sp|Q9C5D2|FBL4_ARATH ----> F-box/LRR-repeat protein 4
Intron 1 GTGGGTAATC ... GTTGAAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.17 | 70 | 15 | 12 |
| A2 | 15.79 | 64 | 11 | 13 |
| A3 | 25.37 | 50 | 23 | 11 |
| A4 | 10.16 | 84 | 5 | 14 |
| A5 | 23.71 | 37 | 17 | 6 |
| A6 | 12.5 | 42 | 8 | 4 |
| A7 | 13.39 | 55 | 13 | 4 |
| A8 | 11.11 | 16 | 3 | 1 |
| A9 | 14.71 | 58 | 12 | 8 |
| A10 | 6.33 | 37 | 3 | 2 |
>TRINITY_DN119362_c7_g1_i13 from sample A3 / Example spliced isoformAAGAAAATGTTTCATTGGAAATGCATACATAAACTTCAACAAGAATCTAAAAATACCGTCACAAAAGCAAATGACGCATCCGCACAGCTCAGCTCAATTATTTGATCTTCTTAGACAAAAATGGCAGTATAAAACAGGACGGGGGCCAGAAGTACATAAAGGTCTGAACGTTACGTGTCCTTCATACCATCCAATACCCA
GGGTTTCTCAGGACGCACAGTTCCGAATATTTCGTTGGACGTCAAATTGGGGTTTCAGCAGCGTAATCTTTAGCGAATTTGGATTCTGAAAGTTCATTTCGCTTCCTCTCGGCTCGTCGGAGTCAGACATCACAGGGCACTTTCTGCAGTTGTTCAATGCAAGAAAAATCGGATAGTGATGGTTCATATATCCTACAAGA
TTTCCCACTGTAAATTGGTTTTTTGTAGGATTTTGTAATGGCAGAGGCAGTCAATGAAAGCAATTTTTAGCTACTAGAGTTTGCCTTAGTAGCAATAAATTGAAAAGTAGCATTTCTTCTTTGTACACTTCAGCCATACATGCATATTTCTTGTTGCCAACTGTGATTTTTGTAGAGCATTGACCGAATATTCTCTGGTA
TAAGAATTGCCCATTTCTGTGCTACATGATTGTAGCAGGGGCTTTGGAGATTTTCTTGCCTTTTTGACTTTCTTGGCAATGAAAGGCCAGGATCTGATAAACACTATTATTCCGGATGAGGTCCTAATCAAAGTGTTTAGACATTTAGATGGACAGAAGTCAGATAGGGATTCCTGTGCACTTGTCTGCAAGAGATGGTA
TCAGCTGGAAAGTGCAAGCAGGCAGACAATTCGAATAGGGGCTTCGGACAGTCCTGATGGCTGCATAGGTTTGCTAGTCCAGCGCTTCAGTGACCTACGCTGTGTGTACCTGGATGAAAGGCTGCCCGTGTCCCTCAAACAAAATTTTCGTTTTCACCTTGGAATTGGACTAAGGCCAAACAGAACTACTGTTGCTGGAA
GTTCATCATCAAGGCGAACACTTAAAAGAAATCATTCTACAGAGACACATGGAACAGAAGAAGCTGAACTGGAATCCCGAAATCTTTCAGACCTTGGTCTGAATGTTCTTGGTCGGGGTTGTCAAAGACTGGAAAAGCTGAGTTTAATATGGTGCTCTGCAGTCACAAGTTCGGGCCTAACATCAGTGGCTGAGCATTGT
AGGCTTTTGAAGGCCTTAGATTTACAGGGTTGCTATATAGGTGATCAAGGTCTTACTGCTGTAGGAGAACAATGCAAACAACTTGAGGATTTGAATATTCGGTTTTGTGAGGGTTTGACAGACAGAGGTGTGACAGCAATAGCGATTGGCTGTTCGAGGACACTGAAATCCCTTGGCATTGCAGCATGTGCAAGGATAAC
