NA ----> NA


Intron 1 GTAATTTCAT ... TGGCCGAAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A17539.5120117
A275.24267682
A367.484010660
A473.832.510182
A57518.55655
A6607513491
A776.7558222161
A871.0777.5198182
A967.5270.5150143
A1066.2566.5152109



>TRINITY_DN120453_c2_g1_i16 from sample A3 / Example spliced isoform
CTTGAGGATCAGTTGTATTTCAAATCCTGAGGATCAGTTGTATGAAACGGCATTTTTTATCAAAACGCAAATCCTGAGGTTACTTTATATTTTTTGAAAAAGCAAAACCTGATACTTTATATTTTTTGAAAAAGCAAAACGGGAGTAGCCGTTGTACGATAACGTCCAGCGTGGTTGAGGTTACTTGGAAAGTCTTGTTA
TTGGCTTTCAGAACTGCTTGGAAACCGCTGTTATTGTTGTTGGGTTTAAGATCTTTGATTAATCAATATCCGTCAATTGATTCAAGTCACTGCTCTCGATTCGGCAGCTTCTTCATGATGGACGGCAGATGAAAATTATAACTACTAGGCAAGCCAATCATCGCTGGCTTCCCTTCCTTGGCTATGATGGGACAGAAGAG
GAGCTTCATGTAAATTACATCCTAAATTGCTGCATAACTTGCTTTCATGTTGGATGGCGCTATAATTTACAGTGCCTCTTAATCATCTTGTTTGAATATTACAATGCTTCTTTATCATCTTTCTTGATGGATTGCTTGTCCATTAATTAGTGATGGTGGATTTTGGTTCATCTAGAGGGTAGCGGCCCAGCGGGTTCAAT
TTGCAATGGAATGGCATCTCGGAGCCAGGATGACTTGAC


>TRINITY_DN120453_c2_g1_i11 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CTTGAGGATCAGTTGTATTTCAAATCCTGAGGATCAGTTGTATGAAACGGCATTTTTTATCAAAACGCAAATCCTGAGGTTACTTTATATTTTTTGAAAAAGCAAAACCTGATACTTTATATTTTTTGAAAAAGCAAAACGGGAGTAGCCGTTGTACGATAACGTCCAGCGTGGTTGAGGTTACTTGGAAAGTCTTGTTA
TTGGCTTTCAGAACTGCTTGGAAACCGCTGTTATTGTTGTTGGGTTTAAGATCTTTGATTAATCAATATCCGTCAATTGATTCAAGTCACTGCTCTCGATTCGGCAGCTTCTTCATGATGGACGGCAGATGAAAATTATAACTACTAGGCAAGCCAATCATCGCTGGCTTCCCTTCCTTGGCTATGATGGGACAGAAGAG
GAGCTTCATGTAAATTACATCCTAAATTGCTGCATAACTTGCTTTCATGGTGAGAGACGAAAAGATTTCATAAATTGCTTCATAACCGAATTCATGGTTATCTTACCATGAATCGACTTTTTTCATATAATTGCGATTTAAGGATCCTCTTTTTCTGACGTTAATGATTTCGGCTCTAATTAATTTTGTGTTACAGTTGG
ATGGCGCTATAATTTACAGTGCCTCTTAATCATCTTGTTTGAATATTACAATGCTTCTTTATCATCTTTCTTGATGGATTGCTTGTCCATTAATTAGTGATGGTGGATTTTGGTTCATCTAGAGgtaatttcatttcattgggttttaagcaaaaccatttatctgtcagcaaaagcctcaattagtgccagataaatag
cgcctaaagttaattcataatgattccaacttcttgtcttcagtttatgtgttgattgctgtgaatttgatataaagctttttaatgtgaaaatatttgtttggtgtttatggccgaaag
GGTAGCGGCCCAGCGGGTTCAATTTGCAATGGAATGGCATCTCGGAGTTAAACCCTAATTCTTCTTGCGACCA




Intron 2 GTAATTTCAT ... ATGGCGAAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A163.9377115158
A264.515275114
A357.8699891
A464.155798106
A560425670
A649.53135135130
A758.84170211275
A858.16173221260
A955.52143158199
A1055.89131155177



>TRINITY_DN46529_c2_g1_i13 from sample A8 / Example spliced isoform
GGAATTGAGCGGTCTTTGCACAGTTGGATGGCGCTATAATTTACTGTGCCTCTTAATCATCTTGTTTGAATATTACAATGCTTCTTTATCATCTTTCTTGATGGATTGCTTGTCCATTAATTATTGATGGTGGATTTTGGTTCATATAGAGGGTAGCGGCCCAGCGGGTTCAATTTGCAATGGAATGGCATGGCGGAGTT
AAACCCTAATTCTTCTTGCGGCCATTTATGCTTTAAATCTGTCAAAAGAGTGCTTAACTTTCCGTTATTGTTATTCTTTTCTGATTATTGGAACCTGTTATTAGCATTAATGGCCCTTTCTTTAATATTATCCGTCCTGAAATCCTGTGGGTTCAACTACGTTATAACATCGTCGTTGATAAAAACCTCAGGAATCAACT
AAGGATTATTCATTTCCAACACTGTTTTTTAGCCTCTTAACGTCGCGGGTTCAATTCCCCCAGTCCCCGTATTTGACTTATAATGATTTCCCAGGTAACTTTTCGTTTCTGACCTTGAAATCTTTCCATATCCTCTTGAGCTAAGATGTCTTGAAACTCCAAAAGACATCTACGGAATTAAGCCATGGGATTGAACATGT
AGTGAAAAATAAACAATGCTAGAGTAAGTCTTATGATCATTTAAAAAAAAGCATAAATTCATTGATTGGGTACTGATTTTCTGTTATTTGCCAACGATTCTTGTGCTTTATAATTTCTCCTTTTCCAACTAAATTTTCAGTTACAATCAATGTTTTTCATCAAAGTGTAACTCAAATATATTGCTGGTTCACGATATCCA
TGTCGCTCATGAAATCCACATTTTTGGCATTAGCATTTAGATATTCGTTTTATTTTAATAAAATTAGCTATTCTCCTGTCTCATTTAATTGTTTATATCCTTTGCCATCCGGACGTTGTGGTTTTCGATTCCTTTCTAATGTCATTTCTGCCCTAAGTCACTTAAAGAGTGTTTCAATTCCAGTTATAATGGTTTCCTCT
TCAGTTCCACTTATATGTTTTCCTGTACAAATGGCAATCAAATAAAAAATTGAGGGAGCTTTATTATTTAAGACTACCATAACTTTTTTCTTATTAAAATAAATATTTTGACAGATAATCACGTGAATAGGATGAAGTTGTTGGTTAATGAGTATAGATTTATTTAAATTAAAATTTATTAAATATTTAGAGGGACAAAA
ATTTAAGTATATTTTTTAATTTATTTTAATTAATTAGATATTAAAATTTTTATGGTGATTTATTTATTTCTTTTATATAAATTTATTCCAAATATTTTGTGATTGTGAATTGTTTTAGTAATTTAATTTTAATGTTTAGATTTTGATTTTGGAAAAAAGTAGGAAACAATTTTTGAGTACCAAGATTTTTAAAATGTGCC
ACGGGGAGATTAGTTGTATTGTGGTTTTGAAAAGTTTCAACATTTTTAATAAACACTACAATCATCTTACAATATTTTTTTTAATTTCTTATTGGTTGATGGAC


