sp|Q10MH8|RH24_ORYSJ ----> DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 24
Intron 1 GTAAGTATCT ... CTATTGTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 72.27 | 8.5 | 20 | 6 |
| A2 | 51.37 | 5.5 | 6.3 | 11.3 |
| A3 | 86.07 | 5.5 | 32.3 | 0 |
| A4 | 74.27 | 5 | 14.3 | 4.7 |
| A5 | 91.32 | 1.5 | 14.3 | 0 |
| A6 | 77.43 | 22 | 77 | 5.3 |
| A7 | 82.7 | 16.5 | 77.3 | 2.7 |
| A8 | 77.89 | 33.5 | 115.7 | 4.7 |
| A9 | 82.77 | 14 | 67 | 5 |
| A10 | 82.53 | 14 | 64.7 | 1.3 |
>TRINITY_DN43889_c1_g1_i8 from sample A9 / Example spliced isoformCTTACGTATCGCCGCCGGACAAATTTCCTGGATGAAATTTGTCGTTCCTGTATATTGGATTACGGAGTTGGACTCGTTGCCATTGAAACCGTGCCAGATTTTTGGTTCAGATGGTATATATAAGCTAGGGTTTTCTGTCTTCAGAGAAATCTGAAGAATGTACTTGAAGAATTTCAGGGCTTTGGGTTTTTAAGAGAATT
TTGAAGAATTTATGGGAAGGATCCGAGGGCTTTGGTTTTTTTTCAGAGAAATCTGAATAGCCTATTGGAAGAGGTTGAGATTTTTTTGCGGATTTTGTTTTCGGAAAAAACCCTCAAAATGTCGAAGCGAAAGTTCGGCTTCGAGGGCTTCGGCATAAACAAGCAGACCAGTTACAACTTCGAGCCCGCGAAGGCTCCCC
GTCGCGGACTCTACATCCCCAGTCACGACAACTGCGAAGATCACGACCTCGATGACATCGATTACGCAGATTCAAAAGAACCCCTGGTCGAGGGTTCGAACCTCTCGGAGCCCTCTGACAACAAGAACAACGGAGAAGAAGAGGAAATTGACCCCCTGGATGCCTTCATGGCGGGTATTCAGGAGGAAATGAACAGCGTC
CCGGCTAAGCCCAAGGCTAAGATGGAGAAATTTGAGGACGATGAAGATGATCCCGTGGAGAGCTTTCTCAAGGCTCGCAAGGACGCAGGATTGGCCCTGGCGGCTGAAGCCCTTCAGGCCGGTTATGACTCTGACCAGGAGGTTTATGCCGCTGCCAAGGCCGTGGACGCCGGGCTGCTCGAGTACGATTCCGATGATAA
CCCCATTGTTCTTGACAAGAAGAAGATCGAGCCTATTCCGGCGCTGGATCATTCGGAGATCGATTATGAGCCGTTTAACAAGGATTTTTACGAGGAAAACCCTTCAATATCTGGTATGAGCGATCAGGAAGTTACGGCATACCAGCAGAGTCTTGGAATCAAGGTTTCTGGATTTGATGTAACAAGGCCAATTAAGACAT
TTGAAGATTGTGGCTTTTCCTCTACATTGATGAATGCCATTGTTAAACAGGGTTATGTGAACCCAACCCCTATACAGTGCCAGGCTCTGCCAATTGTACTATCTGGAGGGGATATTATAGGAATAGCCAAGACTGGTTCAGGAAAAACTGTTGCATTTATTCTGCCAATGATTGTGCATATAATGGATCAGCCAGAACTT
GACAAAGAAGAAGGCCCAATTGGTGTTATTTGTGCACCTACAAGAGAATTGGCTCAGCAAATCTATATTGAGGCAAAGAAATTCGCGAAACCTCATGGCATCCGTGTTTCTGGTGTTTATGGAGGCATGTCAAAGCTAGAACAGCTAAAAGAACTGAAGGCTGGTTGTGAGCTAGTGGTTGCTACCCCAGGAAGGTTGAT
TGACATGCTGAAGATGAAGGCGTTAACAATGCATAGAACAACTTACCTAGTGCTTGATGAGGCAGATAGGATGTTTGATCTGGGGTTTGAGCCTCAAATCAGATCTATTGTGGGTCAGATACGGCCAGATCGCCAGACACTGCTCTTTTCTGCAACTATGCCAAGGAGAGTGGAACGCTTGGCAAGAGAAGTTCTGTCAA
ATCCTGTAAGGGTAACTGTAGGGGAAATAGGAAAGGCAAATGAGGACATCACACAAATTGTCCATGTTATCCCTTCAGATGCAGAGAAAATGCCTTGGCTTCTGAGCAAACTTCCTGCAATGGTTGATAATGGAGATGTTCTAGTTTTTGCTTCGACCAAAGCAAAGGTTGTTGAGATTGAACCTCAGCTGATCCAAGAC
GGGTTCAAAGTTGCAACCCTTCATGGAGATAAGGATCAGTCTTCTCGTATGGAGGTTCTACAAAAGTTTAAGTCAGGGATTTACCATGTTCTTGTTGCAACTGATGTTGCAGCTCGTGGTCTTGATATCAAGTCAATTAAATCTGTTGTTAACTTTGATATTGCCAGAGACATAGATATGCATGTTCACCGTATTGGAAG
GACAGGGCGTGCAGGGGACAAAGAAGGCATAGCTTACACCCTTGTTACACAAAAACAAGCACACTTTGCAGGGGAACTAGTGAACAGTTTGGTTGCTGCTGGTCAAAATGTCTCCATGGAGCTAATGGATCTTGCAATGAAGGATAGTCGTTTCCGGGCCAAACGGGAGGCCAGTAAAGGCTCTGGTAAGAGGAAAGGGG
GCGGGCGAGGAGGGGGGGGAAAGGGTGGCAGTGGTAGCAGTGGTGGTGGAGGTCGAAGTATACGTGGTGTCGATTATGGGCTTGGCATAGGCTATAATCCCGATTCCTCAAACAGACCAGTGCAACCTTCCAATCTTAATCGAGGAGCAGCAGTGAATGCTCTGAAGACGGGAATGATGGCACAATTCAAAAGTAATTTT
GTTCCTGCATCATCTAATTCTTATGCATCAAGCACTAGCCAGTCATCCAGTATTCTAAGCAATAAAAGGCAAGGGATTAGTGGCTTTGTGTCGGGTGGTACGATTGGTGGTTATGCATTGAATGAACAAGGAAGTGGAAATAGGTCTCAACAGGCTGACAATTTGGCCTCAGTGTCAGCTAGTGACACAGAGAGAGAAAG
