sp|Q8RXE7|AGD14_ARATH ----> Probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD14
Intron 1 GTAAGCATCT ... TATTTCTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20.36 | 176 | 0 | 45 |
| A2 | 19.53 | 173 | 1 | 42 |
| A3 | 10.6 | 135 | 1 | 16 |
| A4 | 16.58 | 166 | 1 | 33 |
| A5 | 22.22 | 56 | 2 | 16 |
| A6 | 20.79 | 80 | 0 | 21 |
| A7 | 10.66 | 109 | 0 | 13 |
| A8 | 8.16 | 45 | 0 | 4 |
| A9 | 17.05 | 73 | 0 | 15 |
| A10 | 14.29 | 84 | 0 | 14 |
>TRINITY_DN102830_c0_g1_i3 from sample A5 / Example spliced isoformCCTCGGATGCATAGAGACCTTGAGGGTTTCTAGAAAACTTATGACAGCTACTCTCAAATTGGCATCCAGATCGTCATCTCCTCCAGTTGTATATACAGACCAAGCAGATCGCTGCAGACGTCTCCTGTTTGAGCGGCATCGACGCATTTTTCAGTTAATTCAAAATTGGACCAAGTTTGGTCATCAATTGGGGTTTCGAA
CCCGTAACCTAGCGTTGGACGGGCAATTCCACCTGTGTATACCCTTAGGAGAACAAATGGCGAGCAGAATGAAGGAAGATGAAAGGAATGAGAAGGTTATACGGACTCTTCTAAAGCTTCCTCCCAATCGAAAATGTATTAACTGCAACAGTCTCGGACCCCAATATGTGTGTACAAATTTCTGGACATTTGTTTGCACA
ACTTGCAGTGGGATCCATCGGGAGTTTACACATCGAGTGAAATCAGTATCCATGGCTAAATTCACTTCTCAGGAAGTGACGTCTCTTCAACAAGGTGGCAATCAGAAAGCAAAAGAAATATATTTTAAAGACTTTGACCCACAGCGTCATCCACTACCTGACAGCAGCAATGTTGACAGGCTTCGAGACTTCATAAAGCA
TGTATATGTCGACAAGAGGTATAGCGGTGACAGGGGCGGTGATAGACCTCCACGAGGCAAAATGGGTGATAGAGATGATGCCTCAGAAAACAGGAGACCAGATTTATCTCGTTCAGATTCCCGTAGTCCTCCGTATGAAGATGAATATGGAGAACGCCGTTATGGTGATCGTCCTGGATTTGGTGCTCAAAAATTTGAAT
ATGATCGAAGTCGTTATGATGATCGAGGATATGATGATAGAAGATATGGTTATGATGAGAGAAGAAGTCCGAATCAGTATGATTCTGATCGAAGCAGGTATGATAAAGGTGTTCAGGACAATCGCCGATATGATGATACCTACAAGAGAAGTCCTGGTCAGTTTGAAAGTGGGAGGGATAAACGTTTTGATGACAGGTCT
GGCAATGGAAATCAAAACAAGAGATTTGAAGATCGTAGATATCCTGACACACCTGATAGACGTAGGCCTGAAGAGCAGTCACCAAATTACCAGAGAGATTATGATATCACTAGCCCTCCTCCAGTCCGTCCAGTGAGGGATATTTTAGGTGATGATGTTCCAACTCTTAGAGTAAGTGATTTTCCTCGAGCAAATGGAAG
TAGGGATATTGAAGGATCTACACGTTCACTGCCTGAAGCTCGTAGAGAATTCCGGGGACAGAGAACTGCATCTTCAAGTAGCATGGGATCAGTTGAAGGTAGTTCTCCAAATCTGAACAGGGTTAATTCAGGAAGTTTGATAGATTTTAGTGCAGAGCCTGAACCTCCCACTGCAACTGCACAACAAGATCCATTTGGGG
TTTCTTCAATTACACAGCCCTCTACAGCCACACAACAAGATCCATTTTCAGTTTCCTCTGTTAAACAGCCATCTACTGCTGTACAACAGGATCCCTTTGCAGTTTCTTCAATTTCACAGCAACCTTCAGCTGTACAACAAGTCTTTTCTGCAGTTTCACAGCCATCTGCAGCTTCTGCTTCAGACAATGGTGGATGGGCA
ACATTTGATTTTGCTCCTCAGGTTGCTCATTCTGCAGCTCCAGCACCATTACAATCCCTAGCACCAGCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCAGTGGGCCCAATTGCTGGACCATCAGCAGGGATTATTGATTCTTTTGGAACAGTAAGTAATGCTGGTCAGTGGTCAGCACAGTGGGCTCCTCCTCCTCAGGTACAAGC
TCCAGCAACATCTGTTTCTGGTGGCAATAACTGGTCTGCATTTCCACAGTCTGTTCAACCTTCCAATGGCGTATCGGACTCTCAGTCATGGAATACATTGATGTCTTCTGCTGCTCCTGCGCCTCTGAATCCATCCCAAAATGTGCAACCAGCTCAAGCTGCAACTAAACCGCCTCTGCAGGGACAGGGACAGCAGCCAA
CAGGAACCACACAGAATGGAAGGAATGAAATACCAGAGGACTTATTTAAACTCCCTTATCCTGAACCGGTTTTACATAATGCGGGTTTTCAATTGGGCTCCCAGCTTGGTGGTGTTTCTGGAGTACAATTTTCTTCAGTGGGAGTGCCTTTGCCAGGTTCAGTGCCATATTATCATCCACCTTCAAAATCCACAAACCCA
TTTGATATTGCTGGTGAACTACCTGCAACACAAGGAAGTACGTTTCCAAGCATGGGATCGTTGCAAGCTGCTTTGCCGAATTCTAATACAACTCCTTTGGCTGCACATGGTTCTGGGCCAGGGGCTTTTAATACCCAATGGACACCATCTCTAGCACCAGCTCCTTATCAACCAGTTGCTCCTGGTAGGTTATCTCTCTG
TCAATTGGTTCTCTTGTCAAATATTCAAATCTGTCGTTGACCTACCAAGAGAAGTAACTTGGTCCGTCAAACTGTACCATTGTCAATATTCTAATGGTTAATCTGTTAAGAAGATAGATACTCAAGTATGCACTGCAATTGTATGGTAACTTTTCAATCAAATCTTAAAGTCACGAGGGCTTTAGGCAATTCTATTAATT
TAATATTTCT
>TRINITY_DN102830_c0_g1_i6 from sample A5 / Example unspliced isoform:CAATTCCACCTGTGTATACCCTTgtaagcatctagctcttttgaatggctggatctcgcttattttttagaaaatttgtgcctttaagggttttgtgactgagatttgtaattttgctacggccttctgttattgtttgaatccggtgtatttctaataagacttagcctgaataattattgtgctgatgtaaatcttag
taacggtccttcagatcagttccctatcaaaaaaattgctcgaagataacaaattgttggtattggctttgcttaatccatcgctagttttatttctcagAGGAGAACAAATGGCGAGCAGAATGAAGGAAGATGAAAGGAATGAGAAGGTTATACGGACTCTTCTAAAGCTTCCTCCCAATCGAAAATGTATTAACTGC
AACAGTCTCGGACCCCAATATGTGTGTACAAATTTCTGGACATTTGTTTGCACAACTTGCAGTGGGATCCATCGGGAGTTTACACATCGAGTGAAATCAGTATCCATGGCTAAATTCACTTCTCAGGAAGTGACGTCTCTTCAACAAGGTGGCAATCAGAAAGCAAAAGAAATATATTTTAAAGACTTTGACCCACAGCG
TCATCCACTACCTGACAGCAGCAATGTTGACAGGCTTCGAGACTTCATAAAGCATGTATATGTCGACAAGAGGTATAGCGGTGACAGGGGCGGTGATAGACCTCCACGAGGCAAAATGGGTGATAGAGATGATGCCTCAGAAAACAGGAGACCAGATTTATCTCGTTCAGATTCCCGTAGTCCTCCGTATGAAGATGAAT
ATGGAGAACGCCGTTATGGTGATCGTCCTGGATTTGGTGCTCAAAAATTTGAATATGATCGAAGTCGTTATGATGATCGAGGATATGATGATAGAAGATATGGTTATGATGAGAGAAGAAGTCCGAATCAGTATGATTCTGATCGAAGCAGGTATGATAAAGGTGTTCAGGACAATCGCCGATATGATGATACCTACAAG
AGAAGTCCTGGTCAGTTTGAAAGTGGGAGGGATAAACGTTTTGATGACAGGTCTGGCAATGGAAATCAAAACAAGAGATTTGAAGATCGTAGATATCCTGACACACCTGATAGACGTAGGCCTGAAGAGCAGTCACCAAATTACCAGAGAGATTATGATATCACTAGCCCTCCTCCAGTCCGTCCAGTGAGGGATATTTT
AGGTGATGATGTTCCAACTCTTAGAGTAAGTGATTTTCCTCGAGCAAATGGAAGTAGGGATATTGAAGGATCTACACGTTCACTGCCTGAAGCTCGTAGAGAATTCCGGGGACAGAGAACTGCATCTTCAAGTAGCATGGGATCAGTTGAAGGTAGTTCTCCAAATCTGAACAGGGTTAATTCAGGAAGTTTGATAGATT
TTAGTGCAGAGCCTGAACCTCCCACTGCAACTGCACAACAAGATCCATTTGGGGTTTCTTCAATTACACAGCCCTCTACAGCCACACAACAAGATCCATTTTCAGTTTCCTCTGTTAAACAGCCATCTACTGCTGTACAACAGGATCCCTTTGCAGTTTCTTCAATTTCACAGCAACCTTCAGCTGTACAACAAGTCTTT
TCTGCAGTTTCACAGCCATCTGCAGCTTCTGCTTCAGACAATGGTGGATGGGCAACATTTGATTTTGCTCCTCAGGTTGCTCATTCTGCAGCTCCAGCACCATTACAATCCCTAGCACCAGCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCAGTGGGCCCAATTGCTGGACCATCAGCAGGGATTATTGATTCTTTTGGAACAGT
AAGTAATGCTGGTCAGTGGTCAGCACAGTGGGCTCCTCCTCCTCAGGTACAAGCTCCAGCAACATCTGTTTCTGGTGGCAATAACTGGTCTGCATTTCCACAGTCTGTTCAACCTTCCAATGGCGTATCGGACTCTCAGTCATGGAATACATTGATGTCTTCTGCTGCTCCTGCGCCTCTGAATCCATCCCAAAATGTGC
AACCAGCTCAAGCTGCAACTAAACCGCCTCTGCAGGGACAGGGACAGCAGCCAACAGGAACCACACAGAATGGAAGGAATGAAATACCAGAGGACTTATTTAAACTCCCTTATCCTGAACCGGTTTTACATAATGCGGGTTTTCAATTGGGCTCCCAGCTTGGTGGTGTTTCTGGAGTACAATTTTCTTCAGTGGGAGTG
CCTTTGCCAGGTTCAGTGCCATATTATCATCCACCTTCAAAATCCACAAACCCATTTGATATTGCTGGTGAACTACCTGCAACACAAGGAAGTACGTTTCCAAGCATGGGATCGTTGCAAGCTGCTTTGCCGAATTCTAATACAACTCCTTTGGCTGCACATGGTTCTGGGCCAGGGGCTTTTAATACCCAATGGACACC
ATCTCTAGCACCAGCTCCTTATCAACCAGTTGCTCCTGGATTATACATGGGTCAGCAGGTGTCAAATGCTTTTGCGCCAAAAGTGCAATCTGGTGCCACACCTATTACTAGTTTTCCTTCTGGTTCGTTTCCTAGTGATGACCTCTTCTTCAATCTTGGAGCTCCTCGGCTGTCTTCTCAAAGCTCACTCCCTTCAGTTG
GTGGTAACCCATTTGGTTAGAATCATGGTGGAGACATGGAGTTTTTTCACCCTTGGAATGGAAAATATAGATGGGCTGGACATCTTGCTGCTACTTTTCTGTTGCAAGGACCATGAGATTTTGTATTATGATTGCAGCTAGGCGATTCCCCAAGTAGAAATATTCTGGATTTTGTGCCCTTTGGGAAGTCTTGAGGTGAA
