCAATACTCAAATTACTCCACAGCCGCCGTGGAAATCAATGCAGAATTCAGTATTTCGAAGTCACTGGGAGTACTCTTACACGGTTTCAGCTCGGAAAAACGCTTGAAATGTGTGCAGTAGTTCGGATCGATTGAA
ATTCTTTTATATTGAATTTGGAAATTGCGATTTAGAGCTGAAGGTGGGGAAATTCCATGGTCCGGAGCTAAACTTGAAGAAATTTAGTAGTCAGACCTAAACTTGGAGAAATTCAGCCATTCAGTGCCGAACTTCGAGAAATTTAGCGATTCAGAGCTAAAGTCAGGGTCGCCATTAGTCACAGACGGATTTGGATTGGG
GAAACGAGCTTCATCCGCAATGGTAGCGGATGAAGCCGGGTCGAATGGTTCTATGAAGGCGTTCGGATGCGTATACAGAACTGGCCGCAGGGGCGTAAGCGTTATTTTTGTCGAAGGGAGTTTGTTGAGGTGAATCTTTGTCTCGGCCACTATGAAATCAGGAATTTCTTCGGATGCAAGATCTGTCGGTAGATTGGGCG
CTTCACCAGGAGATCGGCCTAAAGGATCACCACAAAGAGGTTTGAAAGATTTTGCCAAAAAACTTGTCGATAGCAAAGCATTCACAAACAAGCTTCAAGATTGGTTTTCAAGAAAGCGAGATACGTCTGTAGATGGAGAGTCTCCTTTTCATAGAAAATTTCTCTTTGAGTCTCCTTTTCAGCTCGAGGAGCTTCGTGAG
TTCGATTATGCTCTGGAGGGCATTGGTTTCCAACAGCTGCTTCGCATGCCTTGTGGACCGGATGCGTCCACTTCAGGTGCAGTGGAAGCAGATGCATATCTTGCATTGGAAGACTTTTTGCATGCTGGAGCGCAAAGTTTATGGGAAGCATTTTGGAGTAAGGAGGGACCGACGCCGTTTTATATAAGTTGTCCATATGG
CGTGGGATCGAAGTTTCATACCGTGGAGAAGGCAGTTGCAAGGGGAAAAGTTGGAGGCCTTCGTGGAGCAGCTTTGGTAGTAAAAAATAGTCGGAATTCCCATGGGGAGTGGGATCATGTTGCAGAACTTGCTTTGCTGAGGACTGATGCTGGTGGTTTGTCTCAAGAAACCGAGCGAATTCCTTCTTTTGCAGACATTG
GTGAAGCTTTATTCTATGGACTTTATATGTTGTTGTCAAGAAGCTTAAGTAAGTCGAATATGGTAAAGCATGACGACTGTGCATATGTGCTAGTTGTTGATTATCAGTTTGGTGGTGTGGTAAGGCTTAAAGGAGATGTGAATAAATTGGATATAAATGTAAATAGGGTATATGATTGTGCGGTAGAGTGGATACAACAG
CATGCAGAGGTTAGAGTCTCCTCTTTTGATCAAATATGGAACAAGCTTGGTAATGCTAATTGGGGAGATGTTGGCACTCTCCAGCTTCTATTGGCCACCTTTTACTCTATCGTGCAATGCAAAGGGTTGCCAAAAAGGTCAATTGCTGAGCTTGCTGCAGATCATGGTGCTCGTTTGCAAAAGCGAAGAATTGAACGGCG
GCCTCTTGAAGTTCATGAGAATGGCAGTGATTCTTTCCGTCGTCATCAAAGCAGTCGTTCTCATGGGGAAATTGTTGAAATTCAGGATGAATCAGAATCTGCTATAAGGAAAGAAATGGAGGGTATGAAGCTTGAACCAGGAACTGTGCTATGGTTGGAAGATTCACATTGGCAAAGAGGTTTTCAGATACATGAGGTTC
TAGGAGATGAACGGCGCTCCTTGTACAGTTCGACTTCTTTGGAAGAACCAGGAAAGCTTCTGGCTGTTTATGTAGGTTCCCATCCTTCCGAATTTGAGCCTGCATGGGAAGATATGAGTATGTGGTACCAGGTCCAGCGTCAGACCAAAGTGTTGAATATCATGAAACAAAGGGGCATATCAAGTAAGTACCTACCACAG
CTTGTTGCTTCTGGAAGGATCATGCACCCTGGTCCTTGCCACAGACAGAGTCCTGGTGGTCGCTGTGACCATCCATGGTGTGGAACCCCAATTCTAGTGACTTCTCCGGTTGGAGAATCAGTTGCCACTATTGTTGCAAGAAATGGGGTATTCAATACAGAGGAAGCACTGCGATGCTGTTATGATTGTTTATCTGCTTT
GCGAAGTACAGTGTCTGCAGGGATCCAACATGGAGATATCTCACCGGATCATGTAATCCGCATGGCATCTGGGGAAAGACATTCTTACTATATACTTGTGGACTGGGGACATGCTGTTCTTGAAGATAGAGATAGTCCTGCAATTAATGTTCAGTTTTCCTCCACTTATGCCCTCCAAGAAAGAAAACTCTGCCCTGCCT
CAGATGTTGAAAGCGTGGTTTACCTGCTGTATTATTTATGTGGTGGAACTATACCACATCTAGAATCACTGGAAGCTGCTTTGCAGTGGAGAGAGAGATCTTGGGCGAGAAGAACAATTCAACAGCAGCTTGGTGAAGTTTCAGCTGTATTGAAAGCTTTTGCCGACTATGTTGATAGTCTCTGTGGTACTCCGTATCCT
GTAGATTATGAAATATGGTTACGAAGATTAAATAGAGCGCTGCATGGTGAAGATCATGGTAAATGGATTGATAATAGTGCACCTTTAGGAAGGAATGATGATGTGGCTGAATCCTCTGGAACATCTGGAGCATCCTTTTCCTAAAGCCATGCAGACTGAATGCATTTGGTGTTTACTTGTAACTGTATTTGTTCCTTCTG
ACAGGAATACCTATTCAGAGTTAAGTGGAAAGGGTGTGGAATTCCTGCATTTGAAAGCATGTGGGTATTGTTTTAAAACGTAAATTTGTGAAAACAAGAAGTGATAAAAATGGAGAATAAGGTTGAAGATGATGATTTTCAAAGTGCAGGCATTGTAGAATCTGACCCATCCATTTTTCTGAAGTGACTGGAGAGGACTC
AATAGGCACATTCCTGAATCAGTTCTGTCCATGTCAAAACTTTTTTCATCATTCTGCTCAAGTGAAAAGCTTCTCATTGGCCAGGTAGTTGCTGATGCTGGCATTTTCCTTCTTGTGAATGTAATATGGTGTCATGTATGAGAGCCTTGGCATCAAAAGATGGCAACATAAGCTTTGAGTTATGTCTTGCCAACGAGGTA
TTTGTCAACAATATTTGATTGGACTTGTTTGTTATGTTCATGCTTGTTTTAAATATTATGTTGCTTCTTTCTGGTTGCTCTCAAGTTCACTGCGCTAAAACTTGTAACGGAAGAGAATTTCATGTTTGAGCTGCTAGTTGCTAGGTGTTTGAGTATGGAAACATAGATATGGATGATTTTCAAAGTGCAGGCATTGTAGA
ATCTGACCCATCCATTTTTCTGAAGTGGTTAGAGCGGACTCAATAGACACATCCTTGAATCAGCTCTATCTGCGTCAAAACTTTTTCCATCAATCTGCTCAAGTGAAAAGCTTCTCATTGGCTGTCAGGAGGACCTTTATAATGAAGGTGAAATCAGTATGAGGTTCTACAGTAAGTTCTGAGGCATTTCTTAGTGTGAC
TCTTTAGTTTATATTCTATT

>TRINITY_DN113713_c0_g7_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:

TCGTAATATTTCTAATACACAAATACCTCTCCATTCCAAAAACAAACACATTCCACAGCGCTGAGCAAAATCCCTTGCCAAAAGTAAATTAATTTCCAAATGTTTAACACTATTCAATTAATACCGTGCCGTTCCTGGGACGTCAACAAACCCTTCCAGAATATTACACTCAGATACGAAGCCAAAAAACCAATTATTTA
CAATATGTATAATTTTTAATTAGATTACAGAGCCTATGCATCAAAATGGATCCTTCCGCACTTACTCAACCACGGCTGCTTCATATTCGGCGGTGAGTATCGAATTCTCCGCTTTTCCTAGGTTTTTGCGCGGATCTGATGCCGTATTCGTCTCTGTCGCTCTCGAAATACTTGGATAGGGTAAGGTTTGAACTCAGACA
AACGTTCTATGGCTTCCATGAAGTTTTATTCATAATCTGCAATATTTAGAGCTAGCAATATCAGTCAATACTCAAATTACTCCACAGCCGCCGTGGAAATCAATGCAGAATTCAGTATTTCGAAGTCACTGGGAGTACTCTTACACGGTTTCAGCTCGGAAAAACGCTTGAAATGTGTGCAGTAGTTCGGATCGATTGAA
ATTCTTTTATATTGAATTTGGAAATTGCGATTTAGAGCTGAAGGTGGGGAAATTCCATGGTCCGGAGCTAAACTTGAAGAAATTTAGTAGTCAGACCTAAACTTGGAGAAATTCAGCCATTCAGTGCCGAACTTCGAGAAATTTAGCGATTCAGAGCTAAAGTCAGGGTCGCCATTAGTCACAGACGGATTTGGATTGGG
GAAACGAGCTTCATCCGCAATGGTAGCGGATGAAGCCGGGTCGAATGGTTCTATGAAGGCGTTCGGATGCGTATACAGAACTGGCCGCAGGGGCGTAAGCGTTATTTTTGTCGAAGGGAGTTTGTTGAGGTGAATCTTTGTCTCGGCCACTATGAAATCAGGAATTTCTTCGGATGCAAGATCTGTCGGTAGATTGGGCG
CTTCACCAGGAGATCGGCCTAAAGGATCACCACAAAGAGGTTTGAAAGATTTTGCCAAAAAACTTGTCGATAGCAAAGCATTCACAAACAAGCTTCAAGATTGGTTTTCAAGAAAGCGAGATACGTCTGTAGATGGAGAGTCTCCTTTTCATAGAAAATTTCTCTTTGAGTCTCCTTTTCAGCTCGAGGAGCTTCGTGAG
TTCGATTATGCTCTGGAGGGCATTGGTTTCCAACAGCTGCTTCGCATGCCTTGTGGACCGGATGCGTCCACTTCAGGTGCAGTGGAAGCAGATGCATATCTTGCATTGGAAGACTTTTTGCATGCTGGAGCGCAAAGTTTATGGGAAGCATTTTGGAGTAAGGAGGGACCGACGCCGTTTTATATAAGTTGTCCATATGG
CGTGGGATCGAAGTTTCATACCGTGGAGAAGGCAGTTGCAAGGGGAAAAGTTGGAGGCCTTCGTGGAGCAGCTTTGGTAGTAAAAAATAGTCGGAATTCCCATGGGGAGTGGGATCATGTTGCAGAACTTGCTTTGCTGAGGACTGATGCTGGTGGTTTGTCTCAAGAAACCGAGCGAATTCCTTCTTTTGCAGACATTG
GTGAAGCTTTATTCTATGGACTTTATATGTTGTTGTCAAGAAGCTTAAGTAAGTCGAATATGGTAAAGCATGACGACTGTGCATATGTGCTAGTTGTTGATTATCAGTTTGGTGGTGTGGTAAGGCTTAAAGGAGATGTGAATAAATTGGATATAAATGTAAATAGGGTATATGATTGTGCGGTAGAGTGGATACAACAG
CATGCAGAGGTTAGAGTCTCCTCTTTTGATCAAATATGGAACAAGCTTGGTAATGCTAATTGGGGAGATGTTGGCACTCTCCAGCTTCTATTGGCCACCTTTTACTCTATCGTGCAATGCAAAGGGTTGCCAAAAAGGTCAATTGCTGAGCTTGCTGCAGATCATGGTGCTCGTTTGCAAAAGCGAAGAATTGAACGGCG
GCCTCTTGAAGTTCATGAGAATGGCAGTGATTCTTTCCGTCGTCATCAAAGCAGTCGTTCTCATGGGGAAATTGTTGAAATTCAGGATGAATCAGAATCTGCTATAAGGAAAGAAATGGAGGGTATGAAGCTTGAACCAGGAACTGTGCTATGGTTGGAAGATTCACATTGGCAAAGAGGTTTTCAGATACATGAGGTTC
TAGGAGATGAACGGCGCTCCTTGTACAGTTCGACTTCTTTGGAAGAACCAGGAAAGCTTCTGGCTGTTTATGTAGGTTCCCATCCTTCCGAATTTGAGCCTGCATGGGAAGATATGAGTATGTGGTACCAGGTCCAGCGTCAGACCAAAGTGTTGAATATCATGAAACAAAGGGGCATATCAAGTAAGTACCTACCACAG
CTTGTTGCTTCTGGAAGGATCATGCACCCTGGTCCTTGCCACAGACAGAGTCCTGGTGGTCGCTGTGACCATCCATGGTGTGGAACCCCAATTCTAGTGACTTCTCCGGTTGGAGAATCAGTTGCCACTATTGTTGCAAGAAATGGGGTATTCAATACAGAGGAAGCACTGCGATGCTGTTATGATTGTTTATCTGCTTT
GCGAAGTACAGTGTCTGCAGGGATCCAACATGGAGATATCTCACCGGATCATGTAATCCGCATGGCATCTGGGGAAAGACATTCTTACTATATACTTGTGGACTGGGGACATGCTGTTCTTGAAGATAGAGATAGTCCTGCAATTAATGTTCAGTTTTCCTCCACTTATGCCCTCCAAGAAAGAAAACTCTGCCCTGCCT
CAGATGTTGAAAGCGTGGTTTACCTGCTGTATTATTTATGTGGTGGAACTATACCACATCTAGAATCACTGGAAGCTGCTTTGCAGTGGAGAGAGAGATCTTGGGCGAGAAGAACAATTCAACAGCAGCTTGGTGAAGTTTCAGCTGTATTGAAAGCTTTTGCCGACTATGTTGATAGTCTCTGTGGTACTCCGTATCCT
GTAGATTATGAAATATGGTTACGAAGATTAAATAGAGCGCTGCATGGTGAAGATCATGGTAAATGGATTGATAATAGTGCACCTTTAGGAAGGAATGATGATGTGGCTGAATCCTCTGGAACATCTGGAGCATCCTTTTCCTAAAGCCATGCAGACTGAATGCATTTGGTGTTTACTTGTAACTGTATTTGTTCCTTCTG
ACAGGAATACCTATTCAGAGTTAAGTGGAAAGGGTGTGGAATTCCTGCATTTGAAAGCATGTGGGTATTGTTTTAAAACGTAAATTTGTGAAAACAAGAAGTGATAAAAATGGAGAATAAGGTTGAAGATGATGATTTTCAAAGTGCAGGCATTGTAGAATCTGACCCATCCATTTTTCTGAAGTGACTGGAGAGGACTC
AATAGGCACATTCCTGAATCAGTTCTGTCCATGTCAAAACTTTTTTCATCATTCTGCTCAAGTGAAAAGCTTCTCATTGGCCAGGTAGTTGCTGATGCTGGCATTTTCCTTCTTGTGAATGTAATATGGTGTCATGTATGAGAGCCTTGGCATCAAAAGATGGCAACATAAGCTTTGAGTTATGTCTTGCCAACGAGGTA
TTTGTCAACAATATTTGATTGGACTTGTTTGTTATGTTCATGCTTGTTTTAAATATTATGTTGCTTCTTTCTGGTTGCTCTCAAGTTCACTGCGCTAAAACTTGTAACGGAAGAGAATTTCATGTTTGAGCTGCTAGTTGCTAGGTGTTTGAGTATGGAAACATAGATATGGATGATTTTCAAAGTGCAGGCATTGTAGA
ATCTGACCCATCCATTTTTCTGAAGTGGTTAGAGCGGACTCAATAGACACATCCTTGAATCAGCTCTATCTGCGTCAAAACTTTTTCCATCAATCTGCTCAAGTGAAAAGCTTCTCATTGGCTGTCAGgtagttgctgatgctggcattttccttgtgaatgtaatatggtgtcatgtatgatagccttggtttcaaaag
atggcaacataagctttgagttatgtcttgccaaagagGAGGACCTTTATAATGAAGGTGAAATCAGTATGAGGTTCTACAGTAAGTTCTGAGGCATTTCTTAGTGTGACTCTTTAGTTTATATTCTATT

Intron 2 GTAGTTGCTG ... TGGCTGTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	78.83	29	108	1
A2	87.8	10	72	4
A3	87.1	12	81	2
A4	85.33	11	64	8
A5	84.85	10	56	0
A6	86.81	133	875	14
A7	88.72	67	527	15
A8	87.15	133	902	29
A9	86.75	90	589	10
A10	84.45	58	315	4

