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Intron 1 GTATGCTTCT ... AGTGATATAG

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>TRINITY_DN125672_c0_g1_i16 from sample A1 / Example spliced isoform
TCTGAGACTATATTGTCGTTTGCCTTAGTATTCTTTCCTACTTTATTTCCTCTTGTATGGATGGAAGTTTGTGCGGTCATGGTTGACCCTGTGTTCTCGAATTCCATGCGGAAATAAGCGCTTCGATTTCGATCCAGGGCGGTCAGGGCTCCAGGCTGCGAGGGAGTCGTCATCGAAGGCAATCAAATTCCTATTTTTTG
CTGTGAATTTTATTTATTTCGGGTTACGAATGGCGAGAAGTTAGCCAGGTAGGGTTGCAGAAGACTGAAGGCCTGTAGAAATGTGTTACGCGGCTGGACTCGAACTTATAACGTGACTCAGGTGAAGATCGAGGCGCAATGGGAAGTACCGGGGAGCCAGAGCGCAAAAGGCGCCATTTGAACTCCATAAGCCCTACTGT
GAAGAAGCAGCCACCCGCTCCCTCTTCGGACGAAAATAAAGTTGATGCAGCAGTTCTTCAGTATCAGAATCAGAAGCTTGCTCAGCAGTTAGAAGCTCAAAGAAGTGAATTTCATGCATTAGAGAGCAAGTTCAATCAATTAAAAAACAAACAGGCTAAATATGATGACACATTGATAGTAGTTAATAGAACTTGGAAAG
AGTTGGTAGATGACTTGGAGTTGCTATCAATACGAGCTGGAGGATGCACAAATGGAGTTAAGGTTTTGGACCTTTCTCAAACTTTGGAAGATGGAAAAAGTGGATCATGTCCTCCAGAAGAGACCTTTTTGTGTCGGATTTTAGAACCCAGTACAACGGAAAGCAAAGTTGCAAATGCTTCTGTCAACATTGTAGAGAAT
GGCCTTCTGACAAGGCGTGAATCCACATTAAAAATAATGGATTATTTATTAAAAGCAATTGATGATCAGCGAGCTAAAAATCAGGAACTGTCCTCTATTCTTTGTGAGAGGCTGACTGAAGATGAAGTTAGAAAACAACTCCAAAGTAATCATGACAACTTAAGGGAAGAGGTCCAGAATTTACGGGCTGCAATGGATGC
ACATCACTTGAAGCATAAGCAATATTCAAATGAGGTTCAAATTCTTCAAGACAGTCATGCAAAGGATCAATCTGAAATAAAACGGTTGATGGGTGAGCTGGAGGAAACGATGGCAGAGCTTGAAGAAAGTAAATGTAAGCTTGCACGTTTGAAATCACAGAAGGATGCATCACTTGGAGCATCTTTCCCAAACATACATT
TAGGAAATAAAAATGACTTAGACAAATCTGGGGATAAGTCGAGAAAATTGAGAGAGATAGAAGCTGCATTGGAAGAACTTAAGACATTAGCGGAAAATCGACTAATAGAGCTCCAAGAAGCACATCAAGAAAAGCTGAAAATTTCACAGCAGATGGATCGCATACAGGACTCTTTAAACAATGAAAAGCACATTCTGTCA
TCTAGACCCTACCTTTTACTGAACGACCAACTTCAACGCCTGAAAGCTGAAGTGGATCATTATCAGTCTGAAGTTGAATCCTTGCAGGCCGAAAGGGATAGTCTTTTGCGTCGTGAGAAGGAAATGAATTTGAAACTTGAATCATCTGAGGTTTCAAGGAGGGCAGCTGCAGTTGCTGATGCTAGAATAGCTGAGTTAGA
GTTGGATTTGCGAGAGTGCATGACTGAAAGAAATTTATTTGAGACCAGGCTTGAAAAGGCTTTACAGGAGTCAGGAAGGAAAGACATCATTGGTGAATTTAAAGTCATGGTTTCAACTCTACATAAAGAGATGGGCATGATGCAAGCACATTTAACTAAATTTAAAGAGACAGCTTTTGAAGTTCATTCGTTGCGGGCGG
AGGTCCATTCCCTCTCAACTATACTTAACAGAAAGTCAAGTGAATACAAAAAACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGGTTACAGATCTAAGAGAGACTGAACAAGAGTTAAAGTTAATTCTGGAGATGTATGGACGGGAAACCACAGATTCAAGGGATGTCATGGAAGCA
AGGCAAGCAGAATGCAAAGCTTGGGCACAAGTGCATAAGCTAAAGTCTGCCCTTGATGAACACAGTTTGGAATTGCGGGTCAAAGCAGCCAATGAAGCTGAGGCAGTCTGCCAACAGAGACTTGCTGTTGCTGAAGCCGAGATAGCTGACTCAAGGCAAAAGCTTGATGCTGCAGAGAGGGACATATTGGAGTTCACTGA
AGCTCTGAGAGCTAAAAATGAAGAAGGAGAAGCCTATATAGCTGAAATTGAGACTATTGGGCAAGCATATGAAGATATGCAAACTCAAAATCAACGATTACTTCAGCAGATAACAGAGAGAGATGATTACAATATCAAGGTGAGTAGCCCATACAAGGCCTTTAAATCTAGAATCAGATCTTGGCTAATTCTTAGAGGGC
TCTAAAATTCAAGAACACCCATAGCCAAGTAGTTCAAGTAAACTGGATGTTGTTTTCATTAATGTTGTTGAATGGTGGATGATTCATTAGAGGGGAAAAGTTGAAAACATTTGATTTTGTATTTTGTTTTGTTTATTTATTTCCTTCCCTATGTTATCAAAACAAAATTTTTGTTTGATTTTCTATATTCTATTTTGCTT
TTGTATGGTGTCTTTTCGGCTTTTAGCTTTTGCATTCTTCTTTATTTATAGTGCATCTTCTATATGATAATCAATATGCTAAAATGTAGTAAAAGGAATTTCGCTTAGGTCATGTTTGAATATTCACAGTGTAATGATAAATCTAGAATCAAATCTTAGCTAATTCTTAGAGGACTTTCAAATTCAAGTTTACCCCAAGT
AATTTAAGAAAGACTACTAGCTGCTGTTTTCCTTTATGTTGTTGAATGGTGGACGTTTCATCTTTTAAAGGGAGAAGATATTTCATTTTATATTTTGTTTTGTTTATTTAGTTCCTTCCATGTGCTGTCAAAACTAAAATTTATTTCAGCTTTTGATTTCTATTTTCAATTTTATTTTATGGTTTCTTTCTAGCTTTTAG
CTTTTTGCATAGTTATTCATTTATAGTGCATCTTCTGTATGACAATCAATACACTAAAATGTAGGAAACAGAATTTATCTTGGCCCATCTTTGACAATATGAATGCAGTCATCTTAATGTAAGCATGATTGCAATACTGGCTACATAGCTCTAGAAGTAGAAACGTCTGCTTAGCAACTGATTAATCTTATCATCATAAA
CACTCTTTTAGAAAATGAAAGTTGGAAGTTCCATAAATAGACAGTTCCATAAATAGATGAAAGTTGGAATTAGTCATTCTTCCAGGGAATTGAAGCTTGATACATAATGTTCTTATCAGGATCTATGACCTTTGCACTTACTTTATGCAAGTTTAAAAATGTTGGGCCACTGCGTACGTCCAGGAATTGCATTAGCCATT
AGCCTAATAATAGGAGGCAAAGTAAAGGATGTACGATTGATAAGAATAGTATCTACTACCATAAATATACAATCTTTCAGAAAACAATCTTTCACTTCTGACATAGGGAACCTGGTTATAAAGCCATGGAACTTATTCCCACTTCTGAATGGATATGTGCAATAGTTATCATAATTCTAGCTAGTCATGCTTTGTCCCCT
TTATCATTGACAGGGTTTACATTCTGCAATCATGTTCCTATTCTCATTTTAATTGCCTTCCAATAAAAGGACTGAAGAAGTTGTAGTATGATCTAAAAACTTTACCTCGTGTCCTTTCGTTATTTGTATTTTTAGCCCTTGATGTTGCAAT


>TRINITY_DN125672_c0_g1_i18 from sample A1 / Example unspliced isoform:
TGTATTATATAAGAATCCTTTTTGATTATATTTATCTCTTTATTTGCCAAACACATAATTGTATAAAATGTGAATTAGAGATTTGTCTGCACATAAAATATAACCATGATTTTTTTCAAAGCAATGTTCTTATTGTTTTGTTGGTGCAACCCAACCATTGCACCATTCTATTGATATTCAGATGGAAAAAGTGGATCATG
TCCTCCAGAAGAGACCTTTTTGTGTCGGATTTTAGAACCCAGTACAACGGAAAGCAAAGTTGCAAATGCTTCTGTCAACATTGTAGAGAATGGCCTTCTGACAAGGCGTGAATCCACATTAAAAATAATGGATTATTTATTAAAAGCAATTGATGATCAGCGAGCTAAAAATCAGGAACTGTCCTCTATTCTTTGTGAGA
GGCTGACTGAAGATGAAGTTAGAAAACAACTCCAAAGTAATCATGACAACTTAAGGGAAGAGGTCCAGAATTTACGGGCTGCAATGGATGCACATCACTTGAAGCATAAGCAATATTCAAATGAGGTTCAAATTCTTCAAGACAGTCATGCAAAGGATCAATCTGAAATAAAACGGTTGATGGGTGAGCTGGAGGAAACG
ATGGCAGAGCTTGAAGAAAGTAAATGTAAGCTTGCACGTTTGAAATCACAGAAGGATGCATCACTTGGAGCATCTTTCCCAAACATACATTTAGGAAATAAAAATGACTTAGACAAATCTGGGGATAAGTCGAGAAAATTGAGAGAGATAGAAGCTGCATTGGAAGAACTTAAGACATTAGCGGAAAATCGACTAATAGA
GCTCCAAGAAGCACATCAAGAAAAGCTGAAAATTTCACAGCAGATGGATCGCATACAGGACTCTTTAAACAATGAAAAGCACATTCTGTCATCTAGACCCTACCTTTTACTGAACGACCAACTTCAACGCCTGAAAGCTGAAGTGGATCATTATCAGTCTGAAGTTGAATCCTTGCAGGCCGAAAGGGATAGTCTTTTGC
GTCGTGAGAAGGAAATGAATTTGAAACTTGAATCATCTGAGGTTTCAAGGAGGGCAGCTGCAGTTGCTGATGCTAGAATAGCTGAGTTAGAGTTGGATTTGCGAGAGTGCATGACTGAAAGAAATTTATTTGAGACCAGGCTTGAAAAGGCTTTACAGGAGTCAGGAAGGAAAGACATCATTGGTGAATTTAAAGTCATG
GTTTCAACTCTACATAAAGAGATGGGCATGATGCAAGCACATTTAACTAAATTTAAAGAGACAGCTTTTGAAGTTCATTCGTTGCGGGCGGAGGTCCATTCCCTCTCAACTATACTTAACAGAAAGTCAAGTGAATACAAAAAACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGgt
atgcttcttcaaaactgcagtgcttaaaagtttcttcattctttggatcattggttcattggcaatttttcttgttgttaatatatagtatggtcataagtgatatagGTTACAGATCTAAGAGAGACTGAACAAGAGTTAAAGTTAATTCTGGAGATGTATGGACGGGAAACCACAGATTCAAGGTATAAATGGAATAA
TTTTTATTTTATTTTATGTTTTTGGACTTGAGTAACTTTTTTGCAATATCTATATCCTGTTACTTTCTAGAGATAGATGGTAGTGCCCATTATGCAGATTTTGTTAGTTGTTCTTATTTAACTTTTTATTGGCTGGTATTGAA



Intron 2 GTATAACTGC ... ACTTTTACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A523.081033
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A813.511632
A925311
A1026.671135



