sp|Q9M8R7|P2C33_ARATH ----> Probable protein phosphatase 2C 33


Intron 1 GTAGGTGTTC ... TGTTGTTCAG

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A1020.8836712



>TRINITY_DN47593_c0_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoform
GTTGAAGTTAATTAATTAATGATACACGCTTCATCTTATCCGAGTGGCGAACATTGCAGATCATGAATACTTCGTTGTTTTGCAGAGTGGATTGAGGACGACTTTAAGAAATCCATCAATCGCTAGAGTTTCCAATGAACACAATCTGACTGTGCAGATACCCTCCACACTATTTTGTCCTTTATCTTTATTATTAAATT
ACCAATACCTGAAACTGATCCATTTCTTTAGTGCCCAGGGCTTCGAGATTGGTTCAGGAGTAAGCCCATTCGCCCCCTTATAAATTAACAGAAACCCATTTTGAGTAAATGATACCCACTTTGATATAAAGGACACCAATTTGAGTTGTGTGCCCTAAATATACATACCCATCTCAACAGCCTCCATGGCTCCGAAATGG
GTTCAGGATTGAGTCCTTCGCTCTCTGATAAAATTAACATAATCCCATTTTGATTGAAGGATAGCGTTTTTGATATAAAAGCCACCCATCTGAAAACGAGCCATACCCATCACTAATTTCTCATCTATGATGTTTTTGGACCATTAGGTCTTCTCTGAGGTCCAAACATTTATTGTTTTTGTGTAATTTGTGTAGAAATA
TCAAGAGAACAGGCCAGTTTTGCTACCCATCTAGCTCTTGCGGAGGAAGACAGCATGAGGCCCATCTGCACCCCATCATTTAAGGATATGGGCCCTCTGTTAGGATAGGAGGAATCCTGCTGATCTTTTTTCTGTAATATTAACAACGGCATTTTTTAGCACCCAATAGGCTATTTTGAATGCCCAATATCTGAGTCTCC
CCATTACAAGAGTCACTATTTACTTATGTGCCCTTTGATTTTACCTGACATCAAGATTCATTCAGAATCATATGCAAATTTTGTTTGACGATCTTTATCTGGGTGTCTCTGATCTGTCTGTGCCATAGAGGTTTCCTTAGGCCTATAAATTTATCGTATGATTGATTTTTGATCTGGAAAGCCTGAATCCTTGGTAGAAA
TTCCGTGTTCAGGACAAGCAGGGGATTGCAGAAAACCTCCTTTTTCCCAGTGTCTGTAATCTGCTTTGGTCCTGGAGTGCATATTCAGTATCCTCAGGGCCCTTAGAATGGGGTCCTGTATATCTACTGATGGGAGGAGTCTGAGTACTCTTCCTCGGTCTGCTTCCACACCTAGGAACAGCGCGAGGAGGAGGAGGAGG
AACAAAAGGAATATGTCTAACATGCCGAATTCGGCTGCTGAAGCGAAAGCAGATGAGCAGATCAGTAGGATTCCTGGCAGGATGTTTGCCAATGGGGTCAGCAATGTTGCTTGCATGTTTACGCAGCAAGGCCGAAAGGGAACCAATCAGGATGCCATGCTTGTCTGGGAGGATTTCGGTTCTAGAAAGGACACAGTTTT
CTGTGGAGTATTTGATGGGCATGGCCCATTTGGCCATCTAGTTGCCAAGAAGGTGAGGGACTCACTACCATCAAAGCTGAGCAGCCAATGGGAAGCAGAGATTAAGGATGATGACAGCATCAAAGAGGCTAATAGCACTGTGGGAAGCATGAATTCTGAGGAATCATCATCAGTTAACATGGACGATGAATGGAGGGAGT
CAGAAGATATGGAAGAGAGGGAGAAGTGCCCAGAAATATTTTTGACATTGAAAGAGTCGTTTCTGAAAGCCTTCAAAGTAATGGATAAGGAGTTGAGGTTGCATCCTACAATAGATTGCTTTTGTAGTGGAACTACTGCAGTAACTTTGGTGAAACAGGGACAAGACTTGGTAATCGGTAATGTTGGAGACTCAAGAGCA
GTTCTGGGTACAAGAGTTCAAGACAATTCTTTGTCTGCAGTGCAGTTGACTGTGGATTTGAAACCCAATCTCCCAAGGGAAGCTGAGAGGATTCGACAATGCAAAGGCCGAGTTTTTGCATTGCATGATGAACCTGAGGTATCACGTGTTTGGTTGCCTCATAACGATTCCCCGGGGCTGGCTATGGCTAGAGCTTTTGG
TGATTTCTGTCTGAAGGACTTTGGCCTGATTGCTGTGCCTGATGTCTCTTACCATCGTTTAACTGAAAGAGATGAGTTCATTGTACTGGCTACTGATGGGGTCTGGGACGTGTTGTCTAATAAGGAGGTTGTGGACATTGTGGCATCAGTACCCACTCAAACAATTGCAGCCAGAGCTTTGGTGGAATATGCTGTTCGAG
CATGGAGGTTAAAATATCCAACTTCCAAAGTGGATGATTGTGCAGCGGTCTGTCTCTTCCTTAATAATTCTCTGCCCTCTGAGCCAAAATCAAAAACCGCTCTGGCACAGGGCCCTAGTACTCGAGCAGTGCCAAAAGAGATCACTTCAGTGTCAGCTACAGGTTCACGCAAAAGTTCAGAAAAGAAGACAGAGGATTTC