>TRINITY_DN44845_c0_g2_i2 from sample A8 / Example spliced isoform

ATTACACTCAGATACGAAGCCAAAAAACCAATTATTTACAATATGTATAATTTTTAATTAGATTACAGAGCCTATGCATCAAAATGGATCCTTCCGCACTTATTCAACCACGGCTGCTTCATATTCGGCGGTGAGTATCGAATTCTCCGCTTTTCCTAGGTTTTTGCGCGGATCTGATGCCGTAGTCGTCTCTGTCGCTC
TCGAAATACTTGGATAGGGTAAGGTTTGAACTCAGACAAACGTTCTATGGCTTCCATGAAGTTTTATTCATAATCTGCAATATTTAGAGCTAGCAATATCAGTCAATACTCAAATTACTCCACAGCCGCCGTGGAAATCAATGCAGAATTCAGTATTTCCAAGTCACTGGGAGTAATCTTACACGGTTTCAGCTCGGAAA
AACGCTTGAAATGTGTGCAGTAGTTCGGATCGATTGAAATTCTTTTATATTGAATTTGGAAATTGCGATTTAGAGCTAAACTTGAAGAAATTCCATGGTCCGGAGCTAAACTTGAAGAAATTTAGTAGTCAGACCTAAACTTGGAGAAATTCAGCCATTCAGTGCCAAACTTCGAGAAATTTAGCGATTCAGAGCTAAAG
TCAGGGTCGCCATTAGTCACAGACGGATTTGGATTGGGGAAACGAGCTTCATCCGCAATGGTAGCGGATGAAGCCGGGTCGAATGGTTATATGAAGGCGTTCGGATGCGTATACAGAACTGGCCGCAGGGGCGTAAGCGTTATTTTTGTCGAAGGGAGTTTGTTGAGGTGAATCTTTGTCTCGGCCACTATGAAATCAGG
AATTTCTTCGGATGCAAGATCTGTCGGTAGATTGGGCGCTTCACCAGGAGATCGGCCTAAAGGATCACCACAAAGAGGTTTGAAAGATTTTGCCAAAAAACTTGTCGATAGCAAAGCATTCACAAACAAGCTTCAAGATTGGTTTTCAAGAAAGCGAGATACGTCTGTAGATGGAGAGTCTCCTTTTCATAGAAAATTTC
TCTTTGAGTCTCCTTTTCAGCTCGAGGAGCTTCGTGAGTTCGATTATGCTCTGGAGGGCATTGGTTTCCAACAGCTGCTTCGCATGCCTTGTGGACCGGATGCGTCCACTTCAGGTGCAGTGGAAGCAGATGCATATCTTGCATTGGAAGACTTTTTGCATGCTGGAGCGCAAAGTTTATGGGAAGCATTTTGGAGTAAG
GAGGGACCGACGCCGTTTTATATAAGTTGTCCATATGGCGTGGGATCGAAGTTTCATACCGTGGAGAAGGCAGTTGCAAGGGGAAAAGTTGGAGGCCTTCGTGGAGCAGCTTTGGTAGTAAAAAATAGTCGGAATTCCCATGGGGAGTGGGATCATGTTGCAGAACTTGCTTTGCTGAGGACTGATGCTGGTGGTTTGTC
TCAAGAAACCGAGCGAATTCCTTCTTTTGCAGACATTGGTGAAGCTTTATTCTATGGACTTTATATGTTGTTGTCAAGAAGCTTAAGTAAGTCGAATATGGTAAAGTATGACGACTGTGCATATGTGCTAGTTGTTGATTATCAGTTTGGTGGTGTGGTAAGGCTTAAAGGAGATGTGAATAAATTGGATATAAATGTAA
ATAGGGTATATGATTGTGCGGTAGAGTGGATACAACAGCATGCAGAGGTTAGAGTCTCCTCTTTTGATCAAATATGGAACAAGCTTGGTAATGCTAATTGGGGAGATGTTGGCACTCTCCAGCTTCTATTGGCCACCTTTTACTCTATCGTGCAATGCAAAGGGTTGCCAAAAAGGTCAATTGCTGAGCTTGCTGCAGAT
CATGGTGCTCGTTTGCAAAAGCGAAGAATTGAACGGCGGCCTCTTGAAGTTCATGAGAATGGCAGTGATTCTTTCCGTCGTCATCAAAGCAGTCGTTCTCATGGGGAAATTGTTGAAATTCGGGATGAATTAGAATCTGCTATAAGGAAAGAAATGGAGGGTATGAAGCTTGAACCAGGAACTGTGCTATGGTTGGAAGA
TTCACATTGGCAAAGAGGTTTTCAGATACATGAGGTTCTAGGAGATGAACGGCGCTCCTTGTACAGTTCGACTTCTTTGGAAGAACCAGGAAAGCTTCTGGCTGTTTATGTAGGTTCCCATCCTTCCGAATTTGAGCCTGCATGGGAAGATATGAGTATGTGGTACCAGGTCCAGCGTCAGACCAAAGTGTTGAATATCA
TGAAACAAAGGGGCATATCAAGTAAGTACCTACCACAGCTTGTTGCTTCTGGAAGGATCATGCACCCTGGTCCTTGCCACAGACAGAGTCCTGGTGGTCGCTGTGACCATCCATGGTGTGGAACCCCAATTCTAGTGACTTCTCCGGTTGGAGAATCAGTTGCCACTATTGTTGCGAGAAATGGGGTATTCAATACAGAG
GAAGCACTGCGATGCTGTTATGATTGTTTATCTGCTTTGCGAAGTACAGTGTCTGCAGGGATCCAACATGGAGATATCTCACCGGATCATGTAATCCGCATGGCATCTGGGGAAAGACATTCTTACTATATACTTGTGGACTGGGGACATGCTGTTCTTGAAGATAGAGATAGTCCTGCAATTAATGTTCAGTTTTCCTC
CACTTATGCCCTCCAAGAAAGAAAACTCTGCCCTGCCTCAGATGTTGAAAGCGTGGTTTACCTGCTGTATTATTTATGTGGTGGAACTATACCACATCTAGAATCACTGGAAGCTGCTTTGCAGTGGAGAGAGAGATCTTGGGCGAGAAGAACAATTCAACAGCAGCTTGGTGAAGTTTCAGCTGTATTGAAAGCTTTTG
CCGACTATGTTGATAGTCTCTGTGGTACTCCGTATCCTGTAGATTATGAAATATGGTTACGAAGATTAAATAGAGCGCTGCATGGTGAAGATCATGGTAAATGGATTGATAATAGTGCACCTTTAGGAAGGAATGATGATGTGGCTGAATCCTCTGGAACATCTGGAGCATCCTTTTCCTAAAGCCATGCAGACTGAATG
CATTTGGTGTTTACTTGTAACTGTATTTGTTCCTTCTGACAGGAATACCTATTCAGAGTTAAGTGGAAAGGGTGTGGAATTCCTGCATTTGAAAGCATGTGGGTATTGTTTTAAAACGTAAATTTGTGAAAACAAGAAGTGATAAAAATGGAGAATAAGGTTGAAGATGATGATTTTCAAAGTGCAGGCATTGTAGAATC
TGACCCATCCATTTTTCTGAAGTGACTGGAGAGGACTCAATAGGCACATTCCTGAATCAGTTCTGTCCATGTCAAAACTTTTTTCATCATTCTGCTCAAGTGAAAAGCTTCTCATTGGCCAGGAGGACCTTTATAATGAAGGTGAAATCAGTATGAGGTTCTACAGTAAGTTCTGAGGCATTTCTTAGTGTGACTCTTTA
GTTTATATTCTATTTGTTCTCAGGCTTATCTGGCTTAGAGCTAAATTATATCTGAAACTTCAATAATCTCAAAATCTTACATAATGAATAACCACCAAATGTATACAACTATTACACCCATCAGAATTAAGGCTTAATATATACCTATTACCACCTGCTAACAACTAACACTAGAAAAACTGAATTTGATCTAAAAGTTT
ATTTGGTACGAAAGAACGAATATAATATAGTCGATGGGAATTCCATGCTTGTCAATTACCTGATAATACAAGCACTTGGTTGGTGAGGCATGCTTACAAGTTAGTAAAACCAAATGCAGATTGAGAGTCTTTTCAGTGTTAAGTGTGATTGGACAGTAAGAGTTTCAGTTCACTATGTTTCTGTTCTGTGGTTCGTGCAT
CATGCTCATTTGTTAGGTATATCCTAATTCCAAAGCAGGGTTTA

>TRINITY_DN44845_c0_g2_i6 from sample A8 / Example unspliced isoform:

ATTACACTCAGATACGAAGCCAAAAAACCAATTATTTACAATATGTATAATTTTTAATTAGATTACAGAGCCTATGCATCAAAATGGATCCTTCCGCACTTATTCAACCACGGCTGCTTCATATTCGGCGGTGAGTATCGAATTCTCCGCTTTTCCTAGGTTTTTGCGCGGATCTGATGCCGTAGTCGTCTCTGTCGCTC
TCGAAATACTTGGATAGGGTAAGGTTTGAACTCAGACAAACGTTCTATGGCTTCCATGAAGTTTTATTCATAATCTGCAATATTTAGAGCTAGCAATATCAGTCAATACTCAAATTACTCCACAGCCGCCGTGGAAATCAATGCAGAATTCAGTATTTCCAAGTCACTGGGAGTAATCTTACACGGTTTCAGCTCGGAAA
AACGCTTGAAATGTGTGCAGTAGTTCGGATCGATTGAAATTCTTTTATATTGAATTTGGAAATTGCGATTTAGAGCTAAACTTGAAGAAATTCCATGGTCCGGAGCTAAACTTGAAGAAATTTAGTAGTCAGACCTAAACTTGGAGAAATTCAGCCATTCAGTGCCAAACTTCGAGAAATTTAGCGATTCAGAGCTAAAG
TCAGGGTCGCCATTAGTCACAGACGGATTTGGATTGGGGAAACGAGCTTCATCCGCAATGGTAGCGGATGAAGCCGGGTCGAATGGTTATATGAAGGCGTTCGGATGCGTATACAGAACTGGCCGCAGGGGCGTAAGCGTTATTTTTGTCGAAGGGAGTTTGTTGAGGTGAATCTTTGTCTCGGCCACTATGAAATCAGG
AATTTCTTCGGATGCAAGATCTGTCGGTAGATTGGGCGCTTCACCAGGAGATCGGCCTAAAGGATCACCACAAAGAGGTTTGAAAGATTTTGCCAAAAAACTTGTCGATAGCAAAGCATTCACAAACAAGCTTCAAGATTGGTTTTCAAGAAAGCGAGATACGTCTGTAGATGGAGAGTCTCCTTTTCATAGAAAATTTC
TCTTTGAGTCTCCTTTTCAGCTCGAGGAGCTTCGTGAGTTCGATTATGCTCTGGAGGGCATTGGTTTCCAACAGCTGCTTCGCATGCCTTGTGGACCGGATGCGTCCACTTCAGGTGCAGTGGAAGCAGATGCATATCTTGCATTGGAAGACTTTTTGCATGCTGGAGCGCAAAGTTTATGGGAAGCATTTTGGAGTAAG
GAGGGACCGACGCCGTTTTATATAAGTTGTCCATATGGCGTGGGATCGAAGTTTCATACCGTGGAGAAGGCAGTTGCAAGGGGAAAAGTTGGAGGCCTTCGTGGAGCAGCTTTGGTAGTAAAAAATAGTCGGAATTCCCATGGGGAGTGGGATCATGTTGCAGAACTTGCTTTGCTGAGGACTGATGCTGGTGGTTTGTC
TCAAGAAACCGAGCGAATTCCTTCTTTTGCAGACATTGGTGAAGCTTTATTCTATGGACTTTATATGTTGTTGTCAAGAAGCTTAAGTAAGTCGAATATGGTAAAGTATGACGACTGTGCATATGTGCTAGTTGTTGATTATCAGTTTGGTGGTGTGGTAAGGCTTAAAGGAGATGTGAATAAATTGGATATAAATGTAA
ATAGGGTATATGATTGTGCGGTAGAGTGGATACAACAGCATGCAGAGGTTAGAGTCTCCTCTTTTGATCAAATATGGAACAAGCTTGGTAATGCTAATTGGGGAGATGTTGGCACTCTCCAGCTTCTATTGGCCACCTTTTACTCTATCGTGCAATGCAAAGGGTTGCCAAAAAGGTCAATTGCTGAGCTTGCTGCAGAT
CATGGTGCTCGTTTGCAAAAGCGAAGAATTGAACGGCGGCCTCTTGAAGTTCATGAGAATGGCAGTGATTCTTTCCGTCGTCATCAAAGCAGTCGTTCTCATGGGGAAATTGTTGAAATTCGGGATGAATTAGAATCTGCTATAAGGAAAGAAATGGAGGGTATGAAGCTTGAACCAGGAACTGTGCTATGGTTGGAAGA
TTCACATTGGCAAAGAGGTTTTCAGATACATGAGGTTCTAGGAGATGAACGGCGCTCCTTGTACAGTTCGACTTCTTTGGAAGAACCAGGAAAGCTTCTGGCTGTTTATGTAGGTTCCCATCCTTCCGAATTTGAGCCTGCATGGGAAGATATGAGTATGTGGTACCAGGTCCAGCGTCAGACCAAAGTGTTGAATATCA
TGAAACAAAGGGGCATATCAAGTAAGTACCTACCACAGCTTGTTGCTTCTGGAAGGATCATGCACCCTGGTCCTTGCCACAGACAGAGTCCTGGTGGTCGCTGTGACCATCCATGGTGTGGAACCCCAATTCTAGTGACTTCTCCGGTTGGAGAATCAGTTGCCACTATTGTTGCGAGAAATGGGGTATTCAATACAGAG
GAAGCACTGCGATGCTGTTATGATTGTTTATCTGCTTTGCGAAGTACAGTGTCTGCAGGGATCCAACATGGAGATATCTCACCGGATCATGTAATCCGCATGGCATCTGGGGAAAGACATTCTTACTATATACTTGTGGACTGGGGACATGCTGTTCTTGAAGATAGAGATAGTCCTGCAATTAATGTTCAGTTTTCCTC
CACTTATGCCCTCCAAGAAAGAAAACTCTGCCCTGCCTCAGATGTTGAAAGCGTGGTTTACCTGCTGTATTATTTATGTGGTGGAACTATACCACATCTAGAATCACTGGAAGCTGCTTTGCAGTGGAGAGAGAGATCTTGGGCGAGAAGAACAATTCAACAGCAGCTTGGTGAAGTTTCAGCTGTATTGAAAGCTTTTG
CCGACTATGTTGATAGTCTCTGTGGTACTCCGTATCCTGTAGATTATGAAATATGGTTACGAAGATTAAATAGAGCGCTGCATGGTGAAGATCATGGTAAATGGATTGATAATAGTGCACCTTTAGGAAGGAATGATGATGTGGCTGAATCCTCTGGAACATCTGGAGCATCCTTTTCCTAAAGCCATGCAGACTGAATG
CATTTGGTGTTTACTTGTAACTGTATTTGTTCCTTCTGACAGGAATACCTATTCAGAGTTAAGTGGAAAGGGTGTGGAATTCCTGCATTTGAAAGCATGTGGGTATTGTTTTAAAACGTAAATTTGTGAAAACAAGAAGTGATAAAAATGGAGAATAAGGTTGAAGATGATGATTTTCAAAGTGCAGGCATTGTAGAATC
TGACCCATCCATTTTTCTGAAGTGACTGGAGAGGACTCAATAGGCACATTCCTGAATCAGTTCTGTCCATGTCAAAACTTTTTTCATCATTCTGCTCAAGTGAAAAGCTTCTCATTGGCCAGgtagttgctgatgctggcattttccttcttgtgaatgtaatatggtgtcatgtatgagagccttggcatcaaaagatg
gcaacataagctttgagttatgtcttgccaacgagtggttagagcggactcaatagacacatccttgaatcagctctatctgcgtcaaaactttttccatcaatctgctcaagtgaaaagcttctcattggctgtcagGAGGACCTTTATAATGAAGGTGAAATCAGTATGAGGTTCTACAGTAAGTTCTGAGGCATTTC
TTAGTGTGACTCTTTAGTTTATATTCTATTTGTTCTCAGGCTTATCTGGCTTAGAGCTAAATTATATCTGAAACTTCAATAATCTCAAAATCTTACATAATGAATAACCACCAAATGTATACAACTATTACACCCATCAGAATTAAGGCTTAATATATACCTATTACCACCTGCTAACAACTAACACTAGAAAAACTGAA
TTTGATCTAAAAGTTTATTTGGTACGAAAGAACGAATATAATATAGTCGATGGGAATTCCATGCTTGTCAATTACCTGATAATACAAGCACTTGGTTGGTGAGGCATGCTTACAAGTTAGTAAAACCAAATGCAGATTGAGAGTCTTTTCAGTGTTAAGTGTGATTGGACAGTAAGAGTTTCAGTTCACTATGTTTCTGT
TCTGTGGTTCGTGCATCATGCTCATTTGTTAGGTATATCCTAATTCCAAAGCAGGGTTTACGAAAGATCCCTGTGGTTTAGTAAAGATCCCTGTGGTTATGAATATTGTAATCTCAGAGAATTTCTTAGCTAGGTTCAGATTATGGCTTCTATTTCTTTTGAGGATTGTTATATTCCCGTAAGCTGTGAGTTTGTATATG
AATAAAAACAGCATTCGTGTACAGGAAACAAAACCTGAACAATCAGGATAATTTTTAATGTCAGCTTCTTGTACATAGATGCATAGTGGCACATGCAGTCAAGCAGTTAAACCCCATTACTTGAAATGGGGAACTGGTGACAAATTCAAAACATTTTCAAAATGTTAAGAAATTGGGAAGCGGCACCAGTGTGACAATGT
GCACATTGCTTGTATATATGCATGTATTACTTCCAACAGTATTACAACTGGTGACAAATAATGCAACTGTCTTAGTTTTCAATTATTTATAATTTAGTTACAACTGTTTAAGTTTTCCATTATTTATAATTTAGTTATATATTATATTTTGAAAGTATTGTTTTGGTATTTTACAATACCAACTTGAT

Intron 3 GTATTTGTCA ... TTTTCTGAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	76.22	26.8	64	104
A2	68.36	29	64.2	60.3
A3	77.14	18.7	50.3	75
A4	63.91	31.8	48.5	61.7
A5	79.06	7.7	22.3	34.7
A6	63.94	393.7	768.3	605.5
A7	61.38	252.7	427	365.3
A8	61.48	377.7	684.3	500.3
A9	63.35	248	463.5	378.5
A10	68.78	100.8	212.5	228.5