ATTCGATTTGAATGCAGGCAGGGGTGGAAATCATAAAAGTTTTGCTAAGAAGTGCAATCATTTGTTCCATTCAAGGCATTGGTCGCAATTGTTTGCATATATTTCATCCCGATTGAAATACAGTATATGAATAATTTGTTTAGTTCTCATGGAGTTACATATTGTACCTAATGGCATTAGAAGATGCAAACAAATTGAGA
GAATATTATTTAGCCTGAACATATGTAATCATTTGTACTGGCAGGCCTCAGATTCAGGCCTACCCAATTGCCCACTGAATGGTTTTGGGGTCCACTCTGAGGCGTGTGTACAATTGACTGTTTTTATAGGTTATTGATGTGAATTTGTTAGATGGAGCCAGCATTTTCACTTGGCCTCGTGGCTTCTGGAGGCTAAGGAT
TTTTAGCCAGTGACTATTGTTTGCCTGTATTTAGTCTTTTAACGTTTCTTCTAATATTTTTTTAATGCCTTGTACCTGTTTGAATAATAGCCCTTTGGTGTATATTTTATACGTGGCTTGCTTTGCAAGTTTAGACATTCATCTATCCTTTGAATGTCTTTGCTACGTAGCTGATATGGCCTCTGGTTCTGATAGTACGG
TGGTGTCAGTTCTAGGATTAATACTGAACTTCTTTATCTTCAATAATATTAATATTTTGAATTGTTTGGAAACAGATGG
Intron 2 GTATGCACTT ... GTTTTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 24.04 | 218 | 65 | 73 |
| A2 | 23.88 | 161 | 26 | 75 |
| A3 | 24.9 | 190 | 48 | 78 |
| A4 | 19.21 | 122 | 36 | 22 |
| A5 | 25.22 | 86 | 25 | 33 |
| A6 | 24.61 | 130.3 | 21 | 64 |
| A7 | 26.28 | 223 | 52 | 107 |
| A8 | 24.81 | 100 | 20 | 46 |
| A9 | 22.82 | 159 | 33 | 61 |
| A10 | 24.46 | 156 | 9 | 92 |
>TRINITY_DN112992_c0_g2_i5 from sample A3 / Example spliced isoformCGGAATAGCCTGTGACGTCGGCGCCCACGCTTGACCATACGAAGCGCTGGAACCTTTTTCCATGGCGACCTCGGATGCATAGAGACCTTGAGGGTTTCTAGAAAACTTATGACAGCTACTCTCAAATTGGCATCCAGATCGTCATCTCCTCCAGTTGTATATACAGACCAAGCAGATCGCTGCAGACGTCTCCTGTTCGA
GCGGCATCGACGCATTTTTCAGTTAATTCAAAATTGGACCAAGTTTGGTCATCAATTGGGGTTTCGAACCCGTAACCTAGCGTTGGACGGGCAATTCCACCTGTGTATACCCTTTTTTATTTCTCAGAGGAGAACAAATGGCGAGCAGAATGAAGGAAGATGAAAGGAATGAGAAGGTTATACGGACTCTTCTAAAGCTT
CCTCCCAATCGAAAATGTATTAACTGCAACAGTCTCGGACCCCAATATGTGTGTACAAATTTCTGGACATTTGTTTGCACAACTTGCAGTGGGATCCATCGGGAGTTTACACATCGAGTGAAATCAGTATCCATGGCTAAATTCACTTCTCAGGAAGTGACGTCTCTTCAACAAGGTGGCAATCAGAAAGCAAAAGAAAT
ATATTTTAAAGACTTTGACCCACAGCGTCATCCACTACCTGACAGCAGCAATGTTGACAGGCTTCGAGACTTCATAAAGCATGTATATGTCGACAAGAGGTATAGCGGTGACAGGGGCGGTGATAGACCTCCACGAGGCAAAATGGGTGATAGAGATGATGCCTCAGAAAACAGGAGACCAGATTTATCTCGTTCAGATT
CCCGTAGTCCTCCGTATGAAGATGAATATGGAGAACGCCGTTATGGTGATCGTCCTGGATTTGGTGCTCAAAAATTTGAATATGATCGAAGTCGTTATGATGATCGAGGATATGATGATAGAAGATATGGTTATGATGAGAGAAGAAGTCCGAATCAGTATGATTCTGATCGAAGCAGGTATGATAAAGGTGTTCAGGAC
AATCGCCGATATGATGATACCTACAAGAGAAGTCCTGGTCAGTTTGAAAGTGGGAGGGATAAACGTTTTGATGACAGGTCTGGCAATGGAAATCAAAACAAGAGATTTGAAGATCGTAGATATCCTGACACACCTGATAGACGTAGGCCTGAAGAGCAGTCACCAAATTACCAGAGAGATTATGATATCACTAGCCCTCC
TCCAGTCCGTCCAGTGAGGGATATTTTAGGTGATGATGTTCCAACTCTTAGAGTAAGTGATTTTCCTCGAGCAAATGGAAGTAGGGATATTGAAGGATCTACACGTTCACTGCCTGAAGCTCGTAGAGAATTCCGGGGACAGAGAACTGCATCTTCAAGTAGCATGGGATCAGTTGAAGGTAGTTCTCCAAATCTGAACA
GGGTTAATTCAGGAAGTTTGATAGATTTTAGTGCAGAGCCTGAACCTCCCACTGCAACTGCACAACAAGATCCATTTGGGGTTTCTTCAATTACACAGCCCTCTACAGCCACACAACAAGATCCATTTTCAGTTTCCTCTGTTAAACAGCCATCTACTGCTGTACAACAGGATCCCTTTGCAGTTTCTTCAATTTCACAG
CAACCTTCAGCTGTACAACAAGTCTTTTCTGCAGTTTCACAGCCATCTGCAGCTTCTGCTTCAGACAATGGTGGATGGGCAACATTTGATTTTGCTCCTCAGGTTGCTCATTCTGCAGCTCCAGCACCATTACAATCCCTAGCACCAGCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCAGTGGGCCCAATTGCTGGACCATCAGC
AGGGATTATTGATTCTTTTGGAACAGTAAGTAATGCTGGTCAGTGGTCAGCACAGTGGGCTCCTCCTCCTCAGGTACAAGCTCCAGCAACATCTGTTTCTGGTGGCAATAACTGGTCTGCATTTCCACAGTCTGTTCAACCTTCCAATGGCGTATCGGACTCTCAGTCATGGAATACATTGATGTCTTCTGCTGCTCCTG
CGCCTCTGAATCCATCCCAAAATGTGCAACCAGCTCAAGCTGCAACTAAACCGCCTCTGCAGGGACAGGGACAGCAGCCAACAGGAACCACACAGAATGGAAGGAATGAAATACCAGAGGACTTATTTAAACTCCCTTATCCTGAACCGGTTTTACATAATGCGGGTTTTCAATTGGGCTCCCAGCTTGGTGGTGTTTCT
GGAGTACAATTTTCTTCAGTGGGAGTGCCTTTGCCAGGTTCAGTGCCATATTATCATCCACCTTCAAAATCCACAAACCCATTTGATATTGCTGGTGAACTACCTGCAACACAAGGAAGTACGTTTCCAAGCATGGGATCGTTGCAAGCTGCTTTGCCGAATTCTAATACAACTCCTTTGGCTGCACATGGTTCTGGGCC
AGGGGCTTTTAATACCCAATGGACACCATCTCTAGCACCAGCTCCTTATCAACCAGTTGCTCCTGGATTATACATGGGTCAGCAGGTGTCAAATGCTTTTGCGCCAAAAGTGCAATCTGGTGCCACACCTATTACTAGTTTTCCTTCTGGTTCGTTTCCTAGTGATGACCTCTTCTTCAATCTTGGAGCTCCTCGGCTGT
CTTCTCAAAGCTCACTCCCTTCAGTTGGTGGTAACCCATTTGGTTAGAATCATGGTGGAGACATGGAGTTTTTTCACCCTTGGAATGGAAAATATAGATGGGCTGGACATCTTGCTGCTACTTTTCTGTTGCAAGGACCATGAGATTTTGTATTATGATTGCAGCTAGGCGATTCCCCAAGTAGAAATATTCTGGATTTT
GTGCCCTTTGGGAAGTCTTGAGGTGAAATTCGATTTGAATGCAGGCAGGGGTGGAAATCATAAAAGTTTTGCTAAGAAGTGCAATCATTTGTTCCATTCAAGGCATTGGTCGCAATTGTTTGCATATATTTCATCCCGATTGAAATACAGTATATGAATAATTTGTTTAGTTCTCATGGAGTTACATATTGTACCTAATG
GCATTAGAAGATGCAAACAAATTGAGAGAATATTATTTAGCCTGAACATATGTAATCATTTGTACTGGCAGGCCTCAGATTCAGGCCTACCCAATTGCCCACTGAATGGTTTTGGGGTCCACTCTGAGGCGTGTGTACAATTGACTGTTTTTATAGGTTATTGATGTGAATTTGTTAGATGGAGCCAGCATTTTCACTTG
GCCTCGTGGCTTCTGGAGGCTAAGGATTTTTAGCCAGTGACTATTGTTTGCCTGTATTTAGTCTTTTAACGTTTCTTCTAATATTTTTTTAATGCCTTGTACCTGTTTGAATAATAGCCCTTTGGTGTATATTTTATACGTGGCTTGCTTTGCAAGTTTAGACATTCATCTATCCTTTGAATGTCTTTGCTACGTAGCTG
ATATGGCCTCTGGTTCTGATAGTACGGTGGTGTCAGTTCTAGGATTAATACTGAACTTCTTTATCTTCAATAATATTAATATTTTGAATTGTTTGGAAACAGATGGCTTTGGATACACATTTGTGTATTACAATGTGTAAGAAAACTACTTGTAGGCCAATATACTTCTTCTCAGTGC
>TRINITY_DN112992_c0_g2_i7 from sample A3 / Example unspliced isoform:AGGAGAACAAATGGCGAGCAGAATGAAGGAAGATGAAAGGAATGAGAAGGTTATACGGACTCTTCTAAAGCTTCCTCCCAATCGAAAATGTATTAACTGCAACAGTCTCGGACCCCAATATGTGTGTACAAATTTCTGGACATTTGTTTGCACAACTTGCAGTGGGATCCATCGGGAGTTTACACATCGAGTGAAATCAG
TATCCATGGCTAAATTCACTTCTCAGGAAGTGACGTCTCTTCAACAAGGTGGCAATCAGGTACATACATAAAAGTGTCTTGTAGATAAACCATCATTTTGCAAACAAGCAGGATAGAGTGAATTTCTCTAACCTTGTTTGAGAATGATGTGGTTAAGAAATCACATTTTCAGATAGCCTTCTAAATGATCATTTTCTCTC
TTCCATATTGCAGAAAGCAAAAGAAATATATTTTAAAGACTTTGACCCACAGCGTCATCCACTACCTGACAGCAGCAATGTTGACAGGCTTCGAGACTTCATAAAGCATGTATATGTCGACAAGAGGTATAGCGGTGACAGGGGCGGTGATAGACCTCCACGAGGCAAAATGgtatgcacttgatcagctaatgcttgca
aatacttcctgtccatttttcttgtacagaactttctgcattggcctattgacctggaaacattttgctgcatctttacttgaagtgccatttatcattttgtgtattttaataagagattagaatggtatgtcagatttgaaaggttaaaatgcatgttttggcagGGTGATAGAGATGATGCCTCAGAAAACAGGAGA
CCAGATTTATCTCGTTCAGATTCCCGTAGTCCTCCGTATGAAGATGAATATGGAGAACGCCGTTATGGTGATCGTCCTGGATTTGGTGCTCAAAAATTTGAATATGATCGAAGTCGTTATGATGATCGAGGATATGATGATAGAAGATATGGTTATGATGAGAGAAGAAGTCCGAATCAGTATGATTCTGATCGAAGCAG
GTATGATAAAGGTGTTCAGGACAATCGCCGATATGATGATACCTACAAGAGAAGTCCTGGTCAGTTTGAAAGTGGGAGGGATAAACGTTTTGATGACAGGTCTGGCAATGGAAATCAAAACAAGAGATTTGAAGATCGTAGATATCCTGACACACCTGATAGACGTAGGCCTGAAGAGCAGTCACCAAATTACCAGAGAG
ATTATGATATCACTAGCCCTCCTCCAGTCCGTCCAGTGAGGGATATTTTAGGTGATGATGTTCCAACTCTTAGAGTAAGTGATTTTCCTCGAGCAAATGGAAGTAGGGATATTGAAGGATCTACACGTTCACTGCCTGAAGCTCGTAGAGAATTCCGGGGACAGAGAACTGCATCTTCAAGTAGCATGGGATCAGTTGAA