>TRINITY_DN46529_c2_g1_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:
ATTGTATGAGTTGAATCGAAGCTGAGGAATGGCTTTCACATCGACCGCTCATATAAGGTGAGGTAAGAGATCTATTTCCTCATTTTCTTTGTTTTCAAACCCGGTAATTAATAAATTGGCTAGATGCTTTGTTACATATCTTTCCATCTGTGAGTTATTGGTTACAATTTCAATCCATTGAGATTTAGGATTTGTGGTTT
CTTTGTTATTTGTAGTTTCTTTGTTATTTGTAGGCAATGAAGATTTGATGTAAATGGCGTACAGGGGAATTGAGCGGTCTTTGCACAGATAAGCATTTTCTTTTTTTAACAGCTTGTCTCTGTTTTTCTCCTGTAATTTCTTTTTTTTTTACCTAAAGTATATGGAATTTACATTGAGTTTGTATGTTTGATTCCTATGT
GTTTTTTTCAAAGTCTCCTTTCTTTTTCCTCTTAATTTTGTGTTACAACCACTGCTTTTTCCCTCTAATTGTGATTTAAGGATCCTCTTTTTCTGCCATTAATGATTTCGGCTCTAATTGATTTTGTGTTACAGTTGGATGGCGCTATAATTTACTGTGCCTCTTAATCATCTTGTTTGAATATTACAATGCTTCTTTAT
CATCTTTCTTGATGGATTGCTTGTCCATTAATTATTGATGGTGGATTTTGGTTCATATAGAGgtaatttcatttcattgggttttcagcaaaaccatttatctgtcaacaaaagcctcaattagtgccattcttacgataaatagcgcctaaagttaattcataatgattccaacttcttggtttccgtttatctgttga
tttctgtgaatttggtataaagctttttaatgtgaaaatttttgtttggtgtttatggcgaaag
GGTAGCGGCCCAGCGGGTTCAATTTGCAATGGAATGGCATGGCGGAGTTAAACCCTAATTCTTCTTGCGGCCATTTATGCTTTAAATCTGTCAAAAGAGTGCTTAACTTTCCGTTATTGTTATTCTTTTCTGATTA
TTGGAACCTGTTATTAGCATTAATGGCCCTTTCTTTAATATTATCCGTCCTGAAATCCTGTGGGTTCAACTACGTTATAACATCGTCGTTGATAAAAACCTCAGGAATCAACTAAGGATTATTCATTTCCAACACTGTTTTTTAGCCTCTTAACGTCGCGGGTTCAATTCCCCCAGTCCCCGTATTTGACTTATAATGAT
TTCCCAGGTAACTTTTCGTTTCTGACCTTGAAATCTTTCCATATCCTCTTGAGCTAAGATGTCTTGAAACTCCAAAAGACATCTACGGAATTAAGCCATGGGATTGAACATGTAGTGAAAAATAAACAATGCTAGAGTAAGTCTTATGATCATTTAAAAAAAAGCATAAATTCATTGATTGGGTACTGATTTTCTGTTAT
TTGCCAACGATTCTTGTGCTTTATAATTTCTCCTTTTCCAACTAAATTTTCAGTTACAATCAATGTTTTTCATCAAAGTGTAACTCAAATATATTGCTGGTTCACGATATCCATGTCGCTCATGAAATCCACATTTTTGGCATTAGCATTTAGATATTCGTTTTATTTTAATAAAATTAGCTATTCTCCTGTCTCATTTA
ATTGTTTATATCCTTTGCCATCCGGACGTTGTGGTTTTCGATTCCTTTCTAATGTCATTTCTGCCCTAAGTCACTTAAAGAGTGTTTCAATTCCAGTTATAATGGTTTCCTCTTCAGTTCCACTTATATGTTTTCCTGTACAAATGGCAATCAAATAAAAAATTGAGGGAGCTTTATTATTTAAGACTACCATAACTTTT
TTCTTATTAAAATAAATATTTTGACAGATAATCACGTGAATAGGATGAAGTTGTTGGTTAATGAGTATAGATTTATTTAAATTAAAATTTATTAAATATTTAGAGGGACAAAAATTTAAGTATATTTTTTAATTTATTTTAATTAATTAGATATTAAAATTTTTATGGTGATTTATTTATTTCTTTTATATAAATTTATT
CCAAATATTTTGTGATTGTGAATTGTTTTAGTAATTTAATTTTAATGTTTAGATTTTGATTTTGGAAAAAAGTAGGAAACAATTTTTGAGTACCAAGATTTTTAAAATGTGCCACGGGGAGATTAGTTGTATTGTGGTTTTGAAAAGTTTCAACATTTTTAATAAACACTACAATCATCTTACAATATTTTTTTTAATTT
CTTATTGGTTGATGGAC




