sp|Q8GTS2|BZP23_ARATH ----> Basic leucine zipper 23

Intron 1 GCATGTTTTG ... TGTGTTATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	72.83	45.5	132	112
A2	67.05	49.5	121	80.5
A3	62.98	75.5	157	100
A4	78.11	26.5	112	77
A5	64.64	41.1	92	58
A6	59.34	140	160	248.5
A7	64.32	182.5	296	362
A8	66.31	96.5	137	243
A9	65.24	160.5	276	326.6
A10	60.23	256.4	375	401.7

>TRINITY_DN109524_c0_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoform

ATGGATAGTCAACATAACTCAAGAGGTGACGATACAACACACTGATAAGCCAAGTACAGCTTTGCTGGGCCGGACCAATCAGGGTAACTTCCACCCATCGACACCCCTATTTTAAGTTTTTTAACCAAACCTTATGGCGTATCTACTACGTGTCCACATTTTAGCCGTTCGACTATAAAGCTCTACTATATTTTGAAACC
CCACACGAATATCTAAGTCTGGAGTTGCAGACACAGCTCTGCGAGCAACGATCATGGCGAAGACGGAGTTACAGAGAAAATTAATCGAGATGCGGCTGTTTTCGATAAATTGAAGAAAAATATTGAAGTCAAGGGCTGCTAAAATGGATGGATTGATAAACCTCTGACTGCATATTGTATGGTTTGTTACAAAAAATATT
GAAGTCAAAGACTTAGAAAATGGCTGGCATGGATGGCGGGGACATTAATTTTAGCAGCCATATGTTAGATGATCTTGGTAATGGATCCTCCATGGAGTCCTTTTTCGAGGAGATTCTGAGGGACACTACTCATGCCTGCACTCATACCCACACCTGCAACCCCCCTGGGCCGGATAACACGCACACTCACACATGTTTCC
ACACGCACACAAAAATCCTTGCTGCCCCTGATGGCGAGAAATCTGCGGACACCGCCGAGTCTCCACAAAACAGCTCCTCCAAGCCAAAAAAGCGTCCAGTAGGTAATAGAGAGGCAGTTAGAAAATACAGGGAAAAGAAGAAGGCTCGGACGGCCTCCCTGGAGGAGGAGGTTTCGCAACTGACCTCTCTTAATCAGCAG
TTGATAAGAAGATTACAGGGTCAAGCAGCTTTAGAGGCTGAGATTGCAAGATTGAAGTGCTTGCTGGCTGATTTTAGGGGACGGATTGATGGAGAATTGGGGTCCTATCCCTACCAAAAGTCAATTAGAATGGATAAAACTTGCAATGATGCACCATTTCGACAACCGATGCCTGGGGGATATGTCCTGGATCCCTGCAA
TATTTGGTGCAATGCAGATGCAGCTTGTCATGACCCGACTTTGGCATCCAACAGTGAGGGTGGGGTGCAGCACGAACATGATAGTGGTGCACGTTGGAAAGGTGAGTGTGGCCAGATGTCAGGCCATTGTCAAGGTTTGAAGGGTGATATGGCAGTCACCACTAGTGGGCTTTCTGCATGCTCAGAGGGTACAGCAACAA
AAACAGTGCCTGCTACCGTGGCTTCTTCTGGAAAAGAGAGAAAGGGTACATTTGGTGTGTGACCCAATCCTAGTGAGTGTATACCATGCAAATCTTTGTATCTCCCAGAAAATTTTCATGGTGGATGATTTCTGTATATCTTGTAGGGAAGGTATGCATCATCAAACTGCAAAAGTCTTTGGTATTTACTATTTATTGTT
TCAAAGATATTCATTTTCATTTCTGTTTTCTTAGTCTTGAAACAATGCAACTACTGAACCTGAGAGCTAAATGATGAAAATTCAAGCAATTTGCTTTCTTGCTTTCAGGAGTTGGTCTCTTTTTTTTTTCCCTCCCCTGAAAAACAACTACTTTTTCTGCTTATGTTAAAGTGGAGATAACTGGAATATATTTGAAGATG
GTGACTGCAATGTTCCTGAAAAGATTTAACAAAACATTTGCTGGGATTCAAGGAAAGTAACGAACAACATAGTTTGGGTTGTATTTACCTGGAAAGCGTCTTTGAAGCATGTTTAAGATCTATCCAGGAGATAAACGGTTTTGTTATATGAACGGTTTTGTTATATGCATGAAACGATCATATTTCTTTATAAGAGTATC
TATATTGTAATCTTGTTTTTGCGAAAGTTTTCTTAATGCATGTTAATGTTACAGATTGTTATTGTTATATGAACG

