sp|C0LGQ4|MDIS2_ARATH ----> Protein MALE DISCOVERER 2


Intron 1 GTATCTAAAG ... GTTATTTCAG

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>TRINITY_DN125257_c0_g1_i8 from sample A1 / Example spliced isoform
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CACATCTACAAAAGGCAAAACCCCACCTTGAGTCTCCTTCAAGGCTTCTACACCTTTTCCTCATATAACTCCCAGCTCGAATCGTGGGACTCACACGATGATTAAAAATGGCATTCCCCAGATTCCGAGGGCACAAGCAAAGCGAGGTCAATGAATAAACAATAACATGGCATAGCATCATCAAAATGAAGGAGGAAGAG
GAAGGATTGCAAACCGATAGAGACTCGGCTTACGCGTCTAATTGACGGCGTCAGCCTCCGTCATCCGCCGGCAGGCAGGCCGTCCACCGGGCTAAATGGAGTAACGGTGTAAAAAAGCATAGCCAACAGGATGGAGAATGAAAAACAATGAAGAAAATTGCAAAAGTGCGGCGATTCCTTCAAACTCATACATGGCGCTT
CTGCTTGGAAGCTCGCCAAAACCCTTATCAAACAGCCAAGTTTGACTGCAGACCATGTTAATGCTAGTTTTTTAGACCGGAGTTCTGTTTGGAAGGTGCATGAATTCTGAAATCTTGTGCTGATATATGTCTGGAAATTTTCAGCGAAATTTTTGGCGTCTAGGAGAATGTTTCTGGGGAGAATTTAGTGGATTTTGTGG
TTTATTTCTTAAAAATCGAAAAGAATTGGGAACAGTGTAGCGTATTTGTCTGATCTTTGGATAGAAGACCTTCCGCCGATAAATTGCTTAACGGAGGGAATTTCTGTGGCGAATTTGTGAATACGCGAGGTTTTCCTTTACAGTGTATGCGATCTAATTTCAGAGTCGGGCCTTCTTAATAATCAGCGGTTTCAAAAATT
TGTAGGTTGGATGCTTTCACGGTGAAGGATCTCCTGAGGCTACTAGGGTTTGAAGAAATTGAACACAGCATAGAATACATGCTTCTTCCTTTACAATATAAAGGCATTCAGTGGATTACAGGACGTCTCTACAAGTCAAGTCAACTGATTTGAGGGATCACCAGAAAAATAGTTTTGGAGACAGACGTTTATGATCATTA
CAGTTAATTATATCTCAGGACAGTAAGTTGTGAAAATAAAGCTTTGTTAAAATAATGGGATGCCAATGGAGAAATGCAGTGAGGTTTCAGCTCATCCAAGAATTTTGTGCCATCTTGCTATTGCATTTAGCTGTTCGCAATTGCTGGTCTCTTAATTCTGAAGGCATGGCAATGCTCGCATTTCGAGGGTGTGTTGATAA
GGATCCTTACAATGTCTTCTCAAACTGGAGCCCTTATGATGAAGATCCTTGCAAATGGCGTGGAGTAAGTTGTGTAGACGGGAAAGTTATCTCCCTGGAGTTGGTAGATCTTTCTCTTCAAGGAATTCTGGCACCTGAACTTGGGCAGCTTATTCATCTTCAGAAACTTGTCCTTTGCAAGAACAATTTCTCAGGGAGCA
TTCCAAAAGAACTTGGAGAGTTAGGAAGCCTGGAGCTTTTGAATTTAAGTCATAATGGCTTGATTGGAAAGATTCCTTCAGATCTGGGAAATATATCAACCCTCAAAAGCCTTCTTCTCACAGACAATAAACTTGAAGGCAGCATTCCACCCGAACTTGGCAATCTTGTCTCTCTTTGTGAGTTACAGCTGGACAGAAAT
CAATTGTCTGGTTTTATACCAGGTTTTAAACATAGAAATCGAAAGACCATCAACAGTGTCAGCCTATGTGATTTGAAGTACCTAAAGAAAGCTGATTTTTCTTTCAACTTTTTTCAAGGAGAAATCCCTGCTTGTCTAGATCACTTGCCATGCCTCTCTTCGAATTTGTTGATTCAGGTCAAGCTTCCAATGGAATTGTT
TCCAATATCAAATATCTCAGCATCACCTTCAGCGAAGATGTGGATTTTCTCCAAAGAAAGCTTTCTCGCGGAATTACTTGTCTTTCTCTATGAAACAACTAAGACATGTTTTCATCTACTTTACGGGTAATGAAGGACTGCATTTGCAACAAACAGATCAGGGAGGAGCAACAGGCAAAGCTAGAATCTTGGCAGAAAAT
AATGTTAATGTCTCACCTGCAGGTCAAAGTCAAGCACCAACACCTTCACCAACACCTTCACCAAGCCCTTCCTCTCCTCCTTTATTTTCACCCTCACGCTCACCCTCACCCTCACCCTCACCTGTTTCTTCAATTCCCTCACCCTCACCCTCACCTTTAAGTTCTCCTGCACCTTCCTCTGTGTCTTCTTCTAGACCCTC
ATTGGTACCTTCACCTTCACAAAATTCTTCTCATCCATCAAAGAAATCAACTGCATGGAAGTATTATATTGCAGTTCCACTAGTGGCATTTTTTCTCATAACTTCTGTCCTAATCTGTATTTGTCGGAGACGCAATGTGGTGACAATCAGGCCATGGAAAACTGGAATAAGCGGCCAACTACAGAAGGCATTTGTAACAG
GTGTTCCTAAACTAAATCCAGTAGAGTTAGATGCAGCATGTGAGGAGTTTAGTAATGTCATTGGTACCATGCCTGATAGCATGCTATACAAAGGAACTCTGTCAAATGGGGTTGAAATTGCTGTAACATCCACCACAATATCATCTGCAAAAGATTGGTCGGAGCATTCAGAACTTTATTTTAGGAAGAAGATTGAAGTC
CTTTGTCGGATTAACCACAAAAACTTTGTTAATCTTCTTGGCTTCTGTGAGGAGGAGGAGCCATTCAGAAGAATGATGGTTTTTGAATATGCTCCAAATGGGACACTATTTGAACATCTTCACAATAAAGGAGCTGAACATCTGGACTGGGCTGCTCGGATGAGAATTATAATGGGAATAGCATACTGTCTTCAACATAT
GCATCATGATATGGAGCCCCCGGTTACTCATCTTAATTTACACTCTAAAGCAGTCTATTTGACAGATGATTATGCAGCAAAGCTATCAGATCCTGATGTGTGGAAAGAAGCTGCTGTTAAAAGCAATAAAATGAAGTCATTCAGCTATAGCCACTTGCTGGAAGTTGAAAACAATGTATATTGCTTTGGACTACTCCTGC
TTGAAATCATTTCGGGAAAGCTCCCCTATGCCCAAGAGCAAGGCATGCTTATTGAATGGGCCATGGGATACCTTGACAAGAAGGACATGATACAGTATATGGTAGATCCTTCCTTGAAATCTTTCAAATACAGTGAATTAGAAAAAATATGTGAGGTTGTACAATCATGCATTCATCCATATCCTCAACAGAGGCCATCA
ATGCGGGATATTACTTCAGAATTCAGAAAGGCTCTATCAATCTCACCAGAGGCAGCATATCCAAAATTGTCGCCATTGTGGTGGGCAGAACTTGAAATCCTCTCACAAGATGGCAGCTAATTAAATTTGTCGAACAATACTCCTATAGTTGCAACACTATAGGTGTATGTAGTGTGCCTGATAGCTGTAAAGATTGATTT
TTGGTGGCTTTTGGTGTTTTCTCACTGTTTTCTCCCTATCCAATTGCTTAGGATTCAGGACATGCTTCTTTAATTTGGAAGAGGTAAGGGGTAAGCCTTCATCTGAATTATTAGGCTGTATAGTAATATCTTGCCCATTTACATGCTGATTGTTTGAGTTGCTTCAAATTCAGAATAGTGTACCAAGGGTTCTCTTTGTT
TTCACAGCTTATGTTGCTTTGTATTCATATTCTTTCTGCAATCATCTCCATTACTATGATTGAGGTATTGCCTCAGTGGAGTTGAGAGCCATTAATACATAATTGTGCTTGTATATCTGATGGCTAAATGCTATTTCTGGTTTGTCCATCAATTTTTCTATTGCACTAGAAGGGTTAGGCAAATGACAGAGGAAGGTAGC
AGAAGGGACACTTACCAAGCCTTTAAATTGGCACTCCGGTAGTTCCTAAAAATTGAACTTCGATTTTTAAGGAGGATATGTCTGTAAGTTACATGTCAAGAAATCTATTATAGACATGCATCCCCTCAACAAGGTATTTTCTTTGACAATGAAGATTCCACGTTTCTAAGTCCAAGTAGGGCCTTGTTTTCTGGGCCAAA
TAGTGTCACTAAATACTACTCACCCTAGGTATCAAGTAATTTTAAAATATTGTTCACTTCGTGCAGTTTCTTTGATGACTAC


