NA ----> NA
Intron 1 GTATTTGATT ... ATTCGTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 66.67 | 15 | 30 | 6 |
| A2 | 66.67 | 7 | 14 | 3 |
| A3 | 71.43 | 4 | 10 | 2 |
| A4 | 54.84 | 14 | 17 | 1 |
| A5 | 82.35 | 3 | 14 | 0 |
| A6 | 71.73 | 54 | 137 | 4 |
| A7 | 71.35 | 51 | 127 | 6 |
| A8 | 74.85 | 43.5 | 129.5 | 9 |
| A9 | 72.55 | 52 | 137.5 | 11 |
| A10 | 80.27 | 29 | 118 | 6 |
>TRINITY_DN42399_c0_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoformGGCCAACTGAATACGTGTTAGAGAGGAAGGTGGGAGCCATGGATCTTCGATATGTAACTTCAAAAGTGTGGAGACAGTGAAAGTGCATTTGAATTTCGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGGTTCATT
CCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGTTATCCTCATGCAGCATCAACTAAACACAATCAAGTTGTGACAGGGAACTTTATGGCAGTTTGCTCCCACAACGAGGCTCATCATGGCAACTGCTATCTGAAGGCAAGACTATGCCTTATGGGGAGTTCTGTGGTTGAGTGTTTCCTTATAT
TGTTTGCAGGGATGTAGCTCCAGTTTGTTTCACAAATTTTTAAAGAACATCTGGTCACGGGATCTGAATTGTCAAAAAGATACCTAGGCTATCAAGTAAAGAATATTGCTTTGGAATTAGCTTTTAGCACACCTTGACTGTCATTCATATCTTTTGCACAAGTGTTTCATATAATAAATGATAACATATTACAATGTTAA
TAAAATTCATCCTCTTCAAG
>TRINITY_DN42399_c0_g1_i8 from sample A7 / Example unspliced isoform:GGCCAACTGAATACGTGTTAGAGAGGAAGGTGGGAGCCATGGATCTTCGATATGTAACTTCAAAAGTGTGGAGACAGTGAAAGTGCATTTGAATTTCGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGGTTCATT
CCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGgtatttgattaactgtggtcattttgtgttgaaaattggacggggtaggaatcaaatcaggacctgcccatgccctcccactgagctacatgcttctttcttgacagtgtaaactcaatgattgggcacctgtagtttacctactagggctg
gtcagaaacctcaaaagtcttgaagatgtttgggtgtatgtgtggccgacagaatcatggtcatgggcagctacctctgtatattaacaccgaatcgaggagatcaaacgatcaccagtatgcattttatgcaaatcttgtaggctatttgctccaacttaagatatgcccacttgtttttctagtgtatattttgtgct
acacattgtggaacccaacttctgagtgaaatcttatgttgtaaatctagatttatgatatacctgcatacaactgaaaacataaaggagagggttaattgctcatcctatcacattagtgcggaacaaacaacttgcctcggagcaattaataagagaaattccaatgtcagccttcctgatttattgaattcaaacat
gtttcggaccataattttcttctttaatatattttagatattgtctgcaaatgatgggccagaaagtttgaggtcatgaagtagcaactgcttttgaaattttaattgatcgtggtggcttagggccgcttcctactgctcatcgaattaagaatttatcccatttttttctgcttttaatttttaaattgagttgaatc
aaacctgatacaaaatgggtgctcttttatcattttcaaaagtcgctggtgatttttttggaaaccccgaaagtataatattactaaaaggctgcaattgtcatcccttcaaagagtacttaccaagccgtaaatacatcaaaatagcctctccctagctatccatgcaaacagggcaagtgtaagctatctgggatgcg
ggtgtttcctttaacaccaggttccttgcctagttcattctgtacatagccctcccaactaaaccaaggctttataaaacaggcttaacaggtggaaattgcagctattgcagaaatccaaaagttggcgatgatttgctttaaacatataatgttttttcatataaaaatttaattcaggtgaaaatagttagtaattt
aggccactctatatacaaaatatatctatatacacaaattgcaatgtgtaatgtcaaattgctgaaagtgccttgcatcatgctttaatcattaggggaaagaggaatgctaaagcatttatcaaatttctctaccacattgaaatgactctcagagatatgggtcattgattttggcataacgtagttaaaagcagttc
tcgtgactttgttacaaaagttgtgatatgttttcaacccattatgggcttcaatgaagagaatttatttcaaagatgaaatctaacagtggtgttttaatacaaaatgggatcctatagatccataagcagttccatcatcaatccactaatgatggagcaactttgaattccagcagcaaccactagcaacaactata
caaattgcaaaaccatcttttaggagccaacaagatttaaatccagtcctatctggaattaaaccattctgcattcattatcttaaaaatgattaaaaaaaaaatccttttaccagtaactaccaacacactgttctcttcttttactactacagccttcaatgcttccttatatctctgttctgatccaaaagattaca
tctcaacccctttaattaggacacttaatctaactacatcagtatgtatagatatttattattatccttaacatcttgtgcttgtctaaattatacctacaggctatagcctatcattacacataattgatattatcattaagagatgctatactacctccaagataaaaacatatagctaatcttgatgtgcttacatt
cgtgcagTTATCCTCATGCAGCATCAACTAAACACAATCAAGTTGTGACAGGGAACTTTATGGCAGTTTGCTCCCACAACGAGGCTCATCATGGCAACTGCTATCTGAAGGCAAGACTATGCCTTATGGGGAGTTCTGTGGTTGAGTGTTTCCTTATATTGTTTGCAGGGATGTAGCTCCAGTTTGTTTCACAAATTTTT
AAAGAACATCTGGTCACGGGATCTGAATTGTCAAAAAGATACCTAGGCTATCAAGTAAAGAATATTGCTTTGGAATTAGCTTTTAGCACACCTTGACTGTCATTCATATCTTTTGCACAAGTGTTTCATATAATAAATGATAACATATTACAATGTTAATAAAATTCATCCTCTTCAAG
Intron 2 GTATCTTGCT ... TTCACTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 40.35 | 17 | 17 | 6 |
| A2 | 27.66 | 17 | 5 | 8 |
| A3 | 33.33 | 14 | 1 | 13 |
| A4 | 36.36 | 7 | 0 | 8 |
| A5 | 17.24 | 12 | 2 | 3 |
| A6 | 22.7 | 172 | 36 | 65 |
| A7 | 26.44 | 128 | 41 | 51 |
| A8 | 25.12 | 161 | 30 | 78 |
| A9 | 20.93 | 153 | 30 | 51 |
| A10 | 25.74 | 150 | 30 | 74 |
>TRINITY_DN39079_c0_g2_i2 from sample A6 / Example spliced isoformCGAATGACCAACTGAATACGTGTTAGAGAGGAAGGTGGGAGCCATGGATCTTCGATATGTAACTTCAAAAGTGTGGAGACAGTGAAAGTGCATTTGAATTTCGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGGT
TCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGGTATTTGATTAACTGTGGTCATTTTGTGTTGAAAATTGGACGGGGTAGGAATCAAATCAGGACCTGCCCATGCCCTCCCACTGAGCTACATGCTTCTTTCTTGACAGTGTAAACTCAATGATTGGGCACCTGTAGTTTACCTACTAG
GGCTGGTCAGAAACCTCAAAAGTCTTGAAGATGTTTGGGTGTATGTGTGGCCGACAGAATCATGGTCATGGGCAGCTACCTCTGTATATTAACACCGAATCGAGGAGATCAAACGATCACCAGTATGCATTTTATGCAAATCTTGTAGGCTATTTGCTCCAACTTAAGATATGCCCACTTGTTTTTCTAGTGTATATTTT
GTGCTACACATTGTGGAACCCAACTTCTGAGTGAAATCTTATGTTGTAAATCTAGATTTATGATATACCTGCATACAACTGAAAACATAAAGGAGAGGGTTAATTGCTCATCCTATCACATTAGTGCGGAACAAACAACTTGCCTCGGAGCAATTAATAAGAGAAATTCCAATGTCAGCCTTCCTGATTTATTGAATTCA
AACATGTTTCGGACCATAATTTTCTTCTTTAATATATTTTAGATATTGTCTGCA
>TRINITY_DN39079_c0_g2_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:CCTCAGCTATTAGTGGGTAGGTTTATGCTTCCATATCCAATCGGTCCTCTTCTCCTTCATGGTGCCTGATTTTATTCTACTCCTCTGTGTTCTCATCCATGCCTCTCTGATTCTGTCTGGGATTATTGTGGGTGCGGCCATATTGTTGATTGTTTCATTCATCCTTGGCTTTCTGGTCATACTCTGGATGCTTGCATTTG