CTCACAGACACTGAAACAAATACTCCCACATTAGAGCGTGCAAACACAGTCAGGAATGTTAATGATCTGAGCGATGTATCTCAAAATTTAAACAGAGTCAAGAGCTCCAAGGAACTGAAGTGCCCAGAGAGAACACAATCCCAGAGAAAACTTGCCGAGTGTATTTCCACTGGTGATGATGAGGAATGGTCTGCACTTGA
TGGTGTTACAAGGGTGAACTCCCTTCTTAATCTTCCCAGGTTTTTAACTGGAGACAGAAAGGTTGGAGTGCTGAGGAAGTGGCTTTGAATCCTCTCAGATATATATCAGGTTTGAGAGCCGCATTGTGCTCAAATTGTCAGTTTCTTATTCGTGTGTCCAACTCGCTTTTGTTGGACCTGTATGGTATCTTATAAAAGAA
TTTCTTGCATCATCTGTAATTCTAGGAAAATCAGTGGAAAAAATAATGACACAACCTTATTATTACTTTAGGTTCTGTGTTGTTTTGGGGTTCTCGCTTTAGTTATAGGTGGACTTGAATACCGCATCTTGTAGTGAGCTTTTTGAAATTTAAAAGACTAGACGATCCAGCAAGCTTCAAGTTAGCTCTTCAACTCATAT
TTTTATTTTCTCCATATATGTATGCTTATTAAAAATGTAGTTGATGGGAAAAGTAACTGCTTTGTTATTTCTACCATTTATATCTTTTGATTTCTGCTTCA


>TRINITY_DN47593_c0_g1_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:
GTTGAAGTTAATTAATTAATGATACACGCTTCATCTTATCCGAGTGGCGAACATTGCAGATCATGAATACTTCGTTGTTTTGCAGAGTGGATTGAGGACGACTTTAAGAAATCCATCAATCGCTAGAGTTTCCAATGAACACAATCTGACTGTGCAGATACCCTCCACACTATTTTGTCCTTTATCTTTATTATTAAATT
ACCAATACCTGAAACTGATCCATTTCTTTAGTGCCCAGGGCTTCGAGATTGGTTCAGGAGTAAGCCCATTCGCCCCCTTATAAATTAACAGAAACCCATTTTGAGTAAATGATACCCACTTTGATATAAAGGACACCAATTTGAGTTGTGTGCCCTAAATATACATACCCATCTCAACAGCCTCCATGGCTCCGAAATGG
GTTCAGGATTGAGTCCTTCGCTCTCTGATAAAATTAACATAATCCCATTTTGATTGAAGGATAGCGTTTTTGATATAAAAGCCACCCATCTGAAAACGAGCCATACCCATCACTAATTTCTCATCTATGATGTTTTTGGACCATTAGGTCTTCTCTGAGGTCCAAACATTTATTGTTTTTGTGTAATTTGTGTAGAAATA
TCAAGAGAACAGGCCAGTTTTGCTACCCATCTAGCTCTTGCGGAGGAAGACAGCATGAGGCCCATCTGCACCCCATCATTTAAGGATATGGGCCCTCTGTTAGGATAGGAGGAATCCTGCTGATCTTTTTTCTGTAATATTAACAACGGCATTTTTTAGCACCCAATAGGCTATTTTGAATGCCCAATATCTGAGTCTCC
CCATTACAAGAGTCACTATTTACTTATGTGCCCTTTGATTTTACCTGACATCAAGATTCATTCAGAATCATATGCAAATTTTGTTTGACGATCTTTATCTGGGTGTCTCTGATCTGTCTGTGCCATAGAGGTTTCCTTAGGCCTATAAATTTATCGTATGATTGATTTTTGATCTGGAAAGCCTGAATCCTTGGTAGAAA
TTCCGTGTTCAGGACAAGCAGGGGATTGCAGAAAACCTCCTTTTTCCCAGTGTCTGTAATCTGCTTTGGTCCTGGAGTGCATATTCAGTATCCTCAGGGCCCTTAGAATGGGGTCCTGTATATCTACTGATGGGAGGAGTCTGAGTACTCTTCCTCGGTCTGCTTCCACACCTAGGAACAGCGCGAGGAGGAGGAGGAGG
AACAAAAGGAATATGTCTAACATGCCGAATTCGGCTGCTGAAGCGAAAGCAGATGAGCAGATCAGTAGGATTCCTGGCAGGATGTTTGCCAATGGGGTCAGCAATGTTGCTTGCATGTTTACGCAGCAAGGCCGAAAGGGAACCAATCAGGATGCCATGCTTGTCTGGGAGGATTTCGGTTCTAGAAAGGACACAGTTTT
CTGTGGAGTATTTGATGGGCATGGCCCATTTGGCCATCTAGTTGCCAAGAAGGTGAGGGACTCACTACCATCAAAGCTGAGCAGCCAATGGGAAGCAGAGATTAAGGATGATGACAGCATCAAAGAGGCTAATAGCACTGTGGGAAGCATGAATTCTGAGGAATCATCATCAGTTAACATGGACGATGAATGGAGGGAGT
CAGAAGATATGGAAGAGAGGGAGAAGTGCCCAGAAATATTTTTGACATTGAAAGAGTCGTTTCTGAAAGCCTTCAAAGTAATGGATAAGGAGTTGAGGTTGCATCCTACAATAGATTGCTTTTGTAGTGGAACTACTGCAGTAACTTTGGTGAAACAGGGACAAGACTTGGTAATCGGTAATGTTGGAGACTCAAGAGCA
GTTCTGGGTACAAGAGTTCAAGACAATTCTTTGTCTGCAGTGCAGTTGACTGTGGATTTGAAACCCAATCTCCCAAgtaggtgttcttgttttctcccaagcatagtcatatgtttaaaattctattctagtctagttatacctattttgtgatgataaatctaagatatgcattttctctttccatcgaggttaaaagg
