sp|Q9SX83|DTX33_ARATH ----> Protein DETOXIFICATION 33
Intron 1 GTAAATTGCG ... CACAACACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 67.36 | 12.8 | 20.8 | 32 |
| A2 | 70.69 | 8 | 23.6 | 15 |
| A3 | 56.52 | 15 | 20 | 19 |
| A4 | 55 | 18 | 21 | 23 |
| A5 | 42.11 | 11 | 12 | 4 |
| A6 | 67.21 | 10 | 30 | 11 |
| A7 | 61.48 | 18.8 | 32 | 28 |
| A8 | 49.46 | 13.8 | 13 | 14 |
| A9 | 59.92 | 20 | 31 | 28.8 |
| A10 | 72.48 | 18 | 71 | 23.8 |
>TRINITY_DN106018_c1_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoformGCTGAGAGCAAGCCCCGATTGGTGTGGCTGTACAAAAGCGCTTCGAAACAGCAATGTCACAGATCTTCAATGATTTGACATGAATGATATCCTTTTCCACGAAGTTGGGTTCATGTTGGAAAGTTCTTGGTCAAAAATAAACTGCAACATGGGCAGCCACGTATTTATAAGAACCTACAGAATATATGCAAGTGAATTGC
GTGAATCATTTCAATTTTGGTAATGTGATCATATTTGCAGCAATGAGGGATGAGGCTCTGAAATATCCTCTCTTAGAGGACGCTGGCAGAGACAAACCATGGATTCAGAGCAGACAGAATGATCTTTCTCTGGATGCCCACTCAATCTTGGATCCTAAAGTGCTGGCTAGAGAGAGCTGGATCGAATCCAAGAAGCTGTG
GTATATTGGAGGTCCTGCCATTTTCACCGCTATATGTCAATATTCTCTGGGAGCCATCACCCAGACTTTCGCTGGGCATTTGGGCACCGTAGAGCTGGCTGCAGTGGCTATCGAGAACTCGGTTATAGCAGGGCTGGCCTTCGGAACCATGCTTGGCATGGGCAGCGCACTGGAGACACTCTGCGGTCAGGCCTTCGGGG
CTGGGCAGATACACATGCTGGGAGTGTATATGCAGAGGTCATGGATTATACTTAATGTTACAGCATTGGTTTTAAGTCTTGTTTATATTTTTGCACCACCCATATTGAAGCTCTTTGGACAATCTGATGAGATTTCTGCCTTGTCTGGGAAGTTTGCCATCTGGATGCTTCCTCAGCTATTCGCTTATGCAATGAATTTT
CCCATTCAGAAGTTCCTCCAGGCTCAGAGCAAGGTGATGGCCATGGCTTGGATCTCTGCAGTGGTTTTAGTCTTACACGTTTTCTTGAGCTGGCTATGTATTGTGAAATTGGGATGGGGTTTGCCAGGAGCGGCCATAACTCTCAACCTTTCATGGTGGATAGTTGTATTGGGGCAGCTTGCGTATATAATGTTAGGTAG
CTGTCCTGGTGCATGGACTGGACTGTCATGGTTGGCGTTTCAGGATTTGGCTGCCTTTATTAGGCTTTCCTTGGCTTCTGCCGTTATGCTATGCCTGGAGTTCTGGTATTTGATGATATTGATCGTTTTGGCTGGTCACCTGAAAAACCCAGAAATTGAATTAGACTCGATCTCTATTTGTATGAATTTGAACGGATGGG
AAATGATG
>TRINITY_DN106018_c1_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:GCTGAGAGCAAGCCCCGATTGGTGTGGCTGTACAAAAGCGCTTCGAAACAGCAATGTCACAGATCTTCAATGATTTGACATGAATGATATCCTTTTCCACGAAGTTGGGTTCATGTTGGAAAGTTCTTGGTCAAAAATAAACTGCAACATGGGCAGCCACGTATTTATAAGAACCTACAGAATATATGCAAGTGAATTGC
