sp|Q6ICW6|WNK11_ARATH ----> Probable serine/threonine-protein kinase WNK11

Intron 1 GTATGTATTT ... GTTGTTTAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	61.59	33.2	34.6	72
A2	66.44	25	33	66
A3	62.84	34	43	72
A4	65.26	37	44	95
A5	56.46	32	23	60
A6	55.63	136	110	231
A7	49.92	157	91	222
A8	53.44	76	52.4	122
A9	54.52	98	76	159
A10	52.99	173	129	261

>TRINITY_DN133546_c1_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

TGGGGTTTCTGCCAGCATATGTAGGAAATGGTGGTAATGATGATGATGACAGGTGGTGTTACCCTTCTGTTTTGCCCATCAAGAGTTGAGAGATCTCTCCCTTGACAGACGAAACAGGATTTCTTGGTCAGAATATTTGTCCTCTCTGACCCTGATTCTGGAGCGAGAATGTTACTAGTTTCTTCAGTAACCCCCAAGGA
AGCAAAGTCTTCCGTCTTTGCCATCTGTTCGTCATCTGAATTCAGGGAAGATCTGCATTTCTTTGTTTTCCTTTAACCCTGAAAGTTTCAGGGTTTCTGTTTATTCAATTGAAATAAACAGTTGGAATTCAGAGGTTAGGGTTTGTTTCTTTTTCCGTTCCATTATAAGGGAGGGGAGAAATGCCTGGTGTAGAATCTGA
CGCCAGTGATAAGGACAGGGAGCCCTTTGTGGAAGTGGATCCTACCGGTAGGTATGGTCGGTATGAAGATGTCCTGGGTCGTGGTGCTATGAAGACGGTATACCGAGCTTTTGATCAGGAAGATGGCATTGAGGTTGCTTGGAACAAGGTCTCTCTGCAAAACCTTGATGATGTTTCCATTCAAAGGATCTATGCAGAAA
TCCGTTTGTTGAATTCTCTCAGGAATCAAAACATCATTATGCTCTACAATGCCTGGTTGAATAAAAATACAGGACATGTGAATTTCATTACTGAGGTTTGCAGCTCGGGTACCCTGAGGCAGTACCGCCAGAAGCACCGGCATGTCTCCATGAGGGCTGTGAGGAATTGGGCACGTCAGATACTGGAGGGGTTGCATTAT
CTGCATAATCACAAG

>TRINITY_DN133546_c1_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TGGGGTTTCTGCCAGCATATGTAGGAAATGGTGGTAATGATGATGATGACAGGTGGTGTTACCCTTCTGTTTTGCCCATCAAGAGTTGAGAGATCTCTCCCTTGACAGACGAAACAGgtatgtatttatgaggggttttctcttgattactgtgtttggaattctgtggagtgcaaggtttcatttcgtttcttttattg
tggttgtttaagGATTTCTTGGTCAGAATATTTGTCCTCTCTGACCCTGATTCTGGAGCGAGAATGTTACTAGTTTCTTCAGTAACCCCCAAGGAAGCAAAGTCTTCCGTCTTTGCCATCTGTTCGTCATCTGAATTCAGGGAAGATCTGCATTTCTTTGTTTTCCTTTAACCCTGAAAGTTTCAGGGTTTCTGTTTATT
CAATTGAAATAAACAGTTGGAATTCAGAGGTTAGGGTTTGTTTCTTTTTCCGTTCCATTATAAGGGAGGGGAGAAATGCCTGGTGTAGAATCTGACGCCAGTGATAAGGACAGGGAGCCCTTTGTGGAAGTGGATCCTACCGGTAGGTATGGTCGGTATGAAGATGTCCTGGGTCGTGGTGCTATGAAGACGGTATACCG
AGCTTTTGATCAGGAAGATGGCATTGAGGTTGCTTGGAACAAGGTCTCTCTGCAAAACCTTGATGATGTTTCCATTCAAAGGATCTATGCAGAAATCCGTTTGTTGAATTCTCTCAGGAATCAAAACATCATTATGCTCTACAATGCCTGGTTGAATAAAAATACAGGACATGTGAATTTCATTACTGAGGTTTGCAGCT
CGGGTACCCTGAGGCAGTACCGCCAGAAGCACCGGCATGTCTCCATGAGGGCTGTGAGGAATTGGGCACGTCAGATACTGGAGGGGTTGCATTATCTGCATAATCACAAG