acagattaaagaagacagacaaccttgttaaaagttaaaacaaacaaagggattttaatttgaagctggtctatgtttttatcgtttgaaacactcaaaactgtcattggacaaagatgaaagagtaacactcatgacagtattcttccctgaatgtaaaagcatgacattttatttcccttggacatcggacaatgcat
tttgatgatatttcaagaaaatggaaattttggaaaaggattgcatctactgtttctgattcaatgttatttgtttttgtcttttacttggctttcattgtagaaaggtatgttttcagaaacttccacattactttgtattctgtagtcattaaaaacttgtctgaactaagaaaaatttgcaagatttttgagaattt
gtaaaagaacatgatactacactatgataaaacttcatggcagtgtactgcatggaattcttacttgacctgttgtctataataattacacaagagtttataattctttacagaatttttgggattttaagttgtgattcctatgttgtcagtgcctttagctaaccttggaagcatttgggaatcaggatccctgtaaa
agaaggcataattcttttctaatggagtttcatccgccttgtttattgctaccacgtaatacttgaccttctttggaataatcattaattcagaactagtgaataggaaaagtcttatttggattgatatggattgaccacctgtacattaaagccctattctggtcttcaatgttgttcag
GGGAAGCTGAGAGGATTC
GACAATGCAAAGGCCGAGTTTTTGCATTGCATGATGAACCTGAGGTATCACGTGTTTGGTTGCCTCATAACGATTCCCCGGGGCTGGCTATGGCTAGAGCTTTTGGTGATTTCTGTCTGAAGGACTTTGGCCTGATTGCTGTGCCTGATGTCTCTTACCATCGTTTAACTGAAAGAGATGAGTTCATTGTACTGGCTACT
GATGGGGTCTGGGACGTGTTGTCTAATAAGGAGGTTGTGGACATTGTGGCATCAGTACCCACTCAAACAATTGCAGCCAGAGCTTTGGTGGAATATGCTGTTCGAGCATGGAGGTTAAAATATCCAACTTCCAAAGTGGATGATTGTGCAGCGGTCTGTCTCTTCCTTAATAATTCTCTGCCCTCTGAGCCAAAATCAAA
AACCGCTCTGGCACAGGGCCCTAGTACTCGAGCAGTGCCAAAAGAGATCACTTCAGTGTCAGCTACAGGTTCACGCAAAAGTTCAGAAAAGAAGACAGAGGATTTCCTCACAGACACTGAAACAAATACTCCCACATTAGAGCGTGCAAACACAGTCAGGAATGTTAATGATCTGAGCGATGTATCTCAAAATTTAAACA
GAGTCAAGAGCTCCAAGGAACTGAAGTGCCCAGAGAGAACACAATCCCAGAGAAAACTTGCCGAGTGTATTTCCACTGGTGATGATGAGGAATGGTCTGCACTTGATGGTGTTACAAGGGTGAACTCCCTTCTTAATCTTCCCAGGTTTTTAACTGGAGACAGAAAGGTTGGAGTGCTGAGGAAGTGGCTTTGAATCCTC
TCAGATATATATCAGGTTTGAGAGCCGCATTGTGCTCAAATTGTCAGTTTCTTATTCGTGTGTCCAACTCGCTTTTGTTGGACCTGTATGGTATCTTATAAAAGAATTTCTTGCATCATCTGTAATTCTAGGAAAATCAGTGGAAAAAATAATGACACAACCTTATTATTACTTTAGGTTCTGTGTTGTTTTGGGGTTCT
CGCTTTAGTTATAGGTGGACTTGAATACCGCATCTTGTAGTGAGCTTTTTGAAATTTAAAAGACTAGACGATCCAGCAAGCTTCAAGTTAGCTCTTCAACTCATATTTTTATTTTCTCCATATATGTATGCTTATTAAAAATGTAGTTGATGGGAAAAGTAACTGCTTTGTTATTTCTACCATTTATATCTTTTGATTTC
TGCTTCA




Intron 2 GTAATACTTG ... TGTTGTTCAG

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A10604012



>TRINITY_DN47593_c0_g1_i5 from sample A7 / Example spliced isoform
GTTGAAGTTAATTAATTAATGATACACGCTTCATCTTATCCGAGTGGCGAACATTGCAGATCATGAATACTTCGTTGTTTTGCAGAGTGGATTGAGGACGACTTTAAGAAATCCATCAATCGCTAGAGTTTCCAATGAACACAATCTGACTGTGCAGATACCCTCCACACTATTTTGTCCTTTATCTTTATTATTAAATT
ACCAATACCTGAAACTGATCCATTTCTTTAGTGCCCAGGGCTTCGAGATTGGTTCAGGAGTAAGCCCATTCGCCCCCTTATAAATTAACAGAAACCCATTTTGAGTAAATGATACCCACTTTGATATAAAGGACACCAATTTGAGTTGTGTGCCCTAAATATACATACCCATCTCAACAGCCTCCATGGCTCCGAAATGG
GTTCAGGATTGAGTCCTTCGCTCTCTGATAAAATTAACATAATCCCATTTTGATTGAAGGATAGCGTTTTTGATATAAAAGCCACCCATCTGAAAACGAGCCATACCCATCACTAATTTCTCATCTATGATGTTTTTGGACCATTAGGTCTTCTCTGAGGTCCAAACATTTATTGTTTTTGTGTAATTTGTGTAGAAATA
