sp|Q3B724|CALS5_ARATH ----> Callose synthase 5

Intron 1 GTTACTTTCT ... TATTGTGAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	50	2	3	1
A2	26.1	6	3	1.3
A3	65	1	0	3.8
A4	100	0	0	2.5
A5	100	0	4	12
A6	56.22	36	49	43.5
A7	45.93	31	36	16.8
A8	44.21	29	24	22
A9	57.29	29	46	32
A10	40.67	31	21	21.5

>TRINITY_DN41482_c2_g2_i7 from sample A6 / Example spliced isoform

GAAACTCAACTATTGGGTTCCTCCCCAACTTGTTCCTCCGCGCCCAGCCCAATCCCACCATACATACTTTCTCTGTCTACTAGAACTGAACATACTTTCTCCGGTGTGGAGAGCACTGAAAATGGCGAAAAGGAAGATGATGCATTCAAAAGTCTAGCGGCCGCCGGTGATTAGTTCCACAGGTAGTTGAGTTCGCTCGG
TTCCGGACTGATGTGATTGATAGCCTGAATGAAATTGTAAATTGTTTTGGGAGGCTACAAGTCAGTGGTTGAATCGATGACTCATGAGCAAAACAAGAGCCAACAACCATTGCTGGCACAATTGCAGGAACTTGTTGAAATGAAATTTATGTACCTTGTCTCTTGCCAAATGTATGGTCGACAAAAGAGTGGCCAACAAA
AGAAAGAAGGTGAGCAACGTGCAACTGGCATTTTAAACCTTATGGTGACATAAATCATAATATTTCCATTCTTTAGATTCTATTTGGTTTTAAGACACCATTTGCGTAAGTGTATTTAAGTTGAATCACTGTTCAGTTAAAATACATGGTGGTTTTTTCAAATACCCATCTCTAAGTGTGGCCTACATTGATGAGGTAGA
AGAGAGGAAGGAGGGGAAAGCTCACAAGGTTTATTATTCTATCCTTATCAAAGTAGTTAATGGCCTTGACCAGGTAATTTTCATTCATGCAAATGTGTTATAAATTATGATCCTCAATGAAAAGTAACAAGGCATTTGTGAGTATGGAGAA

>TRINITY_DN41482_c2_g2_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:

GAAACTCAACTATTGGGTTCCTCCCCAACTTGTTCCTCCGCGCCCAGCCCAATCCCACCATACATACTTTCTCTGTCTACTAGAACTGAACATACTTTCTCCGGTGTGGAGAGCACTGAAAATGGCGAAAAGGAAGATGATGCATTCAAAAGTCTAGCGGCCGCCGGgttactttctcccatgccctcgagctttctgtt
ctttactatactgaagtcacccttattagggtttaattcatttgaaagggatctggttttttttcttcaaattccttgtttaagggtgctcccattctgaatcaagaaacttgtcttattgtgaagTGATTAGTTCCACAGGTAGTTGAGTTCGCTCGGTTCCGGACTGATGTGATTGATAGCCTGAATGAAATTGTAAA
TTGGTAAGTATTGAGTCGAACCATGATATCATTAACTTCGAGAATAAGGATTTCTTATTTTGGGTTTTCGTTGTAGTCAATCCTTAGCTTTGGATGTCTGAATCTGAACTCTCAAAATTATCAACCATCAACCGTTTTGCTCGCTCTGCTGTGTCTAATCATTGGTGTTCACATTTGATAATAAATTGAAATAATTCTCT
TTCTGTGGGAAAAATCTACTGGATTTGCGAGGGGCATGCATTTTAGGGCACATTTGTGATCTGGATCTAGTTCTGCGAGATCACATATATTAGGGCGTATTTGTTAGTAATGATTTTTTACACTAACGTAAAACAATGAGTTTTCAGTATTGAGCAGAAACTTGTTTGCTATTAAAACTGCCACGATCATGCAACTGTGG
GCACATTCTCTTC

Intron 2 GTAGTTAGCA ... TTTTGTGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	11.34	43	10	1
A2	15.56	19	5	2
A3	26.92	19	8	6
A4	4.17	46	4	0
A5	25	6	1	3
A6	11.11	52	9	4
A7	18.32	78	27	8
A8	20.83	95	35	15
A9	17.24	60	16	9
A10	22.45	38	10	12