>TRINITY_DN114360_c1_g1_i4 from sample A2 / Example spliced isoform

CTCAGATACGAAGCCAAAAAACCAATTATTTACAATATGTATAATTTTTAATTAGATTACAGAGCCTATGCATCAAAATGGATCCTTCCGCACTTACTCAACCACGGCTGCTTCATATTCGGCGGTGAGTATCGAATTCTCCGCTTTTCCTAGGTTTTTGCGCGGATCTGATGCCGTAGTCGTCTCTGTCGCTCTCGAAA
TACTTGGATAGGGTAAGGTTTGAACTCAGACAAACGTTCTATGGCTTCCATGAAGTTTTATTCATAATCTGCAATATTTAGAGCTAGCAATATCAGTCAATACTCAAATTACTCCACAGCCGCCGTGGAAATCAATGCAGAATTCAGTATTTCCAAGTCACTGGGAGTAATCTTACACGGTTTCAGCTCGGAAAAACGCT
TGAAATGTGTGCAGTAGTTCGGATCGATTGAAATTCTTTTATATTGAATTTGGAAATTGCGATTTAGAGCTAAACTTGAAGAAATTCCATGGTCCGGAGCTAAACTTGAAGAAATTTAGTAGTCAGACCTAAACTTGGAGAAATTCAGCCATTCAGTGCCAAACTTCGAGAAATTTAGCGATTCAGAGCTAAAGTCAGGG
TCGCCATTAGTCACAGACGGATTTGGATTGGGGAAACGAGCTTCATCCGCAATGGTAGCGGATGAAGCCGGGTCGAATGGTTCTATGAAGGCGTTCGGATGCGTATACAGAACTGGCCGCAGGGGCGTAAGCGTTATTTTTGTCGAAGGGAGTTTGTTGAGGTGAATCTTTGTCTCGGCCACTATGAAATCAGGAATTTC
TTCGGATGCAAGATCTGTCGGTAGATTGGGCGCTTCACCAGGAGATCGGCCTAAAGGATCACCACAAAGAGGTTTGAAAGATTTTGCCAAAAAACTTGTCGATAGCAAAGCATTCACAAACAAGCTTCAAGATTGGTTTTCAAGAAAGCGAGATACGTCTGTAGATGGAGAGTCTCCTTTTCATAGAAAATTTCTCTTTG
AGTCTCCTTTTCAGCTCGAGGAGCTTCGTGAGTTCGATTATGCTCTGGAGGGCATTGGTTTCCAACAGCTGCTTCGCATGCCTTGTGGACCGGATGCGTCCACTTCAGGTGCAGTGGAAGCAGATGCATATCTTGCATTGGAAGACTTTTTGCATGCTGGAGCGCAAAGTTTATGGGAAGCATTTTGGAGTAAGGAGGGA
CCGACGCCGTTTTATATAAGTTGTCCATATGGCGTGGGATCGAAGTTTCATACCGTGGAGAAGGCAGTTGCAAGGGGAAAAGTTGGAGGCCTTCGTGGAGCAGCTTTGGTAGTAAAAAATAGTCGGAATTCCCATGGGGAGTGGGATCATGTTGCAGAACTTGCTTTGCTGAGGACTGATGCTGGTGGTTTGTCTCAAGA
AACCGAGCGAATTCCTTCTTTTGCAGACATTGGTGAAGCTTTATTCTATGGACTTTATATGTTGTTGTCAAGAAGCTTAAGTAAGTCGAATATGGTAAAGTATGACGACTGTGCATATGTGCTAGTTGTTGATTATCAGTTTGGTGGTGTGGTAAGGCTTAAAGGAGATGTGAATAAATTGGATATAAATGTAAATAGGG
TATATGATTGTGCGGTAGAGTGGATACAACAGCATGCAGAGGTTAGAGTCTCCTCTTTTGATCAAATATGGAACAAGCTTGGTAATGCTAATTGGGGAGATGTTGGCACTCTCCAGCTTCTATTGGCCACCTTTTACTCTATCGTGCAATGCAAAGGGTTGCCAAAAAGGTCAATTGCTGAGCTTGCTGCAGATCATGGT
GCTCGTTTGCAAAAGCGAAGAATTGAACGGCGGCCTCTTGAAGTTCATGAGAATGGCAGTGATTCTTTCCGTCGTCATCAAAGCAGTCGTTCTCATGGGGAAATTGTTGAAATTCAGGATGAATCAGAATCTGCTATAAGGAAAGAAATGGAGGGTATGAAGCTTGAACCAGGAACTGTGCTATGGTTGGAAGATTCACA
TTGGCAAAGAGGTTTTCAGATACATGAGGTTCTAGGAGATGAACGGCGCTCCTTGTACAGTTCGACTTCTTTGGAAGAACCAGGAAAGCTTCTGGCTGTTTATGTAGGTTCCCATCCTTCCGAATTTGAGCCTGCATGGGAAGATATGAGTATGTGGTACCAGGTCCAGCGTCAGACCAAAGTGTTGAATATCATGAAAC
AAAGGGGCATATCAAGTAAGTACCTACCACAGCTTGTTGCTTCTGGAAGGATCATGCACCCTGGTCCTTGCCACAGACAGAGTCCTGGTGGTCGCTGTGACCATCCATGGTGTGGAACCCCAATTCTAGTGACTTCTCCGGTTGGAGAATCAGTTGCCACTATTGTTGCAAGAAATGGGGTATTCAATACAGAGGAAGCA
CTGCGATGCTGTTATGATTGTTTATCTGCTTTGCGAAGTACAGTGTCTGCAGGGATCCAACATGGAGATATCTCACCGGATCATGTAATCCGCATGGCATCTGGGGAAAGACATTCTTACTATATACTTGTGGACTGGGGACATGCTGTTCTTGAAGATAGAGATAGTCCTGCAATTAATGTTCAGTTTTCCTCCACTTA
TGCCCTCCAAGAAAGAAAACTCTGCCCTGCCTCAGATGTTGAAAGCGTGGTTTACCTGCTGTATTATTTATGTGGTGGAACTATACCACATCTAGAATCACTGGAAGCTGCTTTGCAGTGGAGAGAGAGATCTTGGGCGAGAAGAACAATTCAACAGCAGCTTGGTGAAGTTTCAGCTGTATTGAAAGCTTTTGCCGACT
ATGTTGATAGTCTCTGTGGTACTCCGTATCCTGTAGATTATGAAATATGGTTACGAAGATTAAATAGAGCGCTGCATGGTGAAGATCATGGTAAATGGATTGATAATAGTGCACCTTTAGGAAGGAATGATGATGTGGCTGAATCCTCTGGAACATCTGGAGCATCCTTTTCCTAAAGCCATGCAGACTGAATGCATTTG
GTGTTTACTTGTAACTGTATTTGTTCCTTCTGACAGGAATACCTATTCAGAGTTAAGTGGAAAGGGTGTGGAATTCCTGCATTTGAAAGCATGTGGGTATTGTTTTAAAACGTAAATTTGTGAAAACAAGAAGTGATAAAAATGGAGAATAAGGTTGAAGATGATGATTTTCAAAGTGCAGGCATTGTAGAATCTGACCC
ATCCATTTTTCTGAAGTGACTGGAGAGGACTCAATAGGCACATTCCTGAATCAGTTCTGTCCATGTCAAAACTTTTTTCATCATTCTGCTCAAGTGAAAAGCTTCTCATTGGCCAGGTAGTTGCTGATGCTGGCATTTTCCTTCTTGTGAATGTAATATGGTGTCATGTATGAGAGCCTTGGCATCAAAAGATGGCAACA
TAAGCTTTGAGTTATGTCTTGCCAACGAGTGGTTAGAGCGGACTCAATAGACACATCCTTGAATCAGCTCTATCTGCGTCAAAACTTTTTCCATCAATCTGCTCAAGTGAAAAGCTTCTCATTGGCTGTCAGGTAGTTGCTGATGCTGGCATTTTCCTTCTTGTGAATGTAATATGGTGTCATGTATGATAGCCTTGGTT
TCAAAAGATGGCAACATAAGCTTTGAGTTATGTCTTGCCAAAGAGGTATTTGTCAACAATATTTGTTTGGAATTGTTTGTTGTGTTCATGCTTGTTTGAAATATTATCCTATTTCTTTTCTGATTGCCCAAGTTCATTGTGCTCAAAC

>TRINITY_DN114360_c1_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:

CTCAGATACGAAGCCAAAAAACCAATTATTTACAATATGTATAATTTTTAATTAGATTACAGAGCCTATGCATCAAAATGGATCCTTCCGCACTTACTCAACCACGGCTGCTTCATATTCGGCGGTGAGTATCGAATTCTCCGCTTTTCCTAGGTTTTTGCGCGGATCTGATGCCGTAGTCGTCTCTGTCGCTCTCGAAA
TACTTGGATAGGGTAAGGTTTGAACTCAGACAAACGTTCTATGGCTTCCATGAAGTTTTATTCATAATCTGCAATATTTAGAGCTAGCAATATCAGTCAATACTCAAATTACTCCACAGCCGCCGTGGAAATCAATGCAGAATTCAGTATTTCCAAGTCACTGGGAGTAATCTTACACGGTTTCAGCTCGGAAAAACGCT
TGAAATGTGTGCAGTAGTTCGGATCGATTGAAATTCTTTTATATTGAATTTGGAAATTGCGATTTAGAGCTAAACTTGAAGAAATTCCATGGTCCGGAGCTAAACTTGAAGAAATTTAGTAGTCAGACCTAAACTTGGAGAAATTCAGCCATTCAGTGCCAAACTTCGAGAAATTTAGCGATTCAGAGCTAAAGTCAGGG
TCGCCATTAGTCACAGACGGATTTGGATTGGGGAAACGAGCTTCATCCGCAATGGTAGCGGATGAAGCCGGGTCGAATGGTTCTATGAAGGCGTTCGGATGCGTATACAGAACTGGCCGCAGGGGCGTAAGCGTTATTTTTGTCGAAGGGAGTTTGTTGAGGTGAATCTTTGTCTCGGCCACTATGAAATCAGGAATTTC
TTCGGATGCAAGATCTGTCGGTAGATTGGGCGCTTCACCAGGAGATCGGCCTAAAGGATCACCACAAAGAGGTTTGAAAGATTTTGCCAAAAAACTTGTCGATAGCAAAGCATTCACAAACAAGCTTCAAGATTGGTTTTCAAGAAAGCGAGATACGTCTGTAGATGGAGAGTCTCCTTTTCATAGAAAATTTCTCTTTG
AGTCTCCTTTTCAGCTCGAGGAGCTTCGTGAGTTCGATTATGCTCTGGAGGGCATTGGTTTCCAACAGCTGCTTCGCATGCCTTGTGGACCGGATGCGTCCACTTCAGGTGCAGTGGAAGCAGATGCATATCTTGCATTGGAAGACTTTTTGCATGCTGGAGCGCAAAGTTTATGGGAAGCATTTTGGAGTAAGGAGGGA
CCGACGCCGTTTTATATAAGTTGTCCATATGGCGTGGGATCGAAGTTTCATACCGTGGAGAAGGCAGTTGCAAGGGGAAAAGTTGGAGGCCTTCGTGGAGCAGCTTTGGTAGTAAAAAATAGTCGGAATTCCCATGGGGAGTGGGATCATGTTGCAGAACTTGCTTTGCTGAGGACTGATGCTGGTGGTTTGTCTCAAGA
AACCGAGCGAATTCCTTCTTTTGCAGACATTGGTGAAGCTTTATTCTATGGACTTTATATGTTGTTGTCAAGAAGCTTAAGTAAGTCGAATATGGTAAAGTATGACGACTGTGCATATGTGCTAGTTGTTGATTATCAGTTTGGTGGTGTGGTAAGGCTTAAAGGAGATGTGAATAAATTGGATATAAATGTAAATAGGG
TATATGATTGTGCGGTAGAGTGGATACAACAGCATGCAGAGGTTAGAGTCTCCTCTTTTGATCAAATATGGAACAAGCTTGGTAATGCTAATTGGGGAGATGTTGGCACTCTCCAGCTTCTATTGGCCACCTTTTACTCTATCGTGCAATGCAAAGGGTTGCCAAAAAGGTCAATTGCTGAGCTTGCTGCAGATCATGGT
GCTCGTTTGCAAAAGCGAAGAATTGAACGGCGGCCTCTTGAAGTTCATGAGAATGGCAGTGATTCTTTCCGTCGTCATCAAAGCAGTCGTTCTCATGGGGAAATTGTTGAAATTCAGGATGAATCAGAATCTGCTATAAGGAAAGAAATGGAGGGTATGAAGCTTGAACCAGGAACTGTGCTATGGTTGGAAGATTCACA
TTGGCAAAGAGGTTTTCAGATACATGAGGTTCTAGGAGATGAACGGCGCTCCTTGTACAGTTCGACTTCTTTGGAAGAACCAGGAAAGCTTCTGGCTGTTTATGTAGGTTCCCATCCTTCCGAATTTGAGCCTGCATGGGAAGATATGAGTATGTGGTACCAGGTCCAGCGTCAGACCAAAGTGTTGAATATCATGAAAC
AAAGGGGCATATCAAGTAAGTACCTACCACAGCTTGTTGCTTCTGGAAGGATCATGCACCCTGGTCCTTGCCACAGACAGAGTCCTGGTGGTCGCTGTGACCATCCATGGTGTGGAACCCCAATTCTAGTGACTTCTCCGGTTGGAGAATCAGTTGCCACTATTGTTGCAAGAAATGGGGTATTCAATACAGAGGAAGCA
CTGCGATGCTGTTATGATTGTTTATCTGCTTTGCGAAGTACAGTGTCTGCAGGGATCCAACATGGAGATATCTCACCGGATCATGTAATCCGCATGGCATCTGGGGAAAGACATTCTTACTATATACTTGTGGACTGGGGACATGCTGTTCTTGAAGATAGAGATAGTCCTGCAATTAATGTTCAGTTTTCCTCCACTTA
TGCCCTCCAAGAAAGAAAACTCTGCCCTGCCTCAGATGTTGAAAGCGTGGTTTACCTGCTGTATTATTTATGTGGTGGAACTATACCACATCTAGAATCACTGGAAGCTGCTTTGCAGTGGAGAGAGAGATCTTGGGCGAGAAGAACAATTCAACAGCAGCTTGGTGAAGTTTCAGCTGTATTGAAAGCTTTTGCCGACT
ATGTTGATAGTCTCTGTGGTACTCCGTATCCTGTAGATTATGAAATATGGTTACGAAGATTAAATAGAGCGCTGCATGGTGAAGATCATGGTAAATGGATTGATAATAGTGCACCTTTAGGAAGGAATGATGATGTGGCTGAATCCTCTGGAACATCTGGAGCATCCTTTTCCTAAAGCCATGCAGACTGAATGCATTTG
GTGTTTACTTGTAACTGTATTTGTTCCTTCTGACAGGAATACCTATTCAGAGTTAAGTGGAAAGGGTGTGGAATTCCTGCATTTGAAAGCATGTGGGTATTGTTTTAAAACGTAAATTTGTGAAAACAAGAAGTGATAAAAATGGAGAATAAGGTTGAAGATGATGATTTTCAAAGTGCAGGCATTGTAGAATCTGACCC
ATCCATTTTTCTGAAGTGACTGGAGAGGACTCAATAGGCACATTCCTGAATCAGTTCTGTCCATGTCAAAACTTTTTTCATCATTCTGCTCAAGTGAAAAGCTTCTCATTGGCCAGGTAGTTGCTGATGCTGGCATTTTCCTTCTTGTGAATGTAATATGGTGTCATGTATGAGAGCCTTGGCATCAAAAGATGGCAACA
TAAGCTTTGAGTTATGTCTTGCCAACGAGgtatttgtcaacaatatttgattggacttgtttgttatgttcatgcttgttttaaatattatgttgcttctttctggttgctctcaagttcactgcgctaaaacttgtaacggaagagaatttcatgtttgagctgctagttgctaggtgtttgagtatggaaacatagat
atggatgattttcaaagtgcaggcattgtagaatctgacccatccatttttctgaagTGGTTAGAGCGGACTCAATAGACACATCCTTGAATCAGCTCTATCTGCGTCAAAACTTTTTCCATCAATCTGCTCAAGTGAAAAGCTTCTCATTGGCTGTCAGGTAGTTGCTGATGCTGGCATTTTCCTTCTTGTGAATGTAA
TATGGTGTCATGTATGATAGCCTTGGTTTCAAAAGATGGCAACATAAGCTTTGAGTTATGTCTTGCCAAAGAGGTATTTGTCAACAATATTTGTTTGGAATTGTTTGTTGTGTTCATGCTTGTTTGAAATATTATCCTATTTCTTTTCTGATTGCCCAAGTTCATTGTGCTCAAAC

Intron 4 GTAGTTGCTG ... TGGCTGTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	80.27	29	118	17
A2	88.24	10	75	5
A3	88.99	12	97	6
A4	86.59	11	71	13
A5	85.92	10	61	5
A6	88.46	133	1020	61
A7	89.82	67	591	44
A8	88.21	133	995	88
A9	87.85	90	651	32
A10	85.85	58	352	15