AGGAAGGGGAGGTGAAAGGGAGAGACAGCAGTCAAGATGGGATCCTGATCATTTGAATGATTCACATAATCAGAGAGTATCCCAGGAATCCAAGACAAATGGGAATCCAAGCTCTGAAAGGTAAGGGTAGTTTCTGGTTGTATGTTGAATAGTTTACTACATTTGGAGGCAATGTTTTGATTTTTAATTTTACCTTAGTG
ACTGACCATGGTGGATATCTATCATCGTATTTTTGTCATGCTTCCATAGTTTGGGAGCAAATTTTAATTTATAATTGACTGCTGTTTGTTATAGATTTGCTGTTTCATTGTATTCTGAATTCTGATAGTGTTGTCTACAGTGTCAAGAACAGGCCAAGGGAACGAAGGCGACCATCTGGTTGGGATCGTTGATTTTTCCT
TTTATTTATTGAACATGATTTTCTGCCATTCTTGTTTTTGCTGGGCTTTGTACAAGGTAAACATATAAATTCCTAATGCAAACTTAACTTCAATGGATATTGTTGTGTCTGTTTTCAAATCCCATAAATACTGTGTTTCACATGCTTTTAATTTCAGGTTCAATACTCAACTCCTCAAGTAGTTTCCAGTAAAAGTATAT
TGGGAAAGAAGTTCGCATTGCAAGAGTTGGATGCTATTTGATGGATGGTAATTGTACGGAAGGTTGAGATAACATCACCAAGTGTTACGCAACTCTGTTCTTTTATTTGCAGTTAACTTCCATTTTGATGCTTGTATTTTCTTTTTCCAATCCCTTGCCATTTCTCTTGTTTCCTATCTAACATGATTTTGCAAAAAACT
CAATCTATGCTTCATCGTGAATGGACAGTGGACCTTACTCCACACCCGTTAAAATTGCTTACTCTGATAAGTAAAGGAATCAATAATCATAATGTTAAAATTGCATACTCTGATAAGTAAAGGAATCAATAATCATAATGTGCAATGTTAGTTCCTC
>TRINITY_DN43889_c1_g1_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:AGCTAATGGATCTTGCAATGAAGATTTGTCAAAAAAGTTCACTGAGAACTTTTTGTCTGGTGACAAAAATATGCAATTCACATTTCTCACCTGGATTTGTACTGCAACATTGTAGGATAGTCGTTTCCGGGCCAAACGGGAGGCCAGTAAAGGCTCTGGTAAGAGGAAAGGGGGCGGGCGAGGAGGGGGGGGAAAGGGTG
GCAGTGGTAGCAGTGGTGGTGGAGGTCGAAGTATACGTGGTGTCGATTATGGGCTTGGCATAGGCTATAATCCCGATTCCTCAAACAGACCAGTGCAACCTTCCAATCTTAATCGAGGAGCAGCAGTGAATGCTCTGAAGACGGGAATGATGGCACAATTCAAAAGTAATTTTGTTCCTGCATCATCTAATTCTTATGCA
TCAAGCACTAGCCAGTCATCCAGTATTCTAAGCAATAAAAGGCAAGGGATTAGTGGCTTTGTGTCGGGTGGTACGATTGGTGGTTATGCATTGAATGAACAAGGAAGTGGAAATAGGTCTCAACAGGCTGACAATTTGGCCTCAGTGTCAGCTAGTGACACAGAGAGAGAAAGAGGAAGGGGAGGTGAAAGGGAGAGACA
GCAGTCAAGATGGGATCCTGATCATTTGAATGATTCACATAATCAGAGAGTATCCCAGGAATCCAAGACAAATGGGAATCCAAGCTCTGAAAGTGTCAAGAACAGGCCAAGGGAACGAAGGCGACCATCTGGTTGGGATCGTTGATTTTTCCTTTTATTTATTGAACATGATTTTCTGCCATTCTTGTTTTTGCTGGGCT
TTGTACAAGGTAAACATATAAATTCCTAATGCAAACTTAACTTCAATGGATATTGTTGTGTCTGTTTTCAAATCCCATAAATACTGTGTTTCACATGCTTTTAATTTCAGGTTCAATACTCAACTCCTCAAGTAGTTTCCAGTAAAAGTATgtaagtatctattacagggaaaatatgcaaatgcagtgctgttataatc
aaaattcttatttttagaatgcagaggttgccttgaaagactgattttgtttgactgtcatgtcgtggtgtgtatacacatcttctctttaggtgtatgcttgtccttatatttcttaattctggaaagcatttcaattccttgattgcattagatttaggccagaatattttattcggggcaaccatgcaagtttttat
gttttgagcttgcaggcaagtgtcctatggttgtatcatccagtaatgcatgtgctctatactcgctcatgcagctgacacttcaatacacattcatttctcgcttatgcagagtctgatggcacttgaaattatttaaatgacatctgaaaatgtcttgtgcactccttgaggtgtacactgcagatccatcgttagta
atgatccatcgttagtaatgttacataacaaaaataatgattaccagaactgattacatatgaagtaatggcatatgaagatttgctatcgcatctccctttgtagattcaatttgaaattcatctttttaatgaacattttcaagtgcaagtttgaaacatttatggtagcatttcaatccattttctcaagaccctct
caaacattatgaaactactttgcctagatgtatatgtaaatcctgtgcttgttagtccaaacttgatattttagacaatacacgtttgcatgtaaagactatactgggtaagtgccctctacttgtttcaaaggtattattggtatgcttgattaggatgtgatgctttactggttgtttaatcagcaaacatcatttta
agttaccgagctgttagccatgcatatgaagcttcaagataggaactagagtttcctctgatgtattctacttttatgccagaaactgtactcttaatttcccgtcttcttcacctcataataactagaaagaggaggcatagcatgaataaatgaccaggaactattttttttggcagtgttatgaagctatgtgataa
tacactaagatatcatgtatgacagttttttatggtctttctacaacatgatatttatcctgtagcatttcaattagtaactttgatccattggactattgtcagATTGGGAAAGAAGTTCGCATTGCAAGAGTTGGATGCTATTTGATGGAT
Intron 2 GTAAACATAT ... TTAATTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 44.31 | 20.3 | 16 | 16.8 |
