sp|P49087|VATA_MAIZE ----> V-type proton ATPase catalytic subunit A (Fragment)
Intron 1 GTATATGAGT ... CTGATGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 38.1 | 24.7 | 17.5 | 13 |
| A2 | 13.9 | 13 | 5 | 2 |
| A3 | 7.04 | 14.3 | 4 | 1 |
| A4 | 30.25 | 17 | 5.5 | 7 |
| A5 | 21.12 | 19.3 | 4.5 | 5 |
| A6 | 30.54 | 23 | 2.5 | 10 |
| A7 | 21.95 | 26 | 6 | 7 |
| A8 | 32.1 | 21.3 | 2 | 10 |
| A9 | 16.39 | 16.7 | 4 | 3 |
| A10 | 7.04 | 14.3 | 2.5 | 1 |
>TRINITY_DN126464_c0_g1_i8 from sample A1 / Example spliced isoformTCTCCACAGACTTTCATCAAGGAGAACAGGTGAGAAACTTTCTATAAAGGGCCCACGGACCATTCTCTAGTGCCACCTGTAAGATATTGTGCCAACTAGGTTTGATCACAGAGCATTCGATCCCGCCGGACTCCAAAAAGGCTTTCAGTCGGGTTAAACTCCCAAGGGTTTTTCCATCCAATCCAATATTCAGTCTGCTG
GATCTCTTAGACGCTCAGATCCGAAGGATCTTTTCAGAAATTTTGGCTTCTGTATCGAATTCTTCCCTATCGATTCGACGAGATTCTAACGCGAATTAACCAGATCGGATCTGGATTTGCTGTTTTTCGAGCTTTAAATTGAGCTTTTCTGCTCCTGATTTGGGGGATTCTACTGCAATTTGGAGCAGAAAACATGCCGT
CTGTACATGGAGATAAAATGACTACCTTCGAGGACTCTGAGAAGGAGAGCGAGTATGGATACGTCCGAAAGGTGTCAGGACCCGTTGTTGTGGCAGATGGCATGGGAGGGGCAGCTATGTATGAGCTTGTTCGAGTTGGTCATGACAATCTTATTGGTGAAATCATTCGTCTGGAGGGTGATTCTGCCACCATCCAAGTT
TACGAAGAGACTGCAGGATTAATGGTGAATGACCCTGTCTTGCGGACACATAAGCCTTTGTCAGTAGAGCTGGGACCTGGAATACTTGGTAATATTTTTGATGGGATTCAGAGGCCTTTGAAAGCAATTGCTATAAAGTCTGGTGATGTCTATATTCCTCGAGGAGTGGCTGTGCCAGCTCTGGACAAGGACGCAACATG
GGATTTTCAGCCTAAGAAGCTATCTGTTGGAGATGTCTTAACTGGTGGTGATTTATATGCGACGGTCTTTGAGAATAGTCTGATGGAGCACCGTATTGCTGTTCCTCCTGGAGCTATGGGCAAGGTTACATATATTGCACCACCTGGTCATTACACCATTCAGGATACAGTGCTGGAGTTAGAGTTTCAAGGAGTTAAAA
AGCACCTCACAATGCTTCAGACTTGGCCTGTGCGGTCACCTAGGCCTGTCTCTGCCAAGCTTGCAGCTGATACACCACTCCTGACTGGACAGCGTGTTCTTGATGCTCTATTTCCCTCTGTGCTTGGAGGAACATGTGCCATACCTGGTGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTCATTAGTCAAGCTCTTTCCAAGTATTCA
AATTCTGATACTGTTGTCTATGTTGGTTGCGGTGAAAGAGGAAATGAGATGGCTGAGGTTCTAATGGATTTTCCACAACTGACAATGACCTTGCCTGATGGACGAGAAGAATCTGTGATGAAACGCACCACTCTTGTTGCAAACACATCTAACATGCCAGTGGCAGCCAGAGAGGCATCAATTTATACAGGTATCACTTT
AGCAGAGTACTTCCGTGATATGGGATACAATGTCAGTATGATGGCAGACTCAACATCTCGCTGGGCAGAAGCCCTTCGAGAAATCTCTGGCCGTCTGGCTGAAATGCCAGCAGATAGTGGTTATCCAGCCTATTTGGGTGCACGTTTGGCTTCCTTTTATGAGCGGGCTGGTAAAGTTAAATGCTTGGGAAGCCCGGACC
GCACAGGTAGTGTAACAATAGTTGGAGCTGTTTCTCCTCCTGGTGGAGACTTTTCTGATCCAGTAACTGCAGCAACACTTGGTATTGTTCAGGTATTTTGGGGTCTTGACAAGAAACTTGCTCAACGCAAGCATTTTCCATCTGTTAACTGGCTTATTTCATATTCAAAATATACAAAGGCATTAGAATCTTTTTATGAG
CAATTCGACCCAGATTTTATTTCTATTAGGACCAAAGCTCGTGAAGTCTTGCAACGGGAGGATGATCTGAATGAAATTGTCCAACTCGTTGGGAAAGATGCTTTAGCAGAAACCGATAAAATTATTCTGGAGACTGCAAAACTTCTGAGGGAAGACTATCTGGCTCAAAATGCATTTACTCCGTATGATCGATTCTGCCC
ATTTTACAAGTCTGTGTGGATGATGAGAAACATCATCCATTTCAATACATTAGCTAATCAAGCTGTAGAAAGAGGAGCAGGTCCTGATGGGCAGAAGATTACTTACAATATATTAAAACAACGCTTAGGAGACCTTATTTACAAATTAGTGTCTCAAAAGTTTGAAGATCCTGCAGAAGGAGAGCATGCCTTGGTAGAAA
AGTTCAGTAAATTATATGAAGATTTGACAGTTGGTTTCCGCAATCTTGAAGATGAATATCGATAAGTCTATAACTGTTAGTGGTGCTTGCTGCAGAAGGATGCCTTTTGTTTATTTTGTTATTTCCAAGAGCATACTGTTAAACTGGAGCAGCTCAGTCTTTTGTGCATCTGTAATTTTCGAAGTAGGCTGATTTGAATT
ATTGAAAACAGCCAACAGATGTTCTTGATGTGCTGCAAGTTGTCTATTAGTGATTAATTTTGTAAAGAAAACAATCCATTTAATTTATCTGTTATCTGGAGTTCACTGTTATTGGTTCATCTGTGCACATGTTGCATAGATCAAGAATAAGTTGCTTTCCACAATGCATGTCACCATCTGTTTGTGAAATAGTGAAAGAT
CGACAATTACCATGGCAAGGTTTGGTTCCAAAAACTATTTGTTATTTGAAATATATTACGTCC
>TRINITY_DN126464_c0_g1_i11 from sample A1 / Example unspliced isoform:TCTCCACAGACTTTCATCAAGGAGAACAGGTGAGAAACTTTCTATAAAGGGCCCACGGACCATTCTCTAGTGCCACCTGTAAGATATTGTGCCAACTAGGTTTGATCACAGAGCATTCGATCCCGCCGGACTCCAAAAAGGCTTTCAGTCGGGTTAAACTCCCAAGGGTTTTTCCATCCAATCCAATATTCAGTCTGCTG
GATCTCTTAGACGCTCAGATCCGAAGGATCTTTTCAGAAATTTTGGCTTCTGTATCGAATTCTTCCCTATCGATTCGACGAGATTCTAACGCGAATTAACCAGATCGGATCTGGATTTGCTGTTTTTCGAGCTTTAAATTGAGCTTTTCTGCTCCTGATTTGGGGGATTCTACTGCAATTTGGAGCAGAAAACATGCCGT
CTGTACATGGAGATAAAATGACTACCTTCGAGGACTCTGAGAAGGAGAGCGAGTATGGATACGTCCGAAAGGTGTCAGGACCCGTTGTTGTGGCAGATGGCATGGGAGGGGCAGCTATGTATGAGCTTGTTCGAGTTGGTCATGACAATCTTATTGGTGAAATCATTCGTCTGGAGGGTGATTCTGCCACCATCCAAGTT
TACGAAGAGACTGCAGGATTAATGGTGAATGACCCTGTCTTGCGGACACATAAGCCTTTGTCAGTAGAGCTGGGACCTGGAATACTTGGTAATATTTTTGATGGGATTCAGAGGCCTTTGAAAGCAATTGCTATAAAGTCTGGTGATGTCTATATTCCTCGAGGAGTGGCTGTGCCAGCTCTGGACAAGGACGCAACATG
GGATTTTCAGCCTAAGAAGCTATCTGTTGGAGATGTCTTAACTGGTGGTGATTTATATGCGACGGTCTTTGAGAATAGTCTGATGGAGCACCGTATTGCTGTTCCTCCTGGAGCTATGGGCAAGGTTACATATATTGCACCACCTGGTCATTACACCATTCAGGATACAGTGCTGGAGTTAGAGTTTCAAGGAGTTAAAA
AGCACCTCACAATGCTTCAGACTTGGCCTGTGCGGTCACCTAGGCCTGTCTCTGCCAAGCTTGCAGCTGATACACCACTCCTGACTGGACAGgtatatgagttaagatatgaatgttaagtaatgtaaaataggcaatgttaacctttattttaattaccaactatacctggttctgatggcagCGTGTTCTTGATGCTC
TATTTCCCTCTGTGCTTGGAGGAACATGTGCCATACCTGGTGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTCATTAGTCAAGCTCTTTCCAAGTATTCAAATTCTGATACTGTTGTCTATGTTGGTTGCGGTGAAAGAGGAAATGAGATGGCTGAGGTTCTAATGGATTTTCCACAACTGACAATGACCTTGCCTGATGGACGAGAA
GAATCTGTGATGAAACGCACCACTCTTGTTGCAAACACATCTAACATGCCAGTGGCAGCCAGAGAGGCATCAATTTATACAGGTATCACTTTAGCAGAGTACTTCCGTGATATGGGATACAATGTCAGTATGATGGCAGACTCAACATCTCGCTGGGCAGAAGCCCTTCGAGAAATCTCTGGCCGTCTGGCTGAAATGCC
AGCAGATAGTGGTTATCCAGCCTATTTGGGTGCACGTTTGGCTTCCTTTTATGAGCGGGCTGGTAAAGTTAAATGCTTGGGAAGCCCGGACCGCACAGGTAGTGTAACAATAGTTGGAGCTGTTTCTCCTCCTGGTGGAGACTTTTCTGATCCAGTAACTGCAGCAACACTTGGTATTGTTCAGGTATTTTGGGGTCTTG
ACAAGAAACTTGCTCAACGCAAGCATTTTCCATCTGTTAACTGGCTTATTTCATATTCAAAATATACAAAGGCATTAGAATCTTTTTATGAGCAATTCGACCCAGATTTTATTTCTATTAGGACCAAAGCTCGTGAAGTCTTGCAACGGGAGGATGATCTGAATGAAATTGTCCAACTCGTTGGGAAAGATGCTTTAGCA
GAAACCGATAAAATTATTCTGGAGACTGCAAAACTTCTGAGGGAAGACTATCTGGCTCAAAATGCATTTACTCCGTATGATCGATTCTGCCCATTTTACAAGTCTGTGTGGATGATGAGAAACATCATCCATTTCAATACATTAGCTAATCAAGCTGTAGAAAGAGGAGCAGGTCCTGATGGGCAGAAGATTACTTACAA
TATATTAAAACAACGCTTAGGAGACCTTATTTACAAATTAGTGTCTCAAAAGTTTGAAGATCCTGCAGAAGGAGAGCATGCCTTGGTAGAAAAGTTCAGTAAATTATATGAAGATTTGACAGTTGGTTTCCGCAATCTTGAAGATGAATATCGATAAGTCTATAACTGTTAGTGGTGCTTGCTGCAGAAGGATGCCTTTT
GTTTATTTTGTTATTTCCAAGAGCATACTGTTAAACTGGAGCAGCTCAGTCTTTTGTGCATCTGTAATTTTCGAAGTAGGCTGATTTGAATTATTGAAAACAGCCAACAGATGTTCTTGATGTGCTGCAAGTTGTCTATTAGTGATTAATTTTGTAAAGAAAACAATCCATTTAATTTATCTGTTATCTGGAGTTCACTG
TTATTGGTTCATCTGTGCACATGTTGCATAGATCAAGAATAAGTTGCTTTCCACAATGCATGTCACCATCTGTTTGTGAAATAGTGAAAGATCGACAATTACCATGGCAAGGTTTGGTTCCAAAAACTATTTGTTATTTGAAATATATTACGTCC
