NA ----> NA

Intron 1 GTAAGCCTTG ... TGAAGTTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	74.19	4	12	11
A2	87.88	2	15	14
A3	64.91	10	19	18
A4	86.21	2	17	8
A5	89.47	1	10	7
A6	79.89	63	188	312.7
A7	74.89	40	92	146.7
A8	85.28	27	118	195
A9	80.9	38	112	210
A10	85.53	13	74	79.7

>TRINITY_DN40904_c0_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoform

ATTCGCTTAGTGGAGAGCCAAGCTCTTGGAGCTCTTGGCCGCCATGGAAAAGGAGGCACTTACTCAGAGTTTCAGTTGTTGACTTTACTATGGGTTATGGGGGTCTAATACGCATAAGCATTTTGATGGTTCCAGCGTAGTCATATGAGGAGTTTGGTACCAGGCTGGGGTAGCTCATTGGTTGAACCAACATTGCTTTA
CAAAGGTTTTATACAAAGAGGAAGCCTCGATTGATGAACTAAGGGTTTGACAGAAGAGAAGACATCAAACGCCAGGGTTGAAGCTGCCCTGGTAGCCCTACGGGCACTCTGTAACAGCATTTCTTGTACTGAATAGTTCCGGGCCAAATATTTAGAGGTTGGGGTTTCGTCCATCTTATGAATAAAGAAATGAATACAGT
GTTTCCATAATTTTCGTGTTCTGCTTTATGTAGTTTCTTAGTTTAACCCTTCAGGGTTTTAGTAGCATCAGTTGCAAATTGACTTCCTTTGTAGTTCTGGTGCGCGTAGTTCTGTTATGTTGTTAGATTTATTTTAATGGATTCAGG

>TRINITY_DN40904_c0_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:

ATTCGCTTAGTGGAGAGCCAAGCTCTTGGAGCTCTTGGCCGCCATGGAAAAGGAGGCACTTACTCAGAGTTTCAGTTGTTGACTTTACTATGGGTTATGGGGGTCTAATACGCATAAGCATTTTGATGGTTCCAGCGTAGTCATATGAGGAGTTTGGTACCAGGCTGGGGTAGCTCATTGGTTGAACCAACATTGCTTTA
CAAAGGTTTTATACAAAGAGGAAGCCTCGATTGATGAACTAAGGGTTTGACAGAAGAGAAGACATCAAACGCCAGGGTTGAAGCTGCCCTGgtaagccttgggttgtcctcaactatactgctcgttgcgttgttttaagatggatgtggttctatcctttgcatagggttttcattagatttatggttgtatttctata
atactccaaaacagttgtgaggtgtttgtaacatttgcataagtgttcaattactgcccttaaagtaattatggttggttttgtttgaagtttagGTAGCCCTACGGGCACTCTGTAACAGCATTTCTTGTACTGAATAGTTCCGGGCCAAATATTTAGAGGTTGGGGTTTCGTCCATCTTATGAATAAAGAAATGAATA
CAGTGTTTCCATAATTTTCGTGTTCTGCTTTATGTAGTTTCTTAGTTTAACCCTTCAGGGTTTTAGTAGCATCAGTTGCAAATTGACTTCCTTTGTAGTTCTGGTGCGCGTAGTTCTGTTATGTTGTTAGATTTATTTTAATGGATTCAGG