>TRINITY_DN43205_c0_g1_i5 from sample A6 / Example spliced isoform

CACAGCGCTGAGCAAAATCCCTTGCCAAAAGTAAATTAATTTCCAAATGTTTAACACTATTCAATTAATACCGTGCCGTTCCTGGGACGTCAACAAACCCTTCCAGAATATTACACTCAGATACGAAGCCAAAAAACCAATTATTTACAATATGTATAATTTTTAATTAGATTACAGAGCCTATGCATCAAAATGGATCC
TTCCGCACTTACTCAACCACGGCTGCTTCATATTCGGCGGTGGGTATCGAATTCTCCGCTTTTCCTAGGTTTTTGCGCGGATCTGATGCCGTAGTCGTCTCTGTCGCTCTCGAAATACTTGGATAGGGTAAGGTTTGAACTCAGACAAACGTTCTATGGCTTCCATGAAGTTTTATTCATAATCTGCAATATTTAGAGCT
AGCAATATCAGTCAATACTCAAATTACTCCACAGCCGCCGTGGAAATCAATGCAGAATTCAGTATTTCCAAGTCACTGGGAGTAATCTTACACGGTTTCAGCTCGGAAAAACGCTTGAAATGTGTGCAGTAGTTCGGATCGATTGAAATTCTTTTATATTGAATTTGGAAATTGCGATTTAGAGCTAAACTTGAAGAAAT
TCCATGGTCCGGAGCTAAACTTGAAGAAATTTAGTAGTCAGACCTAAACTTGGAGAAATTCAGCCATTCAGTGCCGAACTTCGAGAAATTTAGCGATTCAGAGCTAAAGTCAGGGTCGCCATTAGTCACAGACGGATTTGGATTGGGGAAACGAGCTTCATCCGCAATGGTAGCGGATGAAGCCGGGTCGAATGGTTATA
TGAAGGCGTTCGGATGCGTATACAGAACTGGCCGCAGGGGCGTAAGCGTTATTTTTGTCGAAGGGAGTTTGTTGAGGTGAATCTTTGTCTCGGCCACTATGAAATCAGGAATTTCTTCGGATGCAAGATCTGTCGGTAGATTGGGCGCTTCACCAGGAGATCGGCCTAAAGGATCACCACAAAGAGGTTTGAAAGATTTT
GCCAAAAAACTTGTCGATAGCAAAGCATTCACAAACAAGCTTCAAGATTGGTTTTCAAGAAAGCGAGATACGTCTGTAGATGGAGAGTCTCCTTTTCATAGAAAATTTCTCTTTGAGTCTCCTTTTCAGCTCGAGGAGCTTCGTGAGTTCGATTATGCTCTGGAGGGCATTGGTTTCCAACAGCTGCTTCGCATGCCTTG
TGGACCGGATGCGTCCACTTCAGGTGCAGTGGAAGCAGATGCATATCTTGCATTGGAAGACTTTTTGCATGCTGGAGCGCAAAGTTTATGGGAAGCATTTTGGAGTAAGGAGGGACCGACGCCGTTTTATATAAGTTGTCCATATGGCGTGGGATCGAAGTTTCATACCGTGGAGAAGGCAGTTGCAAGGGGAAAAGTTG
GAGGCCTTCGTGGAGCAGCTTTGGTAGTAAAAAATAGTCGGAATTCCCATGGGGAGTGGGATCATGTTGCAGAACTTGCTTTGCTGAGGACTGATGCTGGTGGTTTGTCTCAAGAAACCGAGCGAATTCCTTCTTTTGCAGACATTGGTGAAGCTTTATTCTATGGACTTTATATGTTGTTGTCAAGAAGCTTAAGTAAG
TCGAATATGGTAAAGTATGACGACTGTGCATATGTGCTAGTTGTTGATTATCAGTTTGGTGGTGTGGTAAGGCTTAAAGGAGATGTGAATAAATTGGATATAAATGTAAATAGGGTATATGATTGTGCGGTAGAGTGGATACAACAGCATGCAGAGGTTAGAGTCTCCTCTTTTGATCAAATATGGAACAAGCTTGGTAA
TGCTAATTGGGGAGATGTTGGCACTCTCCAGCTTCTATTGGCCACCTTTTACTCTATCGTGCAATGCAAAGGGTTGCCAAAAAGGTCAATTGCTGAGCTTGCTGCAGATCATGGTGCTCGTTTGCAAAAGCGAAGAATTGAACGGCGGCCTCTTGAAGTTCATGAGAATGGCAGTGATTCTTTCCGTCGTCATCAAAGCA
GTCGTTCTCATGGGGAAATTGTTGAAATTCAGGATGAATCAGAATCTGCTATAAGGAAAGAAATGGAGGGTATGAAGCTTGAACCAGGAACTGTGCTATGGTTGGAAGATTCACATTGGCAAAGAGGTTTTCAGATACATGAGGTTCTAGGAGATGAACGGCGCTCCTTGTACAGTTCGACTTCTTTGGAAGAACCAGGA
AAGCTTCTGGCTGTTTATGTAGGTTCCCATCCTTCCGAATTTGAGCCTGCATGGGAAGATATGAGTATGTGGTACCAGGTCCAACGTCAGACCAAAGTGTTGAATATCATGAAACAAAGGGGCATATCAAGTAAGTACCTACCACAGCTTGTTGCTTCTGGAAGGATCATGCACCCTGGTCCTTGCCACAGACAGAGTCC
TGGTGGTCGCTGTGACCATCCATGGTGTGGAACCCCAATTCTAGTGACTTCTCCGGTTGGAGAATCAGTTGCCACTATTGTTGCGAGAAATGGGGTATTCAATACAGAGGAAGCACTGCGATGCTGTTATGATTGTTTATCTGCTTTGCGAAGTACAGTGTCTGCAGGGATCCAACATGGAGATATCTCACCGGATCATG
TAATCCGCATGGCATCTGGGGAAAGACATTCTTACTATATACTTGTGGACTGGGGACATGCTGTTCTTGAAGATAGAGATAGTCCTGCAATTAATGTTCAGTTTTCCTCCACTTATGCCCTCCAAGAAAGAAAACTCTGCCCTGCCTCAGATGTTGAAAGCGTGGTTTACCTGCTGTATTATTTATGTGGTGGAACTATA
CCACATCTAGAATCACTGGAAGCTGCTTTGCAGTGGAGAGAGAGATCTTGGGCGAGAAGAACAATTCAACAGCAGCTTGGTGAAGTTTCAGCTGTATTGAAAGCTTTTGCCGACTATGTTGATAGTCTCTGTGGTACTCCGTATCCTGTAGATTATGAAATATGGTTACGAAGATTAAATAGAGCGCTGCATGGTGAAGA
TCATGGTAAATGGATTGATAATAGTGCACCTTTAGGAAGGAATGATGATGTGGCTGAATCCTCTGGAACATCTGGAGCATCCTTTTCCTAAAGCCATGCAGACTGAATGCATTTGGTGTTTACTTGTAACTGTATTTGTTCCTTCTGACAGGAATACCTATTCAGAGTTAAGTGGAAAGGGTGTGGAATTCCTGCATTTG
AAAGCATGTGGGTATTGTTTTAAAACGTAAATTTGTGAAAACAAGAAGTGATAAAAATGGAGGATAAGGTTGAAGATGATGATTTTCAAAGTGCAGGCATTGTAGAATCTGACCCATCCATTTTTCTGAAGTGACTGGAGAGGACTCAATAGGCACATTCCTGAATCAGTTCTGTCCATGTCAAAACTTTTTTCATCATT
CTGCTCAAGTGAAAAGCTTCTCATTGGCCAGGAGGACCTTTATAATGAAGGTGAAATCAGTATGAGGTTCTACAGTAAGTTCTGAGGCATTTCTTAGTGTGACTCTTTAGTTTATATTCTATTTGTTCTCAGGCTTATCTGGCTTAGAGCTAAATTATATCTGAAACTTCAATAATCTCAAAATCTTACATAATGAATAA
CCACCAAATGTATACAACTATTACACCCATCAGAATTAAGGCTTAATATATACCTATTACCACCTGCTAACAACTAACACTAGAAAAACTGAATTTGATCTAAAAGTTTATTTGGTACGAAAGAACGAATATAATATAGTCGATGGGAATTCCATGCTTGTCAATTACCTGATAATACAAGCACTTGGTTGGTGAGGCAT
GCTTACAAGTTAGTAAAACCAAATGCAGATTGAGAGTCTTTTCAGTGTTAAGTGTGATTGGACAGTAAGAGTTTCAGTTCACTATGTTTCTGTTCTGTGGTTCGTGCATCATGCTCATTTGTTAGGTATATCCTAATTCCAAAGCAGGGTTTACGAAAGATCCCTGTGGTTTAGTAAAGATCCCTGTGGTTATGAATATT
GTAATCTCAGAGAATTTCTTAGCTAGGTTCAGATTATGGCTTCTATTTCTTTTGAGGATTGTTATATTCCCGTAAGCTGTGAGTTTGTATATGAATAAAAACAGCATTCGTGTACAGGAAACAAAACCTGAACAATCAGGATAATTTTTAATGTCAGCTTCTTGTACATAGATGCATAGTGGCACATGCAGTCAAGCAGT
TAAACCCCATTACTTGAAATGGGGAACTGGTGACAAATTCAAAACATTTTCAAAATGTTAAGAAATTGGGAAGCGGCACCAGTGTGACAATGTGCACATTGCTTGTATATATGCATGTATTACTTCCAACAGTATTACAACTGGTGACAAATAATGCAACTGTCT

