sp|P93171|CALM_HELAN ----> Calmodulin
Intron 1 GTATCCATCT ... CTCTTCTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 79.82 | 67 | 1 | 265 |
| A2 | 82.31 | 81 | 3 | 377 |
| A3 | 84.75 | 63 | 3 | 350 |
| A4 | 83.62 | 58 | 3 | 296 |
| A5 | 82.64 | 42 | 0 | 200 |
| A6 | 79.49 | 464 | 11 | 1798 |
| A7 | 79.65 | 587 | 29 | 2298 |
| A8 | 81.04 | 349 | 8 | 1492 |
| A9 | 80.39 | 487 | 13 | 1996 |
| A10 | 81.54 | 437 | 22 | 1930 |
>TRINITY_DN39685_c0_g1_i4 from sample A7 / Example spliced isoformGGTTGGAGTTGTAGGTGTCAAGTTCAAAAGTGGTCCTGCTTCATGATTGACGAGCCGGTCACATCGATCGAGAGAAGCGGGTAGAGTCCGCAAAGAAGTTGCAACGGACAAAGTTACAAACCCTCAATAGCGGGCTTCTTTCGCACCTAGACCGTCCGATCGTCTCCTCCGTAAATCGAAAGCGGATTGATTTCAACCAT
AGAAAGAGAAGTAGCTTCAGCCATCTTGGAAAAGTCACAGCTCGAATACTATGGCGGTGCGATTAACCGAAGAACAGATTTCCGAGTTCAAGGAGGCCTTCAGTCTCTTCGACAAGGATGGCGACGGTAACTCATTTCATTTATATGAATCTTTAGGGTTTTCTGATGATTATAACTGATTTCATTTATCTGAGAGTTTA
GTGTTTTTCTGTGTTTTGTTTGCAGGATGCATTACGACCAAGGAATTGGGGACCGTGATGCGTTCCCTGGGACAGAATCCCACAGAAGCCGAGGTCCAAGATATGATCAATGAAGTCGATGCGGATGGGAATGGAACCATTGACTTCCCGGAATTTCTTAATCTCATGTCCAGAAAAATGAAGGTATCGTGATTTTCTTT
TTAATCTTTAAACGCTTTTGATTTATCTCTGCGGAAATATGAATTCACATGGTGCAATTACTGGTTTTTGTTCATCTCTGCGGATTTATGAATTCCAGTTCTGCATTATCGCAGTACTATCTTTAATATAGGTAAGAAGTAGTGTCCGCGATATTCGAACCTTAGACCTTTGCTTTGAATAAGCCATGCTTCTACCAGGG
TTTTGCTTTTCTTTTTCTTTACATTTTTCTTGTTTTGTGTTTCATAGATATTTTTTATTTGTAGGACGCAGATTCAGAACAGGAAGTGATGGAAGCTTTTAAAGTGTTCGATAAGGATCAGAATGGCTTCATCTCTGCTGCAGAAGTAAGTGGGTTTTATATAAATTTTGCAGGCGAAAGAGTGTTTTGTTTGGATTTAT
GAGATGATTTTTTGGATAATTTATTTTAGATTCAAAAGAAGCATTATAATGATTTTGTGGAGTGACATATTAAATACATACTATTAACAATATATATAGAAGGTTTATTTGATGATTTGGGGTTGGTTTTCATGATGGTTTTAGAGTTTTTATTTGCAGCTTCGACATGTCATGACAAATTTGGGGGAGAAGCTCACAGA
TGAGGAGGTTGATGAAATGATCAGGGAGGCTGACGTGGATGGTGATGGACAGGTCAACTATGAGGAATTTGTGAAAATGATGCTGACAAAGTGAATTGTAAAATATATAAGATCTACTTTTGCTGCTTTCTGTGGACGTATCATTTTTGGAGTTACGTTACTTAGTGTTTCGTGTTTCTAGCTTGGAGCTTGGGATGTTG
TCAAGCAGCAATACTTCATTGTTAATCACTTTGGCCTTTAGAGTTAGAATTGAAGGATTTCCACATTTTTCCTTATAGGTAGGTAGGTTTTCCTTATAGGGAGGTTGGGAAAGTCTATATTGTTAAGCTCGTTATTTATTTCAACAAACTACATTTTGTTCGAATTTGTACCATGAATTTTGTTTAATTTACTGTATTTT
TAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTT
>TRINITY_DN39685_c0_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:GGTTGGAGTTGTAGGTGTCAAGTTCAAAAGTGGTCCTGCTTCATGATTGACGAGCCGGTCACATCGATCGAGAGAAGCGGGTAGAGTCCGCAAAGAAGTTGCAACGGACAAAGTTACAAACCCTCAATAGCGGGCTTCTTTCGCACCTAGACCGTCCGATCGTCTCCTCCGTgtatccatctgttgagccccgcgtttaa
gacgcggattttgcgagtggataccgagtatatatatttttatatatatctgtgtgctttgcatgtatttcgcattaatctagttttgtttgtcaggaggcatcggtagggttcctttaagctgctttctcttttctcttctcagAAATCGAAAGCGGATTGATTTCAACCATAGAAAGAGAAGTAGCTTCAGCCATCTT
GGAAAAGTCACAGCTCGAATACTATGGCGGTGCGATTAACCGAAGAACAGATTTCCGAGTTCAAGGAGGCCTTCAGTCTCTTCGACAAGGATGGCGACGGTAACTCATTTCATTTATATGAATCTTTAGGGTTTTCTGATGATTATAACTGATTTCATTTATCTGAGAGTTTAGTGTTTTTCTGTGTTTTGTTTGCAGGA
TGCATTACGACCAAGGAATTGGGGACCGTGATGCGTTCCCTGGGACAGAATCCCACAGAAGCCGAGGTCCAAGATATGATCAATGAAGTCGATGCGGATGGGAATGGAACCATTGACTTCCCGGAATTTCTTAATCTCATGTCCAGAAAAATGAAGGTATCGTGATTTTCTTTTTAATCTTTAAACGCTTTTGATTTATC
TCTGCGGAAATATGAATTCACATGGTGCAATTACTGGTTTTTGTTCATCTCTGCGGATTTATGAATTCCAGTTCTGCATTATCGCAGTACTATCTTTAATATAGGTAAGAAGTAGTGTCCGCGATATTCGAACCTTAGACCTTTGCTTTGAATAAGCCATGCTTCTACCAGGGTTTTGCTTTTCTTTTTCTTTACATTTT
TCTTGTTTTGTGTTTCATAGATATTTTTTATTTGTAGGACGCAGATTCAGAACAGGAAGTGATGGAAGCTTTTAAAGTGTTCGATAAGGATCAGAATGGCTTCATCTCTGCTGCAGAAGTAAGTGGGTTTTATATAAATTTTGCAGGCGAAAGAGTGTTTTGTTTGGATTTATGAGATGATTTTTTGGATAATTTATTTT
AGATTCAAAAGAAGCATTATAATGATTTTGTGGAGTGACATATTAAATACATACTATTAACAATATATATAGAAGGTTTATTTGATGATTTGGGGTTGGTTTTCATGATGGTTTTAGAGTTTTTATTTGCAGCTTCGACATGTCATGACAAATTTGGGGGAGAAGCTCACAGATGAGGAGGTTGATGAAATGATCAGGGA
GGCTGACGTGGATGGTGATGGACAGGTCAACTATGAGGAATTTGTGAAAATGATGCTGACAAAGTGAATTGTAAAATATATAAGATCTACTTTTGCTGCTTTCTGTGGACGTATCATTTTTGGAGTTACGTTACTTAGTGTTTCGTGTTTCTAGCTTGGAGCTTGGGATGTTGTCAAGCAGCAATACTTCATTGTTAATC
ACTTTGGCCTTTAGAGTTAGAATTGAAGGATTTCCACATTTTTCCTTATAGGTAGGTAGGTTTTCCTTATAGGGAGGTTGGGAAAGTCTATATTGTTAAGCTCGTTATTTATTTCAACAAACTACATTTTGTTCGAATTTGTACCATGAATTTTGTTTAATTTACTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATT
GTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTT
Intron 2 GTAAGTGGGT ... TTATTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20.38 | 212.5 | 34.3 | 54 |
| A2 | 19.37 | 181.6 | 31.6 | 43 |
| A3 | 17.53 | 255.3 | 35.6 | 53 |
| A4 | 21.82 | 155.5 | 25 | 43 |
| A5 | 20.26 | 105.9 | 18.3 | 26 |
| A6 | 19.09 | 1823 | 222.8 | 424 |
| A7 | 18.09 | 2255.3 | 292.3 | 490 |
| A8 | 22.44 | 2233.5 | 259.7 | 640 |
| A9 | 17.6 | 1863.8 | 234.1 | 392 |
| A10 | 16.59 | 1732.3 | 248.3 | 336 |
>TRINITY_DN105103_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformCTCTTCGACAAGGATGGCGACGGTAACTCATTTCATTTATATGAATCTTTAGGGTTTTCTGATGATTATAACTGATTTCATTTATCTGAGAGTTTAGTGTTTTTCTGTGTTTTGTTTGCAGGATGCATTACGACCAAGGAATTGGGGACCGTGATGCGTTCCCTGGGACAGAATCCCACAGAAGCCGAGGTCCAAGATAT
GATCAATGAAGTCGATGCGGATGGGAATGGAACCATTGACTTCCCGGAATTTCTTAATCTCATGTCCAGAAAAATGAAGATATTTTTTATTTGTAGGACGCAGATTCAGAACAGGAAGTGATGGAAGCTTTTAAAGTGTTCGATAAGGATCAGAATGGCTTCATCTCTGCTGCAGAACTTCGACATGTCATGACAAATTT
GGGGGAGAAGCTCACAGATGAGGAGGTTGATGAAATGATCAGGGAGGCTGACGTGGATGGTGATGGACAGGTCAACTATGAGGAATTTGTGAAAATGATGCTGACAAAGTGAATTGTAAAATATATAAGATCTACTTTTGCTGCTTTCTGTGGACGTATCATTTTTGGAGTTACGTTACTTAGTGTTTCGTGTTTCTAGC
TTGGAGCTTGGGATGTTGTCAAGCAGCAATACTTCATTGTTAATCACTTTGGCCTTTAGAGTTAGAATTGAAGGATTTCCACATTTTTCCTTATAGGTAGGTAGGTTTTCCTTATAGGGAGGTTGGGAAAGTCTATATTGTTAAGCTCGTTATTTATTTCAACAAACTACATTTTGTTCGAATTTGTACCATGAATTTTG
TTTAATTTACTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTT
>TRINITY_DN105103_c0_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:CCTCCGTGTATCCATCTGTTGAGCCCCGCGTATAAGACGCGGATTTTGCGAGTGGATACCGAGTATATATATTTTTATATATATCTGTGTGCTTTGCATGTATTTCGCATTAATCTAGTTTTGTTTGTCAGGAGGCATCGGTAGGGTTCCTTTAAGCTGCTTTCTCTTTTCTCTTCTCAGAAATCGAAAGCGGATTGATT
TCAACCATAGAAAGAGAAGTAGCTTCAGCCATCTTGGAAAAGTCACAGCTCGAATACTATGGCGGTGCGATTAACCGAAGAACAGATTTCCGAGTTCAAGGAGGCCTTCAGTCTCTTCGACAAGGATGGCGACGGATGCATTACGACCAAGGAATTGGGGACCGTGATGCGTTCCCTGGGACAGAATCCCACAGAAGCCG
AGGTCCAAGATATGATCAATGAAGTCGATGCGGATGGGAATGGAACCATTGACTTCCCGGAATTTCTTAATCTCATGTCCAGAAAAATGAAGGTATCGTGATTTTCTTTTTAATCTTTAAACGCTTTTGATTTATCTCTGCGGAAATATGAATTCACATGGTGCAATTACTGGTTTTTGTTCATCTCTGCGGATTTATGA