ATCTGTATAGGCTACTGTGCTGGGTGGTGCATTATGTGAACACCATAGCTTCCTCTCTGTTCTGGCTTGTTCTCTTTGTGGTGTCATTGGTGTTTAGAATTGTCATGGGATTTGTGGGGATTGTTACGGGCTGTGTTCATTCAATGATCTCAGAATATGGGCTGTGGGCAGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGAC
GAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGGTTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGGTATTTGATTAACTGTGGTCATTTTGTGTTGAAAATTGGACGGGGTAGGAATCAAATCAGGACCTGCCCATGCCCTCCC
ACTGAGCTACATGCTTCTTTCTTGACAGgtatcttgctagttcaatatgaaggtgtggattgctatttccaacattttatgtctcaaactgatatgaccatttttttaaaatcatttagttcttttaatatctgaaattcagtcttacaattttcatagaagcaattttgtatccatgtttcactgcagTGTAAACTCAA
TGATTGGGCACCTGTAGTTTACCTACTAGGGCTGGTCAGAAACCTCAAAAGTCTTGAAGATGTTTGGGTGTATGTGTGGCCGACAGAATCATGGTCATGGGCAGCTACCTCTGTATATTAACACCGAATCGAGGAGATCAAACGATCACCAGTATGCATTTTATGCAAATCTTGTAGGCTATTTGCTCCAACTTAAGATA
TGCCCACTTGTTTTTCTAGTGTATATTTTGTGCTACACATTGTGGAACCCAACTTCTGAGTGAAATCTTATGTTGTAAATCTAGATTTATGATATACCTGCATACAACTGAAAACATAAAGGAGAGGGTTAATTGCTCATCCTATCACATTAGTGCGGAACAAACAACTTGCCTCGGAGCAATTAATAAGAGAAATTCCA
ATGTCAGCCTTCCTGATTTATTGAATTCAAACATGTTTCGGACCATAATTTTCTTCTTTAATATATTTTAGATATTGTCTGCA
Intron 3 GTATTTGATT ... TTCTTGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 65.8 | 15.9 | 30.4 | 16.2 |
| A2 | 56.13 | 11.4 | 14 | 10.4 |
| A3 | 70.56 | 5.3 | 10 | 6.9 |
| A4 | 53.77 | 14.7 | 17 | 3.2 |
| A5 | 76.86 | 4.3 | 14 | 6.4 |
| A6 | 60.41 | 91.8 | 134.2 | 95.9 |
| A7 | 65.51 | 66.6 | 123.6 | 78.9 |
| A8 | 63.92 | 75.8 | 128.2 | 87.3 |
| A9 | 66.47 | 71.3 | 136.1 | 85.8 |
| A10 | 68.08 | 58.8 | 115.7 | 82.3 |
>TRINITY_DN100565_c0_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoformTTATTAACATTTCTGATTCTTCTGCTCTGATCTAATTATGACTGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTGCTCTGATCTAATTATGACTGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTTCTGCTCTGCTTTTCTACTACATGCCCTCCCATGTTTGATATCCATCGTCATGCCTTCTGCCTCAGCTATTAGTGGGTAGGTTTATGCT
TCCATATCCAATCGGTCCTCTTCTCCTTCATGGTGCCTGATTTTATTCTACTCCTCTGTGTTCTCATCCATGCCTCTCTGATTCTGTCTGGGATTATTGTGGGTGCGGCCATATTGTTGATTGTTTCATTCATCCTTGGCTTTCTGGTCATACTCTGGATGCTTGCATTTGATCTGTATAGGCTACTGTGCTGGGTGGTG
CATTATGTGAACACCATAGCTTCCTCTCTGTTCTGGCTTGTTCTCTTTGTGGTGTCATTGGTGTTTAGAATTGTCATGGGATTTGTGGGGATTGTTACGGGCTGTGTTCATTCAATGATCTCAGAATATGGGCTGTGGGCAGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTG
TGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGGTTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGTGTAAACTCAATGATTGGGCACCTGTAGTTTACCTACTAGGGCTGGTCAGAAACCTCAAAAGTCTTGAAGATGTTTGGGTGTATGTGTGGCCGACAGAATCATGGTCA
TGGGCAGCTACCTCTGTATATTAACACCGAATCGAGGAGATCAAACGATCACCAGTATGCATTTTATGCAAATCTTGTAGGCTATTTGCTCCAACTTAAGATATGCCCACTTGTTTTTCTAGTGTATATTTTGTGCTACACATTGTGGAACCCAACTTCTGAGTGAAATCTTATGTTGTAAATCTAGATTTATGATATAC
CTGCATACAACTGAAAACATAAAGGAGAGGGTTAATTGCTCATCCTATCACATTAGTGCGGAACAAACAACTTGCCTCGGA
>TRINITY_DN100565_c0_g1_i2 from sample A2 / Example unspliced isoform:TTATTAACATTTCTGATTCTTCTGCTCTGATCTAATTATGACTGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTGCTCTGATCTAATTATGACTGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTTCTGCTCTGCTTTTCTACTACATGCCCTCCCATGTTTGATATCCATCGTCATGCCTTCTGCCTCAGCTATTAGTGGGTAGGTTTATGCT
TCCATATCCAATCGGTCCTCTTCTCCTTCATGGTGCCTGATTTTATTCTACTCCTCTGTGTTCTCATCCATGCCTCTCTGATTCTGTCTGGGATTATTGTGGGTGCGGCCATATTGTTGATTGTTTCATTCATCCTTGGCTTTCTGGTCATACTCTGGATGCTTGCATTTGATCTGTATAGGCTACTGTGCTGGGTGGTG
CATTATGTGAACACCATAGCTTCCTCTCTGTTCTGGCTTGTTCTCTTTGTGGTGTCATTGGTGTTTAGAATTGTCATGGGATTTGTGGGGATTGTTACGGGCTGTGTTCATTCAATGATCTCAGAATATGGGCTGTGGGCAGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTG
TGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGGTTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGgtatttgattaactgtggtcattttgtgttgaaaattggacggggtaggaatcaaatcaggacctgcccatgccctcccactgagctacatgcttctttcttgacagT
GTAAACTCAATGATTGGGCACCTGTAGTTTACCTACTAGGGCTGGTCAGAAACCTCAAAAGTCTTGAAGATGTTTGGGTGTATGTGTGGCCGACAGAATCATGGTCATGGGCAGCTACCTCTGTATATTAACACCGAATCGAGGAGATCAAACGATCACCAGTATGCATTTTATGCAAATCTTGTAGGCTATTTGCTCCA
ACTTAAGATATGCCCACTTGTTTTTCTAGTGTATATTTTGTGCTACACATTGTGGAACCCAACTTCTGAGTGAAATCTTATGTTGTAAATCTAGATTTATGATATACCTGCATACAACTGAAAACATAAAGGAGAGGGTTAATTGCTCATCCTATCACATTAGTGCGGAACAAACAACTTGCCTCGGA
Intron 4 GTATTTGATT ... ATTCGTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 67.39 | 15 | 31 | 6 |
| A2 | 66.67 | 7 | 14 | 3 |
| A3 | 71.43 | 4 | 10 | 2 |
| A4 | 54.84 | 14 | 17 | 1 |
| A5 | 82.35 | 3 | 14 | 0 |
| A6 | 70.97 | 54 | 132 | 4 |
| A7 | 70.35 | 51 | 121 | 6 |
| A8 | 74.42 | 44 | 128 | 9 |
| A9 | 71.74 | 52 | 132 | 11 |
| A10 | 79.72 | 29 | 114 | 6 |
>TRINITY_DN45197_c2_g1_i4 from sample A8 / Example spliced isoformATTTTAATGTTTGGCATCCGAATGACCAACTGAATACGTGTTAGAGAGGAAGGTGGGAGCCATGGATCTTCGATATGTAACTTCAAAAGTGTGGAGACAGTGAAAGTGCATTTGAATTTCGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATA
AGGCCTGCAAATATTGGTTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGTTATCCTCATGCAGCATCAACTAAACACAATCAAGTTGTGACAGGGAACTTTATGGCAGTTTGCTCCCACAACGAGGCTCATCATGGCAACTGCTATCTGAAGGCAAGACTATGCCTTATGGGGAGTTC
TGTGGTTGAGTGTTTCCTTATATTGTTTGCAGGGATGTAGCTCCAGTTTGTTTCACAAATTTTTAAAGAACATCTGGTCACGGGATCTGAATTGTCAAAAAGATACCTAGGCTATCAAGTAAAGAATATTGCTTTGGAATTAGCTTTTAGCACACCTTGACTGTCATTCATATCTTTTGCACAAGTGTTTCATATAATAA
ATGATAACATATTACAATGTTAATAAAATTCATCCTCTTCAAGAAAACTAGGTTGATTTTATATTTATTCTTTGGGTG