>TRINITY_DN46678_c1_g2_i8 from sample A8 / Example spliced isoform

CCAACTTGTTCCTCCGCGCCCAGCCCAATCCCACCATACATACTTTCTCTGTCTACTAGAACTGAACATACTTTCTCCGGTGTGGAGAGCACTGAAAATGGCGAAAAGGAAGATGATGCATTCAAAAGTCTAGCGGCCGCCGGGTAGTTGAGTTCGCTCGGTTCCGGACTGATGTGATTGATAGCCTGAATGAAATTGTA
AATTGTTTTGGGAGGCTACAAGTCAGTGGTTGAATCGATGACTCATGAGCAAAACAAGAGCCAACAACCATTGCTGGCACAATTGCAGGAACTTGTTGAAATGAAATTTATGTACCTTGTCTCTTGCCAAATGTATGGTCGACAAAAGAGTGGCCAACAAAAGAAAGAAGGTGAGCAACGTGCAACTGGCATTTTAAACC
TTATGGTGACATAAATCATAATATTTCCATTCTTTAGATTCTATTTGGTTTTAAGACACCATTTGCGTAAGTGTATTTAAGTTGAATCACTGTTCAGTTAAAATACATGGTGGTTTTTTCAAATACCCATCTCTAAGTGTGGCCTACATTGATGAGGTAGAAGAGAGGAAGGAGGGGAAAGCTCACAAGGTTTTTTATTC
TATCCTCGTCAAAGCAGTTAATGGCCGTGACGAGATAATATACCGTATCAAGCTTCCTGGTAATCCTATTCTTGGTGAGGGGAAGCCAGAAAATCAGAATCATGCCATTGTTTTCACTCGTGGAGAAGCTCTTCAAACAATTGATATGAACCAGGACAACTATCTAGAAGAAGCTTTCAAAATGCGAAACTTGCTGGAAG
AATTTCTTAAGATACATGGTGTACGATGCCCAACAATACTTGGCCTTAGAGAACATATTTTTACAGGCAGTGTTTCATCACTTGCTTGGTTCATGTCAAATCAAGAAACTAGTTTTGTTACCATTGGACAACGACTGCTAGCAAGCCCGCTTAAGGTGCGCTTTCATTATGGACATCCTGATGTATTTGATAGATTGTTT
CACCTCACAAGAGGTGGGATAAGCAAAGCTTCAAAAGGCATCAACTTAAGTGAGGACATTTTTGCAGGATTCAATTCTACACTACGGCAAGGAAATGTAACTCATCATGAATACATGCAAGTTGGTAAAGGTCGTGATGTGGGACTCAATCAAATATCACAATTTGAGGCAAAGGTGGCAAATGGGAATGGTGAACAAAC
TTTGAGTCGTGATATTTATCGACTCGGACACCGCTTTGACTTTTTCCGGATGATGTCCTGCTATTTCACTACGGTTGGGTTTTATTTCAGCTCCATGGTGACTGTACTTACAGTGTATGTTTTTCTCTATGGTCGATTGTATTTGGTTTTGAGTGGACTTGAAAAGGCAATGTTACATGTAGCTACCGTACAACATAATT
CTGCTCTGGAAGCAGCCCTTGCTTCACAATCACTTGTTCAGCTTGGTATGTTAATGGCTTTACCTATGGTGATGGAGATTGGCCTAGAACAAGGATTCCGCAAAGCCTTAGGTGACTTTGTGGTCATGCAGCTACAGCTGGCATCAGTTTTCTTTACTTTCTCTCTTGGGACAAAGACACATTATTATGGCCGCACATTA
CTTCATGGTGGAGCAAAATACAGAGCTACTGGGCGTGGATTTGTTGTCTTTCATGCTAAGTTTGCAGATAATTACCGCTTCTATTCACGCAGTCACTTTGTCAAAGGACTTGAGTTGATGCTGCTCTTGATTGTGTACACTGTCTATGGCCAGTCATATCATAAAACTGTTCCCTATATCTTAATCACTTATTCCATGTG
GTTTATGGTTGGGACATGGCTATTTGCTCCTTTCCTGTTTAATCCTTCTGGATTCGAGTGGCAAAAGATTGTGGATGACTGGACAGATTGGAAAAAGTGGATCAACAGCCGTGGAGGTATTGGTGTGCCACAGGAAAAGAGTTGGGAATCCTGGTGGGATGAGGAACAGGATCATCTCAAGCATTCAGGATTGCGGGGAC
GGATTTGGGAGATATTGTTATCACTTAGATTTTTCCTCTATCAGTATGGATTGGTCTATCATCTAAACATTGCTCAAGAACACCGGAGTGTTCTGGTATATGGGCTATCGTGGCTTGTTATTGCAATCGTTTTATTGGTATTGAAGACTGTATCCATGGGAAGGCGGAGGTTCAGTGCAGATTTTCAGCTCATGTTCCGG
CTTCTGAAGGGGCTTCTTTTCATTGGTTTCTTATCAGTTCTTATTATTCTCATAGTTGTCTGTGGCTTAACCATAGCAGACTTGTTTACGTGTTTCCTTGCATTCATGCCTACTGGATGGGCCTTCCTGCAGATTACACTAGCCTGCAGGCCGCTATTTCATCACACTGGATTTTGGGATTCTATTCGTGCACTTGCTCG
GAGTTATGAGTATGTAATGGGACTCCTACTTTTTA

