NA ----> NA
Intron 1 GTAATTGACA ... TTCAGGAGAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 22.7 | 109 | 32 | 32 |
| A2 | 25.24 | 157 | 70 | 36 |
| A3 | 21.5 | 168 | 67 | 25 |
| A4 | 20.88 | 161 | 55 | 30 |
| A5 | 24.65 | 107 | 43 | 27 |
| A6 | 25.22 | 811 | 303 | 244 |
| A7 | 25.33 | 669 | 267 | 187 |
| A8 | 25.57 | 409 | 166 | 115 |
| A9 | 24.43 | 744 | 309 | 172 |
| A10 | 26.84 | 575 | 256 | 166 |
>TRINITY_DN36040_c0_g1_i7 from sample A8 / Example spliced isoformCTCATACCCATTTGAATTACTATCATTATTATTATAATCGTAATTCGAATCGGAAGCAGATCTAGAAATAACAGTCTTACCTAGAAATGTTTAACGATGAGTTAAAAATATAAGGATTCGGATTTAAAGATTGACCGGCTGCTTGTGCCCACGCTCAGGATGGGCGGAATTAGCTGGGGCTGACCCAGGTGAAAGAGAAA
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>TRINITY_DN36040_c0_g1_i6 from sample A8 / Example unspliced isoform:CTCATACCCATTTGAATTACTATCATTATTATTATAATCGTAATTCGAATCGGAAGCAGATCTAGAAATAACAGTCTTACCTAGAAATGTTTAACGATGAGTTAAAAATATAAGGATTCGGATTTAAAGATTGACCGGCTGCTTGTGCCCACGCTCAGGATGGGCGGAATTAGCTGGGGCTGACCCAGGTGAAAGAGAAA
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TTGGGACATCAACAACAATATAGGCTGTTCTATCCATCCTATCTGAGCCTCAAGTTTAGATGATTGGTTAAGGCATTCCAGCTTATTGAATTTTAGCTTCTGGAGTGCCTTTAAGATATTTTTCATTGCCTGCACTATGGAGTGCATGCATATTCTTCATAGTAAGACTGTCATCTGCTTTAAATTTACTGGACGGATAG
GTTTCTATTGATGATTTTGGAATATGAGTAGCTTGGAACTAAATTATGTTTGAGATTTGTGGGGGTTAATTTTGTCATTGGTCATGGGATAGAAAGACTGCAGCACCTTGACTTTCTTTAGACTGTTGCTATAAATTTCACACATGGAGACAGCCTAAATCTCTAAGTTCAGTGGATTTGTATTATATGTTTATCAAAAG
GCGTGTGTTGATGTAAAATTTGTCAGCACACTTTTTGTTTGGATTGTATTGGCATATAGCATTTCTATTGATAACATGTTGTGATCTTTCAAGCATACTTTCTGGTGCAATATGTAATGTGTATTTGCATAATTAACAGAAGGATATAAGCCATGTTTTTATTGGCATGTAGC