>TRINITY_DN45197_c2_g1_i5 from sample A8 / Example unspliced isoform:ATTTTAATGTTTGGCATCCGAATGACCAACTGAATACGTGTTAGAGAGGAAGGTGGGAGCCATGGATCTTCGATATGTAACTTCAAAAGTGTGGAGACAGTGAAAGTGCATTTGAATTTCGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATA
AGGCCTGCAAATATTGGTTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGgtatttgattaactgtggtcattttgtgttgaaaattggacggggtaggaatcaaatcaggacctgcccatgccctcccactgagctacatgcttctttcttgacaggtatcttgctagttcaatatga
aggtgtggattgctatttccaacattttatgtctcaaactgatatgaccattttttttaaaatcatttagttcttttaatatctgaaattcagtcttacaattttcatagaagcaattttgtatccatgtttcactgcagtgtaaactcaatgattgggcacctgtagtttacctactagggctggtcagaaacctcaaa
agtcttgaagatgtttgggtgtatgtgtggccgacagaatcatggtcatgggcagctacctctgtatattaacaccgaatcgaggagatcaaacgatcaccagtatgcattttatgcaaatcttgtaggctatttgctccaacttaagatatgcccacttgtttttctagtgtatattttgtgctacacattgtggaacc
caacttctgagtgaaatcttatgttgtaaatctagatttatgatatacctgcatacaactgaaaacataaaggagagggttaattgctcatcctatcacattagtgcggaacaaacaacttgcctcggagcaattaataagagaaattccaatgtcagccttcctgatttattgaattcaaacatgtttcggaccataat
tttcttctttaatatattttagatattgtctgcaaatgatgggccagaaagtttgaggtcatgaagtagcaactgcttttgaaattttaattgatcgtggtggcttagggccgcttcctactgctcatcgaattaagaatttatcccatttttttctgcttttaatttttaaattgagttgaatcaaacctgatacaaaa
tgggtgctcttttatcattttcaaaagtcgctggtgatttttttggaaaccccgaaagtataatattactaaaaggctgcaattgtcatcccttcaaagagtacttaccaagccgtaaatacatcaaaatagcctctccctagctatccatgcaaacagggcaagtgtaagctatctgggatgcgggtgtttcctttaac
accaggttccttgcctagttcattctgtacatagccctcccaactaaaccaaggctttataaaacaggcttaacaggtggaaattgcagctattgcagaaatccaaaagttggcgatgatttgctttaaacatataatgttttttcatataaaaatttaattcaggtgaaaatagttagtaatttaggccactctatata
caaaatatatctatatacacaaattgcaatgtgtaatgtcaaattgctgaaagtgccttgcatcatgctttaatcattaggggaaagaggaatgctaaagcatttatcaaatttctctaccacattgaaatgactctcagagatatgggtcattgattttggcataacgtagttaaaagcagttctcgtgactttgttac
aaaagttgtgatatgttttcaacccattatgggcttcaatgaagagaatttatttcaaagatgaaatctaacagtggtgttttaatacaaaatgggatcctatagatccataagcagttccatcatcaatccactaatgatggagcaactttgaattccagcagcaaccactagcaacaactatacaaattgcaaaacca
tcttttaggagccaacaagatttaaatccagtcctatctggaattaaaccattctgcattcattatcttaaaaatgattaaaaaaaaaatccttttaccagtaactaccaacacactgttctcttcttttactactacagccttcaatgcttccttatatctctgttctgatccaaaagattacatctcaacccctttaa
ttaggacacttaatctaactacatcagtatgtatagatatttattattatccttaacatcttgtgcttgtctaaattatacctacaggctatagcctatcattacacataattgatattatcattaagagatgctatactacctccaagataaaaacatatagctaatcttgatgtgcttacattcgtgcagTTATCCTC
ATGCAGCATCAACTAAACACAATCAAGTTGTGACAGGGAACTTTATGGCAGTTTGCTCCCACAACGAGGCTCATCATGGCAACTGCTATCTGAAGGCAAGACTATGCCTTATGGGGAGTTCTGTGGTTGAGTGTTTCCTTATATTGTTTGCAGGGATGTAGCTCCAGTTTGTTTCACAAATTTTTAAAGAACATCTGGTC
ACGGGATCTGAATTGTCAAAAAGATACCTAGGCTATCAAGTAAAGAATATTGCTTTGGAATTAGCTTTTAGCACACCTTGACTGTCATTCATATCTTTTGCACAAGTGTTTCATATAATAAATGATAACATATTACAATGTTAATAAAATTCATCCTCTTCAAGAAAACTAGGTTGATTTTATATTTATTCTTTGGGTG
Intron 5 GTATCTTGCT ... ATTCGTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 48.28 | 15 | 14 | 6 |
| A2 | 50 | 7 | 7 | 3 |
| A3 | 20 | 4 | 1 | 2 |
| A4 | 48.15 | 14 | 13 | 1 |
| A5 | 50 | 3 | 3 | 0 |
| A6 | 51.79 | 54 | 58 | 4 |
| A7 | 49.5 | 51 | 50 | 6 |
| A8 | 53.68 | 44 | 51 | 9 |
| A9 | 46.39 | 52 | 45 | 11 |
| A10 | 51.67 | 29 | 31 | 6 |
>TRINITY_DN45197_c2_g1_i4 from sample A8 / Example spliced isoformATTTTAATGTTTGGCATCCGAATGACCAACTGAATACGTGTTAGAGAGGAAGGTGGGAGCCATGGATCTTCGATATGTAACTTCAAAAGTGTGGAGACAGTGAAAGTGCATTTGAATTTCGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATA
AGGCCTGCAAATATTGGTTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGTTATCCTCATGCAGCATCAACTAAACACAATCAAGTTGTGACAGGGAACTTTATGGCAGTTTGCTCCCACAACGAGGCTCATCATGGCAACTGCTATCTGAAGGCAAGACTATGCCTTATGGGGAGTTC
TGTGGTTGAGTGTTTCCTTATATTGTTTGCAGGGATGTAGCTCCAGTTTGTTTCACAAATTTTTAAAGAACATCTGGTCACGGGATCTGAATTGTCAAAAAGATACCTAGGCTATCAAGTAAAGAATATTGCTTTGGAATTAGCTTTTAGCACACCTTGACTGTCATTCATATCTTTTGCACAAGTGTTTCATATAATAA
ATGATAACATATTACAATGTTAATAAAATTCATCCTCTTCAAGAAAACTAGGTTGATTTTATATTTATTCTTTGGGTG
>TRINITY_DN45197_c2_g1_i2 from sample A8 / Example unspliced isoform:ATTTTAATGTTTGGCATCCGAATGACCAACTGAATACGTGTTAGAGAGGAAGGTGGGAGCCATGGATCTTCGATATGTAACTTCAAAAGTGTGGAGACAGTGAAAGTGCATTTGAATTTCGGTGAGTTGCGATTTAGCTGTAAAGAAAAAGAGTAATCTGGTGTTTTCTGAAGAAAAGAATAGGAAAAGGTCTTAATATA
TTTGAATTTTCATGTGGGTGTCGTGCCGTGGCAATGTTTTATAAGTGGAGTGGACTGAGATACTTTGATTCTCCACTGCCAAAAGTGCCTTGAAATGAAATTCTCATCTTTTAGGTGTTGATGTTTCACACAATACTCTTTCTCTATCATTTTCCCTCTACACAAAATCTAATTATAACTGTTATTAACATTTCTGATTC
TTCTGCTCTGATCTAATTATGACTGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTTCTGCTCTGCTTTTCTACTACATGCCCTCCCATGTTTGATATCCATCGTCATGCCTTCTGCCTCAGCTATTAGTGGGTAGGTTTATGCTTCCATATCCAATCGGTCCTCTTCTCCTTCATGGTGCCTGATTTTATTCTACTCCTCTGTGTTC
TCATCCATGCCTCTCTGATTCTGTCTGGGATTATTGTGGGTGCGGCCATATTGTTGATTGTTTCATTCATCCTTGGCTTTCTGGTCATACTCTGGATGCTTGCATTTGATCTGTATAGGCTACTGTGCTGGGTGGTGCATTATGTGAACACCATAGCTTCCTCTCTGTTCTGGCTTGTTCTCTTTGTGGTGTCATTGGTG
TTTAGAATTGTCATGGGATTTGTGGGGATTGTTACGGGCTGTGTTCATTCAATGATCTCAGAATATGGGCTGTGGGCAGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGGTTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAG
CGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGgtatcttgctagttcaatatgaaggtgtggattgctatttccaacattttatgtctcaaactgatatgaccatttttttaaaatcatttagttcttttaatatctgaaattcagtcttacaattttcatagaagcaattttgtatccatgtttcactgcagtgtaaactca