TGATAGTACTATGGAAGCTGTTGGAGTCCACTGTCACTGTCTCGAAAAATTAACTCTGGATTCTGAGTCTGTTAATGATGTTGGATTGTTGGCAATAGCTCAGGGTTGCCCCTCTTTAAAATATTTGCACTTACAGTGTGTAAATGTCACAGATGAAACCTTGAAAGCTGTGGGTCGATTCTGTATCTCACTGAAGACAC
TTATATTATGCAGTTTCCAGAAATATACGGACAGGAGCCTTCAGGCAATAGGAAATGGCTGCAAGACATTAAATGTTCTTTCTTTGAGTGACTGTTACTTTTTAAGTGACCAAAGTTTAGTTGCAATTGCTAATGGATGTGGCGAACTTAGACGGCTTGAATTGAATGGTTGTCACAACATTGGCACTAATGGCCTTGAG
TCCATTGGTCGATATTGCCGGAGGCTCACTGAGCTTGTGGTTAAGTATTGCCAAAATATTGGGGATAGTGCCTTCTTGGAGATCGGAAATGGGTGTACACAATTACAAGCTCTTCATTTGGTTGATTGCTCAAGCATTAGTGATGCTGCAATTTGCTATATAGCAAAAGGCTGCAGAAATTTGAAAAAACTGCATGTGCG
GCGATGTTACAAGGTTGGAGATGAAGGAATGATTGCTGTGGGAAGCAATTGTAGACATCTCACTGACTTGAGTCTTCGGTTTTGTGACAGAATTGGGGATGATGCTCTCATTTCTATTGGGAAAGGCTGTCCTTCTCTATGCCAATTGAATGTTAGTGGTTGCTATCGTGTTGGTGATGTTGGAGTTACTGCTATCTCAA
AAGGCTGCCCTCTTTTAATTCATCTGGATGTTAGTGTGTGTCAGAATGTTGGTGATATGGGACTGGCTGCATTGGGGGAAGGATGCCCATATCTAAAAGACATTGTGCTATCTCATTGTCGGAAAATCACTGATATTGGTCTGGCCTATTTGGTAAAACACTGCACAAAACTTGAATCATGTCATATGGTGTACTGCCCA
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CTAATTCATTGTTTTTAATTCCTTTCGTGCTATGAGGAATCAACAATCATTAGACTTTAAAGACACATTCCATTGTTGTCTTTATTGTTGCAGTTTTAGAGTCTGTAATATTGTAACAGTTCTGTCATTCTAAGGCAGGAAATATGTGTTTCATAGTGAAAACTGTCCATTGATTTCCATACAGCATAATATAATATAGT
TCATTGATTCGTAGGAGAAAATAACATCAGTGTTTGATTCTTCAACACACAATTTACTCTCGAGTCAAAATAAATAGCCG
>TRINITY_DN119362_c7_g1_i8 from sample A3 / Example unspliced isoform:AAGAAAATGTTTCATTGGAAATGCATACATAAACTTCAACAAGAATCTAAAAATACCGTCACAAAAGCAAATGACGCATCCGCACAGCTCAGCTCAATTATTTGATCTTCTTAGACAAAAATGGCAGTATAAAACAGGACGGGGGCCAGAAGTACATAAAGGTCTGAACGTTACGTGTCCTTCATACCATCCAATACCCA
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TTTCCCACTGTAAATTGGTTTTTTGTAGGATTTTGTAATGGCAGAGGCAGTCAATGAAAGCAATTTTTAGCTACTAGAGTTTGCCTTAGTAGCAATAAATTGAAAAGTAGCATTTCTTCTTTGTACACTTCAGCCATACATGCATATTTCTTGTTGCCAACTGTGATTTTTGTAGAGCATTGACCGAATATTCTCTGGTA