GGTAGTTCTCCAAATCTGAACAGGGTTAATTCAGGAAGTTTGATAGATTTTAGTGCAGAGCCTGAACCTCCCACTGCAACTGCACAACAAGATCCATTTGGGGTTTCTTCAATTACACAGCCCTCTACAGCCACACAACAAGATCCATTTTCAGTTTCCTCTGTTAAACAGCCATCTACTGCTGTACAACAGGATCCCTT
TGCAGTTTCTTCAATTTCACAGCAACCTTCAGCTGTACAACAAGTCTTTTCTGCAGTTTCACAGCCATCTGCAGCTTCTGCTTCAGACAATGGTGGATGGGCAACATTTGATTTTGCTCCTCAGGTTGCTCATTCTGCAGCTCCAGCACCATTACAATCCCTAGCACCAGCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCAGTGG
GCCCAATTGCTGGACCATCAGCAGGGATTATTGATTCTTTTGGAACAGTAAGTAATGCTGGTCAGTGGTCAGCACAGTGGGCTCCTCCTCCTCAGGTACAAGCTCCAGCAACATCTGTTTCTGGTGGCAATAACTGGTCTGCATTTCCACAGTCTGTTCAACCTTCCAATGGCGTATCGGACTCTCAGTCATGGAATACA
TTGATGTCTTCTGCTGCTCCTGCGCCTCTGAATCCATCCCAAAATGTGCAACCAGCTCAAGCTGCAACTAAACCGCCTCTGCAGGGACAGGGACAGCAGCCAACAGGAACCACACAGAATGGAAGGAATGAAATACCAGAGGACTTATTTAAACTCCCTTATCCTGAACCGGTTTTACATAATGCGGGTTTTCAATTGGG
CTCCCAGCTTGGTGGTGTTTCTGGAGTACAATTTTCTTCAGTGGGAGTGCCTTTGCCAGGTTCAGTGCCATATTATCATCCACCTTCAAAATCCACAAACCCATTTGATATTGCTGGTGAACTACCTGCAACACAAGGAAGTACGTTTCCAAGCATGGGATCGTTGCAAGCTGCTTTGCCGAATTCTAATACAACTCCTT
TGGCTGCACATGGTTCTGGGCCAGGGGCTTTTAATACCCAATGGACACCATCTCTAGCACCAGCTCCTTATCAACCAGTTGCTCCTGGATTATACATGGGTCAGCAGGTGTCAAATGCTTTTGCGCCAAAAGTGCAATCTGGTGCCACACCTATTACTAGTTTTCCTTCTGGTTCGTTTCCTAGTGATGACCTCTTCTTC
AATCTTGGAGCTCCTCGGCTGTCTTCTCAAAGCTCACTCCCTTCAGTTGGTGGTAACCCATTTGGTTAGAATCATGGTGGAGACATGGAGTTTTTTCACCCTTGGAATGGAAAATATAGATGGGCTGGACATCTTGCTGCTACTTTTCTGTTGCAAGGACCATGAGATTTTGTATTATGATTGCAGCTAGGCGATTCCCC
AAGTAGAAATATTCTGGATTTTGTGCCCTTTGGGAAGTCTTGAGGTGAAATTCGATTTGAATGCAGGCAGGGGTGGAAATCATAAAAGTTTTGCTAAGAAGTGCAATCATTTGTTCCATTCAAGGCATTGGTCGCAATTGTTTGCATATATTTCATCCCGATTGAAATACAGTATATGAATAATTTGTTTAGTTCTCATG
GAGTTACATATTGTACCTAATGGCATTAGAAGATGCAAACAAATTGAGAGAATATTATTTAGCCTGAACATATGTAATCATTTGTACTGGCAGGCCTCAGATTCAGGCCTACCCAATTGCCCACTGAATGGTTTTGGGGTCCACTCTGAGGCGTGTGTACAATTGACTGTTTTTATAGGTTATTGATGTGAATTTGTTAG
ATGGAGCCAGCATTTTCACTTGGCCTCGTGGCTTCTGGAGGCTAAGGATTTTTAGCCAGTGACTATTGTTTGCCTGTATTTAGTCTTTTAACGTTTCTTCTAATATTTTTTTAATGCCTTGTACCTGTTTGAATAATAGCCCTTTGGTGTATATTTTATACGTGGCTTGCTTTGCAAGTTTAGACATTCATCTATCCTTT
GAATGTCTTTGCTACGTAGCTGATATGGCCTCTGGTTCTGATAGTACGGTGGTGTCAGTTCTAGGATTAATACTGAACTTCTTTATCTTCAATAATATTAATATTTTGAATTGTTTGGAAACAGATGGCTTTGGATACACATTTGTGTATTACAATGTGTAAGAAAACTACTTGTAGGCCAATATACTTCTTCTCAGTGC
Intron 3 GTATGTAATT ... TGCACTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 21.78 | 169.7 | 47 | 2 |
| A2 | 20.37 | 106.7 | 27 | 0 |
| A3 | 22.57 | 131.3 | 38 | 4 |
| A4 | 30.16 | 79.3 | 34 | 1 |
| A5 | 27.06 | 62.3 | 23 | 0 |
| A6 | 21.67 | 280 | 77 | 0 |
| A7 | 25.5 | 284 | 97 | 0 |
| A8 | 25.85 | 230.7 | 80 | 0 |
| A9 | 23.92 | 242.3 | 76 | 0 |
| A10 | 24.8 | 240 | 79 | 0 |
>TRINITY_DN105073_c4_g1_i7 from sample A4 / Example spliced isoformACCTCGGATGCATAGAGACCTTGAGGGTTTCTAGAAAACTTATGACAGCTACTCTCAAATTGGCATCCAGATCGTCATCTCCTCCAGTTGTATATACAGACCAAGCAGATCGCTGCAGACGTCTCCTGTTCGAGCGGCATCGACGCATTTTTCAGTTAATTCAAAATTGGACCAAGTTTGGTCATCAATTGGGGTTTCGA
ACCCGTAACCTAGCGTTGGACGGGCAATTCCACCTGTGTATACCCTTAGGAGAACAAATGGCGAGCAGAATGAAGGAAGATGAAAGGAATGAGAAGGTTATACGGACTCTTCTAAAGCTTCCTCCCAATCGAAAATGTATTAACTGCAACAGTCTCGGACCCCAATATGTGTGTACAAATTTCTGGACATTTGTTTGCAC
AACTTGCAGTGGGATCCATCGGGAGTTTACACATCGAGTGAAATCAGTATCCATGGCTAAATTCACTTCTCAGGAAGTGACGTCTCTTCAACAAGGTGGCAATCAGAAAGCAAAAGAAATATATTTTAAAGACTTTGACCCACAGCGTCATCCACTACCTGACAGCAGCAATGTTGACAGGCTTCGAGACTTCATAAAGC
ATGTATATGTCGACAAGAGGTATAGCGGTGACAGGGGCGGTGATAGACCTCCACGAGGCAAAATGGGTGATAGAGATGATGCCTCAGAAAACAGGAGACCAGATTTATCTCGTTCAGATTCCCGTAGTCCTCCGTATGAAGATGAATATGGAGAACGCCGTTATGGTGATCGTCCTGGATTTGGTGCTCAAAAATTTGAA
TATGATCGAAGTCGTTATGATGATCGAGGATATGATGATAGAAGATATGGTTATGATGAGAGAAGAAGTCCGAATCAGTATGATTCTGATCGAAGCAGGTATGATAAAGGTGTTCAGGACAATCGCCGATATGATGATACCTACAAGAGAAGTCCTGGTCAGTTTGAAAGTGGGAGGGATAAACGTTTTGATGACAGGTC
TGGCAATGGAAATCAAAACAAGAGATTTGAAGATCGTAGATATCCTGACACACCTGATAGACGTAGGCCTGAAGAGCAGTCACCAAATTACCAGAGAGATTATGATATCACTAGCCCTCCTCCAGTCCGTCCAGTGAGGGATATTTTAGGTGATGATGTTCCAACTCTTAGAGTAAGTGATTTTCCTCGAGCAAATGGAA
GTAGGGATATTGAAGGATCTACACGTTCACTGCCTGAAGCTCGTAGAGAATTCCGGGGACAGAGAACTGCATCTTCAAGTAGCATGGGATCAGTTGAAGGTAGTTCTCCAAATCTGAACAGGGTTAATTCAGGAAGTTTGATAGATTTTAGTGCAGAGCCTGAACCTCCCACTGCAACTGCACAACAAGATCCATTTGGG
GTTTCTTCAATTACACAGCCCTCTACAGCCACACAACAAGATCCATTTTCAGTTTCCTCTGTTAAACAGCCATCTACTGCTGTACAACAGGATCCCTTTGCAGTTTCTTCAATTTCACAGCAACCTTCAGCTGTACAACAAGTCTTTTCTGCAGTTTCACAGCCATCTGCAGCTTCTGCTTCAGACAATGGTGGATGGGC
AACATTTGATTTTGCTCCTCAGGTTGCTCATTCTGCAGCTCCAGCACCATTACAATCCCTAGCACCAGCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCAGTGGGCCCAATTGCTGGACCATCAGCAGGGATTATTGATTCTTTTGGAACAGTAAGTAATGCTGGTCAGTGGTCAGCACAGTGGGCTCCTCCTCCTCAGGTACAAG
CTCCAGCAACATCTGTTTCTGGTGGCAATAACTGGTCTGCATTTCCACAGTCTGTTCAACCTTCCAATGGCGTATCGGACTCTCAGTCATGGAATACATTGATGTCTTCTGCTGCTCCTGCGCCTCTGAATCCATCCCAAAATGTGCAACCAGCTCAAGCTGCAACTAAACCGCCTCTGCAGGGACAGGGACAGCAGCCA
ACAGGAACCACACAGAATGGAAGGAATGAAATACCAGAGGACTTATTTAAACTCCCTTATCCTGAACCGGTTTTACATAATGCGGGTTTTCAATTGGGCTCCCAGCTTGGTGGTGTTTCTGGAGTACAATTTTCTTCAGTGGGAGTGCCTTTGCCAGGTTCAGTGCCATATTATCATCCACCTTCAAAATCCACAAACCC
ATTTGATATTGCTGGTGAACTACCTGCAACACAAGGAAGTACGTTTCCAAGCATGGGATCGTTGCAAGCTGCTTTGCCGAATTCTAATACAACTCCTTTGGCTGCACATGGTTCTGGGCCAGGGGCTTTTAATACCCAATGGACACCATCTCTAGCACCAGCTCCTTATCAACCAGTTGCTCCTGGATTATACATGGGTC
AGCAGGTGTCAAATGCTTTTGCGCCAAAAGTGCAATCTGGTGCCACACCTATTACTAGTTTTCCTTCTGGTTCGTTTCCTAGTGATGACCTCTTCTTCAATCTTGGAGCTCCTCGGCTGTCTTCTCAAAGCTCACTCCCTTCAGTTGGTGGTAACCCATTTGGTTAGAATCATGGTGGAGACATGGAGTTTTTTCACCCT
TGGAATGGAAAATATAGATGGGCTGGACATCTTGCTGCTACTTTTCTGTTGCAAGGACCATGAGATTTTGTATTATGATTGCAGCTAGGCGATTCCCCAAGTAGAAATATTCTGGATTTTGTGCCCTTTGGGAAGTCTTGAGGTGAAATTCGATTTGAATGCAGGCAGGGGTGGAAATCATAAAAGTTTTGCTAAGAAGT
GCAATCATTTGTTCCATTCAAGGCATTGGTCGCAATTGTTTGCATATATTTCATCCCGATTGAAATACAGTATATGAATAATTTGTTTAGTTCTCATGGAGTTACATATTGTACCTAATGGCATTAGAAGATGCAAACAAATTGAGAGAATATTATTTAGCCTGAACATATGTAATCATTTGTACTGGCAGGCCTCAGAT
TCAGGCCTACCCAATTGCCCACTGAATGGTTTTGGGGTCCACTCTGAGGCGTGTGTACAATTGACTGTTTTTATAGGTTATTGATGTGAATTTGTTAGATGGAGCCAGCATTTTCACTTGGCCTCGTGGCTTCTGGAGGCTAAGGATTTTTAGCCAGTGACTATTGTTTGCCTGTATTTAGTCTTTTAACGTTTCTTCTA
ATATTTTTTTAATGCCTTGTACCTGTTTGAATAATAGCCCTTTGGTGTATATTTTATACGTGGCTTGCTTTGCAAGTTTAGACATTCATCTATCCTTTGAATGTCTTTGCTACGTAGCTGATATGGCCTCTGGTTCTGATAGTACGGTGGTGTCAGTTCTAGGATTAATACTGAACTTCTTTATCTTCAATAATATTAAT