GTGAATCATTTCAATTTTGGTAATGTGATCATATTTGCAGgtaaattgcgagaatcatttcaattttggtaatgttatcatatttggacagcgacttccaccgttatcgtatttgctttgcattgtccatctgccattaaaattgagagaagctgcttccagttatcacaagacagcagttttatcatatttgatttgca
ttgtccatccgccattaaaatttagagaagctgattgcatatatcacaacacagCAATGAGGGATGAGGCTCTGAAATATCCTCTCTTAGAGGACGCTGGCAGAGACAAACCATGGATTCAGAGCAGACAGAATGATCTTTCTCTGGATGCCCACTCAATCTTGGATCCTAAAGTGCTGGCTAGAGAGAGCTGGATCGAA
TCCAAGAAGCTGTGGTATATTGGAGGTCCTGCCATTTTCACCGCTATATGTCAATATTCTCTGGGAGCCATCACCCAGACTTTCGCTGGGCATTTGGGCACCGTAGAGCTGGCTGCAGTGGCTATCGAGAACTCGGTTATAGCAGGGCTGGCCTTCGGAACCATGCTTGGCATGGGCAGCGCACTGGAGACACTCTGCGG
TCAGGCCTTCGGGGCTGGGCAGATACACATGCTGGGAGTGTATATGCAGAGGTCATGGATTATACTTAATGTTACAGCATTGGTTTTAAGTCTTGTTTATATTTTTGCACCACCCATATTGAAGCTCTTTGGACAATCTGATGAGATTTCTGCCTTGTCTGGGAAGTTTGCCATCTGGATGCTTCCTCAGCTATTCGCTT
ATGCAATGAATTTTCCCATTCAGAAGTTCCTCCAGGCTCAGAGCAAGGTGATGGCCATGGCTTGGATCTCTGCAGTGGTTTTAGTCTTACACGTTTTCTTGAGCTGGCTATGTATTGTGAAATTGGGATGGGGTTTGCCAGGAGCGGCCATAACTCTCAACCTTTCATGGTGGATAGTTGTATTGGGGCAGCTTGCGTAT
ATAATGTTAGGTAGCTGTCCTGGTGCATGGACTGGACTGTCATGGTTGGCGTTTCAGGATTTGGCTGCCTTTATTAGGCTTTCCTTGGCTTCTGCCGTTATGCTATGCCTGGAGTTCTGGTATTTGATGATATTGATCGTTTTGGCTGGTCACCTGAAAAACCCAGAAATTGAATTAGACTCGATCTCTATTTGTATGAA
TTTGAACGGATGGGAAATGATG
Intron 2 GTGAGTGAAC ... GAATTGCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 30 | 7 | 0 | 3 |
| A2 | 0 | 6 | 1 | 0 |
| A3 | 33.33 | 8 | 2 | 4 |
| A4 | 66.67 | 1 | 1 | 2 |
| A5 | 33.33 | 2 | 0 | 1 |
| A6 | 14.29 | 6 | 0 | 1 |
| A7 | 8.7 | 21 | 0 | 2 |
| A8 | 12.5 | 7 | 0 | 1 |
| A9 | 29.41 | 12 | 0 | 5 |
| A10 | 0 | 5 | 0 | 0 |
>TRINITY_DN104881_c0_g2_i6 from sample A3 / Example spliced isoformAACAACAATGGAGGAGGGGACCCTGAGAACTCCTATCTTAGAAAAACAAGAGAAAGAAAGCGGACAGATAAGAAACAGATCTTTGATTCCTAAAAGACAGAATGTTCGATCATTAGATACCCATTTAGTCTTGAATCTCAAGAAGCTGGCTAAAGAGAGCTGGATAGAATCGAAGAAGCTGTGGTGTATTGGTGGCCCTG