TAAGAATTGCCCATTTCTGTGCTACATGATTGTAGCAGGGGCTTTGGAGATTTTCTTGCCTTTTTGACTTTCTTGGCAATGAAAGGCCAGGATCTGATAAACACTATTATTCCGGATGAGGTCCTAATCAAAGTGTTTAGACATTTAGATGGACAGAAGTCAGATAGGGATTCCTGTGCACTTGTCTGCAAGAGATGGTA
TCAGCTGGAAAGTGCAAGCAGGCAGACAATTCGAATAGGGGCTTCGGACAGTCCTGATGGCTGCATAGGTTTGCTAGTCCAGCGCTTCAGTGACCTACGCTGTGTGTACCTGGATGAAAGGCTGCCCGTGTCCCTCAAACAAAATTTTCGTTTTCACCTTGGAATTGGACTAgtgggtaatctttcttataattgcagga
cactaacttaatattcagtgacctttcttgtattctctttctagaagcagtgattgatgtctgtatcagcagagaagtcatgttatacatttgcaaaactttattgatttgcgaaatgtgttaatttgagccatctaaaatagacattatttggatgaccactagcataaggtttgcttgtgtaagttttgcagatgtct
gcaaactatcaactctgatattttgtttgtcattgtaggaatgttgaatggattttaactagcagccattagagaataggatacatattgcagattgcatttcttgtagtagtttctgtcttcgttccatgatttatctgcacagctctggctcagattaattttgttgaaacagAGGCCAAACAGAACTACTGTTGCTG
GAAGTTCATCATCAAGGCGAACACTTAAAAGAAATCATTCTACAGAGACACATGGAACAGAAGAAGCTGAACTGGAATCCCGAAATCTTTCAGACCTTGGTCTGAATGTTCTTGGTCGGGGTTGTCAAAGACTGGAAAAGCTGAGTTTAATATGGTGCTCTGCAGTCACAAGTTCGGGCCTAACATCAGTGGCTGAGCAT
TGTAGGCTTTTGAAGGCCTTAGATTTACAGGGTTGCTATATAGGTGATCAAGGTCTTACTGCTGTAGGAGAACAATGCAAACAACTTGAGGATTTGAATATTCGGTTTTGTGAGGGTTTGACAGACAGAGGTGTGACAGCAATAGCGATTGGCTGTTCGAGGACACTGAAATCCCTTGGCATTGCAGCATGTGCAAGGAT
AACTGATAGTACTATGGAAGCTGTTGGAGTCCACTGTCACTGTCTCGAAAAATTAACTCTGGATTCTGAGTCTGTTAATGATGTTGGATTGTTGGCAATAGCTCAGGGTTGCCCCTCTTTAAAATATTTGCACTTACAGTGTGTAAATGTCACAGATGAAACCTTGAAAGCTGTGGGTCGATTCTGTATCTCACTGAAGA
CACTTATATTATGCAGTTTCCAGAAATATACGGACAGGAGCCTTCAGGCAATAGGAAATGGCTGCAAGACATTAAATGTTCTTTCTTTGAGTGACTGTTACTTTTTAAGTGACCAAAGTTTAGTTGCAATTGCTAATGGATGTGGCGAACTTAGACGGCTTGAATTGAATGGTTGTCACAACATTGGCACTAATGGCCTT
GAGTCCATTGGTCGATATTGCCGGAGGCTCACTGAGCTTGTGGTTAAGTATTGCCAAAATATTGGGGATAGTGCCTTCTTGGAGATCGGAAATGGGTGTACACAATTACAAGCTCTTCATTTGGTTGATTGCTCAAGCATTAGTGATGCTGCAATTTGCTATATAGCAAAAGGCTGCAGAAATTTGAAAAAACTGCATGT
GCGGCGATGTTACAAGGTTGGAGATGAAGGAATGATTGCTGTGGGAAGCAATTGTAGACATCTCACTGACTTGAGTCTTCGGTTTTGTGACAGAATTGGGGATGATGCTCTCATTTCTATTGGGAAAGGCTGTCCTTCTCTATGCCAATTGAATGTTAGTGGTTGCTATCGTGTTGGTGATGTTGGAGTTACTGCTATCT