ATTTTGAATTGTTTGGAAACAGATGGCTTTGGATACACATTTGTGTATTACAATGTGTAAGAAAACTACTTGTAGGCCAATATACTTCTTCTCAGTGTTC
>TRINITY_DN105073_c4_g1_i3 from sample A4 / Example unspliced isoform:ACCTCGGATGCATAGAGACCTTGAGGGTTTCTAGAAAACTTATGACAGCTACTCTCAAATTGGCATCCAGATCGTCATCTCCTCCAGTTGTATATACAGACCAAGCAGATCGCTGCAGACGTCTCCTGTTCGAGCGGCATCGACGCATTTTTCAGTTAATTCAAAATTGGACCAAGTTTGGTCATCAATTGGGGTTTCGA
ACCCGTAACCTAGCGTTGGACGGGCAATTCCACCTGTGTATACCCTTAGGAGAACAAATGGCGAGCAGAATGAAGGAAGATGAAAGGAATGAGAAGGTTATACGGACTCTTCTAAAGCTTCCTCCCAATCGAAAATGTATTAACTGCAACAGTCTCGGACCCCAATATGTGTGTACAAATTTCTGGACATTTGTTTGCAC
AACTTGCAGTGGGATCCATCGGGAGTTTACACATCGAGTGAAATCAGTATCCATGGCTAAATTCACTTCTCAGGAAGTGACGTCTCTTCAACAAGGTGGCAATCAGAAAGCAAAAGAAATATATTTTAAAGACTTTGACCCACAGCGTCATCCACTACCTGACAGCAGCAATGTTGACAGGCTTCGAGACTTCATAAAGC
ATGTATATGTCGACAAGAGGTATAGCGGTGACAGGGGCGGTGATAGACCTCCACGAGGCAAAATGGGTGATAGAGATGATGCCTCAGAAAACAGGAGACCAGATTTATCTCGTTCAGATTCCCGTAGTCCTCCGTATGAAGATGAATATGGAGAACGCCGTTATGGTGATCGTCCTGGATTTGGTGCTCAAAAATTTGAA
TATGATCGAAGTCGTTATGATGATCGAGGATATGATGATAGAAGATATGGTTATGATGAGAGAAGAAGTCCGAATCAGTATGATTCTGATCGAAGCAGGTATGATAAAGGTGTTCAGGACAATCGCCGATATGATGATACCTACAAGAGAAGTCCTGGTCAGTTTGAAAGTGGGAGGGATAAACGTTTTGATGACAGGTC
TGGCAATGGAAATCAAAACAAGAGATTTGAAGATCGTAGATATCCTGACACACCTGATAGACGTAGGCCTGAAGAGCAGTCACCAAATTACCAGAGAGATTATGATATCACTAGCCCTCCTCCAGTCCGTCCAGTGAGGGATATTTTAGGTGATGATGTTCCAACTCTTAGAGTAAGTGATTTTCCTCGAGCAAATGGAA
GTAGGGATATTGAAGGATCTACACGTTCACTGCCTGAAGCTCGTAGAGAATTCCGGGGACAGAGAACTGCATCTTCAAGTAGCATGGGATCAGTTGAAGGTAGTTCTCCAAATCTGAACAGGGTTAATTCAGGAAGTTTGATAGATTTTAGTGCAGAGCCTGAACCTCCCACTGCAACTGCACAACAAGATCCATTTGGG
GTTTCTTCAATTACACAGCCCTCTACAGCCACACAACAAGATCCATTTTCAGTTTCCTCTGTTAAACAGCCATCTACTGCTGTACAACAGGATCCCTTTGCAGTTTCTTCAATTTCACAGCAACCTTCAGCTGTACAACAAGTCTTTTCTGCAGTTTCACAGCCATCTGCAGCTTCTGCTTCAGACAATGGTGGATGGGC
AACATTTGATTTTGCTCCTCAGGTTGCTCATTCTGCAGCTCCAGCACCATTACAATCCCTAGCACCAGCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCAGTGGGCCCAATTGCTGGACCATCAGCAGGGATTATTGATTCTTTTGGAACAGTAAGTAATGCTGGTCAGTGGTCAGCACAGTGGGCTCCTCCTCCTCAGGTACAAG
CTCCAGCAACATCTGTTTCTGGTGGCAATAACTGGTCTGCATTTCCACAGTCTGTTCAACCTTCCAATGGCGTATCGGACTCTCAGTCATGGAATACATTGATGTCTTCTGCTGCTCCTGCGCCTCTGAATCCATCCCAAAATGTGCAACCAGCTCAAGCTGCAACTAAACCGCCTCTGCAGGGACAGGGACAGCAGCCA
ACAGGAACCACACAGAATGGAAGGAATGAAATACCAGAGGACTTATTTAAACTCCCTTATCCTGAACCGGTTTTACATAATGCGGGTTTTCAATTGGGCTCCCAGCTTGGTGGTGTTTCTGGAGTACAATTTTCTTCAGTGGGAGTGCCTTTGCCAgtatgtaatttgtgaattaagcaaatatacagtcatggcacaat
ttggcctctaagggcgccctatctttgagaaatctattattgtgattttaacaatattttatgttctagtttctctttgtttgaatcgatgtggataattttatgattttgcaaccattatttttcatgcactacagGGTTCAGTGCCATATTATCATCCACCTTCAAAATCCACAAACCCATTTGATATTGCTGGTGAA
CTACCTGCAACACAAGGAAGTACG
Intron 4 GTAATGATTG ... TTCGTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 18.52 | 154 | 47 | 23 |
| A2 | 16.79 | 150 | 34.5 | 26 |
| A3 | 13.26 | 157 | 29 | 19 |
| A4 | 17.05 | 143.5 | 30 | 29 |
| A5 | 16.85 | 74 | 21 | 9 |
| A6 | 18.52 | 66 | 19 | 11 |
| A7 | 16.28 | 90 | 9 | 26 |
| A8 | 14.29 | 42 | 7 | 7 |
| A9 | 16.4 | 79 | 17 | 14 |
| A10 | 18.07 | 102 | 24 | 21 |
>TRINITY_DN106515_c0_g2_i1 from sample A2 / Example spliced isoformGCCGGGGGCGACCTCGGATGCATAGAGACCTTGAGGGTTTCTAGAAAACTTATGACAGCTACTCTCAAATTGGCATCCAGATCGTCATCTCCTCCAGTTGTATATACAGACCAAGCAGATCGCTGCAGACGTCTCCTGTTTGAGCGGCATCGACGCATTTTTCAGTTAATTCAAAATTGGACCAAGTTTGGTCATCAATT
GGGGTTTCGAACCCGTAACCTAGCGTTGGACGGGCAATTCCACCTGTGTATACCCTTAGGAGAACAAATGGCGAGCAGAATGAAGGAAGATGAAAGGAATGAGAAGGTTATACGGACTCTTCTAAAGCTTCCTCCCAATCGAAAATGTATTAACTGCAACAGTCTCGGACCCCAATATGTGTGTACAAATTTCTGGACAT
TTGTTTGCACAACTTGCAGTGGGATCCATCGGGAGTTTACACATCGAGTGAAATCAGTATCCATGGCTAAATTCACTTCTCAGGAAGTGACGTCTCTTCAACAAGGTGGCAATCAGAAAGCAAAAGAAATATATTTTAAAGACTTTGACCCACAGCGTCATCCACTACCTGACAGCAGCAATGTTGACAGGCTTCGAGAC
TTCATAAAGCATGTATATGTCGACAAGAGGTATAGCGGTGACAGGGGCGGTGATAGACCTCCACGAGGCAAAATGGGTGATAGAGATGATGCCTCAGAAAACAGGAGACCAGATTTATCTCGTTCAGATTCCCGTAGTCCTCCGTATGAAGATGAATATGGAGAACGCCGTTATGGTGATCGTCCTGGATTTGGTGCTCA
AAAATTTGAATATGATCGAAGTCGTTATGATGATCGAGGATATGATGATAGAAGATATGGTTATGATGAGAGAAGAAGTCCGAATCAGTATGATTCTGATCGAAGCAGGTATGATAAAGGTGTTCAGGACAATCGCCGATATGATGATACCTACAAGAGAAGTCCTGGTCAGTTTGAAAGTGGGAGGGATAAACGTTTTG
ATGACAGGTCTGGCAATGGAAATCAAAACAAGAGATTTGAAGATCGTAGATATCCTGACACACCTGATAGACGTAGGCCTGAAGAGCAGTCACCAAATTACCAGAGAGATTATGATATCACTAGCCCTCCTCCAGTCCGTCCAGTGAGGGATATTTTAGGTGATGATGTTCCAACTCTTAGAGTAAGTGATTTTCCTCGA
GCAAATGGAAGTAGGGATATTGAAGGATCTACACGTTCACTGGTAAGAATTGTTTTCATTGCCTTAGTGACTAATTTTATTTGATCTAAGATCTTCATAGAAACTTTTAG
>TRINITY_DN106515_c0_g2_i4 from sample A2 / Example unspliced isoform:GCCGGGGGCGACCTCGGATGCATAGAGACCTTGAGGGTTTCTAGAAAACTTATGACAGCTACTCTCAAATTGGCATCCAGATCGTCATCTCCTCCAGTTGTATATACAGACCAAGCAGATCGCTGCAGACGTCTCCTGTTTGAGCGGCATCGACGCATTTTTCAGTTAATTCAAAATTGGACCAAGTTTGGgtaatgatt
gcacacagttcttcattactcctttttcgagcgcttctctttgttcttagtataaagaatcggtatcttaacggaaataaggggttaatactgcgaatttggtttcgttgcagTCATCAATTGGGGTTTCGAACCCGTAACCTAGCGTTGGACGGGCAATTCCACCTGTGTATACCCTTAGGAGAACAAATGGCGAGCAG
AATGAAGGAAGATGAAAGGAATGAGAAGGTTATACGGACTCTTCTAAAGCTTCCTCCCAATCGAAAATGTATTAACTGCAACAGTCTCGGACCCCAATATGTGTGTACAAATTTCTGGACATTTGTTTGCACAACTTGCAGTGGGATCCATCGGGAGTTTACACATCGAGTGAAATCAGTATCCATGGCTAAATTCACTT
CTCAGGAAGTGACGTCTCTTCAACAAGGTGGCAATCAGAAAGCAAAAGAAATATATTTTAAAGACTTTGACCCACAGCGTCATCCACTACCTGACAGCAGCAATGTTGACAGGCTTCGAGACTTCATAAAGCATGTATATGTCGACAAGAGGTATAGCGGTGACAGGGGCGGTGATAGACCTCCACGAGGCAAAATGGGT
GATAGAGATGATGCCTCAGAAAACAGGAGACCAGATTTATCTCGTTCAGATTCCCGTAGTCCTCCGTATGAAGATGAATATGGAGAACGCCGTTATGGTGATCGTCCTGGATTTGGTGCTCAAAAATTTGAATATGATCGAAGTCGTTATGATGATCGAGGATATGATGATAGAAGATATGGTTATGATGAGAGAAGAAG
TCCGAATCAGTATGATTCTGATCGAAGCAGGTATGATAAAGGTGTTCAGGACAATCGCCGATATGATGATACCTACAAGAGAAGTCCTGGTCAGTTTGAAAGTGGGAGGGATAAACGTTTTGATGACAGGTCTGGCAATGGAAATCAAAACAAGAGATTTGAAGATCGTAGATATCCTGACACACCTGATAGACGTAGGC
CTGAAGAGCAGTCACCAAATTACCAGAGAGATTATGATATCACTAGCCCTCCTCCAGTCCGTCCAGTGAGGGATATTTTAGGTGATGATGTTCCAACTCTTAGAGTAAGTGATTTTCCTCGAGCAAATGGAAGTAGGGATATTGAAGGATCTACACGTTCACTGCCTGAAGCTCGTAGAGAATTCCGGGGACAGAGAACT
GCATCTTCAAGTAGCATGGGATCAGTTGAAGGTAGTTCTCCAAATCTGAACAGGGTTAATTCAGGAAGTTTGATAGATTTTAGTGCAGAGCCTGAACCTCCCACTGCAACTGCACAACAAGATCCATTTGGGGTTTCTTCAATTACACAGCCCTCTACAGCCACACAACAAGATCCATTTTCAGTTTCCTCTGTTAAACA