TCAAGAGAACAGGCCAGTTTTGCTACCCATCTAGCTCTTGCGGAGGAAGACAGCATGAGGCCCATCTGCACCCCATCATTTAAGGATATGGGCCCTCTGTTAGGATAGGAGGAATCCTGCTGATCTTTTTTCTGTAATATTAACAACGGCATTTTTTAGCACCCAATAGGCTATTTTGAATGCCCAATATCTGAGTCTCC
CCATTACAAGAGTCACTATTTACTTATGTGCCCTTTGATTTTACCTGACATCAAGATTCATTCAGAATCATATGCAAATTTTGTTTGACGATCTTTATCTGGGTGTCTCTGATCTGTCTGTGCCATAGAGGTTTCCTTAGGCCTATAAATTTATCGTATGATTGATTTTTGATCTGGAAAGCCTGAATCCTTGGTAGAAA
TTCCGTGTTCAGGACAAGCAGGGGATTGCAGAAAACCTCCTTTTTCCCAGTGTCTGTAATCTGCTTTGGTCCTGGAGTGCATATTCAGTATCCTCAGGGCCCTTAGAATGGGGTCCTGTATATCTACTGATGGGAGGAGTCTGAGTACTCTTCCTCGGTCTGCTTCCACACCTAGGAACAGCGCGAGGAGGAGGAGGAGG
AACAAAAGGAATATGTCTAACATGCCGAATTCGGCTGCTGAAGCGAAAGCAGATGAGCAGATCAGTAGGATTCCTGGCAGGATGTTTGCCAATGGGGTCAGCAATGTTGCTTGCATGTTTACGCAGCAAGGCCGAAAGGGAACCAATCAGGATGCCATGCTTGTCTGGGAGGATTTCGGTTCTAGAAAGGACACAGTTTT
CTGTGGAGTATTTGATGGGCATGGCCCATTTGGCCATCTAGTTGCCAAGAAGGTGAGGGACTCACTACCATCAAAGCTGAGCAGCCAATGGGAAGCAGAGATTAAGGATGATGACAGCATCAAAGAGGCTAATAGCACTGTGGGAAGCATGAATTCTGAGGAATCATCATCAGTTAACATGGACGATGAATGGAGGGAGT
CAGAAGATATGGAAGAGAGGGAGAAGTGCCCAGAAATATTTTTGACATTGAAAGAGTCGTTTCTGAAAGCCTTCAAAGTAATGGATAAGGAGTTGAGGTTGCATCCTACAATAGATTGCTTTTGTAGTGGAACTACTGCAGTAACTTTGGTGAAACAGGGACAAGACTTGGTAATCGGTAATGTTGGAGACTCAAGAGCA
GTTCTGGGTACAAGAGTTCAAGACAATTCTTTGTCTGCAGTGCAGTTGACTGTGGATTTGAAACCCAATCTCCCAAGTAGGTGTTCTTGTTTTCTCCCAAGCATAGTCATATGTTTAAAATTCTATTCTAGTCTAGTTATACCTATTTTGTGATGATAAATCTAAGATATGCATTTTCTCTTTCCATCGAGGTTAAAAGG
ACAGATTAAAGAAGACAGACAACCTTGTTAAAAGTTAAAACAAACAAAGGGATTTTAATTTGAAGCTGGTCTATGTTTTTATCGTTTGAAACACTCAAAACTGTCATTGGACAAAGATGAAAGAGTAACACTCATGACAGTATTCTTCCCTGAATGTAAAAGCATGACATTTTATTTCCCTTGGACATCGGACAATGCAT
TTTGATGATATTTCAAGAAAATGGAAATTTTGGAAAAGGATTGCATCTACTGTTTCTGATTCAATGTTATTTGTTTTTGTCTTTTACTTGGCTTTCATTGTAGAAAGGTATGTTTTCAGAAACTTCCACATTACTTTGTATTCTGTAGTCATTAAAAACTTGTCTGAACTAAGAAAAATTTGCAAGATTTTTGAGAATTT
GTAAAAGAACATGATACTACACTATGATAAAACTTCATGGCAGTGTACTGCATGGAATTCTTACTTGACCTGTTGTCTATAATAATTACACAAGAGTTTATAATTCTTTACAGAATTTTTGGGATTTTAAGTTGTGATTCCTATGTTGTCAGTGCCTTTAGCTAACCTTGGAAGCATTTGGGAATCAGGATCCCTGTAAA
AGAAGGCATAATTCTTTTCTAATGGAGTTTCATCCGCCTTGTTTATTGCTACCACGGGAAGCTGAGAGGATTCGACAATGCAAAGGCCGAGTTTTTGCATTGCATGATGAACCTGAGGTATCACGTGTTTGGTTGCCTCATAACGATTCCCCGGGGCTGGCTATGGCTAGAGCTTTTGGTGATTTCTGTCTGAAGGACTT
TGGCCTGATTGCTGTGCCTGATGTCTCTTACCATCGTTTAACTGAAAGAGATGAGTTCATTGTACTGGCTACTGATGGGGTCTGGGACGTGTTGTCTAATAAGGAGGTTGTGGACATTGTGGCATCAGTACCCACTCAAACAATTGCAGCCAGAGCTTTGGTGGAATATGCTGTTCGAGCATGGAGGTTAAAATATCCAA
CTTCCAAAGTGGATGATTGTGCAGCGGTCTGTCTCTTCCTTAATAATTCTCTGCCCTCTGAGCCAAAATCAAAAACCGCTCTGGCACAGGGCCCTAGTACTCGAGCAGTGCCAAAAGAGATCACTTCAGTGTCAGCTACAGGTTCACGCAAAAGTTCAGAAAAGAAGACAGAGGATTTCCTCACAGACACTGAAACAAAT