CAAAAGGCTGCCCTCTTTTAATTCATCTGGATGTTAGTGTGTGTCAGAATGTTGGTGATATGGGACTGGCTGCATTGGGGGAAGGATGCCCATATCTAAAAGACATTGTGCTATCTCATTGTCGGAAAATCACTGATATTGGTCTGGCCTATTTGGTAAAACACTGCACAAAACTTGAATCATGTCATATGGTGTACTGC
CCATCAATAACTGCTGCTGGAGTTGCTACAGTAGTTTCCAGTTGTATAAATATAAGAAAGGTGTTGGTCGAGAAATGGAAAGTCACCCAAAGAACAAGGAGACGTGCTGCCTCAGTGTTAACAGAGCTTTGTTTGGAAGTGTGATGCAGAATTATCACCCACTCCTCGCCCTACACACCCAACCATCAAAATAAGGCCAT
AGTCTAATTCATTGTTTTTAATTCCTTTCGTGCTATGAGGAATCAACAATCATTAGACTTTAAAGACACATTCCATTGTTGTCTTTATTGTTGCAGTTTTAGAGTCTGTAATATTGTAACAGTTCTGTCATTCTAAGGCAGGAAATATGTGTTTCATAGTGAAAACTGTCCATTGATTTCCATACAGCATAATATAATAT
AGTTCATTGATTCGTAGGAGAAAATAACATCAGTGTTTGATTCTTCAACACACAATTTACTCTCGAGTCAAAATAAATAGCCG
Intron 2 GTGGGTAATC ... AGATTTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 66.67 | 28 | 15 | 56 |
| A2 | 64.1 | 28 | 11 | 50 |
| A3 | 54.65 | 39 | 23 | 47 |
| A4 | 72.29 | 23 | 5 | 60 |
| A5 | 48 | 26 | 17 | 24 |
| A6 | 73.2 | 26 | 8 | 71 |
| A7 | 66.96 | 37 | 13 | 75 |
| A8 | 63.33 | 22 | 3 | 38 |
| A9 | 57.69 | 33 | 12 | 45 |
| A10 | 69.09 | 17 | 3 | 38 |
>TRINITY_DN119362_c7_g1_i10 from sample A3 / Example spliced isoformAAGAAAATGTTTCATTGGAAATGCATACATAAACTTCAACAAGAATCTAAAAATACCGTCACAAAAGCAAATGACGCATCCGCACAGCTCAGCTCAATTATTTGATCTTCTTAGACAAAAATGGCAGTATAAAACAGGACGGGGGCCAGAAGTACATAAAGGTCTGAACGTTACGTGTCCTTCATACCATCCAATACCCA
GGGTTTCTCAGGACGCACAGTTCCGAATATTTCGTTGGACGTCAAATTGGGGTTTCAGCAGCGTAATCTTTAGCGAATTTGGATTCTGAAAGTTCATTTCGCTTCCTCTCGGCTCGTCGGAGTCAGACATCACAGGGCACTTTCTGCAGTTGTTCAATGCAAGAAAAATCGGATAGTGATGGTTCATATATCCTACAAGA
TTTCCCACTGTAAATTGGTTTTTTGTAGGATTTTGTAATGGCAGAGGCAGTCAATGAAAGCAATTTTTAGCTACTAGAGTTTGCCTTAGTAGCAATAAATTGAAAAGTAGCATTTCTTCTTTGTACACTTCAGCCATACATGCATATTTCTTGTTGCCAACTGTGATTTTTGTAGAGCATTGACCGAATATTCTCTGGTA
TAAGAATTGCCCATTTCTGTGCTACATGATTGTAGCAGGGGCTTTGGAGATTTTCTTGCCTTTTTGACTTTCTTGGCAATGAAAGGCCAGGATCTGATAAACACTATTATTCCGGATGAGGTCCTAATCAAAGTGTTTAGACATTTAGATGGACAGAAGTCAGATAGGGATTCCTGTGCACTTGTCTGCAAGAGATGGTA