>TRINITY_DN125672_c0_g1_i23 from sample A1 / Example spliced isoform
CTGAAATAAAACGGTTGATGGGTAAGTGATATAATCATCTTTTTCCCTGGCATAAATATAGTATCATATTTCTCGTTTCATTCTGCCATGGAAATATGATATTTAGCAAATCTTAACCCATGCAGCAGATGGTCAAGCTCCAAATCATTTCCAAGGTTCTGATTATCTGTTAAGCTTTGAAAATATTTGAGATGTGAAGA
GTTTTTGTTTGTATGGCCATCCAGGTGAGCTGGAGGAAACGATGGCAGAGCTTGAAGAAAGTAAATGTAAGCTTGCACGTTTGAAATCACAGAAGGATGCATCACTTGGAGCATCTTTCCCAAACATACATTTAGGAAATAAAAATGACTTAGACAAATCTGGGGATAAGTCGAGAAAATTGAGAGAGATAGAAGCTGCA
TTGGAAGAACTTAAGGTACTTATTGGTCTGTGGCAATGTTTCACTTTGTTTACTACTATCATCTATTAACAGTTATCAATCTGGATGTTGGATTACAAGATTAGGAATCTATATCAGAGATATGGATACTGAACATAAAGTCTAAACTGGTTTGGCTTTTATATTTCTTCAGACATTAGCGGAAAATCGACTAATAGAGC
TCCAAGAAGCACATCAAGAAAAGCTGAAAATTTCACAGCAGATGGATCGCATACAGGTTAATGTTTTTGTCAGGACCATAGTACACACTAATGGGGCAAAAAACTATCTGTTTTCTGGTGTATTTTGCATCTGTGCTATGCCACTTCCTAAACATATTTTTATTCATGCTAGTGTTAATATTTTTTGTACCATGCAAAAC
AGGACTCTTTAAACAATGAAAAGCACATTCTGTCATCTAGACCCTACCTTTTACTGAACGACCAACTTCAACGCCTGAAAGCTGAAGTGGATCATTATCAGTCTGAAGTTGAATCCTTGCAGGCCGAAAGGGATAGTCTTTTGCGTCGTGAGAAGGAAATGAATTTGAAACTTGAATCATCTGAGGTTTCAAGGAGGGCA
GCTGCAGTTGCTGATGCTAGAATAGCTGAGTTAGAGTTGGATTTGCGAGAGTGCATGACTGAAAGAAATTTATTTGAGACCAGGCTTGAAAAGGCTTTACAGGAGTCAGGAAGGAAAGACATCATTGGTGAATTTAAAGTCATGGTTTCAACTCTACATAAAGAGATGGGCATGATGCAAGCACATTTAACTAAATTTAA
AGAGACAGCTTTTGAAGTTCATTCGTTGCGGGCGGAGGTCCATTCCCTCTCAACTATACTTAACAGAAAGTCAAGTGAATACAAAAAACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGGT


>TRINITY_DN125672_c0_g1_i14 from sample A1 / Example unspliced isoform:
TCTGAGACTATATTGTCGTTTGCCTTAGTATTCTTTCCTACTTTATTTCCTCTTGTATGGATGGAAGTTTGTGCGGTCATGGTTGACCCTGTGTTCTCGAATTCCATGCGGAAATAAGCGCTTCGATTTCGATCCAGGGCGGTCAGGGCTCCAGGCTGCGAGGGAGTCGTCATCGAAGGCAATCAAATTCCTATTTTTTG
CTGTGAATTTTATTTATTTCGGGTTACGAATGGCGAGAAGTTAGCCAGGTAGGGTTGCAGAAGACTGAAGGCCTGTAGAAATGTGTTACGCGGCTGGACTCGAACTTATAACGTGACTCAGGTGAAGATCGAGGCGCAATGGGAAGTACCGGGGAGCCAGAGCGCAAAAGGCGCCATTTGAACTCCATAAGCCCTACTGT
GAAGAAGCAGCCACCCGCTCCCTCTTCGGACGAAAATAAAGTTGATGCAGCAGTTCTTCAGTATCAGAATCAGAAGCTTGCTCAGCAGTTAGAAGCTCAAAGAAGTGAATTTCATGCATTAGAGAGCAAGTTCAATCAATTAAAAAACAAACAGGCTAAATATGATGACACATTGATAGTAGTTAATAGAACTTGGAAAG
AGTTGGTAGATGACTTGGAGTTGCTATCAATACGAGCTGGAGGATGCACAAATGGAGTTAAGGTTTTGGACCTTTCTCAAACTTTGGAAGATGGAAAAAGTGGATCATGTCCTCCAGAAGAGACCTTTTTGTGTCGGATTTTAGAACCCAGTACAACGGAAAGCAAAGTTGCAAATGCTTCTGTCAACATTGTAGAGAAT
GGCCTTCTGACAAGGCGTGAATCCACATTAAAAATAATGGATTATTTATTAAAAGCAATTGATGATCAGCGAGCTAAAAATCAGGAACTGTCCTCTATTCTTTGTGAGAGGCTGACTGAAGATGAAGTTAGAAAACAACTCCAAAGTAATCATGACAACTTAAGGGAAGAGGTCCAGAATTTACGGGCTGCAATGGATGC
ACATCACTTGAAGCATAAGCAATATTCAAATGAGGTTCAAATTCTTCAAGACAGTCATGCAAAGGATCAATCTGAAATAAAACGGTTGATGGGTGAGCTGGAGGAAACGATGGCAGAGCTTGAAGAAAGTAAATGTAAGCTTGCACGTTTGAAATCACAGAAGGATGCATCACTTGGAGCATCTTTCCCAAACATACATT
TAGGAAATAAAAATGACTTAGACAAATCTGGGGATAAGTCGAGAAAATTGAGAGAGATAGAAGCTGCATTGGAAGAACTTAAGGTACTTATTGGTCTGTGGCAATGTTTCACTTTGTTTACTACTATCATCTATTAACAGTTATCAATCTGGATGTTGGATTACAAGATTAGGAATCTATATCAGAGATATGGATACTGA
ACATAAAGTCTAAACTGGTTTGGCTTTTATATTTCTTCAGACATTAGCGGAAAATCGACTAATAGAGCTCCAAGAAGCACATCAAGAAAAGCTGAAAATTTCACAGCAGATGGATCGCATACAGGTTAATGTTTTTGTCAGGACCATAGTACACACTAATGGGGCAAAAAACTATCTGTTTTCTGGTGTATTTTGCATCT
GTGCTATGCCACTTCCTAAACATATTTTTATTCATGCTAGTGTTAATATTTTTTGTACCATGCAAAACAGGACTCTTTAAACAATGAAAAGCACATTCTGTCATCTAGACCCTACCTTTTACTGAACGACCAACTTCAACGCCTGAAAGCTGAAGTGGATCATTATCAGTCTGAAGTTGAATCCTTGCAGGCCGAAAGGG
ATAGTCTTTTGCGTCGTGAGAAGGAAATGAATTTGAAACTTGAATCATCTGAGGTTTCAAGGAGGGCAGCTGCAGTTGCTGATGCTAGAATAGCTGAGTTAGAGTTGGATTTGCGAGAGTGCATGACTGAAAGAAATTTATTTGAGACCAGGCTTGAAAAGGCTTTACAGGAGTCAGgtataactgctatatagatgctg
tagtgatgcaagcaaattgagatatgatattatcttaggtgctccttttgcattatgtgatcttaaaatggaatctcttaagacaaatgcatttggaacttttacagGAAGGAAAGACATCATTGGTGAATTTAAAGTCATGGTTTCAACTCTACATAAAGAGATGGGCATGATGCAAGCACATTTAACTAAATTTAAAG
AGACAGCTTTTGAAGTTCATTCGTTGCGGGCGGAGGTCCATTCCCTCTCAACTATACTTAACAGAAAGTCAAGTGAATACAAAAAACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGGTTACAGATCTAAGAGAGACTGAACAAGAGTTAAAGTTAATTCTGGAGATGTATGGACGG
GAAACCACAGATTCAAGGGATGTCATGGAAGCAAGGCAAGCAGAATGCAAAGCTTGGGCACAAGTGCATAAGCTAAAGTCTGCCCTTGATGAACACAGTTTGGAATTGCGGGTCAAAGCAGCCAATGAAGCTGAGGCAGTCTGCCAACAGAGACTTGCTGTTGCTGAAGCCGAGATAGCTGACTCAAGGCAAAAGCTTGA
TGCTGCAGAGAGGGACATATTGGAGTTCACTGAAGCTCTGAGAGCTAAAAATGAAGAAGGAGAAGCCTATATAGCTGAAATTGAGACTATTGGGCAAGCATATGAAGATATGCAAACTCAAAATCAACGATTACTTCAGCAGATAACAGAGAGAGATGATTACAATATCAAGCTTGTGTCAGAGAGTGTGAAAACAAAAC
AGGTTCAAAATGCTCTTCTTATGGAGAAACAGCATATGGCAAAGCAATTGCAGCAGGCTGGTACTTCAGCTGAGATGTATAAGCAGAAGATTATGCGCCTTGAAGAACAGGTGAGGGTTTACTTGGATCAAATTGGAAAGGTTACTGAAGATGGTAAGCAGCATGCACTTACGCTAGATAGTACAAAGCGAAAATTGGTA
GATGTAGAGAAAGAGTTACAATCTCTCAAGGTCCGTCTTGAGGCTGTGCAAAAGGAGGCTGAACAGTGCAAACACAGAATTACTGATCTGCAAGTGGAGTTGAAGAATGAGAGGTTTGGGAAAAAGAGACTTGAGGAAGAACTGGTTGCTTTGAACACAAAATTTACGTGCATCAGTTCCCTTAATGATGGTGAAACAGT
TGTAGGAAGACTTCAAGAAGAAATCAAAGAGTACAAGGCAATTTTAAAATGCAGTGTTTGCCATGATAGGCCCAAAGAAGTTGTGATTACCAAGTGCTTCCACTTGTTTTGTGGCCCTTGTATTCAACGAAACTTGGAGACCCGGCACCGCAAATGCCCAGGATGTGGTACAGGTTTTGGACAGAATGATGTGCGGACTG
TATACATATGATTTGCATGGTCAATATAATCTGGTTTTCTAACAATGGAGAACAATGTAGAGGTCTAAGAACAAAGTTGGAGTTTACAACCAGATTTTATTGGTAAAGATGTACCCAAAAATAATTCATTGGGTAGAGCAGGTCCGAGGACATTCTTTTGTGTCTTAAGACCATCTCCTGTTGAAAGTCATGTAAAGTAC
TAACTGAAAACAGTGATTCATGGTTTAGTGTAACCTTCCCCCATTTTAGGAGGGTTTTGTTTTACTGCTAGTCTTTTTTTTCTCTTCCTGACATGCCGAGAACTGGTGTAAATACCATCCATCCTTTATAGTAAAATCTTGGCATTGTAGGTGTAATATGTTTCAGGTTTCAACATTAGACTTGCTGGGGTGGATTTGCT
TGCTCTGTATTGTTATCTGTAACTGACTGCATATTTAACAAATTAATCAAACCAGTTGATGGGATTAAGAAAAACTATTGTACAGACCATTGCTTGTATGAGAGGTGCCATATCCCAAAGGTTGGTCATACTCATTGGAGGCTTCAAGGGAAACTCACCCGGAGCTTTATGATTTCAGAAAAAATGTTCTCTACTTTATG
ATATGATGGTGACTTGTGAGAAACAAGTGTGGAGTTTGTCATACTGTTGCAGAGAATAGCAGTGTTAGAGACACGCATCTTATGCTGCACTCTTGAATCATTGGATCACAGATATTTTGGAAGCTCACGTGAATTAGGGAATTGGTATTGTGACCATAGACCTTTCTTCACAGATCACATTGTAGGGGAACGGGGTCATA
ATTATTTATATGGCTGTTGTCTTTCTCAAAAAATTCCCCATTGTTGCAAGAAAGTACCTTTTTTGATCTTCGTGCTTTCTGGAGAATATGCATATGTGCCCTCGTTTTTGTTTCAAGGTATGATAGTTAATCTTATATCTGGTTGACAAAGTGATTTTATTGTAGATTTTATGTAGTTTGAAGCATTGAGGCTTGTTTGA
TTGTATGGCGATCTTAAAATTTTTACTCATTATGTTACTCCTGAAGTGTTGCCTTGATTTCATGTGAGTCTCTAGAATTGACAAGTTTATAGGAGGTTTGACAATTAGATTTAGTGACCCATTGAGCTATTTGAGAAACTTGTATTCACTGAAGGTTGAGGAAGAAATGCATATATATTGAAAATTCAAATTATGTGTAG
TGGACTGCATTTTCATGAAAATAATTTATGTATATAAGTGTGTGTAGAGTTGCATTGGCAGTTTGTGAAATATATTGGAATTTCTGAAACAGCTAAGTAAATTAAATTCTGAATTTGGAGCTGCATGCTGCAGATAATTGTCCATCTGAAGGTGACATGTACCTGGACAACTGAGCATGTTAGCTTCACACCTGCAAAAA
CCAAATGTAAGTTGTGAGCATTGTGTTCAACTGATTTTCCTACTTGAAGAGGGATCTCCAAACATATTGCAGTTTGCACTTATGCTTTTAGAATCTTAATGAATAAACAGAAATAAAAGAAGTAAAAAATATCCTTGTTTTGACATCAGTGCCATTGGTGAAGAGTTTCTATTTTAGTTTTACTTTATTTATTTAATCAG
TTTATTGTAGTATGCATAGGTCCAACACTACTATATTTTTGTAATGTCTGCAATAAAGCTAGTATCTAACCTTTTTACAGAATAACCCACTGAAAAGATAATTAACAATGTTATGATCTATAATCTTCCAGGAATCATTGATGTGTTTTTTTTTAAATTTAATTTGCAATCCATTTATTTGCATCAGTTGAAATAAGTTC
GACCATCTTTAATCAAGATCTACATAGAAAAATACAACCCAGCATCAGTCAACATGCACCTCAAAACAATTAAAGTCAATCTGGTCATGGGGCAGAATTTATCTGATCTTGTTTCAAACGTTAGTCTGTTTTATGTTAGCATGAAATGAGAATGGAACTGGCCATTTTGTTTTCATAGCATTTATGTACAATGATTTTTA
AGGTCTACATTACAAATTTGTTTTCTCTGGCCCAAGATCTTAATTGATTTTCAGGTTGATTCTATCTACAGACTACAACCACATGGTAACGAGGTCAAGAATGTCACTGGTCCTATTCTTTTCCTATAACAAATTTTGTAATAGGCTCTTAAGTTGTGACTATTATTCTATTTGGGTAAATCCCAAGCACAAAATGACAG
TTTTGTGTGGCTTTGATGTCCTGAAGCCAGGGTTTGTATGATACCATTGAAGTTGATGACTGAGTGTTACTATAATCAACATGTGCATTAGAGAACACTGACCCCGGGAATGTATAATCAGGGGTTGTACATTGCAGAAGGGAGACATCCTTATGTTTTGTTTGTAGCTCTGATAAACTTCTCCAGAGGTACAACTTAAT
GTTCAGTTTTGACGTAGATTTCTAATCTGCTTAGATGTTTTTGTTTGTTAATGTAGTCACTGTCAAATAATTGCTATGGTTATAGTCTCATGCATTGCTTTAGTTGGAGG



