sp|Q1PDV6|PBL27_ARATH ----> Serine/threonine-protein kinase PBL27
Intron 1 GCAAGTTATT ... GTTTTGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 28.42 | 34 | 13 | 14 |
| A2 | 38.46 | 16 | 10 | 10 |
| A3 | 35 | 26 | 9 | 19 |
| A4 | 35.65 | 37 | 21 | 20 |
| A5 | 36 | 16 | 6 | 12 |
| A6 | 25.93 | 30 | 7 | 14 |
| A7 | 28.33 | 43 | 16 | 18 |
| A8 | 33.33 | 15 | 3 | 12 |
| A9 | 25.42 | 22 | 1 | 14 |
| A10 | 28.21 | 28 | 5 | 17 |
>TRINITY_DN98726_c0_g1_i1 from sample A4 / Example spliced isoformACTTCCATACTGCGATGTTTTTATCTGTCATTTCAAAGCTACAAACCACTTCTCATCCCCTCCTGGTCCGTCAAAACCGCCCTATGCAGGGTTTTTACACAAAGACCTTGATCTCCAGCACAGAATCCTCCGATTGGTCCCTGATCCATGACCAATTTAGCTCCAATTTCATTACGGATCCTTGGATTTGCGTCATATGG
CGCTGAATTTGATCGTATAACGACCAAGAACGAGGTCCAGACGGCGAATTCTTCGTAATTGAGATAAATTTAGCTAATTGTTGCAATGGTATTAATAGCAGCGGAGCTGATCGTGCCTTTGAATTCGATTTGGTAAGCTTTTCCGCCGGTGGCGAGGGATTCAGGGATCGAATATTGCAATGGGCTGCTTCCCGTGCTTT
GGATCTCGCAAGACAGGTCCAAATCAGCCCGGCCCCGCTGAGAACGAGAGTAGCAGTAAAGAAACCCAAACACTTGCCGGAAAGGGTTCGCGCCTTTCCAGAGTTTCTTCAGAAAGACTAAAGTCAAAGCCTTCAGCTGACAGTAAAAAAGAGGCACCCATATCTATTAAGAATGGCCCCACTGCGAATATTGCTGCTCA
GACTTTTACATTTCGGGAGCTTGCAGCGGCTACCAAGAACTTCAGACCTGAATGTCTCCTTGGTGAAGGAGGCTTTGGACGAGTTTACAAGGGGCGTTTGGAGAGCACTGGCCAGGTTGTGGCTGTCAAACAACTTGATAGAAACGGGCTTCAAGGAAACAGGGAATTTCTTGTAGAAGTTCTTATGCTCAGTCTTCTAC
ATCATCCTAATCTTGTCAACTTGATTGGTTACTGTGCTGAAGGTGATCAGCGGCTTCTTGTCTATGAATATATGCCTTTGGGTTCCTTGGAAGATCATCTTCTTGATGTTCCACTGGATAAGGAACCTTTGGATTGGAACACAAGAATGAAGGTGGCGGCCGGTGCTGCTAAAGGACTGGAGTATTTGCATGATAAAGCA
AATCCACCAGTTATTTACCGTGATTTTAAATCCTCTAACATATTGCTTGATGAGGGGTTTCATCCAAAGTTATCTGATTTCGGGCTTGCCAAACTTGGCCCAGTTGGAGATAAGACACATGTCTCTACAAGAGTGATGGGAACATATGGTTATTGTGCTCCAGAGTACGCCATGACAGGTCAGCTGACTCTCAAGTCTGA
TGTCTACAGTTTTGGTGTGGTTTTCTTGGAGTTAATTACAGGAAGAAAGGCCATCGATAATTCCAGGAGTGCTGGAGAGCAGAACCTTGTGGCTTGGGCACGACCCCTGTTCAAGGATCGCAGGAAGTTTCCTAAAATGGCTGACCCTTTGTTAGAAGGTCGTTATCCAATGCGTGGCTTGTATCAAGCTCTTGCTGTTG
CTGCAATGTGCCTGCAGGAACAAGCTGCTACTCGTCCTCTTATTGGTGATGTGGTGACTGCTCTCTCTTACTTAGCTTCTCAAACATATGAGACTGGTGTACTTCCTCTTAACAGCAGTAAAATTGGTCCCCACCCTGTTAAAGATAAAGATGAGAAGTCAAATGGCAGAAGAGAGGACCAGGATGAAATGGGTGAGAAC