Intron 2 GTATGTCTTC ... TTTGTTTAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	19.49	79	3	19
A2	8.01	69.1	0	6
A3	19.78	40.6	0	10
A4	17.81	60	0	13
A5	13.45	32.4	1	5
A6	3.26	89.3	0	3
A7	10.97	114.4	0	14
A8	16.37	107.3	1	21
A9	5.59	135.3	0	8
A10	10.97	97.4	0	12

>TRINITY_DN104769_c1_g3_i11 from sample A5 / Example spliced isoform

TTTAAACTTCCCTTTCCATTTTTAGCGGACGAGGAAAAAACAAAAACTGTAATTTTGGAACGCTCCATCAAATCCCATTTTAAACGCCAAACTTAGTTTCGGTGGAAAAAACATACTAAACTTAGTTGTCAAACCTAACCCCGAGAGATGTATTTACTATATATGGAGTTGTCATTAAGCTCGTGTGATTCTCCGTGCTT
GTGACTCTGCAATATTATTGCTTTCTGGGTTTCCCAAACGTGTACCCAATGATCTCAGCATTGCAAAACAGACTGACAAAAAGGATCACGTGGCTCAAAATATTGCAGGAGATTTGTTTCCCGTGATCGGGATCTTCTTCGACAGAGTTTCATCTCTGGAGCGAAAATGCTGTTGGTGTCTTCAGTAACCCCCAAGGAAG
CAAAGTCTTCCGTCTTTGCTATCTGTTCGTCCTCTGAATTCAGGGAACATTTCTATTTCTGTTTCTTTCTTTAGTCATGCAAGGGTTTTTGTGTTCAATTCAAACAACAAGAGGAGCCAAAGTTGCATATTCGAGGTTAGGGTTTGTTTGTTTTTTCTTTTCGTTATAGGAAGAGAAGAAATGGCCGGTGTAGAATATGA
TGTCAGTGATAAGGACAGGGAGCCCTTTGTGGAAGTAGATCCCACTGGCAGGTATGGTCGATATGAAGATGTGCTAGGTCGTGGTGCCATGAAGACGGTGTACCGAGCTTTTGATCAAGAAGATGGTATTGAGGTTGCTTGGAACAAGGCGTGTCTTGAAAACCTCGATGATGTTTCTATACAAAGGATCTATGCAGAAG
TCCGTCTGTTGAAGTCCCTCAGAAAAGAAAATATCATTATGCTCTACAATGCCTGGTTGGATAAAAAGACAAGGTATGTGAATTTCATTACTGAGGTCTGCACCTCGGGGACCCTGAGGCAGTACCGCCAGAAGCACCGGCATGTCTCCATGAAGGCGGTGAAGAATTGGGCGCGCCAGATATTGGAGGGATTGCATTAT
CTTCATAATCATAACCCTTGCATAATTCATAGAGACCTGAATTGCAGCAATATATTCGTGAATGGCAATAGTGGTATTTTGAAGATCGGCGATCTAGGTCTTGCCGCCACCCTGGCAAATGATCATGCTGCGCACACTATCATTGGTACACCGGAATTCATGGCTCCCGAACTATATGAAGAGGATTATAATGAACTTGT
AGATGTTTATTCCTTTGGCATGTGCTTGCTGGAGATGGTTACTCTGGAGATTCCTTATAGCGAGTGCCGTAGTGTTGCTCAGATTTACAAGAAGAATTCCAGTCAATGTCATGAAGATGCTTATTTTCAATAGAACTATACCTGATAAATGTCTGTAGGCCTTGCAATTTAGGTGTTTGTAAACACCGGAAGCAATTCAA
CCAGTGGTGTTACATGCAACAAAGCAGGGCTTTGTTATTGACATGCATGCTTCCCTTCAGATAATTCCTCACTATGTGGAAATGATGATGGATGTCATGATGGAGGGTGGAACTATTGAGCCAGAGGTGTCATTTTTGTTGCAATGAGGTTTGGTAAAAAGGAAGGTAAAGAAGATGAATTATATGGATGGGGAGGAACC
ATTGGGTAACTGTTGGTGCTGCTTTCATCAGGATATGGATATGTAACTTTTGTCAAGCATATTCATAAAATGAATTTCTTACAAACAATGGTATAAATTGTGACTGTACAACAGAGCAACTTGATGATTACTGTGGGGATGTATATGCAAGCCTTTTGGTGTTTAGAATTCAGTCATTGTAATGAAGATCCTTATTTTGA
GGGGAAATGATCAAGATATCATATTTACTGATAGATGGTCTGTAGCCTGTAGGGCTTCCTTTTATGTTACTTACGGTAATCGAAAACTGTGCATAGAGGATATATCATGTTGTAGAAGCAACTAATGAAGTGCAGTTAATAAGATGGGATGACAGTCCCGTGATTGTACATGCACTATTTTATTTCTTCCAAGGAAAACC
TCGAGTAGATCAGTGTGCCTTCCGAAGGGGATTCAAACCAGACACCTGCTGGTATGGAATTAGCCAAATGTCCAGCAAAATCGTTGACAATGGTTGAGCTAGCAAATGTCCAGCAAAATCGTTGACAATGGTTGAGCTAGCCTCTTGAGCTTGCCTTTGTTTAGGTTGTGCCATCTCTGTGTTTAGAAATATGAGAAAGC
T