Intron 3 GTATGATAGT ... CATGCTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A1050462



>TRINITY_DN44660_c1_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoform
CTTGTATGGATGGAAGTTTGTGCGGTCATGGTTGACCCTGTGTTCTCGAATTCCATGCGGAAATAAGCGCTTCGATTTCGATCCAGGGCGGTCAGGGCTCCAGGCTGCGAGGGAGTCGTCATCGAAGGCAATCAAATTCCTATTTTTTGCTGTGAATTTTATTTATTTCGGGTTACGAATGGCGAGAAGTTAGCCAGGTA
GGGTTGCAGAAGACTGAAGGCCTGTAGAAATGTGTTACGCGGCTGGACTCGAACTTATAACGTGACTCAGGTGAAGATCGAGGCGCAATGGGAAGTACCGGGGAGCCAGAGCGCAAAAGGCGCCATTTGAACTCCATAAGCCCTACTGTGAAGAAGCAGCCACCCGCTCCCTCTTCGGACGAAAATAAAGTTGATGCAGC
AGTTCTTCAGTATCAGAATCAGAAGCTTGCTCAGCAGTTAGAAGCTCAAAGAAGTGAATTTCATGCATTAGAGAGCAAGTTCAATCAATTAAAAAACAAACAGGCTAAATATGATGACACATTGATAGTAGTTAATAGAACTTGGAAAGAGTTGGTAGATGACTTGGAGTTGCTATCAATACGAGCTGGAGGATGCACAA
ATGGAGTTAAGGTTTTGGACCTTTCTCAAACTTTGGAAGATGGAAAAAGTGGATCATGTCCTCCAGAAGAGACCTTTTTGTGTCGGATTTTAGAACCCAGTACAACGGAAAGCAAAGTTGCAAATGCTTCTGTCAACATTGTAGAGAATGGCCTTCTGACAAGGCGTGAATCCACATTAAAAATAATGGATTATTTATTA
AAAGCAATTGATGATCAGCGAGCTAAAAATCAGGAACTGTCCTCTATTCTTTGTGAGAGGCTGACTGAAGATGAAGTTAGAAAACAACTCCAAAGTAATCATGACAACTTAAGGGAAGAGGTCCAGAATTTACGGGCTGCAATGGATGCACATCACTTGAAGCATAAGCAATATTCAAATGAGGTTCAAATTCTTCAAGA
CAGTCATGCAAAGGATCAATCTGAAATAAAACGGTTGATGGGTGAGCTGGAGGAAACGATGGCAGAGCTTGAAGAAAGTAAATGTAAGCTTGCACGTTTGAAATCACAGAAGGATGCATCACTTGGAGCATCTTTCCCAAACATACATTTAGGAAATAAAAATGACTTAGACAAATCTGGGGATAAGTCGAGAAAATTGA
GAGAGATAGAAGCTGCATTGGAAGAACTTAAGACATTAGCGGAAAATCGACTAATAGAGCTCCAAGAAGCACATCAAGAAAAGCTGAAAATTTCACAGCAGATGGATCGCATACAGGACTCTTTAAACAATGAAAAGCACATTCTGTCATCTAGACCCTACCTTTTACTGAACGACCAACTTCAACGCCTGAAAGCTGAA
GTGGATCATTATCAGTCTGAAGTTGAATCCTTGCAGGCCGAAAGGGATAGTCTTTTGCGTCGTGAGAAGGAAATGAATTTGAAACTTGAATCATCTGAGGTTTCAAGGAGGGCAGCTGCAGTTGCTGATGCTAGAATAGCTGAGTTAGAGTTGGATTTGCGAGAGTGCATGACTGAAAGAAATTTATTTGAGACCAGGCT
TGAAAAGGCTTTACAGGAGTCAGGAAGGAAAGACATCATTGGTGAATTTAAAGTCATGGTTTCAACTCTACATAAAGAGATGGGCATGATGCAAGCACATTTAACTAAATTTAAAGAGACAGCTTTTGAAGTTCATTCGTTGCGGGCGGAGGTCCATTCCCTCTCAACTATACTTAACAGAAAGTCAAGTGAATACAAAA
AACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGGTTACAGATCTAAGAGAGACTGAACAAGAGTTAAAGTTAATTCTGGAGATGTATGGACGGGAAACCACAGATTCAAGGGATGTCATGGAAGCAAGGCAAGCAGAATGCAAAGCTTGGGCACAAGTGCATAAGCTAAAGTCTGCC
CTTGATGAACACAGTTTGGAATTGCGGGTCAAAGCAGCCAATGAAGCTGAGGCAGTCTGCCAACAGAGACTTGCTGTTGCTGAAGCCGAGATAGCTGACTCAAGGCAAAAGCTTGATGCTGCAGAGAGGGACATATTGGAGTTCACTGAAGCTCTGAGAGCTAAAAATGAAGAAGGAGAAGCCTATATAGCTGAAATTGA
GACTATTGGGCAAGCATATGAAGATATGCAAACTCAAAATCAACGATTACTTCAGCAGATAACAGAGAGAGATGATTACAATATCAAGCTTGTGTCAGAGAGTGTGAAAACAAAACAGGTTCAAAATGCTCTTCTTATGGAGAAACAGCATATGGCAAAGCAATTGCAGCAGGCTGGTACTTCAGCTGAGATGTATAAGC
AGAAGATTATGCGCCTTGAAGAACAGGTGAGGGTTTACTTGGATCAAATTGGAAAGGTTACTGAAGATGGTAAGCAGCATGCACTTACGCTAGATAGTACAAAGCGAAAATTGGTAGATGTAGAGAAAGAGTTACAATCTCTCAAGGTCCGTCTTGAGGCTGTGCAAAAGGAGGCTGAACAGTGCAAACACAGAATTACT
GATCTGCAAGTGGAGTTGAAGAATGAGAGGTTTGGGAAAAAGAGACTTGAGGAAGAACTGGTTGCTTTGAACACAAAATTTACGTGCATCAGTTCCCTTAATGATGGTGAAACAGTTGTAGGAAGACTTCAAGAAGAAATCAAAGAGTACAAGGCAATTTTAAAATGCAGTGTTTGCCATGATAGGCCCAAAGAAGTTGT
GATTACCAAGTGCTTCCACTTGTTTTGTGGCCCTTGTATTCAACGAAACTTGGAGACCCGGCACCGCAAATGCCCAGGATGTGGTACAGGTTTTGGACAGAATGATGTGCGGACTGTATACATATGATTTGCATGGTCAATATAATCTGGTTTTCTAACAATGGAGAACAATGTAGAGGTCTAAGAACAAAGTTGGAGTT
TACAACCAGATTTTATTGGTAAAGATGTACCCAAAAATAATTCATTGGGTAGAGCAGGTCCGAGGACATTCTTTTGTGTCTTAAGACCATCTCCTGTTGAAAGTCATGTAAAGTACTAACTGAAAACAGTGATTCATGGTTTAGTGTAACCTTCCCCCATTTTAGGAGGGTTTTGTTTTACTGCTAGTCTTTTTTTTCTC
TTCCTGACATGCCGAGAACTGGTGTAAATACCATCCATCCTTTATAGTAAAATCTTGGCATTGTAGGTGTAATATGTTTCAGGTTTCAACATTAGACTTGCTGGGGTGGATTTGCTTGCTCTGTATTGTTATCTGTAACTGACTGCATATTTAACAAATTAATCAAACCAGTTGATGGGATTAAGAAAAACTATTGTACA
GACCATTGCTTGTATGAGAGGTGCCATATCCCAAAGGTTGGTCATACTCATTGGAGGCTTCAAGGGAAACTCACCCGGAGCTTTATGATTTCAGAAAAAATGTTCTCTACTTTATGATATGATGGTGACTTGTGAGAAACAAGTGTGGAGTTTGTCATACTGTTGCAGAGAATAGCAGTGTTAGAGACACGCATCTTATG
CTGCACTCTTGAATCATTGGATCACAGATATTTTGGAAGCTCACGTGAATTAGGGAATTGGTATTGTGACCATAGACCTTTCTTCACAGATCACATTGTAGGGGAACGGGGTCATAATTATTTATATGGCTGTTGTCTTTCTCAAAAAAATTCCCCATTGTTGCAAGAAAGTACCTTTTTTGATCTTCGTGCTTTCTGGA
GAATATGCATATGTGCCCTCGTTTTTGTTTCAAGATAATTGTCCATCTGAAGGTGACATGTACCTGGACAACTGAGCATGTTAGCTTCACACCTGCAAAAACCAAATGTTGATTCTATCTACAGACTACAACCACATGGTAACGAGGTCAAGAATGTCACTGGTCCTATTCTTTTCCTATAACAAATTTTGTAATAGGCT
CTTAAGTTGTGACTATTATTCTATTTGGGTAAATCCCAAGCACAAAATGACAGTTTTGTGTGGCTTTGATGTCCTGAAGCCAGGGTTTGTATGATACCATTGAAGTTGATGACTGAGTGTTACTATAATCAACATGTGCATTAGAGAACACTGACCCCGGGAATGTATAATCAGGGGTTGTACATTGCAGAAGGGAGACA
TCCTTATGTTTTGTTTGTAGCTCTGATAAACTTCTCCAGAGGTACAACTTAATGTTCAGTTTTGACGTAGATTTCTAATCTGCTTAGATGTTTTTGTTTGTTAATGTAGTCACTGTCAAATAATTGCTATGGTTATAGTCTCATGCATTGCTTTAGTTGGAGGGCTAATAAGTGCAGGTGGCCAATTTCAATAACCAGTG
CATTGCTTTGTGGAAGCGTGCATACCACAAAAGTATATTGGATCCCACTTCAACAGGAACTATTCCATCGTGGTGATCAGTGATAGATCTGGTGGAAGGTAATTTATGGAAAAGATCCTGGAGTAAACATGTCAATTCTCTGACCTGATTCACTTCACTGAAGACTATTCTCTGACGAGCTATATATTGATGTGTCTTTA
ATAGCTACCTCACTAACATGGTATTTTAAACTCAACTATAGATTTCATCACAATCTTTCATTTTGTACAACAGTTGATGCTACAAGATTGTGTAAATTGCTGAGAATGTCTGTACTTGAGCTACGATTGATTTATGAGCTTGCGAACTTTTGTAGCTTGGATCCCATTTCAGCAGGAACTATTCTGTGGTGATCAGTGAT
AGATTTGGTGAAAGAGTAATTTATGAAAAGAGCCTGGAGTAAACATGTCATGTCCCTGGCCTGATTGACTTCTGACATGCTATGTTGATGTGCCTTTGGTAGCTACTTGACTAACATAGTTTTTAAAATTCAGCTCTAGATTTCATCTCTAAACTCAACTCTAGATTGCATCACAATCTTTCATTTTGTACGACAGTTGC
TCATAAAAGATTGTGGAAATTTCTG