ATGCATGGCGGGTTCCGGTCAGTATCCCAAAACTCTTCTGATTCCCACCACAAGGAAACTGGATGGCAACACCCAGGCTCTGGATCTGAAGTTACAAAGAGTGAAGGATGGGAGTCAGGAAGGCAGTTTGGCTTGGATGATTTAGAGAGACAAGAATTTGAAAGGGACAGCTCTGGTCACAGTGGAAAAGCAAGAGGACA
GAAAAATTTCAATCAAGACCGCCAGCGTGCTGTTGCTGCAGCTAAAGAATGGGGTGAAAACTGGAGAGAGAAGAAGAGAACAAATCAACAGGGTAGTTTTGACGGGGGCATTGGATAGCTAGCTTTTAGTATTATTCATATGGTCAAAGTTATGTTATTTCCATTGCACATCTATTTTTTAGATGATCATGCTTTGATTC
TTATAGCATTAATCAGGTTCATTGATCATGAACCTTACGGAAAAGATTTCGTCTTGTTTGCTGATGAATAGAGAACTGTCTTGGTTTTAGTATTTGGAAATTACTGGGTTAATGCTAGAGAGCTGCTACAGTGGAAGCATGAACTATGTGCAGAGGCTTTGCCTGTTTGGAAACTTTGATTCCCTAGCAATTTAATATCC
AAGGAAGAGCACTCCAAATACATGGCTTGTAACAGAGAAACATTTCACGTGCTTTGTTTATCTGTGCTCATAAACTAGATTAAAGCATCTCAGTTCGAAGGCAGTGGAGAAAAGTTTGATGGACCAGTGGAAAGAACTAGGCAAGTTGATCTAGCGAGTGTTCCTTAAAAACTATGGAGAGAGTACAAGGATTTGAATGT
GATGTGTAATTTTCAACAGTTGAAATTTCATCAGCGAGGTAGGTAAGAACACACTGATCAAGTGCATATTGTAATCAAATTTCATTTATTAAATTATTGCTTATGCAGCATCAAATTTAGAAAATTAATATTTATTTTTGGTACCGACTGAGTTACTTCACTGTTTGGAATCTGTACAATTGTGGGTTGAGGCCCAGTTT
CATTCTCCTATTTCCTTATACTTTATCCGTAGGAATTAGTGAACATTGCCATGTATAATAAAGCAAGCATATATTATTTCAAATTATATAATAATAGTTTATAATGTGA
>TRINITY_DN98726_c0_g1_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:ACTTCCATACTGCGATGTTTTTATCTGTCATTTCAAAGCTACAAACCACTTCTCATCCCCTCCTGGTCCGTCAAAACCGCCCTATGCAGGGTTTTTACACAAAGACCTTGATCTCCAGCACAGAATCCTCCGATTGGTCCCTGATCCATGACCAATTTAGCTCCAATTTCATTACGGATCCTTGGATTTGCGTCATATGG
CGCTGAATTTGATCGTATAACGACCAAGAACGAGGTCCAGACGGCGAATTCTTCGTAATTGAGATAAATTTAGCTAATTGTTGCAATGGTATTAATAGCAGCGGAGCTGATCGTGCCTTTGAATTCGATTTGGTAAGCTTTTCCGCCGGTGGCGAGGGATTCAGGGATCGAATATTGCAATGGGCTGCTTCCCGTGCTTT
GGATCTCGCAAGACAGGTCCAAATCAGCCCGGCCCCGCTGAGAACGAGAGTAGCAGTAAAGAAACCCAAACACTTGCCGGAAAGGGTTCGCGCCTTTCCAGAGTTTCTTCAGAAAGACTAAAGTCAAAGCCTTCAGCTGACAGTAAAAAAGAGGCACCCATATCTATTAAGAATGGCCCCACTGCGAATATTGCTGCTCA
GACTTTTACATTTCGGGAGCTTGCAGCGGCTACCAAGAACTTCAGACCTGAATGTCTCCTTGGTGAAGGAGGCTTTGGACGAGTTTACAAGGGGCGTTTGGAGAGCACTGGCCAGgcaagttattgtagcagattttgttattttggaataacctgtggttttgtagctgcttattatggagacaagcacctgcacacac
atagtgtggaacctgcaattggcactacatctgtcctatttcacaaggtcactgaacttcaactttgaggtttgaacctaaaagaattatcaggttcatcgaacctcatggctgttgactgagttcacatttgtttgttcacctccgttgactaacttctgtagctttgcagcttctagggtttgtgcaacaatttcttt