Intron 2 GTGGGCATAT ... TGTATTATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 35.29 | 44 | 0 | 24 |
| A2 | 32 | 51 | 2 | 24 |
| A3 | 26.53 | 36 | 0 | 13 |
| A4 | 37.7 | 38 | 1 | 23 |
| A5 | 32 | 17 | 2 | 8 |
| A6 | 32.14 | 38 | 0 | 18 |
| A7 | 35.96 | 73 | 0 | 41 |
| A8 | 28.85 | 37 | 0 | 15 |
| A9 | 32.79 | 41 | 0 | 20 |
| A10 | 30.68 | 61 | 0 | 27 |
>TRINITY_DN112919_c3_g1_i11 from sample A2 / Example spliced isoformGAGAACATCTCCACAGACTTTCATCAAGGAGAACAGGTGAGAAACTTTCTATAAAGGGCCGACGGACCATTCTCTAGTGCCACCTGTAAGATATTGTGCCAACTAGGTTTGATCACAGAGCATTCGATCCCGCCGGACTCCAAAAAGGCTTTCAGTCGGGTTAAACTCCCAAGGGTTTTTCCATCCAATCCAATATTCAG
TCTGCTGGATCTCTTAGACGCTCAGATCCGAAGGATCTTTTCAGAAATTTTGGCTTCTGTATCGAATTCTTCCCTATCGATTCGACGAGATTCTAACGCGAATTAACCAGATCGGATCTGGATTTGCTGTTTTTCGAGCTTTAAATTGAGCTTTTCTGCTCCTGATTTGGGGGATTCTACTGCAATTTGGAGCAGAAAAC
ATGCCGTCTGTACATGGAGATAAAATGACTACCTTCGAGGACTCTGAGAAGGAGAGCGAGTATGGATACGTCCGAAAGGTGTCAGGACCCGTTGTTGTGGCAGATGGCATGGGAGGGGCAGCTATGTATGAGCTTGTTCGAGTTGGTCATGACAATCTTATTGGTGAAATCATTCGTCTGGAGGGTGATTCTGCCACCAT
CCAAGTTTACGAAGAGACTGCAGGATTAATGGTGAATGACCCTGTCTTGCGGACACATAAGCCTTTGTCAGTAGAGCTGGGACCTGGAATACTTGGTAATATTTTTGATGGGATTCAGAGGCCTTTGAAAGCAATTGCTATAAAGTCTGGTGATGTCTATATTCCTCGAGGAGTGGCTGTGCCAGCTCTGGACAAGGACG
CAACATGGGATTTTCAGCCTAAGAAGCTATCTGTTGGAGATGTCTTAACTGGTGGTGATTTATATGCGACGGTCTTTGAGAATAGTCTGATGGAGCACCGTATTGCTGTTCCTCCTGGAGCTATGGGCAAGGTTACATATATTGCACCACCTGGTCATTACACCATTCAGGATACAGTGCTGGAGTTAGAGTTTCAAGGA
GTTAAAAAGCACCTCACAATGCTTCAGACTTGGCCTGTGCGGTCACCTAGGCCTGTCTCTGCCAAGCTTGCAGCTGATACACCACTCCTGACTGGACAGCGTGTTCTTGATGCTCTATTTCCCTCTGTGCTTGGAGGAACATGTGCCATACCTGGTGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTCATTAGTCAAGCTCTTTCCAA
GTATTCAAATTCTGATACTGTTGTCTATGTTGGTTGCGGTGAAAGAGGAAATGAGATGGCTGAGGTTCTAATGGATTTTCCACAACTGACAATGACCTTGCCTGATGGACGAGAAGAATCTGTGATGAAACGCACCACTCTTGTTGCAAACACATCTAACATGCCAGTGGCAGCCAGAGAGGCATCAATTTATACAGGTA
TCACTTTAGCAGAGTACTTCCGTGATATGGGATACAATGTCAGTATGATGGCAGACTCAACATCTCGCTGGGCAGAAGCCCTTCGAGAAATCTCTGGCCGTCTGGCTGAAATGCCAGCAGATAGTGGTTATCCAGCCTATTTGGGTGCACGTTTGGCTTCCTTTTATGAGCGGGCTGGTAAAGTTAAATGCTTGGGAAGC
CCGGACCGCACAGGTAGTGTAACAATAGTTGGAGCTGTTTCTCCTCCTGGTGGAGACTTTTCTGATCCAGTAACTGCAGCAACACTTGGTATTGTTCAGGTATTTTGGGGTCTTGACAAGAAACTTGCTCAACGCAAGCATTTTCCATCTGTTAACTGGCTTATTTCATATTCAAAATATACAAAGGCATTAGAATCTTT
TTATGAGCAATTCGACCCAGATTTTATTTCTATTAGGACCAAAGCTCGTGAAGTCTTGCAACGGGAGGATGATCTGAATGAAATTGTCCAACTCGTTGGGAAAGATGCTTTAGCAGAAACCGATAAAATTATTCTGGAGACTGCAAAACTTCTGAGGGAAGACTATCTGGCTCAAAATGCATTTACTCCGTATGATAGAT
TCTGCCCATTTTACAAGTCTGTGTGGATGATGAGAAACATCATCCATTTCAATACATTAGCTAATCAAGCTGTAGAAAGAGGAGCAGGTCCTGATGGGCAGAAGATTACTTACAATATATTAAAACAACGCTTAGGAGACCTTATTTACAAATTAGTGTCTCAAAAGTTTGAAGATCCTGCAGAAGGAGAGCATGCCTTG
GTAGAAAAGTTCAGTAAATTATATGAAGATTTGACAGTTGGTTTCCGCAATCTTGAAGATGAATATCGATAAGTCTATAACTGTTAGTGGTGCTTGCTGCAGAAGGATGCCTTTTGTTTATTTTGTTATTTCCAAGAGCATACTGTTAAACTGGAGCAGCTCAGTCTTTTGTGCATCTGTAATTTTCGAAGTAGGCTGAT
TTGAATTATTGAAAACAGCCAACAGATGTTCTTGATGTGCTGCAAGTTGTCTATTAGTGATTAATTTTGTAAAGAAAACAATCCATTTAATTTATCTGTTATCTGGAGTTCACTGTTATTGGTTCATCTGTGCACATGTTGCATAGATCAAGAATAAGTTGCTTTCCACAATGCATGTCACCATCTGTTTGTGAAATAGT
GAAAGATCGACAATTACCATGGCAAGGTTTGGTTCCGAAAACTATTTGTTATTTGAAATATATTACGTCTTTTTCCCTTTAGTACAAGGTAGTTGTGTTTGACTTTCTCAGTCATGCAAGGGCTTCCACTTTGGGTGAATTGTGTAATCTGGATTCGCAGCCTACTTTTGAGACAAAAACACATG
>TRINITY_DN112919_c3_g1_i10 from sample A2 / Example unspliced isoform:TGAACTTTGTGCAGTATTCAAATTCTGATACTGTTGTCTATGTTGGTTGCGGTGAAAGAGGAAATGAGATGGCTGAGgtgggcatatttaaaaccagtatttcaaactatggccaataacaaaacattctgttttaaattagactgacagctttccactactgtattatagGTTCTAATGGATTTTCCACAACTGACAAT
GACCTTGCCTGATGGACGAGAAGAATCTGTGATGAAACGCACCACTCTTGTTGCAAACACATCTAACATGCCAGTGGCAGCCAGAGAGGCATCAATTTATACAGGTATCACTTTAGCAGAGTACTTCCGTGATATGGGATACAATGTCAGTATGATGGCAGACTCAACATCTCGCTGGGCAGAAGCCCTTCGAGAAATCT
CTGGCCGTCTGGCTGAAATGCCAGCAGATAGTGGTTATCCAGCCTATTTGGGTGCACGTTTGGCTTCCTTTTATGAGCGGGCTGGTAAAGTTAAATGCTTGGGAAGCCCGGACCGCACAGGTAGTGTAACAATAGTTGGAGCTGTTTCTCCTCCTGGTGGAGACTTTTCTGATCCAGTAACTGCAGCAACACTTGGTATT
GTTCAGGTATTTTGGGGTCTTGACAAGAAACTTGCTCAACGCAAGCATTTTCCATCTGTTAACTGGCTTATTTCATATTCAAAATATACAAAGGCATTAGAATCTTTTTATGAGCAATTCGACCCAGATTTTATTTCTATTAGGACCAAAGCTCGTGAAGTCTTGCAACGGGAGGATGATCTGAATGAAATTGTCCAACT
CGTTGGGAAAGATGCTTTAGCAGAAACCGATAAAATTATTCTGGAGACTGCAAAACTTCTGAGGGAAGACTATCTGGCTCAAAATGCATTTACTCCGTATGATAGATTCTGCCCATTTTACAAGTCTGTGTGGATGATGAGAAACATCATCCATTTCAATACATTAGCTAATCAAGCTGTAGAAAGAGGAGCAGGTCCTG
ATGGGCAGAAGATTACTTACAATATATTAAAACAACGCTTAGGAGACCTTATTTACAAATTAGTGTCTCAAAAGTTTGAAGATCCTGCAGAAGGAGAGCATGCCTTGGTAGAAAAGTTCAGTAAATTATATGAAGATTTGACAGTTGGTTTCCGCAATCTTGAAGATGAATATCGATAAGTCTATAACTGTTAGTGGTGC
TTGCTGCAGAAGGATGCCTTTTGTTTATTTTGTTATTTCCAAGAGCATACTGTTAAACTGGAGCAGCTCAGTCTTTTGTGCATCTGTAATTTTCGAAGTAGGCTGATTTGAATTATTGAAAACAGCCAACAGATGTTCTTGATGTGCTGCAAGTTGTCTATTAGTGATTAATTTTGTAAAGAAAACAATCCATTTAATTT
ATCTGTTATCTGGAGTTCACTGTTATTGGTTCATCTGTGCACATGTTGCATAGATCAAGAATAAGTTGCTTTCCACAATGCATGTCACCATCTGTTTGTGAAATAGTGAAAGATCGACAATTACCATGGCAAGGTTTGGTTCCGAAAACTATTTGTTATTTGAAATATATTACGTCTTTTTCCCTTTAGTACAAGGTAGT
TGTGTTTGACTTTCTCAGTCATGCAAGGGCTTCCACTTTGGGTGAATTGTGTAATCTGGATTCGCAGCCTACTTTTGAGACAAAAACACATG
Intron 3 GTTCCATGAG ... ATTGTTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 4.81 | 65 | 2 | 4.6 |
| A2 | 3.85 | 34.1 | 1 | 1.7 |
| A3 | 7.9 | 34.3 | 2 | 3.9 |
| A4 | 3.74 | 25.7 | 2 | 0 |
| A5 | 14.92 | 20.7 | 3 | 4.3 |
| A6 | 0 | 26.9 | 0 | 0 |
| A7 | 0 | 43.7 | 0 | 0 |
| A8 | 0 | 20.1 | 0 | 0 |
| A9 | 0 | 37.1 | 0 | 0 |
| A10 | 0 | 29.6 | 0 | 0 |
>TRINITY_DN126464_c0_g1_i8 from sample A1 / Example spliced isoformTCTCCACAGACTTTCATCAAGGAGAACAGGTGAGAAACTTTCTATAAAGGGCCCACGGACCATTCTCTAGTGCCACCTGTAAGATATTGTGCCAACTAGGTTTGATCACAGAGCATTCGATCCCGCCGGACTCCAAAAAGGCTTTCAGTCGGGTTAAACTCCCAAGGGTTTTTCCATCCAATCCAATATTCAGTCTGCTG
GATCTCTTAGACGCTCAGATCCGAAGGATCTTTTCAGAAATTTTGGCTTCTGTATCGAATTCTTCCCTATCGATTCGACGAGATTCTAACGCGAATTAACCAGATCGGATCTGGATTTGCTGTTTTTCGAGCTTTAAATTGAGCTTTTCTGCTCCTGATTTGGGGGATTCTACTGCAATTTGGAGCAGAAAACATGCCGT
CTGTACATGGAGATAAAATGACTACCTTCGAGGACTCTGAGAAGGAGAGCGAGTATGGATACGTCCGAAAGGTGTCAGGACCCGTTGTTGTGGCAGATGGCATGGGAGGGGCAGCTATGTATGAGCTTGTTCGAGTTGGTCATGACAATCTTATTGGTGAAATCATTCGTCTGGAGGGTGATTCTGCCACCATCCAAGTT