| A2 | 68.33 | 10.8 | 22.6 | 9 |
| A3 | 43.67 | 31.4 | 24 | 5 |
| A4 | 61.79 | 5.1 | 7 | 11.9 |
| A5 | 33.6 | 15.4 | 7.2 | 14.5 |
| A6 | 38.45 | 96.7 | 57.6 | 34.8 |
| A7 | 42.93 | 129.8 | 95.6 | 47.2 |
| A8 | 43.18 | 133.9 | 98.6 | 69.4 |
| A9 | 45.38 | 74.7 | 60.6 | 31 |
| A10 | 47.18 | 67.3 | 57.6 | 42.8 |
>TRINITY_DN115926_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoformGGGCGGGCGAGGAGGGGGGGGAAAGGGTGGCAGTGGTAGCAGTGGTGGTGGAGGTCGAAGTATACGTGGTGTCGATTATGGGCTTGGCATAGGCTATAATCCCGATTCCTCAAACAGACCAGTGCAGCCTTCCAATCTTAATCGAGGAGCAGCAGTGAATGCTCTGAAGACGGGAATGATGGCACAATTCAAAAGTAATT
TTGTTCCTGCATCATCTAATTCTTATGCATCAAGCACTAGCCAGTCATCCAGTATTCTAAGCAATAAAAGGCAAGGGATTAGTGGCTTTGTGTCGGGTGGTACGATTGGTGGTTATGCATTGAATGAACAAGGAAGTGGAAATAGGTCTCAACAGGCTGACAATTTGGCCTCAGTGTCAGCTAGTGACACAGAGAGAGAA
AGAGGAAGGGGAGGTGAAAGGGAGAGACAGCAGTCAAGATGGGATCCTGATCATTTGAATGATTCACATAATCAGAGAGTATCCCAGGAATCCAAGACAAATGGGAATCCAAGCTCTGAAAGTGTCAAGAACAGGCCAAGGGAACGAAGGCGACCATCTGGTTGGGATCGTTGATTTTTCCTTTTATTTATTGAACATGA
TTTTCTGCCATTCTTGTTTTTGCTGGGCTTTGTACAAGGTTCAATACTCAACTCCTCAAGTAGTTTCCAGTAAAAGTATGTAAGTATCTATTACAGGGAAAATATGCAAATGCAGTGCTGTTATACTCAAAATTCTTATTTTTAGAATGCAGAGGTTGCCTTGAAAGACTGATTTTGTTTGACTGTCATGTCGTGGTGTG
TATACACATCTTCTCTTTAGGTTTATGCTTGTCCTTATATTTCTTAATTCTGGAAAGCATTTCAATTCCTTGATTGCATTAGATTTAGGCCAGAATATTTTATTCGGGGCAACCATGCAAGTTTTTATGTTTTGAGCTTGCAGGCAAGTGTCCTATGGTTGTATCATCCAGTAATGCATGTGCTCTATACTCGCTCATGC
AGCTGACACTTCAATACACATTCATTTCTCGCTTATGCAGAGTCTGATGACACTTGAAATTATTTAAATGACATCTGAAAATGTCTTGTGCACTCCTTGAGGTGTACACTGCAGATCCATCGTTAGTAATGATCCATCGTTAGTAATGTTACATAACAAAAATAATGATTACCAGAACTGATTACATATGAAGTAATGGC
ATATGAAGATTTGCTATCGCATCTCCCTTTGTAGATTCAATTTGAAATTCATCTTTTTAATGAACATTTTCAAGTGCAAGTTTGAAACATTTATGGTAGCATTTCAATCCATTTTCTCAAGACCCTCTCAAACATTATGAAACTACTTTGCCTAGATGTATATGTAAATCCTGTGCTTGTTAGTCCAAACTTGATATTTT
AGACAATACACGTTTGCATGTAAAGACTATACTGGGTAAGTGCCCTCTACTTGTTTCAAAGGTATTATTGGTATGCTTGATTAGGATGTGATGCTTTACTGGTTGTTTAATCAGCAAACATCATTTTAAGTTACCGAGCTGTTAGCCATGCATATGAAGCTTCAAGACAGGAACTAGAGTTTCCTCTGATGTATTCTACT
TTTATGCCAGAAACTGTACTCTTAATTTCCCGTCTTCTTCACCTCATAATAACTAGAAAGAGGAGGCATAGCATGAATAAATGACCAGGAACTATGTTTTTTTGGCAGTGTTATGAAGCTATGTGATAATACACTAAGATATCATGTATGACAGTTTTTTATGGTCTTTCTACAACATGATATTTATCCTGTAGCATTTC
AATTAGTAACTTTGATCCATTGGACTATTGTCAGATTGGGAAAGAAGTTCGCATTGCAAGAGTTGGATGCTATTTGATGGATGGTAATTGTACGGAAGGTTGAGATAACATCACCAAGTGTTATGCAACTCTGTTCTTTTATTTGCAGTTAACTTCCATTTTGATGCTTGTATTTTCTTTTTCCAATCCCTTGCCATTTC
TCTTGTTTCCTATCTAACATGATTTTGCAAAAAACTCAATCTATGCTTCATCGTGAATGGACAGTGGACCTTACTCCACACCCGTTAAAATTGCTTACTCTGATAAGTAAAGGAATCAATAATCATAATGTTAAAATTGCATACTCTGATAAGTAAAGGAATCAATAATCATAATGTTAAAATTGCATACTCTGATAAGT
AAAGGAATCA
>TRINITY_DN115926_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:GGGCGGGCGAGGAGGGGGGGGAAAGGGTGGCAGTGGTAGCAGTGGTGGTGGAGGTCGAAGTATACGTGGTGTCGATTATGGGCTTGGCATAGGCTATAATCCCGATTCCTCAAACAGACCAGTGCAGCCTTCCAATCTTAATCGAGGAGCAGCAGTGAATGCTCTGAAGACGGGAATGATGGCACAATTCAAAAGTAATT
TTGTTCCTGCATCATCTAATTCTTATGCATCAAGCACTAGCCAGTCATCCAGTATTCTAAGCAATAAAAGGCAAGGGATTAGTGGCTTTGTGTCGGGTGGTACGATTGGTGGTTATGCATTGAATGAACAAGGAAGTGGAAATAGGTCTCAACAGGCTGACAATTTGGCCTCAGTGTCAGCTAGTGACACAGAGAGAGAA
AGAGGAAGGGGAGGTGAAAGGGAGAGACAGCAGTCAAGATGGGATCCTGATCATTTGAATGATTCACATAATCAGAGAGTATCCCAGGAATCCAAGACAAATGGGAATCCAAGCTCTGAAAGTGTCAAGAACAGGCCAAGGGAACGAAGGCGACCATCTGGTTGGGATCGTTGATTTTTCCTTTTATTTATTGAACATGA