>TRINITY_DN109524_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

ATGGATAGTCAACATAACTCAAGAGGTGACGATACAACACACTGATAAGCCAAGTACAGCTTTGCTGGGCCGGACCAATCAGGGTAACTTCCACCCATCGACACCCCTATTTTAAGTTTTTTAACCAAACCTTATGGCGTATCTACTACGTGTCCACATTTTAGCCGTTCGACTATAAAGCTCTACTATATTTTGAAACC
CCACACGAATATCTAAGTCTGGAGTTGCAGACACAGCTCTGCGAGCAACGATCATGGCGAAGACGGAGTTACAGAGAAAATTAATCGAGATGCGGCTGTTTTCGATAAATTGAAGgcatgttttgtaactcccctcctcccattgtaatcaatttggattctctgattttgaatgaacattatgtgcgaaaataatgtgg
gattataaggggtttggaatggccggggagaattatgaaacagacttggacgaaatttgtggtgacatgagaaatcgtgtgggaatgggtcattagggtttgttgtttggctgaattctgctaggttagatgatttgaaggtctttatgttttccttgttgcttgactattgttttggggttttgggcattggggacatc
ttccattgttaagctctggtcattacattggagggataaaaatggatggcaaacaattttctgcgggtcaggggatgggagtatatagaagcatttctcctgagtgtcagggttaggattagagtcagggtttggcattttttggtagaaaacgaaaatcaaaatatggatctggttgacacaaatttctcagcagattg
catagggcaattaagtttagcttgataattctctgatagcaaattatttgatgtgttatagAAAAATATTGAAGTCAAGGGCTGCTAAAATGGATGGATTGATAAACCTCTGACTGCATATTGTATGGTTTGTTACAAAAAATATTGAAGTCAAAGACTTAGAAAATGGCTGGCATGGATGGCGGGGACATTAATTTTAG
CAGCCATATGTTAGATGATCTTGGTAATGGATCCTCCATGGAGTCCTTTTTCGAGGAGATTCTGAGGGACACTACTCATGCCTGCACTCATACCCACACCTGCAACCCCCCTGGGCCGGATAACACGCACACTCACACATGTTTCCACACGCACACAAAAATCCTTGCTGCCCCTGATGGCGAGAAATCTGCGGACACCG
CCGAGTCTCCACAAAACAGCTCCTCCAAGCCAAAAAAGCGTCCAGTAGGTAATAGAGAGGCAGTTAGAAAATACAGGGAAAAGAAGAAGGCTCGGACGGCCTCCCTGGAGGAGGAGGTTTCGCAACTGACCTCTCTTAATCAGCAGTTGATAAGAAGATTACAGGGTCAAGCAGCTTTAGAGGCTGAGATTGCAAGATTG
AAGTGCTTGCTGGCTGATTTTAGGGGACGGATTGATGGAGAATTGGGGTCCTATCCCTACCAAAAGTCAATTAGAATGGATAAAACTTGCAATGATGCACCATTTCGACAACCGATGCCTGGGGGATATGTCCTGGATCCCTGCAATATTTGGTGCAATGCAGATGCAGCTTGTCATGACCCGACTTTGGCATCCAACAG
TGAGGGTGGGGTGCAGCACGAACATGATAGTGGTGCACGTTGGAAAGGTGAGTGTGGCCAGATGTCAGGCCATTGTCAAGGTTTGAAGGGTGATATGGCAGTCACCACTAGTGGGCTTTCTGCATGCTCAGAGGGTACAGCAACAAAAACAGTGCCTGCTACCGTGGCTTCTTCTGGAAAAGAGAGAAAGGGTACATTTG
GTGTGTGACCCAATCCTAGTGAGTGTATACCATGCAAATCTTTGTATCTCCCAGAAAATTTTCATGGTGGATGATTTCTGTATATCTTGTAGGGAAGGTATGCATCATCAAACTGCAAAAGTCTTTGGTATTTACTATTTATTGTTTCAAAGATATTCATTTTCATTTCTGTTTTCTTAGTCTTGAAACAATGCAACTAC
TGAACCTGAGAGCTAAATGATGAAAATTCAAGCAATTTGCTTTCTTGCTTTCAGGAGTTGGTCTCTTTTTTTTTTCCCTCCCCTGAAAAACAACTACTTTTTCTGCTTATGTTAAAGTGGAGATAACTGGAATATATTTGAAGATGGTGACTGCAATGTTCCTGAAAAGATTTAACAAAACATTTGCTGGGATTCAAGGA
AAGTAACGAACAACATAGTTTGGGTTGTATTTACCTGGAAAGCGTCTTTGAAGCATGTTTAAGATCTATCCAGGAGATAAACGGTTTTGTTATATGAACGGTTTTGTTATATGCATGAAACGATCATATTTCTTTATAAGAGTATCTATATTGTAATCTTGTTTTTGCGAAAGTTTTCTTAATGCATGTTAATGTTACAG
ATTGTTATTGTTATATGAACG