>TRINITY_DN125257_c0_g1_i9 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GAAGATGCGTGTTAAAGAATGGCTTTAACGACGTGGTCAAGCCCCACATCCGATGTCAGCCTTGCTCAGGCCAAGTTGTCCGCTAAATCCCAAAGTAAGAGCTGAAAGGAATGGATGACCTCAATTGGGCGATCTGTTTGTTTCCAACACGCGGGAGGTTGAATCAAAGCGAGTCACTCTACCTCAGATGATACATGCCG
CACATCTACAAAAGGCAAAACCCCACCTTGAGTCTCCTTCAAGGCTTCTACACCTTTTCCTCATATAACTCCCAGCTCGAATCGTGGGACTCACACGATGATTAAAAATGGCATTCCCCAGATTCCGAGGGCACAAGCAAAGCGAGGTCAATGAATAAACAATAACATGGCATAGCATCATCAAAATGAAGGAGGAAGAG
GAAGGATTGCAAACCGATAGAGACTCGGCTTACGCGTCTAATTGACGGCGTCAGCCTCCGTCATCCGCCGGCAGGCAGGCCGTCCACCGGGCTAAATGGAGTAACGGTGTAAAAAAGCATAGCCAACAGGATGGAGAATGAAAAACAATGAAGAAAATTGCAAAAGTGCGGCGATTCCTTCAAACTCATACATGGCGCTT
CTGCTTGGAAGCTCGCCAAAACCCTTATCAAACAGCCAAGTTTGACTGCAGACCATGTTAATGCTAGTTTTTTAGACCGGAGTTCTGTTTGGAAGGTGCATGAATTCTGAAATCTTGTGCTGATATATGTCTGGAAATTTTCAGCGAAATTTTTGGCGTCTAGGAGAATGTTTCTGGGGAGAATTTAGTGGATTTTGTGG
TTTATTTCTTAAAAATCGAAAAGAATTGGGAACAGTGTAGCGTATTTGTCTGATCTTTGGATAGAAGACCTTCCGCCGATAAATTGCTTAACGGAGGGAATTTCTGTGGCGAATTTGTGAATACGCGAGGTTTTCCTTTACAGTGTATGCGATCTAATTTCAGAGTCGGGCCTTCTTAATAATCAGCGGTTTCAAAAATT
TGTAGGTTGGATGCTTTCACGGTGAAGGATCTCCTGAGGCTACTAGGGTTTGAAGAAATTGAACACAGCATAGAATACATGCTTCTTCCTTTACAATATAAAGGCATTCAGTGGATTACAGGACGTCTCTACAAGTCAAGTCAACTGATTTGAGGGATCACCAGAAAAATAGTTTTGGAGACAGACGTTTATGATCATTA
CAGTTAATTATATCTCAGGACAGTAAGTTGTGAAAATAAAGCTTTGTTAAAATAATGGGATGCCAATGGAGAAATGCAGTGAGGTTTCAGCTCATCCAAGAATTTTGTGCCATCTTGCTATTGCATTTAGCTGTTCGCAATTGCTGGTCTCTTAATTCTGAAGGCATGGCAATGCTCGCATTTCGAGGGTGTGTTGATAA
GGATCCTTACAATGTCTTCTCAAACTGGAGCCCTTATGATGAAGATCCTTGCAAATGGCGTGGAGTAAGTTGTGTAGACGGGAAAGTTATCTCCCTGGAGTTGGTAGATCTTTCTCTTCAAGGAATTCTGGCACCTGAACTTGGGCAGCTTATTCATCTTCAGAAACTTGTCCTTTGCAAGAACAATTTCTCAGGGAGCA
TTCCAAAAGAACTTGGAGAGTTAGGAAGCCTGGAGCTTTTGAATTTAAGTCATAATGGCTTGATTGGAAAGATTCCTTCAGATCTGGGAAATATATCAACCCTCAAAAGCCTTCTTCTCACAGACAATAAACTTGAAGGCAGCATTCCACCCGAACTTGGCAATCTTGTCTCTCTTTGTGAGTTACAGCTGGACAGAAAT
CAATTGTCTGGTTTTATACCAGGTTTTAAACATAGAAATCGAAAGACCATCAACAGTGTCAGCCTATGTGATTTGAAGTACCTAAAGAAAGCTGATTTTTCTTTCAACTTTTTTCAAGGAGAAATCCCTGCTTGTCTAGATCACTTGCCATGGTCAAGCTTCCAATGGAATTGTTTCCAATATCAAATATCTCAGCATCA
CCTTCAGCGAAGATGTGGATTTTCTCCAAAGAAAGCTTTCTCGCGGAATTACTTGTCTTTCTCTATGAAACAACTAAGACATGTTTTCATCTACTTTACGGGTAATGAAGGACTGCATTTGCAACAAACAGATCAGGGAGGAGCAACAGGCAAAGCTAGAATCTTGGCAGAAAATAATGTTAATGTCTCACCTGCAGGTC
AAAGTCAAGCACCAACACCTTCACCAACACCTTCACCAAGCCCTTCCTCTCCTCCTTTATTTTCACCCTCACGCTCACCCTCACCCTCACCCTCACCTGTTTCTTCAATTCCCTCACCCTCACCCTCACCTTTAAGTTCTCCTGCACCTTCCTCTGTGTCTTCTTCTAGACCCTCATTGGTACCTTCACCTTCACAAAAT
TCTTCTCATCCATCAAAGAAATCAACTGCATGGAAGTATTATATTGCAGTTCCACTAGTGGCATTTTTTCTCATAACTTCTGTCCTAATCTGTATTTGTCGGAGACGCAATGTGGTGACAATCAGGCCATGGAAAACTGGAATAAGCGGCCAACTACAGAAGGCATTTGTAACAGGTGTTCCTAAACTAAATCCAGTAGA
GTTAGATGCAGCATGTGAGGAGTTTAGTAATGTCATTGGTACCATGCCTGATAGCATGCTATACAAAGGAACTCTGTCAAATGGGGTTGAAATTGCTGTAACATCCACCACAATATCATCTGCAAAAGATTGGTCGGAGCATTCAGAACTTTATTTTAGGAAGAAGATTGAAGTCCTTTGTCGGATTAACCACAAAAACT
TTGTTAATCTTCTTGGCTTCTGTGAGGAGGAGGAGCCATTCAGAAGAATGATGGTTTTTGAATATGCTCCAAATGGGACACTATTTGAACATCTTCACAATAAAGGAGCTGAACATCTGGACTGGGCTGCTCGGATGAGAATTATAATGGGAATAGCATACTGTCTTCAACATATGCATCATGATATGGAGCCCCCGGTT
ACTCATCTTAATTTACACTCTAAAGCAGTCTATTTGACAGATGATTATGCAGCAAAGgtatctaaagacttggaacaagtttgctttttcaattcgaacacccctttcagtgtttctctatttttaagtgatgtcatatctccttttaatgtttggttatttcagCTATCAGATCCTGATGTGTGGAAAGAAGCTGCTGT
TAAAAGCAATAAAATGAAGTCATTCAGCTATAGCCACTTGCTGGAAGTTGAAAACAATGTATATTGCTTTGGACTACTCCTGCTTGAAATCATTTCGGGAAAGCTCCCCTATGCCCAAGAGCAAGGCATGCTTATTGAATGGGCCATGGGATACCTTGACAAGAAGGACATGATACAGTATATGGTAGATCCTTCCTTGA
AATCTTTCAAATACAGTGAATTAGAAAAAATATGTGAGGTTGTACAATCATGCATTCATCCATATCCTCAACAGAGGCCATCAATGCGGGATATTACTTCAGAATTCAGAAAGGCTCTATCAATCTCACCAGAGGCAGCATATCCAAAATTGTCGCCATTGTGGTGGGCAGAACTTGAAATCCTCTCACAAGATGGCAGC
TAATTAAATTTGTCGAACAATACTCCTATAGTTGCAACACTATAGGTGTATGTAGTGTGCCTGATAGCTGTAAAGATTGATTTTTGGTGGCTTTTGGTGTTTTCTCACTGTTTTCTCCCTATCCAATTGCTTAGGATTCAGGACATGCTTCTTTAATTTGGAAGAGGTAAGGGGTAAGCCTTCATCTGAATTATTAGGCT
GTATAGTAATATCTTGCCCATTTACATGCTGATTGTTTGAGTTGCTTCAAATTCAGAATAGTGTACCAAGGGTTCTCTTTGTTTTCACAGCTTATGTTGCTTTGTATTCATATTCTTTCTGCAATCATCTCCATTACTATGATTGAGGTATTGCCTCAGTGGAGTTGAGAGCCATTAATACATAATTGTGCTTGTATATC
TGATGGCTAAATGCTATTTCTGGTTTGTCCATCAATTTTTCTATTGCACTAGAAGGGTTAGGCAAATGACAGAGGAAGGTAGCAGAAGGGACACTTACCAAGCCTTTAAATTGGCACTCCGGTAGTTCCTAAAAATTGAACTTCGATTTTTAAGGAGGATATGTCTGTAAGTTACATGTCAAGAAATCTATTATAGACAT
GCATCCCCTCAACAAGGTATTTTCTTTGACAATGAAGATTCCACGTTTCTAAGTCCAAGTAGGGCCTTGTTTTCTGGGCCAAATAGTGTCACTAAATACTACTCACCCTAGGTATCAAGTAATTTTAAAATATTGTTCACTTCGTGCAGTTTCTTTGATGACTAC