tcccgatcccttataaaccttgataaacctcatgtcacagcccaagctcatatatatatataaaatttcaaatttgaagcaagcctaatcgttgccgaacctgacctcaaacccaaaccatgtgacttggcctctgtcatctgggttgttgggaattcattctccaagggagttttgtttaccattgtttctttgccttt
ggcaatttggacctcaacttacgggaacttgacttatcatggtctgattttagtgacatagacaaagggtcacattcttgttattcaatttgaatttaaacttttacttacttcattgtctgtgattgcattggttttgaattgttttgacagGTTGTGGCTGTCAAACAACTTGATAGAAACGGGCTTCAAGGAAACAG
GGAATTTCTTGTAGAAGTTCTTATGCTCAGTCTTCTACATCATCCTAATCTTGTCAACTTGATTGGTTACTGTGCTGAAGGTGATCAGCGGCTTCTTGTCTATGAATATATGCCTTTGGGTTCCTTGGAAGATCATCTTCTTGGTTAGCTTTCTAAGCCTGCCAAGCTTTTTATTTATGTACAAATTATTTTCCTCCAAT
GTATGACTTTTTAGTTACTTCCTTGTGCTGTTATTTACAAGTTGAAATTCAGAATCTAGGTTTCTGTAAAGAGTTCTAACTTCTAATGAATAAAATTTGGGTTACCTCGGGGGTTCATTTTCTTGATGTTCCAATATGATGGCTGTAGGGATTTGGTTGTACAAGGAGTAAGGGGATATACGCATAGGAATACAAAGTGC
TATATATTTCACTCATGAAACCTTGAGTGAAAAAGAAGAGTTTGTCCCTATAAAATTTGTTAACAAGAGCAGAAATACCTTCAC
Intron 2 GCAAGTTATT ... GTTTTGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 28.42 | 34 | 13 | 14 |
| A2 | 38.46 | 16 | 10 | 10 |
| A3 | 35 | 26 | 9 | 19 |
| A4 | 35.65 | 37 | 21 | 20 |
| A5 | 36 | 16 | 6 | 12 |
| A6 | 25.93 | 30 | 7 | 14 |
| A7 | 28.33 | 43 | 16 | 18 |
| A8 | 33.33 | 15 | 3 | 12 |
| A9 | 25.42 | 22 | 1 | 14 |
| A10 | 28.21 | 28 | 5 | 17 |
>TRINITY_DN113649_c2_g1_i5 from sample A2 / Example spliced isoformCAGCAATAGTGGAGTAATTGGCATTTATTGACTCATTTTATGTTAAGGGTATTATTCACTTTTAACAGTAGTTTGGTATGCTATTCAATTTATGATTTAAGCTGGTATTTATACTGGATGAGATGTCTTGTATCTTTCCTCAATTGTTAATATGTTTTTTAATTTGTTTTCAATAAAAATGTAGATTTCTGGTAATAGAA
ATGAAATTGTCACACATCTTTTGTTTCTTTGTAATCGCAGAAAGACTAAAGTCAAAGCCTTCAGCTGACAGTAAAAAAGAGGCACCCATATCTATTAAGAATGGGCCCACTGCGAATATTGCTGCTCAGACTTTTACATTTCGGGAGCTTGCAGCGGCTACCAAGAACTTCAGACCTGAATGTCTCCTTGGTGAAGGAGG
CTTTGGACGAGTTTACAAGGGGCGTTTGGAGAGCACTGGCCAGGTTGTGGCTGTCAAACAACTTGATAGAAACGGGCTTCAAGGAAACAGGGAATTTCTTGTAGAAGTTCTTATGCTCAGTCTTCTACATCATCCTAATCTTGTCAACTTGATTGGTTACTGTGCTGAAGGTGATCAGCGGCTTCTTGTCTATGAATATA
TGCCTTTGGGTTCCTTGGAAGATCATCTTCTTGATGTTCCACTGGATAAGGAACCTTTGGATTGGAACACAAGAATGAAGGTGGCGGCCGGTGCTGCTAAAGGACTGGAGTATTTGCATGATAAAGCAAATCCACCAGTTATTTACCGTGATTTTAAATCCTCTAACATATTGCTTGATGAGGGGTTTCATCCAAAGTTA
TCTGATTTCGGGCTTGCCAAACTTGGCCCAGTTGGAGATAAGACACATGTCTCTACAAGAGTGATGGGAACATATGGTTATTGTGCTCCAGAGTACGCCATGACAGGTCAGCTGACTCTCAAGTCTGATGTCTACAGTTTTGGTGTGGTTTTCTTGGAGTTAATTACAGGAAGAAAGGCCATCGATAATTCCAGGAGTGC
