NA ----> NA
Intron 1 GTACGTATAA ... GTTTGATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 0 | 6 | 0 | 0 |
| A2 | 46.67 | 4 | 2 | 5 |
| A3 | 28.57 | 5 | 4 | 0 |
| A4 | 11.11 | 4 | 0 | 1 |
| A5 | 23.08 | 5 | 2 | 1 |
| A6 | 28.7 | 39 | 18.4 | 13 |
| A7 | 28.38 | 27 | 14.4 | 7 |
| A8 | 34.71 | 25.4 | 14 | 13 |
| A9 | 29.11 | 28 | 11 | 12 |
| A10 | 45.45 | 9 | 4 | 11 |
>TRINITY_DN31930_c0_g2_i2 from sample A6 / Example spliced isoformAGGGCACGTAGACCATTCAAAAGACAAGCCCAATGAATCTGAGTTGGGCTTGTTTCATAGGTATGTGTTGGTTCCCTTTCCTTCAAACCAGAGGGCGCGTGGACCATTCAAAAGACAAGCTCGGAGAATTTGACTTGGGCTCGATTCATACATATGTGTTGGTTTCTATTGAAGAGAGTGATGGCAAGGTTACATATCTG
CACTAGCCCATCAGATCTCTACTCATGCCAGTATTATACAAATCCCTAATCATTCTCGTGGAAGAGGCTCCGCTCACAAGCAAGGACCCATTCTCCCTCCTTAATGTCACAGCTTGGTATGCGTTGGAGTGCTTGGATTCATCAATAATGGATACGGGAGAATGATAACCTATTTCCTTTTTGTTTTCTTATATATTTTA
CCACACCTCAATGCTCAAACATGTGCTCAGTTACAAGAAGTTTTATTTTGTTTACAAGGACACCATCATATGTTGGTGCTCTCCAACTTTAATCCCTTTAAGTGATGTAAAGTTTTTTCTCTCCATCTATCCTTTGGGATTTGTAGCAACGTTGATTCCTGAGGGTTTAGGTTACAATTGAGACAGAATTGAGAGAGTAA
TTATCTCATGTTCACAGAAATTGTGTTTAAATGCATTGCATAATATTGTGGAGAGAAATATATTTTATGTGTAGAGTAAGTAATGTGTATAGCATAGGTGAGCTTTGAGAACCTATGGAACCACTTGTAGCAAATGCAAAGTCTTGTTGTGTAGTAAATGCAAAGTTTTGTTGTGTTGAGGTGGAGGTGTACAATTGACC
AAGTGCCAAGCTATAGATATGGTTCTCTAACTCTTTAATGTTGGCTGACTATTACCTTCGATACAACATCATAAAAGTATTTATATACAAGCCAATGATATCATAATTGGAC
>TRINITY_DN31930_c0_g2_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:AGGGCACGTAGACCATTCAAAAGACAAGCCCAATGAATCTGAGTTGGGCTTGTTTCATAGGTATGTGTTGGTTCCCTTTCCTTCAAACCAGAGGGCGCGTGGACCATTCAAAAGACAAGCTCGGAGAATTTGACTTGGGCTCGATTCATACATATGTGTTGGTTTCTATTGAAGAGAGTGATGGCAAGGTTACATATCTG
CACTAGCCCATCAGATCTCTACTCATGCCAGTATTATACAAATCCCTAATCATTCTCGTGGAAGAGGCTCCGCTCACAAGCAAGGACCCATTCTCCCTCCTTAATGTCACAGgtacgtataactctaaacagatccgcaaattttaggaggaatccagaacaaatcctaaatttgttgggcattttgggtagaatagaca
aagaagattatgaatctatacatttgagtacatattcttcctatttcgtgtatattctaggttatgtgtctttggtctacagagtaaaaccctagttttcataatcagttaagttgcatcgtgtttgatcagCTTGGTATGCGTTGGAGTGCTTGGATTCATCAATAATGGATACGGGAGAATGATAACCTATTTCCTTT
TTGTTTTCTTATATATTTTACCACACCTCAATGCTCAAACATGTGCTCAGTTACAAGAAGTTTTATTTTGTTTACAAGGACACCATCATATGTTGGTGCTCTCCAACTTTAATCCCTTTAAGTGATGTAAAGTTTTTTCTCTCCATCTATCCTTTGGGATTTGTAGCAACGTTGATTCCTGAGGGTTTAGGTTACAATTG
AGACAGAATTGAGAGAGTAATTATCTCATGTTCACAGAAATTGTGTTTAAATGCATTGCATAATATTGTGGAGAGAAATATATTTTATGTGTAGAGTAAGTAATGTGTATAGCATAGGTGAGCTTTGAGAACCTATGGAACCACTTGTAGCAAATGCAAAGTCTTGTTGTGTAGTAAATGCAAAGTTTTGTTGTGTTGAG
GTGGAGGTGTACAATTGACCAAGTGCCAAGCTATAGATATGGTTCTCTAACTCTTTAATGTTGGCTGACTATTACCTTCGATACAACATCATAAAAGTATTTATATACAAGCCAATGATATCATAATTGGAC