CCACTTTCACGGTTATATGCCAGTATTCGCTAGGAGCCGTCACCCAGATTTTTGCTGGGCATTTGGGCACCGTAGAGCTGGCTGCAGTGGCTATCGAGAACTTGGTTATAGCAGGGATGGCCTTCGCAATTATGGTGAGCAGCTTGGCATGGGCAGTGCACTGGAGACACTGTGTGGTCAGGCCTTTGGAGCAGGGCAGA
TACACATGCTGGGAGTTTATATGCAGAGGTCATGGGTTATACTTAACGTTACAGCATTGGCTTTAAGTCTTGTTTATATTTTTGCACCGCCCATATTGAAGCTCTTTGGACAATCTGATGAAATTTCTGCCCTGGCAGGGAAGTTTGCCATCTGGATGCTTCCTCAGCTGTTTGCTTATGCAATGAATTTTCCCGTCCAG
AAGTTCCTCCAGTCGCAGAGCAAGGTCATGGCTATGGCTTGGATCTCTGCAGTTGCTCTAATTTTACACATTTTCTTGAGCTGGCTGTGTATTATGAGATTGGGATGGGGTTTGCCGGGAGCAGCCATAACCCTTAACCTTTCATGGTGGATAGTTGTATTGGGGCAGCTTGCGTATATAATGTTAGGTAGCTGTCCTGG
TGCATGGACTGGACTGTCATGGTTGGCGTTTCAGGATTTGGCTGCCTTTATTAGGCTTTCCTTGGCTTCTGCCGTTATGCTATGCCTGGAGTTCTGGTATTTGATGATATTGATCGTTTTGGCTGGTCACCTGAAAAACCCAGAAATTGAATTAGACTCGATCTCTATTTGTATGAATTTGAATGGATGGGAAGTGATGA
TAGCCCTTGGATTCAATGTTGCTATCAGTGTGAGAGTATCGAATGAACTGGGAGCTGGACATCCAAAGGCTGCAAAATTCTCAGTTGTGGTCGTGACCTTGACCTCGCTGTTGATAGGCATATTTTTTATGATTCTTGTTTTCATCACCAAAAATGATTTTCCAGTGCTTTTTACAAATAGCCAAGAGGTTATGCATGCA
GTAACCAAGCTAGCAACCTTGCTTGCGCTGACAATGGTTCTCAACAGCGTGCAGCCTGTTCTATCAGGGGTGGCAGTAGGAGCAGGATGGCAAGCTTTGGTGGCATATGTAAATATAGGTTGTTATTATGTCATTGGGCTTCCGCTTGGTAGTTTCCTGGGATACAAAATGAACCTTGGATCCAAGGGTATTTGGAGCGG
TATGATTGGAGGAACAGTTCTGCAAACTATAATTCTCATGTTTATCACATGTAGGACTGACTGGGACAGAGAGGCTTCAGAAGCTGGAGATCGGATTAAAGCTTGGGGAGGTTCAGTAGATCCCGTCAAAGAGGATTCAAAGAAGGACACAGAAGGAAGTGACAGAAAGAAGTTACCTTCGAACATCTGAAAATGAGGAT
TGCTACACTGTTATTCTAAAGTGACGTGTGTAATCTTTTCATTTACATCACTAGATTCGGCTGGCAACAAACATTTTCTGAATAAAATTCAAAAAGCTGGTAAATTGATGGTGAATTTGATTATGGTGTTTTCTGCTTCAATGAGGGAAGGGTGAATCAGTTGAGGAATTACTGAACTATTTTTCGATCTACCCTCTCAT
TTATTGTTTCATGGAATTGCCATGTTTTATTCTTTGCAGAGTTATGACTCTTACAAGATGCTAGTTAACCGGTATCCTAGTTCCCATGAAATCATTTGAATTTCAAGTGATAGTGAAAATAGATGCCATACAAATAGAGAAAAATGCTCCTCATGTCTATCTGGATTTAAAACGATAGGCTAGGTCATATTCAAATTTGA
AAGCCAATTTTAAGTCTCGGAATTGAATATAGTCAC
>TRINITY_DN104881_c0_g2_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:AACAACAATGGAGGAGGGGACCCTGAGAACTCCTATCTTAGAAAAACAAGAGAAAGAAAGCGGACAGATAAGAAACAGATCTTTGATTCCTAAAAGACAGAATGTTCGATCATTAGATACCCATTTAGTCTTGAATCTCAAGAAGCTGGCTAAAGAGAGCTGGATAGAATCGAAGAAGCTGTGGTGTATTGGTGGCCCTG