Intron 3 GTGAGTTTCT ... TTATTTGTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A117.892808438
A217.443037256
A315.763187049
A412.253085828
A514.431753425
A61.1924594217
A71.6229706929
A80.9928073818
A91.1926534321
A101.529966328



>TRINITY_DN109487_c1_g1_i6 from sample A4 / Example spliced isoform
TGTGAGTCTGTGCTGTATGTTATATTATGTCTATGCTGTATGTTATGTTCATTGTTGTGTTTTGTGAGTCAATGTTAATGTATTCTTACCTTCGATATTTCGGCATGGCATATCGAAGCTGAGGAATGGCTTTCACATCGACCGCTCATATAAGGCAATGAAGATTTGATGTAAATGGCGTACAGGGGAATTGAGCGGTC
TTTGCACAGATAAGCATTTTCGTGCCATTCATACGATCAACAAAAACCCTTTATCTCTCAACAAAAGCCTCAATTAGTGCCATTCATACGATAAATCATGCCGAAAATCAGTTCATAATGATTCCAACTTCTTGTTTTCCGTTTATCTGTTGATTGCTGTCAATTTGATATCAAGCTTTTTAATGTGAAAATATTTGTTT
GGTGTTTATGGCCGAAAGGGTAGCGGGTTCAATTTTCAATAGGATGGCATCGCCGAGTAAAATCTGTCAAAAGAGTCAGTAACTTTGGAACCTGATATTAGCATCAATGGACATTTCTTAGTGTTGATCATTCATTTCAACACTATTTTTTGGCCTCTCAACGTCGCGGGTTCAATTTCGCCAGTGCTCCGATTTGACTT
ATAAAATTTCCCATGAAATTCCAATAGACATCTACGGAATTAAGCCATGGGATTGGACATGCAGTGAAAAGAAATTATGCCTAGAGTAAGTCTTATGATAATTTAAATAAAGCATAAATTCTTGAAAGTCTTATGATAATTTAAATAAAGCATAAATTCTTGATAGGTACCGACTTTCCGTTTTTTTATTGCTCTCGATT
TGATATGAATATTGTAATGGCTTGTAATCCCGGGTTAGATTCATGTAGAATGGAGTCGCTGGATAAATCTTGAAAGAGTTATAATCTTTGCAGCCTCAACTCCGGTTCGACTCCTGTGCTTTACCTTTATTTTTCTGATGTCGTTCATCAAAGTGTCACTCATATGTTGCCCATGTCCATGATGAAACCCCACATTCTTT
CCATTGCCTTTGTTGTTGTTCTCGATCATGACCATTTCTTATATGAAAGTTAAGATTTCTATATTAGTTTTAGACATTTAGCATTTATACATTTGTTTTATTTTATCTTACTTTTGGACATTACATTGAAACTTCGGGTTGAATTTCAGTCCAGAATGACTACGACTT


>TRINITY_DN109487_c1_g1_i5 from sample A4 / Example unspliced isoform:
GTTGTGTTTTGTGAGTCAATGTTCATTGTTGTGTTTTGTGAGTCAATGTTAATGTATTCTTACCTTCGATATTTCGGCATGGCATATATTGTATGAGTTGAATCGAAGCTGAGGAATGGCTTTCACATCGACCGCTCATATAAGgtgagtttctttgttatttgtagGCAATGAAGATTTGATGTAAATGGCGTACAAGG
GAATTGAGCGGTCTTTGCACAGATAAGCATTTTC




Intron 4 GTTAAACCCT ... TGTTTTTTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A177.052811474
A29089153
A371.03318864
A481.61167666
A586.5265522
A679.5234155109
A785.5742311187
A888.3633273228
A990.6721238170
A1091.316201135



>TRINITY_DN43659_c2_g1_i11 from sample A7 / Example spliced isoform
CTTTTTAATGTGAAAATATTTGTCTGGTGTTGATGGCCGAAAGGGTAGCGGCCCAGCGGGTTCAATTTGCAATGGAATGGCATCTCGGACCTCTTAACGTCGCGGGTTCAATTCCGCCAGGCCAGGATGACTTGACGGTAGTGGAGATGAATCCCTCCGGAGGGATAGACAGGAATCGCTACGGTGAAATGTAATCAATT
CAATACGTTGGATTCTGCTGGCCTATGTGATCATAAGGATTCTTGGTAGGTTTTCAAGGCCCTT


>TRINITY_DN43659_c2_g1_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:
CTTTTTAATGTGAAAATATTTGTCTGGTGTTGATGGCCGAAAGGGTAGCGGCCCAGCGGGTTCAATTTGCAATGGAATGGCATCTCGGAgttaaaccctaattcttcttgcgaccatttatgttttaaatctgtcaaaagagtggttaactttccattattgttgttcttttctgattattggaacctgttattagcatt
aatggccctttctttaatattatccgtcctgaaatcctgtgggttcaactacgttataacatcgtcgttgataaaaacctcaagaatcaactaaggattattcatttccaacactgttttttag
CCTCTTAACGTCGCGGGTTCAATTCCCCCAGTCCCCGTATTTGACTTATAATGATTTCCCAGGTAACTTTTCGTTT
CTGACCTTGAAATCTTTCCATATCCTCTTGAGCTAAGGTGTCTTGAAACTCCAAAAGACATCTACGGAATTAAGCCATGGGATTGAACATGTGAAAAATAAACAATGTTCGTGGGAGTTCGGTTCCCTTATGGTTCTGTCGTGTTTATTAAATCACATCCAGCTAGCTGTTTGTTGCTCTCGATTTGATATGGATCTTAT
AATGGGTTGTAATGCTGCGGTAGATTCATGTAGAATGAAATCGTTGGATAAACTTTTAAAGAGTGTAATTTAATTGATGATAAATGGTGGTTCACGACTTTGCAGCCTCAGCACCTGAGATTCGATTACTTTGCAGCCTCAGCACCTGAGATTCGATTCGCGTGCTTTACATTTTCTCTCTTTCCAACTAAATTTTCAGT
TACAATCAATGTTTTTCATCAAAGTGTAACTCAAATATATTGCTGGTTCACGATATCCATGTCGCTCATGAAATCCACATTTTTGGCATTAGCATTTAGATATTCTTTTTATTATAATAAAATTAGTTATTCTCCCG