ATTCCAGTTCTGCATTATCGCAGTACTATCTTTAATATAGGTAAGAAGTAGTGTCCGCGATATTCGAACCTTAGACCTTTGCTTTGAATAAGCCATGCTTCTACCAGGGTTTTGCTTTTCTTTTTCTTTACATTTTTCTTGTTTTGTGTTTCATAGATATTTTTTATTTGTAGGACGCAGATTCAGAACAGGAAGTGATG
GAAGCTTTTAAAGTGTTCGATAAGGATCAGAATGGCTTCATCTCTGCTGCAGAAgtaagtgggttttatataaattttgcaggcgaaagagtgttttgtttggatttatgagatgattttttggataatttattttagattcaaaagaagcattataatgattttgtggagtgacatattaaatacatactattaacaat
atatatagaaggtttatttgatgatttggggttggttttcatgatggttttagagtttttatttgcagCTTCGACATGTCATGACAAATTTGGGGGAGAAGCTCACAGATGAGGAGGTTGATGAAATGATCAGGGAGGCTGACGTGGATGGTGATGGACAGGTCAACTATGAGGAATTTGTGAAAATGATGCTGACAAAG
TGAATTGTAAAATATATAAGATCTACTTTTGCTGCTTTCTGTGGACGTATCATTTTTGGAGTTACGTTACTTAGTGTTTCGTGTTTCTAGCTTGGAGCTTGGGATGTTGTCAAGCAGCAATACTTCATTGTTAATCACTTTGGCCTTTAGAGTTAGAATTGAAGGATTTCCACATTTTTCCTTATAGGTAGGTAGGTTTT
CCTTATAGGGAGGTTGGGAAAGTCTATATTGTTAAGCTCGTTATTTATTTCAACAAACTACATTTTGTTCGAATTTGTACCATGAATTTTGTTTAATTTACTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTT
Intron 3 GTAACTCATT ... TTGTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 23.55 | 276 | 47.3 | 85 |
| A2 | 18.73 | 256 | 51.6 | 59 |
| A3 | 18.67 | 257 | 45.4 | 59 |
| A4 | 19.43 | 340 | 43.8 | 82 |
| A5 | 17.2 | 154 | 25 | 32 |
| A6 | 17.94 | 1070 | 119.8 | 234 |
| A7 | 19.26 | 1425 | 174.8 | 340 |
| A8 | 18.02 | 1213 | 157.5 | 266.6 |
| A9 | 18.5 | 1220.3 | 140.7 | 277 |
| A10 | 16.67 | 1155 | 142.3 | 231 |
>TRINITY_DN105103_c0_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformCCTCCGTGTATCCATCTGTTGAGCCCCGCGTATAAGACGCGGATTTTGCGAGTGGATACCGAGTATATATATTTTTATATATATCTGTGTGCTTTGCATGTATTTCGCATTAATCTAGTTTTGTTTGTCAGGAGGCATCGGTAGGGTTCCTTTAAGCTGCTTTCTCTTTTCTCTTCTCAGAAATCGAAAGCGGATTGATT
TCAACCATAGAAAGAGAAGTAGCTTCAGCCATCTTGGAAAAGTCACAGCTCGAATACTATGGCGGTGCGATTAACCGAAGAACAGATTTCCGAGTTCAAGGAGGCCTTCAGTCTCTTCGACAAGGATGGCGACGGATGCATTACGACCAAGGAATTGGGGACCGTGATGCGTTCCCTGGGACAGAATCCCACAGAAGCCG
AGGTCCAAGATATGATCAATGAAGTCGATGCGGATGGGAATGGAACCATTGACTTCCCGGAATTTCTTAATCTCATGTCCAGAAAAATGAAGGACGCAGATTCAGAACAGGAAGTGATGGAAGCTTTTAAAGTGTTCGATAAGGATCAGAATGGCTTCATCTCTGCTGCAGAACTTCGACATGTCATGACAAATTTGGGG