GCCATCTACTGCTGTACAACAGGATCCCTTTGCAGTTTCTTCAATTTCACAGCAACCTTCAGCTGTACAACAAGTCTTTTCTGCAGTTTCACAGCCATCTGCAGCTTCTGCTTCAGACAATGGTGGATGGGCAACATTTGATTTTGCTCCTCAGGTTGCTCATTCTGCAGCTCCAGCACCATTACAATCCCTAGCACCAG
CGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCAGTGGGCCCAATTGCTGGACCATCAGCAGGGATTATTGATTCTTTTGGAACAGTAAGTAATGCTGGTCAGTGGTCAGCACAGTGGGCTCCTCCTCCTCAGGTACAAGCTCCAGCAACATCTGTTTCTGGTGGCAATAACTGGTCTGCATTTCCACAGTCTGTTCAACCTTCCAAT
GGCGTATCGGACTCTCAGTCATGGAATACATTGATGTCTTCTGCTGCTCCTGCGCCTCTGAATCCATCCCAAAATGTGCAACCAGCTCAAGCTGCAACTAAACCGCCTCTGCAGGGACAGGGACAGCAGCCAACAGGAACCACACAGAATGGAAGGAATGAAATACCAGAGGACTTATTTAAACTCCCTTATCCTGAACC
GGTTTTACATAATGCGGGTTTTCAATTGGGCTCCCAGCTTGGTGGTGTTTCTGGAGTACAATTTTCTTCAGTGGGAGTGCCTTTGCCAGGTTCAGTGCCATATTATCATCCACCTTCAAAATCCACAAACCCATTTGATATTGCTGGTGAACTACCTGCAACACAAGGAAGTACGTTTCCAAGCATGGGATCGTTGCAAG
CTGCTTTGCCGAATTCTAATACAACTCCTTTGGCTGCACATGGTTCTGGGCCAGGGGCTTTTAATACCCAATGGACACCATCTCTAGCACCAGCTCCTTATCAACCAGTTGCTCCTGGATTATACATGGGTCAGCAGGTGTCAAATGCTTTTGCGCCAAAAGTGCAATCTGGTGCCACACCTATTACTAGTTTTCCTTCT
GGTTCGTTTCCTAGTGATGACCTCTTCTTCAATCTTGGAGCTCCTCGGCTGTCTTCTCAAAGCTCACTCCCTTCAGTTGGTGGTAACCCATTTGGTTAGAATCATGGTGGAGACATGGAGTTTTTTCACCCTTGGAATGGAAAATATAGATGGGCTGGACATCTTGCTGCTACTTTTCTGTTGCAAGGACCATGAGATTT
TGTATTATGATTGCAGCTAGGCGATTCCCCAAGTAGAAATATTCTGGATTTTGTGCCCTTTGGGAAGTCTTGAGGTGAAATTCGATTTGAATGCAGGCAGGGGTGGAAATCATAAAAGTTTTGCTAAGAAGTGCAATCATTTGTTCCATTCAAGGCATTGGTCGCAATTGTTTGCATATATTTCATCCCGATTGAAATAC
AGTATATGAATAATTTGTTTAGTTCTCATGGAGTTACATATTGTACCTAATGGCATTAGAAGATGCAAACAAATTGAGAGAATATTATTTAGCCTGAACATATGTAATCATTTGTACTGGCAGGCCTCAGATTCAGGCCTACCCAATTGCCCACTGAATGGTTTTGGGGTCCACTCTGAGGCGTGTGTACAATTGACTGT
TTTTATAGGTTATTGATGTGAATTTGTTAGATGGAGCCAGCATTTTCACTTGGCCTCGTGGCTTCTGGAGGCTAAGGATTTTTAGCCAGTGACTATTGTTTGCCTGTATTTAGTCTTTTAACGTTTCTTCTAATATTTTTTTAATGCCTTGTACCTGTTTGAATAATAGCCCTTTGGTGTATATTTTATACGTGGCTTGC
TTTGCAAGTTTAGACATTCATCTATCCTTTGAATGTCTTTGCTACGTAGCTGATATGGCCTCTGGTTCTGATAGTACGGTGGTGTCAGTTCTAGGATTAATACTGAACTTCTTTATCTTCAATAATATTAATATTTTGAATTGTTTGGAAACAGATGGCTTTGGATACACATTTGTGTATTACAATGTGTAAGAAAACTA
CTTGTAGG
Intron 5 GTACATACAT ... CATATTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 11.14 | 295.3 | 33 | 41 |
| A2 | 14.02 | 245.5 | 35 | 45 |
| A3 | 15.33 | 251.5 | 34 | 57 |
| A4 | 13.46 | 238 | 37 | 37 |
| A5 | 12.23 | 143.5 | 15 | 25 |
| A6 | 11.92 | 140.5 | 21 | 17 |
| A7 | 16.34 | 243.8 | 45 | 50 |
| A8 | 18.34 | 80.8 | 22 | 14 |
| A9 | 14.33 | 179.8 | 29 | 31 |
| A10 | 15.13 | 244.3 | 48 | 39 |
>TRINITY_DN112992_c0_g2_i5 from sample A3 / Example spliced isoformCGGAATAGCCTGTGACGTCGGCGCCCACGCTTGACCATACGAAGCGCTGGAACCTTTTTCCATGGCGACCTCGGATGCATAGAGACCTTGAGGGTTTCTAGAAAACTTATGACAGCTACTCTCAAATTGGCATCCAGATCGTCATCTCCTCCAGTTGTATATACAGACCAAGCAGATCGCTGCAGACGTCTCCTGTTCGA
GCGGCATCGACGCATTTTTCAGTTAATTCAAAATTGGACCAAGTTTGGTCATCAATTGGGGTTTCGAACCCGTAACCTAGCGTTGGACGGGCAATTCCACCTGTGTATACCCTTTTTTATTTCTCAGAGGAGAACAAATGGCGAGCAGAATGAAGGAAGATGAAAGGAATGAGAAGGTTATACGGACTCTTCTAAAGCTT
CCTCCCAATCGAAAATGTATTAACTGCAACAGTCTCGGACCCCAATATGTGTGTACAAATTTCTGGACATTTGTTTGCACAACTTGCAGTGGGATCCATCGGGAGTTTACACATCGAGTGAAATCAGTATCCATGGCTAAATTCACTTCTCAGGAAGTGACGTCTCTTCAACAAGGTGGCAATCAGAAAGCAAAAGAAAT
ATATTTTAAAGACTTTGACCCACAGCGTCATCCACTACCTGACAGCAGCAATGTTGACAGGCTTCGAGACTTCATAAAGCATGTATATGTCGACAAGAGGTATAGCGGTGACAGGGGCGGTGATAGACCTCCACGAGGCAAAATGGGTGATAGAGATGATGCCTCAGAAAACAGGAGACCAGATTTATCTCGTTCAGATT
CCCGTAGTCCTCCGTATGAAGATGAATATGGAGAACGCCGTTATGGTGATCGTCCTGGATTTGGTGCTCAAAAATTTGAATATGATCGAAGTCGTTATGATGATCGAGGATATGATGATAGAAGATATGGTTATGATGAGAGAAGAAGTCCGAATCAGTATGATTCTGATCGAAGCAGGTATGATAAAGGTGTTCAGGAC
AATCGCCGATATGATGATACCTACAAGAGAAGTCCTGGTCAGTTTGAAAGTGGGAGGGATAAACGTTTTGATGACAGGTCTGGCAATGGAAATCAAAACAAGAGATTTGAAGATCGTAGATATCCTGACACACCTGATAGACGTAGGCCTGAAGAGCAGTCACCAAATTACCAGAGAGATTATGATATCACTAGCCCTCC
TCCAGTCCGTCCAGTGAGGGATATTTTAGGTGATGATGTTCCAACTCTTAGAGTAAGTGATTTTCCTCGAGCAAATGGAAGTAGGGATATTGAAGGATCTACACGTTCACTGCCTGAAGCTCGTAGAGAATTCCGGGGACAGAGAACTGCATCTTCAAGTAGCATGGGATCAGTTGAAGGTAGTTCTCCAAATCTGAACA
GGGTTAATTCAGGAAGTTTGATAGATTTTAGTGCAGAGCCTGAACCTCCCACTGCAACTGCACAACAAGATCCATTTGGGGTTTCTTCAATTACACAGCCCTCTACAGCCACACAACAAGATCCATTTTCAGTTTCCTCTGTTAAACAGCCATCTACTGCTGTACAACAGGATCCCTTTGCAGTTTCTTCAATTTCACAG
CAACCTTCAGCTGTACAACAAGTCTTTTCTGCAGTTTCACAGCCATCTGCAGCTTCTGCTTCAGACAATGGTGGATGGGCAACATTTGATTTTGCTCCTCAGGTTGCTCATTCTGCAGCTCCAGCACCATTACAATCCCTAGCACCAGCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCAGTGGGCCCAATTGCTGGACCATCAGC
AGGGATTATTGATTCTTTTGGAACAGTAAGTAATGCTGGTCAGTGGTCAGCACAGTGGGCTCCTCCTCCTCAGGTACAAGCTCCAGCAACATCTGTTTCTGGTGGCAATAACTGGTCTGCATTTCCACAGTCTGTTCAACCTTCCAATGGCGTATCGGACTCTCAGTCATGGAATACATTGATGTCTTCTGCTGCTCCTG
CGCCTCTGAATCCATCCCAAAATGTGCAACCAGCTCAAGCTGCAACTAAACCGCCTCTGCAGGGACAGGGACAGCAGCCAACAGGAACCACACAGAATGGAAGGAATGAAATACCAGAGGACTTATTTAAACTCCCTTATCCTGAACCGGTTTTACATAATGCGGGTTTTCAATTGGGCTCCCAGCTTGGTGGTGTTTCT
GGAGTACAATTTTCTTCAGTGGGAGTGCCTTTGCCAGGTTCAGTGCCATATTATCATCCACCTTCAAAATCCACAAACCCATTTGATATTGCTGGTGAACTACCTGCAACACAAGGAAGTACGTTTCCAAGCATGGGATCGTTGCAAGCTGCTTTGCCGAATTCTAATACAACTCCTTTGGCTGCACATGGTTCTGGGCC
AGGGGCTTTTAATACCCAATGGACACCATCTCTAGCACCAGCTCCTTATCAACCAGTTGCTCCTGGATTATACATGGGTCAGCAGGTGTCAAATGCTTTTGCGCCAAAAGTGCAATCTGGTGCCACACCTATTACTAGTTTTCCTTCTGGTTCGTTTCCTAGTGATGACCTCTTCTTCAATCTTGGAGCTCCTCGGCTGT
CTTCTCAAAGCTCACTCCCTTCAGTTGGTGGTAACCCATTTGGTTAGAATCATGGTGGAGACATGGAGTTTTTTCACCCTTGGAATGGAAAATATAGATGGGCTGGACATCTTGCTGCTACTTTTCTGTTGCAAGGACCATGAGATTTTGTATTATGATTGCAGCTAGGCGATTCCCCAAGTAGAAATATTCTGGATTTT
GTGCCCTTTGGGAAGTCTTGAGGTGAAATTCGATTTGAATGCAGGCAGGGGTGGAAATCATAAAAGTTTTGCTAAGAAGTGCAATCATTTGTTCCATTCAAGGCATTGGTCGCAATTGTTTGCATATATTTCATCCCGATTGAAATACAGTATATGAATAATTTGTTTAGTTCTCATGGAGTTACATATTGTACCTAATG
GCATTAGAAGATGCAAACAAATTGAGAGAATATTATTTAGCCTGAACATATGTAATCATTTGTACTGGCAGGCCTCAGATTCAGGCCTACCCAATTGCCCACTGAATGGTTTTGGGGTCCACTCTGAGGCGTGTGTACAATTGACTGTTTTTATAGGTTATTGATGTGAATTTGTTAGATGGAGCCAGCATTTTCACTTG
GCCTCGTGGCTTCTGGAGGCTAAGGATTTTTAGCCAGTGACTATTGTTTGCCTGTATTTAGTCTTTTAACGTTTCTTCTAATATTTTTTTAATGCCTTGTACCTGTTTGAATAATAGCCCTTTGGTGTATATTTTATACGTGGCTTGCTTTGCAAGTTTAGACATTCATCTATCCTTTGAATGTCTTTGCTACGTAGCTG
ATATGGCCTCTGGTTCTGATAGTACGGTGGTGTCAGTTCTAGGATTAATACTGAACTTCTTTATCTTCAATAATATTAATATTTTGAATTGTTTGGAAACAGATGGCTTTGGATACACATTTGTGTATTACAATGTGTAAGAAAACTACTTGTAGGCCAATATACTTCTTCTCAGTGC