Intron 5 GTAAGAGATC ... TTATTTGTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A152.18010965
A238.53714940
A329.89613715
A443.43565333
A545.76323222
A643.36323316
A746.05586633
A846.22323025
A943.24424717
A1050597048



>TRINITY_DN109487_c1_g1_i5 from sample A4 / Example spliced isoform
GTTGTGTTTTGTGAGTCAATGTTCATTGTTGTGTTTTGTGAGTCAATGTTAATGTATTCTTACCTTCGATATTTCGGCATGGCATATATTGTATGAGTTGAATCGAAGCTGAGGAATGGCTTTCACATCGACCGCTCATATAAGGTGAGTTTCTTTGTTATTTGTAGGCAATGAAGATTTGATGTAAATGGCGTACAAGG
GAATTGAGCGGTCTTTGCACAGATAAGCATTTTC


>TRINITY_DN109487_c1_g1_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:
GTTGTGTTTTGTGAGTCAATGTTCATTGTTGTGTTTTGTGAGTCAATGTTAATGTATTCTTACCTTCGATATTTCGGCATGGCATATATTGTATGAGTTGAATCGAAGCTGAGGAATGGCTTTCACATCGACCGCTCATATAAGGTGAGgtaagagatccatttgctcctttctctgttacaaatctttccatctgtgag
ttattggttacaatttcaatccattgagatttaggatttgtggtttctttgttatttgtag
TTTCTTTGTTATTTGTAGGCAATGAAGATTTGATGTAAATGGCGTACAAGGGAATTGAGCGGTCTTTGCACAGATAAGCATTTTCTTTTTTTAACAGCTTGTCTCTGTTTTTCTCCTGTAATTTCTTTTTTTTTACCTA
AAGTATATGGAATTTACATTGAGTTTGTATGTTTGATTCCTATGTGTTTTTTTCAAAGTCTCCTTTCTTTTTCCTCTTAATTTTGTGTTACAACCACTGCTTTTTCCCTCTAATTGTGATTTAAGGATCCTCTTTTTCTGCCATTTTATGATTTCGTCTCTAATTAATTTTTTGTTGCAGTTGGAGGGTTTGCAATGCCT
CCTTATCATCTTTCCTGCTGGAATGCTTGTCCATTAATCATTGATTGTGAATTTTGGTTCATCCAGAGGTAATTTTATTTCATTGGCTTGAATTCGTGAACTCGTTTTTCAACAAAACCCTTTATCTCTCAACAAAAGCCTCAATTAGTGCCATTCATACGATAAATCATGCCGAAAATCAGTTCATAATGATTCCAACT
TCTTGTTTTCCGTTTATCTGTTGATTGCTGTCAATTTGATATCAAGCTTTTTAATGTGAAAATATTTGTTTGGTGTTTATGGCCGAAAGGGTAGCGGGTTCAATTTTCAATAGGATGGCATCGCCGAGTAAAATCTGTCAAAAGAGTCAGTAACTTTGGAACCTGATATTAGCATCAATGGACATTTCTTAGTGTTGATC
ATTCATTTCAACACTATTTTTTGGCCTCTCAACGTCGCGGGTTCAATTTCGCCAGTGCTCCGATTTGACTTATAAAATTTCCCATGAAATTCCAATAGACATCTACGGAATTAAGCCATGGGATTGGACATGCAGTGAAAAGAAATTATGCCTAGAGTAAGTCTTATGATAATTTAAATAAAGCATAAATTCTTGAAAGT
CTTATGATAATTTAAATAAAGCATAAATTCTTGATAGGTACCGACTTTCCGTTTTTTTATTGCTCTCGATTTGATATGAATATTGTAATGGCTTGTAATCCCGGGTTAGATTCATGTAGAATGGAGTCGCTGGATAAATCTTGAAAGAGTTATAATCTTTGCAGCCTCAACTCCGGTTCGACTCCTGTGCTTTACCTTTA
TTTTTCTGATGTCGTTCATCAAAGTGTCACTCATATGTTGCCCATGTCCATGATGAAACCCCACATTCTTTCCATTGCCTTTGTTGTTGTTCTCGATCATGACCATTTCTTATATGAAAGTTAAGATTTCTATATTAGTTTTAGACATTTAGCATTTATACATTTGTTTTATTTTATCTTACTTTTGGACATTACATTGA
AACTTCGGGTTGAATTTCAGTCCAGAATGACTACGACTT




Intron 6 GTGAGAGACG ... TGTGTTACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A148.22111.712682
A244.69869049
A342.95898450
A443.06121.710975
A540.27664841
A638.51399381
A744.17189157142
A846.32153123141
A938.85167.712192
A1036.7173.398103



>TRINITY_DN120453_c2_g1_i6 from sample A3 / Example spliced isoform
CTTGAGGATCAGTTGTATTTCAAATCCTGAGGATCAGTTGTATGAAACGGCATTTTTTATCAAAACGCAAATCCTGAGGTTACTTTATATTTTTTGAAAAAGCAAAACCTGATACTTTATATTTTTTGAAAAAGCAAAACGGGAGTAGCCGTTGTACGATAACGTCCAGCGTGGTTGAGGTTACTTGGAAAGTCTTGTTA
TTGGCTTTCAGAACTGCTTGGAAACCGCTGTTATTGTTGTTGGGTTTAAGATCTTTGATTAATCAATATCCGTCAATTGATTCAAGTCACTGCTCTCGATTCGGCAGCTTCTTCATGATGGACGGCAGATGAAAATTATAACTACTAGGCAAGCCAATCATCGCTGGCTTCCCTTCCTTGGCTATGATGGGACAGAAGAG
GAGCTTCATGTAAATTACATCCTAAATTGCTGCATAACTTGCTTTCATGTTGGATGGCGCTATAATTTACAGTGCCTCTTAATCATCTTGTTTGAATATTACAATGCTTCTTTATCATCTTTCTTGATGGATTGCTTGTCCATTAATTAGTGATGGTGGATTTTGGTTCATCTAGAGCGGCCCAGCGGGTTCAATTTGCA
ATGGAATGGCATCTCGGACCTCTTAACGTCGCGGGTTCAATTCCGCCAGTCCTCCGATTTGACTTATAAAGATTTCCCATGTAGGCCAGCAACTTTTCGTCTCTGATCTTGAAATCTTTCCATCTCTGACCATGAATTGCTTCATAACCATCAATTGCTAGAGCTGGTTATCTTTCTCACAGATATAGAACCTTAATATT
TCTGACAGAGGAGAATATGATCAATTAGCAGGTTTGTGTGTTCGTGGTATAACCTCCGCGCCACCGGAGTATACTGGTTATCTTTATCTCCGAAGGTGACATTGCTGTGAGTATACTCGTGTTTTTGTGGGTTGTGTGTATACTTTGTTTTTCTGTGTATATACTCTGTCTTGGTAGGTCTGGTAGATCCGCTCTTTGTT
TGCAGGCCAGGATGACTTGACGATAGTGGAGATGAATCCCTCCTGAGGGATTCACAGGAATCCCTACGGTGAAATG