Intron 2 GTGACGATTA ... TCGTTATTAG

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>TRINITY_DN46513_c0_g3_i6 from sample A7 / Example spliced isoform
GGCTTTAACGACGTGGTCAAGCCCCACATCCGATGTCAGCCTTGCTCAGGCCAAGTTGTCCGCTAAATCCCAAAGTAAGAGCTGAAAGGAATGGATGACCTCAATTGGGCGATCTGTTTGTTTCCAACACGCGGGAGGTTGAATCAAAGCGAGTCACTCTACCTCAGATGATACATGCCGCACATCTACAAAAGGCAAAA
CCCCACCTTGAGTCTCCTTCAAGGCTTCTACACCTTTTCCTCATATAACTCCCAGCTCGAATCGTGGGACTCACACGATGATTAAAAATGGCATTCCCCAGATTCCGAGGGCACAAGCAAAGCGAGGTCAATGAATAATAAACAATAACATGGCATAGCATCATCAAAATGAAGGAGGAAGAGGAAGGATTGCAAACCGA
TAGAGACTCGGCTTACGCGTCTAATTGACGGCGTCAGCCTCCGTCATCCGCCGGCAGGCAGGCCGTCCACCGGGCTAAATGGAGTAACGGTGTAAAAAAGCATAGCCAACAGGATGGAGAATGAAAAACAATGAAGAAAATTGCAAAAGTGCGGCGATTCCTTCAAACTCATAAATGGCGCTTCTGCTTGGAAGCTCGCC
AAAACCCTTATCAAACAGCCAAGTTTGACTGCAGACCATGTTAATGCTAGTTTTTTAGACCGGAGTTCTGTTTGGAAGGTGCATGAATTCTGAAATCTTGTGTTGATTTATGTCTGGAAATTTTCAGCGAAATTTTTGGCGTCCAGGAGAATGTTTCTAGGGAGAATTTAGTGGATTTTGTGGTTTATTTTCTTAAAAAT
CGAAAAGAATTGGGAACAGTGTAGCGTATTTGTCTGATCTTTGGATAGAAGACCTTCCGCCGATAAATTGCTTAACGGAGGGAATTTCTGTGGCGAATTTGTGAATACGCGAGGTTTTCCTTTACAGTGTATGCGATCTAATTTCAGAGTCGGGCCTTCTTAATAATCAGCGGTTTCAAAAATTTGTAGTTTGGTGGATT
CCGTCAAAAATCGTAGTTTCAGCTGCAGAGTTTGGTAGCTTGGTCAGACATTACGGTTTTCGTCTAGTACGGGGCAATGCGTCTCACGGATTTAGAATCTTATTTCTCTGTTTAGCGTTTTTTGTTGGATGCTTTCACGGTGAAGGATCTCCTGAGGCTACTAGGGTTTGAAGAAATTGAACACAGCATAGAATACATGC
TTCTTCCTTTACAATATAAAGGCATTCAGTGGATTACAGGACGTCTCTACAAGTCAAGTCAACTGATTTGAGGGATCACCAGAAAAATAGTTTTGGAGACAGACGTTTATGATCATTACAGTTAATTATATCTCAGGACAGTAAGTTGTGAAAATAAAGCTTTGTTAAAATAATGGGATGCCAATGGAGAAATGCAGTGA
GGTTTCAGCTCATCCAAGAATTTTGTGCCATCTTGCTATTGCATTTAGCTGTTCGCAATTGCTGGTCTCTTAATTCTGAAGGCATGGCAATGCTAGCATTTCGAGGGTGTGTTGATAAGGATCCTTACAATGTCTTCTCAAACTGGAGCCCTTATGATGAAGATCCTTGCAAATGGCGTGGAGTAAGTTGTGTAGACGGG
AAAGTTATCTCCCTGGAGTTGGTAGATCTTTCTCTTCAAGGAATTCTGGCACCTGAACTTGGGCAGCTTATTCATCTTCAGAAACTTGTCCTTTGCAAGAACAATTTCTCAGGGAGCATTCCAAAAGAACTTGGAGAGTTAGGAAGCCTGGAGCTTTTGAATTTAAGTCATAATGGCTTGATTGGAAAGATTCCTTCAGA
TCTGGGAAATATATCAACCCTCAAAAGCCTTCTTCTCACAGACAATAAACTTGAAGGCAGCATTCCACCCGAACTTGGCAATCTTGTCTCTCTTTGTGAGTTACAGCTGGACAGAAATCAATTGTCTGGTTTTATACCAGGTTTTAAACATAGAAATCGAAAGACCATCAACAGTGTCAGCCTATGTGATTTGAAGTACC
TAAAGAAAGCTGATTTTTCTTTCAACTTTTTTCAAGGAGAAATCCCTGCTTGTCTAGATCACTTGCCATGGTCAAGCTTCCAATGGAATTGTTTCCAATATCAAATATCTCAGCATCACCTTCAGCGAAGATGTGGATTTTCTCCAAAGAAAGCTTTCTCGCGGAATTACTTGTCTTTCTCTATGAAACAACTAAGACAT
GTTTTCATCTGCTTTACGGGTAATGAAGGACTGCATTTGCAACAAACAGATCAGGGAGGAGCAACAGGCAAAGCTAGAATCTTGGCAGAAAATAATGTTAATGTCTCACCTGCAGGTCAAAGTCAAGCACCAACACCTTCACCAACACCTTCACCAAGCCCTTCCTCTCCTCCTTTATTTTCACCCTCACGCTCACCCTC
ACCCTCACCCTCACCTGTTTCTTCAATTCCCTCACCCTCACCCTCACCTTTAAGTTCTCCTGCACCTTCCTCTGTGTCTTCTTCTAGACCCTCATTGGTACCTTCACCTTCACAAAATTCTTCTCATCCATCAAAGAAATCAACTGCATGGAAGTATTATATTGCAGTTCCACTAGTGGCATTTTTTCTCATAACTTCTG
TCCTAATCTGTATTTGTCGGAGACGCAATGTGGTGACAATCAGGCCATGGAAAACTGGAATAAGCGGCCAACTACAGAAGGCATTTGTAACAGGTGTTCCTAAACTAAATCCAATAGAGTTAGATGCAGCATGTGAGGAGTTTAGTAATGTCATTGGTACCATGCCTGATAGCATGCTATACAAAGGAACTCTGTCAAAT
GGGGTTGAAATTGCTGTAACATCCACCACAATATCATCTGCAAAAGATTGGTCGGAGCATTCAGAACTTTATTTTAGGAAGAAGATTGAAGTCCTTTGTCGGATTAACCACAAAAACTTTGTTAATCTTCTTGGCTTCTGTGAGGAGGAGGAGCCATTCAGAAGAATGATGGTTTTTGAATATGCTCCAAATGGGACACT
ATTTGAACATCTTCACAATAAAGGAGCTGAACATCTGGACTGGGCTGCTCGGATGAGAATTATAATGGGAATAGCATACTGTCTTCAACATATGCATCATGATATGGAGCCCCCGGTTACTCATCTTAATTTACACTCTAAAGCAGTCTATTTGACAGATGATTATGCAGCAAAGCTATCAGATCCTGATGTGTGGAAAG
AAGCTGCTGTTAAAAGCAATAAAATGAAGTCATTCAGCTATAGCCACTTGCTGGAAGTTGAAAACAATGTATATTGCTTTGGACTACTCCTGCTTGAAATCATTTCGGGAAAGCTCCCCTATGCCCAAGAGCAAGGCATGCTTATTGAATGGGCCATGGGATACCTTGACAAGAAGGACATGATACAGTATATGGTAGAT
CCTTCCTTGAAATCTTTCAAATACAGTGAATTAGAAAAAATATGTGAGGTTGTACAATCATGCATTCATCCATATCCTCAACAGAGGCCATCAATGCGGGATATTACTTCAGAATTCAGAAAGGCTCTATCAATCTCACCAGAGGCAGCATATCCAAAATTGTCGCCATTGTGGTGGGCAGAACTTGAAATCCTCTCACA
AGATGGCAGCTAATTAAATTTGTCGAACAATACTCCTATAGTTGCAACACTATAGGTGTATGTAGTGTGCCTGATAGCTGTAAAGATTGATTTTTGGTGGCTTTTGGTGTTTTCTCACTGTTTTCTCCCTATCCAATTGCTTAGGATTCAGGACATGCTTCTTTAATTTGGAAGAGGTAAGGGGTAAGCCTTCATCTGAA
TTATTAGGCTGTATAGTAATATCTTGCCCATTTACATGCTGATTGTTTGAGTTGCTTCAAATTCAGAATAGTGTACCAAGGGTTCTCTTTGTTTTCACAGCTTATGTTGCTTTGTATTCATATTCTTTCTGCAATCATCTCCATTACTATGATTGAGGTATTGCCTCAGTGGAGTTGAGAGCCATTAATACATAATTGTG
CTTGTATATCTGATGGCTAAATGCTATTTCTGGTTTGTCCATCAATTTTTCTATTGCACTAGAAGGGTTAGGCAAATGACAGAGGAAGGTAGCAGAAGGGACACTTACCAAGCCTTTAAATTGGCACTCCGGTAGTTCCTAAAAATTGAACTTCGATTTTTAAGGAGGATATGTCTGTAAGTTACATGTCAAGAAATCTA
TTATAGACATGCATCCCCTCAACAAGGTATTTTCTTTGACAATGAAGATTCCACGTTTCTAAGTCCAAGTAGGGCCTTGTTTTCTGGGCCAAATAGTGTCACTAAATACTACTCACCCTAGGTATCAAGTAATTTTAAAATATTGTTCACTTCGTGCAGTTTCTTTGATGACTATATATTTACATTTCAAAAAGTTCAAT
GATGCTTCATTGACAGACGTAGATGTCAATGTTTTGAATGGTTTTCAAGGTGGTTCTGCACTTTGTTTCTGTGCTGCCTTCTTAATAATTATGTTTTCGTAGATATTCCAAACGTATGGAGGCTCTGAAACATTACATTACTATTTTCCAG