TGGAGAGCAGAACCTTGTGGCTTGGGCACGACCCCTGTTCAAGGATCGCAGGAAGTTTCCTAAAATGGCTGACCCTTTGTTAGAAGGTCGTTATCCAATGCGTGGCTTGTATCAAGCTCTTGCTGTTGCTGCAATGTGCCTGCAGGAACAAGCTGCTACTCGTCCTCTTATTGGTGATGTGGTGACTGCTCTCTCTTACT
TAGCTTCTCAAACATATGAGACTGGTGTACTTCCTCTTAACAGCAGTAAAATTGGTCCCCACCCTGTTAAAGATAAAGATGAGAAGTCAAATGGCAGAAGAGAGGACCAGGATGAAATGGGTGAGAACATGCATGGCGGGTTCCGGTCAGTATCCCAAAACTCTTCTGATTCCCACCACAAGGAAACTGGATGGCAACAC
CCAGGCTCTGGATCTGAAGTTACAAAGAGTGAAGGATGGGAGTCAGGAAGGCAGTTTGGCTTGGATGATTTAGAGAGACAAGAATTTGAAAGGGACAGCTCTGGTCACAGTGGAAAAGCAAGAGGACAGAAAAATTTCAATCAAGACCGCCAGCGTGCTGTTGCTGCAGCTAAAGAATGGGGTGAAAACTGGAGAGAGAA
GAAGAGAACAAATCAACAGGGTAGTTTTGACGGGGGCATTGGATAGCTAGCTTTTAGTATTATTCATATGGTCAAAGTTATGTTATTTCCATTGCACATCTATTTTTTAGATGATCATGCTTTGATTCTTATAGCATTAATCAGGTTCATTGATCATGAACCTTACGGAAAAGATTTCGTCTTGTTTGCTGATGAATAGA
GAACTGTCTTGGTTTTAGTATTTGGAAATTACTGGGTTAATGCTAGAGAGCTGCTACAGTGGAAGCATGAACTATGTGCAGAGGCTTTGCCTGTTTGGAAACTTTGATTCCCTAGCAATTTAATATCCAAGGAAGAGCACTCCAAATACATGGCTTGTAACAGAGAAACATTTCACGTGCTTTGTTTATCTGTGCTCATA
AACTAGATTAAAGCATCTCAGTTCGAAGGCAGTGGAGAAAAGTTTGATGGACCAGTGGAAAGAACTAGGCAAGTTGATCTAGCGAGTGTTCCTT
>TRINITY_DN113649_c2_g1_i9 from sample A2 / Example unspliced isoform:CCTCCTGGTCCGTCAAAACCGCCCTATGCAGGGTTTTTACACAAAGACCTTGATCTCCAGCACAGAATCCTCCGATTGGTCCCTGATCCATGACCAATTTAGCTCCAATTTCATTACGGATCCTTGGATTTGCGTCATATGGCGCTGAATTTGATCGTATAACGACCAAGAACGAGGTCCAGACGGCGAATTCTTCGTAA
TTGAGATAAATTTAGCTAATTGTTGCAATGGTATTAATAGCAGCGGAGCTGATCGTGCCTTTGAATTCGATTTGGTAAGCTTTTCCGCCGGTGGCGAGGGATTCAGGGATCGAATATTGCAATGGGCTGCTTCCCGTGCTTTGGATCTCGCAAGACAGGTCCAAATCAGCCCGGCCCCGCTGAGAACGAGAGTAGCAGTA
AAGAAACCCAAACACTTGCCGGAAAGGGTTCGCGCCTTTCCAGAGTTTCTTCAGAAAGACTAAAGTCAAAGCCTTCAGCTGACAGTAAAAAAGAGGCACCCATATCTATTAAGAATGGGCCCACTGCGAATATTGCTGCTCAGACTTTTACATTTCGGGAGCTTGCAGCGGCTACCAAGAACTTCAGACCTGAATGTCTC
CTTGGTGAAGGAGGCTTTGGACGAGTTTACAAGGGGCGTTTGGAGAGCACTGGCCAGgcaagttattgtagcagattttgttattttggaataacctgtggttttgtagctgcttattatggagacaagcacctgcacacacatagtgtggaacctgcaattggcactacatctgtcctatttcacaaggttcactgaac
ttcaactttgaggtttgaacctaaaagaattatcaggttcatcgaacctcatggctgttgactgagttcacatttgtttgttcacctccgttgactaacttctgtagctttgcagcttctagggtttgtgcaacaatttcttttcccgatcccttataaaccttgataaacctcatgtcacagcccaagctcatatatat