>TRINITY_DN120453_c2_g1_i11 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CTTGAGGATCAGTTGTATTTCAAATCCTGAGGATCAGTTGTATGAAACGGCATTTTTTATCAAAACGCAAATCCTGAGGTTACTTTATATTTTTTGAAAAAGCAAAACCTGATACTTTATATTTTTTGAAAAAGCAAAACGGGAGTAGCCGTTGTACGATAACGTCCAGCGTGGTTGAGGTTACTTGGAAAGTCTTGTTA
TTGGCTTTCAGAACTGCTTGGAAACCGCTGTTATTGTTGTTGGGTTTAAGATCTTTGATTAATCAATATCCGTCAATTGATTCAAGTCACTGCTCTCGATTCGGCAGCTTCTTCATGATGGACGGCAGATGAAAATTATAACTACTAGGCAAGCCAATCATCGCTGGCTTCCCTTCCTTGGCTATGATGGGACAGAAGAG
GAGCTTCATGTAAATTACATCCTAAATTGCTGCATAACTTGCTTTCATGgtgagagacgaaaagatttcataaattgcttcataaccgaattcatggttatcttaccatgaatcgacttttttcatataattgcgatttaaggatcctctttttctgacgttaatgatttcggctctaattaattttgtgttacagTTGG
AT
GGCGCTATAATTTACAGTGCCTCTTAATCATCTTGTTTGAATATTACAATGCTTCTTTATCATCTTTCTTGATGGATTGCTTGTCCATTAATTAGTGATGGTGGATTTTGGTTCATCTAGAGGTAATTTCATTTCATTGGGTTTTAAGCAAAACCATTTATCTGTCAGCAAAAGCCTCAATTAGTGCCAGATAAATAG
CGCCTAAAGTTAATTCATAATGATTCCAACTTCTTGTCTTCAGTTTATGTGTTGATTGCTGTGAATTTGATATAAAGCTTTTTAATGTGAAAATATTTGTTTGGTGTTTATGGCCGAAAGGGTAGCGGCCCAGCGGGTTCAATTTGCAATGGAATGGCATCTCGGAGTTAAACCCTAATTCTTCTTGCGACCA




Intron 7 GTAAGAGATC ... TTATTTGTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A168.79224750
A284.6262640
A353.4910716
A474.03102334
A595.3511823
A647.1714817
A736.69441932
A832.26421426
A946.99221524
A1062.89181843



>TRINITY_DN122972_c0_g1_i5 from sample A2 / Example spliced isoform
CTGAGGAATGGCTTTCACATCGACCGCTCATATAAGGTGAGGCAATGAAGATTTGATGTAAATGGCGTACAAGGGAATTGAGCGGTCTTTGCACAGATAAGCATTTTCTTTTTTTAACAGCTTGTCTCTGTTTTTCTCCTGTAATTTCTTTTTTTTTTACCTAAAGTATATGGAATTTACATTGAGTTTGTATGTTTGAT
TCCTATGTGTTTTTTTCAAAGTCTCCTTTCTTTTTCCTCTTAATTTTGTGTTACAACCACTGCTTTTTCCCTCTAATTGTGATTTAAGGATCCTCTTTTTCTGCCATTTTATGATTTCGTCTCTAATTAATTTTTTGTTGCAGTTGGAGGGTTTGCAATGCCTCCTTATCATCTTTCCTGCTGGAATGCTTGTCCATTAA
TCATTGATTGTGAATTTTGGTTCATCCAGAGGTAATTTTATTTCATTGGCTTGAATTCGTGAACTCGTTTTTCAACAAAACCCTTTATCTCTCAACAAAAGCCTCAATTAGTGCCATTCATACGATAAATCATGCCGAAAATCAGTTCATAATGATTCCAACTTCTTGTTTTCCGTTTATCTGTTGATTGCTGTCAATTT
GATATCAAGCTTTTTGATGTGAAAATATGTGTTTGGTGTTTATGGCCGAAAGGGTAGCGGGTTCAATTTTCAATAGGATGGCATCGCCGAGTAAAACCCTAATTCTTGTTGCTGCCCTTTATTATGTTTTAAATCTGTCAAAAGAGTCAGTAACTTTCCGTTATTGTTGTTCTTTCCTGATTATTGGAACCTGATATCAG
CATCAATGGCCATTTCTTTAATATTATCCGGCCTGAAATCCCATGGGTTCGTCTCCGATATAACATCGTCGTTGAAAAGACCTCAGGAATCAACTAAGGATCATTCATTTCAACACTATTTTTTGGCCTCTCAATGTCGCGGGTTCAATTCCGCCAGTGCTCCGATTTGACTTATAA