GAGAAGCTCACAGATGAGGAGGTTGATGAAATGATCAGGGAGGCTGACGTGGATGGTGATGGACAGGTCAACTATGAGGAATTTGTGAAAATGATGCTGACAAAGTGAATTGTAAAATATATAAGATCTACTTTTGCTGCTTTCTGTGGACGTATCATTTTTGGAGTTACGTTACTTAGTGTTTCGTGTTTCTAGCTTGG
AGCTTGGGATGTTGTCAAGCAGCAATACTTCATTGTTAATCACTTTGGCCTTTAGAGTTAGAATTGAAGGATTTCCACATTTTTCCTTATAGGTAGGTAGGTTTTCCTTATAGGGAGGTTGGGAAAGTCTATATTGTTAAGCTCGTTATTTATTTCAACAAACTACATTTTGTTCGAATTTGTACCATGAATTTTGTTTA
ATTTACTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTT
>TRINITY_DN105103_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:CTCTTCGACAAGGATGGCGACGgtaactcatttcatttatatgaatctttagggttttctgatgattataactgatttcatttatctgagagtttagtgtttttctgtgttttgtttgcagGATGCATTACGACCAAGGAATTGGGGACCGTGATGCGTTCCCTGGGACAGAATCCCACAGAAGCCGAGGTCCAAGATAT
GATCAATGAAGTCGATGCGGATGGGAATGGAACCATTGACTTCCCGGAATTTCTTAATCTCATGTCCAGAAAAATGAAGATATTTTTTATTTGTAGGACGCAGATTCAGAACAGGAAGTGATGGAAGCTTTTAAAGTGTTCGATAAGGATCAGAATGGCTTCATCTCTGCTGCAGAACTTCGACATGTCATGACAAATTT
GGGGGAGAAGCTCACAGATGAGGAGGTTGATGAAATGATCAGGGAGGCTGACGTGGATGGTGATGGACAGGTCAACTATGAGGAATTTGTGAAAATGATGCTGACAAAGTGAATTGTAAAATATATAAGATCTACTTTTGCTGCTTTCTGTGGACGTATCATTTTTGGAGTTACGTTACTTAGTGTTTCGTGTTTCTAGC
TTGGAGCTTGGGATGTTGTCAAGCAGCAATACTTCATTGTTAATCACTTTGGCCTTTAGAGTTAGAATTGAAGGATTTCCACATTTTTCCTTATAGGTAGGTAGGTTTTCCTTATAGGGAGGTTGGGAAAGTCTATATTGTTAAGCTCGTTATTTATTTCAACAAACTACATTTTGTTCGAATTTGTACCATGAATTTTG
TTTAATTTACTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTT
Intron 4 GTATCGTGAT ... TGTTTCATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 14.58 | 123 | 21 | 8 |
| A2 | 10.8 | 157 | 19 | 9 |
| A3 | 8.02 | 172 | 15 | 5 |
| A4 | 13.01 | 107 | 16 | 8 |
| A5 | 7.92 | 93 | 8 | 1 |
| A6 | 7.62 | 1273 | 105 | 19 |
| A7 | 9.06 | 1687 | 168 | 20 |
| A8 | 9.43 | 1450 | 151 | 26 |
| A9 | 7.82 | 1332 | 113 | 12 |
| A10 | 8.2 | 1287 | 115 | 11 |
>TRINITY_DN105103_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformCTCTTCGACAAGGATGGCGACGGTAACTCATTTCATTTATATGAATCTTTAGGGTTTTCTGATGATTATAACTGATTTCATTTATCTGAGAGTTTAGTGTTTTTCTGTGTTTTGTTTGCAGGATGCATTACGACCAAGGAATTGGGGACCGTGATGCGTTCCCTGGGACAGAATCCCACAGAAGCCGAGGTCCAAGATAT