>TRINITY_DN44660_c1_g1_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:
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AGTTCTTCAGTATCAGAATCAGAAGCTTGCTCAGCAGTTAGAAGCTCAAAGAAGTGAATTTCATGCATTAGAGAGCAAGTTCAATCAATTAAAAAACAAACAGGCTAAATATGATGACACATTGATAGTAGTTAATAGAACTTGGAAAGAGTTGGTAGATGACTTGGAGTTGCTATCAATACGAGCTGGAGGATGCACAA
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AAAGCAATTGATGATCAGCGAGCTAAAAATCAGGAACTGTCCTCTATTCTTTGTGAGAGGCTGACTGAAGATGAAGTTAGAAAACAACTCCAAAGTAATCATGACAACTTAAGGGAAGAGGTCCAGAATTTACGGGCTGCAATGGATGCACATCACTTGAAGCATAAGCAATATTCAAATGAGGTTCAAATTCTTCAAGA
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GAGAGATAGAAGCTGCATTGGAAGAACTTAAGACATTAGCGGAAAATCGACTAATAGAGCTCCAAGAAGCACATCAAGAAAAGCTGAAAATTTCACAGCAGATGGATCGCATACAGGACTCTTTAAACAATGAAAAGCACATTCTGTCATCTAGACCCTACCTTTTACTGAACGACCAACTTCAACGCCTGAAAGCTGAA
GTGGATCATTATCAGTCTGAAGTTGAATCCTTGCAGGCCGAAAGGGATAGTCTTTTGCGTCGTGAGAAGGAAATGAATTTGAAACTTGAATCATCTGAGGTTTCAAGGAGGGCAGCTGCAGTTGCTGATGCTAGAATAGCTGAGTTAGAGTTGGATTTGCGAGAGTGCATGACTGAAAGAAATTTATTTGAGACCAGGCT
TGAAAAGGCTTTACAGGAGTCAGGAAGGAAAGACATCATTGGTGAATTTAAAGTCATGGTTTCAACTCTACATAAAGAGATGGGCATGATGCAAGCACATTTAACTAAATTTAAAGAGACAGCTTTTGAAGTTCATTCGTTGCGGGCGGAGGTCCATTCCCTCTCAACTATACTTAACAGAAAGTCAAGTGAATACAAAA
AACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGGTTACAGATCTAAGAGAGACTGAACAAGAGTTAAAGTTAATTCTGGAGATGTATGGACGGGAAACCACAGATTCAAGGGATGTCATGGAAGCAAGGCAAGCAGAATGCAAAGCTTGGGCACAAGTGCATAAGCTAAAGTCTGCC
CTTGATGAACACAGTTTGGAATTGCGGGTCAAAGCAGCCAATGAAGCTGAGGCAGTCTGCCAACAGAGACTTGCTGTTGCTGAAGCCGAGATAGCTGACTCAAGGCAAAAGCTTGATGCTGCAGAGAGGGACATATTGGAGTTCACTGAAGCTCTGAGAGCTAAAAATGAAGAAGGAGAAGCCTATATAGCTGAAATTGA
GACTATTGGGCAAGCATATGAAGATATGCAAACTCAAAATCAACGATTACTTCAGCAGATAACAGAGAGAGATGATTACAATATCAAGCTTGTGTCAGAGAGTGTGAAAACAAAACAGGTTCAAAATGCTCTTCTTATGGAGAAACAGCATATGGCAAAGCAATTGCAGCAGGCTGGTACTTCAGCTGAGATGTATAAGC
AGAAGATTATGCGCCTTGAAGAACAGGTGAGGGTTTACTTGGATCAAATTGGAAAGGTTACTGAAGATGGTAAGCAGCATGCACTTACGCTAGATAGTACAAAGCGAAAATTGGTAGATGTAGAGAAAGAGTTACAATCTCTCAAGGTCCGTCTTGAGGCTGTGCAAAAGGAGGCTGAACAGTGCAAACACAGAATTACT
GATCTGCAAGTGGAGTTGAAGAATGAGAGGTTTGGGAAAAAGAGACTTGAGGAAGAACTGGTTGCTTTGAACACAAAATTTACGTGCATCAGTTCCCTTAATGATGGTGAAACAGTTGTAGGAAGACTTCAAGAAGAAATCAAAGAGTACAAGGCAATTTTAAAATGCAGTGTTTGCCATGATAGGCCCAAAGAAGTTGT
GATTACCAAGTGCTTCCACTTGTTTTGTGGCCCTTGTATTCAACGAAACTTGGAGACCCGGCACCGCAAATGCCCAGGATGTGGTACAGGTTTTGGACAGAATGATGTGCGGACTGTATACATATGATTTGCATGGTCAATATAATCTGGTTTTCTAACAATGGAGAACAATGTAGAGGTCTAAGAACAAAGTTGGAGTT
TACAACCAGATTTTATTGGTAAAGATGTACCCAAAAATAATTCATTGGGTAGAGCAGGTCCGAGGACATTCTTTTGTGTCTTAAGACCATCTCCTGTTGAAAGTCATGTAAAGTACTAACTGAAAACAGTGATTCATGGTTTAGTGTAACCTTCCCCCATTTTAGGAGGGTTTTGTTTTACTGCTAGTCTTTTTTTTCTC
TTCCTGACATGCCGAGAACTGGTGTAAATACCATCCATCCTTTATAGTAAAATCTTGGCATTGTAGGTGTAATATGTTTCAGGTTTCAACATTAGACTTGCTGGGGTGGATTTGCTTGCTCTGTATTGTTATCTGTAACTGACTGCATATTTAACAAATTAATCAAACCAGTTGATGGGATTAAGAAAAACTATTGTACA
GACCATTGCTTGTATGAGAGGTGCCATATCCCAAAGGTTGGTCATACTCATTGGAGGCTTCAAGGGAAACTCACCCGGAGCTTTATGATTTCAGAAAAAATGTTCTCTACTTTATGATATGATGGTGACTTGTGAGAAACAAGTGTGGAGTTTGTCATACTGTTGCAGAGAATAGCAGTGTTAGAGACACGCATCTTATG
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AATATGCATATGTGCCCTCGTTTTTGTTTCAAGgtatgatagttaatcttatatctggttgacaaagtgattttattgtagattttatgtagtttgaagcattgaggcttgtttgattgtatggcgatcttaaaatttttactcattatgttactcctgaagtgttgccttgatttcatgtgagtctctagaattgacaa
gtttataggaggtttgacaattagatttagtgacccattgagctatttgagaaacttgtattcactgaaggttgaggaagaaatgcatatatattgaaaattcaaattatgtgtagtggactgcattttcatgaaaataatttatgtatataagtgtgtgtagagttgcattggcagtttgtgaaatatattggaatttc
tgaaacagctaagtaaattaaattctgaatttggagctgcatgctgcagATAATTGTCCATCTGAAGGTGACATGTACCTGGACAACTGAGCATGTTAGCTTCACACCTGCAAAAACCAAATGTTGATTCTATCTACAGACTACAACCACATGGTAACGAGGTCAAGAATGTCACTGGTCCTATTCTTTTCCTATAACAA
ATTTTGTAATAGGCTCTTAAGTTGTGACTATTATTCTATTTGGGTAAATCCCAAGCACAAAATGACAGTTTTGTGTGGCTTTGATGTCCTGAAGCCAGGGTTTGTATGATACCATTGAAGTTGATGACTGAGTGTTACTATAATCAACATGTGCATTAGAGAACACTGACCCCGGGAATGTATAATCAGGGGTTGTACAT
TGCAGAAGGGAGACATCCTTATGTTTTGTTTGTAGCTCTGATAAACTTCTCCAGAGGTACAACTTAATGTTCAGTTTTGACGTAGATTTCTAATCTGCTTAGATGTTTTTGTTTGTTAATGTAGTCACTGTCAAATAATTGCTATGGTTATAGTCTCATGCATTGCTTTAGTTGGAGGGCTAATAAGTGCAGGTGGCCAA
TTTCAATAACCAGTGCATTGCTTTGTGGAAGCGTGCATACCACAAAAGTATATTGGATCCCACTTCAACAGGAACTATTCCATCGTGGTGATCAGTGATAGATCTGGTGGAAGGTAATTTATGGAAAAGATCCTGGAGTAAACATGTCAATTCTCTGACCTGATTCACTTCACTGAAGACTATTCTCTGACGAGCTATAT
ATTGATGTGTCTTTAATAGCTACCTCACTAACATGGTATTTTAAACTCAACTATAGATTTCATCACAATCTTTCATTTTGTACAACAGTTGATGCTACAAGATTGTGTAAATTGCTGAGAATGTCTGTACTTGAGCTACGATTGATTTATGAGCTTGCGAACTTTTGTAGCTTGGATCCCATTTCAGCAGGAACTATTCT
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AGTTCTTCAGTATCAGAATCAGAAGCTTGCTCAGCAGTTAGAAGCTCAAAGAAGTGAATTTCATGCATTAGAGAGCAAGTTCAATCAATTAAAAAACAAACAGGCTAAATATGATGACACATTGATAGTAGTTAATAGAACTTGGAAAGAGTTGGTAGATGACTTGGAGTTGCTATCAATACGAGCTGGAGGATGCACAA
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AACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGGTTACAGATCTAAGAGAGACTGAACAAGAGTTAAAGTTAATTCTGGAGATGTATGGACGGGAAACCACAGATTCAAGGGATGTCATGGAAGCAAGGCAAGCAGAATGCAAAGCTTGGGCACAAGTGCATAAGCTAAAGTCTGCC
CTTGATGAACACAGTTTGGAATTGCGGGTCAAAGCAGCCAATGAAGCTGAGGCAGTCTGCCAACAGAGACTTGCTGTTGCTGAAGCCGAGATAGCTGACTCAAGGCAAAAGCTTGATGCTGCAGAGAGGGACATATTGGAGTTCACTGAAGCTCTGAGAGCTAAAAATGAAGAAGGAGAAGCCTATATAGCTGAAATTGA
GACTATTGGGCAAGCATATGAAGATATGCAAACTCAAAATCAACGATTACTTCAGCAGATAACAGAGAGAGATGATTACAATATCAAGCTTGTGTCAGAGAGTGTGAAAACAAAACAGGTTCAAAATGCTCTTCTTATGGAGAAACAGCATATGGCAAAGCAATTGCAGCAGGCTGGTACTTCAGCTGAGATGTATAAGC
AGAAGATTATGCGCCTTGAAGAACAGGTGAGGGTTTACTTGGATCAAATTGGAAAGGTTACTGAAGATGGTAAGCAGCATGCACTTACGCTAGATAGTACAAAGCGAAAATTGGTAGATGTAGAGAAAGAGTTACAATCTCTCAAGGTCCGTCTTGAGGCTGTGCAAAAGGAGGCTGAACAGTGCAAACACAGAATTACT
GATCTGCAAGTGGAGTTGAAGAATGAGAGGTTTGGGAAAAAGAGACTTGAGGAAGAACTGGTTGCTTTGAACACAAAATTTACGTGCATCAGTTCCCTTAATGATGGTGAAACAGTTGTAGGAAGACTTCAAGAAGAAATCAAAGAGTACAAGGCAATTTTAAAATGCAGTGTTTGCCATGATAGGCCCAAAGAAGTTGT
GATTACCAAGTGCTTCCACTTGTTTTGTGGCCCTTGTATTCAACGAAACTTGGAGACCCGGCACCGCAAATGCCCAGGATGTGGTACAGGTTTTGGACAGAATGATGTGCGGACTGTATACATATGATTTGCATGGTCAATATAATCTGGTTTTCTAACAATGGAGAACAATGTAGAGGTCTAAGAACAAAGTTGGAGTT
TACAACCAGATTTTATTGGTAAAGATGTACCCAAAAATAATTCATTGGGTAGAGCAGGTCCGAGGACATTCTTTTGTGTCTTAAGACCATCTCCTGTTGAAAGTCATGTAAAGTACTAACTGAAAACAGTGATTCATGGTTTAGTGTAACCTTCCCCCATTTTAGGAGGGTTTTGTTTTACTGCTAGTCTTTTTTTTCTC
TTCCTGACATGCCGAGAACTGGTGTAAATACCATCCATCCTTTATAGTAAAATCTTGGCATTGTAGGTGTAATATGTTTCAGGTTTCAACATTAGACTTGCTGGGGTGGATTTGCTTGCTCTGTATTGTTATCTGTAACTGACTGCATATTTAACAAATTAATCAAACCAGTTGATGGGATTAAGAAAAACTATTGTACA
GACCATTGCTTGTATGAGAGGTGCCATATCCCAAAGGTTGGTCATACTCATTGGAGGCTTCAAGGGAAACTCACCCGGAGCTTTATGATTTCAGAAAAAATGTTCTCTACTTTATGATATGATGGTGACTTGTGAGAAACAAGTGTGGAGTTTGTCATACTGTTGCAGAGAATAGCAGTGTTAGAGACACGCATCTTATG
CTGCACTCTTGAATCATTGGATCACAGATATTTTGGAAGCTCACGTGAATTAGG