>TRINITY_DN122972_c0_g1_i2 from sample A2 / Example unspliced isoform:
TGAGAACATTGTTCCAGTTTTGGATTTTTTAAGTGTTTAAACATTTGTAGGAAGGAGCATCATTGATTTTAACATCGTGGATGTTGCTGGAAATAGCTTATATATGAGAACATTGTTCCAGTTTTGGATTTTTTAATCTCCTCCCTGCGATTTCTGCTTCTGCGTCTCCTCTCAGGTGGTGTTTGGTGTGCTTTTTAATG
CTTTGGAGCGCTCATTGTTGTGTGATGTATGTTATGTCTGTGCTGTATGTTATGTTTGCCTGTGTGTTGTGTTGTTTAGTTTCTTTTTTGTTTGTGTATTTGTGAATCAATGTTAATGTATTCTTACCGTGATGTATGTTATGTTTGTCTGTTGTGATAACTGAGAGGAAGGGAGGCAAATTTATATTTGGACATGGCAT
ATATTGTATGATACGAATAGAAGCTGAGGAATGGCTTTCACATCGACTTCTCATATAAGGTGAGgtaagagatccatttgctcctttctctgttacaaatctttccatctgtgagttattggttacaatttcaatccattgagatttaggatttgtggtttctttgttatttgtagtttctttgttatttgtagGCAATG

AAGATTTGATGTAAATGGCGTACAAGGGAATTGAGCGGTCTTTGCACAGATAAGCATTTTCTTTTTTTAACAGCTTGTCTCTGTTTTTCTCCTGTAATTTCTTTTTTTTTTACCTAAAGTATATGGAATTTACATTGAGTTTGTATGTTTGATTCCTATGTGTTTTTTTCAAAGTCTCCTTTCTTTTTCCTCTTAATTTT
GTGTTACAACCACTGCTTTTTCCCTCTAATTGTGATTTAAGGATCCTCTTTTTCTGCCATTTTATGATTTCGTCTCTAATTAATTTTTTGTTGCAGTTGGAGGGTTTGCAATGCCTCCTTATCATCTTTCCTGCTGGAATGCTTGTCCATTAATCATTGATTGTGAATTTTGGTTCATCCAGAGGTAATTTTATTTCATT
GGCTTGAATTCGTGAACTCGTTTTTCAACAAAACCCTTTATCTCTCAACAAAAGCCTCAATTAGTGCCATTCATACGATAAATCATGCCGAAAATCAGTTCATAATGATTCCAACTTCTTGTTTTCCGTTTATCTGTTGATTGCTGTCAATTTGATATCAAGCTTTTTGATGTGAAAATATGTGTTTGGTGTTTATGGCC
GAAAGGGTAGCGGGTTCAATTTTCAATAGGATGGCATCGCCGAGTAAAACCCTAATTCTTGTTGCTGCCCTTTATTATGTTTTAAATCTGTCAAAAGAGTCAGTAACTTTCCGTTATTGTTGTTCTTTCCTGATTATTGGAACCTGATATTAGCATCAATGGCCATTTCTTTAATATTATCCGGCCTGAAATCCCATGGG
TTCGTCTCCGATATAACATCGTCGTTGAAAAGACCTCAGGAATCAACTAAGGATCATTCATTTCAACACTATTTTTTGGCCTCTCAATGTCGCGGGTTCAATTCCGCCAGTGCTCCGATTTGACTTATAATGATTTCCCATGTAGGCCAGAAACTTTTAGTCTTGAAATCTTTCTATATCTTTTGAGCTAAGATATCATG
AAATTCCAATAGACATCTACGGAATTAAGCCATGGGATTGAACATGTAGTGAAAAGAAATTATGCCTAGAGTAAGTCTTATGATAATTTAAATAAAGCATAAATTCTTGAAAGTCTTATGATAATTTAAATAAAGCATAAATTCTTGATCAGGTACTGACTTTCCGTGTTTTTGTTGCTCTCGATTTGATATGAATATTG
TAATGGCTTGTAATCCCGGGTTAGATTCATGTAGAATGGAGTCGCTGGATAAATCTTGAAAGAGTTATAATCTTTGCAGCCTCAACGCCTCCGGTTCGACTCCTGTGCTTTACCTTTCCTTTTCTGATGTCGTTCATCAAAGTGTGATTAATATTTATATATTTTATGATAAATTTAATATTAATATTTGTCGTAACGGT
TTAAAAATTACCACAAGGATCTAAACAAATCCAAATATAATCCTTAATGGATGTAAAATCTTTATGTACATATGCCGTTTAATTTGCGCGCTATTGAGTTGTTGGCAGCTATAACGCTCAATTCTGATAGGGCTATGTTATTAAAATAAAATCTCAAATTTCAAATGGTAAGCATTAATCCAATGAGACTATCAATCAAT
TTCTTAATTTTTTTAAATTTTTTTTATGTTTTTTAATATATAGAGAGAGAGTAATACTATATTTTTTTATTCAAATAACCCTGTTCTGGATGGCAACGAGTTCGAACCTCAAAGTTTTTAGTGGAAGAGTTCTACTTTCGGATTTTTTAAGTGTTCGTGTTTAAACATTTGTAGGAAGGAGCATCATTGATTTTAACATC
GTGGATGTTGCTGGAAATAGCTTATATATGAGAACATTGTTCCAGTTTTGGTTTATAATGATTTTTCATATAAACCCA




Intron 8 GTATGTTATG ... CATATCGAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A281.9859158379
A379.8569201346
A471.1294135328
A576.164985228
A674.0170312792725
A778.8568116533424
A875.5172614183060
A971.7684014662803.5
A1079.0271218963469