ACTCCCACATTAGAGCGTGCAAACACAGTCAGGAATGTTAATGATCTGAGCGATGTATCTCAAAATTTAAACAGAGTCAAGAGCTCCAAGGAACTGAAGTGCCCAGAGAGAACACAATCCCAGAGAAAACTTGCCGAGTGTATTTCCACTGGTGATGATGAGGAATGGTCTGCACTTGATGGTGTTACAAGGGTGAACTC
CCTTCTTAATCTTCCCAGGTTTTTAACTGGAGACAGAAAGGTTGGAGTGCTGAGGAAGTGGCTTTGAATCCTCTCAGATATATATCAGGTTTGAGAGCCGCATTGTGCTCAAATTGTCAGTTTCTTATTCGTGTGTCCAACTCGCTTTTGTTGGACCTGTATGGTATCTTATAAAAGAATTTCTTGCATCATCTGTAATT
CTAGGAAAATCAGTGGAAAAAATAATGACACAACCTTATTATTACTTTAGGTTCTGTGTTGTTTTGGGGTTCTCGCTTTAGTTATAGGTGGACTTGAATACCGCATCTTGTAGTGAGCTTTTTGAAATTTAAAAGACTAGACGATCCAGCAAGCTTCAAGTTAGCTCTTCAACTCATATTTTTATTTTCTCCATATATGT
ATGCTTATTAAAAATGTAGTTGATGGGAAAAGTAACTGCTTTGTTATTTCTACCATTTATATCTTTTGATTTCTGCTTCA


>TRINITY_DN47593_c0_g1_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:
GTTGAAGTTAATTAATTAATGATACACGCTTCATCTTATCCGAGTGGCGAACATTGCAGATCATGAATACTTCGTTGTTTTGCAGAGTGGATTGAGGACGACTTTAAGAAATCCATCAATCGCTAGAGTTTCCAATGAACACAATCTGACTGTGCAGATACCCTCCACACTATTTTGTCCTTTATCTTTATTATTAAATT
ACCAATACCTGAAACTGATCCATTTCTTTAGTGCCCAGGGCTTCGAGATTGGTTCAGGAGTAAGCCCATTCGCCCCCTTATAAATTAACAGAAACCCATTTTGAGTAAATGATACCCACTTTGATATAAAGGACACCAATTTGAGTTGTGTGCCCTAAATATACATACCCATCTCAACAGCCTCCATGGCTCCGAAATGG
GTTCAGGATTGAGTCCTTCGCTCTCTGATAAAATTAACATAATCCCATTTTGATTGAAGGATAGCGTTTTTGATATAAAAGCCACCCATCTGAAAACGAGCCATACCCATCACTAATTTCTCATCTATGATGTTTTTGGACCATTAGGTCTTCTCTGAGGTCCAAACATTTATTGTTTTTGTGTAATTTGTGTAGAAATA
TCAAGAGAACAGGCCAGTTTTGCTACCCATCTAGCTCTTGCGGAGGAAGACAGCATGAGGCCCATCTGCACCCCATCATTTAAGGATATGGGCCCTCTGTTAGGATAGGAGGAATCCTGCTGATCTTTTTTCTGTAATATTAACAACGGCATTTTTTAGCACCCAATAGGCTATTTTGAATGCCCAATATCTGAGTCTCC
CCATTACAAGAGTCACTATTTACTTATGTGCCCTTTGATTTTACCTGACATCAAGATTCATTCAGAATCATATGCAAATTTTGTTTGACGATCTTTATCTGGGTGTCTCTGATCTGTCTGTGCCATAGAGGTTTCCTTAGGCCTATAAATTTATCGTATGATTGATTTTTGATCTGGAAAGCCTGAATCCTTGGTAGAAA
TTCCGTGTTCAGGACAAGCAGGGGATTGCAGAAAACCTCCTTTTTCCCAGTGTCTGTAATCTGCTTTGGTCCTGGAGTGCATATTCAGTATCCTCAGGGCCCTTAGAATGGGGTCCTGTATATCTACTGATGGGAGGAGTCTGAGTACTCTTCCTCGGTCTGCTTCCACACCTAGGAACAGCGCGAGGAGGAGGAGGAGG
AACAAAAGGAATATGTCTAACATGCCGAATTCGGCTGCTGAAGCGAAAGCAGATGAGCAGATCAGTAGGATTCCTGGCAGGATGTTTGCCAATGGGGTCAGCAATGTTGCTTGCATGTTTACGCAGCAAGGCCGAAAGGGAACCAATCAGGATGCCATGCTTGTCTGGGAGGATTTCGGTTCTAGAAAGGACACAGTTTT
CTGTGGAGTATTTGATGGGCATGGCCCATTTGGCCATCTAGTTGCCAAGAAGGTGAGGGACTCACTACCATCAAAGCTGAGCAGCCAATGGGAAGCAGAGATTAAGGATGATGACAGCATCAAAGAGGCTAATAGCACTGTGGGAAGCATGAATTCTGAGGAATCATCATCAGTTAACATGGACGATGAATGGAGGGAGT
CAGAAGATATGGAAGAGAGGGAGAAGTGCCCAGAAATATTTTTGACATTGAAAGAGTCGTTTCTGAAAGCCTTCAAAGTAATGGATAAGGAGTTGAGGTTGCATCCTACAATAGATTGCTTTTGTAGTGGAACTACTGCAGTAACTTTGGTGAAACAGGGACAAGACTTGGTAATCGGTAATGTTGGAGACTCAAGAGCA
GTTCTGGGTACAAGAGTTCAAGACAATTCTTTGTCTGCAGTGCAGTTGACTGTGGATTTGAAACCCAATCTCCCAAGTAGGTGTTCTTGTTTTCTCCCAAGCATAGTCATATGTTTAAAATTCTATTCTAGTCTAGTTATACCTATTTTGTGATGATAAATCTAAGATATGCATTTTCTCTTTCCATCGAGGTTAAAAGG