>TRINITY_DN46513_c0_g3_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:
GGCTTTAACGACGTGGTCAAGCCCCACATCCGATGTCAGCCTTGCTCAGGCCAAGTTGTCCGCTAAATCCCAAAGTAAGAGCTGAAAGGAATGGATGACCTCAATTGGGCGATCTGTTTGTTTCCAACACGCGGGAGGTTGAATCAAAGCGAGTCACTCTACCTCAGATGATACATGCCGCACATCTACAAAAGGCAAAA
CCCCACCTTGAGTCTCCTTCAAGGCTTCTACACCTTTTCCTCATATAACTCCCAGCTCGAATCGTGGGACTCACACGATGATTAAAAATGGCATTCCCCAGATTCCGAGGGCACAAGCAAAGCGAGGTCAATGAATAATAAACAATAACATGGCATAGCATCATCAAAATGAAGGAGGAAGAGGAAGGATTGCAAACCGA
TAGAGACTCGGCTTACGCGTCTAATTGACGGCGTCAGCCTCCGTCATCCGCCGGCAGGCAGGCCGTCCACCGGGCTAAATGGAGTAACGGTGTAAAAAAGCATAGCCAACAGGATGGAGAATGAAAAACAATGAAGAAAATTGCAAAAGTGCGGCGATTCCTTCAAACTCATAAATGGCGCTTCTGCTTGGAAGCTCGCC
AAAACCCTTATCAAACAGCCAAGTTTGACTGCAGACCATGTTAATGCTAGTTTTTTAGACCGGAGTTCTGTTTGGAAGGTGCATGAATTCTGAAATCTTGTGTTGATTTATGTCTGGAAATTTTCAGCGAAATTTTTGGCGTCCAGGAGAATGTTTCTAGGGAGAATTTAGTGGATTTTGTGGTTTATTTTCTTAAAAAT
CGAAAAGAATTGGGAACAGTGTAGCGTATTTGTCTGATCTTTGGATAGAAGACCTTCCGCCGATAAATTGCTTAACGGAGGGAATTTCTGTGGCGAATTTGTGAATACGCGAGGTTTTCCTTTACAGTGTATGCGATCTAATTTCAGAGTCGGGCCTTCTTAATAATCAGCGGTTTCAAAAATTTGTAGTTTGGTGGATT
CCGTCAAAAATCGTAGTTTCAGCTGCAGAGTTTGGTAGCTTGGTCAGACATTACGGTTTTCGTCTAGTACGGGgtgacgattactttatttctttgaatctgaaattatcgttattagGCAATGCGTCTCACGGATTTAGAATCTTATTTCTCTGTTTAGCGTTTTTTGTTGGATGCTTTCACGGTGAAGGATCTCCTGA
GGCTACTAGGGTTTGAAGAAATTGAACACAGCATAGAATACATGCTTCTTCCTTTACAATATAAAGGCATTCAGTGGATTACAGGACGTCTCTACAAGTCAAGTCAACTGATTTGAGGGATCACCAGAAAAATAGTTTTGGAGACAGACGTTTATGATCATTACAGTTAATTATATCTCAGGACAGTAAGTTGTGAAAAT
AAAGCTTTGTTAAAATAATGGGATGCCAATGGAGAAATGCAGTGAGGTTTCAGCTCATCCAAGAATTTTGTGCCATCTTGCTATTGCATTTAGCTGTTCGCAATTGCTGGTCTCTTAATTCTGAAGGCATGGCAATGCTAGCATTTCGAGGGTGTGTTGATAAGGATCCTTACAATGTCTTCTCAAACTGGAGCCCTTAT
GATGAAGATCCTTGCAAATGGCGTGGAGTAAGTTGTGTAGACGGGAAAGTTATCTCCCTGGAGTTGGTAGATCTTTCTCTTCAAGGAATTCTGGCACCTGAACTTGGGCAGCTTATTCATCTTCAGAAACTTGTCCTTTGCAAGAACAATTTCTCAGGGAGCATTCCAAAAGAACTTGGAGAGTTAGGAAGCCTGGAGCT
TTTGAATTTAAGTCATAATGGCTTGATTGGAAAGATTCCTTCAGATCTGGGAAATATATCAACCCTCAAAAGCCTTCTTCTCACAGACAATAAACTTGAAGGCAGCATTCCACCCGAACTTGGCAATCTTGTCTCTCTTTGTGAGTTACAGCTGGACAGAAATCAATTGTCTGGTTTTATACCAGGTTTTAAACATAGAA
ATCGAAAGACCATCAACAGTGTCAGCCTATGTGATTTGAAGTACCTAAAGAAAGCTGATTTTTCTTTCAACTTTTTTCAAGGAGAAATCCCTGCTTGTCTAGATCACTTGCCATGGTCAAGCTTCCAATGGAATTGTTTCCAATATCAAATATCTCAGCATCACCTTCAGCGAAGATGTGGATTTTCTCCAAAGAAAGCT
TTCTCGCGGAATTACTTGTCTTTCTCTATGAAACAACTAAGACATGTTTTCATCTGCTTTACGGGTAATGAAGGACTGCATTTGCAACAAACAGATCAGGGAGGAGCAACAGGCAAAGCTAGAATCTTGGCAGAAAAGGGTAATGTTAATGTCTCACCTGCAGGTCAAAGTCAAGCACCAATGGAGTCTAGTACCAACCC
TAGTGGTATATTGCGTGCTGTGAAAAGTCCAACACCTTCACCAAGCCCTTCCTCTCCATCTCCTTTATTTTCACCCTCACGCTCACCCTCACCCTCACCCTCACCTGTTTCTTCAATTCCCTCACCCTCACCCTCACCCTCACCCTCACCCTCACCTTTAAGTTCTCCTGCACCTTCCTCTGTGTCTTCTTCTAGACCCT
CATTGGTACCTTCACCTTCACAAAATTCTTCTCATCCATCAAAGAAATCAACTGCATGGAAGTATTATATTGCAGTTCCACTAGTGGCATTTTTTCTCATAACTTCTGTCCTAATCTGTATTTGTCGGAGACGCAATGTGGTGACAATCAGGCCATGGAAAACTGGAATAAGCGGCCAACTACAGAAGGCATTTGTAACA
GGTGTTCCTAAACTAAATCCAATAGAGTTAGATGCAGCATGTGAGGAGTTTAGTAATGTCATTGGTACCATGCCTGATAGCATGCTATACAAAGGAACTCTGTCAAATGGGGTTGAAATTGCTGTAACATCCACCACAATATCATCTGCAAAAGATTGGTCGGAGCATTCAGAACTTTATTTTAGGAAGAAGATTGAAGT
CCTTTGTCGGATTAACCACAAAAACTTTGTTAATCTTCTTGGCTTCTGTGAGGAGGAGGAGCCATTCAGAAGAATGATGGTTTTTGAATATGCTCCAAATGGGACACTATTTGAACATCTTCACAATAAAGGAGCTGAACATCTGGACTGGGCTGCTCGGATGAGAATTATAATGGGAATAGCATACTGTCTTCAACATA
TGCATCATGATATGGAGCCCCCGGTTACTCATCTTAATTTACACTCTAAAGCAGTCTATTTGACAGATGATTATGCAGCAAAGCTATCAGATCCTGATGTGTGGAAAGAAGCTGCTGTTAAAAGCAATAAAATGAAGTCATTCAGCTATAGCCACTTGCTGGAAGTTGAAAACAATGTATATTGCTTTGGACTACTCCTG
CTTGAAATCATTTCGGGAAAGCTCCCCTATGCCCAAGAGCAAGGCATGCTTATTGAATGGGCCATGGGATACCTTGACAAGAAGGACATGATACAGTATATGGTAGATCCTTCCTTGAAATCTTTCAAATACAGTGAATTAGAAAAAATATGTGAGGTTGTACAATCATGCATTCATCCATATCCTCAACAGAGGCCATC
AATGCGGGATATTACTTCAGAATTCAGAAAGGCTCTATCAATCTCACCAGAGGCAGCATATCCAAAATTGTCGCCATTGTGGTGGGCAGAACTTGAAATCCTCTCACAAGATGGCAGCTAATTAAATTTGTCGAACAATACTCCTATAGTTGCAACACTATAGGTGTATGTAGTGTGCCTGATAGCTGTAAAGATTGATT
TTTGGTGGCTTTTGGTGTTTTCTCACTGTTTTCTCCCTATCCAATTGCTTAGGATTCAGGACATGCTTCTTTAATTTGGAAGAGGTAAGGGGTAAGCCTTCATCTGAATTATTAGGCTGTATAGTAATATCTTGCCCATTTACATGCTGATTGTTTGAGTTGCTTCAAATTCAGAATAGTGTACCAAGGGTTCTCTTTGT
TTTCACAGCTTATGTTGCTTTGTATTCATATTCTTTCTGCAATCATCTCCATTACTATGATTGAGGTATTGCCTCAGTGGAGTTGAGAGCCATTAATACATAATTGTGCTTGTATATCTGATGGCTAAATGCTATTTCTGGTTTGTCCATCAATTTTTCTATTGCACTAGAAGGGTTAGGCAAATGACAGAGGAAGGTAG
CAGAAGGGACACTTACCAAGCCTTTAAATTGGCACTCCGGTAGTTCCTAAAAATTGAACTTCGATTTTTAAGGAGGATATGTCTGTAAGTTACATGTCAAGAAATCTATTATAGACATGCATCCCCTCAACAAGGTATTTTCTTTGACAATGAAGATTCCACGTTTCTAAGTCCAAGTAGGGCCTTGTTTTCTGGGCCAA
ATAGTGTCACTAAATACTACTCACCCTAGGTATCAAGTAATTTTAAAATATTGTTCACTTCGTGCAGTTTCTTTGATGACTATATATTTACATTTCAAAAAGTTCAATGATGCTTCATTGACAGACGTAGATGTCAATGTTTTGAATGGTTTTCAAGGTGGTTCTGCACTTTGTTTCTGTGCTGCCTTCTTAATAATTAT
GTTTTCGTAGATATTCCAAACGTATGGAGGCTCTGAAACATTACATTACTATTTTCCAG