atgattgggcacctgtagtttacctactagggctggtcagaaacctcaaaagtcttgaagatgtttgggtgtatgtgtggccgacagaatcatggtcatgggcagctacctctgtatattaacaccgaatcgaggagatcaaacgatcaccagtatgcattttatgcaaatcttgtaggctatttgctccaacttaagat
atgcccacttgtttttctagtgtatattttgtgctacacattgtggaacccaacttctgagtgaaatcttatgttgtaaatctagatttatgatatacctgcatacaactgaaaacataaaggagagggttaattgctcatcctatcacattagtgcggaacaaacaacttgcctcggagcaattaataagagaaattcc
aatgtcagccttcctgatttattgaattcaaacatgtttcggaccataattttcttctttaatatattttagatattgtctgcaaatgatgggccagaaagtttgaggtcatgaagtagcaactgcttttgaaattttaattgatcgtggtggcttagggccgcttcctactgctcatcgaattaagaatttatcccatt
tttttctgcttttaatttttaaattgagttgaatcaaacctgatacaaaatgggtgctcttttatcattttcaaaagtcgctggtgatttttttggaaaccccgaaagtataatattactaaaaggctgcaattgtcatcccttcaaagagtacttaccaagccgtaaatacatcaaaatagcctctccctagctatcca
tgcaaacagggcaagtgtaagctatctgggatgcgggtgtttcctttaacaccaggttccttgcctagttcattctgtacatagccctcccaactaaaccaaggctttataaaacaggcttaacaggtggaaattgcagctattgcagaaatccaaaagttggcgatgatttgctttaaacatataatgttttttcatat
aaaaatttaattcaggtgaaaatagttagtaatttaggccactctatatacaaaatatatctatatacacaaattgcaatgtgtaatgtcaaattgctgaaagtgccttgcatcatgctttaatcattaggggaaagaggaatgctaaagcatttatcaaatttctctaccacattgaaatgactctcagagatatgggt
cattgattttggcataacgtagttaaaagcagttctcgtgactttgttacaaaagttgtgatatgttttcaacccattatgggcttcaatgaagagaatttatttcaaagatgaaatctaacagtggtgttttaatacaaaatgggatcctatagatccataagcagttccatcatcaatccactaatgatggagcaact
ttgaattccagcagcaaccactagcaacaactatacaaattgcaaaaccatcttttaggagccaacaagatttaaatccagtcctatctggaattaaaccattctgcattcattatcttaaaaatgattaaaaaaaaaatccttttaccagtaactaccaacacactgttctcttcttttactactacagccttcaatgc
ttccttatatctctgttctgatccaaaagattacatctcaacccctttaattaggacacttaatctaactacatcagtatgtatagatatttattattatccttaacatcttgtgcttgtctaaattatacctacaggctatagcctatcattacacataattgatattatcattaagagatgctatactacctccaaga
taaaaacatatagctaatcttgatgtgcttacattcgtgcagTTATCCTCATGCAGCATCAACTAAACACAATCAAGTTGTGACAGGGAACTTTATGGCAGTTTGCTCCCACAACGAGGCTCATCATGGCAACTGCTATCTGAAGGCAAGACTATGCCTTATGGGGAGTTCTGTGGTTGAGTGTTTCCTTATATTGTTTG
CAGGGATGTAGCTCCAGTTTGTTTCACAAATTTTTAAAGAACATCTGGTCACGGGATCTGAATTGTCAAAAAGATACCTAGGCTATCAAGTAAAGAATATTGCTTTGGAATTAGCTTTTAGCACACCTTGACTGTCATTCATATCTTTTGCACAAGTGTTTCATATAATAAATGATAACATATTACAATGTTAATAAAAT
TCATCCTCTTCAAGAAAACTAGGTTGATTTTATATTTATTCTTTGGGTG
Intron 6 GTATTTGATT ... ATTCGTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 67.39 | 15 | 31 | 6 |
| A2 | 66.67 | 7 | 14 | 3 |
| A3 | 71.43 | 4 | 10 | 2 |
| A4 | 54.84 | 14 | 17 | 1 |
| A5 | 82.35 | 3 | 14 | 0 |
| A6 | 70.97 | 54 | 132 | 4 |
| A7 | 70.35 | 51 | 121 | 6 |
| A8 | 74.27 | 44 | 127 | 9 |
| A9 | 72.19 | 52 | 135 | 11 |
| A10 | 79.72 | 29 | 114 | 6 |
>TRINITY_DN45197_c2_g1_i4 from sample A8 / Example spliced isoformATTTTAATGTTTGGCATCCGAATGACCAACTGAATACGTGTTAGAGAGGAAGGTGGGAGCCATGGATCTTCGATATGTAACTTCAAAAGTGTGGAGACAGTGAAAGTGCATTTGAATTTCGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATA
AGGCCTGCAAATATTGGTTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGTTATCCTCATGCAGCATCAACTAAACACAATCAAGTTGTGACAGGGAACTTTATGGCAGTTTGCTCCCACAACGAGGCTCATCATGGCAACTGCTATCTGAAGGCAAGACTATGCCTTATGGGGAGTTC
TGTGGTTGAGTGTTTCCTTATATTGTTTGCAGGGATGTAGCTCCAGTTTGTTTCACAAATTTTTAAAGAACATCTGGTCACGGGATCTGAATTGTCAAAAAGATACCTAGGCTATCAAGTAAAGAATATTGCTTTGGAATTAGCTTTTAGCACACCTTGACTGTCATTCATATCTTTTGCACAAGTGTTTCATATAATAA
ATGATAACATATTACAATGTTAATAAAATTCATCCTCTTCAAGAAAACTAGGTTGATTTTATATTTATTCTTTGGGTG
>TRINITY_DN45197_c2_g1_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:ATTTTAATGTTTGGCATCCGAATGACCAACTGAATACGTGTTAGAGAGGAAGGTGGGAGCCATGGATCTTCGATATGTAACTTCAAAAGTGTGGAGACAGTGAAAGTGCATTTGAATTTCGGTGAGTTGCGATTTAGCTGTAAAGAAAAAGAGTAATCTGGTGTTTTCTGAAGAAAAGAATAGGAAAAGGTCTTAATATA
TTTGAATTTTCATGTGGGTGTCGTGCCGTGGCAATGTTTTATAAGTGGAGTGGACTGAGATACTTTGATTCTCCACTGCCAAAAGTGCCTTGAAATGAAATTCTCATCTTTTAGGTGTTGATGTTTCACACAATACTCTTTCTCTATCATTTTCCCTCTACACAAAATCTAATTATAACTGTTATTAACATTTCTGATTC
TTCTGCTCTGATCTAATTATGACTGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTTCTGCTCTGCTTTTCTACTACATGCCCTCCCATGTTTGATATCCATCGTCATGCCTTCTGCCTCAGCTATTAGTGGGTAGGTTTATGCTTCCATATCCAATCGGTCCTCTTCTCCTTCATGGTGCCTGATTTTATTCTACTCCTCTGTGTTC
TCATCCATGCCTCTCTGATTCTGTCTGGGATTATTGTGGGTGCGGCCATATTGTTGATTGTTTCATTCATCCTTGGCTTTCTGGTCATACTCTGGATGCTTGCATTTGATCTGTATAGGCTACTGTGCTGGGTGGTGCATTATGTGAACACCATAGCTTCCTCTCTGTTCTGGCTTGTTCTCTTTGTGGTGTCATTGGTG
TTTAGAATTGTCATGGGATTTGTGGGGATTGTTACGGGCTGTGTTCATTCAATGATCTCAGAATATGGGCTGTGGGCAGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGGTTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAG
CGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGgtatttgattaactgtggtcattttgtgttgaaaattggacggggtaggaatcaaatcaggacctgcccatgccctcccactgagctacatgcttctttcttgacaggtatcttgctagttcaatatgaaggtgtggattgctatttccaacattttatgtctcaaactga
tatgaccattttttttgtaaactcaatgattgggcacctgtagtttacctactagggctggtcagaaacctcaaaagtcttgaagatgtttgggtgtatgtgtggccgacagaatcatggtcatgggcagctacctctgtatattaacaccgaatcgaggagatcaaacgatcaccagtatgcattttatgcaaatcttg
taggctatttgctccaacttaagatatgcccacttgtttttctagtgtatattttgtgctacacattgtggaacccaacttctgagtgaaatcttatgttgtaaatctagatttatgatatacctgcatacaactgaaaacataaaggagagggttaattgctcatcctatcacattagtgcggaacaaacaacttgcct
cggagcaattaataagagaaattccaatgtcagccttcctgatttattgaattcaaacatgtttcggaccataattttcttctttaatatattttagatattgtctgcaaatgatgggccagaaagtttgaggtcatgaagtagcaactgcttttgaaattttaattgatcgtggtggcttagggccgcttcctactgct