atataaaatttcaaatttgaagcaagcctaatcgttgccgaacctgacctcaaacccaaaccatgtgacttggcctctgtcatctgggttgttgggaattcattctccaagggagttttgtttaccattgtttctttgcctttggcaatttggacctcaacttacgggaacttgacttatcatggtctgattttagtgac
atagacaaagggtcacattcttgttattcaatttgaatttaaacttttacttactgcattgtctgtgattgcattggttttgaattgttttgacagGTTGTGGCTGTCAAACAACTTGATAGAAACGGGCTTCAAGGAAACAGGGAATTTCTTGTAGAAGTTCTTATGCTCAGTCTTCTACATCATCCTAATCTTGTCAA
CTTGATTGGTTACTGTGCTGAAGGTGATCAGCGGCTTCTTGTCTATGAATATATGCCTTTGGGTTCCTTGGAAGATCATCTTCTTGATGTTCCACTGGATAAGGAACCTTTGGATTGGAACACAAGAATGAAGGTGGCGGCCGGTGCTGCTAAAGGACTGGAGTATTTGCATGATAAAGCAAATCCACCAGTTATTTACC
GTGATTTTAAATCCTCTAACATATTGCTTGATGAGGGGTTTCATCCAAAGTTATCTGATTTCGGGCTTGCCAAACTTGGCCCAGTTGGAGATAAGACACATGTCTCTACAAGAGTGATGGGAACATATGGTTATTGTGCTCCAGAGTACGCCATGACAGGTCAGCTGACTCTCAAGTCTGATGTCTACAGTTTTGGTGTG
GTTTTCTTGGAGTTAATTACAGGAAGAAAGGCCATCGATAATTCCAGGAGTGCTGGAGAGCAGAACCTTGTGGCTTGGGCACGACCCCTGTTCAAGGATCGCAGGAAGTTTCCTAAAATGGCTGACCCTTTGTTAGAAGGTCGTTATCCAATGCGTGGCTTGTATCAAGCTCTTGCTGTTGCTGCAATGTGCCTGCAGGA
ACAAGCTGCTACTCGTCCTCTTATTGGTGATGTGGTGACTGCTCTCTCTTACTTAGCTTCTCAAACATATGAGACTGGTGTACTTCCTCTTAACAGCAGTAAAATTGGTCCCCACCCTGTTAAAGATAAAGATGAGAAGTCAAATGGCAGAAGAGAGGACCAGGATGAAATGGGTGAGAACATGCATGGCGGGTTCCGGT
CAGTATCCCAAAACTCTTCTGATTCCCACCACAAGGAAACTGGATGGCAACACCCAGGCTCTGGATCTGAAGTTACAAAGAGTGAAGGATGGGAGTCAGGAAGGCAGTTTGGCTTGGATGATTTAGAGAGACAAGAATTTGAAAGGGACAGCTCTGGTCACAGTGGAAAAGCAAGAGGACAGAAAAATTTCAATCAAGAC
CGCCAGCGTGCTGTTGCTGCAGCTAAAGAATGGGGTGAAAACTGGAGAGAGAAGAAGAGAACAAATCAACAGGGTAGTTTTGACGGGGGCATTGGATAGCTAGCTTTTAGTATTATTCATATGGTCAAAGTTATGTTATTTCCATTGCACATCTATTTTTTAGATGATCATGCTTTGATTCTTATAGCATTAATCAGGTT
CATTGATCATGAACCTTACGGAAAAGATTTCGTCTTGTTTGCTGATGAATAGAGAACTGTCTTGGTTTTAGTATTTGGAAATTACTGGGTTAATGCTAGAGAGCTGCTACAGTGGAAGCATGAACTATGTGCAGAGGCTTTGCCTGTTTGGAAACTTTGATTCCCTAGCAATTTAATATCCAAGGAAGAGCACTCCAAAT
ACATGGCTTGTAACAGAGAAACATTTCACGTGCTTTGTTTATCTGTGCTCATAAACTAGATTAAAGCATCTCAGTTCGAAGGCAGTGGAGAAAAGTTTGATGGACCAGTGGAAAGAACTAGGCAAGTTGATCTAGCGAGTGTTCCTT
Intron 3 GTAAATCCTC ... ACTATTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 25.58 | 32 | 13.5 | 11 |
| A2 | 31.25 | 22 | 6.1 | 10 |