ACAGATTAAAGAAGACAGACAACCTTGTTAAAAGTTAAAACAAACAAAGGGATTTTAATTTGAAGCTGGTCTATGTTTTTATCGTTTGAAACACTCAAAACTGTCATTGGACAAAGATGAAAGAGTAACACTCATGACAGTATTCTTCCCTGAATGTAAAAGCATGACATTTTATTTCCCTTGGACATCGGACAATGCAT
TTTGATGATATTTCAAGAAAATGGAAATTTTGGAAAAGGATTGCATCTACTGTTTCTGATTCAATGTTATTTGTTTTTGTCTTTTACTTGGCTTTCATTGTAGAAAGGTATGTTTTCAGAAACTTCCACATTACTTTGTATTCTGTAGTCATTAAAAACTTGTCTGAACTAAGAAAAATTTGCAAGATTTTTGAGAATTT
GTAAAAGAACATGATACTACACTATGATAAAACTTCATGGCAGTGTACTGCATGGAATTCTTACTTGACCTGTTGTCTATAATAATTACACAAGAGTTTATAATTCTTTACAGAATTTTTGGGATTTTAAGTTGTGATTCCTATGTTGTCAGTGCCTTTAGCTAACCTTGGAAGCATTTGGGAATCAGGATCCCTGTAAA
AGAAGGCATAATTCTTTTCTAATGGAGTTTCATCCGCCTTGTTTATTGCTACCACgtaatacttgaccttctttggaataatcattaattcagaactagtgaataggaaaagtcttatttggattgatatggattgaccacctgtacattaaagccctattctggtcttcaatgttgttcagGGGAAGCTGAGAGGATTC
GACAATGCAAAGGCCGAGTTTTTGCATTGCATGATGAACCTGAGGTATCACGTGTTTGGTTGCCTCATAACGATTCCCCGGGGCTGGCTATGGCTAGAGCTTTTGGTGATTTCTGTCTGAAGGACTTTGGCCTGATTGCTGTGCCTGATGTCTCTTACCATCGTTTAACTGAAAGAGATGAGTTCATTGTACTGGCTACT
GATGGGGTCTGGGACGTGTTGTCTAATAAGGAGGTTGTGGACATTGTGGCATCAGTACCCACTCAAACAATTGCAGCCAGAGCTTTGGTGGAATATGCTGTTCGAGCATGGAGGTTAAAATATCCAACTTCCAAAGTGGATGATTGTGCAGCGGTCTGTCTCTTCCTTAATAATTCTCTGCCCTCTGAGCCAAAATCAAA
AACCGCTCTGGCACAGGGCCCTAGTACTCGAGCAGTGCCAAAAGAGATCACTTCAGTGTCAGCTACAGGTTCACGCAAAAGTTCAGAAAAGAAGACAGAGGATTTCCTCACAGACACTGAAACAAATACTCCCACATTAGAGCGTGCAAACACAGTCAGGAATGTTAATGATCTGAGCGATGTATCTCAAAATTTAAACA
GAGTCAAGAGCTCCAAGGAACTGAAGTGCCCAGAGAGAACACAATCCCAGAGAAAACTTGCCGAGTGTATTTCCACTGGTGATGATGAGGAATGGTCTGCACTTGATGGTGTTACAAGGGTGAACTCCCTTCTTAATCTTCCCAGGTTTTTAACTGGAGACAGAAAGGTTGGAGTGCTGAGGAAGTGGCTTTGAATCCTC
TCAGATATATATCAGGTTTGAGAGCCGCATTGTGCTCAAATTGTCAGTTTCTTATTCGTGTGTCCAACTCGCTTTTGTTGGACCTGTATGGTATCTTATAAAAGAATTTCTTGCATCATCTGTAATTCTAGGAAAATCAGTGGAAAAAATAATGACACAACCTTATTATTACTTTAGGTTCTGTGTTGTTTTGGGGTTCT
CGCTTTAGTTATAGGTGGACTTGAATACCGCATCTTGTAGTGAGCTTTTTGAAATTTAAAAGACTAGACGATCCAGCAAGCTTCAAGTTAGCTCTTCAACTCATATTTTTATTTTCTCCATATATGTATGCTTATTAAAAATGTAGTTGATGGGAAAAGTAACTGCTTTGTTATTTCTACCATTTATATCTTTTGATTTC
TGCTTCA




Intron 3 GTAAAGCTTA ... TATCGACCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A142.2213109
A230715
A33.031610
A426.091775
A50300
A620.831964
A724.6426710
A834.4320165
A923.41883
A1031.0320108



>TRINITY_DN100722_c0_g1_i4 from sample A4 / Example spliced isoform
GTATGAGGGACATAGTAATAATTCTGAAGGCAAGCTGGCATGTTTTGATGTAATTTTTTACATCCATGAACATATTTTCCTAATGTCTTCTGGCAGGATTTCGGTTCTAGAAAGGACACAGTTTTCTGTGGAGTATTTGATGGGCATGGCCCCTTTGGCCATCTAGTTGCCAAGAAGGTGAGGGACTCACTACCATCAAA
GCTGAGCAGCCAATGGGAAGCAGAGATTAAGGATGATGACAGCATCAAAGAGGCTAATAGCACTGTGGGAAGCATGAATTCTGAGGAATCATCATCAGTTAACATGGACGATGAATGGAGGGAGTCAGAAGATATGGAAGAGAGGGAGAAGTGCCCAGAAATATTTTTGACATTGAAAGAGTCGTTTCTGAAAGCCTTCA