catcgaattaagaatttatcccatttttttctgcttttaatttttaaattgagttgaatcaaacctgatacaaaatgggtgctcttttatcattttcaaaagtcgctggtgatttttttggaaaccccgaaagtataatattactaaaaggctgcaattgtcatcccttcaaagagtacttaccaagccgtaaatacatc
aaaatagcctctccctagctatccatgcaaacagggcaagtgtaagctatctgggatgcgggtgtttcctttaacaccaggttccttgcctagttcattctgtacatagccctcccaactaaaccaaggctttataaaacaggcttaacaggtggaaattgcagctattgcagaaatccaaaagttggcgatgatttgct
ttaaacatataatgttttttcatataaaaatttaattcaggtgaaaatagttagtaatttaggccactctatatacaaaatatatctatatacacaaattgcaatgtgtaatgtcaaattgctgaaagtgccttgcatcatgctttaatcattaggggaaagaggaatgctaaagcatttatcaaatttctctaccacat
tgaaatgactctcagagatatgggtcattgattttggcataacgtagttaaaagcagttctcgtgactttgttacaaaagttgtgatatgttttcaacccattatgggcttcaatgaagagaatttatttcaaagatgaaatctaacagtggtgttttaatacaaaatgggatcctatagatccataagcagttccatca
tcaatccactaatgatggagcaactttgaattccagcagcaaccactagcaacaactatacaaattgcaaaaccatcttttaggagccaacaagatttaaatccagtcctatctggaattaaaccattctgcattcattatcttaaaaatgattaaaaaaaaaatccttttaccagtaactaccaacacactgttctctt
cttttactactacagccttcaatgcttccttatatctctgttctgatccaaaagattacatctcaacccctttaattaggacacttaatctaactacatcagtatgtatagatatttattattatccttaacatcttgtgcttgtctaaattatacctacaggctatagcctatcattacacataattgatattatcatt
aagagatgctatactacctccaagataaaaacatatagctaatcttgatgtgcttacattcgtgcagTTATCCTCATGCAGCATCAACTAAACACAATCAAGTTGTGACAGGGAACTTTATGGCAGTTTGCTCCCACAACGAGGCTCATCATGGCAACTGCTATCTGAAGGCAAGACTATGCCTTATGGGGAGTTCTGTG
GTTGAGTGTTTCCTTATATTGTTTGCAGGGATGTAGCTCCAGTTTGTTTCACAAATTTTTAAAGAACATCTGGTCACGGGATCTGAATTGTCAAAAAGATACCTAGGCTATCAAGTAAAGAATATTGCTTTGGAATTAGCTTTTAGCACACCTTGACTGTCATTCATATCTTTTGCACAAGTGTTTCATATAATAAATGA
TAACATATTACAATGTTAATAAAATTCATCCTCTTCAAGAAAACTAGGTTGATTTTATATTTATTCTTTGGGTG
Intron 7 GTATCTTGCT ... TTCACTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 40.35 | 17 | 17 | 6 |
| A2 | 27.66 | 17 | 5 | 8 |
| A3 | 33.33 | 14 | 1 | 13 |
| A4 | 36.36 | 7 | 0 | 8 |
| A5 | 17.24 | 12 | 2 | 3 |
| A6 | 22.7 | 172 | 36 | 65 |
| A7 | 26.44 | 128 | 41 | 51 |
| A8 | 25.12 | 161 | 30 | 78 |
| A9 | 20.93 | 153 | 30 | 51 |
| A10 | 25.56 | 150 | 29 | 74 |
>TRINITY_DN42399_c0_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoformGGCCAACTGAATACGTGTTAGAGAGGAAGGTGGGAGCCATGGATCTTCGATATGTAACTTCAAAAGTGTGGAGACAGTGAAAGTGCATTTGAATTTCGGTGAGTTGCGATTTAGCTGTAAAGAAAAAGAGTAATCTGGTGTTTTCTGAAGAAAAGAATAGGAAAAGGTCTTAATATATTTGAATTTTCATGTGGGTGTCG
TGCCGTGGCAATGTTTTATAAGTGGAGTGGACTGAGATACTTTGATTCTCCACTGCCAAAAGTGCCTTGAAATGAAATTCTCATCTTTTAGGTGTTGATGTTTCACACAATACTCTTTCTCTATCATTTTCCCTCTACACAAAATCTAATTATAACTGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTGCTCTGATCTAATTATGAC
TGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTTCTGCTCTGCTTTTCTACTACATGCCCTCCCATGTTTGATATCCATCGTCATGCCTTCTGCCTCAGCTATTAGTGGGTAGGTTTATGCTTCCATATCCAATCGGTCCTCTTCTCCTTCATGGTGCCTGATTTTATTCTACTCCTCTGTGTTCTCATCCATGCCTCTCTGATTCTG
TCTGGGATTATTGTGGGTGCGGCCATATTGTTGATTGTTTCATTCATCCTTGGCTTTCTGGTCATACTCTGGATGCTTGCATTTGATCTGTATAGGCTACTGTGCTGGGTGGTGCATTATGTGAACACCATAGCTTCCTCTCTGTTCTGGCTTGTTCTCTTTGTGGTGTCATTGGTGTTTAGAATTGTCATGGGATTTGT
GGGGATTGTTACGGGCTGTGTTCATTCAATGATCTCAGAATATGGGCTGTGGGCAGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGGTTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATAT
AAGCAGGTATTTGATTAACTGTGGTCATTTTGTGTTGAAAATTGGACGGGGTAGGAATCAAATCAGGACCTGCCCATGCCCTCCCACTGAGCTACATGCTTCTTTCTTGACAGTGTAAACTCAATGATTGGGCACCTGTAGTTTACCTACTAGGGCTGGTCAGAAACCTCAAAAGTCTTGAAGATGTTTGGGTGTATGTG
TGGCCGACAGAATCATGGTCATGGGCAGCTACCTCTGTATATTAACACCGAATCGAGGAGATCAAACGATCACCAGTATGCATTTTATGCAAATCTTGTAGGCTATTTGCTCCAACTTAAGATATGCCCACTTGTTTTTCTAGTGTATATTTTGTGCTACACATTGTGGAACCCAACTTCTGAGTGAAATCTTATGTTGT
AAATCTAGATTTATGATATACCTGCATACAACTGAAAACATAAAGGAGAGGGTTAATTGCTCATCCTATCACATTAGTGCGGAACAAACAACTTGCCTCGGAGCAATTAATAAGAGAAATTCCAATGTCAGCCTTCCTGATTTATTGAATTCAAACATGTTTCGGACCATAATTTTCTTCTTTAATATATTTTAGATATT
GTCTGCAAATGATGGGCCAGAAAGTTTGAGGTCATGAAGTAGCAACTGCTTTTGAAATTTTAATTGATCGTGGTGGCTTAGGGCCGCTTCCTACTGCTCATCGAATTAAGAATTTATCCCATTTTTTTCTGCTTTTAATTTTTAAATTGAGTTGAATCAAACCTGATACAAAATGGGTGCTCTTTTATCATTTTCAAAAG
TCGCTGGTGATTTTTTTGGAAACCCCGAAAGTATAATATTACTAAAAGGCTGCAATTGTCATCCCTTCAAAGAGTACTTACCAAGCCGTAAATACATCAAAATAGCCTCTCCCTAGCTATCCATGCAAACAGGGCAAGTGTAAGCTATCTGGGATGCGGGTGTTTCCTTTAACACCAGGTTCCTTGCCTAGTTCATTCTG
TACATAGCCCTCCCAACTAAACCAAGGCTTTATAAAACAGGCTTAACAGGTGGAAATTGCAGCTATTGCAGAAATCCAAAAGTTGGCGATGATTTGCTTTAAACATATAATGTTTTTTCATATAAAAATTTAATTCAGGTGAAAATAGTTAGTAATTTAGGCCACTCTATATACAAAATATATCTATATACACAAATTGC
AATGTGTAATGTCAAATTGCTGAAAGTGCCTTGCATCATGCTTTAATCATTAGGGGAAAGAGGAATGCTAAAGCATTTATCAAATTTCTCTACCACATTGAAATGACTCTCAGAGATATGGGTCATTGATTTTGGCATAACGTAGTTAAAAGCAGTTCTCGTGACTTTGTTACAAAAGTTGTGATATGTTTTCAACCCAT
TATGGGCTTCAATGAAGAGAATTTATTTCAAAGATGAAATCTAACAGTGGTGTTTTAATACAAAATGGGATCCTATAGATCCATAAGCAGTTCCATCATCAATCCACTAATGATGGAGCAACTTTGAATTCCAGCAGCAACCACTAGCAACAACTATACAAATTGCAAAACCATCTTTTAGGAGCCAACAAGATTTAAAT
CCAGTCCTATCTGGAATTAAACCATTCTGCATTCATTATCTTAAAAATGATTAAAAAAAAAATCCTTTTACCAGTAACTACCAACACACTGTTCTCTTCTTTTACTACTACAGCCTTCAATGCTTCCTTATATCTCTGTTCTGATCCAAAAGATTACATCTCAACCCCTTTAATTAGGACACTTAATCTAACTACATCAG
TATGTATAGATATTTATTATTATCCTTAACATCTTGTGCTTGTCTAAATTATACCTACAGGCTATAGCCTATCATTACACATAATTGATATTATCATTAAGAGATGCTATACTACCTCCAAGATAAAAACATATAGCTAATCTTGATGTGCTTACATTCGTGCAGTTATCCTCATGCAGCATCAACTAAACACAATCAAG