TACGAAGAGACTGCAGGATTAATGGTGAATGACCCTGTCTTGCGGACACATAAGCCTTTGTCAGTAGAGCTGGGACCTGGAATACTTGGTAATATTTTTGATGGGATTCAGAGGCCTTTGAAAGCAATTGCTATAAAGTCTGGTGATGTCTATATTCCTCGAGGAGTGGCTGTGCCAGCTCTGGACAAGGACGCAACATG
GGATTTTCAGCCTAAGAAGCTATCTGTTGGAGATGTCTTAACTGGTGGTGATTTATATGCGACGGTCTTTGAGAATAGTCTGATGGAGCACCGTATTGCTGTTCCTCCTGGAGCTATGGGCAAGGTTACATATATTGCACCACCTGGTCATTACACCATTCAGGATACAGTGCTGGAGTTAGAGTTTCAAGGAGTTAAAA
AGCACCTCACAATGCTTCAGACTTGGCCTGTGCGGTCACCTAGGCCTGTCTCTGCCAAGCTTGCAGCTGATACACCACTCCTGACTGGACAGCGTGTTCTTGATGCTCTATTTCCCTCTGTGCTTGGAGGAACATGTGCCATACCTGGTGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTCATTAGTCAAGCTCTTTCCAAGTATTCA
AATTCTGATACTGTTGTCTATGTTGGTTGCGGTGAAAGAGGAAATGAGATGGCTGAGGTTCTAATGGATTTTCCACAACTGACAATGACCTTGCCTGATGGACGAGAAGAATCTGTGATGAAACGCACCACTCTTGTTGCAAACACATCTAACATGCCAGTGGCAGCCAGAGAGGCATCAATTTATACAGGTATCACTTT
AGCAGAGTACTTCCGTGATATGGGATACAATGTCAGTATGATGGCAGACTCAACATCTCGCTGGGCAGAAGCCCTTCGAGAAATCTCTGGCCGTCTGGCTGAAATGCCAGCAGATAGTGGTTATCCAGCCTATTTGGGTGCACGTTTGGCTTCCTTTTATGAGCGGGCTGGTAAAGTTAAATGCTTGGGAAGCCCGGACC
GCACAGGTAGTGTAACAATAGTTGGAGCTGTTTCTCCTCCTGGTGGAGACTTTTCTGATCCAGTAACTGCAGCAACACTTGGTATTGTTCAGGTATTTTGGGGTCTTGACAAGAAACTTGCTCAACGCAAGCATTTTCCATCTGTTAACTGGCTTATTTCATATTCAAAATATACAAAGGCATTAGAATCTTTTTATGAG
CAATTCGACCCAGATTTTATTTCTATTAGGACCAAAGCTCGTGAAGTCTTGCAACGGGAGGATGATCTGAATGAAATTGTCCAACTCGTTGGGAAAGATGCTTTAGCAGAAACCGATAAAATTATTCTGGAGACTGCAAAACTTCTGAGGGAAGACTATCTGGCTCAAAATGCATTTACTCCGTATGATCGATTCTGCCC
ATTTTACAAGTCTGTGTGGATGATGAGAAACATCATCCATTTCAATACATTAGCTAATCAAGCTGTAGAAAGAGGAGCAGGTCCTGATGGGCAGAAGATTACTTACAATATATTAAAACAACGCTTAGGAGACCTTATTTACAAATTAGTGTCTCAAAAGTTTGAAGATCCTGCAGAAGGAGAGCATGCCTTGGTAGAAA
AGTTCAGTAAATTATATGAAGATTTGACAGTTGGTTTCCGCAATCTTGAAGATGAATATCGATAAGTCTATAACTGTTAGTGGTGCTTGCTGCAGAAGGATGCCTTTTGTTTATTTTGTTATTTCCAAGAGCATACTGTTAAACTGGAGCAGCTCAGTCTTTTGTGCATCTGTAATTTTCGAAGTAGGCTGATTTGAATT
ATTGAAAACAGCCAACAGATGTTCTTGATGTGCTGCAAGTTGTCTATTAGTGATTAATTTTGTAAAGAAAACAATCCATTTAATTTATCTGTTATCTGGAGTTCACTGTTATTGGTTCATCTGTGCACATGTTGCATAGATCAAGAATAAGTTGCTTTCCACAATGCATGTCACCATCTGTTTGTGAAATAGTGAAAGAT
CGACAATTACCATGGCAAGGTTTGGTTCCAAAAACTATTTGTTATTTGAAATATATTACGTCC
>TRINITY_DN126464_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:GTTCAATGCTTGAAAAGAAGGATGGTTTTGATAAGTTGTGCAGAAACGTTACCCTTTTCAATGTTGATGCTAGATATTTAATTAAGTATTCTAGATATTCTTCCTCCAAATCTTTGGAATTCTAAAATTTTTGGTCCTTATTCTCAAGGTGAGTCTAATTGGTGATGAGAGATTGTTCCAACCAGGCAGGCAGGGGTTGG
CGATTTTGGGAGTAGAGTAAGCCAGTGGGCCATGTGTATAAACTTTAAATTGAGCTGTATTGATAATGCTAGAGGGATCTGAAGTTCAGGATAGTGTGAAATTATCAATTGCATTTCCAGCTTTAATGTTGTCTGGTGTTCTATCTTTGAGTTCCATGTAAATTGTAGCATTTTGATTTTAGTTCTTGGATGCACGCTTT
TGACCCATTTTGTCCTGGTATTTGTTTTCCAGAATCACATTGATACAATTTTATTTGTTTCCTCACTCTTTATCATGCTTGTAGCTTCTCTTTTTTGATGTCATTTGTCATACTGTTCACAGGATACAGTGCTGGAGTTAGAGTTTCAAGGAGTTAAAAAGCACCTCACAATGCTTCAGgttccatgagatcatttcttc
tttttgatgatgtgctaaggattcaaaatgctgtaagatcattttattatcctagttcaaaatgggcttatttagtatagtatattcattagtgcacatttatattgttccagACTTGGCCTGTGCGGTCACCTAGGCCTGTCTCTGCCAAGCTTGCAGCTGATACACCACTCCTGACTGGACAGGTATATGAGTTAAGA
TATGAATGTTAAGTAATGTAAAATAGGCAATGTTAACCTTTATTTTAATTACCAACTATACCTGGTTCTGATGGCAGCGTGTTCTTGATGCTCTATTTCCCTCTGTGCTTGGAGGAACATGTGCCATACCTGGTGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTCATTAGTCAAGCTCTTTCCAAGTATTCAAATTCTGATACTGTT
GTCTATGTTGGTTGCGGTGAAAGAGGAAATGAGATGGCTGAGGTTCTAATGGATTTTCCACAACTGACAATGACCTTGCCTGATGGACGAGAAGAATCTGTGATGAAACGCACCACTCTTGTTGCAAACACATCTAACATGCCAGTGGCAGCCAGAGAGGCATCAATTTATACAGGTATCACTTTAGCAGAGTACTTCCG
TGATATGGGATACAATGTCAGTATGATGGCAGACTCAACATCTCGCTGGGCAGAAGCCCTTCGAGAAATCTCTGGCCGTCTGGCTGAAATGCCAGCAGATAGTGGTTATCCAGCCTATTTGGGTGCACGTTTGGCTTCCTTTTATGAGCGGGCTGGTAAAGTTAAATGCTTGGGAAGCCCGGACCGCACAGGTAGTGTAA
CAATAGTTGGAGCTGTTTCTCCTCCTGGTGGAGACTTTTCTGATCCAGTAACTGCAGCAACACTTGGTATTGTTCAGGTATTTTGGGGTCTTGACAAGAAACTTGCTCAACGCAAGCATTTTCCATCTGTTAACTGGCTTATTTCATATTCAAAATATACAAAGGCATTAGAATCTTTTTATGAGCAATTCGACCCAGAT
TTTATTTCTATTAGGACCAAAGCTCGTGAAGTCTTGCAACGGGAGGATGATCTGAATGAAATTGTCCAACTCGTTGGGAAAGATGCTTTAGCAGAAACCGATAAAATTATTCTGGAGACTGCAAAACTTCTGAGGGAAGACTATCTGGCTCAAAATGCATTTACTCCGTATGATCGATTCTGCCCATTTTACAAGTCTGT
GTGGATGATGAGAAACATCATCCATTTCAATACATTAGCTAATCAAGCTGTAGAAAGAGGAGCAGGTCCTGATGGGCAGAAGATTACTTACAATATATTAAAACAACGCTTAGGAGACCTTATTTACAAATTAGTGTCTCAAAAGTTTGAAGATCCTGCAGAAGGAGAGCATGCCTTGGTAGAAAAGTTCAGTAAATTAT
ATGAAGATTTGACAGTTGGTTTCCGCAATCTTGAAGATGAATATCGATAAGTCTATAACTGTTAGTGGTGCTTGCTGCAGAAGGATGCCTTTTGTTTATTTTGTTATTTCCAAGAGCATACTGTTAAACTGGAGCAGCTCAGTCTTTTGTGCATCTGTAATTTTCGAAGTAGGCTGATTTGAATTATTGAAAACAGCCAA
CAGATGTTCTTGATGTGCTGCAAGTTGTCTATTAGTGATTAATTTTGTAAAGAAAACAATCCATTTAATTTATCTGTTATCTGGAGTTCACTGTTATTGGTTCATCTGTGCACATGTTGCATAGATCAAGAATAAGTTGCTTTCCACAATGCATGTCACCATCTGTTTGTGAAATAGTGAAAGATCGACAATTACCATGG
CAAGGTTTGGTTCCAAAAACTATTTGTTATTTGAAATATATTACGTCC
Intron 4 GTATCGAATA ... TTGTTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 27.27 | 40 | 15 | 5 |
| A2 | 18.92 | 30 | 7 | 1 |
| A3 | 23.19 | 53 | 16 | 3 |
| A4 | 29.31 | 41 | 17 | 3 |
| A5 | 22.92 | 37 | 11 | 4 |
| A6 | 26.32 | 28 | 10 | 0 |
| A7 | 17.5 | 66 | 14 | 0 |
| A8 | 21.88 | 25 | 7 | 0 |
| A9 | 20.63 | 50 | 13 | 0 |
| A10 | 28.3 | 38 | 15 | 0 |
>TRINITY_DN103955_c0_g2_i17 from sample A4 / Example spliced isoformCTTTCATCAAGGAGAACAGGTGAGAAACTTTCTATAAAGGGCCGACGGACCATTCTCTAGTGCCACCTGTAAGATATTGTGCCAACTAGGTTTGATCACAGAGCATTCGATCCCGCCGGACTCCAAAAAGGCTTTCAGTCGGGTTAAACTCCCAAGGGTTTTTCCATCCAATCCAATATTCAGTCTGCTGGATCTCTTAG
ACGCTCAGATCCGAAGGATCTTTTCAGAAATTTTGGCTTCTGTATCGAATTCTTCCCTATCGATTCGACGAGATTCTAACGCGAATTAACCAGATCGGATCTGGATTTGCTGTTTTTCGAGCTTTAAATTGAGCTTTTCTGCTCCTGATTTGGGGGATTCTACTGCAATTTGGAGCAGAAAACATGCCGTCTGTACATGG
AGATAAAATGACTACCTTCGAGGACTCTGAGAAGGAGAGCGAGTATGGATACGTCCGAAAGGTGTCAGGACCCGTTGTTGTGGCAGATGGCATGGGAGGGGCAGCTATGTATGAGCTTGTTCGAGTTGGTCATGACAATCTTATTGGTGAAATCATTCGTCTGGAGGGTGATTCTGCCACCATCCAAGTTTACGAAGAGA
CTGCAGGATTAATGGTGAATGACCCTGTCTTGCGGACACATAAGCCTTTGTCAGTAGAGCTGGGACCTGGAATACTTGGTAATATTTTTGATGGGATTCAGAGGCCTTTGAAAGCAATTGCTATAAAGTCTGGTGATGTCTATATTCCTCGAGGAGTGGCTGTGCCAGCTCTGGACAAGGACGCAACATGGGATTTTCAG
CCTAAGAAGCTATCTGTTGGAGATGTCTTAACTGGTGGTGATTTATATGCGACGGTCTTTGAGAATAGTCTGATGGAGCACCGTATTGCTGTTCCTCCTGGAGCTATGGGCAAGGTTACATATATTGCACCACCTGGTCATTACACCATTCAGGATACAGTGCTGGAGTTAGAGTTTCAAGGAGTTAAAAAGCACCTCAC