>TRINITY_DN115667_c0_g1_i22 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CTTGTATGGATGGAAGTTTGTGCGGTCATGGTTGACCCTGTGTTCTCGAATTCCATGCGGAAATAAGCGCTTCGATTTCGATCCAGGGCGGTCAGGGCTCCAGGCTGCGAGGGAGTCGTCATCGAAGGCAATCAAATTCCTATTTTTTGCTGTGAATTTTATTTATTTCGGGTTACGAATGGCGAGAAGTTAGCCAGGTA
GGGTTGCAGAAGACTGAAGGCCTGTAGAAATGTGTTACGCGGCTGGACTCGAACTTATAACGTGACTCAGGTGAAGATCGAGGCGCAATGGGAAGTACCGGGGAGCCAGAGCGCAAAAGGCGCCATTTGAACTCCATAAGCCCTACTGTGAAGAAGCAGCCACCCGCTCCCTCTTCGGACGAAAATAAAGTTGATGCAGC
AGTTCTTCAGTATCAGAATCAGAAGCTTGCTCAGCAGTTAGAAGCTCAAAGAAGTGAATTTCATGCATTAGAGAGCAAGTTCAATCAATTAAAAAACAAACAGGCTAAATATGATGACACATTGATAGTAGTTAATAGAACTTGGAAAGAGTTGGTAGATGACTTGGAGTTGCTATCAATACGAGCTGGAGGATGCACAA
ATGGAGTTAAGGTTTTGGACCTTTCTCAAACTTTGGAAGATGGAAAAAGTGGATCATGTCCTCCAGAAGAGACCTTTTTGTGTCGGATTTTAGAACCCAGTACAACGGAAAGCAAAGTTGCAAATGCTTCTGTCAACATTGTAGAGAATGGCCTTCTGACAAGGCGTGAATCCACATTAAAAATAATGGATTATTTATTA
AAAGCAATTGATGATCAGCGAGCTAAAAATCAGGAACTGTCCTCTATTCTTTGTGAGAGGCTGACTGAAGATGAAGTTAGAAAACAACTCCAAAGTAATCATGACAACTTAAGGGAAGAGGTCCAGAATTTACGGGCTGCAATGGATGCACATCACTTGAAGCATAAGCAATATTCAAATGAGGTTCAAATTCTTCAAGA
CAGTCATGCAAAGGATCAATCTGAAATAAAACGGTTGATGGGTGAGCTGGAGGAAACGATGGCAGAGCTTGAAGAAAGTAAATGTAAGCTTGCACGTTTGAAATCACAGAAGGATGCATCACTTGGAGCATCTTTCCCAAACATACATTTAGGAAATAAAAATGACTTAGACAAATCTGGGGATAAGTCGAGAAAATTGA
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AACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGGTTACAGATCTAAGAGAGACTGAACAAGAGTTAAAGTTAATTCTGGAGATGTATGGACGGGAAACCACAGATTCAAGGGATGTCATGGAAGCAAGGCAAGCAGAATGCAAAGCTTGGGCACAAGTGCATAAGCTAAAGTCTGCC
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GACTATTGGGCAAGCATATGAAGATATGCAAACTCAAAATCAACGATTACTTCAGCAGATAACAGAGAGAGATGATTACAATATCAAGCTTGTGTCAGAGAGTGTGAAAACAAAACAGGTTCAAAATGCTCTTCTTATGGAGAAACAGCATATGGCAAAGCAATTGCAGCAGGCTGGTACTTCAGCTGAGATGTATAAGC
AGAAGATTATGCGCCTTGAAGAACAGGTGAGGGTTTACTTGGATCAAATTGGAAAGGTTACTGAAGATGGTAAGCAGCATGCACTTACGCTAGATAGTACAAAGCGAAAATTGGTAGATGTAGAGAAAGAGTTACAATCTCTCAAGGTCCGTCTTGAGGCTGTGCAAAAGGAGGCTGAACAGTGCAAACACAGAATTACT
GATCTGCAAGTGGAGTTGAAGAATGAGAGGTTTGGGAAAAAGAGACTTGAGGAAGAACTGGCTGTTTTGAACACAAAATATACGTGCCTCTGTTCCCTTAATGATGGTGAAACAGTTGTAGGAAGACTTCAAGAAGAAATCAAAGAGTACAAGGCAATTTTAAAATTCAGTGTTTTCCATGATAGGCCCAAAGAAgtaag
cattattaagtccagcatgtatattcttagatgtttcagtgtttgttaatgaccttagtgtcattgcatcgagtgttgtgaaagggaagtagcagcgttcattttcatcttagatttattggatttgtgatcaaattgaaattaattttatttgtgctttatgatagGTTGTGATTACCAAGTGCTTCCACTTGTTTTGT
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TACCATCCATCCTTTATAGTAAAATCTTGGCATTGTAGGTGTAATATGTTTCAGGTTTCAACATTAGACTTGCTGGGGTGGATTTGCTTGCTCTGTATTGTTATCTGTAACTGACTGCATATTTAACAAATTAATCAAACCAGTTGATGGGATTAAGAAAAACTATTGTACAGACCATTGCTTGTATGAGAGGTGCCATA
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>TRINITY_DN125672_c0_g1_i16 from sample A1 / Example spliced isoform
TCTGAGACTATATTGTCGTTTGCCTTAGTATTCTTTCCTACTTTATTTCCTCTTGTATGGATGGAAGTTTGTGCGGTCATGGTTGACCCTGTGTTCTCGAATTCCATGCGGAAATAAGCGCTTCGATTTCGATCCAGGGCGGTCAGGGCTCCAGGCTGCGAGGGAGTCGTCATCGAAGGCAATCAAATTCCTATTTTTTG
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TTGTATGGTGTCTTTTCGGCTTTTAGCTTTTGCATTCTTCTTTATTTATAGTGCATCTTCTATATGATAATCAATATGCTAAAATGTAGTAAAAGGAATTTCGCTTAGGTCATGTTTGAATATTCACAGTGTAATGATAAATCTAGAATCAAATCTTAGCTAATTCTTAGAGGACTTTCAAATTCAAGTTTACCCCAAGT
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CTTTTTGCATAGTTATTCATTTATAGTGCATCTTCTGTATGACAATCAATACACTAAAATGTAGGAAACAGAATTTATCTTGGCCCATCTTTGACAATATGAATGCAGTCATCTTAATGTAAGCATGATTGCAATACTGGCTACATAGCTCTAGAAGTAGAAACGTCTGCTTAGCAACTGATTAATCTTATCATCATAAA
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>TRINITY_DN125672_c0_g1_i23 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CTGAAATAAAACGGTTGATGGgtaagtgatataatcatctttttccctggcataaatatagtatcatatttctcgtttcattctgccatggaaatatgatatttagcaaatcttaacccatgcagcagatggtcaagctccaaatcatttccaaggttctgattatctgttaagctttgaaaatatttgagatgtgaaga
gtttttgtttgtatggccatccagGTGAGCTGGAGGAAACGATGGCAGAGCTTGAAGAAAGTAAATGTAAGCTTGCACGTTTGAAATCACAGAAGGATGCATCACTTGGAGCATCTTTCCCAAACATACATTTAGGAAATAAAAATGACTTAGACAAATCTGGGGATAAGTCGAGAAAATTGAGAGAGATAGAAGCTGCA
TTGGAAGAACTTAAGGTACTTATTGGTCTGTGGCAATGTTTCACTTTGTTTACTACTATCATCTATTAACAGTTATCAATCTGGATGTTGGATTACAAGATTAGGAATCTATATCAGAGATATGGATACTGAACATAAAGTCTAAACTGGTTTGGCTTTTATATTTCTTCAGACATTAGCGGAAAATCGACTAATAGAGC
TCCAAGAAGCACATCAAGAAAAGCTGAAAATTTCACAGCAGATGGATCGCATACAGGTTAATGTTTTTGTCAGGACCATAGTACACACTAATGGGGCAAAAAACTATCTGTTTTCTGGTGTATTTTGCATCTGTGCTATGCCACTTCCTAAACATATTTTTATTCATGCTAGTGTTAATATTTTTTGTACCATGCAAAAC
AGGACTCTTTAAACAATGAAAAGCACATTCTGTCATCTAGACCCTACCTTTTACTGAACGACCAACTTCAACGCCTGAAAGCTGAAGTGGATCATTATCAGTCTGAAGTTGAATCCTTGCAGGCCGAAAGGGATAGTCTTTTGCGTCGTGAGAAGGAAATGAATTTGAAACTTGAATCATCTGAGGTTTCAAGGAGGGCA
GCTGCAGTTGCTGATGCTAGAATAGCTGAGTTAGAGTTGGATTTGCGAGAGTGCATGACTGAAAGAAATTTATTTGAGACCAGGCTTGAAAAGGCTTTACAGGAGTCAGGAAGGAAAGACATCATTGGTGAATTTAAAGTCATGGTTTCAACTCTACATAAAGAGATGGGCATGATGCAAGCACATTTAACTAAATTTAA
AGAGACAGCTTTTGAAGTTCATTCGTTGCGGGCGGAGGTCCATTCCCTCTCAACTATACTTAACAGAAAGTCAAGTGAATACAAAAAACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGGT



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>TRINITY_DN110894_c0_g1_i11 from sample A3 / Example spliced isoform
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TAGAGAATGGCCTTCTGACAAGGCGTGAATCCACATTAAAAATAATGGATTATTTATTAAAAGCAATTGATGATCAGCGAGCTAAAAATCAGGAACTGTCCTCTATTCTTTGTGAGAGGCTGACTGAAGATGAAGTTAGAAAACAACTCCAAAGTAATCATGACAACTTAAGGGAAGAGGTCCAGAATTTACGGGCTGCA
ATGGATGCACATCACTTGAAGCATAAGCAATATTCAAATGAGGTTCAAATTCTTCAAGACAGTCATGCAAAGGATCAATCTGAAATAAAACGGTTGATGGGTGAGCTGGAGGAAACGATGGCAGAGCTTGAAGAAAGTAAATGTAAGCTTGCACGTTTGAAATCACAGAAGGATGCATCACTTGGAGCATCTTTCCCAAA
CATACATTTAGGAAATAAAAATGACTTAGACAAATCTGGGGATAAGTCGAGAAAATTGAGAGAGATAGAAGCTGCATTGGAAGAACTTAAGACATTAGCGGAAAATCGACTAATAGAGCTCCAAGAAGCACATCAAGAAAAGCTGAAAATTTCACAGCAGATGGATCGCATACAGGACTCTTTAAACAATGAAAAGCACA
TTCTGTCATCTAGACCCTACCTTTTACTGAACGACCAACTTCAACGCCTGAAAGCTGAAGTGGATCATTATCAGTCTGAAGTTGAATCCTTGCAGGCCGAAAGGGATAGTCTTTTGCGTCGTGAGAAGGAAATGAATTTGAAACTTGAATCATCTGAGGTTTCAAGGAGGGCAGCTGCAGTTGCTGATGCTAGAATAGCT
GAGTTAGAGTTGGATTTGCGAGAGTGCATGACTGAAAGAAATTTATTTGAGACCAGGCTTGAAAAGGCTTTACAGGAGTCAGGAAGGAAAGACATCATTGGTGAATTTAAAGTCATGGTTTCAACTCTACATAAAGAGATGGGCATGATGCAAGCACATTTAACTAAATTTAAAGAGACAGCTTTTGAAGTTCATTCGTT
GCGGGCGGAGGTCCATTCCCTCTCAACTATACTTAACAGAAAGTCAAGTGAATACAAAAAACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGGTTACAGATCTAAGAGAGACTGAACAAGAGTTAAAGTTAATTCTGGAGATGTATGGACGGGAAACCACAGATTCAAGGGATGTCA
TGGAAGCAAGGCAAGCAGAATGCAAAGCTTGGGCACAAGTGCATAAGCTAAAGTCTGCCCTTGATGAACACAGTTTGGAATTGCGGGTCAAAGCAGCCAATGAAGCTGAGGCAGTCTGCCAACAGAGACTTGCTGTTGCTGAAGCCGAGATAGCTGACTCAAGGCAAAAGCTTGATGCTGCAGAGAGGGACATATTGGAG
TTCACTGAAGCTCTGAGAGCTAAAAATGAAGAAGGAGAAGCCTATATAGCTGAAATTGAGACTATTGGGCAAGCATATGAAGATATGCAAACTCAAAATCAACGATTACTTCAGCAGATAACAGAGAGAGATGATTACAATATCAAGCTTGTGTCAGAGAGTGTGAAAACAAAACAGGTTCAAAATGCTCTTCTTATGGA
GAAACAGCATATGGCAAAGCAATTGCAGCAGGCTGGTACTTCAGCTGAGATGTATAAGCAGAAGATTATGCGCCTTGAAGAACAGGTGAGGGTTTACTTGGATCAAATTGGAAAGGTTACTGAAGATGGTAAGCAGCATGCACTTACGCTAGATAGTACAAAGCGAAAATTGGTAGATGTAGAGAAAGAGTTACAATCTC
TCAAGGTCCGTCTTGAGGCTGTGCAAAAGGAGGCTGAACAGTGCAAACACAGAATTACTGATCTGCAAGTGGAGTTGAAGAATGAGAGGTTTGGGAAAAAGAGACTTGAGGAAGAACTGGTTGCTTTGAACACAAAATTTACGTGCATCAGTTCCCTTAATGATGGTGAAACAGTTGTAGGAAGACTTCAAGAAGAAATC
AAAGAGTACAAGGCAATTTTAAAATGCAGTGTTTGCCATGATAGGCCCAAAGAAGTTGTGATTACCAAGTGCTTCCACTTGTTTTGTGGCCCTTGTATTCAACGAAACTTGGAGACCCGGCACCGCAAATGCCCAGGATGTGGTACAGGTTTTGGACAGAATGATGTGCGGACTGTATACATATGATTTGCATGGTCAAT
ATAATCTGGTTTTCTAACAATGGAGAACAATGTAGAGGTCTAAGAACAAAGTTGGAGTTTACAACCAGATTTTATTGGTAAAGATGTACCCAAAAATAATTCATTGGGTAGAGCAGGTCCGAGGACATTCTTTTGTGTCTTAAGACCATCTCCTGTTGAAAGTCATGTAAAGTACTAACTGAAAACAGTGATTCATGGTT
TAGTGTAACCTTCCCCCATTTTAGGAGGGTTTTGTTTTACTGCTAGTCTTTTTTTTCTCTTCCTGACATGCCGAGAACTGGTGTAAATACCATCCATCCTTTATAGTAAAATCTTGGCATTGTAGGTGTAATATGTTTCAGGTTTCAACATTAGACTTGCTGGGGTGGATTTGCTTGCTCTGTATTGTTATCTGTAACTG
ACTGCATATTTAACAAATTAATCAAACCAGTTGATGGGATTAAGAAAAACTATTGTACAGACCATTGCTTGTATGAGAGGTGCCATATCCCAAAGGTTGGTCATACTCATTGGAGGCTTCAAGGGAAACTCACCCGGAGCTTTATGATTTCAGAAAAAATGTTCTCTACTTTATGATATGATGGTGACTTGTGAGAAACA
AGTGTGGAGTTTGTCATACTGTTGCAGAGAATAGCAGTGTTAGAGACACGCATCTTATGCTGCACTCTTGAATCATTGGATCACAGATATTTTGGAAGCTCACGTGAATTAGGGAATTGGTATTGTGACCATAGACCTTTCTTCACAGATCACATTGTAGGGGAACGGGGTCATAATTATTTATATGGCTGTTGTCTTTC
TCAAAAAATTCCCCATTGTTGCAAGAAAGTACCTTTTTTGATCTTCGTGCTTTCTGGAGAATATGCATATGTGCCCTCGTTTTTGTTTCAAGGTATGATAGTTAATCTTATATCTGGTTGACAAAGTGATTTTATTGTAGATTTTATGTAGTTTGAAGCATTGAGGCTTGTTTGATTGTATGGCGATCTTAAAATTTTTA
CTCATTATGTTACTCCTGAAGTGTTGCCTTGATTTCATGTGAGTCTCTAGAATTGACAAGTTTATAGGAGGTTTGACAATTAGATTTAGTGACCCATTGAGCTATTTGAGAAACTTGTATTCACTGAAGGTTGAGGAAGAAATGCATATATATTGAAAATTCAAATTATGTGTAGTGGACTGCATTTTCATGAAAATAAT
TTATGTATATAAGTGTGTGTAGAGTTGCATTGGCAGTTTGTGAAATATATTGGAATTTCTGAAACAGCTAAGTAAATTAAATTCTGAATTTGGAGCTGCATGCTGCAGATAATTGTCCATCTGAAGGTGACATGTACCTGGACAACTGAGCATGTTAGCTTCACACCTGCAAAAACCAAATGTAAGTTGTGAGCATTGTG
TTCAACTGATTTTCCTACTTGAAGAGGGATCTCCAAACATATTGCAGTTTGCACTTATGCTTTTAGAATCTTAATGAATAAACAGAAATAAAA