>TRINITY_DN104769_c1_g3_i4 from sample A5 / Example unspliced isoform:

TGCAAAACAGACTGACAAAAAGgtatgtcttctgcagaaccaggagggttttcaattttctcgcttaacgtgtttaaaactctctgcactacaagggttttcttaatctattgtttgttttgtttaagGATCACGTGGCTCAAAATATTGCAGGAGATTTGTTTCCCGTGATCGGGATCTTCTTCGACAGAGTTTGTTTG
TATTTAGAGAGCTATTTTGTTGGAATATTTAGATTGAATTAAGATTGTGTAGAGATTTTAGATTTTTCCATTTAAATTTATTGGGCGGTTTTCTGAATCTGGGGGCTTTTCCTTTTCAGCATCTCTGGAGCGAAAATGCTGTTGGTGTCTTCAGTAACCCCCAAGGAAGCAAAGTCTTCCGTCTTTGCTATCTGTTCGTC
CTCTGAATTCAGGGAACATTTCTATTTCTGTTTCTTTCTTTAGTCATGCAAGGGTTTTTGTGTTCAATTCAAACAACAAGAGGAGCCAAAGTTGCATATTCGAGGTTAGGGTTTGTTTGTTTTTTCTTTTCGTTATAGGAAGAGAAGAAATGGCCGGTGTAGAATATGATGTCAGTGATAAGGACAGGGAGCCCTTTGTG
GAAGTAGATCCCACTGGCAGGTATGGTCGATATGAAGATGTGCTAGGTCGTGGTGCCATGAAGACGGTGTACCGAGCTTTTGATCAAGAAGATGGTATTGAGGTTGCTTGGAACAAGGCGTGTCTTGAAAACCTCGATGATGTTTCTATACAAAGGATCTATGCAGAAGTCCGTCTGTTGAAGTCCCTCAGAAAAGAAAA
TATCATTATGCTCTACAATGCCTGGTTGGATAAAAAGACAAGGTATGTGAATTTCATTACTGAGGTCTGCACCTCGGGGACCCTGAGGCAGTACCGCCAGAAGCACCGGCATGTCTCCATGAAGGCGGTGAAGAATTGGGCGCGCCAGATATTGGAGGGATTGCATTATCTTCATAATCATAACCCTTGCATAATTCATA
GAGACCTGAATTGCAGCAATATATTCGTGAATGGCAATAGTGGTATTTTGAAGATCGGCGATCTAGGTCTTGCCGCCACCCTGGCAAATGATCATGCTGCGCACACTATCATTGGTACACCGGAATTCATGGCTCCCGAACTATATGAAGAGGATTATAATGAACTTGTAGATGTTTATTCCTTTGGCATGTGCTTGCTG
GAGATGGTTACTCTGGAGATTCCTTATAGCGAGTGCCGTAGTGTTGCTCAGATTTACAAGAAGAATTCCAGTCAATGTCATGAAGATGCTTATTTTCAATAGAACTATACCTGATAAATGTCTGTAGGCCTTGCAATTTAGGTGTTTGTAAACACCGGAAGCAATTCAACCAGTGGTGTTACATGCAACAAAGCAGGGCT
TTGTTATTGACATGCATGCTTCCCTTCAGATAATTCCTCACTATGTGGAAATGATGATGGATGTCATGATGGAGGGTGGAACTATTGAGCCAGAGGTGTCATTTTTGTTGCAATGAGGTTTGGTAAAAAGGAAGGTAAAGAAGATGAATTATATGGATGGGGAGGAACCATTGGGTAACTGTTGGTGCTGCTTTCATCAG
GATATGGATATGTAACTTTTGTCAAGCATATTCATAAAATGAATTTCTTACAAACAATGGTATAAATTGTGACTGTACAACAGAGCAACTTGATGATTACTGTGGGGATGTATATGCAAGCCTTTTGGTGTTTAGAATTCAGTCATTGTAATGAAGATCCTTATTTTGAGGGGAAATGATCAAGATATCATATTTACTGA
TAGATGGTCTGTAGCCTGTAGGGCTTCCTTTTATGTTACTTACGGTAATCGAAAACTGTGCATAGAGGATATATCATGTTGTAGAAGCAACTAATGAAGTGCAGTTAATAAGATGGGATGACAGTCCCGTGATTGTACATGCACTATTTTATTTCTTCCAAGGAAAACCTCGAGTAGATCAGTGTGCCTTCCGAAGGGGA
TTCAAACCAGACACCTGCTGGTATGGAATTAGCCAAATGTCCAGCAAAATCGTTGACAATGGTTGAGCTAGCAAATGTCCAGCAAAATCGTTGACAATGGTTGAGCTAGCCTCTTGAGCTTGCCTTTGTTTAGGTTGTGCCATCTCTGTGTTTAGAAATATGAGAAAGCT