>TRINITY_DN122972_c0_g1_i24 from sample A2 / Example spliced isoform
AATGACGTATAACCTTCCATCATACAAACTTGATCCATCCAACGGCTATAAAAGAGGATTTTTTTAACCGTTGGGCCATGGCAGCCTGACAATGACGTATAAAATAAAAAAGGAATCCATATTCAAGCATTCTCCTACTTATTCCTTCTTGATTTTTATATCCTTCGTGCGATTTCTGCTTCTGCTTCTCATCTCAGGCG
GTGTTTGGTGTGCTTTTTAATGCTTTGGAGGGTTCATTGTTGTGCGTGATCTGAGGAATGGCTTTCACATCGACCGCTCATATAAGGTGAGGCAATGAAGATTTGATGTAAATGGCGTACAGGGGAATTGAGCGGTCTTTGCACAGATAAGCATTTTCGTGCCATTCATACGATCAACAAAAACCCTTTATCTCTCAACA
AAAGCCTCAATTAGTGCCATTCATACGATAAATCATGCCGAAAATCAGTTCATAATGATTCCAACTTCTTGTTTTCCGTTTATCTGTTGATTGCTGTCAATTTGATATCAAGCTTTTTAATGTGAAAATATGTGTTTGGTGTTTATGGCCGAAAGGGTAGCGGGTTCAATTTTCAATAGGATGGCATCGCCGAGTAAAAT
CTGTCAAAAGAGTCAGTAACTTTGGAACCTGATATTAGCATCAATGGACATTTCTTAGTGTTGATCATTCATTTCAACACTATTTTTTGGCCTCTCAATGTCGCGGGTTCAATTCCGCCAGTGCTCCGATTTGACTTATAAAATTTCCCATGAAATTCCAATAGACATCTACGGAATTAAGCCATGGGATTGGACATGCA
GTGAAAAGAAATTATGCCTAGAGTAAGTCTTATGATAATTTAAATAAATCATAAATTCTTAATCATACTTAACTTTCCCTTCTTTTTCCTTAGAGCCTCTGAAAATCATGGGAATTCGATTCCCTTATAGGTTCTGTCGGGTCAATTAAATCACATCAGGTTGGCTGTTTGATTCTCTGGATTTGATATTAATCTTATAA
TGGCCTGTAATCCCGGGTCAGATTCATGTAGAGCATAAATTCTTGATGTCGCTGGATAAATCTTGAAAGAGTTATAATATTTGCAGCCTCAACGCCTCCGGTTCGACTCCTGTGCTTTACCTTTACCTTTCCTGTTTTTTCAACTTAATTTCTGATGTCTTTCATCAAAGTGTCACTCATATTTTGTTATATGAAAGTTA
AGATTTCTAATCATTTTTAGGCATTTCAATATTAGTTTTATTTTATTTTACTTTTGGACATTACAATGAAAATTCGGGTTGAAATTCAGTTCATAATGATGTGGATTTTTATAAATGTTTTCAATTTGATATTCAATTTGTTTTTATTAAAATTTTAATCTCATATAAA


>TRINITY_DN122972_c0_g1_i10 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CTCTCAGGCAGTGTTTGGTGTGCTTTTTAATGCTTTGGAGGGTTCATTGTTGTGCGTGATgtatgttatgtttgtctgtgttgtgagtctgtgctgtatgttctattatgtctatgctgtatgtgatgttcattgttgtgttttgtgagtcaatgttaatgtattcttaccttcgatatttcggcatggcatatcgaagC
TGAGG
AATGGCTTTCACATCGACCGCTCATATAAGGTGAGGCAATGAAGATTTGATGTAAATGGCGTACAGGGGAATTGAGCGGTCTTTGCACAGATAAGCATTTTCGTGCCATTCATACGATCAACAAAAACCCTTTATCTCTCAACAAAAGCCTCAATTAGTGCCATTCATACGATAAATCATGCCGAAAATCAGTTC
ATAATGATTCCAACTTCTTGTTTTCCGTTTATCTGTTGATTGCTGTCAATTTGATATCAAGCTTTTTAATGTGAAAATATGTGTTTGGTGTTTATGGCCGAAAGGGTAGCGGGTTCAATTTTCAATAGGATGGCATCGCCGAGTAAAATCTGTCAAAAGAGTCAGTAACTTTGGAACCTGATATTAGCATCAATGGACAT
TTCTTAGTGTTGATCATTCATTTCAACACTATTTTTTGGCCTCTCAATGTCGCGGGTTCAATTCCGCCAGTGCTCCGATTTGACTTATAAAATTTCCCATGAAATTCCAATAGACATCTACGGAATTAAGCCATGGGATTGGACATGCAGTGAAAAGAAATTATGCCTAGAGTAAGTCTTATGATAATTTAAATAAATCA
TAAATTCTTAATCATACTTAACTTTCCCTTCTTTTTCCTTAGAGCCTCTGAAAATCATGGGAATTCGATTCCCTTATAGGTTCTGTCGGGTCAATTAAATCACATCAGGTTGGCTGTTTGATTCTCTGGATTTGATATTAATCTTATAATGGCCTGTAATCCCGGGTCAGATTCATGTAGAGCATAAATTCTTGATGTCG
CTGGATAAATCTTGAAAGAGTTATAATATTTGCAGCCTCAACGCCTCCGGTTCGACTCCTGTGCTTTACCTTTACCTTTCCTGTTTTTTCAACTTAATTTCTGATGTCTTTCATCAAAGTGTCACTCATATTTTGTTATATGAAAGTTAAGATTTCTAATCATTTTTAGGCATTTCAATATTAGTTTTATTTTATTTTAC
TTTTGGACATTACAATGAAAATTCGGGTTGAAATTCAGTTCATAATGATGTGGATTTTTATAAATGTTTTCAATTTGATATTCAATTTGTTTTTATTAAAATTTTAATCTCATATAAAATCCTTAATGGATGTGAAAGAAACCTCGAAATAGTATATGCCGTTCAATTTGTAAACTTAAGGAACAAACCCAAAAAATAAT
TCTTAATGGATTTAAAGTTTTTATGTATATCAAATATACAGTTCAATTCCGAGAGGGCTACGTTGTTAAATAAAATCTCTAAGGAACAAACCCAAAAATAATTCTTAATGGAAGTAAAATCTTTATGTATATAAAATATTATACCGTTCAATTCCGAGAGGGGCTACATTGTTAAATAAAATCTCAAATTTCAAGTGGTA
AGCATTAAGCCAACGAGACTGTCATTCAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTTCATTTAATTTTATATATATATATATATATATTTTT




Intron 9 GTAATTTCAT ... GAAAGGGTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A175.6438120116
A275.24267682
A367.354010659
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A775.162222152
A871.4873198168
A966.970150133
A1069.0758152107