AATGCTTCAGACTTGGCCTGTGCGGTCACCTAGGCCTGTCTCTGCCAAGCTTGCAGCTGATACACCACTCCTGACTGGACAGCGTGTTCTTGATGCTCTATTTCCCTCTGTGCTTGGAGGAACATGTGCCATACCTGGTGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTCATTAGTCAAGCTCTTTCCAAGTATTCAAATTCTGATA
CTGTTGTCTATGTTGGTTGCGGTGAAAGAGGAAATGAGATGGCTGAGGTTCTAATGGATTTTCCACAACTGACAATGACCTTGCCTGATGGACGAGAAGAATCTGTGATGAAACGCACCACTCTTGTTGCAAACACATCTAACATGCCAGTGGCAGCCAGAGAGGCATCAATTTATACAGGTATCACTTTAGCAGAGTAC
TTCCGTGATATGGGATACAATGTCAGTATGATGGCAGACTCAACATCTCGCTGGGCAGAAGCCCTTCGAGAAATCTCTGGCCGTCTGGCTGAAATGCCAGCAGATAGTGGTTATCCAGCCTATTTGGGTGCACGTTTGGCTTCCTTTTATGAGCGGGCTGGTAAAGTTAAATGCTTGGGAAGCCCGGACCGCACAGGTAG
TGTAACAATAGTTGGAGCTGTTTCTCCTCCTGGTGGAGACTTTTCTGATCCAGTAACTGCAGCAACACTTGGTATTGTTCAGGTATTTTGGGGTCTTGACAAGAAACTTGCTCAACGCAAGCATTTTCCATCTGTTAACTGGCTTATTTCATATTCAAAATATACAAAGGCATTAGAATCTTTTTATGAGCAATTCGACC
CAGATTTTATTTCTATTAGGACCAAAGCTCGTGAAGTCTTGCAACGGGAGGATGATCTGAATGAAATTGTCCAAGTAAGTTAATTTATTTTGGATATATACATATATCATTCAGTAATACCTCTTGTTATTTTTCCAGGCCTCAATGCTTTGTGAGTCTTATTGCTGTTTATGGTGTGGCTTGATTTCTGCAATTTTTTA
TTTTAACCAGTATATTAATCTTAATTTTGAGTTGTAACATCCATGCAATTTTATCATACGAGATTATAGATTCTCATTATCTTATTTATGACAACTGTCACTTAGAGTTCTTAATTCACAACCATTCACTTTTTAGCTTAGATTGGATCTAATTCCATCTTTTGTTCAGTACCATCCTTTTTACTTTTTTTTTTTAACAA
ATGGGAAGCTGCCTTTTTAGGGCGGTAGACCACGATATACATGTCCCACCATCTCTCACATAATCAACAATAGGTGCAACTGATGTCCCACCATCTCTCACTTAATCAACAATAGGTGCAACTGGCAAATCCCATGCAGGGGAGGAGCATTCCCACCCGTATCTGAGCCTGGGTCATTGTCACAACAAACACACCAAGTT
GCCACTCGACCACTGCCCAAAAGACTGGGAAGTTCAGAAGCTTATTAGAAATATTTTTTGTACAACGTTCGAAAATGGTTAAGATCCTCTTGTGGTAGCTTGAAAACACACATTCTTGTTCTAGTAAAGAAGTTATTATGTTTCTTGTTAACTGCACCGGAAACTCTCTTTTGAGATGTCAGAAGTGCTTGCGTCTAGAC
TTTACTGTCACTGGCACACTGTTGGGATATTGGTATAATGGTGCTGCTTTATATCATTCTTTGTGCATCAAAATTTTTCCATTGCTCTTATAAAACCAATTCTGTTTATTAGATGAGTTAGGTGGGAAACTGCCGATTCTCTGATGGTTCTGATTTTATGCAGCAGAAGAAAAATGATGTATTCTACGAGGATTTAGAAT
TATAATATGCTCAATTTGTTTTCTAAGATTAAAGGATATGATGGTTTGGAGAGTCATGCCTATCTGCAAATAAGAATTGGAAGTTTTCAAATAATGCGCTGTTCTGCAGGTGCAGATAAGTTGATTATATGGAGTATAATGTTGGAATGTTAAGCATTTTAAATATTAAAGGACCTGATTTTCATAATTTTAACTTGACT
AGATAGTTTGATGAAGATTGGAATGCACCCAACTGAAATGAGGATAAAGGATGTTATTTGAAGCATTATAAATTATAATTTATATATATCACTTAAACTTTTTGGATTAATCTATTTGTCTCAATATATTATTTCCTGGTTGGAAGCCCACATGGGAGATTATGCAGGGTTACATAAGCAGGCTATTTAGAATTTTTATG
GATTC
>TRINITY_DN103955_c0_g2_i18 from sample A4 / Example unspliced isoform:CTTTCATCAAGGAGAACAGGTGAGAAACTTTCTATAAAGGGCCGACGGACCATTCTCTAGTGCCACCTGTAAGATATTGTGCCAACTAGGTTTGATCACAGAGCATTCGATCCCGCCGGACTCCAAAAAGGCTTTCAGTCGGGTTAAACTCCCAAGGGTTTTTCCATCCAATCCAATATTCAGTCTGCTGGATCTCTTAG
ACGCTCAGATCCGAAGGATCTTTTCAGAAATTTTGGCTTCTGTATCGAATTCTTCCCTATCGATTCGACGAGATTCTAACGCGAATTAACCAGATCGGATCTGGATTTGCTGTTTTTCGAGCTTTAAATTGAGCTTTTCTGCTCCTGATTTGGGGGATTCTACTGCAATTTGGAGCAGAAAACATGCCGTCTGTACATGG
AGATAAAATGACTACCTTCGAGGACTCTGAGAAGGAGAGCGAGTATGGATACGTCCGAAAGGTGTCAGGACCCGTTGTTGTGGCAGATGGCATGGGAGGGGCAGCTATGTATGAGCTTGTTCGAGTTGGTCATGACAATCTTATTGGTGAAATCATTCGTCTGGAGGGTGATTCTGCCACCATCCAAGTTTACGAAGAGA
CTGCAGGATTAATGGTGAATGACCCTGTCTTGCGGACACATAAGgtatcgaatatcatcagtagctcagaactatcattggaacttatgttctgtaggttaaagatctcagctgttggatttaaatagtgggaatttatgaaggatttgttttgttttcagCCTTTGTCAGTAGAGCTGGGACCTGGAATACTTGGTAAT
ATTTTTGATGGGATTCAGGTTTGTCTTTTTGCCTGAACATACCCCATGCTTTATGATGACATTTTTCCTAATAATTGTTCCTTTTTGCTAGTCACTACAGTACTAGGAAATGGTAAAAGTGATTTGGTGAATGCAGTTATTATGTTTAATATAACAACAAAATATCAAATAAGCAGGATGCCAGGTTCTACGCTCCATGT
TCACAGTGCATGGTTATTGTGCCAGATTTTATTATGGTC
Intron 5 GTTTGTCTGG ... CTGGATGGAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 13.01 | 63.7 | 13 | 6 |
| A2 | 18.62 | 33 | 8 | 7 |
| A3 | 22.25 | 33.3 | 11 | 8 |
| A4 | 20.44 | 25.3 | 11 | 2 |
| A5 | 16.46 | 20.3 | 6 | 2 |
| A6 | 18.14 | 25.3 | 4 | 7 |
| A7 | 18.58 | 42 | 12 | 7 |
| A8 | 18.07 | 18.7 | 2 | 6 |
| A9 | 12.26 | 36 | 6 | 4 |
| A10 | 20.61 | 27.7 | 7 | 7 |
>TRINITY_DN126464_c0_g1_i8 from sample A1 / Example spliced isoformTCTCCACAGACTTTCATCAAGGAGAACAGGTGAGAAACTTTCTATAAAGGGCCCACGGACCATTCTCTAGTGCCACCTGTAAGATATTGTGCCAACTAGGTTTGATCACAGAGCATTCGATCCCGCCGGACTCCAAAAAGGCTTTCAGTCGGGTTAAACTCCCAAGGGTTTTTCCATCCAATCCAATATTCAGTCTGCTG
GATCTCTTAGACGCTCAGATCCGAAGGATCTTTTCAGAAATTTTGGCTTCTGTATCGAATTCTTCCCTATCGATTCGACGAGATTCTAACGCGAATTAACCAGATCGGATCTGGATTTGCTGTTTTTCGAGCTTTAAATTGAGCTTTTCTGCTCCTGATTTGGGGGATTCTACTGCAATTTGGAGCAGAAAACATGCCGT
CTGTACATGGAGATAAAATGACTACCTTCGAGGACTCTGAGAAGGAGAGCGAGTATGGATACGTCCGAAAGGTGTCAGGACCCGTTGTTGTGGCAGATGGCATGGGAGGGGCAGCTATGTATGAGCTTGTTCGAGTTGGTCATGACAATCTTATTGGTGAAATCATTCGTCTGGAGGGTGATTCTGCCACCATCCAAGTT
TACGAAGAGACTGCAGGATTAATGGTGAATGACCCTGTCTTGCGGACACATAAGCCTTTGTCAGTAGAGCTGGGACCTGGAATACTTGGTAATATTTTTGATGGGATTCAGAGGCCTTTGAAAGCAATTGCTATAAAGTCTGGTGATGTCTATATTCCTCGAGGAGTGGCTGTGCCAGCTCTGGACAAGGACGCAACATG
GGATTTTCAGCCTAAGAAGCTATCTGTTGGAGATGTCTTAACTGGTGGTGATTTATATGCGACGGTCTTTGAGAATAGTCTGATGGAGCACCGTATTGCTGTTCCTCCTGGAGCTATGGGCAAGGTTACATATATTGCACCACCTGGTCATTACACCATTCAGGATACAGTGCTGGAGTTAGAGTTTCAAGGAGTTAAAA
AGCACCTCACAATGCTTCAGACTTGGCCTGTGCGGTCACCTAGGCCTGTCTCTGCCAAGCTTGCAGCTGATACACCACTCCTGACTGGACAGCGTGTTCTTGATGCTCTATTTCCCTCTGTGCTTGGAGGAACATGTGCCATACCTGGTGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTCATTAGTCAAGCTCTTTCCAAGTATTCA
AATTCTGATACTGTTGTCTATGTTGGTTGCGGTGAAAGAGGAAATGAGATGGCTGAGGTTCTAATGGATTTTCCACAACTGACAATGACCTTGCCTGATGGACGAGAAGAATCTGTGATGAAACGCACCACTCTTGTTGCAAACACATCTAACATGCCAGTGGCAGCCAGAGAGGCATCAATTTATACAGGTATCACTTT
AGCAGAGTACTTCCGTGATATGGGATACAATGTCAGTATGATGGCAGACTCAACATCTCGCTGGGCAGAAGCCCTTCGAGAAATCTCTGGCCGTCTGGCTGAAATGCCAGCAGATAGTGGTTATCCAGCCTATTTGGGTGCACGTTTGGCTTCCTTTTATGAGCGGGCTGGTAAAGTTAAATGCTTGGGAAGCCCGGACC
GCACAGGTAGTGTAACAATAGTTGGAGCTGTTTCTCCTCCTGGTGGAGACTTTTCTGATCCAGTAACTGCAGCAACACTTGGTATTGTTCAGGTATTTTGGGGTCTTGACAAGAAACTTGCTCAACGCAAGCATTTTCCATCTGTTAACTGGCTTATTTCATATTCAAAATATACAAAGGCATTAGAATCTTTTTATGAG
CAATTCGACCCAGATTTTATTTCTATTAGGACCAAAGCTCGTGAAGTCTTGCAACGGGAGGATGATCTGAATGAAATTGTCCAACTCGTTGGGAAAGATGCTTTAGCAGAAACCGATAAAATTATTCTGGAGACTGCAAAACTTCTGAGGGAAGACTATCTGGCTCAAAATGCATTTACTCCGTATGATCGATTCTGCCC
ATTTTACAAGTCTGTGTGGATGATGAGAAACATCATCCATTTCAATACATTAGCTAATCAAGCTGTAGAAAGAGGAGCAGGTCCTGATGGGCAGAAGATTACTTACAATATATTAAAACAACGCTTAGGAGACCTTATTTACAAATTAGTGTCTCAAAAGTTTGAAGATCCTGCAGAAGGAGAGCATGCCTTGGTAGAAA