| A3 | 20 | 24 | 7.1 | 6 |
| A4 | 10.81 | 33 | 8.5 | 4 |
| A5 | 16.13 | 26 | 6.8 | 5 |
| A6 | 11.11 | 32 | 8.5 | 4 |
| A7 | 19.05 | 85 | 18.6 | 20 |
| A8 | 29.51 | 43 | 10.5 | 18 |
| A9 | 15.69 | 43 | 13.7 | 8 |
| A10 | 15.69 | 43 | 8.6 | 8 |
>TRINITY_DN117109_c1_g2_i2 from sample A1 / Example spliced isoformTGTCATTTCAAAGCTACAAACCACTTCTCATCCCCTCCTGGTCCGTCAAAACCGCCCTATGCAGGGTTTTTACACAAAGACCTTGATCTCCAGCACAGAATCCTCCGATTGGTCCCTGATCCATGACCAATTTAGCTCCAATTTCATTACGGATCCTTGGATTTGCGTCATATGGCGCTGAATTTGATCGTATAACGACC
AAGAACGAGGTCCAGACGGCGAATTCTTCGTAATTGAGATAAATTTAGCTAATTGTTGCAATGGTATTAATAGCAGCGGAGCTGATCGTGCCTTTGAATTCGATTTGGTAAGCTTTTCCGCCGGTGGCGAGGGATTCAGGGATCGAATATTGCAATGGGCTGCTTCCCGTGCTTTGGATCTCGCAAGACAGGTCCAAATC
AGCCCGGCCCCGCTGAGAACGAGAGTAGCAGTAAAGAAACCCAAACACTTGCCGGAAAGGGTTCGCGCCTTTCCAGAGTTTCTTCAGAAAGACTAAAGTCAAAGTCTTCAGCTGACAGTAAAAAAGAGGCACCCATATCTATTAAGAATGGCCCCACTGCGAATATTGCTGCTCAGACTTTTACATTTCGGGAGCTTGCA
GCGGCTACCAAGAACTTCAGACCTGAATGTCTCCTTGGTGAAGGAGGCTTTGGACGAGTTTACAAGGGGCGTTTGGAGAGCACTGGCCAGGTTGTGGCTGTCAAACAACTTGATAGAAACGGGCTTCAAGGAAACAGGGAATTTCTTGTAGAAGTTCTTATGCTCAGTCTTCTACATCATCCTAATCTTGTCAACTTGAT
TGGTTACTGTGCTGAAGGTGATCAGCGGCTTCTTGTCTATGAATATATGCCTTTGGGTTCCTTGGAAGATCATCTTCTTGATGTTCCACTGGATAAGGAACCTTTGGATTGGAACACAAGAATGAAGGTGGCGGCCGGTGCTGCTAAAGGACTGGAGTATTTGCATGATAAAGCAAATCCACCAGTTATTTACCGTGATT
TTAAATCCTCTAACATATTGCTTGATGAGGGGTTTCATCCAAAGTTATCTGATTTCGGGCTTGCCAAACTTGGCCCAGTTGGAGATAAGACACATGTCTCTACAAGAGTGATGGGAACATATGGTTATTGTGCTCCAGAGTACGCCATGACAGGTCAGCTGACTCTCAAGTCTGATGTCTACAGTTTTGGTGTGGTTTTC
TTGGAGTTAATTACAGGAAGAAAGGCCATCGATAATTCCAGGAGTGCTGGAGAGCAGAACCTTGTGGCTTGGGCACGACCCCTGTTCAAGGATCGCAGGAAGTTTCCTAAAATGGCTGACCCTTTGTTAGAAGGTCGTTATCCAATGCGTGGCTTGTATCAAGCTCTTGCTGTTGCTGCAATGTGCCTGCAGGAACAAGC
TGCTACTCGTCCTCTTATTGGTGATGTGGTGACTGCTCTCTCTTACTTAGCTTCTCAAACATATGAGACTGGTGTACTTCCTCTTAACAGCAGTAAAATTGGTCCCCACCCTGTTAAAGATAAAGATGAGAAGTCAAATGGCAGAAGAGAGGACCAGGATGAAATGGGTGAGAACATGCATGGCGGGTTCCGGTCAGTAT
CCCAAAACTCTTCTGATTCCCACCACAAGGAAACTGGATGGCAACACCCAGGCTCTGGATCTGAAGTTACAAAGAGTGAAGGATGGGAGTCAGGAAGGCAGTTTGGCTTGGATGATTTAGAGAGACAAGAATTTGAAAGGGACAGCTCTGGTCACAGTGGAAAAGCAAGAGGACAGAAAAATTTCAATCAAGACCGCCAG