Intron 2 GTATGCATCA ... TTGCTTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	45.12	59	56	41
A2	35.77	44	30	19
A3	34.67	49	19	33
A4	39.86	43	37	20
A5	33.33	17	8	9
A6	39.27	334	213	219
A7	40.79	286	205	189.1
A8	39.52	374	236	252.8
A9	40.1	307	203	208
A10	36.11	215	127	116

>TRINITY_DN109524_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

ATGGATAGTCAACATAACTCAAGAGGTGACGATACAACACACTGATAAGCCAAGTACAGCTTTGCTGGGCCGGACCAATCAGGGTAACTTCCACCCATCGACACCCCTATTTTAAGTTTTTTAACCAAACCTTATGGCGTATCTACTACGTGTCCACATTTTAGCCGTTCGACTATAAAGCTCTACTATATTTTGAAACC
CCACACGAATATCTAAGTCTGGAGTTGCAGACACAGCTCTGCGAGCAACGATCATGGCGAAGACGGAGTTACAGAGAAAATTAATCGAGATGCGGCTGTTTTCGATAAATTGAAGGCATGTTTTGTAACTCCCCTCCTCCCATTGTAATCAATTTGGATTCTCTGATTTTGAATGAACATTATGTGCGAAAATAATGTGG
GATTATAAGGGGTTTGGAATGGCCGGGGAGAATTATGAAACAGACTTGGACGAAATTTGTGGTGACATGAGAAATCGTGTGGGAATGGGTCATTAGGGTTTGTTGTTTGGCTGAATTCTGCTAGGTTAGATGATTTGAAGGTCTTTATGTTTTCCTTGTTGCTTGACTATTGTTTTGGGGTTTTGGGCATTGGGGACATC
TTCCATTGTTAAGCTCTGGTCATTACATTGGAGGGATAAAAATGGATGGCAAACAATTTTCTGCGGGTCAGGGGATGGGAGTATATAGAAGCATTTCTCCTGAGTGTCAGGGTTAGGATTAGAGTCAGGGTTTGGCATTTTTTGGTAGAAAACGAAAATCAAAATATGGATCTGGTTGACACAAATTTCTCAGCAGATTG
CATAGGGCAATTAAGTTTAGCTTGATAATTCTCTGATAGCAAATTATTTGATGTGTTATAGAAAAATATTGAAGTCAAGGGCTGCTAAAATGGATGGATTGATAAACCTCTGACTGCATATTGTATGGTTTGTTACAAAAAATATTGAAGTCAAAGACTTAGAAAATGGCTGGCATGGATGGCGGGGACATTAATTTTAG
CAGCCATATGTTAGATGATCTTGGTAATGGATCCTCCATGGAGTCCTTTTTCGAGGAGATTCTGAGGGACACTACTCATGCCTGCACTCATACCCACACCTGCAACCCCCCTGGGCCGGATAACACGCACACTCACACATGTTTCCACACGCACACAAAAATCCTTGCTGCCCCTGATGGCGAGAAATCTGCGGACACCG
CCGAGTCTCCACAAAACAGCTCCTCCAAGCCAAAAAAGCGTCCAGTAGGTAATAGAGAGGCAGTTAGAAAATACAGGGAAAAGAAGAAGGCTCGGACGGCCTCCCTGGAGGAGGAGGTTTCGCAACTGACCTCTCTTAATCAGCAGTTGATAAGAAGATTACAGGGTCAAGCAGCTTTAGAGGCTGAGATTGCAAGATTG
AAGTGCTTGCTGGCTGATTTTAGGGGACGGATTGATGGAGAATTGGGGTCCTATCCCTACCAAAAGTCAATTAGAATGGATAAAACTTGCAATGATGCACCATTTCGACAACCGATGCCTGGGGGATATGTCCTGGATCCCTGCAATATTTGGTGCAATGCAGATGCAGCTTGTCATGACCCGACTTTGGCATCCAACAG
TGAGGGTGGGGTGCAGCACGAACATGATAGTGGTGCACGTTGGAAAGGTGAGTGTGGCCAGATGTCAGGCCATTGTCAAGGTTTGAAGGGTGATATGGCAGTCACCACTAGTGGGCTTTCTGCATGCTCAGAGGGTACAGCAACAAAAACAGTGCCTGCTACCGTGGCTTCTTCTGGAAAAGAGAGAAAGGGTACATTTG
GTGTGTGACCCAATCCTAGTGAGTGTATACCATGCAAATCTTTGTATCTCCCAGAAAATTTTCATGGTGGATGATTTCTGTATATCTTGTAGGGAAGGAGTTGGTCTCTTTTTTTTTTCCCTCCCCTGAAAAACAACTACTTTTTCTGCTTATGTTAAAGTGGAGATAACTGGAATATATTTGAAGATGGTGACTGCAAT
GTTCCTGAAAAGATTTAACAAAACATTTGCTGGGATTCAAGGAAAGTAACGAACAACATAGTTTGGGTTGTATTTACCTGGAAAGCGTCTTTGAAGCATGTTTAAGATCTATCCAGGAGATAAACGGTTTTGTTATATGAACGGTTTTGTTATATGCATGAAACGATCATATTTCTTTATAAGAGTATCTATATTGTAAT
CTTGTTTTTGCGAAAGTTTTCTTAATGCATGTTAATGTTACAGATTGTTATTGTTATATGAACG