AGTTCAGTAAATTATATGAAGATTTGACAGTTGGTTTCCGCAATCTTGAAGATGAATATCGATAAGTCTATAACTGTTAGTGGTGCTTGCTGCAGAAGGATGCCTTTTGTTTATTTTGTTATTTCCAAGAGCATACTGTTAAACTGGAGCAGCTCAGTCTTTTGTGCATCTGTAATTTTCGAAGTAGGCTGATTTGAATT
ATTGAAAACAGCCAACAGATGTTCTTGATGTGCTGCAAGTTGTCTATTAGTGATTAATTTTGTAAAGAAAACAATCCATTTAATTTATCTGTTATCTGGAGTTCACTGTTATTGGTTCATCTGTGCACATGTTGCATAGATCAAGAATAAGTTGCTTTCCACAATGCATGTCACCATCTGTTTGTGAAATAGTGAAAGAT
CGACAATTACCATGGCAAGGTTTGGTTCCAAAAACTATTTGTTATTTGAAATATATTACGTCC
>TRINITY_DN126464_c0_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:TAACTGGTGGTGATTTATATGCGACGGTCTTTGAGAATAGTCTGATGGAGCACCGTATTGCTGTTCCTCCTGGAGCTATGGGCAAGGTTACATATATTGCACCACCTGGTCATTACACCATTCAGGTGTCAGGACCCGTTGTTGTGGCAGATGGCATGGGAGGGGCAGCTATGTATGAGCTTGTTCGAGTTGGTCATGAC
AATCTTATTGGTGAAATCATTCGTCTGGAGGGTGATTCTGCCACCATCCAAGTTTACGAAGAGACTGCAGGATTAATGGTGAATGACCCTGTCTTGCGGACACATAAGCCTTTGTCAGTAGAGCTGGGACCTGGAATACTTGGTAATATTTTTGATGGGATTCAGAGGCCTTTGAAAGCAATTGCTATAAAGTCTGGTGA
TGTCTATATTCCTCGAGGAGTGGCTGTGCCAGCTCTGGACAAGGACGCAACATGGGATTTTCAGCCTAAGAAGCTATCTGTTGGAGATGTCTTAACTGGTGGTGATTTATATGCGACGGTCTTTGAGAATAGTCTGATGGAGCACCGTATTGCTGTTCCTCCTGGAGCTATGGGCAAGGTTACATATATTGCACCACCTG
GTCATTACACCATTCAGGATACAGTGCTGGAGTTAGAGTTTCAAGGAGTTAAAAAGCACCTCACAATGCTTCAgtttgtctggcttatatctttgacctttctgacatgcaacaaggtcttgtaatgtatagaaggttgtgataacaagggcttaatataatagtttgtttttattgcctgaatcaaatcaaattcaata
tgttgtcaaaagatagtggtcatgagaataggtatgcttatagggtggatacatgagatttgacaatagtatgatccccaaattggtttgacattgtggtcaaaagttttgtgatttattgttttgaaaatgtaaaatgatgacagtttgttatctattgttttgattgactatttgctgctaacttttaatattttctt
attcgttctgtttccgaggaaaatcttgtgggatccccctcttctccaaaatatctggatggagGACTTGGCCTGTGCGGTCACCTAGGCCTGTCTCTGCCAAGCTTGCAGCTGATACACCACTCCTGACTGGACAGCGTGTTCTTGATGCTCTATTTCCCTCTGTGCTTGGAGGAACATGTGCCATACCTGGTGCATTT
GGTTGTGGTAAAACTGTCATTAGTCAAGCTCTTTCCAAGTATTCAAATTCTGATACTGTTGTCTATGTTGGTTGCGGTGAAAGAGGAAATGAGATGGCTGAGGTTCTAATGGATTTTCCACAACTGACAATGACCTTGCCTGATGGACGAGAAGAATCTGTGATGAAACGCACCACTCTTGTTGCAAACACATCTAACAT
GCCAGTGGCAGCCAGAGAGGCATCAATTTATACAGGTATCACTTTAGCAGAGTACTTCCGTGATATGGGATACAATGTCAGTATGATGGCAGACTCAACATCTCGCTGGGCAGAAGCCCTTCGAGAAATCTCTGGCCGTCTGGCTGAAATGCCAGCAGATAGTGGTTATCCAGCCTATTTGGGTGCACGTTTGGCTTCCT
TTTATGAGCGGGCTGGTAAAGTTAAATGCTTGGGAAGCCCGGACCGCACAGGTAGTGTAACAATAGTTGGAGCTGTTTCTCCTCCTGGTGGAGACTTTTCTGATCCAGTAACTGCAGCAACACTTGGTATTGTTCAGGTATTTTGGGGTCTTGACAAGAAACTTGCTCAACGCAAGCATTTTCCATCTGTTAACTGGCTT
ATTTCATATTCAAAATATACAAAGGCATTAGAATCTTTTTATGAGCAATTCGACCCAGATTTTATTTCTATTAGGACCAAAGCTCGTGAAGTCTTGCAACGGGAGGATGATCTGAATGAAATTGTCCAACTCGTTGGGAAAGATGCTTTAGCAGAAACCGATAAAATTATTCTGGAGACTGCAAAACTTCTGAGGGAAGA
CTATCTGGCTCAAAATGCATTTACTCCGTATGATCGATTCTGCCCATTTTACAAGTCTGTGTGGATGATGAGAAACATCATCCATTTCAATACATTAGCTAATCAAGCTGTAGAAAGAGGAGCAGGTCCTGATGGGCAGAAGATTACTTACAATATATTAAAACAACGCTTAGGAGACCTTATTTACAAATTAGTGTCTC
AAAAGTTTGAAGATCCTGCAGAAGGAGAGCATGCCTTGGTAGAAAAGTTCAGTAAATTATATGAAGATTTGACAGTTGGTTTCCGCAATCTTGAAGATGAATATCGATAAGTCTATAACTGTTAGTGGTGCTTGCTGCAGAAGGATGCCTTTTGTTTATTTTGTTATTTCCAAGAGCATACTGTTAAACTGGAGCAGCTC
AGTCTTTTGTGCATCTGTAATTTTCGAAGTAGGCTGATTTGAATTATTGAAAACAGCCAACAGATGTTCTTGATGTGCTGCAAGTTGTCTATTAGTGATTAATTTTGTAAAGAAAACAATCCATTTAATTTATCTGTTATCTGGAGTTCACTGTTATTGGTTCATCTGTGCACATGTTGCATAGATCAAGAATAAGTTGC
TTTCCACAATGCATGTCACCATCTGTTTGTGAAATAGTGAAAGATCGACAATTACCATGGCAAGGTTTGGTTCCAAAAACTATTTGTTATTTGAAATATATTACGTCC
Intron 6 GTATGTAATA ... ATTTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 12.2 | 36 | 3 | 5 |
| A2 | 22.58 | 24 | 2 | 7 |
| A3 | 19.05 | 17 | 0.7 | 4 |
| A4 | 0 | 10 | 0 | 0 |
| A5 | 27.27 | 8 | 3.3 | 3 |
| A6 | 21.51 | 146 | 7.3 | 40 |
| A7 | 20 | 84 | 4.7 | 21 |
| A8 | 18.87 | 129 | 11.7 | 30 |
| A9 | 18.56 | 79 | 5.3 | 18 |
| A10 | 21.05 | 60 | 1.3 | 16 |
>TRINITY_DN37644_c0_g2_i1 from sample A7 / Example spliced isoformGAAACTTTCTATAAAGGGCCGACGGACCATTCTCTAGTGCCACCTGTAAGATATTGTGCCAACTAGGTTTGATCACAGAGCATTCGATCCCGCCGGACTCCAAAAAGGCTTTCAGTCGGGTTAAACTCCCAAGGGTTTTTCCATCCAATCCAATATTCAGTCTGCTGGATCTCTTAGACGCTCAGATCCGAAGGATCTTT
TCAGAAATTTTGGCTTCTGTATCGAATTCTTCCCTATCGATTCGACGAGATTCTAACGCGAATTAACCAGATCGGATCTGGATTTGCTGTTTTTCGAGCTTTAAATTGAGCTTTTCTGCTCCTGATTTGGGGGATTCTACTGCAATTTGGAGCAGAAAACATGCCGTCTGTACATGGAGATAAAATGACTACCTTCGAGG
ACTCTGAGAAGGAGAGCGAGTATGGATACGTCCGAAAGGTGTCAGGACCCGTTGTTGTGGCAGATGGCATGGGAGGGGCAGCTATGTATGAGCTTGTTCGAGTTGGTCATGACAATCTTATTGGTGAAATCATTCGTCTGGAGGGTGATTCTGCCACCATCCAAGTTTACGAAGAGACTGCAGGATTAATGGTGAATGAC
CCTGTCTTGCGGACACATAAGCCTTTGTCAGTAGAGCTGGGACCTGGAATACTTGGTAATATTTTTGATGGGATTCAGAGGCCTTTGAAAGCAATTGCTATAAAGTCTGGTGATGTCTATATTCCTCGAGGAGTGGCTGTGCCAGCTCTGGACAAGGACGCAACATGGGATTTTCAGCCTAAGAAGCTATCTGTTGGAGA
TGTCTTAACTGGTGGTGATTTATATGCGACGGTCTTTGAGAATAGTCTGATGGAGCACCGTATTGCTGTTCCTCCTGGAGCTATGGGCAAGGTTACATATATTGCACCACCTGGTCATTACACCATTCAGGATACAGTGCTGGAGTTAGAGTTTCAAGGAGTTAAAAAGCACCTCACAATGCTTCAGACTTGGCCTGTGC
GGTCACCTAGGCCTGTCTCTGCCAAGCTTGCAGCTGATACACCACTCCTGACTGGACAGCGTGTTCTTGATGCTCTATTTCCCTCTGTGCTTGGAGGAACATGTGCCATACCTGGTGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTCATTAGTCAAGCTCTTTCCAAGTATTCAAATTCTGATACTGTTGTCTATGTTGGTTGCGGT
GAAAGAGGAAATGAGATGGCTGAGGTTCTAATGGATTTTCCACAACTGACAATGACCTTGCCTGATGGACGAGAAGAATCTGTGATGAAACGCACCACTCTTGTTGCAAACACATCTAACATGCCAGTGGCAGCCAGAGAGGCATCAATTTATACAGGTATCACTTTAGCAGAGTACTTCCGTGATATGGGATACAATGT
CAGTATGATGGCAGACTCAACATCTCGCTGGGCAGAAGCCCTTCGAGAAATCTCTGGCCGTCTGGCTGAAATGCCAGCAGATAGTGGTTATCCAGCCTATTTGGGTGCACGTTTGGCTTCCTTTTATGAGCGGGCTGGTAAAGTTAAATGCTTGGGAAGCCCGGACCGCACAGGTAGTGTAACAATAGTTGGAGCTGTTT
CTCCTCCTGGTGGAGACTTTTCTGATCCAGTAACTGCAGCAACACTTGGTATTGTTCAGGTATTTTGGGGTCTTGACAAGAAACTTGCTCAACGCAAGCATTTTCCATCTGTTAACTGGCTTATTTCATATTCAAAATATACAAAGGCATTAGAATCTTTTTATGAGCAATTCGACCCAGATTTTATTTCTATTAGGACC
AAAGCTCGTGAAGTCTTGCAACGGGAGGATGATCTGAATGAAATTGTCCAACTCGTTGGGAAAGATGCTTTAGCAGAAACCGATAAAATTATTCTGGAGACTGCAAAACTTCTGAGGGAAGACTATCTGGCTCAAAATGCATTTACTCCGTATGATAGATTCTGCCCATTTTACAAGTCTGTGTGGATGATGAGAAACAT
CATCCATTTCAATACATTAGCTAATCAAGCTGTAGAAAGAGGAGCAGGTCCTGATGGGCAGAAGATTACTTACAATATATTAAAACAACGCTTAGGAGACCTTATTTACAAATTAGTGTCTCAAAAGTTTGAAGATCCTGCAGAAGGAGAGCATGCCTTGGTAGAAAAGTTCAGTAAATTATATGAAGATTTGACAGTTG
GTTTCCGCAATCTTGAAGATGAATATCGATAAGTCTATAACTGTTAGTGGTGCTTGCTGCAGAAGGATGCCTTTTGTTTATTTTGTTATTTCCAAGAGCATACTGTTAAACTGGAGCAGCTCAGTCTTTTGTGCATCTGTAATTTTCGAAGTAGGCTGATTTGAATTATTGAAAACAGCCAACAGATGTTCTTGATGTGC