Intron 3 GTTTGTATTT ... TCCTTTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	46.37	98	71.9	98
A2	35.92	79	43	47
A3	46.22	63	56.7	52
A4	40.43	86.4	58.2	60
A5	50.47	40	32.6	49
A6	40.37	108	60.6	87
A7	43.45	130	90.1	111
A8	45.12	99	90	75
A9	35.75	159	103.7	77
A10	42.15	126	87.2	98

>TRINITY_DN104769_c1_g3_i11 from sample A5 / Example spliced isoform

TTTAAACTTCCCTTTCCATTTTTAGCGGACGAGGAAAAAACAAAAACTGTAATTTTGGAACGCTCCATCAAATCCCATTTTAAACGCCAAACTTAGTTTCGGTGGAAAAAACATACTAAACTTAGTTGTCAAACCTAACCCCGAGAGATGTATTTACTATATATGGAGTTGTCATTAAGCTCGTGTGATTCTCCGTGCTT
GTGACTCTGCAATATTATTGCTTTCTGGGTTTCCCAAACGTGTACCCAATGATCTCAGCATTGCAAAACAGACTGACAAAAAGGATCACGTGGCTCAAAATATTGCAGGAGATTTGTTTCCCGTGATCGGGATCTTCTTCGACAGAGTTTCATCTCTGGAGCGAAAATGCTGTTGGTGTCTTCAGTAACCCCCAAGGAAG
CAAAGTCTTCCGTCTTTGCTATCTGTTCGTCCTCTGAATTCAGGGAACATTTCTATTTCTGTTTCTTTCTTTAGTCATGCAAGGGTTTTTGTGTTCAATTCAAACAACAAGAGGAGCCAAAGTTGCATATTCGAGGTTAGGGTTTGTTTGTTTTTTCTTTTCGTTATAGGAAGAGAAGAAATGGCCGGTGTAGAATATGA
TGTCAGTGATAAGGACAGGGAGCCCTTTGTGGAAGTAGATCCCACTGGCAGGTATGGTCGATATGAAGATGTGCTAGGTCGTGGTGCCATGAAGACGGTGTACCGAGCTTTTGATCAAGAAGATGGTATTGAGGTTGCTTGGAACAAGGCGTGTCTTGAAAACCTCGATGATGTTTCTATACAAAGGATCTATGCAGAAG
TCCGTCTGTTGAAGTCCCTCAGAAAAGAAAATATCATTATGCTCTACAATGCCTGGTTGGATAAAAAGACAAGGTATGTGAATTTCATTACTGAGGTCTGCACCTCGGGGACCCTGAGGCAGTACCGCCAGAAGCACCGGCATGTCTCCATGAAGGCGGTGAAGAATTGGGCGCGCCAGATATTGGAGGGATTGCATTAT