>TRINITY_DN109524_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

ATGGATAGTCAACATAACTCAAGAGGTGACGATACAACACACTGATAAGCCAAGTACAGCTTTGCTGGGCCGGACCAATCAGGGTAACTTCCACCCATCGACACCCCTATTTTAAGTTTTTTAACCAAACCTTATGGCGTATCTACTACGTGTCCACATTTTAGCCGTTCGACTATAAAGCTCTACTATATTTTGAAACC
CCACACGAATATCTAAGTCTGGAGTTGCAGACACAGCTCTGCGAGCAACGATCATGGCGAAGACGGAGTTACAGAGAAAATTAATCGAGATGCGGCTGTTTTCGATAAATTGAAGGCATGTTTTGTAACTCCCCTCCTCCCATTGTAATCAATTTGGATTCTCTGATTTTGAATGAACATTATGTGCGAAAATAATGTGG
GATTATAAGGGGTTTGGAATGGCCGGGGAGAATTATGAAACAGACTTGGACGAAATTTGTGGTGACATGAGAAATCGTGTGGGAATGGGTCATTAGGGTTTGTTGTTTGGCTGAATTCTGCTAGGTTAGATGATTTGAAGGTCTTTATGTTTTCCTTGTTGCTTGACTATTGTTTTGGGGTTTTGGGCATTGGGGACATC
TTCCATTGTTAAGCTCTGGTCATTACATTGGAGGGATAAAAATGGATGGCAAACAATTTTCTGCGGGTCAGGGGATGGGAGTATATAGAAGCATTTCTCCTGAGTGTCAGGGTTAGGATTAGAGTCAGGGTTTGGCATTTTTTGGTAGAAAACGAAAATCAAAATATGGATCTGGTTGACACAAATTTCTCAGCAGATTG
CATAGGGCAATTAAGTTTAGCTTGATAATTCTCTGATAGCAAATTATTTGATGTGTTATAGAAAAATATTGAAGTCAAGGGCTGCTAAAATGGATGGATTGATAAACCTCTGACTGCATATTGTATGGTTTGTTACAAAAAATATTGAAGTCAAAGACTTAGAAAATGGCTGGCATGGATGGCGGGGACATTAATTTTAG
CAGCCATATGTTAGATGATCTTGGTAATGGATCCTCCATGGAGTCCTTTTTCGAGGAGATTCTGAGGGACACTACTCATGCCTGCACTCATACCCACACCTGCAACCCCCCTGGGCCGGATAACACGCACACTCACACATGTTTCCACACGCACACAAAAATCCTTGCTGCCCCTGATGGCGAGAAATCTGCGGACACCG
CCGAGTCTCCACAAAACAGCTCCTCCAAGCCAAAAAAGCGTCCAGTAGGTAATAGAGAGGCAGTTAGAAAATACAGGGAAAAGAAGAAGGCTCGGACGGCCTCCCTGGAGGAGGAGGTTTCGCAACTGACCTCTCTTAATCAGCAGTTGATAAGAAGATTACAGGGTCAAGCAGCTTTAGAGGCTGAGATTGCAAGATTG