TTGTGACAGGGAACTTTATGGCAGTTTGCTCCCACAACGAGGCTCATCATGGCAACTGCTATCTGAAGGCAAGACTATGCCTTATGGGGAGTTCTGTGGTTGAGTGTTTCCTTATATTGTTTGCAGGGATGTAGCTCCAGTTTGTTTCACAAATTTTTAAAGAACATCTGGTCACGGGATCTGAATTGTCAAAAAGATAC
CTAGGCTATCAAGTAAAGAATATTGCTTTGGAATTAGCTTTTAGCACACCTTGACTGTCATTCATATCTTTTGCACAAGTGTTTCATATAATAAATGATAACATATTACAATGTTAATAAAATTCATCCTCTTCAAG
>TRINITY_DN42399_c0_g1_i6 from sample A7 / Example unspliced isoform:GGCCAACTGAATACGTGTTAGAGAGGAAGGTGGGAGCCATGGATCTTCGATATGTAACTTCAAAAGTGTGGAGACAGTGAAAGTGCATTTGAATTTCGGTGAGTTGCGATTTAGCTGTAAAGAAAAAGAGTAATCTGGTGTTTTCTGAAGAAAAGAATAGGAAAAGGTCTTAATATATTTGAATTTTCATGTGGGTGTCG
TGCCGTGGCAATGTTTTATAAGTGGAGTGGACTGAGATACTTTGATTCTCCACTGCCAAAAGTGCCTTGAAATGAAATTCTCATCTTTTAGGTGTTGATGTTTCACACAATACTCTTTCTCTATCATTTTCCCTCTACACAAAATCTAATTATAACTGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTGCTCTGATCTAATTATGAC
TGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTTCTGCTCTGCTTTTCTACTACATGCCCTCCCATGTTTGATATCCATCGTCATGCCTTCTGCCTCAGCTATTAGTGGGTAGGTTTATGCTTCCATATCCAATCGGTCCTCTTCTCCTTCATGGTGCCTGATTTTATTCTACTCCTCTGTGTTCTCATCCATGCCTCTCTGATTCTG
TCTGGGATTATTGTGGGTGCGGCCATATTGTTGATTGTTTCATTCATCCTTGGCTTTCTGGTCATACTCTGGATGCTTGCATTTGATCTGTATAGGCTACTGTGCTGGGTGGTGCATTATGTGAACACCATAGCTTCCTCTCTGTTCTGGCTTGTTCTCTTTGTGGTGTCATTGGTGTTTAGAATTGTCATGGGATTTGT
GGGGATTGTTACGGGCTGTGTTCATTCAATGATCTCAGAATATGGGCTGTGGGCAGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGGTTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATAT
AAGCAGGTATTTGATTAACTGTGGTCATTTTGTGTTGAAAATTGGACGGGGTAGGAATCAAATCAGGACCTGCCCATGCCCTCCCACTGAGCTACATGCTTCTTTCTTGACAGgtatcttgctagttcaatatgaaggtgtggattgctatttccaacattttatgtctcaaactgatatgaccattttttttaaaatca
tttagttcttttaatatctgaaattcagtcttacaattttcatagaagcaattttgtatccatgtttcactgcagTGTAAACTCAATGATTGGGCACCTGTAGTTTACCTACTAGGGCTGGTCAGAAACCTCAAAAGTCTTGAAGATGTTTGGGTGTATGTGTGGCCGACAGAATCATGGTCATGGGCAGCTACCTCTGT
ATATTAACACCGAATCGAGGAGATCAAACGATCACCAGTATGCATTTTATGCAAATCTTGTAGGCTATTTGCTCCAACTTAAGATATGCCCACTTGTTTTTCTAGTGTATATTTTGTGCTACACATTGTGGAACCCAACTTCTGAGTGAAATCTTATGTTGTAAATCTAGATTTATGATATACCTGCATACAACTGAAAA
CATAAAGGAGAGGGTTAATTGCTCATCCTATCACATTAGTGCGGAACAAACAACTTGCCTCGGAGCAATTAATAAGAGAAATTCCAATGTCAGCCTTCCTGATTTATTGAATTCAAACATGTTTCGGACCATAATTTTCTTCTTTAATATATTTTAGATATTGTCTGCAAATGATGGGCCAGAAAGTTTGAGGTCATGAA
GTAGCAACTGCTTTTGAAATTTTAATTGATCGTGGTGGCTTAGGGCCGCTTCCTACTGCTCATCGAATTAAGAATTTATCCCATTTTTTTCTGCTTTTAATTTTTAAATTGAGTTGAATCAAACCTGATACAAAATGGGTGCTCTTTTATCATTTTCAAAAGTCGCTGGTGATTTTTTTGGAAACCCCGAAAGTATAATA
TTACTAAAAGACTGC
Intron 8 GTGTGGATTG ... TTCACTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 50 | 6 | 15 | 6 |
| A2 | 47.06 | 9 | 0 | 8 |
| A3 | 59.09 | 9 | 0 | 13 |
| A4 | 66.67 | 4 | 1 | 8 |
| A5 | 50 | 3 | 0 | 3 |
| A6 | 40.88 | 94 | 11 | 65 |
| A7 | 46.36 | 59 | 23 | 51 |
| A8 | 46.99 | 88 | 18 | 78 |
| A9 | 45.95 | 60 | 6 | 51 |
| A10 | 51.39 | 70 | 12 | 74 |
>TRINITY_DN39079_c0_g2_i5 from sample A6 / Example spliced isoformCCTCAGCTATTAGTGGGTAGGTTTATGCTTCCATATCCAATCGGTCCTCTTCTCCTTCATGGTGCCTGATTTTATTCTACTCCTCTGTGTTCTCATCCATGCCTCTCTGATTCTGTCTGGGATTATTGTGGGTGCGGCCATATTGTTGATTGTTTCATTCATCCTTGGCTTTCTGGTCATACTCTGGATGCTTGCATTTG
ATCTGTATAGGCTACTGTGCTGGGTGGTGCATTATGTGAACACCATAGCTTCCTCTCTGTTCTGGCTTGTTCTCTTTGTGGTGTCATTGGTGTTTAGAATTGTCATGGGATTTGTGGGGATTGTTACGGGCTGTGTTCATTCAATGATCTCAGAATATGGGCTGTGGGCAGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGAC
GAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGGTTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGGTATCTTGCTAGTTCAATATGAAGTGTAAACTCAATGATTGGGCACCTGTAGTTTACCTACTAGGGCTGGTCAGAAACC
TCAAAAGTCTTGAAGATGTTTGGGTGTATGTGTGGCCGACAGAATCATGGTCATGGGCAGCTACCTCTGTATATTAACACCGAATCGAGGAGATCAAACGATCACCAGTATGCATTTTATGCAAATCTTGTAGGCTATTTGCTCCAACTTAAGATATGCCCACTTGTTTTTCTAGTGTATATTTTGTGCTACACATTGTG
GAACCCAACTTCTGAGTGAAATCTTATGTTGTAAATCTAGATTTATGATATACCTGCATACAACTGAAAACATAAAGGAGAGGGTTAATTGCTCATCCTATCACATTAGTGCGGAACAAACAACTTGCCTCGGAGCAATTAATAAGAGAAATTCCAATGTCAGCCTTCCTGATTTATTGAATTCAAACATGTTTCGGACC
ATAATTTTCTTCTTTAATATATTTTAGATATTGTCTGCA
>TRINITY_DN39079_c0_g2_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:CCTCAGCTATTAGTGGGTAGGTTTATGCTTCCATATCCAATCGGTCCTCTTCTCCTTCATGGTGCCTGATTTTATTCTACTCCTCTGTGTTCTCATCCATGCCTCTCTGATTCTGTCTGGGATTATTGTGGGTGCGGCCATATTGTTGATTGTTTCATTCATCCTTGGCTTTCTGGTCATACTCTGGATGCTTGCATTTG
ATCTGTATAGGCTACTGTGCTGGGTGGTGCATTATGTGAACACCATAGCTTCCTCTCTGTTCTGGCTTGTTCTCTTTGTGGTGTCATTGGTGTTTAGAATTGTCATGGGATTTGTGGGGATTGTTACGGGCTGTGTTCATTCAATGATCTCAGAATATGGGCTGTGGGCAGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGAC
GAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGGTTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGGTATTTGATTAACTGTGGTCATTTTGTGTTGAAAATTGGACGGGGTAGGAATCAAATCAGGACCTGCCCATGCCCTCCC
ACTGAGCTACATGCTTCTTTCTTGACAGGTATCTTGCTAGTTCAATATGAAGgtgtggattgctatttccaacattttatgtctcaaactgatatgaccatttttttaaaatcatttagttcttttaatatctgaaattcagtcttacaattttcatagaagcaattttgtatccatgtttcactgcagTGTAAACTCAA
TGATTGGGCACCTGTAGTTTACCTACTAGGGCTGGTCAGAAACCTCAAAAGTCTTGAAGATGTTTGGGTGTATGTGTGGCCGACAGAATCATGGTCATGGGCAGCTACCTCTGTATATTAACACCGAATCGAGGAGATCAAACGATCACCAGTATGCATTTTATGCAAATCTTGTAGGCTATTTGCTCCAACTTAAGATA
TGCCCACTTGTTTTTCTAGTGTATATTTTGTGCTACACATTGTGGAACCCAACTTCTGAGTGAAATCTTATGTTGTAAATCTAGATTTATGATATACCTGCATACAACTGAAAACATAAAGGAGAGGGTTAATTGCTCATCCTATCACATTAGTGCGGAACAAACAACTTGCCTCGGAGCAATTAATAAGAGAAATTCCA