GATCAATGAAGTCGATGCGGATGGGAATGGAACCATTGACTTCCCGGAATTTCTTAATCTCATGTCCAGAAAAATGAAGATATTTTTTATTTGTAGGACGCAGATTCAGAACAGGAAGTGATGGAAGCTTTTAAAGTGTTCGATAAGGATCAGAATGGCTTCATCTCTGCTGCAGAACTTCGACATGTCATGACAAATTT
GGGGGAGAAGCTCACAGATGAGGAGGTTGATGAAATGATCAGGGAGGCTGACGTGGATGGTGATGGACAGGTCAACTATGAGGAATTTGTGAAAATGATGCTGACAAAGTGAATTGTAAAATATATAAGATCTACTTTTGCTGCTTTCTGTGGACGTATCATTTTTGGAGTTACGTTACTTAGTGTTTCGTGTTTCTAGC
TTGGAGCTTGGGATGTTGTCAAGCAGCAATACTTCATTGTTAATCACTTTGGCCTTTAGAGTTAGAATTGAAGGATTTCCACATTTTTCCTTATAGGTAGGTAGGTTTTCCTTATAGGGAGGTTGGGAAAGTCTATATTGTTAAGCTCGTTATTTATTTCAACAAACTACATTTTGTTCGAATTTGTACCATGAATTTTG
TTTAATTTACTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTT
>TRINITY_DN105103_c0_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:CCTCCGTGTATCCATCTGTTGAGCCCCGCGTATAAGACGCGGATTTTGCGAGTGGATACCGAGTATATATATTTTTATATATATCTGTGTGCTTTGCATGTATTTCGCATTAATCTAGTTTTGTTTGTCAGGAGGCATCGGTAGGGTTCCTTTAAGCTGCTTTCTCTTTTCTCTTCTCAGAAATCGAAAGCGGATTGATT
TCAACCATAGAAAGAGAAGTAGCTTCAGCCATCTTGGAAAAGTCACAGCTCGAATACTATGGCGGTGCGATTAACCGAAGAACAGATTTCCGAGTTCAAGGAGGCCTTCAGTCTCTTCGACAAGGATGGCGACGGATGCATTACGACCAAGGAATTGGGGACCGTGATGCGTTCCCTGGGACAGAATCCCACAGAAGCCG
AGGTCCAAGATATGATCAATGAAGTCGATGCGGATGGGAATGGAACCATTGACTTCCCGGAATTTCTTAATCTCATGTCCAGAAAAATGAAGgtatcgtgattttctttttaatctttaaacgcttttgatttatctctgcggaaatatgaattcacatggtgcaattactggtttttgttcatctctgcggatttatga
attccagttctgcattatcgcagtactatctttaatataggtaagaagtagtgtccgcgatattcgaaccttagacctttgctttgaataagccatgcttctaccagggttttgcttttctttttctttacatttttcttgttttgtgtttcatagATATTTTTTATTTGTAGGACGCAGATTCAGAACAGGAAGTGATG
GAAGCTTTTAAAGTGTTCGATAAGGATCAGAATGGCTTCATCTCTGCTGCAGAAGTAAGTGGGTTTTATATAAATTTTGCAGGCGAAAGAGTGTTTTGTTTGGATTTATGAGATGATTTTTTGGATAATTTATTTTAGATTCAAAAGAAGCATTATAATGATTTTGTGGAGTGACATATTAAATACATACTATTAACAAT
ATATATAGAAGGTTTATTTGATGATTTGGGGTTGGTTTTCATGATGGTTTTAGAGTTTTTATTTGCAGCTTCGACATGTCATGACAAATTTGGGGGAGAAGCTCACAGATGAGGAGGTTGATGAAATGATCAGGGAGGCTGACGTGGATGGTGATGGACAGGTCAACTATGAGGAATTTGTGAAAATGATGCTGACAAAG
TGAATTGTAAAATATATAAGATCTACTTTTGCTGCTTTCTGTGGACGTATCATTTTTGGAGTTACGTTACTTAGTGTTTCGTGTTTCTAGCTTGGAGCTTGGGATGTTGTCAAGCAGCAATACTTCATTGTTAATCACTTTGGCCTTTAGAGTTAGAATTGAAGGATTTCCACATTTTTCCTTATAGGTAGGTAGGTTTT