AAGTGCTTGCTGGCTGATTTTAGGGGACGGATTGATGGAGAATTGGGGTCCTATCCCTACCAAAAGTCAATTAGAATGGATAAAACTTGCAATGATGCACCATTTCGACAACCGATGCCTGGGGGATATGTCCTGGATCCCTGCAATATTTGGTGCAATGCAGATGCAGCTTGTCATGACCCGACTTTGGCATCCAACAG
TGAGGGTGGGGTGCAGCACGAACATGATAGTGGTGCACGTTGGAAAGGTGAGTGTGGCCAGATGTCAGGCCATTGTCAAGGTTTGAAGGGTGATATGGCAGTCACCACTAGTGGGCTTTCTGCATGCTCAGAGGGTACAGCAACAAAAACAGTGCCTGCTACCGTGGCTTCTTCTGGAAAAGAGAGAAAGGGTACATTTG
GTGTGTGACCCAATCCTAGTGAGTGTATACCATGCAAATCTTTGTATCTCCCAGAAAATTTTCATGGTGGATGATTTCTGTATATCTTGTAGGGAAGgtatgcatcatcaaactgcaaaagtctttggtatttactatttattgtttcaaagatattcattttcatttctgttttcttagtcttgaaacaatgcaactac
tgaacctgagagctaaatgatgaaaattcaagcaatttgctttcttgctttcagGAGTTGGTCTCTTTTTTTTTTCCCTCCCCTGAAAAACAACTACTTTTTCTGCTTATGTTAAAGTGGAGATAACTGGAATATATTTGAAGATGGTGACTGCAATGTTCCTGAAAAGATTTAACAAAACATTTGCTGGGATTCAAGGA
AAGTAACGAACAACATAGTTTGGGTTGTATTTACCTGGAAAGCGTCTTTGAAGCATGTTTAAGATCTATCCAGGAGATAAACGGTTTTGTTATATGAACGGTTTTGTTATATGCATGAAACGATCATATTTCTTTATAAGAGTATCTATATTGTAATCTTGTTTTTGCGAAAGTTTTCTTAATGCATGTTAATGTTACAG
ATTGTTATTGTTATATGAACG

Intron 3 GTATGCATCA ... TATGTTAAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	62.86	26	56	32
A2	57.14	21	30	26
A3	63.83	17	19	41
A4	67.62	17	37	34
A5	54.72	12	8	21
A6	60.04	182	213	334
A7	58.03	183	205	301
A8	63.32	177	236	375
A9	64.37	150	203	339
A10	60.95	99	127	182