TGCAAGTTGTCTATTAGTGATTAATTTTGTAAAGAAAACAATCCATTTAATTTATCTGTTATCTGGAGTTCACTGTTATTGGTTCATCTGTGCACATGTTGCATAGATCAAGAATAAGTTGCTTTCCACAATGCATGTCACCATCTGTTTGTGAAATAGTGAAAGATCGACAATTACCATGGCAAGGTTTGGTTCCAAAA
ACTATTTGTTATTTGAAATATATTACGTCTTTTTCCCTTTAGTACAAGGTAGTTGTGTTTGACTTTCTCAGTCATGCAAGGGCTTCCACTTTGGGTGAATTGTGTAATCTGGATTCGCAGCCTACTTTTGAGACAAAAACAC
>TRINITY_DN37644_c0_g2_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:GAAACTTTCTATAAAGGGCCGACGGACCATTCTCTAGTGCCACCTGTAAGATATTGTGCCAACTAGGTTTGATCACAGAGCATTCGATCCCGCCGGACTCCAAAAAGGCTTTCAGTCGGGTTAAACTCCCAAGGGTTTTTCCATCCAATCCAATATTCAGTCTGCTGGATCTCTTAGACGCTCAGATCCGAAGGATCTTT
TCAGAAATTTTGGCTTCTGTATCGAATTCTTCCCTATCGATTCGACGAGATTCTAACGCGAATTAACCAGATCGGATCTGGATTTGCTGTTTTTCGAGCTTTAAATTGAGCTTTTCTGCTCCTGATTTGGGGGATTCTACTGCAATTTGGAGCAGAAAACATGCCGTCTGTACATGGAGATAAAATGACTACCTTCGAGG
ACTCTGAGAAGGAGAGCGAGTATGGATACGTCCGAAAGGTGTCAGGACCCGTTGTTGTGGCAGATGGCATGGGAGGGGCAGCTATGTATGAGCTTGTTCGAGTTGGTCATGACAATCTTATTGGTGAAATCATTCGTCTGGAGGGTGATTCTGCCACCATCCAAGTTTACGAAGAGACTGCAGGATTAATGGTGAATGAC
CCTGTCTTGCGGACACATAAGCCTTTGTCAGTAGAGCTGGGACCTGGAATACTTGGTAATATTTTTGATGGGATTCAGAGGCCTTTGAAAGCAATTGCTATAAAGTCTGGTGATGTCTATATTCCTCGAGGAGTGGCTGTGCCAGCTCTGGACAAGGACGCAACATGGGATTTTCAGCCTAAGAAGCTATCTGTTGGAGA
TGTCTTAACTGGTGGTGATTTATATGCGACGGTCTTTGAGAATAGTCTGATGGAGCACCGTATTGCTGTTCCTCCTGGAGCTATGGGCAAGGTTACATATATTGCACCACCTGGTCATTACACCATTCAGGATACAGTGCTGGAGTTAGAGTTTCAAGGAGTTAAAAAGCACCTCACAATGCTTCAGACTTGGCCTGTGC
GGTCACCTAGGCCTGTCTCTGCCAAGCTTGCAGCTGATACACCACTCCTGACTGGACAGCGTGTTCTTGATGCTCTATTTCCCTCTGTGCTTGGAGGAACATGTGCCATACCTGGTGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTCATTAGTCAAGCTCTTTCCAAGTATTCAAATTCTGATACTGTTGTCTATGTTGGTTGCGGT
GAAAGAGGAAATGAGATGGCTGAGGTTCTAATGGATTTTCCACAACTGACAATGACCTTGCCTGATGGACGAGAAGAATCTGTGATGAAACGCACCACTCTTGTTGCAAACACATCTAACATGCCAGTGGCAGCCAGAGAGGCATCAATTTATACAGGTATCACTTTAGCAGAGTACTTCCGTGATATGGGATACAATGT
CAGTATGATGGCAGACTCAACATCTCGCTGGGCAGAAGCCCTTCGAGAAATCTCTGGCCGTCTGGCTGAAATGCCAGCAGATAGTGGTTATCCAGCCTATTTGGGTGCACGTTTGGCTTCCTTTTATGAGCGGGCTGGTAAAGTTAAATGCTTGGGAAGCCCGGACCGCACAGGTAGTGTAACAATAGTTGGAGCTGTTT
CTCCTCCTGGTGGAGACTTTTCTGATCCAGTAACTGCAGCAACACTTGGTATTGTTCAGGTATTTTGGGGTCTTGACAAGAAACTTGCTCAACGCAAGCATTTTCCATCTGTTAACTGGCTTATTTCATATTCAAAATATACAAAGGCATTAGAATCTTTTTATGAGCAATTCGACCCAGATTTTATTTCTATTAGGACC
AAAGCTCGTGAAGTCTTGCAACGGGAGGATGATCTGAATGAAATTGTCCAACTCGTTGGGAAAGATGCTTTAGCAGAAACCGATAAAATTATTCTGGAGACTGCAAAACTTCTGAGGGAAGACTATCTGGCTCAAAATGCATTTACTCCGTATGATAGATTCTGCCCATTTTACAAGTCTGTGTGGATGATGAGAAACAT
CATCCATTTCAATACATTAGCTAATCAAGCTGTAGAAAGAGGAGCAGGTCCTGATGGGCAGAAGATTACTTACAATATATTAAAACAACGCTTAGGAGACCTTATTTACAAATTAGTgtatgtaatatgtatatgcttccagttcttgatgttacatacattctgtaaggaaatagtgtatcctaagagaacacactaat
tatttttgcagGTCTCAAAAGTTTGAAGATCCTGCAGAAGGAGAGCATGCCTTGGTAGAAAAGTTCAGTAAATTATATGAAGATTTGACAGTTGGTTTCCGCAATCTTGAAGATGAATATCGATAAGTCTATAACTGTTAGTGGTGCTTGCTGCAGAAGGATGCCTTTTGTTTATTTTGTTATTTCCAAGAGCATACTGT
TAAACTGGAGCAGCTCAGTCTTTTGTGCATCTGTAATTTTCGAAGTAGGCTGATTTGAATTATTGAAAACAGCCAACAGATGTTCTTGATGTGCTGCAAGTTGTCTATTAGTGATTAATTTTGTAAAGAAAACAATCCATTTAATTTATCTGTTATCTGGAGTTCACTGTTATTGGTTCATCTGTGCACATGTTGCATAG
ATCAAGAATAAGTTGCTTTCCACAATGCATGTCACCATCTGTTTGTGAAATAGTGAAAGATCGACAATTACCATGGCAAGGTTTGGTTCCAAAAACTATTTGTTATTTGAAATATATTACGTCTTTTTCCCTTTAGTACAAGGTAGTTGTGTTTGACTTTCTCAGTCATGCAAGGGCTTCCACTTTGGGTGAATTGTGTA
ATCTGGATTCGCAGCCTACTTTTGAGACAAAAACAC
Intron 7 GTAAATTTTA ... CTTTGTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 24.14 | 22 | 4 | 10 |
| A2 | 7.94 | 29 | 1 | 4 |
| A3 | 27.66 | 17 | 1 | 12 |
| A4 | 27.66 | 17 | 7 | 6 |
| A5 | 41.46 | 12 | 8 | 9 |
| A6 | 20.48 | 33 | 4 | 13 |
| A7 | 19.1 | 36 | 5 | 12 |
| A8 | 20.93 | 34 | 8 | 10 |
| A9 | 11.54 | 23 | 0 | 6 |
| A10 | 14.29 | 24 | 1 | 7 |
>TRINITY_DN103652_c0_g1_i15 from sample A5 / Example spliced isoformCATGGTCAATTTATAGCTCTGATTTTGATTATTGGATAGCTTCAGATCTTAGATTCTTTATTGGTTGCATGTGTTGCAGCTGTTGGAGATGTCTTAACTGGTGGTGATTTATATGCGGTGTGCATTTGGCTCCTTTAAATCCTGAAGTCTACGATACAATTATCTATGTGTTGGTGCTCGTCTCTTATTTAGTTTCTCAT
TATGGAGCTTTTCGATTTTCATGTACTACCGATTATTTTGCAGACGGTCTTTGAGAATAGTCTGATGGAGCACCGTATTGCTGTTCCTCCTGGAGCTATGGGCAAGGTTACATATATTGCACCACCTGGTCATTACACCATTCAGGATACAGTGCTGGAGTTAGAGTTTCAAGGAGTTAAAAAGCACCTCACAATGCTTC
AGACTTGGCCTGTGCGGTCACCTAGGCCTGTCTCTGCCAAGCTTGCAGCTGATACACCACTCCTGACTGGACAGCGTGTTCTTGATGCTCTATTTCCCTCTGTGCTTGGAGGAACATGTGCCATACCTGGTGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTCATTAGTCAAGCTCTTTCCAAGTATTCAAATTCTGATACTGTTGTC
TATGTTGGTTGCGGTGAAAGAGGAAATGAGATGGCTGAGGTTCTAATGGATTTTCCACAACTGACAATGACCTTGCCTGATGGACGAGAAGAATCTGTGATGAAACGCACCACTCTTGTTGCAAACACATCCAACATGCCAGTGGCAGCCAGAGAGGCATCAATTTATACAGGTATCACTTTAGCAGAGTACTTCCGTGA
TATGGGATACAATGTCAGTATGATGGCAGACTCAACATCTCGCTGGGCAGAAGCCCTTCGAGAAATCTCTGGCCGTCTGGCTGAAATGCCAGCAGATAGTGGTTATCCAGCCTATTTGGGTGCACGTTTGGCTTCCTTTTATGAGCGGGCTGGTAAAGTTAAATGCTTGGGAAGCCCGGACCGCACAGGTAGTGTAACAA
TAGTTGGAGCTGTTTCTCCTCCTGGTGGAGACTTTTCTGATCCAGTAACTGCAGCAACACTTGGTATTGTTCAGGTATTTTGGGGTCTTGACAAGAAACTTGCTCAACGCAAGCATTTTCCATCTGTTAACTGGCTTATTTCATATTCAAAATATACAAAGGCATTAGAATCTTTTTATGAGCAATTCGACCCAGATTTT
ATTTCTATTAGGACCAAAGCTCGTGAAGTCTTGCAACGGGAGGATGATCTGAATGAAATTGTCCAACTCGTTGGGAAAGATGCTTTAGCAGAAACCGATAAAATTATTCTGGAGACTGCAAAACTTCTGAGGGAAGACTATCTGGCTCAAAATGCATTTACTCCGTATGATAGATTCTGCCCATTTTACAAGTCTGTGTG
GATGATGAGAAACATCATCCATTTCAATACATTAGCTAATCAAGCTGTAGAAAGAGGAGCAGGTCCTGATGGGCAGAAGATTACTTACAATATATTAAAACAACGCTTAGGAGACCTTATTTACAAATTAGTGTCTCAAAAGTTTGAAGATCCTGCAGAAGGAGAGCATGCCTTGGTAGAAAAGTTCAGTAAATTATATG
AAGATTTGACAGTTGGTTTCCGCAATCTTGAAGATGAATATCGATAAGTCTATAACTGTTAGTGGTGCTTGCTGCAGAAGGATGCCTTTTGTTTATTTTGTTATTTCCAAGAGCATACTGTTAAACTGGAGCAGCTCAGTCTTTTGTGCATCTGTAATTTTCGAAGTAGGCTGATTTGAATTATTGAAAACAGCCAACAG
ATGTTCTTGATGTGCTGCAAGTTGTCTATTAGTGATTAATTTTGTAAAGAAA
>TRINITY_DN103652_c0_g1_i14 from sample A5 / Example unspliced isoform:GAGAAACTTTCTATAAAGGGCCGACGGACCATTCTCTAGTGCCACCTGTAAGATATTGTGCCAACTAGGTTTGATCACAGAGCATTCGATCCCGCCGGACTCCAAAAAGGCTTTCAGTCGGGTTAAACTCCCAAGGGTTTTTCCATCCAATCCAATATTCAGTCTGCTGGATCTCTTAGACGCTCAGATCCGAAGGATCT
TTTCAGAAATTTTGGCTTCTGTATCGAATTCTTCCCTATCGATTCGACGAGATTCTAACGCGAATTAACCAGATCGGATCTGGATTTGCTGTTTTTCGAGCTTTAAATTGAGCTTTTCTGCTCCTGATTTGGGGGATTCTACTGCAATTTGGAGCAGAAAACATGCCGTCTGTACATGGAGATAAAATGACTACCTTCGA