CGTGCTGTTGCTGCAGCTAAAGAATGGGGTGAAAACTGGAGAGAGAAGAAGAGAACAAATCAACAGGGTAGTTTTGACGGGGGCATTGGATAGCTAGCTTTTAGTATTATTCATATGGTCAAAGTTATGTTATTTCCATTGCACATCTATTTTTTAGATGATCATGCTTTGATTCTTATAGCATTAATCAGGTTCATTGA
TCATGAACCTTACGGAAAAGATTTCGTCTTGTTTGCTGATGAATAGAGAACTGTCTTGGTTTTAGTATTTGGAAATTACTGGGTTAATGCTAGAGAGCTGCTACAGTGGAAGCATGAACTATGTGCAGAGGCTTTGCCTGTTTGGAAACTTTGATTCCCTAGCAATTTAATATCCAAGGAAGAGCACTCCAAATACATGG
CTTGTAACAGAGAAACATTTCACGTGCTTTGTTTATCTGTGCTCATAAACTAGATTAAAGCATCTCAGTTCGAAGGCAGTGGAGAAAAGTTTGATGGACCAGTGGAAAGAACTAGGCAAGTTGATCTAGCGAGTGTTCCTTAAAAACTATGGAGAGAGTACAAGGATTTGAATGTGATGTGTAATTTTCAACAGTTGAAA
TTTCATCAGCGAGGTAGGTAAGAACACACTGATCAAGTGCATATTGTAATCAAATTTCATTTATTAAATTATTGCTTATGCAGCATCAAATTTAGAAAATTAATATTTATTTTTGGTACCGACTGAGTTACTTCACTGTTTGGAATCTGTACAATTGTGGGTTGAGGCCCAGTTTCATTCTCCTATTTCCTTATACTTTA
TCCGTAGGAATTAGTGAACATTGCCATGTATAATAAAGCAAGCATATATTATTTCAAATTATATAATAATAGTTTGTAATGTGCTTTGTTTTTCTTTAATATTCCCCCCTGCTATCTGATACGCTTTCGAACAATTATAGAACACATTTTTCAAACGTTTTCAGTGAAATAATATGTTTGACTTACTTGGTCAATGTCTT
TTTAGAAGGCTCTGTTTGGGTGCACTGCTTCAAGAACCAAGAAGCTTGTATTTGGGATATACCAGAAATAGTGGTTGTAAAAACTGGTGAAATTGGACGGTTTTAACAAGTTTTTTGGTGAGGGATCAAGTAAGTTGCATGTTCATGTGAGTTTTTCGTCAAGACTAATCTTTATAA
>TRINITY_DN117109_c1_g2_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:TGTCATTTCAAAGCTACAAACCACTTCTCATCCCCTCCTGGTCCGTCAAAACCGCCCTATGCAGGGTTTTTACACAAAGACCTTGATCTCCAGCACAGAATCCTCCGATTGGTCCCTGATCCATGACCAATTTAGCTCCAATTTCATTACGGATCCTTGGATTTGCGTCATATGGCGCTGAATTTGATCGTATAACGACC
AAGAACGAGGTCCAGACGGCGAATTCTTCGTAATTGAGATAAATTTAGCTAATTGTTGCAATGGTATTAATAGCAGCGGAGCTGATCGTGCCTTTGAATTCGATTTGGTAAGCTTTTCCGCCGGTGGCGAGGGATTCAGGGATCGAATATTGCAATGGGCTGCTTCCCGTGCTTTGGATCTCGCAAGACAGGTCCAAATC
AGCCCGGCCCCGCTGAGAACGAGAGTAGCAGTAAAGAAACCCAAACACTTGCCGGAAAGGGTTCGCGCCTTTCCAGAGTTTCTTCAGAAAGACTAAAGTCAAAGTCTTCAGCTGACAGTAAAAAAGAGGCACCCATATCTATTAAGAATGGCCCCACTGCGAATATTGCTGCTCAGACTTTTACATTTCGGGAGCTTGCA
GCGGCTACCAAGAACTTCAGACCTGAATGTCTCCTTGGTGAAGGAGGCTTTGGACGAGTTTACAAGGGGCGTTTGGAGAGCACTGGCCAGGTTGTGGCTGTCAAACAACTTGATAGAAACGGGCTTCAAGGAAACAGGGAATTTCTTGTAGAAGTTCTTATGCTCAGTCTTCTACATCATCCTAATCTTGTCAACTTGAT
TGGTTACTGTGCTGAAGGTGATCAGCGGCTTCTTGTCTATGAATATATGCCTTTGGGTTCCTTGGAAGATCATCTTCTTGATGTTCCACTGGATAAGGAACCTTTGGATTGGAACACAAGAATGAAGGTGGCGGCCGGTGCTGCTAAAGGACTGGAGTATTTGCATGATAAAGCAAATCCACCAGTTATTTACCGTGATT