Intron 3 GTAAATTTTT ... TTTTGCAAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A1042.4219140



>TRINITY_DN120946_c0_g2_i2 from sample A2 / Example spliced isoform
CGAATTTTTCTTTAAATAAGACAAAACCTTTGAAGATGCGTGTTAAAGAATGGCTTTAACGACGTGGTCAAGCCCCACATCCGATGTCAGCCTTGCTCAGGCCAAGTTGTCCGCTAAATCCCAAAGTAAGAGCTGAAAGGAATGGATGACCTCAATTGGGCGATCTGTTTGTTTCCAACACGCGGGAGGTTGAATCAAAG
CGAGTCACTCTACCTCAGATGATACATGCCGCACATCTACAAAAGGCAAAACCCCACCTTGAGTCTCCTTCAAGGCTTCTACACCTTTTCCTCATATAACTCCCAGCTCGAATCGTGGGACTCACACGATGATTAAAAATGGCATTCCCCAGATTCCGAGGGCACAAGCAAAGCGAGGTCAATGAATAAACAATAACATG
GCATAGCATCATCAAAATGAAGGAGGAAGAGGAAGGATTGCAAACCGATAGAGACTCGGCTTACGCGTCTAATTGACGGCGTCAGCCTCCGTCATCCGCCGGCAGGCAGGCCGTCCACCGGGCTAAATGGAGTAACGGTGTAAAAAAGCATAGCCAACAGGATGGAGAATGAAAAACAATGAAGAAAATTGCAAAAGTGC
GGCGATTCCTTCAAACTCATACATGGCGCTTCTGCTTGGAAGCTCGCCAAAACCCTTATCATACAGCCAAGTTTGACTGCAGACCATGTTAATGCTAGTTTTTTAGACCGGAGTTCTGTTTGGAAGGTGCATGAATTCTGAAATCTTGTGTTGATTTATGTCTGGAAATTTTCAGCGAAATTTTTGGCGTCCAGGAGAAT
GTTTCTAGGGAGAATTTAGTGGATTTTGTGGTTTATTTTCTTAAAAATCGAAAAGAATTGGGAACAGTGTAGCGTATTTGTCTGATCTTTGGATAGAAGACCTTCCGCCGATAAATTGCTTAACGGAGGGAATTTCTGTGGCGAATTTGTGAATACGCGAGGTTTTCCTTTACAGTGTATGCGATCTAATTTCAGAGTCG
GGCCTTCTTAATAATCAGCGGTTTCAAAAATTTGTAGTTTGGTGGATTCCGTCAAAAATCGTAGTTTCAGCTGCAGAGTTTGGTAGCTTGGTCAGACATTACGGTTTTCGTCTAGCAATGCGTCTCACGGATTTAGAATCTTATTTCTCTGTTTAGCGTTTTTTGTTGGATGCTTTCACGGTGAAGGATCTCCTGAGGCT
ACTAGGGTTTGAAGAAATTGAACACAGCATAGAATACATGCTTCTTCCTTTACAATATAAAGGCATTCAGTGGATTACAGGACGTCTCTACAAGTCAAGTCAACTGATTTGAGGGATCACCAGAAAAATAGTTTTGGAGACAGACGTTTATGATCATTACAGTTAATTATATCTCAGGACAGTAAGTTGTGAAAATAAAG
CTTTGTTAAAATAATGGGATGCCAATGGAGAAATGCAGTGAGGTTTCAGCTCATCCAAGAATTTTGTGCCATCTTGCTATTGCATTTAGCTGTTCGCAATTGCTGGTCTCTTAATTCTGAAGGCATGGCAATGCTAGCATTTCGAGGGTGTGTTGATAAGGATCCTTACAATGTCTTCTCAAACTGGAGCCCTTATGATG
AAGATCCTTGCAAATGGCGTGGAGTAAGTTGTGTAGACGGGAAAGTCATCTCCCTGGAGTTGGTAGATCTTTCTCTTCAAGGAATTCTGGCACCTGAACTTGGGCAGCTTATTCATCTTCAGAAACTTGTCCTTTGCAAGAACAATTTCTCAGGGAGCATTCCAAAAGAACTTGGAGAGTTAGGAAGCCTGGAGCTTTTG
AATTTAAGTCATAATGGCTTGATTGGAAAGATTCCTTCAGATCTGGGAAATATATCAACCCTCAAAAGCCTTCTTCTCACAGACAATAAACTTGAAGGCAGCATTCCACCCGAACTTGGCAATCTTGTCTCTCTTTGTGAGTTACAGCTGGACAGAAATCAATTGTCTGGTTTTATACCAGGTTTTAAACATAGAAATCG
AAAGACCATCAACAGTGTCAGCCTATGTGATTTGAAGTACCTAAAGAAAGCTGATTTTTCTTTCAACTTTTTTCAAGGAGAAATCCCTGCTTGTCTAGATCACTTGCCATGGTCAAGCTTCCAATGGAATTGTTTCCAATATCAAATATCTCAGCATCACCTTCAGCGAAGATGTGGATTTTCTCCAAAGAAAGCTTTCT
CGCGGAATTACTTGTCTTTCTCTATGAAACAACTAAGACATGTTTTCATCTACTTTACGGGTAATGAAGGACTGCATTTGCAACAAACAGATCAGGGAGGAGCAACAGGCAAAGCTAGAATCTTGGCAGAAAAGGGTAATGTTAATGCCTCACCTGCAGGTCAAAGTCAAGCACCAATGGAGTCTAGTACCAACCCTAGT
GGTATATTGCGTGCTGTGAAAAGTCCAACACCTTCACCAAGCCCTTCCTCTCCATCTCCTTTATTTTCACCCTCACGCTCACCCTCACCCTCACCCTCACCTGTTTCTTCAATTCCCTCACCCTCACCCTCACCTTTAAGTTCTCCTGCACCTTCCTCTGTGTCTTCTTCTAGACCCTCATTGGTACCTTCACCTTCACA
AAATTCTTCTCATCCATCAAAGAAATCAACTGCATGGAAGTATTATATTGCAGTTCCACTAGTGGCATTTTTTCTCATAACTTCTGTCCTAATCTGTATTTGTCGGAGACGCAATGTGGTGACAATCAGGCCATGGAAAACTGGAATAAGCGGCCAACTACAGAAGGCATTTGTAACAGGTGTTCCTAAACTAAATCCAA
TAGAGTTAGATGCAGCATGTGAGGAGTTTAGTAATGTCATTGGTACCATGCCTGATAGCATGCTATACAAAGGAACTCTGTCAAATGGGGTTGAAATTGCTGTAACATCCACCACAATATCATCTGCAAAAGATTGGTCGGAGCATTCAGAACTTTATTTTAGGAAGAAGATTGAAGTCCTTTGTCGGATTAACCACAAA
AACTTTGTTAATCTTCTTGGCTTCTGTGAGGAGGAGGAGCCATTCAGAAGAATGATGGTTTTTGAATATGCTCCAAATGGGACACTATTTGAACATCTTCACAATAAAGGAGCTGAACATCTGGACTGGGCTGCTCGGATGAGAATTATAATGGGAATAGCATACTGTCTTCAACATATGCATCATGATATGGAGCCCCC
GGTTACTCATCTTAATTTACACTCTAAAGCAGTCTATTTGACAGATGATTATGCAGCAAAGCTATCAGATCCTGATGTGTGGAAAGAAGCTGCTGTTAAAAGCAATAAAATGAAGTCATTCAGCTATAGCCACTTGCTGGAAGTTGAAAACAATGTATATTGCTTTGGACTACTCTTGCTTGAAATCATTTCGGGAAAGC
TCCCCTATGCCCAAGAGCAAGGCATGCTTATTGAATGGGCCATGGGATACCTTGACAAGAAGGACATGATACAGTATATGGTAGATCCTTCCTTGAAATCTTTCAAATACAGTGAATTAGAAAAAATATGTGAGGTTGTACAATCATGCATTCATCCATATCCTCAACAGAGGCCATCAATGCGGGATATTACTTCAGAA
TTCAGAAAGGCTCTATCAATCTCACCAGAGGCAGCATATCCAAAATTGTCGCCATTGTGGTGGGCAGAACTTGAAATCCTCTCACAAGATGGCAGCTAATTAAATTTGTCGAACAATACTCCTATAGTTGCAACACTATAGGTGTATGTAGTGTGCCTGATAGCTGTAAAGATTGATTTTTGGTGGCTTTTGGTGTTTTC
TCACTGTTTTCTCCCTATCCAATTGCTTAGGATTCAGGACATGCTTCTTTAACTTGGAAGAGGTAAGGGGTAAGCCTTCATCTGAATTATTAGGCTGTATAGTAATATCTTGCCCATTTACATGCTGATTGTTTGAGTTGCTTCAAATTCAGAATAGTGTACCAAGGGTTCTCTTTGTTTTCACAGCTTATGTTGCTTTG
TATTCATATTCTTTCTGCAATCATCTCCATTACTATGATTGAGGTATTGCCTCAGTGGAGTTGAGAGCCATTAATACATAATTGTGCTTGTATATCTGATGGCTAAATGCTATTTCTGGTTTGTCCATCAATTTTTCTATTGCACTAGAAGGGTTAGGCAAATGACAGAGGAAGGTAGCAGAAGGGACACTTACCAAGCC
TTTAAATTGGCACTCCGGTAGTTCCTAAAAATTGAACTTCGATTTTTAAGGAGGATATGTCTGTAAGTTACATGTCAAGAAATCTATTATAGACATGCATCCCCTCAACAAGGTATTTTCTTTGACAATGAAGATTCCATGTTTCTAAGTCC