TCAGCTGGAAAGTGCAAGCAGGCAGACAATTCGAATAGGGGCTTCGGACAGTCCTGATGGCTGCATAGGTTTGCTAGTCCAGCGCTTCAGTGACCTACGCTGTGTGTACCTGGATGAAAGGCTGCCCGTGTCCCTCAAACAAAATTTTCGTTTTCACCTTGGAATTGGACTAGGTTGCTATATAGGTGATCAAGGTCTTA
CTGCTGTAGGAGAACAATGCAAACAACTTGAGGATTTGAATATTCGGTTTTGTGAGGGTTTGACAGACAGAGGTGTGACAGCAATAGCGATTGGCTGTTCGAGGACACTGAAATCCCTTGGCATTGCAGCATGTGCAAGGATAACTGATAGTACTATGGAAGCTGTTGGAGTCCACTGTCACTGTCTCGAAAAATTAACT
CTGGATTCTGAGTCTGTTAATGATGTTGGATTGTTGGCAATAGCTCAGGGTTGCCCCTCTTTAAAATATTTGCACTTACAGTGTGTAAATGTCACAGATGAAACCTTGAAAGCTGTGGGTCGATTCTGTATCTCACTGAAGACACTTATATTATGCAGTTTCCAGAAATATACGGACAGGAGCCTTCAGGCAATAGGAAA
TGGCTGCAAGACATTAAATGTTCTTTCTTTGAGTGACTGTTACTTTTTAAGTGACCAAAGTTTAGTTGCAATTGCTAATGGATGTGGCGAACTTAGACGGCTTGAATTGAATGGTTGTCACAACATTGGCACTAATGGCCTTGAGTCCATTGGTCGATATTGCCGG
>TRINITY_DN119362_c7_g1_i8 from sample A3 / Example unspliced isoform:AAGAAAATGTTTCATTGGAAATGCATACATAAACTTCAACAAGAATCTAAAAATACCGTCACAAAAGCAAATGACGCATCCGCACAGCTCAGCTCAATTATTTGATCTTCTTAGACAAAAATGGCAGTATAAAACAGGACGGGGGCCAGAAGTACATAAAGGTCTGAACGTTACGTGTCCTTCATACCATCCAATACCCA
GGGTTTCTCAGGACGCACAGTTCCGAATATTTCGTTGGACGTCAAATTGGGGTTTCAGCAGCGTAATCTTTAGCGAATTTGGATTCTGAAAGTTCATTTCGCTTCCTCTCGGCTCGTCGGAGTCAGACATCACAGGGCACTTTCTGCAGTTGTTCAATGCAAGAAAAATCGGATAGTGATGGTTCATATATCCTACAAGA
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TAAGAATTGCCCATTTCTGTGCTACATGATTGTAGCAGGGGCTTTGGAGATTTTCTTGCCTTTTTGACTTTCTTGGCAATGAAAGGCCAGGATCTGATAAACACTATTATTCCGGATGAGGTCCTAATCAAAGTGTTTAGACATTTAGATGGACAGAAGTCAGATAGGGATTCCTGTGCACTTGTCTGCAAGAGATGGTA
TCAGCTGGAAAGTGCAAGCAGGCAGACAATTCGAATAGGGGCTTCGGACAGTCCTGATGGCTGCATAGGTTTGCTAGTCCAGCGCTTCAGTGACCTACGCTGTGTGTACCTGGATGAAAGGCTGCCCGTGTCCCTCAAACAAAATTTTCGTTTTCACCTTGGAATTGGACTAgtgggtaatctttcttataattgcagga
cactaacttaatattcagtgacctttcttgtattctctttctagaagcagtgattgatgtctgtatcagcagagaagtcatgttatacatttgcaaaactttattgatttgcgaaatgtgttaatttgagccatctaaaatagacattatttggatgaccactagcataaggtttgcttgtgtaagttttgcagatgtct