>TRINITY_DN46678_c1_g2_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CCAACTTGTTCCTCCGCGCCCAGCCCAATCCCACCATACATACTTTCTCTGTCTACTAGAACTGAACATACTTTCTCCGGTGTGGAGAGCACTGAAAATGGCGAAAAGGAAGATGATGCATTCAAAAGTCTAGCGGCCGCCGGTGATTAGTTCCACAGGTAGTTGAGTTCGCTCGGTTCCGGACTGATGTGATTGATAGC
CTGAATGAAATTGTAAATTGTTTTGGGAGGCTACAAGTCAGTGGTTGAATCGATGACTCATGAGCAAAACAAGAGCCAACAACCATTGCTGGCACAATTGCAGGAACTTGTTGAAATGAAATTTATGTACCTTGTCTCTTGCCAAATGTATGGTCGACAAAAGAGTGGCCAACAAAAGAAAGAAGGTGAGCAACGTGCAA
CTGGCATTTTAAACCTTATGGTGACATAAATCATAATATTTCCATTCTTTAGATTCTATTTGGTTTTAAGACACCATTTGCGTAAGTGTATTTAAGTTGAATCACTGTTCAGTTAAAATACATGGTGGTTTTTTCAAATACCCATCTCTAAGTGTGGCCTACATTGATGAGGTAGAAGAGAGGAAGGAGGGGAAAGCTCA
CAAGGTTTTTTATTCTATCCTCGTCAAAGCAGTTAATGGCCGTGACGAGATAATATACCGTATCAAGCTTCCTGGTAATCCTATTCTTGGTGAGGGGAAGCCAGAAAATCAGAATCATGCCATTGTTTTCACTCGTGGAGAAGCTCTTCAAACAATTGATATGAACCAGGACAACTATCTAGAAGAAGCTTTCAAAATGC
GAAACTTGCTGGAAGAATTTCTTAAGATACATGGTGTACGATGCCCAACAATACTTGGCCTTAGAGAACATATTTTTACAGGCAGTGTTTCATCACTTGCTTGGTTCATGTCAAATCAAGAAACTAGTTTTGTTACCATTGGACAACGACTGCTAGCAAGCCCGCTTAAGGTGCGCTTTCATTATGGACATCCTGATGTA
TTTGATAGATTGTTTCACCTCACAAGAGGTGGGATAAGCAAAGCTTCAAAAGGCATCAACTTAAGTGAGGACATTTTTGCAGGATTCAATTCTACACTACGGCAAGGAAATGTAACTCATCATGAATACATGCAAGTTGGTAAAGGTCGTGATGTGGGACTCAATCAAATATCACAATTTGAGGCAAAGGTGGCAAATGG
GAATGGTGAACAAACTTTGAGTCGTGATATTTATCGACTCGGACACCGCTTTGACTTTTTCCGGATGATGTCCTGCTATTTCACTACGGTTGGGTTTTATTTCAGCTCCATGGTGACTGTACTTACAGTGTATGTTTTTCTCTATGGTCGATTGTATTTGGTTTTGAGTGGACTTGAAAAGGCAATGTTACATGTAGCTA
CCGTACAACATAATTCTGCTCTGGAAGCAGCCCTTGCTTCACAATCACTTGTTCAGCTTGGTATGTTAATGGCTTTACCTATGGTGATGGAGATTGGCCTAGAACAAGGATTCCGCAAAGCCTTAGGTGACTTTGTGGTCATGCAGCTACAGCTGGCATCAGTTTTCTTTACTTTCTCTCTTGGGACAAAGACACATTAT
TATGGCCGCACATTACTTCATGGTGGAGCAAAATACAGAGCTACTGGGCGTGGATTTGTTGTCTTTCATGCTAAGTTTGCAGATAATTACCGCTTCTATTCACGCAGTCACTTTGTCAAAGGACTTGAGTTGATGCTGCTCTTGATTGTGTACACTGTCTATGGCCAGTCATATCATAAAACTGTTCCCTATATCTTAAT
CACTTATTCCATGTGGTTTATGGTTGGGACATGGCTATTTGCTCCTTTCCTGTTTAATCCTTCTGGATTCGAGTGGCAAAAGATTGTGGATGACTGGACAGATTGGAAAAAGTGGATCAACAGCCGTGGAGGTATTGGTGTGCCACAGGAAAAGAGTTGGGAATCCTGGTGGGATGAGGAACAGGATCATCTCAAGCATT
CAGGATTGCGGGGACGGATTTGGGAGATATTGTTATCACTTAGATTTTTCCTCTATCAGTATGGATTGGTCTATCATCTAAACATTGCTCAAGAACACCGGAGTGTTCTGGTATATGGGCTATCGTGGCTTGTTATTGCAATCGTTTTATTGGTATTGAAGACTGTATCCATGGGAAGGCGGAGGTTCAGTGCAGATTTT
CAGCTCATGTTCCGGCTTCTGAAGGGGCTTCTTTTCATTGGTTTCTTATCAGTTCTTATTATTCTCATAGTTGTCTGTGGCTTAACCATAGCAGACTTGTTTACGTGTTTCCTTGCATTCATGCCTACTGGATGGGCCTTCCTGCAGgtagttagcattaatgaagttgtgtcttatatctgttatctgtttccagttgg
gattagaaattggtgtagtttatgcataatagaagatctggattttttttgtgtagATTACACTAGCCTGCAGGCCGCTATTTCATCACACTGGATTTTGGGATTCTATTCGTGCACTTGCTCGGAGTTATGAGTATGTAATGGGACTCCTACTTTTTA