CCACTTTCACGGTTATATGCCAGTATTCGCTAGGAGCCGTCACCCAGATTTTTGCTGGGCATTTGGGCACCGTAGAGCTGGCTGCAGTGGCTATCGAGAACTTGGTTATAGCAGGGATGGCCTTCGCAATTATGgtgagtgaacataaaaaaatgtagttttttctgtttagttttatatttttgcagatattgaattga
attgccagGTGAGCAGCTTGGCATGGGCAGTGCACTGGAGACACTGTGTGGTCAGGCCTTTGGAGCAGGGCAGATACACATGCTGGGAGTTTATATGCAGAGGTCATGGGTTATACTTAACGTTACAGCATTGGCTTTAAGTCTTGTTTATATTTTTGCACCGCCCATATTGAAGCTCTTTGGACAATCTGATGAAATTT
CTGCCCTGGCAGGGAAGTTTGCCATCTGGATGCTTCCTCAGCTGTTTGCTTATGCAATGAATTTTCCCGTCCAGAAGTTCCTCCAGTCGCAGAGCAAGGTCATGGCTATGGCTTGGATCTCTGCAGTTGCTCTAATTTTACACATTTTCTTGAGCTGGCTGTGTATTATGAGATTGGGATGGGGTTTGCCGGGAGCAGCC
ATAACCCTTAACCTTTCATGGTGGATAGTTGTATTGGGGCAGCTTGCGTATATAATGTTAGGTAGCTGTCCTGGTGCATGGACTGGACTGTCATGGTTGGCGTTTCAGGATTTGGCTGCCTTTATTAGGCTTTCCTTGGCTTCTGCCGTTATGCTATGCCTGGAGTTCTGGTATTTGATGATATTGATCGTTTTGGCTGG
TCACCTGAAAAACCCAGAAATTGAATTAGACTCGATCTCTATTTGTATGAATTTGAATGGATGGGAAGTGATGATAGCCCTTGGATTCAATGTTGCTATCAGTGTGAGAGTATCGAATGAACTGGGAGCTGGACATCCAAAGGCTGCAAAATTCTCAGTTGTGGTCGTGACCTTGACCTCGCTGTTGATAGGCATATTTT
TTATGATTCTTGTTTTCATCACCAAAAATGATTTTCCAGTGCTTTTTACAAATAGCCAAGAGGTTATGCATGCAGTAACCAAGCTAGCAACCTTGCTTGCGCTGACAATGGTTCTCAACAGCGTGCAGCCTGTTCTATCAGGGGTGGCAGTAGGAGCAGGATGGCAAGCTTTGGTGGCATATGTAAATATAGGTTGTTAT
TATGTCATTGGGCTTCCGCTTGGTAGTTTCCTGGGATACAAAATGAACCTTGGATCCAAGGGTATTTGGAGCGGTATGATTGGAGGAACAGTTCTGCAAACTATAATTCTCATGTTTATCACATGTAGGACTGACTGGGACAGAGAGGCTTCAGAAGCTGGAGATCGGATTAAAGCTTGGGGAGGTTCAGTAGATCCCGT
CAAAGAGGATTCAAAGAAGGACACAGAAGGAAGTGACAGAAAGAAGTTACCTTCGAACATCTGAAAATGAGGATTGCTACACTGTTATTCTAAAGTGACGTGTGTAATCTTTTCATTTACATCACTAGATTCGGCTGGCAACAAACATTTTCTGAATAAAATTCAAAAAGCTGGTAAATTGATGGTGAATTTGATTATGG
TGTTTTCTGCTTCAATGAGGGAAGGGTGAATCAGTTGAGGAATTACTGAACTATTTTTCGATCTACCCTCTCATTTATTGTTTCATGGAATTGCCATGTTTTATTCTTTGCAGAGTTATGACTCTTACAAGATGCTAGTTAACCGGTATCCTAGTTCCCATGAAATCATTTGAATTTCAAGTGATAGTGAAAATAGATGC
CATACAAATAGAGAAAAATGCTCCTCATGTCTATCTGGATTTAAAACGATAGGCTAGGTCATATTCAAATTTGAAAGCCAATTTTAAGTCTCGGAATTGAATATAGTCAC