gcaaactatcaactctgatattttgtttgtcattgtaggaatgttgaatggattttaactagcagccattagagaataggatacatattgcagattgcatttcttgtagtagtttctgtcttcgttccatgatttatctgcacagctctggctcagattaattttgttgaaacagaggccaaacagaactactgttgctg
gaagttcatcatcaaggcgaacacttaaaagaaatcattctacagagacacatggaacagaagaagctgaactggaatcccgaaatctttcagaccttggtctgaatgttcttggtcggggttgtcaaagactggaaaagctgagtttaatatggtgctctgcagtcacaagttcgggcctaacatcagtggctgagcat
tgtaggcttttgaaggccttagatttacagGGTTGCTATATAGGTGATCAAGGTCTTACTGCTGTAGGAGAACAATGCAAACAACTTGAGGATTTGAATATTCGGTTTTGTGAGGGTTTGACAGACAGAGGTGTGACAGCAATAGCGATTGGCTGTTCGAGGACACTGAAATCCCTTGGCATTGCAGCATGTGCAAGGAT
AACTGATAGTACTATGGAAGCTGTTGGAGTCCACTGTCACTGTCTCGAAAAATTAACTCTGGATTCTGAGTCTGTTAATGATGTTGGATTGTTGGCAATAGCTCAGGGTTGCCCCTCTTTAAAATATTTGCACTTACAGTGTGTAAATGTCACAGATGAAACCTTGAAAGCTGTGGGTCGATTCTGTATCTCACTGAAGA
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GAGTCCATTGGTCGATATTGCCGGAGGCTCACTGAGCTTGTGGTTAAGTATTGCCAAAATATTGGGGATAGTGCCTTCTTGGAGATCGGAAATGGGTGTACACAATTACAAGCTCTTCATTTGGTTGATTGCTCAAGCATTAGTGATGCTGCAATTTGCTATATAGCAAAAGGCTGCAGAAATTTGAAAAAACTGCATGT
GCGGCGATGTTACAAGGTTGGAGATGAAGGAATGATTGCTGTGGGAAGCAATTGTAGACATCTCACTGACTTGAGTCTTCGGTTTTGTGACAGAATTGGGGATGATGCTCTCATTTCTATTGGGAAAGGCTGTCCTTCTCTATGCCAATTGAATGTTAGTGGTTGCTATCGTGTTGGTGATGTTGGAGTTACTGCTATCT
CAAAAGGCTGCCCTCTTTTAATTCATCTGGATGTTAGTGTGTGTCAGAATGTTGGTGATATGGGACTGGCTGCATTGGGGGAAGGATGCCCATATCTAAAAGACATTGTGCTATCTCATTGTCGGAAAATCACTGATATTGGTCTGGCCTATTTGGTAAAACACTGCACAAAACTTGAATCATGTCATATGGTGTACTGC
CCATCAATAACTGCTGCTGGAGTTGCTACAGTAGTTTCCAGTTGTATAAATATAAGAAAGGTGTTGGTCGAGAAATGGAAAGTCACCCAAAGAACAAGGAGACGTGCTGCCTCAGTGTTAACAGAGCTTTGTTTGGAAGTGTGATGCAGAATTATCACCCACTCCTCGCCCTACACACCCAACCATCAAAATAAGGCCAT
AGTCTAATTCATTGTTTTTAATTCCTTTCGTGCTATGAGGAATCAACAATCATTAGACTTTAAAGACACATTCCATTGTTGTCTTTATTGTTGCAGTTTTAGAGTCTGTAATATTGTAACAGTTCTGTCATTCTAAGGCAGGAAATATGTGTTTCATAGTGAAAACTGTCCATTGATTTCCATACAGCATAATATAATAT
AGTTCATTGATTCGTAGGAGAAAATAACATCAGTGTTTGATTCTTCAACACACAATTTACTCTCGAGTCAAAATAAATAGCCG