>TRINITY_DN110894_c0_g1_i17 from sample A3 / Example unspliced isoform:
ATGACACATTGATAGTAGTTAATAGAACTTGGAAAGAGTTGGTAGATGACTTGGAGTTGCTATCAATACGAGCTGGAGGATGCACAAATGGAGTTAAGgttttggacctttctcaaactttggaagATGGAAAAAGTGGATCATGTCCTCCAGAAGAGACCTTTTTGTGTCGGATTTTAGAACCCAGTACAACGGAAAGC
AAAGTTGCAAATGCTTCTGTCAACATTGTAGAGAATGGCCTTCTGACAAGGCGTGAATCCACATTAAAAATAATGGATTATTTATTAAAAGCAATTGATGATCAGCGAGCTAAAAATCAGGAACTGTCCTCTATTCTTTGTGAGAGGCTGACTGAAGATGAAGTTAGAAAACAACTCCAAAGTAATCATGACAACTTAAG
GGAAGAGGTCCAGAATTTACGGGCTGCAATGGATGCACATCACTTGAAGCATAAGCAATATTCAAATGAGGTTCAAATTCTTCAAGACAGTCATGCAAAGGATCAATCTGAAATAAAACGGTTGATGGGTGAGCTGGAGGAAACGATGGCAGAGCTTGAAGAAAGTAAATGTAAGCTTGCACGTTTGAAATCACAGAAGG
ATGCATCACTTGGAGCATCTTTCCCAAACATACATTTAGGAAATAAAAATGACTTAGACAAATCTGGGGATAAGTCGAGAAAATTGAGAGAGATAGAAGCTGCATTGGAAGAACTTAAGACATTAGCGGAAAATCGACTAATAGAGCTCCAAGAAGCACATCAAGAAAAGCTGAAAATTTCACAGCAGATGGATCGCATA
CAGGTTAATGTTTTTGTCAGGACCATAGTACACACTAATGGGGCAAAAAACTATCTGTTTTCTGGCGTATTTTGCATCTGTGCTATGCCACTTCCTAAACATATTTTTATTCATGCTAGTGTTAATATTTTTTGTACCATGCAAAACAGGACTCTTTAAACAATGAAAAGCACATTCTGTCATCTAGACCCTACCTTTTA
CTGAACGACCAACTTCAACGCCTGAAAGCTGAAGTGGATCATTATCAGTCTGAAGTTGAATCCTTGCAGGCCGAAAGGGATAGTCTTTTGCGTCGTGAGAAGGAAATGAATTTGAAACTTGAATCATCTGAGGTTTCAAGGAGGGCAGCTGCAGTTGCTGATGCTAGAATAGCTGAGTTAGAGTTGGATTTGCGAGAGTG
CATGACTGAAAGAAATTTATTTGAGACCAGGCTTGAAAAGGCTTTACAGGAGTCAGGAAGGAAAGACATCATTGGTGAATTTAAAGTCATGGTTTCAACTCTACATAAAGAGATGGGCATGATGCAAGCACATTTAACTAAATTTAAAGAGACAGCTTTTGAAGTTCATTCGTTGCGGGCGGAGGTCCATTCCCTCTCAA
CTATACTTAACAGAAAGTCAAGTGAATACAAAAAACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGGTTACAGATCTAAGAGAGACTGAACAAGAGTTAAAGTTAATTCTGGAGATGTATGGACGGGAAACCACAGATTCAAGGGATGTCATGGAAGCAAGGCAAGCAGAATGCAAA
GCTTGGGCACAAGTGCATAAGCTAAAGTCTGCCCTTGATGAACACAGTTTGGAATTGCGGGTCAAAGCAGCCAATGAAGCTGAGGCAGTCTGCCAACAGAGACTTGCTGTTGCTGAAGCCGAGATAGCTGACTCAAGGCAAAAGCTTGATGCTGCAGAGAGGGACATATTGGAGTTCACTGAAGCTCTGAGAGCTAAAAA
TGAAGAAGGAGAAGCCTATATAGCTGAAATTGAGACTATTGGGCAAGCATATGAAGATATGCAAACTCAAAATCAACGATTACTTCAGCAGATAACAGAGAGAGATGATTACAATATCAAGCTTGTGTCAGAGAGTGTGAAAACAAAACAGGTTCAAAATGCTCTTCTTATGGAGAAACAGCATATGGCAAAGCAATTGC
AGCAGGCTGGTACTTCAGCTGAGATGTATAAGCAGAAGATTATGCGCCTTGAAGAACAGGTGAGGGTTTACTTGGATCAAATTGGAAAGGTTACTGAAGATGGTAAGCAGCATGCACTTACGCTAGATAGTACAAAGCGAAAATTGGTAGATGTAGAGAAAGAGTTACAATCTCTCAAGGTCCGTCTTGAGGCTGTGCAA
AAGGAGGCTGAACAGTGCAAACACAGAATTACTGATCTGCAAGTGGAGTTGAAGAATGAGAGGTTTGGGAAAAAGAGACTTGAGGAAGAACTGGTTGCTTTGAACACAAAATTTACGTGCATCAGTTCCCTTAATGATGGTGAAACAGTTGTAGGAAGACTTCAAGAAGAAATCAAAGAGTACAAGGCAATTTTAAAATG
CAGTGTTTGCCATGATAGGCCCAAAGAAGTTGTGATTACCAAGTGCTTCCACTTGTTTTGTGGCCCTTGTATTCAACGAAACTTGGAGACCCGGCACCGCAAATGCCCAGGATGTGGTACAGGTTTTGGACAGAATGATGTGCGGACTGTATACATATGATTTGCATGGTCAATATAATCTGGTTTTCTAACAATGGAGA
ACAATGTAGAGGTCTAAGAACAAAGTTGGAGTTTACAACCAGATTTTATTGGTAAAGATGTACCCAAAAATAATTCATTGGGTAGAGCAGGTCCGAGGACATTCTTTTGTGTCTTAAGACCATCTCCTGTTGAAAGTCATGTAAAGTACTAACTGAAAACAGTGATTCATGGTTTAGTGTAACCTTCCCCCATTTTAGGA
GGGTTTTGTTTTACTGCTAGTCTTTTTTTTCTCTTCCTGACATGCCGAGAACTGGTGTAAATACCATCCATCCTTTATAGTAAAATCTTGGCATTGTAGGTGTAATATGTTTCAGGTTTCAACATTAGACTTGCTGGGGTGGATTTGCTTGCTCTGTATTGTTATCTGTAACTGACTGCATATTTAACAAATTAATCAAA
CCAGTTGATGGGATTAAGAAAAACTATTGTACAGACCATTGCTTGTATGAGAGGTGCCATATCCCAAAGGTTGGTCATACTCATTGGAGGCTTCAAGGGAAACTCACCCGGAGCTTTATGATTTCAGAAAAAATGTTCTCTACTTTATGATATGATGGTGACTTGTGAGAAACAAGTGTGGAGTTTGTCATACTGTTGCA
GAGAATAGCAGTGTTAGAGACACGCATCTTATGCTGCACTCTTGAATCATTGGATCACAGATATTTTGGAAGCTCACGTGAATTAGGGAATTGGTATTGTGACCATAGACCTTTCTTCACAGATCACATTGTAGGGGAACGGGGTCATAATTATTTATATGGCTGTTGTCTTTCTCAAAAAATTCCCCATTGTTGCAAGA
AAGTACCTTTTTTGATCTTCGTGCTTTCTGGAGAATATGCATATGTGCCCTCGTTTTTGTTTCAAGGTATGATAGTTAATCTTATATCTGGTTGACAAAGTGATTTTATTGTAGATTTTATGTAGTTTGAAGCATTGAGGCTTGTTTGATTGTATGGCGATCTTAAAATTTTTACTCATTATGTTACTCCTGAAGTGTTG
CCTTGATTTCATGTGAGTCTCTAGAATTGACAAGTTTATAGGAGGTTTGACAATTAGATTTAGTGACCCATTGAGCTATTTGAGAAACTTGTATTCACTGAAGGTTGAGGAAGAAATGCATATATATTGAAAATTCAAATTATGTGTAGTGGACTGCATTTTCATGAAAATAATTTATGTATATAAGTGTGTGTAGAGTT
GCATTGGCAGTTTGTGAAATATATTGGAATTTCTGAAACAGCTAAGTAAATTAAATTCTGAATTTGGAGCTGCATGCTGCAGATAATTGTCCATCTGAAGGTGACATGTACCTGGACAACTGAGCATGTTAGCTTCACACCTGCAAAAACCAAATGTAAGTTGTGAGCATTGTGTTCAACTGATTTTCCTACTTGAAGAG
GGATCTCCAAACATATTGCAGTTTGCACTTATGCTTTTAGAATCTTAATGAATAAACAGAAATAAAA