CTTCATAATCATAACCCTTGCATAATTCATAGAGACCTGAATTGCAGCAATATATTCGTGAATGGCAATAGTGGTATTTTGAAGATCGGCGATCTAGGTCTTGCCGCCACCCTGGCAAATGATCATGCTGCGCACACTATCATTGGTACACCGGAATTCATGGCTCCCGAACTATATGAAGAGGATTATAATGAACTTGT
AGATGTTTATTCCTTTGGCATGTGCTTGCTGGAGATGGTTACTCTGGAGATTCCTTATAGCGAGTGCCGTAGTGTTGCTCAGATTTACAAGAAGAATTCCAGTCAATGTCATGAAGATGCTTATTTTCAATAGAACTATACCTGATAAATGTCTGTAGGCCTTGCAATTTAGGTGTTTGTAAACACCGGAAGCAATTCAA
CCAGTGGTGTTACATGCAACAAAGCAGGGCTTTGTTATTGACATGCATGCTTCCCTTCAGATAATTCCTCACTATGTGGAAATGATGATGGATGTCATGATGGAGGGTGGAACTATTGAGCCAGAGGTGTCATTTTTGTTGCAATGAGGTTTGGTAAAAAGGAAGGTAAAGAAGATGAATTATATGGATGGGGAGGAACC
ATTGGGTAACTGTTGGTGCTGCTTTCATCAGGATATGGATATGTAACTTTTGTCAAGCATATTCATAAAATGAATTTCTTACAAACAATGGTATAAATTGTGACTGTACAACAGAGCAACTTGATGATTACTGTGGGGATGTATATGCAAGCCTTTTGGTGTTTAGAATTCAGTCATTGTAATGAAGATCCTTATTTTGA
GGGGAAATGATCAAGATATCATATTTACTGATAGATGGTCTGTAGCCTGTAGGGCTTCCTTTTATGTTACTTACGGTAATCGAAAACTGTGCATAGAGGATATATCATGTTGTAGAAGCAACTAATGAAGTGCAGTTAATAAGATGGGATGACAGTCCCGTGATTGTACATGCACTATTTTATTTCTTCCAAGGAAAACC
TCGAGTAGATCAGTGTGCCTTCCGAAGGGGATTCAAACCAGACACCTGCTGGTATGGAATTAGCCAAATGTCCAGCAAAATCGTTGACAATGGTTGAGCTAGCAAATGTCCAGCAAAATCGTTGACAATGGTTGAGCTAGCCTCTTGAGCTTGCCTTTGTTTAGGTTGTGCCATCTCTGTGTTTAGAAATATGAGAAAGC
T

>TRINITY_DN104769_c1_g3_i5 from sample A5 / Example unspliced isoform:

TTTAAACTTCCCTTTCCATTTTTAGCGGACGAGGAAAAAACAAAAACTGTAATTTTGGAACGCTCCATCAAATCCCATTTTAAACGCCAAACTTAGTTTCGGTGGAAAAAACATACTAAACTTAGTTGTCAAACCTAACCCCGAGAGATGTATTTACTATATATGGAGTTGTCATTAAGCTCGTGTGATTCTCCGTGCTT
GTGACTCTGCAATATTATTGCTTTCTGGGTTTCCCAAACGTGTACCCAATGATCTCAGCATTGCAAAACAGACTGACAAAAAGGATCACGTGGCTCAAAATATTGCAGGAGATTTGTTTCCCGTGATCGGGATCTTCTTCGACAGAGTTTgtttgtatttagagagctattttgttggaatatttagattgaattaagat
tgtgtagagattttagatttttccatttaaatttattgggcggttttctgaatctgggggcttttccttttcagCATCTCTGGAGCGAAAATGCTGTTGGTGTCTTCAGTAACCCCCAAGGAAGCAAAGTCTTCCGTCTTTGCTATCTGTTCGTCCTCTGAATTCAGGGAACATTTCTATTTCTGTTTCTTTCTTTAGTC
ATGCAAGGGTTTTTGTGTTCAATTCAAACAACAAGAGGAGCCAAAGTTGCATATTCGAGGTTAGGGTTTGTTTGTTTTTTCTTTTCGTTATAGGAAGAGAAGAAATGGCCGGTGTAGAATATGATGTCAGTGATAAGGACAGGGAGCCCTTTGTGGAAGTAGATCCCACTGGCAGGTATGGTCGATATGAAGATGTGCTA
GGTCGTGGTGCCATGAAGACGGTGTACCGAGCTTTTGATCAAGAAGATGGTATTGAGGTTGCTTGGAACAAGGCGTGTCTTGAAAACCTCGATGATGTTTCTATACAAAGGATCTATGCAGAAGTCCGTCTGTTGAAGTCCCTCAGAAAAGAAAATATCATTATGCTCTACAATGCCTGGTTGGATAAAAAGACAAGGTA
TGTGAATTTCATTACTGAGGTCTGCACCTCGGGGACCCTGAGGCAGTACCGCCAGAAGCACCGGCATGTCTCCATGAAGGCGGTGAAGAATTGGGCGCGCCAGATATTGGAGGGATTGCATTATCTTCATAATCATAACCCTTGCATAATTCATAGAGACCTGAATTGCAGCAATATATTCGTGAATGGCAATAGTGGTA
TTTTGAAGATCGGCGATCTAGGTCTTGCCGCCACCCTGGCAAATGATCATGCTGCGCACACTATCATTGGTACACCGGAATTCATGGCTCCCGAACTATATGAAGAGGATTATAATGAACTTGTAGATGTTTATTCCTTTGGCATGTGCTTGCTGGAGATGGTTACTCTGGAGATTCCTTATAGCGAGTGCCGTAGTGTT
GCTCAGATTTACAAGAAGAATTCCAGTCAATGTCATGAAGATGCTTATTTTCAATAGAACTATACCTGATAAATGGTCTGTAAGACCTCACTTTATGTCATTTATGGAATTAGAAAACAGTACAGAGGATATTATTTTTGGATAATCAGCTGATGAAGTAAACTTAATGAGACAGGATGATGATACTGTGCGAATTGTAC
ATTAAAGTCTGTAGGCCTTGCAATTTAGGCAGAGGATATTATTTTTGGATAATCAGCTGATGAAGTAAACTTAATGAGACAGGATGATGATACTGTGCGAATTGTACATTAAAGTCTGTAGGCCTTGCAATTTAGGTGTTTGTAAACACCGGAAGCAATTCAACCAGTGGTGTTACATGCAACAAAGCAGGGCTTTGTTA
TTGACATGCATGCTTCCCTTCAGATAATTCCTCACTATGTGGAAATGATGATGGATGTCATGATGGAGGGTGGAACTATTGAGCCAGAGGTGTCATTTTTGTTGCAATGAGGTTTGGTAAAAAGGAAGGTAAAGAAGATGAATTATATGGATGGGGAGGAACCATTGGGTAACTGTTGGTGCTGCTTTCATCAGG

Intron 4 GTCTGTAAGA ... TACATTAAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	59.39	11	13.3	19
A2	64.2	12	12.3	31
A3	61.66	10	20.3	12
A4	57.83	7	6.3	13
A5	72.86	2	7.8	3
A6	33.39	16	6.3	10
A7	47.45	25	17.3	28
A8	56.06	16	15	26
A9	39.22	20	16	10
A10	53.58	23	31.5	22