ATGTCAGCCTTCCTGATTTATTGAATTCAAACATGTTTCGGACCATAATTTTCTTCTTTAATATATTTTAGATATTGTCTGCA
Intron 9 GTGTGGATTG ... TTCACTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 50 | 6 | 10.5 | 6 |
| A2 | 47.06 | 9 | 0.5 | 8 |
| A3 | 59.09 | 9 | 0 | 13 |
| A4 | 66.67 | 4 | 1 | 8 |
| A5 | 50 | 3 | 0 | 3 |
| A6 | 40.88 | 94 | 14 | 65 |
| A7 | 46.36 | 59 | 24.5 | 51 |
| A8 | 46.99 | 88 | 20.5 | 78 |
| A9 | 45.95 | 60 | 5 | 51 |
| A10 | 51.39 | 70 | 10 | 74 |
>TRINITY_DN41582_c0_g5_i3 from sample A9 / Example spliced isoformGTGAATCATTTGAATAAGGGACACCATTTTAATGTTTGGCATCCGAATGACCAACTGAATACGTGTTAGAGAGGAAGGTGGGAGCCATGGATCTTCGATATGTAACTTCAAAAGTGTGGAGACAGTGAAAGTGCATTTGAATTTCGGTGAGTTGCGATTTAGCTGTAAAGAAAAAGAGTAATCTGGTGTTTTCTGAAGAA
AAGAATAGGAAAAGGTCTTAATATATTTGAATTTTCATGTGGGTGTCGTGCCGTGGCAATGTTTTATAAGTGGAGTGGACTGAGATACTTTGATTCTCCACTGCCAAAAGTGCCTTGAAATGAAATTCTCATCTTTTAGGTGTTGATGTTTCACACAATACTCTTTCTCTATCATTTTCCCTCTACACAAAATCTAATTA
TAACTGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTGCTCTGATCTAATTATGACTGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTTCTGCTCTGCTTTTCTACTACATGCCCTCCCATGTTTGATATCCATCGTCATGCCTTCTGCCTCAGCTATTAGTGGGTAGGTTTATGCTTCCATATCCAATCGGTCCTCTTCTCCTTCATGGTGCCT
GATTTTATTCTACTCCTCTGTGTTCTCATCCATGCCTCTCTGATTCTGTCTGGGATTATTGTGGGTGCGGCCATATTGTTGATTGTTTCATTCATCCTTGGCTTTCTGGTCATACTCTGGATGCTTGCATTTGATCTGTATAGGCTACTGTGCTGGGTGGTGCATTATGTGAACACCATAGCTTCCTCTCTGTTCTGGCT
TGTTCTCTTTGTGGTGTCATTGGTGTTTAGAATTGTCATGGGATTTGTGGGGATTGTTACGGGCTGTGTTCATTCAATGATCTCAGAATATGGGCTGTGGGCAGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGG
TTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGGTATCTTGCTAGTTCAATATGAAGTGTAAACTCAATGATTGGGCACCTGTAGTTTACCTACTAGGGCTGGTCAGAAACCTCAAAAGTCTTGAAGATGTTTGGGTGTATGTGTGGCCGACAGAATCATGGTCATGGGCAGCTACCTC
TGTATATTAACACCGAATCGAGGAGATCAAACGATCACCAGTATGCATTTTATGCAAATCTT
>TRINITY_DN41582_c0_g5_i6 from sample A9 / Example unspliced isoform:GTGAATCATTTGAATAAGGGACACCATTTTAATGTTTGGCATCCGAATGACCAACTGAATACGTGTTAGAGAGGAAGGTGGGAGCCATGGATCTTCGATATGTAACTTCAAAAGTGTGGAGACAGTGAAAGTGCATTTGAATTTCGGTGAGTTGCGATTTAGCTGTAAAGAAAAAGAGTAATCTGGTGTTTTCTGAAGAA
AAGAATAGGAAAAGGTCTTAATATATTTGAATTTTCATGTGGGTGTCGTGCCGTGGCAATGTTTTATAAGTGGAGTGGACTGAGATACTTTGATTCTCCACTGCCAAAAGTGCCTTGAAATGAAATTCTCATCTTTTAGGTGTTGATGTTTCACACAATACTCTTTCTCTATCATTTTCCCTCTACACAAAATCTAATTA
TAACTGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTGCTCTGATCTAATTATGACTGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTTCTGCTCTGCTTTTCTACTACATGCCCTCCCATGTTTGATATCCATCGTCATGCCTTCTGCCTCAGCTATTAGTGGGTAGGTTTATGCTTCCATATCCAATCGGTCCTCTTCTCCTTCATGGTGCCT
GATTTTATTCTACTCCTCTGTGTTCTCATCCATGCCTCTCTGATTCTGTCTGGGATTATTGTGGGTGCGGCCATATTGTTGATTGTTTCATTCATCCTTGGCTTTCTGGTCATACTCTGGATGCTTGCATTTGATCTGTATAGGCTACTGTGCTGGGTGGTGCATTATGTGAACACCATAGCTTCCTCTCTGTTCTGGCT
TGTTCTCTTTGTGGTGTCATTGGTGTTTAGAATTGTCATGGGATTTGTGGGGATTGTTACGGGCTGTGTTCATTCAATGATCTCAGAATATGGGCTGTGGGCAGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGG
TTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGGTATTTGATTAACTGTGGTCATTTTGTGTTGAAAATTGGACGGGGTAGGAATCAAATCAGGACCTGCCCATGCCCTCCCACTGAGCTACATGCTTCTTTCTTGACAGGTATCTTGCTAGTTCAATATGAAGgtgtggattgctatt
tccaacattttatgtctcaaactgatatgaccattttttttaaaatcatttagttcttttaatatctgaaattcagtcttacaattttcatagaagcaattttgtatccatgtttcactgcagTGTAAACTCAATGATTGGGCACCTGTAGTTTACCTACTAGGGCTGGTCAGAAACCTCAAAAGTCTTGAAGATGTTTG
GGTGTATGTGTGGCCGACAGAATCATGGTCATGGGCAGCTACCTCTGTATATTAACACCGAATCGAGGAGATCAAACGATCACCAGTATGCATTTTATGCAAATCTTGTAGGCTATTTGCTCCAACTTAAGATATGCCCACTTGTTTTTCTAGTGTATATTTTGTGCTACACATTGTGGAACCCAACTTCTGAGTGAAAT
CTTATGTTGTAAATCTAGATTTATGATATACCTGCATACAACTGAAAACATAAAGGAGAGGGTTAATTGCTCATCCTATCACATTAGTGCGGAACAAACAACTTGCCTCGGAGCAATTAATAAGAGAAATTCCAATGTCAGCCTTCCTGATTTATTGAATTCAAACATGTTTCGGACCATAATTTTCTTCTTTAATATAT
TTTAGATATTGTCTGC
Intron 10 GTATTTGATT ... TTCACTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 50.68 | 18 | 31 | 6 |
| A2 | 42.31 | 15 | 14 | 8 |
| A3 | 53.49 | 10 | 10 | 13 |
| A4 | 43.86 | 16 | 17 | 8 |
| A5 | 58.62 | 6 | 14 | 3 |
| A6 | 44.67 | 122 | 132 | 65 |
| A7 | 50.29 | 85 | 121 | 51 |
| A8 | 49.4 | 105 | 127 | 78 |
| A9 | 48.95 | 97 | 135 | 51 |
| A10 | 51.09 | 90 | 114 | 74 |
>TRINITY_DN43387_c0_g2_i5 from sample A10 / Example spliced isoformTTATTAACATTTCTGATTCTTCTGCTCTGATCTAATTATGACTGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTGCTCTGATCTAATTATGACTGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTTCTGCTCTGCTTTTCTACTACATGCCCTCCCATGTTTGATATCCATCGTCATGCCTTCTGCCTCAGCTATTAGTGGGTAGGTTTATGCT
TCCATATCCAATCGGTCCTCTTCTCCTTCATGGTGCCTGATTTTATTCTACTCCTCTGTGTTCTCATCCATGCCTCTCTGATTCTGTCTGGGATTATTGTGGGTGCGGCCATATTGTTGATTGTTTCATTCATCCTTGGCTTTCTGGTCATACTCTGGATGCTTGCATTTGATCTGTATAGGCTACTGTGCTGGGTGGTG
CATTATGTGAACACCATAGCTTCCTCTCTGTTCTGGCTTGTTCTCTTTGTGGTGTCATTGGTGTTTAGAATTGTCATGGGATTTGTGGGGATTGTTACGGGCTGTGTTCATTCAATGATCTCAGAATATGGGCTGTGGGCAGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTG
TGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGGTTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGTGTAAACTCAATGATTGGGCACCTGTAGTTTACCTACTAGGGCTGGTCAGAAACCTCAAAAGTCTTGAAGATGTTTGGGTGTATGTGTGGCCGACAGAATCATGGTCA
TGGGCAGCTACCTCTGTATATTAACACCGAATCGAGGAGATCAAACGATCACCAGTATGCATTTTATGCAAATCTTGTAGGCTATTTGCTCCAACTTAAGATATGCCCACTTGTTTTTCTAGTGTATATTTTGTGCTACACATTGTGGAACCCAACTTCTGAGTGAAATCTTATGTTGTAAATCTAGATTTATGATATAC