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>TRINITY_DN125672_c0_g1_i16 from sample A1 / Example spliced isoform
TCTGAGACTATATTGTCGTTTGCCTTAGTATTCTTTCCTACTTTATTTCCTCTTGTATGGATGGAAGTTTGTGCGGTCATGGTTGACCCTGTGTTCTCGAATTCCATGCGGAAATAAGCGCTTCGATTTCGATCCAGGGCGGTCAGGGCTCCAGGCTGCGAGGGAGTCGTCATCGAAGGCAATCAAATTCCTATTTTTTG
CTGTGAATTTTATTTATTTCGGGTTACGAATGGCGAGAAGTTAGCCAGGTAGGGTTGCAGAAGACTGAAGGCCTGTAGAAATGTGTTACGCGGCTGGACTCGAACTTATAACGTGACTCAGGTGAAGATCGAGGCGCAATGGGAAGTACCGGGGAGCCAGAGCGCAAAAGGCGCCATTTGAACTCCATAAGCCCTACTGT
GAAGAAGCAGCCACCCGCTCCCTCTTCGGACGAAAATAAAGTTGATGCAGCAGTTCTTCAGTATCAGAATCAGAAGCTTGCTCAGCAGTTAGAAGCTCAAAGAAGTGAATTTCATGCATTAGAGAGCAAGTTCAATCAATTAAAAAACAAACAGGCTAAATATGATGACACATTGATAGTAGTTAATAGAACTTGGAAAG
AGTTGGTAGATGACTTGGAGTTGCTATCAATACGAGCTGGAGGATGCACAAATGGAGTTAAGGTTTTGGACCTTTCTCAAACTTTGGAAGATGGAAAAAGTGGATCATGTCCTCCAGAAGAGACCTTTTTGTGTCGGATTTTAGAACCCAGTACAACGGAAAGCAAAGTTGCAAATGCTTCTGTCAACATTGTAGAGAAT
GGCCTTCTGACAAGGCGTGAATCCACATTAAAAATAATGGATTATTTATTAAAAGCAATTGATGATCAGCGAGCTAAAAATCAGGAACTGTCCTCTATTCTTTGTGAGAGGCTGACTGAAGATGAAGTTAGAAAACAACTCCAAAGTAATCATGACAACTTAAGGGAAGAGGTCCAGAATTTACGGGCTGCAATGGATGC
ACATCACTTGAAGCATAAGCAATATTCAAATGAGGTTCAAATTCTTCAAGACAGTCATGCAAAGGATCAATCTGAAATAAAACGGTTGATGGGTGAGCTGGAGGAAACGATGGCAGAGCTTGAAGAAAGTAAATGTAAGCTTGCACGTTTGAAATCACAGAAGGATGCATCACTTGGAGCATCTTTCCCAAACATACATT
TAGGAAATAAAAATGACTTAGACAAATCTGGGGATAAGTCGAGAAAATTGAGAGAGATAGAAGCTGCATTGGAAGAACTTAAGACATTAGCGGAAAATCGACTAATAGAGCTCCAAGAAGCACATCAAGAAAAGCTGAAAATTTCACAGCAGATGGATCGCATACAGGACTCTTTAAACAATGAAAAGCACATTCTGTCA
TCTAGACCCTACCTTTTACTGAACGACCAACTTCAACGCCTGAAAGCTGAAGTGGATCATTATCAGTCTGAAGTTGAATCCTTGCAGGCCGAAAGGGATAGTCTTTTGCGTCGTGAGAAGGAAATGAATTTGAAACTTGAATCATCTGAGGTTTCAAGGAGGGCAGCTGCAGTTGCTGATGCTAGAATAGCTGAGTTAGA
GTTGGATTTGCGAGAGTGCATGACTGAAAGAAATTTATTTGAGACCAGGCTTGAAAAGGCTTTACAGGAGTCAGGAAGGAAAGACATCATTGGTGAATTTAAAGTCATGGTTTCAACTCTACATAAAGAGATGGGCATGATGCAAGCACATTTAACTAAATTTAAAGAGACAGCTTTTGAAGTTCATTCGTTGCGGGCGG
AGGTCCATTCCCTCTCAACTATACTTAACAGAAAGTCAAGTGAATACAAAAAACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGGTTACAGATCTAAGAGAGACTGAACAAGAGTTAAAGTTAATTCTGGAGATGTATGGACGGGAAACCACAGATTCAAGGGATGTCATGGAAGCA
AGGCAAGCAGAATGCAAAGCTTGGGCACAAGTGCATAAGCTAAAGTCTGCCCTTGATGAACACAGTTTGGAATTGCGGGTCAAAGCAGCCAATGAAGCTGAGGCAGTCTGCCAACAGAGACTTGCTGTTGCTGAAGCCGAGATAGCTGACTCAAGGCAAAAGCTTGATGCTGCAGAGAGGGACATATTGGAGTTCACTGA
AGCTCTGAGAGCTAAAAATGAAGAAGGAGAAGCCTATATAGCTGAAATTGAGACTATTGGGCAAGCATATGAAGATATGCAAACTCAAAATCAACGATTACTTCAGCAGATAACAGAGAGAGATGATTACAATATCAAGGTGAGTAGCCCATACAAGGCCTTTAAATCTAGAATCAGATCTTGGCTAATTCTTAGAGGGC
TCTAAAATTCAAGAACACCCATAGCCAAGTAGTTCAAGTAAACTGGATGTTGTTTTCATTAATGTTGTTGAATGGTGGATGATTCATTAGAGGGGAAAAGTTGAAAACATTTGATTTTGTATTTTGTTTTGTTTATTTATTTCCTTCCCTATGTTATCAAAACAAAATTTTTGTTTGATTTTCTATATTCTATTTTGCTT
TTGTATGGTGTCTTTTCGGCTTTTAGCTTTTGCATTCTTCTTTATTTATAGTGCATCTTCTATATGATAATCAATATGCTAAAATGTAGTAAAAGGAATTTCGCTTAGGTCATGTTTGAATATTCACAGTGTAATGATAAATCTAGAATCAAATCTTAGCTAATTCTTAGAGGACTTTCAAATTCAAGTTTACCCCAAGT
AATTTAAGAAAGACTACTAGCTGCTGTTTTCCTTTATGTTGTTGAATGGTGGACGTTTCATCTTTTAAAGGGAGAAGATATTTCATTTTATATTTTGTTTTGTTTATTTAGTTCCTTCCATGTGCTGTCAAAACTAAAATTTATTTCAGCTTTTGATTTCTATTTTCAATTTTATTTTATGGTTTCTTTCTAGCTTTTAG
CTTTTTGCATAGTTATTCATTTATAGTGCATCTTCTGTATGACAATCAATACACTAAAATGTAGGAAACAGAATTTATCTTGGCCCATCTTTGACAATATGAATGCAGTCATCTTAATGTAAGCATGATTGCAATACTGGCTACATAGCTCTAGAAGTAGAAACGTCTGCTTAGCAACTGATTAATCTTATCATCATAAA
CACTCTTTTAGAAAATGAAAGTTGGAAGTTCCATAAATAGACAGTTCCATAAATAGATGAAAGTTGGAATTAGTCATTCTTCCAGGGAATTGAAGCTTGATACATAATGTTCTTATCAGGATCTATGACCTTTGCACTTACTTTATGCAAGTTTAAAAATGTTGGGCCACTGCGTACGTCCAGGAATTGCATTAGCCATT
AGCCTAATAATAGGAGGCAAAGTAAAGGATGTACGATTGATAAGAATAGTATCTACTACCATAAATATACAATCTTTCAGAAAACAATCTTTCACTTCTGACATAGGGAACCTGGTTATAAAGCCATGGAACTTATTCCCACTTCTGAATGGATATGTGCAATAGTTATCATAATTCTAGCTAGTCATGCTTTGTCCCCT
TTATCATTGACAGGGTTTACATTCTGCAATCATGTTCCTATTCTCATTTTAATTGCCTTCCAATAAAAGGACTGAAGAAGTTGTAGTATGATCTAAAAACTTTACCTCGTGTCCTTTCGTTATTTGTATTTTTAGCCCTTGATGTTGCAAT