>TRINITY_DN120453_c2_g1_i6 from sample A3 / Example spliced isoform
CTTGAGGATCAGTTGTATTTCAAATCCTGAGGATCAGTTGTATGAAACGGCATTTTTTATCAAAACGCAAATCCTGAGGTTACTTTATATTTTTTGAAAAAGCAAAACCTGATACTTTATATTTTTTGAAAAAGCAAAACGGGAGTAGCCGTTGTACGATAACGTCCAGCGTGGTTGAGGTTACTTGGAAAGTCTTGTTA
TTGGCTTTCAGAACTGCTTGGAAACCGCTGTTATTGTTGTTGGGTTTAAGATCTTTGATTAATCAATATCCGTCAATTGATTCAAGTCACTGCTCTCGATTCGGCAGCTTCTTCATGATGGACGGCAGATGAAAATTATAACTACTAGGCAAGCCAATCATCGCTGGCTTCCCTTCCTTGGCTATGATGGGACAGAAGAG
GAGCTTCATGTAAATTACATCCTAAATTGCTGCATAACTTGCTTTCATGTTGGATGGCGCTATAATTTACAGTGCCTCTTAATCATCTTGTTTGAATATTACAATGCTTCTTTATCATCTTTCTTGATGGATTGCTTGTCCATTAATTAGTGATGGTGGATTTTGGTTCATCTAGAGCGGCCCAGCGGGTTCAATTTGCA
ATGGAATGGCATCTCGGACCTCTTAACGTCGCGGGTTCAATTCCGCCAGTCCTCCGATTTGACTTATAAAGATTTCCCATGTAGGCCAGCAACTTTTCGTCTCTGATCTTGAAATCTTTCCATCTCTGACCATGAATTGCTTCATAACCATCAATTGCTAGAGCTGGTTATCTTTCTCACAGATATAGAACCTTAATATT
TCTGACAGAGGAGAATATGATCAATTAGCAGGTTTGTGTGTTCGTGGTATAACCTCCGCGCCACCGGAGTATACTGGTTATCTTTATCTCCGAAGGTGACATTGCTGTGAGTATACTCGTGTTTTTGTGGGTTGTGTGTATACTTTGTTTTTCTGTGTATATACTCTGTCTTGGTAGGTCTGGTAGATCCGCTCTTTGTT
TGCAGGCCAGGATGACTTGACGATAGTGGAGATGAATCCCTCCTGAGGGATTCACAGGAATCCCTACGGTGAAATG


>TRINITY_DN120453_c2_g1_i11 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CTTGAGGATCAGTTGTATTTCAAATCCTGAGGATCAGTTGTATGAAACGGCATTTTTTATCAAAACGCAAATCCTGAGGTTACTTTATATTTTTTGAAAAAGCAAAACCTGATACTTTATATTTTTTGAAAAAGCAAAACGGGAGTAGCCGTTGTACGATAACGTCCAGCGTGGTTGAGGTTACTTGGAAAGTCTTGTTA
TTGGCTTTCAGAACTGCTTGGAAACCGCTGTTATTGTTGTTGGGTTTAAGATCTTTGATTAATCAATATCCGTCAATTGATTCAAGTCACTGCTCTCGATTCGGCAGCTTCTTCATGATGGACGGCAGATGAAAATTATAACTACTAGGCAAGCCAATCATCGCTGGCTTCCCTTCCTTGGCTATGATGGGACAGAAGAG
GAGCTTCATGTAAATTACATCCTAAATTGCTGCATAACTTGCTTTCATGGTGAGAGACGAAAAGATTTCATAAATTGCTTCATAACCGAATTCATGGTTATCTTACCATGAATCGACTTTTTTCATATAATTGCGATTTAAGGATCCTCTTTTTCTGACGTTAATGATTTCGGCTCTAATTAATTTTGTGTTACAGTTGG
ATGGCGCTATAATTTACAGTGCCTCTTAATCATCTTGTTTGAATATTACAATGCTTCTTTATCATCTTTCTTGATGGATTGCTTGTCCATTAATTAGTGATGGTGGATTTTGGTTCATCTAGAGgtaatttcatttcattgggttttaagcaaaaccatttatctgtcagcaaaagcctcaattagtgccagataaatag
cgcctaaagttaattcataatgattccaacttcttgtcttcagtttatgtgttgattgctgtgaatttgatataaagctttttaatgtgaaaatatttgtttggtgtttatggccgaaagggtag
CGGCCCAGCGGGTTCAATTTGCAATGGAATGGCATCTCGGAGTTAAACCCTAATTCTTCTTGCGACCA




Intron 10 GTTAAACCCT ... TATTTTTTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A180.3528114115
A290.8689168
A375.693189104
A484167791
A58865632
A680.5234155126
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A990.3921240155
A1091.3516201137



>TRINITY_DN43659_c2_g1_i11 from sample A7 / Example spliced isoform
CTTTTTAATGTGAAAATATTTGTCTGGTGTTGATGGCCGAAAGGGTAGCGGCCCAGCGGGTTCAATTTGCAATGGAATGGCATCTCGGACCTCTTAACGTCGCGGGTTCAATTCCGCCAGGCCAGGATGACTTGACGGTAGTGGAGATGAATCCCTCCGGAGGGATAGACAGGAATCGCTACGGTGAAATGTAATCAATT
CAATACGTTGGATTCTGCTGGCCTATGTGATCATAAGGATTCTTGGTAGGTTTTCAAGGCCCTT


>TRINITY_DN43659_c2_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:
CTTTTTAATGTGAAAATATTTGTCTGGTGTTGATGGCCGAAAGGGTAGCGGCCCAGCGGGTTCAATTTGCAATGGAATGGCATCTCGGAgttaaaccctaattcttcttgcgaccatttatgttttaaatctgtcaaaagagtggttaactttccattattgttgttcttttctgattattggaacctgttattagcatt
aatggccgtttctttaatattatccgaccagaaatcctatgggttcgactacgttataacatcgtcgttgataaaacctcaagaatcaactaaggattattcatttctaacactattttttag
CCTCTTAACGTCGCGGGTTCAATTCCGCCAGGCCAGGATGACTTGACGGTAGTGGAGATGAATCCCTCCGGAGGGAT
AGACAGGAATCGCTACGGTGAAATGTAATCAATTCAATACGTTGGATTCTGCTGGCCTATGTGATCATAAGGATTCTTGGTAGGTTTTCAAGGCCCTT