>TRINITY_DN120946_c0_g2_i5 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CGAATTTTTCTTTAAATAAGACAAAACCTTTGAAGATGCGTGTTAAAGAATGGCTTTAACGACGTGGTCAAGCCCCACATCCGATGTCAGCCTTGCTCAGGCCAAGTTGTCCGCTAAATCCCAAAGTAAGAGCTGAAAGGAATGGATGACCTCAATTGGGCGATCTGTTTGTTTCCAACACGCGGGAGGTTGAATCAAAG
CGAGTCACTCTACCTCAGATGATACATGCCGCACATCTACAAAAGGCAAAACCCCACCTTGAGTCTCCTTCAAGGCTTCTACACCTTTTCCTCATATAACTCCCAGCTCGAATCGTGGGACTCACACGATGATTAAAAATGGCATTCCCCAGATTCCGAGGGCACAAGCAAAGCGAGGTCAATGAATAAACAATAACATG
GCATAGCATCATCAAAATGAAGGAGGAAGAGGAAGGATTGCAAACCGATAGAGACTCGGCTTACGCGTCTAATTGACGGCGTCAGCCTCCGTCATCCGCCGGCAGGCAGGCCGTCCACCGGGCTAAATGGAGTAACGGTGTAAAAAAGCATAGCCAACAGGATGGAGAATGAAAAACAATGAAGAAAATTGCAAAAGTGC
GGCGATTCCTTCAAACTCATACATGGCGCTTCTGCTTGGAAGCTCGCCAAAACCCTTATCATACAGCCAAGTTTGACTGCAGACCATGTTAATGCTAGTTTTTTAGACCGGAGTTCTGTTTGGAAGGTGCATGAATTCTGAAATCTTGTGTTGATTTATGTCTGGAAATTTTCAGCGAAATTTTTGGCGTCCAGGAGAAT
GTTTCTAGGGAGAATTTAGTGGATTTTGTGGTTTATTTTCTTAAAAATCGAAAAGAATTGGGAACAGTGTAGCGTATTTGTCTGATCTTTGGATAGAAGACCTTCCGCCGATAAATTGCTTAACGGAGGGAATTTCTGTGGCGAATTTGTGAATACGCGAGGTTTTCCTTTACAGTGTATGCGATCTAATTTCAGAGTCG
GGCCTTCTTAATAATCAGCGGTTTCAAAAATTTGTAGgtaaatttttttcacggtattaaaccttttagatcatagtatttgtgtgaaatttgacaatttcattgacttatcgtcgttttttgcaaagTTTGGTGGATTCCGTC



Intron 4 GTAGGTAAAT ... TTTTGCAAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A149.5556558
A242.4238283
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A445.128234
A545.4512101
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A755.2617210
A857.14340
A943.4813100
A1037.8423146



>TRINITY_DN106910_c2_g1_i2 from sample A4 / Example spliced isoform
TTTCTTAAAAATCGAAAAGAATTGGGAACAGTGTAGCGTATTTGTCTGATCTTTGGATAGAAGACCTTCCGCCGATAAATTGCTTAACGGAGGGAATTTCTGTGGCGAATTTGTGAATACGCGAGGTTTTCCTTTACAGTGTATGCGATCTAATTTCAGAGTCGGGCCTTCTTAATAATCAGCGGTTTCAAAAATTTTTT
GGTGGATTCCGTCAAAAATCGTAGTTTCAGCTGCAGAGTTTGGTAGCTTGGTCAGACATTACGGTTTTCGTCTAGTACGGGGTGACGATTACTTTATTTCTTTGAATCTGAAATTATCGTTATTAGGTTGGATGCTTTCACGGTGAAGGATCTCCTGAGGCTACTAGGGTTTGAAGAAATTGAACACGGCATAGAATACA
TGCTTCTTCCTTTACAATATAAAGGCATTCAGTGGATTACAGGACGTCTCTACAAGTCAAGTCAACTGATTTGAGGGATCACCAGAAAAATAGTTTTGGAGACAGACGTTTATGATCATTACAGTTAATTATATCTCAGGACAGTAAGTTGTGAAAATAAAGCTTTGTTAAAATAATGGGATGCCAATGGAGAAATGCAG
TGAGGTTTCAGCTCATCCAAGAATTTTGTGCCATCTTGCTATTGCATTTAGCTGTTCGCAATTGCTGGTCTCTTAATTCTGAAGGCATGGCAATGCTCGCATTTCGAGGGTGTGTTGATAAGGATCCTTACAATGTCTTCTCAAACTGGAGCCCTTATGATGAAGATCCTTGCAAATGGCGTGGAGTAAGTTGTGTAGAC
GGGAAAGTCATCTCCCTGGAGTTGGTAGATCTTTCTCTTCAAGGAATTCTGGCACCTGAACTTGGGCAGCTTATTCATCTTCAGAAACTTGTCCTTTGCAAGAACAATTTCTCAGGGAGCATTCCAAAAGAACTTGGAGAGTTAGGAAGCCTGGAGCTTTTGAATTTAAGTCATAATGGCTTGATTGGAAAGATTCCTTC
AGATCTGGGAAATATATCAACCCTCAAAAGCCTTCTTCTCACAGACAATAAACTTGAAGGCAGCATTCCACCCGAACTTGGCAATCTTGTCTCTCTTTGTGAGTTACAGCTGGACAGAAATCAATTGTCTGGTTTTATACCAGGTTTTAAACATAGAAATCGAAAGACCATCAACAGTGTCAGCCTATGTGATTTGAAGT
ACCTAAAGAAAGCTGATTTTTCTTTCAACTTTTTTCAAGGAGAAATCCCTGCTTGTCTAGATCACTTGCCATGGTCAAGCTTCCAATGGAATTGTTTCCAATATCAAATATCTCAGCATCACCTTCAGCGAAGATGTGGATTTTCTCCAAAGAAAGCTTTCTCGCGGAATTACTTGTCTTTCTCTATGAAACAACTAAGA
CATGTTTTCATCTGCTTTACGGGTAATGAAGGACTGCATTTGCAACAAACAGATCAGGGAGGAGCAACAGGCAAAGCTAGAATCTTGGCAGAAAATAATGTTAATGTCTCACCTGCAGGTCAAAGTCAAGCACCAACACCTTCACCAACACCTTCACCAAGCCCTTCCTCTCCTCCTTTATTTTCACCCTCACGCTCACC
CTCACCCTCACCCTCACCTGTTTCTTCAATTCCCTCACCCTCACCCTCACCTTTAAGTTCTCCTGCACCTTCCTCTGTGTCTTCTTCTAGACCCTCATTGGTACCTTCACCTTCACAAAATTCTTCTCATCCATCAAAGAAATCAACTGCATGGAAGTATTATATTGCAGTTCCACTAGTGGCATTTTTTCTCATAACTT
CTGTCCTAATCTGTATTTGTCGGAGACGCAATGTGGTGACAATCAGGCCATGGAAAACTGGAATAAGCGGCCAACTACAGAAGGCATTTGTAACAGGTGTTCCTAAACTAAATCCAATAGAGTTAGATGCAGCATGTGAGGAGTTTAGTAATGTCATTGGTACCATGCCTGATAGCATGCTATACAAAGGAACTCTGTCA
AATGGGGTTGAAATTGCTGTAACATCCACCACAATATCATCTGCAAAAGATTGGTCGGAGCATTCAGAACTTTATTTTAGGAAGAAGATTGAAGTCCTTTGTCGGATTAACCACAAAAACTTTGTTAATCTTCTTGGCTTCTGTGAGGAGGAGGAGCCATTCAGAAGAATGATGGTTTTTGAATATGCTCCAAATGGGAC
ACTATTTGAACATCTTCACAATAAAGGAGCTGAACATCTGGACTGGGCTGCTCGGATGAGAATTATAATGGGAATAGCATACTGTCTTCAACATATGCATCATGATATGGAGCCCCCGGTTACTCATCTTAATTTACACTCTAAAGCAGTCTATTTGACAGATGATTATGCAGCAAAGCTATCAGATCCTGATGTGTGGA
AAGAAGCTGCTGTTAAAAGCAATAAAATGAAGTCATTCAGCTATAGCCACTTGCTGGAAGTTGAAAACAATGTATATTGCTTTGGACTACTCTTGCTTGAAATCATTTCGGGAAAGCTCCCCTATGCCCAAGAGCAAGGCATGCTTATTGAATGGGCCATGGGATACCTTGACAAGAAGGACATGATACAGTATATGGTA
GATCCTTCCTTGAAATCTTTCAAATACAGTGAATTAGAAAAAATATGTGAGGTTGTACAATCATGCATTCATCCATATCCTCAACAGAGGCCATCAATGCGGGATATTACTTCAGAATTCAGAAAGGCTCTATCAATCTCACCAGAGGCAGCATATCCAAAATTGTCGCCATTGTGGTGGGCAGAACTTGAAATCCTCTC
ACAAGATGGCAGCTAATTAAATTTGTCGAACAATACTCCTATAGTTGCAACACTATAGGTGTATGTAGTGTGCCTGATAGCTGTAAAGATTGATTTTTGGTGGCTTTTGGTGTTTTCTCACTGTTTTCTCCCTATCCAATTGCTTAGGATTCAGGACATGCTTCTTTAATTTGGAAGAGGTAAGGGGTAAGCCTTCATCT
GAATTATTAGGCTGTATAGTAATATCTTGCCCATTTACATGCTGATTGTTTGAGTTGCTTCAAATTCAGAATAGTGTACCAAGGGTTCTCTTTGTTTTCACAGCTTATGTTGCTTTGTATTCATATTCTTTCTGCAATCATCTCCATTACTATGATTGAGGTATTGCCTCAGTGGAGTTGAGAGCCATTAATACATAATT
GTGC