>TRINITY_DN112992_c0_g2_i7 from sample A3 / Example unspliced isoform:AGGAGAACAAATGGCGAGCAGAATGAAGGAAGATGAAAGGAATGAGAAGGTTATACGGACTCTTCTAAAGCTTCCTCCCAATCGAAAATGTATTAACTGCAACAGTCTCGGACCCCAATATGTGTGTACAAATTTCTGGACATTTGTTTGCACAACTTGCAGTGGGATCCATCGGGAGTTTACACATCGAGTGAAATCAG
TATCCATGGCTAAATTCACTTCTCAGGAAGTGACGTCTCTTCAACAAGGTGGCAATCAGgtacatacataaaagtgtcttgtagataaaccatcattttgcaaacaagcaggatagagtgaatttctctaaccttgtttgagaatgatgtggttaagaaatcacattttcagatagccttctaaatgatcattttctctc
ttccatattgcagAAAGCAAAAGAAATATATTTTAAAGACTTTGACCCACAGCGTCATCCACTACCTGACAGCAGCAATGTTGACAGGCTTCGAGACTTCATAAAGCATGTATATGTCGACAAGAGGTATAGCGGTGACAGGGGCGGTGATAGACCTCCACGAGGCAAAATGGTATGCACTTGATCAGCTAATGCTTGCA
AATACTTCCTGTCCATTTTTCTTGTACAGAACTTTCTGCATTGGCCTATTGACCTGGAAACATTTTGCTGCATCTTTACTTGAAGTGCCATTTATCATTTTGTGTATTTTAATAAGAGATTAGAATGGTATGTCAGATTTGAAAGGTTAAAATGCATGTTTTGGCAGGGTGATAGAGATGATGCCTCAGAAAACAGGAGA
CCAGATTTATCTCGTTCAGATTCCCGTAGTCCTCCGTATGAAGATGAATATGGAGAACGCCGTTATGGTGATCGTCCTGGATTTGGTGCTCAAAAATTTGAATATGATCGAAGTCGTTATGATGATCGAGGATATGATGATAGAAGATATGGTTATGATGAGAGAAGAAGTCCGAATCAGTATGATTCTGATCGAAGCAG
GTATGATAAAGGTGTTCAGGACAATCGCCGATATGATGATACCTACAAGAGAAGTCCTGGTCAGTTTGAAAGTGGGAGGGATAAACGTTTTGATGACAGGTCTGGCAATGGAAATCAAAACAAGAGATTTGAAGATCGTAGATATCCTGACACACCTGATAGACGTAGGCCTGAAGAGCAGTCACCAAATTACCAGAGAG
ATTATGATATCACTAGCCCTCCTCCAGTCCGTCCAGTGAGGGATATTTTAGGTGATGATGTTCCAACTCTTAGAGTAAGTGATTTTCCTCGAGCAAATGGAAGTAGGGATATTGAAGGATCTACACGTTCACTGCCTGAAGCTCGTAGAGAATTCCGGGGACAGAGAACTGCATCTTCAAGTAGCATGGGATCAGTTGAA
GGTAGTTCTCCAAATCTGAACAGGGTTAATTCAGGAAGTTTGATAGATTTTAGTGCAGAGCCTGAACCTCCCACTGCAACTGCACAACAAGATCCATTTGGGGTTTCTTCAATTACACAGCCCTCTACAGCCACACAACAAGATCCATTTTCAGTTTCCTCTGTTAAACAGCCATCTACTGCTGTACAACAGGATCCCTT
TGCAGTTTCTTCAATTTCACAGCAACCTTCAGCTGTACAACAAGTCTTTTCTGCAGTTTCACAGCCATCTGCAGCTTCTGCTTCAGACAATGGTGGATGGGCAACATTTGATTTTGCTCCTCAGGTTGCTCATTCTGCAGCTCCAGCACCATTACAATCCCTAGCACCAGCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCAGTGG
GCCCAATTGCTGGACCATCAGCAGGGATTATTGATTCTTTTGGAACAGTAAGTAATGCTGGTCAGTGGTCAGCACAGTGGGCTCCTCCTCCTCAGGTACAAGCTCCAGCAACATCTGTTTCTGGTGGCAATAACTGGTCTGCATTTCCACAGTCTGTTCAACCTTCCAATGGCGTATCGGACTCTCAGTCATGGAATACA
TTGATGTCTTCTGCTGCTCCTGCGCCTCTGAATCCATCCCAAAATGTGCAACCAGCTCAAGCTGCAACTAAACCGCCTCTGCAGGGACAGGGACAGCAGCCAACAGGAACCACACAGAATGGAAGGAATGAAATACCAGAGGACTTATTTAAACTCCCTTATCCTGAACCGGTTTTACATAATGCGGGTTTTCAATTGGG
CTCCCAGCTTGGTGGTGTTTCTGGAGTACAATTTTCTTCAGTGGGAGTGCCTTTGCCAGGTTCAGTGCCATATTATCATCCACCTTCAAAATCCACAAACCCATTTGATATTGCTGGTGAACTACCTGCAACACAAGGAAGTACGTTTCCAAGCATGGGATCGTTGCAAGCTGCTTTGCCGAATTCTAATACAACTCCTT
TGGCTGCACATGGTTCTGGGCCAGGGGCTTTTAATACCCAATGGACACCATCTCTAGCACCAGCTCCTTATCAACCAGTTGCTCCTGGATTATACATGGGTCAGCAGGTGTCAAATGCTTTTGCGCCAAAAGTGCAATCTGGTGCCACACCTATTACTAGTTTTCCTTCTGGTTCGTTTCCTAGTGATGACCTCTTCTTC
AATCTTGGAGCTCCTCGGCTGTCTTCTCAAAGCTCACTCCCTTCAGTTGGTGGTAACCCATTTGGTTAGAATCATGGTGGAGACATGGAGTTTTTTCACCCTTGGAATGGAAAATATAGATGGGCTGGACATCTTGCTGCTACTTTTCTGTTGCAAGGACCATGAGATTTTGTATTATGATTGCAGCTAGGCGATTCCCC
AAGTAGAAATATTCTGGATTTTGTGCCCTTTGGGAAGTCTTGAGGTGAAATTCGATTTGAATGCAGGCAGGGGTGGAAATCATAAAAGTTTTGCTAAGAAGTGCAATCATTTGTTCCATTCAAGGCATTGGTCGCAATTGTTTGCATATATTTCATCCCGATTGAAATACAGTATATGAATAATTTGTTTAGTTCTCATG
GAGTTACATATTGTACCTAATGGCATTAGAAGATGCAAACAAATTGAGAGAATATTATTTAGCCTGAACATATGTAATCATTTGTACTGGCAGGCCTCAGATTCAGGCCTACCCAATTGCCCACTGAATGGTTTTGGGGTCCACTCTGAGGCGTGTGTACAATTGACTGTTTTTATAGGTTATTGATGTGAATTTGTTAG
ATGGAGCCAGCATTTTCACTTGGCCTCGTGGCTTCTGGAGGCTAAGGATTTTTAGCCAGTGACTATTGTTTGCCTGTATTTAGTCTTTTAACGTTTCTTCTAATATTTTTTTAATGCCTTGTACCTGTTTGAATAATAGCCCTTTGGTGTATATTTTATACGTGGCTTGCTTTGCAAGTTTAGACATTCATCTATCCTTT
GAATGTCTTTGCTACGTAGCTGATATGGCCTCTGGTTCTGATAGTACGGTGGTGTCAGTTCTAGGATTAATACTGAACTTCTTTATCTTCAATAATATTAATATTTTGAATTGTTTGGAAACAGATGGCTTTGGATACACATTTGTGTATTACAATGTGTAAGAAAACTACTTGTAGGCCAATATACTTCTTCTCAGTGC
Intron 6 GTAAGTCTTT ... TGTTTTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 23.98 | 168 | 25.1 | 53 |
| A2 | 24.52 | 102 | 16.9 | 33.1 |
| A3 | 18.25 | 112 | 18 | 25 |
| A4 | 28.44 | 78 | 14.3 | 31 |
| A5 | 20.31 | 51 | 3.4 | 13 |
| A6 | 23.49 | 342 | 38.4 | 105 |
| A7 | 24.94 | 301 | 35 | 100 |
| A8 | 22.65 | 321 | 44.6 | 94 |
| A9 | 23.44 | 258 | 34.3 | 79 |
| A10 | 20.21 | 225 | 28.6 | 57 |
>TRINITY_DN125793_c11_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoformCGCTTGACCATACGAAGCGCTGGAACCTTTTTCCATGGCGACCTCGGATGCATAGAGACCTTGAGGGTTTCTAGAAAACTTATGACAGCTACTCTCAAATTGGCATCCAGATCGTCATCTCCTCCAGTTGTATATACAGACCAAGCAGATCGCTGCAGACGTCTCCTGTTCGAGCGGCATCGACGCATTTTTCAGTTAAT
TCAAAATTGGACCAAGTTTGGTCATCAATTGGGGTTTCGAACCCGTAACCTAGCGTTGGACGGGCAATTCCACCTGTGTATACCCTTAGGAGAACAAATGGCGAGCAGAATGAAGGAAGATGAAAGGAATGAGAAGGTTATACGGACTCTTCTAAAGCTTCCTCCCAATCGAAAATGTATTAACTGCAACAGTCTCGGAC
CCCAATATGTGTGTACAAATTTCTGGACATTTGTTTGCACAACTTGCAGTGGGATCCATCGGGAGTTTACACATCGAGTGAAATCAGTATCCATGGCTAAATTCACTTCTCAGGAAGTGACGTCTCTTCAACAAGGTGGCAATCAGAAAGCAAAAGAAATATATTTTAAAGACTTTGACCCACAGCGTCATCCACTACCT
GACAGCAGCAATGTTGACAGGCTTCGAGACTTCATAAAGCATGTATATGTCGACAAGAGGTATAGCGGTGACAGGGGCGGTGATAGACCTCCACGAGGCAAAATGGGTGATAGAGATGATGCCTCAGAAAACAGGAGACCAGATTTATCTCGTTCAGATTCCCGTAGTCCTCCGTATGAAGATGAATATGGAGAACGCCG
TTATGGTGATCGTCCTGGATTTGGTGCTCAAAAATTTGAATATGATCGAAGTCGTTATGATGATCGAGGATATGATGATAGAAGATATGGTTATGATGAGAGAAGAAGTCCGAATCAGTATGATTCTGATCGAAGCAGGTATGATAAAGGTGTTCAGGACAATCGCCGATATGATGATACCTACAAGAGAAGTCCTGGTC
AGTTTGAAAGTGGGAGGGATAAACGTTTTGATGACAGGTCTGGCAATGGAAATCAAAACAAGAGATTTGAAGATCGTAGATATCCTGACACACCTGATAGACGTAGGCCTGAAGAGCAGTCACCAAATTACCAGAGAGATTATGATATCACTAGCCCTCCTCCAGTCCGTCCAGTGAGGGATATTTTAGGTGATGATGTT
CCAACTCTTAGAGTAAGTGATTTTCCTCGAGCAAATGGAAGTAGGGATATTGAAGGATCTACACGTTCACTGCCTGAAGCTCGTAGAGAATTCCGGGGACAGAGAACTGCATCTTCAAGTAGCATGGGATCAGTTGAAGGTAGTTCTCCAAATCTGAACAGGGTTAATTCAGGAAGTTTGATAGATTTTAGTGCAGAGCC
TGAACCTCCCACTGCAACTGCACAACAAGATCCATTTGGGGTTTCTTCAATTACACAGCCCTCTACAGCCACACAACAAGATCCATTTTCAGTTTCCTCTGTTAAACAGCCATCTACTGCTGTACAACAGGATCCCTTTGCAGTTTCTTCAATTTCACAGCAACCTTCAGCTGTACAACAAGTCTTTTCTGCAGTTTCAC
AGCCATCTGCAGCTTCTGCTTCAGACAATGGTGGATGGGCAACATTTGATTTTGCTCCTCAGGTTGCTCATTCTGCAGCTCCAGCACCATTACAATCCCTAGCACCAGCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCAGTGGGCCCAATTGCTGGACCATCAGCAGGGATTATTGATTCTTTTGGAACAGTAAGTAATGCTGGT