TTTTCTGCCATTCTTGTTTTTGCTGGGCTTTGTACAAGgtaaacatataaattcctaatacaaatttaacttcaatggatattgttgtgtctgttttcaaatcccataaatactgtgtttcacatgcttttaatttcagGTTCAATACTCAACTCCTCAAGTAGTTTCCAGTAAAAGTATGTAAGTATCTATTACAGGGA
AAATATGCAAATGCAGTGCTGTTATACTCAAAATTCTTATTTTTAGAATGCAGAGGTTGCCTTGAAAGACTGATTTTGTTTGACTGTCATGTCGTGGTGTGTATACACATCTTCTCTTTAGGTTTATGCTTGTCCTTATATTTCTTAATTCTGGAAAGCATTTCAATTCCTTGATTGCATTAGATTTAGGCCAGAATATT
TTATTCGGGGCAACCATGCAAGTTTTTATGTTTTGAGCTTGCAGGCAAGTGTCCTATGGTTGTATCATCCAGTAATGCATGTGCTCTATACTCGCTCATGCAGCTGACACTTCAATACACATTCATTTCTCGCTTATGCAGAGTCTGATGACACTTGAAATTATTTAAATGACATCTGAAAATGTCTTGTGCACTCCTTG
AGGTGTACACTGCAGATCCATCGTTAGTAATGATCCATCGTTAGTAATGTTACATAACAAAAATAATGATTACCAGAACTGATTACATATGAAGTAATGGCATATGAAGATTTGCTATCGCATCTCCCTTTGTAGATTCAATTTGAAATTCATCTTTTTAATGAACATTTTCAAGTGCAAGTTTGAAACATTTATGGTAG
CATTTCAATCCATTTTCTCAAGACCCTCTCAAACATTATGAAACTACTTTGCCTAGATGTATATGTAAATCCTGTGCTTGTTAGTCCAAACTTGATATTTTAGACAATACACGTTTGCATGTAAAGACTATACTGGGTAAGTGCCCTCTACTTGTTTCAAAGGTATTATTGGTATGCTTGATTAGGATGTGATGCTTTAC
TGGTTGTTTAATCAGCAAACATCATTTTAAGTTACCGAGCTGTTAGCCATGCATATGAAGCTTCAAGACAGGAACTAGAGTTTCCTCTGATGTATTCTACTTTTATGCCAGAAACTGTACTCTTAATTTCCCGTCTTCTTCACCTCATAATAACTAGAAAGAGGAGGCATAGCATGAATAAATGACCAGGAACTATGTTT
TTTTGGCAGTGTTATGAAGCTATGTGATAATACACTAAGATATCATGTATGACAGTTTTTTATGGTCTTTCTACAACATGATATTTATCCTGTAGCATTTCAATTAGTAACTTTGATCCATTGGACTATTGTCAGATTGGGAAAGAAGTTCGCATTGCAAGAGTTGGATGCTATTTGATGGATGGTAATTGTACGGAAGG
TTGAGATAACATCACCAAGTGTTATGCAACTCTGTTCTTTTATTTGCAGTTAACTTCCATTTTGATGCTTGTATTTTCTTTTTCCAATCCCTTGCCATTTCTCTTGTTTCCTATCTAACATGATTTTGCAAAAAACTCAATCTATGCTTCATCGTGAATGGACAGTGGACCTTACTCCACACCCGTTAAAATTGCTTACT
CTGATAAGTAAAGGAATCAATAATCATAATGTTAAAATTGCATACTCTGATAAGTAAAGGAATCAATAATCATAATGTTAAAATTGCATACTCTGATAAGTAAAGGAATCA
Intron 3 GCAAGTGTCC ... GCTCATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 46.67 | 20 | 19 | 16 |
| A2 | 69.23 | 4 | 8 | 10 |
| A3 | 42.86 | 8 | 10 | 2 |
| A4 | 71.43 | 2 | 5 | 5 |
| A5 | 38.46 | 8 | 7 | 3 |
| A6 | 63.06 | 29 | 52 | 47 |
| A7 | 60 | 39 | 59 | 58 |
| A8 | 55.12 | 57 | 71 | 69 |
| A9 | 48.57 | 27 | 29 | 22 |
| A10 | 53.12 | 30 | 41 | 27 |
>TRINITY_DN44337_c0_g1_i8 from sample A8 / Example spliced isoformGTCGTTTCCGGGCCAAACGGGAGGCCAGTAAAGGATCTGGTAAGAGGAAAGGGGGCGGGCGAGGAGGGGGGGGAAAGGGTGGCAGTGGTAGCAGTGGTGGTGGAGGTCGAAGTATACGTGGTGTCGATTATGGGCTTGGCATAGGCTATAATCCCGATTCCTCAAACAGACCAGTGCAACCTTCCAATCTTAATCGAGGA
GCAGCAGTGAATGCTCTGAAGACGGGAATGATGGCACAATTCAAAAGTAATTTTGTTCCTGCATCATCTAATTCTTATGCATCAAGCACTAGCCAGTCATCCAGTATTCTAAGCAATAAAAGGCAAGGGATTAGTGGCTTTGTGTCGGGTGGTACGATTGGTGGTTATGCATTGAATGAACAAGGAAGTGGAAATAGGTC
TCAACAGGCTGACAATTTGGCCTCAGTGTCAGCTAGTGACACAGAGAGAGAAAGAGGAAGGGGAGGTGAAAGGGAGAGACAGCAGTCAAGATGGGATCCTGATCATTTGAATGATTCACATAATCAGAGAGTATCCCAGGAATCCAAGACAAATGGGAATCCAAGCTCTGAAAGTGTCAAGAACAGGCCAAGGGAACGAA
GGCGACCATCTGGTTGGGATCGTTGATTTTTCCTTTTATTTATTGAACATGATTTTCTGCCATTCTTGTTTTTGCTGGGCTTTGTACAAGGTTCAATACTCAACTCCTCAAGTAGTTTCCAGTAAAAGTATCTGACACTTCAATACACATTCATTTCTCGCTTATGCAGAGTCTGATGACACTTGAAATTATTTAAATGA
CATCTGAAAATGTCTTGTGCACTCCTTGAGGTGTACACTGCAGATCCATCGTTAGTAATGTTACATAACAAAATAATGATTACCAGAACTGATTACATATGAAGTAATGGCATATGAAGATTTGCTATCGCATCTCCCTTTGTAGATTCAATTTGAAATTCATCTTTTTAATGAACATTTTCAAGTGCAAGTTTGAAACA