>TRINITY_DN43205_c0_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CACAGCGCTGAGCAAAATCCCTTGCCAAAAGTAAATTAATTTCCAAATGTTTAACACTATTCAATTAATACCGTGCCGTTCCTGGGACGTCAACAAACCCTTCCAGAATATTACACTCAGATACGAAGCCAAAAAACCAATTATTTACAATATGTATAATTTTTAATTAGATTACAGAGCCTATGCATCAAAATGGATCC
TTCCGCACTTACTCAACCACGGCTGCTTCATATTCGGCGGTGGGTATCGAATTCTCCGCTTTTCCTAGGTTTTTGCGCGGATCTGATGCCGTAGTCGTCTCTGTCGCTCTCGAAATACTTGGATAGGGTAAGGTTTGAACTCAGACAAACGTTCTATGGCTTCCATGAAGTTTTATTCATAATCTGCAATATTTAGAGCT
AGCAATATCAGTCAATACTCAAATTACTCCACAGCCGCCGTGGAAATCAATGCAGAATTCAGTATTTCCAAGTCACTGGGAGTAATCTTACACGGTTTCAGCTCGGAAAAACGCTTGAAATGTGTGCAGTAGTTCGGATCGATTGAAATTCTTTTATATTGAATTTGGAAATTGCGATTTAGAGCTAAACTTGAAGAAAT
TCCATGGTCCGGAGCTAAACTTGAAGAAATTTAGTAGTCAGACCTAAACTTGGAGAAATTCAGCCATTCAGTGCCGAACTTCGAGAAATTTAGCGATTCAGAGCTAAAGTCAGGGTCGCCATTAGTCACAGACGGATTTGGATTGGGGAAACGAGCTTCATCCGCAATGGTAGCGGATGAAGCCGGGTCGAATGGTTATA
TGAAGGCGTTCGGATGCGTATACAGAACTGGCCGCAGGGGCGTAAGCGTTATTTTTGTCGAAGGGAGTTTGTTGAGGTGAATCTTTGTCTCGGCCACTATGAAATCAGGAATTTCTTCGGATGCAAGATCTGTCGGTAGATTGGGCGCTTCACCAGGAGATCGGCCTAAAGGATCACCACAAAGAGGTTTGAAAGATTTT
GCCAAAAAACTTGTCGATAGCAAAGCATTCACAAACAAGCTTCAAGATTGGTTTTCAAGAAAGCGAGATACGTCTGTAGATGGAGAGTCTCCTTTTCATAGAAAATTTCTCTTTGAGTCTCCTTTTCAGCTCGAGGAGCTTCGTGAGTTCGATTATGCTCTGGAGGGCATTGGTTTCCAACAGCTGCTTCGCATGCCTTG
TGGACCGGATGCGTCCACTTCAGGTGCAGTGGAAGCAGATGCATATCTTGCATTGGAAGACTTTTTGCATGCTGGAGCGCAAAGTTTATGGGAAGCATTTTGGAGTAAGGAGGGACCGACGCCGTTTTATATAAGTTGTCCATATGGCGTGGGATCGAAGTTTCATACCGTGGAGAAGGCAGTTGCAAGGGGAAAAGTTG
GAGGCCTTCGTGGAGCAGCTTTGGTAGTAAAAAATAGTCGGAATTCCCATGGGGAGTGGGATCATGTTGCAGAACTTGCTTTGCTGAGGACTGATGCTGGTGGTTTGTCTCAAGAAACCGAGCGAATTCCTTCTTTTGCAGACATTGGTGAAGCTTTATTCTATGGACTTTATATGTTGTTGTCAAGAAGCTTAAGTAAG
TCGAATATGGTAAAGTATGACGACTGTGCATATGTGCTAGTTGTTGATTATCAGTTTGGTGGTGTGGTAAGGCTTAAAGGAGATGTGAATAAATTGGATATAAATGTAAATAGGGTATATGATTGTGCGGTAGAGTGGATACAACAGCATGCAGAGGTTAGAGTCTCCTCTTTTGATCAAATATGGAACAAGCTTGGTAA
TGCTAATTGGGGAGATGTTGGCACTCTCCAGCTTCTATTGGCCACCTTTTACTCTATCGTGCAATGCAAAGGGTTGCCAAAAAGGTCAATTGCTGAGCTTGCTGCAGATCATGGTGCTCGTTTGCAAAAGCGAAGAATTGAACGGCGGCCTCTTGAAGTTCATGAGAATGGCAGTGATTCTTTCCGTCGTCATCAAAGCA
GTCGTTCTCATGGGGAAATTGTTGAAATTCAGGATGAATCAGAATCTGCTATAAGGAAAGAAATGGAGGGTATGAAGCTTGAACCAGGAACTGTGCTATGGTTGGAAGATTCACATTGGCAAAGAGGTTTTCAGATACATGAGGTTCTAGGAGATGAACGGCGCTCCTTGTACAGTTCGACTTCTTTGGAAGAACCAGGA
AAGCTTCTGGCTGTTTATGTAGGTTCCCATCCTTCCGAATTTGAGCCTGCATGGGAAGATATGAGTATGTGGTACCAGGTCCAACGTCAGACCAAAGTGTTGAATATCATGAAACAAAGGGGCATATCAAGTAAGTACCTACCACAGCTTGTTGCTTCTGGAAGGATCATGCACCCTGGTCCTTGCCACAGACAGAGTCC
TGGTGGTCGCTGTGACCATCCATGGTGTGGAACCCCAATTCTAGTGACTTCTCCGGTTGGAGAATCAGTTGCCACTATTGTTGCGAGAAATGGGGTATTCAATACAGAGGAAGCACTGCGATGCTGTTATGATTGTTTATCTGCTTTGCGAAGTACAGTGTCTGCAGGGATCCAACATGGAGATATCTCACCGGATCATG
TAATCCGCATGGCATCTGGGGAAAGACATTCTTACTATATACTTGTGGACTGGGGACATGCTGTTCTTGAAGATAGAGATAGTCCTGCAATTAATGTTCAGTTTTCCTCCACTTATGCCCTCCAAGAAAGAAAACTCTGCCCTGCCTCAGATGTTGAAAGCGTGGTTTACCTGCTGTATTATTTATGTGGTGGAACTATA
CCACATCTAGAATCACTGGAAGCTGCTTTGCAGTGGAGAGAGAGATCTTGGGCGAGAAGAACAATTCAACAGCAGCTTGGTGAAGTTTCAGCTGTATTGAAAGCTTTTGCCGACTATGTTGATAGTCTCTGTGGTACTCCGTATCCTGTAGATTATGAAATATGGTTACGAAGATTAAATAGAGCGCTGCATGGTGAAGA
TCATGGTAAATGGATTGATAATAGTGCACCTTTAGGAAGGAATGATGATGTGGCTGAATCCTCTGGAACATCTGGAGCATCCTTTTCCTAAAGCCATGCAGACTGAATGCATTTGGTGTTTACTTGTAACTGTATTTGTTCCTTCTGACAGGAATACCTATTCAGAGTTAAGTGGAAAGGGTGTGGAATTCCTGCATTTG
AAAGCATGTGGGTATTGTTTTAAAACGTAAATTTGTGAAAACAAGAAGTGATAAAAATGGAGGATAAGGTTGAAGATGATGATTTTCAAAGTGCAGGCATTGTAGAATCTGACCCATCCATTTTTCTGAAGTGACTGGAGAGGACTCAATAGGCACATTCCTGAATCAGTTCTGTCCATGTCAAAACTTTTTTCATCATT
CTGCTCAAGTGAAAAGCTTCTCATTGGCCAGgtagttgctgatgctggcattttccttcttgtgaatgtaatatggtgtcatgtatgagagccttggcatcaaaagatggcaacataagctttgagttatgtcttgccaacgaggtatttgtcaacaatatttgattggacttgtttgttatgttcatgcttgttttaaa
tattatgttgcttctttctggttgctctcaagttcactgcgctaaaacttgtaacggaagagaatttcatgtttgagctgctagttgctaggtgtttgagtatggaaacatagatatggatgattttcaaagtgcaggcattgtagaatctgacccatccatttttctgaagtggttagagcggactcaatagacacatc
cttgaatcagctctatctgcgtcaaaactttttccatcaatctgctcaagtgaaaagcttctcattggctgtcagGAGGACCTTTATAATGAAGGTGAAATCAGTATGAGGTTCTACAGTAAGTTCTGAGGCATTTCTTAGTGTGACTCTTTAGTTTATATTCTATTTGTTCTCAGGCTTATCTGGCTTAGAGCTAAATT
ATATCTGAAACTTCAATAATCTCAAAATCTTACATAATGAATAACCACCAAATGTATACAACTATTACACCCATCAGAATTAAGGCTTAATATATACCTATTACCACCTGCTAACAACTAACACTAGAAAAACTGAATTTGATCTAAAAGTTTATTTGGTACGAAAGAACGAATATAATATAGTCGATGGGAATTCCATG
CTTGTCAATTACCTGATAATACAAGCACTTGGTTGGTGAGGCATGCTTACAAGTTAGTAAAACCAAATGCAGATTGAGAGTCTTTTCAGTGTTAAGTGTGATTGGACAGTAAGAGTTTCAGTTCACTATGTTTCTGTTCTGTGGTTCGTGCATCATGCTCATTTGTTAGGTATATCCTAATTCCAAAGCAGGGTTTACGA
AAGATCCCTGTGGTTTAGTAAAGATCCCTGTGGTTATGAATATTGTAATCTCAGAGAATTTCTTAGCTAGGTTCAGATTATGGCTTCTATTTCTTTTGAGGATTGTTATATTCCCGTAAGCTGTGAGTTTGTATATGAATAAAAACAGCATTCGTGTACAGGAAACAAAACCTGAACAATCAGGATAATTTTTAATGTCA
GCTTCTTGTACATAGATGCATAGTGGCACATGCAGTCAAGCAGTTAAACCCCATTACTTGAAATGGGGAACTGGTGACAAATTCAAAACATTTTCAAAATGTTAAGAAATTGGGAAGCGGCACCAGTGTGACAATGTGCACATTGCTTGTATATATGCATGTATTACTTCCAACAGTATTACAACTGGTGACAAATAATG
CAACTGTCT

Intron 5 GTAAGTTGTG ... GTTTCAGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	16.97	203	35	48
A2	18.22	220	50	48
A3	14.7	206	33	38
A4	18.16	196	45	42
A5	17.75	139	18	42
A6	12.2	180	26	24
A7	14.02	328	47	60
A8	15.15	84	11	19
A9	14.92	308	47	61
A10	12.34	334	37	57

>TRINITY_DN121098_c0_g2_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

TCTGTTCGTAATATTTCTAATACACAAATACCTCTCCATTCCAAAAACAAACACATTCCACAGCGCTGAGCAAAATCCCTTGCCAAAAGTAAATTAATTTCCAAATGTTTAACACTATTCAATTAATACCGTGCCGTTCCTGGGACGTCAACAAACCCTTCCAGAATATTACACTCAGATACGAAGCCAAAAAACCAATT
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