>TRINITY_DN101042_c0_g1_i5 from sample A2 / Example spliced isoform

GCTTTGCTGGGCCGGACCAATCAGGGTAACTTCCACCCATCGACACCCCTATTTTAAGTTTTTTAACCAAACCTTATGGCGTATCTACTACGTGTCCACATTTTAGCCGTTCGACTATAAAGCTCTACTATATTTTGAAACCCCACACGAATATCTAAGTCTGGAGTTGCAGACACAGCTCTGCGAGCAACGATCATGGC
GAAGACGGAGTTACAGAGAAAATTAATCGAGATGCGGCTGTTTTCGATAAATTGAAGGCATGTTTTGTAACTCCCCTCCTCCCATTGTAATCAATTTGGATTCTCTGATTTTGAATGAACATTATGTGCGAAAATAATGTGGGATTATAAGGGGTTTGGAATGGCCGGGGAGAATTATGAAACAGACTTGGACGAAATTT
GTGGTGACATGAGAAATCGTGTGGGAATGGGTCATTAGGGTTTGTTGTTTGGCTGAATTCTGCTAGGTTAGATGATTTGAAGGTCTTTATGTTTTCCTTGTTGCTTGACTATTGTTTTGGGGTTTTGGGCATTGGGGACATCTTCCATTGTTAAGCTCTGGTCATTACATTGGAGGGATAAAAATGGATGGCAAACAATT
TTCTGCGGGTCAGGGGATGGGAGTATATAGAAGCATTTCTCCTGAGTGTCAGGGTTAGGATTAGAGTCAGGGTTTGGCATTTTTTGGTAGAAAACGAAAATCAAAATATGGATCTGGTTGACACAAATTTCTCAGCAGATTGCATAGGGCAATTAAGTTTAGCTTGATAATTCTCTGATAGCAAATTATTTGATGTGTTA
TAGAAAAATATTGAAGTCAAGGGCTGCTAAAATGGATGGATTGATAAACCTCTGACTGCATATTGTATGGTTTGTTACAAAAAATATTGAAGTCAAAGACTTAGAAAATGGCTGGCATGGATGGCGGGGACATTAATTTTAGCAGCCATATGTTAGATGATCTTGGTAATGGATCCTCCATGGAGTCCTTTTTCGAGGAG
ATTCTGAGGGACACTACTCATGCCTGCACTCATACCCACACCTGCAACCCCCCTGGGCCGGATAACACGCACACTCACACATGTTTCCACACGCACACAAAAATCCTTGCTGCCCCTGATGGCGAGAAATCTGCGGACACCGCCGAGTCTCCACAAAACAGCTCCTCCAAGCCAAAAAAGCGTCCAGTAGGTAATAGAGA
GGCAGTTAGAAAATACAGGGAAAAGAAGAAGGCTCGGACGGCCTCCCTGGAGGAGGAGGTTTCGCAACTGACCTCTCTTAATCAGCAGTTGATAAGAAGATTACAGGGTCAAGCAGCTTTAGAGGCTGAGATTGCAAGATTGAAGTGCTTGCTGGCTGATTTTAGGGGACGGATTGATGGAGAATTGGGGTCCTATCCCT
ACCAAAAGTCAATTAGAATGGATAAAACTTGCAATGATGCACCATTTCGACAACCGATGCCTGGGGGATATGTCCTGGATCCCTGCAATATTTGGTGCAATGCAGATGCAGCTTGTCATGACCCGACTTTGGCATCCAACAGTGAGGGTGGGGTGCAGCACGAACATGATAGTGGTGCACGTTGGAAAGGTGAGTGTGGC
CAGATGTCAGGCCATTGTCAAGGTTTGAAGGGTGATATGGCAGTCACCACTAGTGGGCTTTCTGCATGCTCAGAGGGTACAGCAACAAAAACAGTGCCTGCTACCGTGGCTTCTTCTGGAAAAGAGAGAAAGGGTACATTTGGTGTGTGACCCAATCCTAGTGAGTGTATACCATGCAAATCTTTGTATCTCCCAGAAAA
TTTTCATGGTGGATGATTTCTGTATATCTTGTAGGGAAGTGGAGATAACTGGAATATATTTGAAGATGGTGACTGCAATGTTCCTGAAAAGATTTAACAAAACATTTGCTGGGATTCAAGGAAAGTAACGAACAACATAGTTTGGGTTGTATTTACCTGGAAAGCGTCTTTGAAGCATGTTTAAGATCTATCCAGGAGAT
AAACGGTTTTGTTATATGAACGGTTTTGTTATATGCATGAAACGATCATATTTCTTTATAAGAGTATCTATATTGTAATCTTGTTTTTGCGAAAGTTTTCTTAATGCATGTTAATGTTACAGATTGTTATTGTTAAAGCTTTTTTAATGCAGGAG

>TRINITY_DN101042_c0_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:

GCTTTGCTGGGCCGGACCAATCAGGGTAACTTCCACCCATCGACACCCCTATTTTAAGTTTTTTAACCAAACCTTATGGCGTATCTACTACGTGTCCACATTTTAGCCGTTCGACTATAAAGCTCTACTATATTTTGAAACCCCACACGAATATCTAAGTCTGGAGTTGCAGACACAGCTCTGCGAGCAACGATCATGGC
GAAGACGGAGTTACAGAGAAAATTAATCGAGATGCGGCTGTTTTCGATAAATTGAAGGCATGTTTTGTAACTCCCCTCCTCCCATTGTAATCAATTTGGATTCTCTGATTTTGAATGAACATTATGTGCGAAAATAATGTGGGATTATAAGGGGTTTGGAATGGCCGGGGAGAATTATGAAACAGACTTGGACGAAATTT
GTGGTGACATGAGAAATCGTGTGGGAATGGGTCATTAGGGTTTGTTGTTTGGCTGAATTCTGCTAGGTTAGATGATTTGAAGGTCTTTATGTTTTCCTTGTTGCTTGACTATTGTTTTGGGGTTTTGGGCATTGGGGACATCTTCCATTGTTAAGCTCTGGTCATTACATTGGAGGGATAAAAATGGATGGCAAACAATT
TTCTGCGGGTCAGGGGATGGGAGTATATAGAAGCATTTCTCCTGAGTGTCAGGGTTAGGATTAGAGTCAGGGTTTGGCATTTTTTGGTAGAAAACGAAAATCAAAATATGGATCTGGTTGACACAAATTTCTCAGCAGATTGCATAGGGCAATTAAGTTTAGCTTGATAATTCTCTGATAGCAAATTATTTGATGTGTTA
TAGAAAAATATTGAAGTCAAGGGCTGCTAAAATGGATGGATTGATAAACCTCTGACTGCATATTGTATGGTTTGTTACAAAAAATATTGAAGTCAAAGACTTAGAAAATGGCTGGCATGGATGGCGGGGACATTAATTTTAGCAGCCATATGTTAGATGATCTTGGTAATGGATCCTCCATGGAGTCCTTTTTCGAGGAG
ATTCTGAGGGACACTACTCATGCCTGCACTCATACCCACACCTGCAACCCCCCTGGGCCGGATAACACGCACACTCACACATGTTTCCACACGCACACAAAAATCCTTGCTGCCCCTGATGGCGAGAAATCTGCGGACACCGCCGAGTCTCCACAAAACAGCTCCTCCAAGCCAAAAAAGCGTCCAGTAGGTAATAGAGA
GGCAGTTAGAAAATACAGGGAAAAGAAGAAGGCTCGGACGGCCTCCCTGGAGGAGGAGGTTTCGCAACTGACCTCTCTTAATCAGCAGTTGATAAGAAGATTACAGGGTCAAGCAGCTTTAGAGGCTGAGATTGCAAGATTGAAGTGCTTGCTGGCTGATTTTAGGGGACGGATTGATGGAGAATTGGGGTCCTATCCCT
ACCAAAAGTCAATTAGAATGGATAAAACTTGCAATGATGCACCATTTCGACAACCGATGCCTGGGGGATATGTCCTGGATCCCTGCAATATTTGGTGCAATGCAGATGCAGCTTGTCATGACCCGACTTTGGCATCCAACAGTGAGGGTGGGGTGCAGCACGAACATGATAGTGGTGCACGTTGGAAAGGTGAGTGTGGC
CAGATGTCAGGCCATTGTCAAGGTTTGAAGGGTGATATGGCAGTCACCACTAGTGGGCTTTCTGCATGCTCAGAGGGTACAGCAACAAAAACAGTGCCTGCTACCGTGGCTTCTTCTGGAAAAGAGAGAAAGGGTACATTTGGTGTGTGACCCAATCCTAGTGAGTGTATACCATGCAAATCTTTGTATCTCCCAGAAAA
TTTTCATGGTGGATGATTTCTGTATATCTTGTAGGGAAGgtatgcatcatcaaactgcaaaagtctttggtatttactatttattgtttcaaagacattcattttcatttctgttttcttagtcttgaaacaatgcaactactgaacctgagagctaaatgatgaaaattcaagcaatttgctttcttgctttcaggagt
tggtctcttttttttttccctcccctgaaaaacaactactttttctgcttatgttaaagTGGAGATAACTGGAATATATTTGAAGATGGTGACTGCAATGTTCCTGAAAAGATTTAACAAAACATTTGCTGGGATTCAAGGAAAGTAACGAACAACATAGTTTGGGTTGTATTTACCTGGAAAGCGTCTTTGAAGCATGT
TTAAGATCTATCCAGGAGATAAACGGTTTTGTTATATGAACGGTTTTGTTATATGCATGAAACGATCATATTTCTTTATAAGAGTATCTATATTGTAATCTTGTTTTTGCGAAAGTTTTCTTAATGCATGTTAATGTTACAGATTGTTATTGTTAAAGCTTTTTTAATGCAGGAG