>TRINITY_DN106910_c2_g1_i3 from sample A4 / Example unspliced isoform:
TTTCTTAAAAATCGAAAAGAATTGGGAACAGTGTAGCGTATTTGTCTGATCTTTGGATAGAAGACCTTCCGCCGATAAATTGCTTAACGGAGGGAATTTCTGTGGCGAATTTGTGAATACGCGAGGTTTTCCTTTACAGTGTATGCGATCTAATTTCAGAGTCGGGCCTTCTTAATAATCAGCGGTTTCAAAAATTTgta
ggtaaatttttttcacggtattaaaccttttagatcatagtatttgtgtgaaatttgacaatttcattgacttatcgtcgttttttgcaaagTTTGGTGGATTCCGTCAAAAATCGTAGTTTCAGCTGCAGAGTTTGGTAGCTTGGTCAGACATTACGGTTTTCGTCTAGTACGGGGTGACGATTACTTTATTTCTTTGA
ATCTGAAATTATCGTTATTAGGTTGGATGCTTTCACGGTGAAGGATCTCCTGAGGCTACTAGGGTTTGAAGAAATTGAACACGGCATAGAATACATGCTTCTTCCTTTACAATATAAAGGCATTCAGTGGATTACAGGACGTCTCTACAAGTCAAGTCAACTGATTTGAGGGATCACCAGAAAAATAGTTTTGGAGACAG
ACGTTTATGATCATTACAGTTAATTATATCTCAGGACAGTAAGTTGTGAAAATAAAGCTTTGTTAAAATAATGGGATGCCAATGGAGAAATGCAGTGAGGTTTCAGCTCATCCAAGAATTTTGTGCCATCTTGCTATTGCATTTAGCTGTTCGCAATTGCTGGTCTCTTAATTCTGAAGG



Intron 5 GTAAATTTTT ... TCGTTATTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A722.45762123
A819.051744
A919.75631021
A1018.78801423



>TRINITY_DN106910_c2_g1_i6 from sample A4 / Example spliced isoform
TTTCTTAAAAATCGAAAAGAATTGGGAACAGTGTAGCGTATTTGTCTGATCTTTGGATAGAAGACCTTCCGCCGATAAATTGCTTAACGGAGGGAATTTCTGTGGCGAATTTGTGAATACGCGAGGTTTTCCTTTACAGTGTATGCGATCTAATTTCAGAGTCGGGCCTTCTTAATAATCAGCGGTTTCAAAAATTTGTA
GGTTGGATGCTTTCACGGTGAAGGATCTCCTGAGGCTACTAGGGTTTGAAGAAATTGAACACGGCATAGAATACATGCTTCTTCCTTTACAATATAAAGGCATTCAGTGGATTACAGGACGTCTCTACAAGTCAAGTCAACTGATTTGAGGGATCACCAGAAAAATAGTTTTGGAGACAGACGTTTATGATCATTACAGT
TAATTATATCTCAGGACAGTAAGTTGTGAAAATAAAGCTTTGTTAAAATAATGGGATGCCAATGGAGAAATGCAGTGAGGTTTCAGCTCATCCAAGAATTTTGTGCCATCTTGCTATTGCATTTAGCTGTTCGCAATTGCTGGTCTCTTAATTCTGAAGGCATGGCAATGCTCGCATTTCGAGGGTGTGTTGATAAGGAT
CCTTACAATGTCTTCTCAAACTGGAGCCCTTATGATGAAGATCCTTGCAAATGGCGTGGAGTAAGTTGTGTAGACGGGAAAGTCATCTCCCTGGAGTTGGTAGATCTTTCTCTTCAAGGAATTCTGGCACCTGAACTTGGGCAGCTTATTCATCTTCAGAAACTTGTCCTTTGCAAGAACAATTTCTCAGGGAGCATTCC
AAAAGAACTTGGAGAGTTAGGAAGCCTGGAGCTTTTGAATTTAAGTCATAATGGCTTGATTGGAAAGATTCCTTCAGATCTGGGAAATATATCAACCCTCAAAAGCCTTCTTCTCACAGACAATAAACTTGAAGGCAGCATTCCACCCGAACTTGGCAATCTTGTCTCTCTTTGTGAGTTACAGCTGGACAGAAATCAAT
TGTCTGGTTTTATACCAGGTTTTAAACATAGAAATCGAAAGACCATCAACAGTGTCAGCCTATGTGATTTGAAGTACCTAAAGAAAGCTGATTTTTCTTTCAACTTTTTTCAAGGAGAAATCCCTGCTTGTCTAGATCACTTGCCATGGTCAAGCTTCCAATGGAATTGTTTCCAATATCAAATATCTCAGCATCACCTT
CAGCGAAGATGTGGATTTTCTCCAAAGAAAGCTTTCTCGCGGAATTACTTGTCTTTCTCTATGAAACAACTAAGACATGTTTTCATCTGCTTTACGGGTAATGAAGGACTGCATTTGCAACAAACAGATCAGGGAGGAGCAACAGGCAAAGCTAGAATCTTGGCAGAAAATAATGTTAATGTCTCACCTGCAGGTCAAAG
TCAAGCACCAACACCTTCACCAACACCTTCACCAAGCCCTTCCTCTCCTCCTTTATTTTCACCCTCACGCTCACCCTCACCCTCACCCTCACCTGTTTCTTCAATTCCCTCACCCTCACCCTCACCTTTAAGTTCTCCTGCACCTTCCTCTGTGTCTTCTTCTAGACCCTCATTGGTACCTTCACCTTCACAAAATTCTT
CTCATCCATCAAAGAAATCAACTGCATGGAAGTATTATATTGCAGTTCCACTAGTGGCATTTTTTCTCATAACTTCTGTCCTAATCTGTATTTGTCGGAGACGCAATGTGGTGACAATCAGGCCATGGAAAACTGGAATAAGCGGCCAACTACAGAAGGCATTTGTAACAGGTGTTCCTAAACTAAATCCAATAGAGTTA
GATGCAGCATGTGAGGAGTTTAGTAATGTCATTGGTACCATGCCTGATAGCATGCTATACAAAGGAACTCTGTCAAATGGGGTTGAAATTGCTGTAACATCCACCACAATATCATCTGCAAAAGATTGGTCGGAGCATTCAGAACTTTATTTTAGGAAGAAGATTGAAGTCCTTTGTCGGATTAACCACAAAAACTTTGT
TAATCTTCTTGGCTTCTGTGAGGAGGAGGAGCCATTCAGAAGAATGATGGTTTTTGAATATGCTCCAAATGGGACACTATTTGAACATCTTCACAATAAAGGAGCTGAACATCTGGACTGGGCTGCTCGGATGAGAATTATAATGGGAATAGCATACTGTCTTCAACATATGCATCATGATATGGAGCCCCCGGTTACTC
ATCTTAATTTACACTCTAAAGCAGTCTATTTGACAGATGATTATGCAGCAAAGCTATCAGATCCTGATGTGTGGAAAGAAGCTGCTGTTAAAAGCAATAAAATGAAGTCATTCAGCTATAGCCACTTGCTGGAAGTTGAAAACAATGTATATTGCTTTGGACTACTCTTGCTTGAAATCATTTCGGGAAAGCTCCCCTAT
GCCCAAGAGCAAGGCATGCTTATTGAATGGGCCATGGGATACCTTGACAAGAAGGACATGATACAGTATATGGTAGATCCTTCCTTGAAATCTTTCAAATACAGTGAATTAGAAAAAATATGTGAGGTTGTACAATCATGCATTCATCCATATCCTCAACAGAGGCCATCAATGCGGGATATTACTTCAGAATTCAGAAA
GGCTCTATCAATCTCACCAGAGGCAGCATATCCAAAATTGTCGCCATTGTGGTGGGCAGAACTTGAAATCCTCTCACAAGATGGCAGCTAATTAAATTTGTCGAACAATACTCCTATAGTTGCAACACTATAGGTGTATGTAGTGTGCCTGATAGCTGTAAAGATTGATTTTTGGTGGCTTTTGGTGTTTTCTCACTGTT
TTCTCCCTATCCAATTGCTTAGGATTCAGGACATGCTTCTTTAATTTGGAAGAGGTAAGGGGTAAGCCTTCATCTGAATTATTAGGCTGTATAGTAATATCTTGCCCATTTACATGCTGATTGTTTGAGTTGCTTCAAATTCAGAATAGTGTACCAAGGGTTCTCTTTGTTTTCACAGCTTATGTTGCTTTGTATTCATA
TTCTTTCTGCAATCATCTCCATTACTATGATTGAGGTATTGCCTCAGTGGAGTTGAGAGCCATTAATACATAATTGTGC