AAGTAATGGATAAGGAGTTGAGGTTGCATCCTACAATAGATTGCTTTTGTAGTGGAACTACTGCAGTAACTTTGGTGAAACAGGGACAAGACTTGGTAATCGGTAATGTTGGAGACTCAAGAGCAGTTCTGGGTACAAGAGTTCAAGACAATTCTTTGTCTGCAGTGCAGTTGACTGTGGATTTGAAACCCAATCTCCCA
AGGGAAGCTGAGAGGATTCGACAATGCAAAGGCCGAGTTTTTGCATTGCATGATGAACCTGAGGTATCACGTGTTTGGTTGCCTCATAACGATTCCCCGGGGCTGGCTATGGCTAGAGCTTTTGGTGATTTCTGTCTGAAGGACTTTGGCCTGATTGCTGTGCCTGATGTCTCTTACCATCGTTTAACTGAAAGAGATGA
GTTCATTGTACTGGCTACTGATGGGGTATGCTAAGATTCTGATTGCAAGTTTAGTGTTAATACTGACCCTGTCTGCACAATATAATTGTCCTTAGAAATCGGTCTTTGATCTTTATGAATTTTCCACAGGTCTGGGACGTGTTGTCTAATAAGGAGG


>TRINITY_DN100722_c0_g1_i7 from sample A4 / Example unspliced isoform:
TAAAGGACACCAATTTGAGTTGTGTGCCCTAAATATACATACCCATCTCAACAGCCTCCATGGCTCCGAAATGGGTTCAGGATTGAGTCCTTCGCTCTCTGATAAAATTAACATAATCCCATTTTGATTGAAGGATAGCGTTTTTGATATAAAAGCCACCCATCTGAAAACGAGCCATACCCATCACTAATTTCTCATCT
ATGATGTTTTTGGACCATTAGGTCTTCTCTGAGGTCCAAACATTTATTGTTTTTGTGTAATTTGTGTAGAAATATCAAGAGAACAGGCCAGTTTTGCTACCCATCTAGCTCTTGCGGAGGAAGACAGCATGAGGCCCATCTGCACCCCATCATTTAAGGATATGGGCCCTCTGTTAGGGTAGGAGGAATCCTGCTGATCT
TTTTTCTGTAATATTAACAACGGCATTTTTTAGCACCCAATAGGCTATTTTGAATGCCCAATATCTGAGTCTCCCCATTACAAGAGTCACTATTTACTTATGTGCCCTTTGATTTTACCTGACATCAAGATTCATTCAGAATCATATGCAAATTTTGTTTGACGATCTTTATCTGGGTGTCTCTGATCTGTCTGTGCCAT
AGAGGTTTCCTTAGGCCTATAAATTTATCGTATGATTGATTTTTGATCTGGAAAGCCTGAATCCTTGGTAGAAATTCCGTGTTCAGGACAAGCAGGGGATTGCAGAAAACCTCCTTTTTCCCAGTGTCTGTAATCTGCTTTGGTCCTGGAGTGCATATTCAGTATCCTCAGGGCCCTTAGAATGGGGTCCTGTATATCTA
CTGATGGGAGGAGTCTGAGTACTCTTCCTCGGTCTGCTTCCACACCGAGGAACAGCGCGAGGAGGAGGAGGAGGAACAAAAGGAATATGTCTAACATGCCGACTTCGGCTGCTGAAGCGAAAGCAGATGAGCAGATCAGTAGGATTCCTGGCAGGATGTTTGCCAATGGGGTCAGCAATGTTGCTTGCATGTTTACGCAG
CAAGGCCGAAAGGGAACCAATCAGGATGCCATGCTTGTCTGGGAGGATTTCGGTTCTAGAAAGGACACAGTTTTCTGTGGAGTATTTGATGGGCATGGCCCCTTTGGCCATCTAGTTGCCAAGAAGGTGAGGGACTCACTACCATCAAAGCTGAGCAGCCAATGGGAAGCAGAGATTAAGGATGATGACAGCATCAAAGA
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GTGGAACTACTGCAGTAACTTTGGTGAAACAGgtaaagcttaagaatatctgttctaattaacacagtatatagagacaacagatctagcaattctgtttttattttttaataaatacagtctggtcaccacttcctatctccaattattgacattaatcaaaacaaagaagtatatttgtgggctaagtattttttgtt
gtctctcccattatcgaccag
GGACAAGACTTGGTAATCGGTAATGTTGGAGACTCAAGAGCAGTTCTGGGTACAAGAGTTCAAGACAATTCTTTGTCTGCAGTGCAGTTGACTGTGGATTTGAAACCCAATCTCCCAAGTAGGTGTTCTTGTTTTCTCCCAAGCATAGTCATATGTTTAAAATTCTATTCTAGTCTAGT
TATACCTATTTTGTGATGATAAATCTAAGATATGCATTTTCTCTTTCCATCGAGGTTAAAAGGACAGATTAAAGAAGACAGACAACCTTGTTAAAAGTTAAAACAAACAAAGGGATTTTAATTTGAAGGTGGTCTATGTTTTTATCGTTTGAAACACTCAAAACTGTCATTGGACAAAGATGAAAGAGTAACACTCATGA
CAGTATTCTTCCCTGAATGTAAAAGCATGACATTTTATTTCCCTTGGACATCGGAC




Intron 4 GTAAAGCTTA ... TATCGACCAG

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>TRINITY_DN120081_c1_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoform
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ATATAAAAGCCACCCATCTGAAAACGAGCCATACCCATCACTAATTTCTCATCTATGATGTTTTTGGACCATTAGGTCTTCTCTGAGGTCCAAACATTTATTGTTTTTGTGTAATTTGTGTAGAAATATCAAGAGAACAGGTCAGTTTTGCTACCCATCTAGCTCTTGCGGAGGAAGACAGCATGAGGCCCATCTGCACC
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GGAGTGCATATTCAGTATCCTCAGGGCCCTTAGAATGGGGTCCTGTATATCTACTGATGGGAGGAGTCTGAGTACTCTTCCTCGGTCTGCTTCCACACCGAGGAACAGCGCGAGGAGGAGGAGGAGGAACAAAAGGAATATGTCTAACATGCCGACTTCGGCTGCTGAAGCGAAAGCAGATGAGCAGATCAGTAGGATTC
CTGGCAGGATGTTTGCCAATGGGGTCAGCAATATTGCTTGCATGTTTACGCAGCAAGGCCGAAAGGGAACCAATCAGGATGCCATGCTTGTCTGGGAGGATTTCGGTTCTAGAAAGGACACAGTTTTCTGTGGAGTATTTGATGGGCATGGCCCCTTTGGCCATCTAGTTGCCAAGAAGGTGAGGGACTCACTACCATCA
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GAGTTCATTGTACTGGCTACTGATGGGGTCTGGGATGTGTTGTCTAATAAGGAGGTTGTGGACATTGTGGCATCAGTACCCACTCAAACAATTGCAGCCAGAGCTTTGGTGGAATATGCTGTTCGAGCATGGAGGTTAAAATATCCAACTTCCAAAGTGGATGATTGTGCAGCGGTCTGTCTCTTCCTTAATAATTCTCT
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>TRINITY_DN120081_c1_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CCCCCTTATAAATTAACAGAAACCCATTTTGAGTAAATGATACCCACTTTGAGATAAAGGACACCAATTTGAGTTGTGTGCCCTAAATATACATACCCATCTCAACAGCCTCCATGGCTCCGAAATGGGTTCAGGATTGAGTCCTTCGCTCTCTGATAAAATTAACATAATCCCATTTTGATTGAAGGATAGCGTTTTTG
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GGAGTGCATATTCAGTATCCTCAGGGCCCTTAGAATGGGGTCCTGTATATCTACTGATGGGAGGAGTCTGAGTACTCTTCCTCGGTCTGCTTCCACACCGAGGAACAGCGCGAGGAGGAGGAGGAGGAACAAAAGGAATATGTCTAACATGCCGACTTCGGCTGCTGAAGCGAAAGCAGATGAGCAGATCAGTAGGATTC
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AAGCTGAGCAGCCAATGGGAAGCAGAGATTAAGGATGATGACAGCATCAAAGAGGCTAATAGCACTGTGGGAAGCATGAATTCTGAGGAATCATCATCAGTTAACATGGACGATGAATGGAGGGAGTCAGAAGATATGGAAGAGAGGGAGAAGTGCCCAGAAATATTTTTGACATTGAAAGAGTCGTTTCTGAAAGCCTT
CAAAGTAATGGATAAGGAGTTGAGGTTGCATCCTACAATAGATTGCTTTTGTAGTGGAACTACTGCAGTAACTTTGGTGAAACAGgtaaagcttaagaatatctgttctaattaacacagtacatagagacaacagatctagcaattttgtttttattttttaataaatacagtcggtcaccacttcctatctccaatta
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CTGGCTACTGATGGGGTCTGGGATGTGTTGTCTAATAAGGAGGTTGTGGACATTGTGGCATCAGTACCCACTCAAACAATTGCAGCCAGAGCTTTGGTGGAATATGCTGTTCGAGCATGGAGGTTAAAATATCCAACTTCCAAAGTGGATGATTGTGCAGCGGTCTGTCTCTTCCTTAATAATTCTCTGCCCTCTGAGCC
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ATTTAAACAGAGTCAAGAGCTCCAAGGAACTGAAGTGCCCAGAGAGAACACAATCCCAGAGAAAACTTGCCGAGTGTATTTCCACTGGTGATGATGAGGAATGGTCTGCACTTGATGGTGTTACAAGGGTGAACTCCCTTCTTAATCTTCCCAGGTTTTTAACTGGAGACAGAAAGGTTGGAGTGCTGAGGAAGTGGCTT
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TGGGGTTCTCGCTTTAGTTATAGGTGGTCTTGAATACCGCATCTTGTAGCGAGCTTTTTGAAATTTAAAAGACTAGACGATCCAGCAAGCTTCAAGTTAGCTCTTCAACTCATATTTTTATTTTCTCCATATATGTAT