CAGTGGTCAGCACAGTGGGCTCCTCCTCCTCAGGTACAAGCTCCAGCAACATCTGTTTCTGGTGGCAATAACTGGTCTGCATTTCCACAGTCTGTTCAACCTTCCAATGGCGTATCGGACTCTCAGTCATGGAATACATTGATGTCTTCTGCTGCTCCTGCGCCTCTGAATCCATCCCAAAATGTGCAACCAGCTCAAGC
TGCAACTAAACCGCCTCTGCAGGGACAGGGACAGCAGCCAACAGGAACCACACAGAATGGAAGGAATGAAATACCAGAGGACTTATTTAAACTCCCTTATCCTGAACCGGTTTTACATAATGCGGGTTTTCAATTGGGCTCCCAGCTTGGTGGTGTTTCTGGAGTACAATTTTCTTCAGTGGGAGTGCCTTTGCCAGGTT
CAGTGCCATATTATCATCCACCTTCAAAATCCACAAACCCATTTGATATTGCTGGTGAACTACCTGCAACACAAGGAAGTACGTTTCCAAGCATGGGATCGTTGCAAGCTGCTTTGCCGAATTCTAATACAACTCCTTTGGCTGCACATGGTTCTGGGCCAGGGGCTTTTAATACCCAATGGACACCATCTCTAGCACCA
GCTCCTTATCAACCAGTTGCTCCTGGATTATACATGGGTCAGCAGGTGTCAAATGCTTTTGCGCCAAAAGTGCAATCTGGTGCCACACCTATTACTAGTTTTCCTTCTGGTTCGTTTCCTAGTGATGACCTCTTCTTCAATCTTGGAGCTCCTCGGCTGTCTTCTCAAAGCTCACTCCCTTCAGTTGGTGGTAACCCATT
TGGTTAGAATCATGGTGGAGACATGGAGTTTTTTCACCCTTGGAATGGAAAATATAGATGGGCTGGACATCTTGCTGCTACTTTTCTGTTGCAAGGACCATGAGATTTTGTATTATGATTGCAGCTAGGCGATTCCCCAAGTAGAAATATTCTGGATTTTGTGCCCTTTGGGAAGTCTTGAGGTGAAATTCGATTTGAAT
GCAGGCAGGGGTGGAAATCATAAAAGTTTTGCTAAGAAGTGCAATCATTTGTTCCATTCAAGGCATTGGTCGCAATTGTTTGCATATATTTCATCCCGATTGAAATACAGTATATGAATAATTTGTTTAGTTCTCATGGAGTTACATATTGTACCTAATGGCATTAGAAGATGCAAACAAATTGAGAGAATATTATTTAG
CCTGAACATATGTAATCATTTGTACTGGCAGGCCTCAGATTCAGGCCTACCCAATTGCCCACTGAATGGTTTTGGGGTCCACTCTGAGGCGTGTGTACAATTGACTGTTTTTATAGGTTATTGATGTGAATTTGTTAGATGGAGCCAGCATTTTCACTTGGCCTCGTGGCTTCTGGAGGCTAAGGATTTTTAGCCAGTGA
CTATTGTTTGCCTGTATTTAGTCTTTTAACGTTTCTTCTAATATTTTTTTAATGCCTTGTACCTGTTTGAATAATAGCCCTTTGGTGTATATTTTATACGTGGCTTGCTTTGCAAGTTTAGACATTCATCTATCCTTTGAATGTCTTTGCTACGTAGCTGATATGGCCTCTGGTTCTGATAGTACGGTGGTGTCAGTTCT
AGGATTAATACTGAACTTCTTTATCTTCAATAATATTAATATTTTGAATTGTTTGGAAACAGATGGCTTTGGATACACATTTGTGTATTACAATGTGTAAGAAAACTACTTGTAGGCCAATATACTTCTTCTCAGTGTTCATGTTATTTGCACATGGTGTTGTTTGAATCTTTTGAAATTTTTTAGTTTGAATCCTTTTG
CAATTAAAATTGTACAAATGTAATCTAGCCCTAGTCTTATTTTGCAAGTGAGCAGATTGGATCACTTCCACATAAAACGGTGTATTATATTGACTTTATTTCGAGGGCAGTTTCTCACTGAATATTTCGTCTTTCATTGCTGTTGCATCTCGTTATTGAGCATCTTCTTTTAATTGTGAAAATGGTTAAGCTCTTTGTTG
AGCAGGTTTTCATTAATTTCTTACAAGGTAAATTGGCGCTGTTAAATTCCATAGGACCCTCATTAGAGCAATATTCGCAGAAATTGTAATATAATTAACGATTTTGAAAGACAACAAAACTAAAATTGAAGAGCATGTTTGTGAAATTTTCAATCAATTAGATTCCTTAGATTCCTCTTGCTGTGTTAGACTTGATTTTC
AATCTAATTTTATTTTTAATGGATGGATGGCTTTTCTTTTATAGACGTTTTGAAGGCGTCTTTGAAAGGATTAAAGATGGCTCTTTATTATATTTTTGTACCTCTTTTCGTAATCATTTTGGTAAATGATTGGTTTTTCTTTTACAGACTTGTTGAAAGAATGGTAGAAGGGGACTAAAGATTACTCCA
>TRINITY_DN125793_c11_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:GGGGTAAGCCGAATTGGTAAGTCTCTCTTGTAATGACGGTTTGACCCGTGTTCGAGTCTCTCAAAGGCATTTCTCACTTGAATGGGAGTGCTGATTCGGTGATTGGGCATGTTAGGTTGCATTGCATTGTAGGAGCACTTTTCCGGGATATGAACCCCCATCTTTTTCTCCTGTCGCGAGCACCTGAGTGGGCCTAATGG
TTAAGAACATGTGTTATCTCCGAGGAGGTCACAGGTTCAAAACCGACGGGGGGGAGGGTTGCTCATTGGCCCGTTGTGACAAGGCTGGATATTTTTAACATCAGCTGGTTACGTTATTATTTTGCAGGATTATACATGGGTCAGCAGGTGTCAAATGCTTTTGCGCCAAAAGTgtaagtctttcctgaaggcctggtggg
atgagatctcatgttggttgattttcaagttctttggtataaatattgactgaagtttttcaaatttatcatgtatctcatctatttatatcgttttttattcataaaatgtgactgtcttaaatattcatgttttacagGCAATCTGGTGCCACACCTATTACTAGTTTTCCTTCTGGTTCGTTTCCTAGTGATGACCT
CTTCTTCAATCTTGGAGCTCCTCGGCTGTCTTCTCAAAGCTCACTCCCTTCAGTTGGTGGTAACCCATTTGGTTAGAATCATGGTGGAGACATGGAGTTTTTTCACCCTTGGAATGGAAAATATAGATGGGCTGGACATCTTGCTGCTACTTTTCTGTTGCAAGGACCATGAGATTTTGTATTATGATTGCAGCTAGGCG
ATTCCCCAAGTAGAAATATTCTGGATTTTGTGCCCTTTGGGAAGTCTTGAGGTGAAATTCGATTTGAATGCAGGCAGGGGTGGAAATCATAAAAGTTTTGCTAAGAAGTGCAATCATTTGTTCCATTCAAGGCATTGGTCGCAATTGTTTGCATATATTTCATCCCGATTGAAATACAGTATATGAATAATTTGTTTAGT
TCTCATGGAGTTACATATTGTACCTAATGGCATTAGAAGATGCAAACAAATTGAGAGAATATTATTTAGCCTGAACATATGTAATCATTTGTACTGGCAGGCCTCAGATTCAGGCCTACCCAATTGCCCACTGAATGGTTTTGGGGTCCACTCTGAGGCGTGTGTACAATTGACTGTTTTTATAGGTTATTGATGTGAAT
TTGTTAGATGGAGCCAGCATTTTCACTTGGCCTCGTGGCTTCTGGAGGCTAAGGATTTTTAGCCAGTGACTATTGTTTGCCTGTATTTAGTCTTTTAACGTTTCTTCTAATATTTTTTTAATGCCTTGTACCTGTTTGAATAATAGCCCTTTGGTGTATATTTTATACGTGGCTTGCTTTGCAAGTTTAGACATTCATCT
ATCCTTTGAATGTCTTTGCTACGTAGCTGATATGGCCTCTGGTTCTGATAGTACGGTGGTGTCAGTTCTAGGATTAATACTGAACTTCTTTATCTTCAATAATATTAATATTTTGAATTGTTTGGAAACAGATGGCTTTGGATACACATTTGTGTATTACAATGTGTAAGAAAACTACTTGTAGGCCAATATACTTCTTC
TCAGTGTTCATGTTATTTGCACATGGTGTTGTTTGAATCTTTTGAAATTTTTTAGTTTGAATCCTTTTGCAATTAAAATTGTACAAATGTAATCTAGCCCTAGTCTTATTTTGCAAGTGAGCAGATTGGATCACTTCCACATAAAACGGTGTATTATATTGACTTTATTTCGAGGGCAGTTTCTCACTGAATATTTCGTC
TTTCATTGCTGTTGCATCTCGTTATTGAGCATCTTCTTTTAATTGTGAAAATGGTTAAGCTCTTTGTTGAGCAGGTTTTCATTAATTTCTTACAAGGTAAATTGGCGCTGTTAAATTCCATAGGACCCTCATTAGAGCAATATTCGCAGAAATTGTAATATAATTAACGATTTTGAAAGACAACAAAACTAAAATTGAAG
AGCATGTTTGTGAAATTTTCAATCAATTAGATTCCTTAGATTCCTCTTGCTGTGTTAGACTTGATTTTCAATCTAATTTTATTTTTAATGGATGGATGGCTTTTCTTTTATAGACGTTTTGAAGGCGTCTTTGAAAGGATTAAAGATGGCTCTTTATTATATTTTTGTACCTCTTTTCGTAATCATTTTGGTAAATGATT
GGTTTTTCTTTTACAGACTTGTTGAAAGAATGGTAGAAGGGGACTAAAGATTACTCCA
Intron 7 GTAAGTGAAT ... GAATTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 26.61 | 182 | 1 | 66 |
| A2 | 27.46 | 177 | 0 | 67 |
| A3 | 24.89 | 175 | 4 | 58 |
| A4 | 27.53 | 179 | 1 | 68 |
| A5 | 26.21 | 107 | 2 | 38 |
| A6 | 26.17 | 110 | 0 | 39 |
| A7 | 22.66 | 157 | 0 | 46 |
| A8 | 18.75 | 65 | 0 | 15 |
| A9 | 21.58 | 149 | 0 | 41 |
| A10 | 28.81 | 173 | 0 | 70 |
>TRINITY_DN112992_c0_g2_i5 from sample A3 / Example spliced isoformCGGAATAGCCTGTGACGTCGGCGCCCACGCTTGACCATACGAAGCGCTGGAACCTTTTTCCATGGCGACCTCGGATGCATAGAGACCTTGAGGGTTTCTAGAAAACTTATGACAGCTACTCTCAAATTGGCATCCAGATCGTCATCTCCTCCAGTTGTATATACAGACCAAGCAGATCGCTGCAGACGTCTCCTGTTCGA
GCGGCATCGACGCATTTTTCAGTTAATTCAAAATTGGACCAAGTTTGGTCATCAATTGGGGTTTCGAACCCGTAACCTAGCGTTGGACGGGCAATTCCACCTGTGTATACCCTTTTTTATTTCTCAGAGGAGAACAAATGGCGAGCAGAATGAAGGAAGATGAAAGGAATGAGAAGGTTATACGGACTCTTCTAAAGCTT
CCTCCCAATCGAAAATGTATTAACTGCAACAGTCTCGGACCCCAATATGTGTGTACAAATTTCTGGACATTTGTTTGCACAACTTGCAGTGGGATCCATCGGGAGTTTACACATCGAGTGAAATCAGTATCCATGGCTAAATTCACTTCTCAGGAAGTGACGTCTCTTCAACAAGGTGGCAATCAGAAAGCAAAAGAAAT
ATATTTTAAAGACTTTGACCCACAGCGTCATCCACTACCTGACAGCAGCAATGTTGACAGGCTTCGAGACTTCATAAAGCATGTATATGTCGACAAGAGGTATAGCGGTGACAGGGGCGGTGATAGACCTCCACGAGGCAAAATGGGTGATAGAGATGATGCCTCAGAAAACAGGAGACCAGATTTATCTCGTTCAGATT
CCCGTAGTCCTCCGTATGAAGATGAATATGGAGAACGCCGTTATGGTGATCGTCCTGGATTTGGTGCTCAAAAATTTGAATATGATCGAAGTCGTTATGATGATCGAGGATATGATGATAGAAGATATGGTTATGATGAGAGAAGAAGTCCGAATCAGTATGATTCTGATCGAAGCAGGTATGATAAAGGTGTTCAGGAC