TTTATGGTAGCATTTCAATCCATTTTCTCAAGACCCTCTCAAACATTATGAAACTACTTTGCCTAGATGTATATGTAAATCCTGTGCTTGTTAGTCCAAACTTGATATTTTAGACAATACACGTTTGCATGTAAAGACTATACTGGGTAAGTGCCCTCTACTTGTTTCAAAGGTATTATTGGTATGCTTGATTAGGATGT
GATGCTTTACTGGTTGTTTAATCAGCAAACATCATTTTAAGTTACCGAGCTGTTAGCCATGCATATGAAGCTTCAAGACAGGAACTAGAGTTTCCTCTGATGTATTCTACTTTTATGCCAGAAACTGTACTCTTAATTTCCCGTCTTCTTCACCTCATAATAACTAGAAAGAGGAGGCATAGCATGAATAAATGACCAGG
>TRINITY_DN44337_c0_g1_i12 from sample A8 / Example unspliced isoform:GTCGTTTCCGGGCCAAACGGGAGGCCAGTAAAGGATCTGGTAAGAGGAAAGGGGGCGGGCGAGGAGGGGGGGGAAAGGGTGGCAGTGGTAGCAGTGGTGGTGGAGGTCGAAGTATACGTGGTGTCGATTATGGGCTTGGCATAGGCTATAATCCCGATTCCTCAAACAGACCAGTGCAACCTTCCAATCTTAATCGAGGA
GCAGCAGTGAATGCTCTGAAGACGGGAATGATGGCACAATTCAAAAGTAATTTTGTTCCTGCATCATCTAATTCTTATGCATCAAGCACTAGCCAGTCATCCAGTATTCTAAGCAATAAAAGGCAAGGGATTAGTGGCTTTGTGTCGGGTGGTACGATTGGTGGTTATGCATTGAATGAACAAGGAAGTGGAAATAGGTC
TCAACAGGCTGACAATTTGGCCTCAGTGTCAGCTAGTGACACAGAGAGAGAAAGAGGAAGGGGAGGTGAAAGGGAGAGACAGCAGTCAAGATGGGATCCTGATCATTTGAATGATTCACATAATCAGAGAGTATCCCAGGAATCCAAGACAAATGGGAATCCAAGCTCTGAAAGTGTCAAGAACAGGCCAAGGGAACGAA
GGCGACCATCTGGTTGGGATCGTTGATTTTTCCTTTTATTTATTGAACATGATTTTCTGCCATTCTTGTTTTTGCTGGGCTTTGTACAAGGTTCAATACTCAACTCCTCAAGTAGTTTCCAGTAAAAGTATgcaagtgtcctatggttgtatcatccagtaatgcatgtgctctatactcgctcatgcagCTGACACTTC
AATACACATTCATTTCTCGCTTATGCAGAGTCTGATGACACTTGAAATTATTTAAATGACATCTGAAAATGTCTTGTGCACTCCTTGAGGTGTACACTGCAGATCCATCGTTAGTAATGTTACATAACAAAAATAATGATTACCAGAACTGATTACATATGAAGTAATGGCATATGAAGATTTGCTATCGCATCTCCCTT
TGTAGATTCAATTTGAAATTCATCTTTTTAATGAACATTTTCAAGTGCAAGTTTGAAACATTTATGGTAGCATTTCAATCCATTTTCTCAAGACCCTCTCAAACATTATGAAACTACTTTGCCTAGATGTATATGTAAATCCTGTGCTTGTTAGTCCAAACTTGATATTTTAGACAATACACGTTTGCATGTAAAGACTA
TACTGGGTAAGTGCCCTCTACTTGTTTCAAAGGTATTATTGGTATGCTTGATTAGGATGTGATGCTTTACTGGTTGTTTAATCAGCAAACATCATTTTAAGTTACCGAGCTGTTAGCCATGCATATGAAGCTTCAAGACAGGAACTAGAGTTTCCTCTGATGTATTCTACTTTTATGCCAGAAACTGTACTCTTAATTTC
CCGTCTTCTTCACCTCATAATAACTAGAAAGAGGAGGCATAGCATGAATAAATGACCAGG
Intron 4 GTAAGTATCT ... GAGCTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 57.5 | 18.7 | 17.9 | 33 |
| A2 | 54.25 | 8 | 5.1 | 14 |
| A3 | 60.78 | 10 | 28.3 | 4 |
| A4 | 70.44 | 5 | 13.9 | 10 |
| A5 | 56.01 | 7 | 13.9 | 4 |
| A6 | 61.13 | 52 | 64.9 | 101 |
| A7 | 54.94 | 59 | 69 | 76 |
| A8 | 64.81 | 70.7 | 104.7 | 157 |
| A9 | 67.87 | 29.3 | 59.9 | 65 |
| A10 | 57.32 | 41 | 56.6 | 55 |
>TRINITY_DN46191_c0_g1_i10 from sample A7 / Example spliced isoformGTGGATATCTATCATCGTATTTTTGTCATGCTTCCATAGTTTGGGAGCAAATTTTAATTTATAATTGACTGCTGTTTGTTATAGATTTGCTGTTTCATTGTATTCTGAATTCTGATAGTGTTGTCTACAGTGTCAAGAACAGGCCAAGGGAACGAAGGCGACCATCTGGTTGGGATCGTTGATTTTTCCTTTTATTTATT
GAACATGATTTTCTGCCATTCTTGTTTTTGCTGGGCTTTGTACAAGGTTCAATACTCAACTCCTCAAGTAGTTTCCAGTAAAAGTATGCAAGTGTCCTATGGTTGTATCATCCAGTAATGCATGTGCTCTATACTCGCTCATGCAGCTGACACTTCAATACACATTCATTTCTCGCTTATGCAGAGTCTGATGGCACTTG
AAATTATTTAAATGACATCTGAAAATGTCTTGTGCACTCCTTGAGGTGTACACTGCAGATCCATCGTTAGTAATGATCCATCGTTAGTAATGTTACATAACAAAAATAATGATTACCAGAACTGATTACATATGAAGTAATGGCATATGAAGATTTGCTATCGCATCTCCCTTTGTAGATTCAATTTGAAATTCATCTTT
TTAATGAACGTTTTCAAGTGCAAGTTTGAAACATTTATGGTAGCATTTCAATCCATTTTCTCAAGACCCTCTCAAACATTATGAAACTACTTTGCCTAGATGTATATGTAAATCCTGTGCTTGTTAGTCCAAACTTGATATTTTAGACAATACACGTTTGCATGTAAAGACTATACTGGGTAAGTGCCCTCTACTTGTTT