CCTTATAGGGAGGTTGGGAAAGTCTATATTGTTAAGCTCGTTATTTATTTCAACAAACTACATTTTGTTCGAATTTGTACCATGAATTTTGTTTAATTTACTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTT
Intron 5 GTATCGTGAT ... TTATTTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 12.53 | 147.2 | 21 | 18.5 |
| A2 | 10.09 | 170 | 19 | 13.4 |
| A3 | 6.87 | 204.7 | 15 | 11 |
| A4 | 11.58 | 122.6 | 16 | 13.5 |
| A5 | 7.31 | 101.8 | 8 | 4.2 |
| A6 | 6.76 | 1465.7 | 105.8 | 63.2 |
| A7 | 8.22 | 1897.7 | 169.3 | 70.8 |
| A8 | 8.51 | 1631 | 151 | 76.4 |
| A9 | 6.79 | 1565.8 | 113.4 | 65.4 |
| A10 | 7.42 | 1458.3 | 116.4 | 51.8 |
>TRINITY_DN105103_c0_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformCCTCCGTGTATCCATCTGTTGAGCCCCGCGTATAAGACGCGGATTTTGCGAGTGGATACCGAGTATATATATTTTTATATATATCTGTGTGCTTTGCATGTATTTCGCATTAATCTAGTTTTGTTTGTCAGGAGGCATCGGTAGGGTTCCTTTAAGCTGCTTTCTCTTTTCTCTTCTCAGAAATCGAAAGCGGATTGATT
TCAACCATAGAAAGAGAAGTAGCTTCAGCCATCTTGGAAAAGTCACAGCTCGAATACTATGGCGGTGCGATTAACCGAAGAACAGATTTCCGAGTTCAAGGAGGCCTTCAGTCTCTTCGACAAGGATGGCGACGGATGCATTACGACCAAGGAATTGGGGACCGTGATGCGTTCCCTGGGACAGAATCCCACAGAAGCCG
AGGTCCAAGATATGATCAATGAAGTCGATGCGGATGGGAATGGAACCATTGACTTCCCGGAATTTCTTAATCTCATGTCCAGAAAAATGAAGGACGCAGATTCAGAACAGGAAGTGATGGAAGCTTTTAAAGTGTTCGATAAGGATCAGAATGGCTTCATCTCTGCTGCAGAACTTCGACATGTCATGACAAATTTGGGG
GAGAAGCTCACAGATGAGGAGGTTGATGAAATGATCAGGGAGGCTGACGTGGATGGTGATGGACAGGTCAACTATGAGGAATTTGTGAAAATGATGCTGACAAAGTGAATTGTAAAATATATAAGATCTACTTTTGCTGCTTTCTGTGGACGTATCATTTTTGGAGTTACGTTACTTAGTGTTTCGTGTTTCTAGCTTGG
AGCTTGGGATGTTGTCAAGCAGCAATACTTCATTGTTAATCACTTTGGCCTTTAGAGTTAGAATTGAAGGATTTCCACATTTTTCCTTATAGGTAGGTAGGTTTTCCTTATAGGGAGGTTGGGAAAGTCTATATTGTTAAGCTCGTTATTTATTTCAACAAACTACATTTTGTTCGAATTTGTACCATGAATTTTGTTTA
ATTTACTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTT
>TRINITY_DN105103_c0_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:CCTCCGTGTATCCATCTGTTGAGCCCCGCGTATAAGACGCGGATTTTGCGAGTGGATACCGAGTATATATATTTTTATATATATCTGTGTGCTTTGCATGTATTTCGCATTAATCTAGTTTTGTTTGTCAGGAGGCATCGGTAGGGTTCCTTTAAGCTGCTTTCTCTTTTCTCTTCTCAGAAATCGAAAGCGGATTGATT