Intron 3 GTTACTTTCT ... AGTTCCACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	34.69	2.9	3	0
A2	26.82	5.9	3	1.3
A3	56.12	1.7	0	3.7
A4	100	0	0	2.6
A5	80.95	1.7	4	10
A6	53.78	39.4	49	40.3
A7	44.53	33.3	36	16
A8	41.85	33.3	24	22.6
A9	53.05	34.6	46	31.3
A10	37.11	35.3	21	19.4

>TRINITY_DN41482_c2_g2_i4 from sample A6 / Example spliced isoform

GAAACTCAACTATTGGGTTCCTCCCCAACTTGTTCCTCCGCGCCCAGCCCAATCCCACCATACATACTTTCTCTGTCTACTAGAACTGAACATACTTTCTCCGGTGTGGAGAGCACTGAAAATGGCGAAAAGGAAGATGATGCATTCAAAAGTCTAGCGGCCGCCGGGTAGTTGAGTTCGCTCGGTTCCGGACTGATGTG
ATTGATAGCCTGAATGAAATTGTAAATTGTTTTGGGAGGCTACAAGTCAGTGGTTGAATCGATGACTCATGAGCAAAACAAGAGCCAACAACCATTGCTGGCACAATTGCAGGAACTTGTTGAAATGAAATTTATGTACCTTGTCTCTTGCCAAATGTATGGTCGACAAAAGAGTGGCCAACAAAAGAAAGAAGGTGAGC
AACGTGCAACTGGCATTTTAAACCTTATGGTGACATAAATCATAATATTTCCATTCTTTAGATTCTATTTGGTTTTAAGACACCATTTGCGTAAGTGTATTTAAGTTGAATCACTGTTCAGTTAAAATACATGGTGGTTTTTTCAAATACCCATCTCTAAGTGTGGCCTACATTGATGAGGTAGAAGAGAGGAAGGAGGG
GAAAGCTCACAAGGTTTATTATTCTATCCTTATCAAAGTAGTTAATGGCCTTGACCAGGTAATTTTCATTCATGCAAATGTGTTATAAATTATGATCCTCAATGAAAAGTAACAAGGCATTTGTGAGTATGGAGAA

>TRINITY_DN41482_c2_g2_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:

GAAACTCAACTATTGGGTTCCTCCCCAACTTGTTCCTCCGCGCCCAGCCCAATCCCACCATACATACTTTCTCTGTCTACTAGAACTGAACATACTTTCTCCGGTGTGGAGAGCACTGAAAATGGCGAAAAGGAAGATGATGCATTCAAAAGTCTAGCGGCCGCCGGgttactttctcccatgccctcgagctttctgtt
ctttactatactgaagtcacccttattagggtttaattcatttgaaagggatctggttttttttcttcaaattccttgtttaagggtgctcccattctgaatcaagaaacttgtcttattgtgaagtgattagttccacagGTAGTTGAGTTCGCTCGGTTCCGGACTGATGTGATTGATAGCCTGAATGAAATTGTAAA
TTGGTAAGTATTGAGTCGAACCATGATATCATTAACTTCGAGAATAAGGATTTCTTATTTTGGGTTTTCGTTGTAGTCAATCCTTAGCTTTGGATGTCTGAATCTGAACTCTCAAAATTATCAACCATCAACCGTTTTGCTCGCTCTGCTGTGTCTAATCATTGGTGTTCACATTTGATAATAAATTGAAATAATTCTCT
TTCTGTGGGAAAAATCTACTGGATTTGCGAGGGGCATGCATTTTAGGGCACATTTGTGATCTGGATCTAGTTCTGCGAGATCACATATATTAGGGCGTATTTGTTAGTAATGATTTTTTACACTAACGTAAAACAATGAGTTTTCAGTATTGAGCAGAAACTTGTTTGCTATTAAAACTGCCACGATCATGCAACTGTGG
GCACATTCTCTTC