CAAAGGTATTATTGGTATGCTTGATTAGGATGTGATGCTTTACTGGTTGTTTAATCAGCAAACATCATTTTAAGTTACCGAGCTGTTAGCCATGCATATGAAGCTTCAAGACAGGAACTAGAGTTTCCTCTGATGTATTCTACTTTTATGCCAGAAACTGTACTCTTAATTTCCCGTCTTCTTCACCTCATAATAACTAG
AAAGAGGAGACATAGCATGAATAAATGACCAGGAACTATGTTTTTTTGGCAGTGTTATGAAGCTATGTGATAATACACTAAGATATCATGTATGACAGTTTTTTATGGTCTTTCTACAACATGATATTTATCCTGTAGCATTTCAATTAGTAACTTTGATCCATTGGACTATTGTCAGATTGGGAAAGAAGTTCGCAT
>TRINITY_DN46191_c0_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:GAAAGGGTGGCAGTGGTAGCAGTGGTGGTGGAGGTCGAAGTATACGTGGTGTCGATTATGGGCTTGGCATAGGCTATAATCCCGATTCCTCAAACAGACCAGTGCAACCTTCCAATCTTAATCGAGGAGCAGCAGTGAATGCTCTGAAGACGGGAATGATGGCACAATTCAAAAGTAATTTTGTTCCTGCATCATCTAAT
TCTTATGCATCAAGCACTAGCCAGTCATCCAGTATTCTAAGCAATAAAAGGCAAGGGATTAGTGGCTTTGTGTCGGGTGGTACGATTGGTGGTTATGCATTGAATGAACAAGGAAGTGGAAATAGGTCTCAACAGGCTGACAATTTGGCCTCAGTGTCAGCTAGTGACACAGAGAGAGAAAGAGGAAGGGGAGGTGAAAG
GGAGAGACAGCAGTCAAGATGGGATCCTGATCATTTGAATGATTCACATAATCAGAGAGTATCCCAGGAATCCAAGACAAATGGGAATCCAAGCTCTGAAAGTGTCAAGAACAGGCCAAGGGAACGAAGGCGACCATCTGGTTGGGATCGTTGATTTTTCCTTTTATTTATTGAACATGATTTTCTGCCATTCTTGTTTT
TGCTGGGCTTTGTACAAGGTTCAATACTCAACTCCTCAAGTAGTTTCCAGTAAAAGTATgtaagtatctattacagggaaaatatgcaaatgcagtgctgttataatcaaaattcttatttttagaatgcagaggttgccttgaaagactgattttgtttgactgtcatgtcgtggtgtgtatacacatcttctctttag
gtttatgcttgtccttatatttcttaattctggaaagcatttcaattccttgattgcattagatttaggccagaatattttattcggggcaaccatgcaagtttttatgttttgagcttgcagGCAAGTGTCCTATGGTTGTATCATCCAGTAATGCATGTGCTCTATACTCGCTCATGCAGCTGACACTTCAATACACA
TTCATTTCTCGCTTATGCAGAGTCTGATGGCACTTGAAATTATTTAAATGACATCTGAAAATGTCTTGTGCACTCCTTGAGGTGTACACTGCAGATCCATCGTTAGTAATGATCCATCGTTAGTAATGTTACATAACAAAAATAATGATTACCAGAACTGATTACATATGAAGTAATGGCATATGAAGATTTGCTATCGC
ATCTCCCTTTGTAGATTCAATTTGAAATTCATCTTTTTAATGAACGTTTTCAAGTGCAAGTTTGAAACATTTATGGTAGCATTTCAATCCATTTTCTCAAGACCCTCTCAAACATTATGAAACTACTTTGCCTAGATGTATATGTAAATCCTGTGCTTGTTAGTCCAAACTTGATATTTTAGACAATACACGTTTGCATG
TAAAGACTATACTGGGTAAGTGCCCTCTACTTGTTTCAAAGGTATTATTGGTATGCTTGATTAGGATGTGATGCTTTACTGGTTGTTTAATCAGCAAACATCATTTTAAGTTACCGAGCTGTTAGCCATGCATATGAAGCTTCAAGACAGGAACTAGAGTTTCCTCTGATGTATTCTACTTTTATGCCAGAAACTGTACT
CTTAATTTCCCGTCTTCTTCACCTCATAATAACTAGAAAGAGGAGACATAGCATGAATAAATGACCAGGAACTATGTTTTTTTGGCAGTGTTATGAAGCTATGTGATAATACACTAAGATATCATGTATGACAGTTTTTTATGGTCTTTCTACAACATGATATTTATCCTGTAGCATTTCAATTAGTAACTTTGATCCAT
TGGACTATTGTCAGATTGGGAAAGAAGTTCGCAT
Intron 5 GTAAGTATCT ... GCTCATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 57.15 | 19.5 | 18.2 | 34 |
| A2 | 71.71 | 4 | 5.5 | 15 |
| A3 | 67.39 | 8 | 29.5 | 5 |
| A4 | 85.62 | 2 | 13.8 | 10 |
| A5 | 52.91 | 8 | 14 | 4 |
| A6 | 74.15 | 29 | 68 | 101.3 |
| A7 | 67.22 | 38.8 | 71.2 | 89 |
| A8 | 69.44 | 57 | 108.5 | 152 |
| A9 | 68.39 | 26 | 61.7 | 52 |
| A10 | 65.15 | 29.5 | 59 | 53 |
>TRINITY_DN44337_c0_g1_i8 from sample A8 / Example spliced isoformGTCGTTTCCGGGCCAAACGGGAGGCCAGTAAAGGATCTGGTAAGAGGAAAGGGGGCGGGCGAGGAGGGGGGGGAAAGGGTGGCAGTGGTAGCAGTGGTGGTGGAGGTCGAAGTATACGTGGTGTCGATTATGGGCTTGGCATAGGCTATAATCCCGATTCCTCAAACAGACCAGTGCAACCTTCCAATCTTAATCGAGGA
GCAGCAGTGAATGCTCTGAAGACGGGAATGATGGCACAATTCAAAAGTAATTTTGTTCCTGCATCATCTAATTCTTATGCATCAAGCACTAGCCAGTCATCCAGTATTCTAAGCAATAAAAGGCAAGGGATTAGTGGCTTTGTGTCGGGTGGTACGATTGGTGGTTATGCATTGAATGAACAAGGAAGTGGAAATAGGTC
TCAACAGGCTGACAATTTGGCCTCAGTGTCAGCTAGTGACACAGAGAGAGAAAGAGGAAGGGGAGGTGAAAGGGAGAGACAGCAGTCAAGATGGGATCCTGATCATTTGAATGATTCACATAATCAGAGAGTATCCCAGGAATCCAAGACAAATGGGAATCCAAGCTCTGAAAGTGTCAAGAACAGGCCAAGGGAACGAA