AATCGCCGATATGATGATACCTACAAGAGAAGTCCTGGTCAGTTTGAAAGTGGGAGGGATAAACGTTTTGATGACAGGTCTGGCAATGGAAATCAAAACAAGAGATTTGAAGATCGTAGATATCCTGACACACCTGATAGACGTAGGCCTGAAGAGCAGTCACCAAATTACCAGAGAGATTATGATATCACTAGCCCTCC
TCCAGTCCGTCCAGTGAGGGATATTTTAGGTGATGATGTTCCAACTCTTAGAGTAAGTGATTTTCCTCGAGCAAATGGAAGTAGGGATATTGAAGGATCTACACGTTCACTGCCTGAAGCTCGTAGAGAATTCCGGGGACAGAGAACTGCATCTTCAAGTAGCATGGGATCAGTTGAAGGTAGTTCTCCAAATCTGAACA
GGGTTAATTCAGGAAGTTTGATAGATTTTAGTGCAGAGCCTGAACCTCCCACTGCAACTGCACAACAAGATCCATTTGGGGTTTCTTCAATTACACAGCCCTCTACAGCCACACAACAAGATCCATTTTCAGTTTCCTCTGTTAAACAGCCATCTACTGCTGTACAACAGGATCCCTTTGCAGTTTCTTCAATTTCACAG
CAACCTTCAGCTGTACAACAAGTCTTTTCTGCAGTTTCACAGCCATCTGCAGCTTCTGCTTCAGACAATGGTGGATGGGCAACATTTGATTTTGCTCCTCAGGTTGCTCATTCTGCAGCTCCAGCACCATTACAATCCCTAGCACCAGCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCAGTGGGCCCAATTGCTGGACCATCAGC
AGGGATTATTGATTCTTTTGGAACAGTAAGTAATGCTGGTCAGTGGTCAGCACAGTGGGCTCCTCCTCCTCAGGTACAAGCTCCAGCAACATCTGTTTCTGGTGGCAATAACTGGTCTGCATTTCCACAGTCTGTTCAACCTTCCAATGGCGTATCGGACTCTCAGTCATGGAATACATTGATGTCTTCTGCTGCTCCTG
CGCCTCTGAATCCATCCCAAAATGTGCAACCAGCTCAAGCTGCAACTAAACCGCCTCTGCAGGGACAGGGACAGCAGCCAACAGGAACCACACAGAATGGAAGGAATGAAATACCAGAGGACTTATTTAAACTCCCTTATCCTGAACCGGTTTTACATAATGCGGGTTTTCAATTGGGCTCCCAGCTTGGTGGTGTTTCT
GGAGTACAATTTTCTTCAGTGGGAGTGCCTTTGCCAGGTTCAGTGCCATATTATCATCCACCTTCAAAATCCACAAACCCATTTGATATTGCTGGTGAACTACCTGCAACACAAGGAAGTACGTTTCCAAGCATGGGATCGTTGCAAGCTGCTTTGCCGAATTCTAATACAACTCCTTTGGCTGCACATGGTTCTGGGCC
AGGGGCTTTTAATACCCAATGGACACCATCTCTAGCACCAGCTCCTTATCAACCAGTTGCTCCTGGATTATACATGGGTCAGCAGGTGTCAAATGCTTTTGCGCCAAAAGTGCAATCTGGTGCCACACCTATTACTAGTTTTCCTTCTGGTTCGTTTCCTAGTGATGACCTCTTCTTCAATCTTGGAGCTCCTCGGCTGT
CTTCTCAAAGCTCACTCCCTTCAGTTGGTGGTAACCCATTTGGTTAGAATCATGGTGGAGACATGGAGTTTTTTCACCCTTGGAATGGAAAATATAGATGGGCTGGACATCTTGCTGCTACTTTTCTGTTGCAAGGACCATGAGATTTTGTATTATGATTGCAGCTAGGCGATTCCCCAAGTAGAAATATTCTGGATTTT
GTGCCCTTTGGGAAGTCTTGAGGTGAAATTCGATTTGAATGCAGGCAGGGGTGGAAATCATAAAAGTTTTGCTAAGAAGTGCAATCATTTGTTCCATTCAAGGCATTGGTCGCAATTGTTTGCATATATTTCATCCCGATTGAAATACAGTATATGAATAATTTGTTTAGTTCTCATGGAGTTACATATTGTACCTAATG
GCATTAGAAGATGCAAACAAATTGAGAGAATATTATTTAGCCTGAACATATGTAATCATTTGTACTGGCAGGCCTCAGATTCAGGCCTACCCAATTGCCCACTGAATGGTTTTGGGGTCCACTCTGAGGCGTGTGTACAATTGACTGTTTTTATAGGTTATTGATGTGAATTTGTTAGATGGAGCCAGCATTTTCACTTG
GCCTCGTGGCTTCTGGAGGCTAAGGATTTTTAGCCAGTGACTATTGTTTGCCTGTATTTAGTCTTTTAACGTTTCTTCTAATATTTTTTTAATGCCTTGTACCTGTTTGAATAATAGCCCTTTGGTGTATATTTTATACGTGGCTTGCTTTGCAAGTTTAGACATTCATCTATCCTTTGAATGTCTTTGCTACGTAGCTG
ATATGGCCTCTGGTTCTGATAGTACGGTGGTGTCAGTTCTAGGATTAATACTGAACTTCTTTATCTTCAATAATATTAATATTTTGAATTGTTTGGAAACAGATGGCTTTGGATACACATTTGTGTATTACAATGTGTAAGAAAACTACTTGTAGGCCAATATACTTCTTCTCAGTGC
>TRINITY_DN112992_c0_g2_i6 from sample A3 / Example unspliced isoform:CTTGCAGTGGGATCCAgtaagtgaatattttttgcttttttagtctaaataatatttgattttgtatttttgatggttgtacctcttttccaccttgttagtaaaataacagagcaaaataagggttaaaaacttaaaacatgagttgattttcgatgaatcatgaaattgcttgcattttttatttctttaccgaattt
agataattgaccttaacagtcattggctcgctaatgtgacctttatttaatgaattggcagTCGGGAGTTTACACATCGAGTGAAATCAGTATCCATGGCTAAATTCACTTCTCAGGAAGTGACGTCTCTTCAACAAGGTGGCAATCAGAAAGCAAAAGAAATATATTTTAAAGACTTTGACCCACAGCGTCATCCACTA
CCTGACAGCAGCAATGTTGACAGGCTTCGAGACTTCATAAAGCATGTATATGTCGACAAGAGGTATAGCGGTGACAGGGGCGGTGATAGACCTCCACGAGGCAAAATGGGTGATAGAGATGATGCCTCAGAAAACAGGAGACCAGATTTATCTCGTTCAGATTCCCGTAGTCCTCCGTATGAAGATGAATATGGAGAACG
CCGTTATGGTGATCGTCCTGGATTTGGTGCTCAAAAATTTGAATATGATCGAAGTCGTTATGATGATCGAGGATATGATGATAGAAGATATGGTTATGATGAGAGAAGAAGTCCGAATCAGTATGATTCTGATCGAAGCAGGTATGATAAAGGTGTTCAGGACAATCGCCGATATGATGATACCTACAAGAGAAGTCCTG
GTCAGTTTGAAAGTGGGAGGGATAAACGTTTTGATGACAGGTCTGGCAATGGAAATCAAAACAAGAGATTTGAAGATCGTAGATATCCTGACACACCTGATAGACGTAGGCCTGAAGAGCAGTCACCAAATTACCAGAGAGATTATGATATCACTAGCCCTCCTCCAGTCCGTCCAGTGAGGGATATTTTAGGTGATGAT
GTTCCAACTCTTAGAGTAAGTGATTTTCCTCGAGCAAATGGAAGTAGGGATATTGAAGGATCTACACGTTCACTGCCTGAAGCTCGTAGAGAATTCCGGGGACAGAGAACTGCATCTTCAAGTAGCATGGGATCAGTTGAAGGTAGTTCTCCAAATCTGAACAGGGTTAATTCAGGAAGTTTGATAGATTTTAGTGCAGA
GCCTGAACCTCCCACTGCAACTGCACAACAAGATCCATTTGGGGTTTCTTCAATTACACAGCCCTCTACAGCCACACAACAAGATCCATTTTCAGTTTCCTCTGTTAAACAGCCATCTACTGCTGTACAACAGGATCCCTTTGCAGTTTCTTCAATTTCACAGCAACCTTCAGCTGTACAACAAGTCTTTTCTGCAGTTT
CACAGCCATCTGCAGCTTCTGCTTCAGACAATGGTGGATGGGCAACATTTGATTTTGCTCCTCAGGTTGCTCATTCTGCAGCTCCAGCACCATTACAATCCCTAGCACCAGCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCAGTGGGCCCAATTGCTGGACCATCAGCAGGGATTATTGATTCTTTTGGAACAGTAAGTAATGCT
GGTCAGTGGTCAGCACAGTGGGCTCCTCCTCCTCAGGTACAAGCTCCAGCAACATCTGTTTCTGGTGGCAATAACTGGTCTGCATTTCCACAGTCTGTTCAACCTTCCAATGGCGTATCGGACTCTCAGTCATGGAATACATTGATGTCTTCTGCTGCTCCTGCGCCTCTGAATCCATCCCAAAATGTGCAACCAGCTCA
AGCTGCAACTAAACCGCCTCTGCAGGGACAGGGACAGCAGCCAACAGGAACCACACAGAATGGAAGGAATGAAATACCAGAGGACTTATTTAAACTCCCTTATCCTGAACCGGTTTTACATAATGCGGGTTTTCAATTGGGCTCCCAGCTTGGTGGTGTTTCTGGAGTACAATTTTCTTCAGTGGGAGTGCCTTTGCCAG
GTTCAGTGCCATATTATCATCCACCTTCAAAATCCACAAACCCATTTGATATTGCTGGTGAACTACCTGCAACACAAGGAAGTACGTTTCCAAGCATGGGATCGTTGCAAGCTGCTTTGCCGAATTCTAATACAACTCCTTTGGCTGCACATGGTTCTGGGCCAGGGGCTTTTAATACCCAATGGACACCATCTCTAGCA
CCAGCTCCTTATCAACCAGTTGCTCCTGGATTATACATGGGTCAGCAGGTGTCAAATGCTTTTGCGCCAAAAGTGCAATCTGGTGCCACACCTATTACTAGTTTTCCTTCTGGTTCGTTTCCTAGTGATGACCTCTTCTTCAATCTTGGAGCTCCTCGGCTGTCTTCTCAAAGCTCACTCCCTTCAGTTGGTGGTAACCC
ATTTGGTTAGAATCATGGTGGAGACATGGAGTTTTTTCACCCTTGGAATGGAAAATATAGATGGGCTGGACATCTTGCTGCTACTTTTCTGTTGCAAGGACCATGAGATTTTGTATTATGATTGCAGCTAGGCGATTCCCCAAGTAGAAATATTCTGGATTTTGTGCCCTTTGGGAAGTCTTGAGGTGAAATTCGATTTG
AATGCAGGCAGGGGTGGAAATCATAAAAGTTTTGCTAAGAAGTGCAATCATTTGTTCCATTCAAGGCATTGGTCGCAATTGTTTGCATATATTTCATCCCGATTGAAATACAGTATATGAATAATTTGTTTAGTTCTCATGGAGTTACATATTGTACCTAATGGCATTAGAAGATGCAAACAAATTGAGAGAATATTATT
TAGCCTGAACATATGTAATCATTTGTACTGGCAGGCCTCAGATTCAGGCCTACCCAATTGCCCACTGAATGGTTTTGGGGTCCACTCTGAGGCGTGTGTACAATTGACTGTTTTTATAGGTTATTGATGTGAATTTGTTAGATGGAGCCAGCATTTTCACTTGGCCTCGTGGCTTCTGGAGGCTAAGGATTTTTAGCCAG
TGACTATTGTTTGCCTGTATTTAGTCTTTTAACGTTTCTTCTAATATTTTTTTAATGCCTTGTACCTGTTTGAATAATAGCCCTTTGGTGTATATTTTATACGTGGCTTGCTTTGCAAGTTTAGACATTCATCTATCCTTTGAATGTCTTTGCTACGTAGCTGATATGGCCTCTGGTTCTGATAGTACGGTGGTGTCAGT
TCTAGGATTAATACTGAACTTCTTTATCTTCAATAATATTAATATTTTGAATTGTTTGGAAACAGATGGCTTTGGATACACATTTGTGTATTACAATGTGTAAGAAAACTACTTGTAGGCCAATATACTTCTTCTCAGTGC