>TRINITY_DN104769_c1_g3_i11 from sample A5 / Example spliced isoform

TTTAAACTTCCCTTTCCATTTTTAGCGGACGAGGAAAAAACAAAAACTGTAATTTTGGAACGCTCCATCAAATCCCATTTTAAACGCCAAACTTAGTTTCGGTGGAAAAAACATACTAAACTTAGTTGTCAAACCTAACCCCGAGAGATGTATTTACTATATATGGAGTTGTCATTAAGCTCGTGTGATTCTCCGTGCTT
GTGACTCTGCAATATTATTGCTTTCTGGGTTTCCCAAACGTGTACCCAATGATCTCAGCATTGCAAAACAGACTGACAAAAAGGATCACGTGGCTCAAAATATTGCAGGAGATTTGTTTCCCGTGATCGGGATCTTCTTCGACAGAGTTTCATCTCTGGAGCGAAAATGCTGTTGGTGTCTTCAGTAACCCCCAAGGAAG
CAAAGTCTTCCGTCTTTGCTATCTGTTCGTCCTCTGAATTCAGGGAACATTTCTATTTCTGTTTCTTTCTTTAGTCATGCAAGGGTTTTTGTGTTCAATTCAAACAACAAGAGGAGCCAAAGTTGCATATTCGAGGTTAGGGTTTGTTTGTTTTTTCTTTTCGTTATAGGAAGAGAAGAAATGGCCGGTGTAGAATATGA
TGTCAGTGATAAGGACAGGGAGCCCTTTGTGGAAGTAGATCCCACTGGCAGGTATGGTCGATATGAAGATGTGCTAGGTCGTGGTGCCATGAAGACGGTGTACCGAGCTTTTGATCAAGAAGATGGTATTGAGGTTGCTTGGAACAAGGCGTGTCTTGAAAACCTCGATGATGTTTCTATACAAAGGATCTATGCAGAAG
TCCGTCTGTTGAAGTCCCTCAGAAAAGAAAATATCATTATGCTCTACAATGCCTGGTTGGATAAAAAGACAAGGTATGTGAATTTCATTACTGAGGTCTGCACCTCGGGGACCCTGAGGCAGTACCGCCAGAAGCACCGGCATGTCTCCATGAAGGCGGTGAAGAATTGGGCGCGCCAGATATTGGAGGGATTGCATTAT
CTTCATAATCATAACCCTTGCATAATTCATAGAGACCTGAATTGCAGCAATATATTCGTGAATGGCAATAGTGGTATTTTGAAGATCGGCGATCTAGGTCTTGCCGCCACCCTGGCAAATGATCATGCTGCGCACACTATCATTGGTACACCGGAATTCATGGCTCCCGAACTATATGAAGAGGATTATAATGAACTTGT
AGATGTTTATTCCTTTGGCATGTGCTTGCTGGAGATGGTTACTCTGGAGATTCCTTATAGCGAGTGCCGTAGTGTTGCTCAGATTTACAAGAAGAATTCCAGTCAATGTCATGAAGATGCTTATTTTCAATAGAACTATACCTGATAAATGTCTGTAGGCCTTGCAATTTAGGTGTTTGTAAACACCGGAAGCAATTCAA
CCAGTGGTGTTACATGCAACAAAGCAGGGCTTTGTTATTGACATGCATGCTTCCCTTCAGATAATTCCTCACTATGTGGAAATGATGATGGATGTCATGATGGAGGGTGGAACTATTGAGCCAGAGGTGTCATTTTTGTTGCAATGAGGTTTGGTAAAAAGGAAGGTAAAGAAGATGAATTATATGGATGGGGAGGAACC
ATTGGGTAACTGTTGGTGCTGCTTTCATCAGGATATGGATATGTAACTTTTGTCAAGCATATTCATAAAATGAATTTCTTACAAACAATGGTATAAATTGTGACTGTACAACAGAGCAACTTGATGATTACTGTGGGGATGTATATGCAAGCCTTTTGGTGTTTAGAATTCAGTCATTGTAATGAAGATCCTTATTTTGA
GGGGAAATGATCAAGATATCATATTTACTGATAGATGGTCTGTAGCCTGTAGGGCTTCCTTTTATGTTACTTACGGTAATCGAAAACTGTGCATAGAGGATATATCATGTTGTAGAAGCAACTAATGAAGTGCAGTTAATAAGATGGGATGACAGTCCCGTGATTGTACATGCACTATTTTATTTCTTCCAAGGAAAACC
TCGAGTAGATCAGTGTGCCTTCCGAAGGGGATTCAAACCAGACACCTGCTGGTATGGAATTAGCCAAATGTCCAGCAAAATCGTTGACAATGGTTGAGCTAGCAAATGTCCAGCAAAATCGTTGACAATGGTTGAGCTAGCCTCTTGAGCTTGCCTTTGTTTAGGTTGTGCCATCTCTGTGTTTAGAAATATGAGAAAGC
T