GGCGACCATCTGGTTGGGATCGTTGATTTTTCCTTTTATTTATTGAACATGATTTTCTGCCATTCTTGTTTTTGCTGGGCTTTGTACAAGGTTCAATACTCAACTCCTCAAGTAGTTTCCAGTAAAAGTATCTGACACTTCAATACACATTCATTTCTCGCTTATGCAGAGTCTGATGACACTTGAAATTATTTAAATGA
CATCTGAAAATGTCTTGTGCACTCCTTGAGGTGTACACTGCAGATCCATCGTTAGTAATGTTACATAACAAAATAATGATTACCAGAACTGATTACATATGAAGTAATGGCATATGAAGATTTGCTATCGCATCTCCCTTTGTAGATTCAATTTGAAATTCATCTTTTTAATGAACATTTTCAAGTGCAAGTTTGAAACA
TTTATGGTAGCATTTCAATCCATTTTCTCAAGACCCTCTCAAACATTATGAAACTACTTTGCCTAGATGTATATGTAAATCCTGTGCTTGTTAGTCCAAACTTGATATTTTAGACAATACACGTTTGCATGTAAAGACTATACTGGGTAAGTGCCCTCTACTTGTTTCAAAGGTATTATTGGTATGCTTGATTAGGATGT
GATGCTTTACTGGTTGTTTAATCAGCAAACATCATTTTAAGTTACCGAGCTGTTAGCCATGCATATGAAGCTTCAAGACAGGAACTAGAGTTTCCTCTGATGTATTCTACTTTTATGCCAGAAACTGTACTCTTAATTTCCCGTCTTCTTCACCTCATAATAACTAGAAAGAGGAGGCATAGCATGAATAAATGACCAGG
>TRINITY_DN44337_c0_g1_i6 from sample A8 / Example unspliced isoform:GTCGTTTCCGGGCCAAACGGGAGGCCAGTAAAGGATCTGGTAAGAGGAAAGGGGGCGGGCGAGGAGGGGGGGGAAAGGGTGGCAGTGGTAGCAGTGGTGGTGGAGGTCGAAGTATACGTGGTGTCGATTATGGGCTTGGCATAGGCTATAATCCCGATTCCTCAAACAGACCAGTGCAACCTTCCAATCTTAATCGAGGA
GCAGCAGTGAATGCTCTGAAGACGGGAATGATGGCACAATTCAAAAGTAATTTTGTTCCTGCATCATCTAATTCTTATGCATCAAGCACTAGCCAGTCATCCAGTATTCTAAGCAATAAAAGGCAAGGGATTAGTGGCTTTGTGTCGGGTGGTACGATTGGTGGTTATGCATTGAATGAACAAGGAAGTGGAAATAGGTC
TCAACAGGCTGACAATTTGGCCTCAGTGTCAGCTAGTGACACAGAGAGAGAAAGAGGAAGGGGAGGTGAAAGGGAGAGACAGCAGTCAAGATGGGATCCTGATCATTTGAATGATTCACATAATCAGAGAGTATCCCAGGAATCCAAGACAAATGGGAATCCAAGCTCTGAAAGTGTCAAGAACAGGCCAAGGGAACGAA
GGCGACCATCTGGTTGGGATCGTTGATTTTTCCTTTTATTTATTGAACATGATTTTCTGCCATTCTTGTTTTTGCTGGGCTTTGTACAAGGTAAACATATAAATTCCTAATACAAATTTAACTTCAATGGATATTGTTGTGTCTGTTTTCAAATCCCATAAATACTGTGTTTCACATGCTTTTAATTTCAGGTTCAATAC
TCAACTCCTCAAGTAGTTTCCAGTAAAAGTATgtaagtatctattacagggaaaatatgcaaatgcagtgctgttataatcaaaattcttatttttagaatgcagaggttgccttgaaagactgattttgtttgactgtcatgtcgtggtgtgtatacacatcttctctttaggtgtatgcttgtccttatatttcttaa
ttctggaaagcatttcaattccttgattgcattagatttaggccagaatattttattcggggcaaccatgcaagtttttatgttttgagcttgcaggcaagtgtcctatggttgtatcatccagtaatgcatgtgctctatactcgctcatgcagCTGACACTTCAATACACATTCATTTCTCGCTTATGCAGAGTCTGA
TGACACTTGAAATTATTTAAATGACATCTGAAAATGTCTTGTGCACTCCTTGAGGTGTACACTGCAGATCCATCGTTAGTAATGTTACATAACAAAAATAATGATTACCAGAACTGATTACATATGAAGTAATGGCATATGAAGATTTGCTATCGCATCTCCCTTTGTAGATTCAATTTGAAATTCATCTTTTTAATGAA
CATTTTCAAGTGCAAGTTTGAAACATTTATGGTAGCATTTCAATCCATTTTCTCAAGACCCTCTCAAACATTATGAAACTACTTTGCCTAGATGTATATGTAAATCCTGTGCTTGTTAGTCCAAACTTGATATTTTAGACAATACACGTTTGCATGTAAAGACTATACTGGGTAAGTGCCCTCTACTTGTTTCAAAGGTA
TTATTGGTATGCTTGATTAGGATGTGATGCTTTACTGGTTGTTTAATCAGCAAACATCATTTTAAGTTACCGAGCTGTTAGCCATGCATATGAAGCTTCAAGACAGGAACTAGAGTTTCCTCTGATGTATTCTACTTTTATGCCAGAAACTGTACTCTTAATTTCCCGTCTTCTTCACCTCATAATAACTAGAAAGAGGA
GGCATAGCATGAATAAATGACCAGG
Intron 6 GTAAGGGTAG ... TTGTCTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 44.44 | 45 | 36 | 14.5 |
| A2 | 43.06 | 41 | 31 | 12.7 |
| A3 | 35.44 | 51 | 28 | 16.7 |
| A4 | 40 | 27 | 18 | 2 |
| A5 | 30.43 | 16 | 7 | 4.9 |
| A6 | 17.57 | 122 | 26 | 35.3 |
| A7 | 21.25 | 189 | 51 | 36.4 |
| A8 | 23.39 | 190 | 58 | 43.5 |
| A9 | 27.59 | 105 | 40 | 23.4 |
| A10 | 28 | 180 | 70 | 24.4 |