TTAAATCCTCTAACATATTGCTTGATGAGGGGTTTCATCCAAAGTTATCTGATTTCGGGCTTGCCAAACTTGGCCCAGTTGGAGATAAGACACATGTCTCTACAAGAGTGATGGGAACATATGGTTATTGTGCTCCAGAGTACGCCATGACAGGTCAGCTGACTCTCAAGTCTGATGTCTACAGTTTTGGTGTGGTTTTC
TTGGAGTTAATTACAGGAAGAAAGGCCATCGATAATTCCAGGAGTGCTGGAGAGCAGAACCTTGTGGCTTGGgtaaatcctcaatctttggtggaaaacttttgtagtgtttttttcaatgaaatatttgagggatggactgaaagttactaaaaatattagaaactgtcagatgtaatggcttctctgtggtatatcat
tctcatctacctcaacgtaactattgcagGCACGACCCCTGTTCAAGGATCGCAGGAAGTTTCCTAAAATGGCTGACCCTTTGTTAGAAGGTCGTTATCCAATGCGTGGCTTGTATCAAGCTCTTGCTGTTGCTGCAATGTGCCTGCAGGAACAAGCTGCTACTCGTCCTCTTATTGGTGATGTGGTGACTGCTCTCTCT
TACTTAGCTTCTCAAACATATGAGACTGGTGTACTTCCTCTTAACAGCAGTAAAATTGGTCCCCACCCTGTTAAAGATAAAGATGAGAAGTCAAATGGCAGAAGAGAGGACCAGGATGAAATGGGTGAGAACATGCATGGCGGGTTCCGGTCAGTATCCCAAAACTCTTCTGATTCCCACCACAAGGAAACTGGATGGCA
ACACCCAGGCTCTGGATCTGAAGTTACAAAGAGTGAAGGATGGGAGTCAGGAAGGCAGTTTGGCTTGGATGATTTAGAGAGACAAGAATTTGAAAGGGACAGCTCTGGTCACAGTGGAAAAGCAAGAGGACAGAAAAATTTCAATCAAGACCGCCAGCGTGCTGTTGCTGCAGCTAAAGAATGGGGTGAAAACTGGAGAG
AGAAGAAGAGAACAAATCAACAGGGTAGTTTTGACGGGGGCATTGGATAGCTAGCTTTTAGTATTATTCATATGGTCAAAGTTATGTTATTTCCATTGCACATCTATTTTTTAGATGATCATGCTTTGATTCTTATAGCATTAATCAGGTTCATTGATCATGAACCTTACGGAAAAGATTTCGTCTTGTTTGCTGATGAA
TAGAGAACTGTCTTGGTTTTAGTATTTGGAAATTACTGGGTTAATGCTAGAGAGCTGCTACAGTGGAAGCATGAACTATGTGCAGAGGCTTTGCCTGTTTGGAAACTTTGATTCCCTAGCAATTTAATATCCAAGGAAGAGCACTCCAAATACATGGCTTGTAACAGAGAAACATTTCACGTGCTTTGTTTATCTGTGCT
CATAAACTAGATTAAAGCATCTCAGTTCGAAGGCAGTGGAGAAAAGTTTGATGGACCAGTGGAAAGAACTAGGCAAGTTGATCTAGCGAGTGTTCCTTAAAAACTATGGAGAGAGTACAAGGATTTGAATGTGATGTGTAATTTTCAACAGTTGAAATTTCATCAGCGAGGTAGGTAAGAACACACTGATCAAGTGCATA
TTGTAATCAAATTTCATTTATTAAATTATTGCTTATGCAGCATCAAATTTAGAAAATTAATATTTATTTTTGGTACCGACTGAGTTACTTCACTGTTTGGAATCTGTACAATTGTGGGTTGAGGCCCAGTTTCATTCTCCTATTTCCTTATACTTTATCCGTAGGAATTAGTGAACATTGCCATGTATAATAAAGCAAGC
ATATATTATTTCAAATTATATAATAATAGTTTGTAATGTGCTTTGTTTTTCTTTAATATTCCCCCCTGCTATCTGATACGCTTTCGAACAATTATAGAACACATTTTTCAAACGTTTTCAGTGAAATAATATGTTTGACTTACTTGGTCAATGTCTTTTTAGAAGGCTCTGTTTGGGTGCACTGCTTCAAGAACCAAGAA
GCTTGTATTTGGGATATACCAGAAATAGTGGTTGTAAAAACTGGTGAAATTGGACGGTTTTAACAAGTTTTTTGGTGAGGGATCAAGTAAGTTGCATGTTCATGTGAGTTTTTCGTCAAGACTAATCTTTATAA