>TRINITY_DN106910_c2_g1_i3 from sample A4 / Example unspliced isoform:
TTTCTTAAAAATCGAAAAGAATTGGGAACAGTGTAGCGTATTTGTCTGATCTTTGGATAGAAGACCTTCCGCCGATAAATTGCTTAACGGAGGGAATTTCTGTGGCGAATTTGTGAATACGCGAGGTTTTCCTTTACAGTGTATGCGATCTAATTTCAGAGTCGGGCCTTCTTAATAATCAGCGGTTTCAAAAATTTGTA
Ggtaaatttttttcacggtattaaaccttttagatcatagtatttgtgtgaaatttgacaatttcattgacttatcgtcgttttttgcaaagtttggtggattccgtcaaaaatcgtagtttcagctgcagagtttggtagcttggtcagacattacggttttcgtctagtacggggtgacgattactttatttctttga
atctgaaattatcgttattagGTTGGATGCTTTCACGGTGAAGGATCTCCTGAGGCTACTAGGGTTTGAAGAAATTGAACACGGCATAGAATACATGCTTCTTCCTTTACAATATAAAGGCATTCAGTGGATTACAGGACGTCTCTACAAGTCAAGTCAACTGATTTGAGGGATCACCAGAAAAATAGTTTTGGAGACAG
ACGTTTATGATCATTACAGTTAATTATATCTCAGGACAGTAAGTTGTGAAAATAAAGCTTTGTTAAAATAATGGGATGCCAATGGAGAAATGCAGTGAGGTTTCAGCTCATCCAAGAATTTTGTGCCATCTTGCTATTGCATTTAGCTGTTCGCAATTGCTGGTCTCTTAATTCTGAAGG



Intron 6 GTATACTAGG ... CTTTGCCTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A151.11111112
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A9100010
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>TRINITY_DN116531_c0_g1_i7 from sample A3 / Example spliced isoform
TCAAGCCCCACATCCGATGTCAGCCTTGCTCAGGCCAAGTTGTCCGCTAAATCCCAAAGTAAGAGCTGAAAGGAATGGATGACCTCAATTGGGCGATCTGTTTGTTTCCAACACGCGGGAGGTTGAATCAAAGCGAGTCACTCTACCTCAGATGATACATGCCGCACATCTACAAAAGGCAAAACCCCACCTTGAGTCTC
CTTCAAGGCTTCTACACCTTTTCCTCATATAACTCCCAGCTCGAATCGTGGGACTCACACGATGATTAAAAATGGCATTCCCCAGATTCCGAGGGCACAAGCAAAGCGAGGTCAATGAATAATAAACAATAACATGGCATAGCATCATCAAAATGAAGGAGGAAGAGGAAGGATTGCAAACCGATAGAGACTCGGCTTAC
GCGTCTAATTGACGGCGTCAGCCTCCGTCATCCGCCGGCAGGCAGGCCGTCCACCGGGCTAAATGGAGTAACGGTGTAAAAAAGCATAGCCAACAGGATGGAGAATGAAAAACAATGAAGAAAATTGCAAAAGTGCGGCGATTCCTTCAAACTCATACATGGCGCTTCTGCTTGGAAGCTCGCCAAAACCCTTATCATAC
AGCCAAGTTTGACTGCAGACCATGTTAATGCTAGTTTTTTAGACCGGAGTTCTGTTTGGAAGGTGCATGAATTCTGAAATCTTGTGTTGATTTATGTCTGGAAATTTTCAGCGAAATTTTTGGCGTCCAGGAGAATGTTTCTAGGGAGAATTTAGTGGATTTTGTGGTTTATTTTCTTAAAAATCGAAAAGAATTGGGAA
CAGTGTAGCGTATTTGTCTGATCTTTGGATAGAAGACCTTCCGCCGATAAATTGCTTAACGGAGGGAATTTCTGTGGCGAATTTGTGAATACGCGAGGTTTTCCTTTACAGTGTATGCGATCTAATTTCAGAGTCGGGCCTTCTTAATAATCAGCGGTTTCAAAAATTTGTAGTTTGGTGGATTCCGTCAAAAATCGTAG
TTTCAGCTGCAGAGTTTGGTAGCTTGGTCAGACATTACGGTTTTCGTCTAGTACGGGGTGACGATTACTTTATTTCTTTGAATCTGAAATTATCGTTATTAGGCAATGCGTCTCACGGATTTAGAATCTTATTTCTCTGTTTAGCGTTTTTTGTTGGATGCTTTCACGGTGAAGGATCTCCTGAGGCTACTAGGGTTTGA
AGAAATTGAACACGGCATAGAATACATGCTTCTTCCTTTACAATATAAAGGCATTCAGTGGATTACAGGACGTCTCTACAAGTCAAGTCAACTGATTTGAGGGATCACCAGAAAAATAGTTTTGGAGACAGACGTTTATGATCATTACAGTTAATTATATCTCAGGACAGTAAGTTGTGAAAATAAAGCTTTGTTAAAAT
AATGGGATGCCAATGGAGAAATGCAGTGAGGTTTCAGCTCATCCAAGAATTTTGTGCCATCTTGCTATTGCATTTAGCTGTTCGCAATTGCTGGTCTCTTAATTCTGAAGG


>TRINITY_DN116531_c0_g1_i8 from sample A3 / Example unspliced isoform:
ATAATCAGCGGTTTCAAAAATTTTTTGGTGGATTCCGTCAAAAATCGTAGTTTCAGCTGCAGAGTTTGGTAGCTTGGTCAGACATTACGGTTTTCGTCTAGTACGGGGTGACGATTACTTTATTTCTTTGAATCTGAAATTATCGTTATTAGgtatactaggtttcccccgcgtttaactattttcgagatgttatagct
gacattgatctttattatgttgatttggccttgattctggtgtctttgcctagGCAATGCGTCTCACGGATTTAGAATCTTATTTCTCTGTTTAGCGTTTTTTGTAAGTTCCTCGACTCCGCGCATTTCTTCGCAATCTTTAGTATATTTTCTCAGATATTACAGTGCTTGCCTTTGGCTGCTCGGTATTGGTATTTTTT
CCGCCGAC