GGACTCTGAGAAGGAGAGCGAGTATGGATACGTCCGAAAGGTGTCAGGACCCGTTGTTGTGGCAGATGGCATGGGAGGGGCAGCTATGTATGAGCTTGTTCGAGTTGGTCATGACAATCTTATTGGTGAAATCATTCGTCTGGAGGGTGATTCTGCCACCATCCAAGTTTACGAAGAGACTGCAGGATTAATGGTGAATG
ACCCTGTCTTGCGGACACATAAGCCTTTGTCAGTAGAGCTGGGACCTGGAATACTTGGTAATATTTTTGATGGGATTCAGAGGCCTTTGAAAGCAATTGCTATAAAGTCTGGTGATGTCTATATTCCTCGAGGAGTGGCTGTGCCAGCTCTGGACAAGGACGCAACATGGGATTTTCAGCCTAAGAAGCTATCTGTTGGA
GATGTCTTAACTGGTGGTGATTTATATGCGACGGTCTTTGAGAATAGTCTGATGGAGCACCGTATTGCTGTTCCTCCTGGAGCTATGGGCAAGGTTACATATATTGCACCACCTGGTCATTACACCATTCAGGATACAGTGCTGGAGTTAGAGTTTCAAGGAGTTAAAAAGCACCTCACAATGCTTCAGACTTGGCCTGT
GCGGTCACCTAGGCCTGTCTCTGCCAAGCTTGCAGCTGATACACCACTCCTGACTGGACAGCGTGTTCTTGATGCTCTATTTCCCTCTGTGCTTGGAGGAACATGTGCCATACCTGGTGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTCATTAGTCAAGCTCTTTCCAAGgtaaattttaaatattctcttattgtagaacctttgg
attttgaagtcatgccaatatattttaaagcatagagattgctgactttgttcatgaactttgtgcagTATTCAAATTCTGATACTGTTGTCTATGTTGGTTGCGGTGAAAGAGGAAATGAGATGGCTGAGGTTCTAATGGATTTTCCACAACTGACAATGACCTTGCCTGATGGACGAGAAGAATCTGTGATGAAACGC
ACCACTCTTGTTGCAAACACATCCAACATGCCAGTGGCAGCCAGAGAGGCATCAATTTATACAGGTATCACTTTAGCAGAGTACTTCCGTGATATGGGATACAATGTCAGTATGATGGCAGACTCAACATCTCGCTGGGCAGAAGCCCTTCGAGAAATCTCTGGCCGTCTGGCTGAAATGCCAGCAGATAGTGGTTATCC
AGCCTATTTGGGTGCACGTTTGGCTTCCTTTTATGAGCGGGCTGGTAAAGTTAAATGCTTGGGAAGCCCGGACCGCACAGGTAGTGTAACAATAGTTGGAGCTGTTTCTCCTCCTGGTGGAGACTTTTCTGATCCAGTAACTGCAGCAACACTTGGTATTGTTCAGGTTGGTATGGTCAATTTGTGTGCTTGCTGTAGGG
GAGTTCCATTAAATTCATATTACCAGATATGTATTCATGTTGTAATGGTAATTGATCAATGGCTATGTAGTGCTTATACATTCAATATTTGAACAGGTATTTTGG
Intron 8 GTGTGTATAT ... TGCTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 28.57 | 15 | 6 | 1 |
| A2 | 15.79 | 16 | 3 | 0 |
| A3 | 31.82 | 30 | 14 | 2 |
| A4 | 35.31 | 29.3 | 16 | 2 |
| A5 | 16.67 | 5 | 1 | 0 |
| A6 | 23.41 | 55.7 | 17 | 2 |
| A7 | 29.88 | 58.7 | 25 | 0 |
| A8 | 25.82 | 46 | 16 | 2 |
| A9 | 26.48 | 41.7 | 15 | 0 |
| A10 | 30.02 | 42 | 18 | 0 |
>TRINITY_DN103955_c0_g2_i17 from sample A4 / Example spliced isoformCTTTCATCAAGGAGAACAGGTGAGAAACTTTCTATAAAGGGCCGACGGACCATTCTCTAGTGCCACCTGTAAGATATTGTGCCAACTAGGTTTGATCACAGAGCATTCGATCCCGCCGGACTCCAAAAAGGCTTTCAGTCGGGTTAAACTCCCAAGGGTTTTTCCATCCAATCCAATATTCAGTCTGCTGGATCTCTTAG
ACGCTCAGATCCGAAGGATCTTTTCAGAAATTTTGGCTTCTGTATCGAATTCTTCCCTATCGATTCGACGAGATTCTAACGCGAATTAACCAGATCGGATCTGGATTTGCTGTTTTTCGAGCTTTAAATTGAGCTTTTCTGCTCCTGATTTGGGGGATTCTACTGCAATTTGGAGCAGAAAACATGCCGTCTGTACATGG
AGATAAAATGACTACCTTCGAGGACTCTGAGAAGGAGAGCGAGTATGGATACGTCCGAAAGGTGTCAGGACCCGTTGTTGTGGCAGATGGCATGGGAGGGGCAGCTATGTATGAGCTTGTTCGAGTTGGTCATGACAATCTTATTGGTGAAATCATTCGTCTGGAGGGTGATTCTGCCACCATCCAAGTTTACGAAGAGA
CTGCAGGATTAATGGTGAATGACCCTGTCTTGCGGACACATAAGCCTTTGTCAGTAGAGCTGGGACCTGGAATACTTGGTAATATTTTTGATGGGATTCAGAGGCCTTTGAAAGCAATTGCTATAAAGTCTGGTGATGTCTATATTCCTCGAGGAGTGGCTGTGCCAGCTCTGGACAAGGACGCAACATGGGATTTTCAG
CCTAAGAAGCTATCTGTTGGAGATGTCTTAACTGGTGGTGATTTATATGCGACGGTCTTTGAGAATAGTCTGATGGAGCACCGTATTGCTGTTCCTCCTGGAGCTATGGGCAAGGTTACATATATTGCACCACCTGGTCATTACACCATTCAGGATACAGTGCTGGAGTTAGAGTTTCAAGGAGTTAAAAAGCACCTCAC
AATGCTTCAGACTTGGCCTGTGCGGTCACCTAGGCCTGTCTCTGCCAAGCTTGCAGCTGATACACCACTCCTGACTGGACAGCGTGTTCTTGATGCTCTATTTCCCTCTGTGCTTGGAGGAACATGTGCCATACCTGGTGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTCATTAGTCAAGCTCTTTCCAAGTATTCAAATTCTGATA
CTGTTGTCTATGTTGGTTGCGGTGAAAGAGGAAATGAGATGGCTGAGGTTCTAATGGATTTTCCACAACTGACAATGACCTTGCCTGATGGACGAGAAGAATCTGTGATGAAACGCACCACTCTTGTTGCAAACACATCTAACATGCCAGTGGCAGCCAGAGAGGCATCAATTTATACAGGTATCACTTTAGCAGAGTAC
TTCCGTGATATGGGATACAATGTCAGTATGATGGCAGACTCAACATCTCGCTGGGCAGAAGCCCTTCGAGAAATCTCTGGCCGTCTGGCTGAAATGCCAGCAGATAGTGGTTATCCAGCCTATTTGGGTGCACGTTTGGCTTCCTTTTATGAGCGGGCTGGTAAAGTTAAATGCTTGGGAAGCCCGGACCGCACAGGTAG
TGTAACAATAGTTGGAGCTGTTTCTCCTCCTGGTGGAGACTTTTCTGATCCAGTAACTGCAGCAACACTTGGTATTGTTCAGGTATTTTGGGGTCTTGACAAGAAACTTGCTCAACGCAAGCATTTTCCATCTGTTAACTGGCTTATTTCATATTCAAAATATACAAAGGCATTAGAATCTTTTTATGAGCAATTCGACC
CAGATTTTATTTCTATTAGGACCAAAGCTCGTGAAGTCTTGCAACGGGAGGATGATCTGAATGAAATTGTCCAAGTAAGTTAATTTATTTTGGATATATACATATATCATTCAGTAATACCTCTTGTTATTTTTCCAGGCCTCAATGCTTTGTGAGTCTTATTGCTGTTTATGGTGTGGCTTGATTTCTGCAATTTTTTA
TTTTAACCAGTATATTAATCTTAATTTTGAGTTGTAACATCCATGCAATTTTATCATACGAGATTATAGATTCTCATTATCTTATTTATGACAACTGTCACTTAGAGTTCTTAATTCACAACCATTCACTTTTTAGCTTAGATTGGATCTAATTCCATCTTTTGTTCAGTACCATCCTTTTTACTTTTTTTTTTTAACAA
ATGGGAAGCTGCCTTTTTAGGGCGGTAGACCACGATATACATGTCCCACCATCTCTCACATAATCAACAATAGGTGCAACTGATGTCCCACCATCTCTCACTTAATCAACAATAGGTGCAACTGGCAAATCCCATGCAGGGGAGGAGCATTCCCACCCGTATCTGAGCCTGGGTCATTGTCACAACAAACACACCAAGTT
GCCACTCGACCACTGCCCAAAAGACTGGGAAGTTCAGAAGCTTATTAGAAATATTTTTTGTACAACGTTCGAAAATGGTTAAGATCCTCTTGTGGTAGCTTGAAAACACACATTCTTGTTCTAGTAAAGAAGTTATTATGTTTCTTGTTAACTGCACCGGAAACTCTCTTTTGAGATGTCAGAAGTGCTTGCGTCTAGAC
TTTACTGTCACTGGCACACTGTTGGGATATTGGTATAATGGTGCTGCTTTATATCATTCTTTGTGCATCAAAATTTTTCCATTGCTCTTATAAAACCAATTCTGTTTATTAGATGAGTTAGGTGGGAAACTGCCGATTCTCTGATGGTTCTGATTTTATGCAGCAGAAGAAAAATGATGTATTCTACGAGGATTTAGAAT
TATAATATGCTCAATTTGTTTTCTAAGATTAAAGGATATGATGGTTTGGAGAGTCATGCCTATCTGCAAATAAGAATTGGAAGTTTTCAAATAATGCGCTGTTCTGCAGGTGCAGATAAGTTGATTATATGGAGTATAATGTTGGAATGTTAAGCATTTTAAATATTAAAGGACCTGATTTTCATAATTTTAACTTGACT
AGATAGTTTGATGAAGATTGGAATGCACCCAACTGAAATGAGGATAAAGGATGTTATTTGAAGCATTATAAATTATAATTTATATATATCACTTAAACTTTTTGGATTAATCTATTTGTCTCAATATATTATTTCCTGGTTGGAAGCCCACATGGGAGATTATGCAGGGTTACATAAGCAGGCTATTTAGAATTTTTATG
GATTC
>TRINITY_DN103955_c0_g2_i12 from sample A4 / Example unspliced isoform:CTTTCATCAAGGAGAACAGGTGAGAAACTTTCTATAAAGGGCCGACGGACCATTCTCTAGTGCCACCTGTAAGATATTGTGCCAACTAGGTTTGATCACAGAGCATTCGATCCCGCCGGACTCCAAAAAGGCTTTCAGTCGGGTTAAACTCCCAAGGGTTTTTCCATCCAATCCAATATTCAGTCTGCTGGATCTCTTAG
ACGCTCAGATCCGAAGGATCTTTTCAGAAATTTTGGCTTCTGTATCGAATTCTTCCCTATCGATTCGACGAGATTCTAACGCGAATTAACCAGATCGGATCTGGATTTGCTGTTTTTCGAGCTTTAAATTGAGCTTTTCTGCTCCTGATTTGGGGGATTCTACTGCAATTTGGAGCAGAAAACATGCCGTCTGTACATGG
AGATAAAATGACTACCTTCGAGGACTCTGAGAAGGAGAGCGAGTATGGATACGTCCGAAAGGTGTCAGGACCCGTTGTTGTGGCAGATGGCATGGGAGGGGCAGCTATGTATGAGCTTGTTCGAGTTGGTCATGACAATCTTATTGGTGAAATCATTCGTCTGGAGGGTGATTCTGCCACCATCCAAGTTTACGAAGAGA
CTGCAGGATTAATGGTGAATGACCCTGTCTTGCGGACACATAAGCCTTTGTCAGTAGAGCTGGGACCTGGAATACTTGGTAATATTTTTGATGGGATTCAGAGGCCTTTGAAAGCAATTGCTATAAAGTCTGGTGATGTCTATATTCCTCGAGGAGTGGCTGTGCCAGCTCTGGACAAGGACGCAACATGGGATTTTCAG