TCAACCATAGAAAGAGAAGTAGCTTCAGCCATCTTGGAAAAGTCACAGCTCGAATACTATGGCGGTGCGATTAACCGAAGAACAGATTTCCGAGTTCAAGGAGGCCTTCAGTCTCTTCGACAAGGATGGCGACGGATGCATTACGACCAAGGAATTGGGGACCGTGATGCGTTCCCTGGGACAGAATCCCACAGAAGCCG
AGGTCCAAGATATGATCAATGAAGTCGATGCGGATGGGAATGGAACCATTGACTTCCCGGAATTTCTTAATCTCATGTCCAGAAAAATGAAGgtatcgtgattttctttttaatctttaaacgcttttgatttatctctgcggaaatatgaattcacatggtgcaattactggtttttgttcatctctgcggatttatga
attccagttctgcattatcgcagtactatctttaatataggtaagaagtagtgtccgcgatattcgaaccttagacctttgctttgaataagccatgcttctaccagggttttgcttttctttttctttacatttttcttgttttgtgtttcatagatattttttatttgtagGACGCAGATTCAGAACAGGAAGTGATG
GAAGCTTTTAAAGTGTTCGATAAGGATCAGAATGGCTTCATCTCTGCTGCAGAAGTAAGTGGGTTTTATATAAATTTTGCAGGCGAAAGAGTGTTTTGTTTGGATTTATGAGATGATTTTTTGGATAATTTATTTTAGATTCAAAAGAAGCATTATAATGATTTTGTGGAGTGACATATTAAATACATACTATTAACAAT
ATATATAGAAGGTTTATTTGATGATTTGGGGTTGGTTTTCATGATGGTTTTAGAGTTTTTATTTGCAGCTTCGACATGTCATGACAAATTTGGGGGAGAAGCTCACAGATGAGGAGGTTGATGAAATGATCAGGGAGGCTGACGTGGATGGTGATGGACAGGTCAACTATGAGGAATTTGTGAAAATGATGCTGACAAAG
TGAATTGTAAAATATATAAGATCTACTTTTGCTGCTTTCTGTGGACGTATCATTTTTGGAGTTACGTTACTTAGTGTTTCGTGTTTCTAGCTTGGAGCTTGGGATGTTGTCAAGCAGCAATACTTCATTGTTAATCACTTTGGCCTTTAGAGTTAGAATTGAAGGATTTCCACATTTTTCCTTATAGGTAGGTAGGTTTT
CCTTATAGGGAGGTTGGGAAAGTCTATATTGTTAAGCTCGTTATTTATTTCAACAAACTACATTTTGTTCGAATTTGTACCATGAATTTTGTTTAATTTACTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTTAAATAATTTATTGTATTTTTAGTTTGGAGATTTT
Intron 6 GTATATATAT ... CTCTTCTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 88.04 | 36 | 1 | 265 |
| A2 | 89.76 | 43 | 3 | 377 |
| A3 | 89.74 | 40 | 6 | 350 |
| A4 | 88.54 | 38.3 | 2.3 | 296 |
| A5 | 88.5 | 26 | 0 | 200 |
| A6 | 85.74 | 299 | 12 | 1798 |
| A7 | 87.16 | 338.7 | 26.7 | 2298 |
| A8 | 88.72 | 189.7 | 12.7 | 1492 |
| A9 | 87.61 | 282.3 | 27.3 | 1996 |
| A10 | 88.96 | 239.7 | 30.7 | 1930 |
>TRINITY_DN37564_c0_g1_i4 from sample A6 / Example spliced isoformATCGTCTCCTCCGTGTATCCATCTGTTGAGCCCCGCGTTTAAGACGCGGATTTTGCGAGTGGATACCGAAAATCGAAAGCGGATTGATTTCAACCATAGAAAGAGAAGTAGCTTCAGCCATCTTGGAAAAGTCACAGCTCGAATACTATGGCGGTGCGATTAACCGAAGAACAGATTTCCGAGTTCAAGGAGGCCTTCAG
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