CTGCATACAACTGAAAACATAAAGGAGAGGGTTAATTGCTCATCCTATCACATTAGTGCGGAACAAACAACTTGCCTCGGAGCAATTAATAAGAGAAATTCCAATGTCAGCCTTCCTGATTTATTGAATTCAAACATGTTTCGGACCATAATTTTCTTCTTTAATATATTTTAGATATTGTCTGCAAATGATGGGCCAGA
AAGTTTGAGGTCATGAAGTAGCAACTGCTTTTGAAATTTTAATTGATCGTGGTGGCTTAGGGCCGCTTCCTACTGCTCATCGAATTAAGAATTTATCCCATTTTTTTCTGCTTTTAATTTTTAAATTGAGTTGAATCAAACCTGATACAAAATGGGTGCTCTTTTATCATTTTCAAAAGTCGCTGGTGATTTTTTTGGAA
ACCCCGAAAGTATAATATTACTAAAAGACTG
>TRINITY_DN43387_c0_g2_i4 from sample A10 / Example unspliced isoform:TTATTAACATTTCTGATTCTTCTGCTCTGATCTAATTATGACTGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTGCTCTGATCTAATTATGACTGTTATTAACATTTCTGATTCTTCTTCTGCTCTGCTTTTCTACTACATGCCCTCCCATGTTTGATATCCATCGTCATGCCTTCTGCCTCAGCTATTAGTGGGTAGGTTTATGCT
TCCATATCCAATCGGTCCTCTTCTCCTTCATGGTGCCTGATTTTATTCTACTCCTCTGTGTTCTCATCCATGCCTCTCTGATTCTGTCTGGGATTATTGTGGGTGCGGCCATATTGTTGATTGTTTCATTCATCCTTGGCTTTCTGGTCATACTCTGGATGCTTGCATTTGATCTGTATAGGCTACTGTGCTGGGTGGTG
CATTATGTGAACACCATAGCTTCCTCTCTGTTCTGGCTTGTTCTCTTTGTGGTGTCATTGGTGTTTAGAATTGTCATGGGATTTGTGGGGATTGTTACGGGCTGTGTTCATTCAATGATCTCAGAATATGGGCTGTGGGCAGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTG
TGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGGTTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGgtatttgattaactgtggtcattttgtgttgaaaattggacggggtaggaatcaaatcaggacctgcccatgccctcccactgagctacatgcttctttcttgacagg
tatcttgctagttcaatatgaaggtgtggattgctatttccaacattttatgtctcaaactgatatgaccattttttttaaaatcatttagttcttttaatatctgaaattcagtcttacaattttcatagaagcaattttgtatccatgtttcactgcagTGTAAACTCAATGATTGGGCACCTGTAGTTTACCTACTA
GGGCTGGTCAGAAACCTCAAAAGTCTTGAAGATGTTTGGGTGTATGTGTGGCCGACAGAATCATGGTCATGGGCAGCTACCTCTGTATATTAACACCGAATCGAGGAGATCAAACGATCACCAGTATGCATTTTATGCAAATCTTGTAGGCTATTTGCTCCAACTTAAGATATGCCCACTTGTTTTTCTAGTGTATATTT
TGTGCTACACATTGTGGAACCCAACTTCTGAGTGAAATCTTATGTTGTAAATCTAGATTTATGATATACCTGCATACAACTGAAAACATAAAGGAGAGGGTTAATTGCTCATCCTATCACATTAGTGCGGAACAAACAACTTGCCTCGGAGCAATTAATAAGAGAAATTCCAATGTCAGCCTTCCTGATTTATTGAATTC
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TGAATCAAACCTGATACAAAATGGGTGCTCTTTTATCATTTTCAAAAGTCGCTGGTGATTTTTTTGGAAACCCCGAAAGTATAATATTACTAAAAGACTG
Intron 11 GTGAGTTGCG ... CTGTGGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 73.96 | 15.5 | 0.5 | 44 |
| A2 | 91.07 | 5 | 1 | 51 |
| A3 | 81.19 | 10.5 | 0 | 45.3 |
| A4 | 76.77 | 11.5 | 2.5 | 38 |
| A5 | 80.12 | 5 | 0.7 | 20 |
| A6 | 81.31 | 57 | 4 | 248 |
| A7 | 79.57 | 76 | 8 | 296 |
| A8 | 78.08 | 52.5 | 2.5 | 187 |
| A9 | 77.73 | 62.5 | 9.1 | 218.1 |
| A10 | 75.52 | 83 | 7.1 | 256 |
>TRINITY_DN42399_c0_g1_i4 from sample A7 / Example spliced isoformGGCCAACTGAATACGTGTTAGAGAGGAAGGTGGGAGCCATGGATCTTCGATATGTAACTTCAAAAGTGTGGAGACAGTGAAAGTGCATTTGAATTTCGATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGGTTCATT
CCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATATAAGCAGGTATTTGATTAACTGTGGTCATTTTGTGTTGAAAATTGGACGGGGTAGGAATCAAATCAGGACCTGCCCATGCCCTCCCACTGAGCTACATGCTTCTTTCTTGACAGGTATCTTGCTAGTTCAATATGAAGGTGTGGATTGCTATTTCCAAC
ATTTTATGTCTCAAACTGATATGACCATTTTTTTTAAAATCATTTAGTTCTTTTAATATCTGAAATTCAGTCTTACAATTTTCATAGAAGCAATTTTGTATCCATGTTTCACTGCAGTGTAAACTCAATGATTGGGCACCTGTAGTTTACCTACTAGGGCTGGTCAGAAACCTCAAAAGTCTTGAAGATGTTTGGGTGTA
TGTGTGGCCGACAGAATCATGGTCATGGGCAGCTACCTCTGTATATTAACACCGAATCGAGGAGATCAAACGATCACCAGTATGCATTTTATGCAAATCTTGTAGGCTATTTGCTCCAACTTAAGATATGCCCACTTGTTTTTCTAGTGTATATTTTGTGCTACACATTGTGGAACCCAACTTCTGAGTGAAATCTTATG
TTGTAAATCTAGATTTATGATATACCTGCATACAACTGAAAACATAAAGGAGAGGGTTAATTGCTCATCCTATCACATTAGTGCGGAACAAACAACTTGCCTCGGAGCAATTAATAAGAGAAATTCCAATGTCAGCCTTCCTGATTTATTGAATTCAAACATGTTTCGGACCATAATTTTCTTCTTTAATATATTTTAGA
TATTGTCTGCAAATGATGGGCCAGAAAGTTTGAGGTCATGAAGTAGCAACTGCTTTTGAAATTTTAATTGATCGTGGTGGCTTAGGGCCGCTTCCTACTGCTCATCGAATTAAGAATTTATCCCATTTTTTTCTGCTTTTAATTTTTAAATTGAGTTGAATCAAACCTGATACAAAATGGGTGCTCTTTTATCATTTTCA
AAAGTCGCTGGTGATTTTTTTGGAAACCCCGAAAGTATAATATTACTAAAAGACTGC
>TRINITY_DN42399_c0_g1_i7 from sample A7 / Example unspliced isoform:GGCCAACTGAATACGTGTTAGAGAGGAAGGTGGGAGCCATGGATCTTCGATATGTAACTTCAAAAGTGTGGAGACAGTGAAAGTGCATTTGAATTTCGgtgagttgcgatttagctgtaaagaaaaagagtaatctggtgttttctgaagaaaagaataggaaaaggtcttaatatatttgaattttcatgtgggtgtcg
tgccgtggcaatgttttataagtggagtggactgagatactttgattctccactgccaaaagtgccttgaaatgaaattctcatcttttaggtgttgatgtttcacacaatactctttctctatcattttccctctacacaaaatctaattataactgttattaacatttctgattcttctgctctgatctaattatgac
tgttattaacatttctgattcttcttctgctctgcttttctactacatgccctcccatgtttgatatccatcgtcatgccttctgcctcagctattagtgggtaggtttatgcttccatatccaatcggtcctcttctccttcatggtgcctgattttattctactcctctgtgttctcatccatgcctctctgattctg
tctgggattattgtgggtgcggccatattgttgattgtttcattcatccttggctttctggtcatactctggatgcttgcatttgatctgtataggctactgtgctgggtggtgcattatgtgaacaccatagcttcctctctgttctggcttgttctctttgtggtgtcattggtgtttagaattgtcatgggatttgt
ggggattgttacgggctgtgttcattcaatgatctcagaatatgggctgtgggcagATTACAGCATTTCGAGCGATGGTTCAGACGAATGAATCTCTTACAGCCATCCAAATTGTGGCAGGAGGAAACCCAAATAAGGCCTGCAAATATTGGTTCATTCCAGGTGCCCAAGAGGAAGCGGATCACCTTCTGATTTGATAT
AAGCAGTTATCCTCATGCAGCATCAACTAAACACAATCAAGTTGTGACAGGGAACTTTATGGCAGTTTGCTCCCACAACGAGGCTCATCATGGCAACTGCTATCTGAAGGCAAGACTATGCCTTATGGGGAGTTCTGTGGTTGAGTGTTTCCTTATATTGTTTGCAGGGATGTAGCTCCAGTTTGTTTCACAAATTTTTA
AAGAACATCTGGTCACGGGATCTGAATTGTCAAAAAGATACCTAGGCTATCAAGTAAAGAATATTGCTTTGGAATTAGCTTTTAGCACACCTTGACTGTCATTCATATCTTTTGCACAAGTGTTTCATATAATAAATGATAACATATTACAATGTTAATAAAATTCATCCTCTTCAAG