sp|P52855|RLA1_MAIZE ----> Large ribosomal subunit protein P1
Intron 1 GTCGGTCTTT ... TGTTTAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.55 | 474 | 82.5 | 94 |
| A2 | 16.99 | 513 | 80.5 | 105 |
| A3 | 18.45 | 588 | 77 | 133 |
| A4 | 17.93 | 444 | 72.5 | 97 |
| A5 | 16.79 | 342 | 48.5 | 69 |
| A6 | 18.11 | 9250 | 1403.5 | 2045 |
| A7 | 17.6 | 4971 | 780 | 1062 |
| A8 | 19.06 | 6092 | 900 | 1435 |
| A9 | 18.69 | 5966 | 958 | 1371 |
| A10 | 19.28 | 3764 | 592.5 | 899 |
>TRINITY_DN126645_c3_g2_i4 from sample A1 / Example spliced isoformTGATATGGTTTCGTGGACAATGCGACAACAAAATCAATCAATCCATCTCCTTTAAGGTAGGGCTAGGGTTTTGGAAGGGTAGGGCTAGGGTTTTGGACGAGTGAATGCGGGTTTGCACAACTAAGGTTAGAGCCGTAACAACTTATTTTCTTTGAGAGGGAGAGCAATCAGAGCGACACGGCAAGCGCTTGGAGACATCG
TCGGGCGGAGAAAACAGGAGAAAATCCGGAAGAGGACTGTTGTTGAAGGGGCTTTGAGTTCGTTTTCTCAAGATGTCAGTCAGCGAAGTTGCCTGTACTTATGCAGCGTTGATTCTTTATGATGATGGAATCCCTATTACTGGTGAGAAGATTACCACATTGGTGAAGGCAGCCAATGTCCAAATAGAATCCTATTGGCC
TGGTCTCTTTGCCAAGCTTCTGGAGAAAAGAAACATTGAAGACCTCATTTTGAATGTTGGCTCTGGAGGTGGTGGTGGTGGTGCACCTATTGCAGTTGCTGCTTCTGTTGGTGGCGGCGCTGCTGCTGCTGAGGCTGCCCCTCCGGTTGAAGAGAAAAAGGAGGAACCTAAGGAGGAGAGTGATGAAGACATGGGATTCA
GCTTATTTGATTAAGCAATTTATTTTGGAGTTTAATTATGTAGTTGTAGGTACAAATCAAGTGTTTTTTGTATTATTACAACTTCTTCAAATATGTGAAAATGCGGATGTGTGTTCAGTGCAAACCAGTTTTTTGGTTGCTTGACTTATTTTCTTGCAGACATCATTTATGCTTCTCTTATTTTCTTGTAAGCATCAATT
CTGGTTGTTCAATGATTAACTTTAATATAACCTGTTTTTCAGAGTATCGGTCATTGTAACATATGTTTTGAACCACCTTATCTGTCGATTAAGATTTTGGGTGTAAGCCATATTTTGTATGCTTACTGTAATACTGTCTTGGCTCTTAGCCCATAAGATCTATTCTTTCTACC
>TRINITY_DN126645_c3_g2_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:GCTATTCCTGGACACCAGATCCAATTGAAATCATAGCCCTTCTTGGGGGTGCATCTGCACTGGATGCCTCTGGTTGGGTGGAAAATTACTTGTTCTTATCCAGTTTCTAGGATTTGCTTTGGTTAAAAGATAAGTATCATAATCTCTTCTTATAAATCTACAGTCAAATTCTCTGCTGATATGTAAATATATGGAATATG
TATGCTATGTGTGAGCATGCATTTGCCACGGATTCTGTTTATCTGAGTTATTTTCTGCTACAATTTAATTATTGCAGTGAAGCTTGCATTTCCATAAGTTTTCTGGGCTATTCCTGGACACCAGATCCAGTTTAAGTTATGTTCAAATAGGCTGGAAATTTCCGGAATTTGTTATTGACTTGCATTTCCCTTGGATGTAT
TTCCCCTTAATTTCAGCTGTAGATTGTCCATTTTACTTCCTTTTGGGCTTGGATATTATATTTTTTTTTTGCCTTCAATCTGAGCTCCAGATGATCCATTTTAGCACATAATATTGCTATATATTATTTAAGTGAAACTGTAAAACCTGTGTAGAAACATTTGAGGTTTTCTTAATCCTTTTTTACACTTTTTTTCTTTT
CGCCATATTTGAACTCCAAGTAGACTAGTAAATATCAGGGTTATGCGATAAGAAACTGAAATACTGTTGCAGAGGGTTTTAAGTTTAAGTTTCATCTGCTCTCCTTTTTTTCCTAGTTTCCCCCCTTTAATTTGTGCCCCAAATTGTCCATTTTAGTGCAGTCAAATATAAAATTTGAAGGACTCTAAAACATTTGCAGA
GAAACATAAGCTAATTACTTGTTAGTATTTTCCCTTTCCATTTCGAATTTTGCATATTCTATTTGTTGCATTCCAGATTAACTTAAATTTTAAGGTATGTTGCATTGAAATCATAGCCCTTCTTGGGGGTGCATCTGCACTGGATGCCTCTGGTTGGGTGGAAAATTACTTGTTCTTATCCAGTTTCTAGGATTTGCTTT
GGTTAAAAGATAAGTATCATAATCTCTTCTTATAAATAGAGGACTGTTGTTGAAGGGGCTTTGAGTTCGTTTTCTCAAGATGTCAGTCAGCGAAGTTGCCTGTACTTATGCAGCGTTGATTCTTTATGATGATGGAATCCCTATTACTGGTGAGAAGATTACCACATTGGTGAAGGCAGCCAATGTCCAAATAGAATCCT
ATTGGCCTGGTCTCTTTGCCAAGCTTCTGGAGAAAAGAAACATTGAAGACCTCATTTTGAATGTTGGCTCTGGAGGTGGTGGTGGTGGTGCACCTATTGCAGTTGCTGCTTCTGTTGGTGGCGGCGCTGCTGCTGCTGAGGCTGCCCCTCCGGTTGAAGAGAAAAAGgtcggtcttttgtttctaaaaatatgttatttc
ctcgtaaattggccttgcactactatgaattgtgcttccaaagactggccaatagtgctggtagtagattatctgtttctgatctatgttttttgtttaacagGAGGAACCTAAGGAGGAGAGTGATGAAGACATGGGATTCAGCTTATTTGATTAAGCAATTTATTTTGGAGTTTAATTATGTAGTTGTAGGTACAAAT
CAAGTGTTTTTTGTATTATTACAACTTCTTCAAATATGTGAAAATGCGGATGTGTGTTCAGTGCAAACCAGTTTTTTGGTTGCTTGACTTATTTTCTTGCAGACATCATTTATGCTTCTCTTATTTTCTTGTAAGCATCAATTCTGGTTGTTCAATGATTAACTTTAATATAACCTGTTTTTCAGAGTATCGGTCATTGT
AACATATGTTTTGAACCACCTTATCTGTCGATTAAGATTTTGGGTGTAAGCCATATTTTGTATGCTTACTGTAATACTGTCTTGGCTCTTAGCCCATAAGATCTATTCTTTCTACC