>TRINITY_DN104769_c1_g3_i20 from sample A5 / Example unspliced isoform:

TTTAAACTTCCCTTTCCATTTTTAGCGGACGAGGAAAAAACAAAAACTGTAATTTTGGAACGCTCCATCAAATCCCATTTTAAACGCCAAACTTAGTTTCGGTGGAAAAAACATACTAAACTTAGTTGTCAAACCTAACCCCGAGAGATGTATTTACTATATATGGAGTTGTCATTAAGCTCGTGTGATTCTCCGTGCTT
GTGACTCTGCAATATTATTGCTTTCTGGGTTTCCCAAACGTGTACCCAATGATCTCAGCATTGCAAAACAGACTGACAAAAAGGATCACGTGGCTCAAAATATTGCAGGAGATTTGTTTCCCGTGATCGGGATCTTCTTCGACAGAGTTTCATCTCTGGAGCGAAAATGCTGTTGGTGTCTTCAGTAACCCCCAAGGAAG
CAAAGTCTTCCGTCTTTGCTATCTGTTCGTCCTCTGAATTCAGGGAACATTTCTATTTCTGTTTCTTTCTTTAGTCATGCAAGGGTTTTTGTGTTCAATTCAAACAACAAGAGGAGCCAAAGTTGCATATTCGAGGTTAGGGTTTGTTTGTTTTTTCTTTTCGTTATAGGAAGAGAAGAAATGGCCGGTGTAGAATATGA
TGTCAGTGATAAGGACAGGGAGCCCTTTGTGGAAGTAGATCCCACTGGCAGGTATGGTCGATATGAAGATGTGCTAGGTCGTGGTGCCATGAAGACGGTGTACCGAGCTTTTGATCAAGAAGATGGTATTGAGGTTGCTTGGAACAAGGCGTGTCTTGAAAACCTCGATGATGTTTCTATACAAAGGATCTATGCAGAAG
TCCGTCTGTTGAAGTCCCTCAGAAAAGAAAATATCATTATGCTCTACAATGCCTGGTTGGATAAAAAGACAAGGTATGTGAATTTCATTACTGAGGTCTGCACCTCGGGGACCCTGAGGCAGTACCGCCAGAAGCACCGGCATGTCTCCATGAAGGCGGTGAAGAATTGGGCGCGCCAGATATTGGAGGGATTGCATTAT
CTTCATAATCATAACCCTTGCATAATTCATAGAGACCTGAATTGCAGCAATATATTCGTGAATGGCAATAGTGGTATTTTGAAGATCGGCGATCTAGGTCTTGCCGCCACCCTGGCAAATGATCATGCTGCGCACACTATCATTGGTACACCGGAATTCATGGCTCCCGAACTATATGAAGAGGATTATAATGAACTTGT
AGATGTTTATTCCTTTGGCATGTGCTTGCTGGAGATGGTTACTCTGGAGATTCCTTATAGCGAGTGCCGTAGTGTTGCTCAGATTTACAAGAAGAATTCCAGTCAATGTCATGAAGATGCTTATTTTCAATAGAACTATACCTGATAAATGgtctgtaagacctcactttatgtcatttatggaattagaaaacagtaca
gaggatattatttttggataatcagctgatgaagtaaacttaatgagacaggatgatgatactgtgcgaattgtacattaaagtctgtaggccttgcaatttaggcagaggatattatttttggataatcagctgatgaagtaaacttaatgagacaggatgatgatactgtgcgaattgtacattaaagTCTGTAGGCC
TTGCAATTTAGGTGTTTGTAAACACCGGAAGCAATTCAACCAGTGGTGTTACATGCAACAAAGCAGGGCTTTGTTATTGACATGCATGCTTCCCTTCAGATAATTCCTCACTATGTGGAAATGATGATGGATGTCATGATGGAGGGTGGAACTATTGAGCCAGAGGTGTCATTTTTGTTGCAATGAGGTTTGGTAAAAAG
GAAGGTAAAGAAGATGAATTATATGGATGGGGAGGAACCATTGGGTAACTGTTGGTGCTGCTTTCATCAGG