CCTAAGAAGCTATCTGTTGGAGATGTCTTAACTGGTGGTGATTTATATGCGACGGTCTTTGAGAATAGTCTGATGGAGCACCGTATTGCTGTTCCTCCTGGAGCTATGGGCAAGGTTACATATATTGCACCACCTGGTCATTACACCATTCAGGATACAGTGCTGGAGTTAGAGTTTCAAGGAGTTAAAAAGCACCTCAC
AATGCTTCAGACTTGGCCTGTGCGGTCACCTAGGCCTGTCTCTGCCAAGCTTGCAGCTGATACACCACTCCTGACTGGACAGCGTGTTCTTGATGCTCTATTTCCCTCTGTGCTTGGAGGAACATGTGCCATACCTGGTGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTCATTAGTCAAGCTCTTTCCAAGTATTCAAATTCTGATA
CTGTTGTCTATGTTGGTTGCGGTGAAAGAGGAAATGAGATGGCTGAGGTTCTAATGGATTTTCCACAACTGACAATGACCTTGCCTGATGGACGAGAAGAATCTGTGATGAAACGCACCACTCTTGTTGCAAACACATCTAACATGCCAGTGGCAGCCAGAGAGGCATCAATTTATACAGGTATCACTTTAGCAGAGTAC
TTCCGTGATATGGGATACAATGTCAGTATGATGGCAGACTCAACATCTCGCTGGGCAGAAGCCCTTCGAGAAATCTCTGGCCGTCTGGCTGAAATGCCAGCAGATAGTGGTTATCCAGCCTATTTGGGTGCACGTTTGGCTTCCTTTTATGAGCGGGCTGGTAAAGTTAAATGCTTGGGAAGCCCGGACCGCACAGGTAG
TGTAACAATAGTTGGAGCTGTTTCTCCTCCTGGTGGAGACTTTTCTGATCCAGTAACTGCAGCAACACTTGGTATTGTTCAGGTATTTTGGGGTCTTGACAAGAAACTTGCTCAACGCAAGCATTTTCCATCTGTTAACTGGCTTATTTCATATTCAAAATATACAAAGgtgtgtatattcctatttgggcccaggttgt
tgattatgttgaaatctgaaacatttgagtatggctcattggtcacagtgctctaacctaagagtcattttaatcatgaggcattttttatttgtccaactatgttcattgagattatatggggctgctttgcagGCATTAGAATCTTTTTATGAGCAATTCGACCCAGATTTTATTTCTATTAGGACCAAAGCTCGTGA
AGTCTTGCAACGGGAGGATGATCTGAATGAAATTGTCCAA
Intron 9 GTGTGCATTT ... TATTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 30.4 | 35.1 | 14.5 | 12 |
| A2 | 27.49 | 32.7 | 14.1 | 4.8 |
| A3 | 22.76 | 39.5 | 17.2 | 9.5 |
| A4 | 40.65 | 12.2 | 5 | 8.2 |
| A5 | 25.49 | 32.5 | 15.2 | 7.4 |
| A6 | 12.51 | 34.4 | 4.5 | 5.5 |
| A7 | 14.53 | 45.7 | 14.1 | 7.8 |
| A8 | 15.67 | 16.1 | 3.3 | 4.5 |
| A9 | 16.9 | 28.9 | 7.4 | 6.9 |
| A10 | 11.09 | 25.4 | 6 | 4.5 |
>TRINITY_DN126464_c0_g1_i8 from sample A1 / Example spliced isoformTCTCCACAGACTTTCATCAAGGAGAACAGGTGAGAAACTTTCTATAAAGGGCCCACGGACCATTCTCTAGTGCCACCTGTAAGATATTGTGCCAACTAGGTTTGATCACAGAGCATTCGATCCCGCCGGACTCCAAAAAGGCTTTCAGTCGGGTTAAACTCCCAAGGGTTTTTCCATCCAATCCAATATTCAGTCTGCTG
GATCTCTTAGACGCTCAGATCCGAAGGATCTTTTCAGAAATTTTGGCTTCTGTATCGAATTCTTCCCTATCGATTCGACGAGATTCTAACGCGAATTAACCAGATCGGATCTGGATTTGCTGTTTTTCGAGCTTTAAATTGAGCTTTTCTGCTCCTGATTTGGGGGATTCTACTGCAATTTGGAGCAGAAAACATGCCGT
CTGTACATGGAGATAAAATGACTACCTTCGAGGACTCTGAGAAGGAGAGCGAGTATGGATACGTCCGAAAGGTGTCAGGACCCGTTGTTGTGGCAGATGGCATGGGAGGGGCAGCTATGTATGAGCTTGTTCGAGTTGGTCATGACAATCTTATTGGTGAAATCATTCGTCTGGAGGGTGATTCTGCCACCATCCAAGTT
TACGAAGAGACTGCAGGATTAATGGTGAATGACCCTGTCTTGCGGACACATAAGCCTTTGTCAGTAGAGCTGGGACCTGGAATACTTGGTAATATTTTTGATGGGATTCAGAGGCCTTTGAAAGCAATTGCTATAAAGTCTGGTGATGTCTATATTCCTCGAGGAGTGGCTGTGCCAGCTCTGGACAAGGACGCAACATG
GGATTTTCAGCCTAAGAAGCTATCTGTTGGAGATGTCTTAACTGGTGGTGATTTATATGCGACGGTCTTTGAGAATAGTCTGATGGAGCACCGTATTGCTGTTCCTCCTGGAGCTATGGGCAAGGTTACATATATTGCACCACCTGGTCATTACACCATTCAGGATACAGTGCTGGAGTTAGAGTTTCAAGGAGTTAAAA
AGCACCTCACAATGCTTCAGACTTGGCCTGTGCGGTCACCTAGGCCTGTCTCTGCCAAGCTTGCAGCTGATACACCACTCCTGACTGGACAGCGTGTTCTTGATGCTCTATTTCCCTCTGTGCTTGGAGGAACATGTGCCATACCTGGTGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTCATTAGTCAAGCTCTTTCCAAGTATTCA
AATTCTGATACTGTTGTCTATGTTGGTTGCGGTGAAAGAGGAAATGAGATGGCTGAGGTTCTAATGGATTTTCCACAACTGACAATGACCTTGCCTGATGGACGAGAAGAATCTGTGATGAAACGCACCACTCTTGTTGCAAACACATCTAACATGCCAGTGGCAGCCAGAGAGGCATCAATTTATACAGGTATCACTTT
AGCAGAGTACTTCCGTGATATGGGATACAATGTCAGTATGATGGCAGACTCAACATCTCGCTGGGCAGAAGCCCTTCGAGAAATCTCTGGCCGTCTGGCTGAAATGCCAGCAGATAGTGGTTATCCAGCCTATTTGGGTGCACGTTTGGCTTCCTTTTATGAGCGGGCTGGTAAAGTTAAATGCTTGGGAAGCCCGGACC
GCACAGGTAGTGTAACAATAGTTGGAGCTGTTTCTCCTCCTGGTGGAGACTTTTCTGATCCAGTAACTGCAGCAACACTTGGTATTGTTCAGGTATTTTGGGGTCTTGACAAGAAACTTGCTCAACGCAAGCATTTTCCATCTGTTAACTGGCTTATTTCATATTCAAAATATACAAAGGCATTAGAATCTTTTTATGAG
CAATTCGACCCAGATTTTATTTCTATTAGGACCAAAGCTCGTGAAGTCTTGCAACGGGAGGATGATCTGAATGAAATTGTCCAACTCGTTGGGAAAGATGCTTTAGCAGAAACCGATAAAATTATTCTGGAGACTGCAAAACTTCTGAGGGAAGACTATCTGGCTCAAAATGCATTTACTCCGTATGATCGATTCTGCCC
ATTTTACAAGTCTGTGTGGATGATGAGAAACATCATCCATTTCAATACATTAGCTAATCAAGCTGTAGAAAGAGGAGCAGGTCCTGATGGGCAGAAGATTACTTACAATATATTAAAACAACGCTTAGGAGACCTTATTTACAAATTAGTGTCTCAAAAGTTTGAAGATCCTGCAGAAGGAGAGCATGCCTTGGTAGAAA
AGTTCAGTAAATTATATGAAGATTTGACAGTTGGTTTCCGCAATCTTGAAGATGAATATCGATAAGTCTATAACTGTTAGTGGTGCTTGCTGCAGAAGGATGCCTTTTGTTTATTTTGTTATTTCCAAGAGCATACTGTTAAACTGGAGCAGCTCAGTCTTTTGTGCATCTGTAATTTTCGAAGTAGGCTGATTTGAATT
ATTGAAAACAGCCAACAGATGTTCTTGATGTGCTGCAAGTTGTCTATTAGTGATTAATTTTGTAAAGAAAACAATCCATTTAATTTATCTGTTATCTGGAGTTCACTGTTATTGGTTCATCTGTGCACATGTTGCATAGATCAAGAATAAGTTGCTTTCCACAATGCATGTCACCATCTGTTTGTGAAATAGTGAAAGAT
CGACAATTACCATGGCAAGGTTTGGTTCCAAAAACTATTTGTTATTTGAAATATATTACGTCC
>TRINITY_DN126464_c0_g1_i14 from sample A1 / Example unspliced isoform:TCTCCACAGACTTTCATCAAGGAGAACAGGTGAGAAACTTTCTATAAAGGGCCCACGGACCATTCTCTAGTGCCACCTGTAAGATATTGTGCCAACTAGGTTTGATCACAGAGCATTCGATCCCGCCGGACTCCAAAAAGGCTTTCAGTCGGGTTAAACTCCCAAGGGTTTTTCCATCCAATCCAATATTCAGTCTGCTG
GATCTCTTAGACGCTCAGATCCGAAGGATCTTTTCAGAAATTTTGGCTTCTGTATCGAATTCTTCCCTATCGATTCGACGAGATTCTAACGCGAATTAACCAGATCGGATCTGGATTTGCTGTTTTTCGAGCTTTAAATTGAGCTTTTCTGCTCCTGATTTGGGGGATTCTACTGCAATTTGGAGCAGAAAACATGCCGT
CTGTACATGGAGATAAAATGACTACCTTCGAGGACTCTGAGAAGGAGAGCGAGTATGGATACGTCCGAAAGGTGTCAGGACCCGTTGTTGTGGCAGATGGCATGGGAGGGGCAGCTATGTATGAGCTTGTTCGAGTTGGTCATGACAATCTTATTGGTGAAATCATTCGTCTGGAGGGTGATTCTGCCACCATCCAAGTT
TACGAAGAGACTGCAGGATTAATGGTGAATGACCCTGTCTTGCGGACACATAAGCCTTTGTCAGTAGAGCTGGGACCTGGAATACTTGGTAATATTTTTGATGGGATTCAGAGGCCTTTGAAAGCAATTGCTATAAAGTCTGGTGATGTCTATATTCCTCGAGGAGTGGCTGTGCCAGCTCTGGACAAGGACGCAACATG
GGATTTTCAGCCTAAGAAGCTATCTGTTGGAGATGTCTTAACTGGTGGTGATTTATATGCGgtgtgcatttggctcctttaaatcctgaagtctacgatacaattatctatgtgttggtgctcgtctcttatttagtttctcattatggagcttttcgattttcatgtactaccgattattttgcagACGGTCTTTGAGA
ATAGTCTGATGGAGCACCGTATTGCTGTTCCTCCTGGAGCTATGGGCAAGGTTACATATATTGCACCACCTGGTCATTACACCATTCAGGTTTGTCTGGCTTATATCTTTGACCTTTCTGACATGCAACAAGGTCTTGTAATGTATAGAAGGTTGTGATAACAAGGGCTTAATATAATAGTTTGTTTTTATTGCCTGAAT
CAAATCAAATTCAATATGTTGTCAAAAGATAGTGGTCATGAGAATAGGTATGCTTATAGGGTGGATACATGAGATTTGACAATAGTATGATCCCCAAATTGGTTTGACATTGTGGTCAAAAGTTTTGTGATTTATTGTTTTGAAAATGTAAAATGATGACAGTTTGTTATCTATTGTTTTGATTGACTATTTGCTGCTAA
CTTTTAATATTTTCTTATTCGTTCTGTTTCCGAGGAAAATCTTGTGGGATCCCCCTCTTCTCCAAAATATCTGGATGGAGG