>TRINITY_DN115926_c0_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoformGGGCGGGCGAGGAGGGGGGGGAAAGGGTGGCAGTGGTAGCAGTGGTGGTGGAGGTCGAAGTATACGTGGTGTCGATTATGGGCTTGGCATAGGCTATAATCCCGATTCCTCAAACAGACCAGTGCAGCCTTCCAATCTTAATCGAGGAGCAGCAGTGAATGCTCTGAAGACGGGAATGATGGCACAATTCAAAAGTAATT
TTGTTCCTGCATCATCTAATTCTTATGCATCAAGCACTAGCCAGTCATCCAGTATTCTAAGCAATAAAAGGCAAGGGATTAGTGGCTTTGTGTCGGGTGGTACGATTGGTGGTTATGCATTGAATGAACAAGGAAGTGGAAATAGGTCTCAACAGGCTGACAATTTGGCCTCAGTGTCAGCTAGTGACACAGAGAGAGAA
AGAGGAAGGGGAGGTGAAAGGGAGAGACAGCAGTCAAGATGGGATCCTGATCATTTGAATGATTCACATAATCAGAGAGTATCCCAGGAATCCAAGACAAATGGGAATCCAAGCTCTGAAAGTGTCAAGAACAGGCCAAGGGAACGAAGGCGACCATCTGGTTGGGATCGTTGATTTTTCCTTTTATTTATTGAACATGA
TTTTCTGCCATTCTTGTTTTTGCTGGGCTTTGTACAAGGTAAACATATAAATTCCTAATACAAATTTAACTTCAATGGATATTGTTGTGTCTGTTTTCAAATCCCATAAATACTGTGTTTCACATGCTTTTAATTTCAGGTTCAATACTCAACTCCTCAAGTAGTTTCCAGTAAAAGTATGTAAGTATCTATTACAGGGA
AAATATGCAAATGCAGTGCTGTTATACTCAAAATTCTTATTTTTAGAATGCAGAGGTTGCCTTGAAAGACTGATTTTGTTTGACTGTCATGTCGTGGTGTGTATACACATCTTCTCTTTAGGTTTATGCTTGTCCTTATATTTCTTAATTCTGGAAAGCATTTCAATTCCTTGATTGCATTAGATTTAGGCCAGAATATT
TTATTCGGGGCAACCATGCAAGTTTTTATGTTTTGAGCTTGCAGGCAAGTGTCCTATGGTTGTATCATCCAGTAATGCATGTGCTCTATACTCGCTCATGCAGCTGACACTTCAATACACATTCATTTCTCGCTTATGCAGAGTCTGATGACACTTGAAATTATTTAAATGACATCTGAAAATGTCTTGTGCACTCCTTG
AGGTGTACACTGCAGATCCATCGTTAGTAATGTTACATAACAAAAATAATGATTACCAGAACTGATTACATATGAAGTAATGGCATATGAAGATTTGCTATCGCATCTCCCTTTGTAGATTCAATTTGAAATTCATCTTTTTAATGAACATTTTCAAGTGCAAGTTTGAAACATTTATGGTAGCATTTCAATCCATTTTC
TCAAGACCCTCTCAAACATTATGAAACTACTTTGCCTAGATGTATATGTAAATCCTGTGCTTGTTAGTCCAAACTTGATATTTTAGACAATACACGTTTGCATGTAAAGACTATACTGGGTAAGTGCCCTCTACTTGTTTCAAAGGTATTATTGGTATGCTTGATTAGGATGTGATGCTTTACTGGTTGTTTAATCAGCA
AACATCATTTTAAGTTACCGAGCTGTTAGCCATGCATATGAAGCTTCAAGACAGGAACTAGAGTTTCCTCTGATGTATTCTACTTTTATGCCAGAAACTGTACTCTTAATTTCCCGTCTTCTTCACCTCATAATAACTAGAAAGAGGAGGCATAGCATGAATAAATGACCAGGAACTATGTTTTTTTGGCAGTGTTATGA
AGCTATGTGATAATACACTAAGATATCATGTATGACAGTTTTTTATGGTCTTTCTACAACATGATATTTATCCTGTAGCATTTCAATTAGTAACTTTGATCCATTGGACTATTGTCAGATTGGGAAAGAAGTTCGCATTGCAAGAGTTGGATGCTATTTGATGGATGGTAATTGTACGGAAGGTTGAGATAACATCACCA
AGTGTTATGCAACTCTGTTCTTTTATTTGCAGTTAACTTCCATTTTGATGCTTGTATTTTCTTTTTCCAATCCCTTGCCATTTCTCTTGTTTCCTATCTAACATGATTTTGCAAAAAACTCAATCTATGCTTCATCGTGAATGGACAGTGGACCTTACTCCACACCCGTTAAAATTGCTTACTCTGATAAGTAAAGGAAT
CAATAATCATAATGTTAAAATTGCATACTCTGATAAGTAAAGGAATCAATAATCATAATGTTAAAATTGCATACTCTGATAAGTAAAGGAATCA
>TRINITY_DN115926_c0_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:GGGCGGGCGAGGAGGGGGGGGAAAGGGTGGCAGTGGTAGCAGTGGTGGTGGAGGTCGAAGTATACGTGGTGTCGATTATGGGCTTGGCATAGGCTATAATCCCGATTCCTCAAACAGACCAGTGCAGCCTTCCAATCTTAATCGAGGAGCAGCAGTGAATGCTCTGAAGACGGGAATGATGGCACAATTCAAAAGTAATT
TTGTTCCTGCATCATCTAATTCTTATGCATCAAGCACTAGCCAGTCATCCAGTATTCTAAGCAATAAAAGGCAAGGGATTAGTGGCTTTGTGTCGGGTGGTACGATTGGTGGTTATGCATTGAATGAACAAGGAAGTGGAAATAGGTCTCAACAGGCTGACAATTTGGCCTCAGTGTCAGCTAGTGACACAGAGAGAGAA
AGAGGAAGGGGAGGTGAAAGGGAGAGACAGCAGTCAAGATGGGATCCTGATCATTTGAATGATTCACATAATCAGAGAGTATCCCAGGAATCCAAGACAAATGGGAATCCAAGCTCTGAAAGgtaagggtagtttctggttgtatgttgaatagtttactacatttggaggcaatgttttgatttttaatttcacgttag
tgactgaccatggtggatatctatcatcgtatttttgtcatgcttccatagtttgggagcaaattttaatttataattgactgctgtttgttatagatttgctgtttcattgtattctgaattatgatagtgttgtctacagTGTCAAGAACAGGCCAAGGGAACGAAGGCGACCATCTGGTTGGGATCGTTGATTTTTC
CTTTTATTTATTGAACATGATTTTCTGCCATTCTTGTTTTTGCTGGGCTTTGTACAAGGT