>TRINITY_DN125672_c0_g1_i15 from sample A1 / Example unspliced isoform:
TCTGAGACTATATTGTCGTTTGCCTTAGTATTCTTTCCTACTTTATTTCCTCTTGTATGGATGGAAGTTTGTGCGGTCATGGTTGACCCTGTGTTCTCGAATTCCATGCGGAAATAAGCGCTTCGATTTCGATCCAGGGCGGTCAGGGCTCCAGGCTGCGAGGGAGTCGTCATCGAAGGCAATCAAATTCCTATTTTTTG
CTGTGAATTTTATTTATTTCGGGTTACGAATGGCGAGAAGTTAGCCAGGTAGGGTTGCAGAAGACTGAAGGCCTGTAGAAATGTGTTACGCGGCTGGACTCGAACTTATAACGTGACTCAGGTGAAGATCGAGGCGCAATGGGAAGTACCGGGGAGCCAGAGCGCAAAAGGCGCCATTTGAACTCCATAAGCCCTACTGT
GAAGAAGCAGCCACCCGCTCCCTCTTCGGACGAAAATAAAGTTGATGCAGCAGTTCTTCAGTATCAGAATCAGAAGCTTGCTCAGCAGTTAGAAGCTCAAAGAAGTGAATTTCATGCATTAGAGAGCAAGTTCAATCAATTAAAAAACAAACAGGCTAAATATGATGACACATTGATAGTAGTTAATAGAACTTGGAAAG
AGTTGGTAGATGACTTGGAGTTGCTATCAATACGAGCTGGAGGATGCACAAATGGAGTTAAGGTTTTGGACCTTTCTCAAACTTTGGAAGATGGAAAAAGTGGATCATGTCCTCCAGAAGAGACCTTTTTGTGTCGGATTTTAGAACCCAGTACAACGGAAAGCAAAGTTGCAAATGCTTCTGTCAACATTGTAGAGAAT
GGCCTTCTGACAAGGCGTGAATCCACATTAAAAATAATGGATTATTTATTAAAAGCAATTGATGATCAGCGAGCTAAAAATCAGGAACTGTCCTCTATTCTTTGTGAGAGGCTGACTGAAGATGAAGTTAGAAAACAACTCCAAAGTAATCATGACAACTTAAGGGAAGAGGTCCAGAATTTACGGGCTGCAATGGATGC
ACATCACTTGAAGCATAAGCAATATTCAAATGAGGTTCAAATTCTTCAAGACAGTCATGCAAAGGATCAATCTGAAATAAAACGGTTGATGGGTGAGCTGGAGGAAACGATGGCAGAGCTTGAAGAAAGTAAATGTAAGCTTGCACGTTTGAAATCACAGAAGGATGCATCACTTGGAGCATCTTTCCCAAACATACATT
TAGGAAATAAAAATGACTTAGACAAATCTGGGGATAAGTCGAGAAAATTGAGAGAGATAGAAGCTGCATTGGAAGAACTTAAGGTACTTATTGGTCTGTGGCAATGTTTCACTTTGTTTACTACTATCATCTATTAACAGTTATCAATCTGGATGTTGGATTACAAGATTAGGAATCTATATCAGAGATATGGATACTGA
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ATATGGTGCCTTGTTGAACAATATTAACTGAATATCAAATCATTTTCGTTCAAATTGAAGTTTGAATTTCAATATTGTGGTAAAATCATTTCTATTCAAACTGAATGTTAAGGTTGAAAGATTTGTCCTTCCAATTTGCAATTTGCAAAATTTATGTTGCAGGCCGAAAGGGATAGTCTTTTGCGTCGTGAGAAGGAAAT
GAATTTGAAACTTGAATCATCTGAGGTTTCAAGGAGGGCAGCTGCAGTTGCTGATGCTAGAATAGCTGAGTTAGAGTTGGATTTGCGAGAGTGCATGACTGAAAGAAATTTATTTGAGACCAGGCTTGAAAAGGCTTTACAGGAGTCAGGTATAACTGCTATATAGATGCTGTAGTGATGCAAGCAAATTGAGATATGAT
ATTATCTTAGGTGCTCCTTTTGCATTATGTGATCTTAAAATGGAATCTCTTAAGACAAATGCATTTGGAACTTTTACAGGAAGGAAAGACATCATTGGTGAATTTAAAGTCATGGTTTCAACTCTACATAAAGAGATGGGCATGATGCAAGCACATTTAACTAAATTTAAAGAGACAGCTTTTGAAGTTCATTCGTTGCG
GGCGGAGGTCCATTCCCTCTCAACTATACTTAACAGAAAGTCAAGTGAATACAAAAAACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGGTTACAGATCTAAGAGAGACTGAACAAGAGTTAAAGTTAATTCTGGAGATGTATGGACGGGAAACCACAGATTCAAGGGATGTCATGG
AAGCAAGGCAAGCAGAATGCAAAGCTTGGGCACAAGTGCATAAGCTAAAGTCTGCCCTTGATGAACACAGTTTGGAATTGCGGGTCAAAGCAGCCAATGAAGCTGAGGCAGTCTGCCAACAGAGACTTGCTGTTGCTGAAGCCGAGATAGCTGACTCAAGGCAAAAGCTTGATGCTGCAGAGAGGGACATATTGGAGTTC
ACTGAAGCTCTGAGAGCTAAAAATGAAGAAGGAGAAGCCTATATAGCTGAAATTGAGACTATTGGGCAAGCATATGAAGATATGCAAACTCAAAATCAACGATTACTTCAGCAGATAACAGAGAGAGATGATTACAATATCAAGCTTGTGTCAGAGAGTGTGAAAACAAAACAGGTTCAAAATGCTCTTCTTATGGAGAA
ACAGCATATGGCAAAGCAATTGCAGCAGGCTGGTACTTCAGCTGAGATGTATAAGCAGAAGATTATGCGCCTTGAAGAACAGGTGAGGGTTTACTTGGATCAAATTGGAAAGGTTACTGAAGATGGTAAGCAGCATGCACTTACGCTAGATAGTACAAAGCGAAAATTGGTAGATGTAGAGAAAGAGTTACAATCTCTCA
AGGTCCGTCTTGAGGCTGTGCAAAAGGAGGCTGAACAGTGCAAACACAGAATTACTGATCTGCAAGTGGAGTTGAAGAATGAGAGGTTTGGGAAAAAGAGACTTGAGGAAGAACTGGTTGCTTTGAACACAAAATTTACGTGCATCAGTTCCCTTAATGATGGTGAAACAGTTGTAGGAAGACTTCAAGAAGAAATCAAA
GAGTACAAGGCAATTTTAAAATGCAGTGTTTGCCATGATAGGCCCAAAGAAGTTGTGATTACCAAGTGCTTCCACTTGTTTTGTGGCCCTTGTATTCAACGAAACTTGGAGACCCGGCACCGCAAATGCCCAGGATGTGGTACAGGTTTTGGACAGAATGATGTGCGGACTGTATACATATGATTTGCATGGTCAATATA
ATCTGGTTTTCTAACAATGGAGAACAATGTAGAGGTCTAAGAACAAAGTTGGAGTTTACAACCAGATTTTATTGGTAAAGATGTACCCAAAAATAATTCATTGGGTAGAGCAGGTCCGAGGACATTCTTTTGTGTCTTAAGACCATCTCCTGTTGAAAGTCATGTAAAGTACTAACTGAAAACAGTGATTCATGGTTTAG
TGTAACCTTCCCCCATTTTAGGAGGGTTTTGTTTTACTGCTAGTCTTTTTTTTCTCTTCCTGACATGCCGAGAACTGGTGTAAATACCATCCATCCTTTATAGTAAAATCTTGGCATTGTAGGTGTAATATGTTTCAGGTTTCAACATTAGACTTGCTGGGGTGGATTTGCTTGCTCTGTATTGTTATCTGTAACTGACT
GCATATTTAACAAATTAATCAAACCAGTTGATGGGATTAAGAAAAACTATTGTACAGACCATTGCTTGTATGAGAGGTGCCATATCCCAAAGGTTGGTCATACTCATTGGAGGCTTCAAGGGAAACTCACCCGGAGCTTTATGATTTCAGAAAAAATGTTCTCTACTTTATGATATGATGGTGACTTGTGAGAAACAAGT
GTGGAGTTTGTCATACTGTTGCAGAGAATAGCAGTGTTAGAGACACGCATCTTATGCTGCACTCTTGAATCATTGGATCACAGATATTTTGGAAGCTCACGTGAATTAGGGAATTGGTATTGTGACCATAGACCTTTCTTCACAGATCACATTGTAGGGGAACGGGGTCATAATTATTTATATGGCTGTTGTCTTTCTCA
AAAAATTCCCCATTGTTGCAAGAAAGTACCTTTTTTGATCTTCGTGCTTTCTGGAGAATATGCATATGTGCCCTCGTTTTTGTTTCAAGGTATGATAGTTAATCTTATATCTGGTTGACAAAGTGATTTTATTGTAGATTTTATGTAGTTTGAAGCATTGAGGCTTGTTTGATTGTATGGCGATCTTAAAATTTTTACTC
ATTATGTTACTCCTGAAGTGTTGCCTTGATTTCATGTGAGTCTCTAGAATTGACAAGTTTATAGGAGGTTTGACAATTAGATTTAGTGACCCATTGAGCTATTTGAGAAACTTGTATTCACTGAAGGTTGAGGAAGAAATGCATATATATTGAAAATTCAAATTATGTGTAGTGGACTGCATTTTCATGAAAATAATTTA
TGTATATAAGTGTGTGTAGAGTTGCATTGGCAGTTTGTGAAATATATTGGAATTTCTGAAACAGCTAAGTAAATTAAATTCTGAATTTGGAGCTGCATGCTGCAGATAATTGTCCATCTGAAGGTGACATGTACCTGGACAACTGAGCATGTTAGCTTCACACCTGCAAAAACCAAATGTAAGTTGTGAGCATTGTGTTC
AACTGATTTTCCTACTTGAAGAGGGATCTCCAAACATATTGCAGTTTGCACTTATGCTTTTAGAATCTTAATGAATAAACAGAAATAAAAGAAGTAAAAAATATCCTTGTTTTGACATCAGTGCCATTGGTGAAGAGTTTCTATTTTAGTTTTACTTTATTTATTTAATCAGTTTATTGTAGTATGCATAGGTCCAACAC
TACTATATTTTTGTAATGTCTGCAATAAAGCTAGTATCTAACCTTTTTACAGAATAACCCACTGAAAAGATAATTAACAATGTTATGATCTATAATCTTCCAGGAATCATTGATGTGTTTTTTTTTAAATTTAATTTGCAATCCATTTATTTGCATCAGTTGAAATAAGTTCGACCATCTTTAATCAAGATCTACATAGA
AAAATACAACCCAGCATCAGTCAACATGCACCTCAAAACAATTAAAGTCAATCTGGTCATGGGGCAGAATTTATCTGATCTTGTTTCAAACGTTAGTCTGTTTTATGTTAGCATGAAATGAGAATGGAACTGGCCATTTTGTTTTCATAGCATTTATGTACAATGATTTTTAAGGTCTACATTACAAATTTGTTTTCTCT
GGCCCAAGATCTTAATTGATTTTCAGGTTGATTCTATCTACAGACTACAACCACATGGTAACGAGGTCAAGAATGTCACTGGTCCTATTCTTTTCCTATAACAAATTTTGTAATAGGCTCTTAAGTTGTGACTATTATTCTATTTGGGTAAATCCCAAGCACAAAATGACAGTTTTGTGTGGCTTTGATGTCCTGAAGCC
AGGGTTTGTATGATACCATTGAAGTTGATGACTGAGTGTTACTATAATCAACATGTGCATTAGAGAACACTGACCCCGGGAATGTATAATCAGGGGTTGTACATTGCAGAAGGGAGACATCCTTATGTTTTGTTTGTAGCTCTGATAAACTTCTCCAGAGGTACAACTTAATGTTCAGTTTTGACGTAGATTTCTAATCT
GCTTAGATGTTTTTGTTTGTTAATGTAGTCACTGTCAAATAATTGCTATGGTTATAGTCTCATGCATTGCTTTAGTTGGAGG



Intron 8 GTAAACATTC ... CTCTTTGCAG

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>TRINITY_DN43918_c1_g4_i7 from sample A9 / Example spliced isoform
CTTGTATGGATGGAAGTTTGTGCGGTCATGGTTGACCCTGTGTTCTCGAATTCCATGCGGAAATAAGCGCTTCGATTTCGATCCAGGGCGGTCAGGGCTCCAGGCTGCGAGGGAGTCGTCATCGAAGGCAATCAAATTCCTATTTTTTGCTGTGAATTTTATTTATTTCGGGTTACGAATGGCGAGAAGTTAGCCAGGTA
GGGTTGCAGAAGACTGAAGGCCTGTAGAAATGTGTTACGCGGCTGGACTCGAACTTATAACGTGACTCAGGTGAAGATCGAGGCGCAATGGGAAGTACCGGGGAGCCAGAGCGCAAAAGGCGCCATTTGAACTCCATAAGCCCTACTGTGAAGAAGCAGCCACCCGCTCCCTCTTCGGACGAAAATAAAGTTGATGCAGC
AGTTCTTCAGTATCAGAATCAGAAGCTTGCTCAGCAGTTAGAAGCTCAAAGAAGTGAATTTCATGCATTAGAGAGCAAGTTCAATCAATTAAAAAACAAACAGGATAAATATGATGACACATTGATAGTAGTTAATAGAACTTGGAAAGAGTTGGTAGATGACTTGGAGTTGCTATCAATACGAGCTGGAGGATGCACAA
ATGGAGTTAAGGTTTTGGACCTTTCTCAAACTTTGGAAGATGGAAAAAGTGGATCATGTCCTCCAGAAGAGACCTTTTTGTGTCGGATTTTAGAACCCAGTACAACGGAAAGCAAAGTTGCAAATGCTTCTGTCAACATTGTAGAGAATGGCCTTCTGACAAGGCGTGAATCCACATTAAAAATAATGGATTATTTATTA
AAAGCAATTGATGATCAGCGAGCTAAAAATCAGGAACTGTCCTCTATTCTTTGTGAGAGGCTGACTGAAGATGAAGTTAGAAAACAACTCCAAAGTAATCATGACAACTTAAGGGAAGAGGTCCAGAATTTACGGGCTGCAATGGATGCACATCACTTGAAGCATAAGCAATATTCAAATGAGGTTCAAATTCTTCAAGA
CAGTCATGCAAAGGATCAATCTGAAATAAAACGGTTGATGGGTGAGCTGGAGGAAACGATGGCAGAGCTTGAAGAAAGTAAATGTAAGCTTGCACGTTTGAAATCACAGAAGGATGCATCACTTGGAGCATCTTTCCCAAACATACATTTAGGAAATAAAAATGACTTAGACAAATCTGGGGATAAGTCGAGAAAATTGA
GAGAGATAGAAGCTGCATTGGAAGAACTTAAGACATTAGCGGAAAATCGACTAATAGAGCTCCAAGAAGCACATCAAGAAAAGCTGAAAATTTCACAGCAGATGGATCGCATACAGGACTCTTTAAACAATGAAAAGCACATTCTGTCATCTAGACCCTACCTTTTACTGAACGACCAACTTCAACGCCTGAAAGCTGAA
GTGGATCATTATCAGTCTGAAGTTGAATCCTTGCAGGCCGAAAGGGATAGTCTTTTGCGTCGTGAGAAGGAAATGAATTTGAAACTTGAATCATCTGAGGTTTCAAGGAGGGCAGCTGCAGTTGCTGATGCTAGAATAGCTGAGTTAGAGTTGGATTTGCGAGAGTGCATGACTGAAAGAAATTTATTTGAGACCAGGCT
TGAAAAGGCTTTACAGGAGTCAGGAAGGAAAGACATCATTGGTGAATTTAAAGTCATGGTTTCAACTCTACATAAAGAGATGGGCATGATGCAAGCACATTTAACTAAATTTAAAGAGACAGCTTTTGAAGTTCATTCGTTGCGGGCGGAGGTCCATTCCCTCTCAACTATACTTAACAGAAAGTCAAGTGAATACAAAA
AACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGGTTACAGATCTAAGAGAGACTGAACAAGAGTTAAAGTTAATTCTGGAGATGTATGGACGGGAAACCACAGATTCAAGGGATGTCATGGAAGCAAGGCAAGCAGAATGCAAAGCTTGGGCACAAGTGCATAAGCTAAAGTCTGCC
CTTGATGAACACAGTTTGGAATTGCGGGTCAAAGCAGCCAATGAAGCTGAGGCAGTCTGCCAACAGAGACTTGCTGTTGCTGAAGCCGAGATAGCTGACTCAAGGCAAAAGCTTGATGCTGCAGAGAGGGACATATTGGAGTTCACTGAAGCTCTGAGAGCTAAAAATGAAGAAGGAGAAGCCTATATAGCTGAAATTGA
GACTATTGGGCAAGCATATGAAGATATGCAAACTCAAAATCAACGATTACTTCAGCAGATAACAGAGAGAGATGATTACAATATCAAGATAATTGTCCATCTGAAGGTGACATGTACCTGGACAACTGAGCATGTTAGCTTCACACCTGCAAAAACCAAATGGAGAACGTGCTACACCGTAAACTTAGGGGACAAGCCAA
CCACCATGGCTCAGTGGTATTGAGGTCGTGGCTACTATTTGGGCGTTTAAGTCGGTACATGTAACTGGAACCTCCACAAGAGTGTTTATTGCTCACTGATTCAAGCTTACGCATGGGCTGAGACACCCATAACGAAATTAACGATTTGCTTGTTTAATCTCTGAGCCGGTTGGCTCTGTTAATTATTTACCACCTTGTTT
TAATGAAGGAAGTGCTTGTCGGCTTATTCTATTTCTTGTATTAAACAATACTTTGAATACTTTCAACCTATGGAACCCTTACGGCTCTGTATTTGTGATTTTATTTATACAATGTTATTAAAAGATTGATGCCCTTCGGCATTCAAACTCTGCATTGAATTTATGCAAAGCCATTCAGCTTGGTTGCTTAAGTCTTGTTT
TATA


>TRINITY_DN43918_c1_g4_i10 from sample A9 / Example unspliced isoform:
GGGACATTGCCAATCTATAAGCATTTTTAAGTTATGCTCACTTGATAGTTAAATTAAAAGAAAGATGATATTCTTTGTAGTTTTAAAGGTACATTATTAAAAAGTATAACATGGTCAATCTTAGCTTTTTGGATCCATGAAGCTTGGTAGCTAATATAGTTTGCATAATTTCATGTTTGTGGAAGCATGCCATTGTACCT
AATAATAATGTAAGTCTTGCATAATTTTGGTGTAATAGATACTTCCCACTTCTGGCTTGTAAGTTCAGATGACCAAATTGATTGATGCTAGTGTTCCTTTGTGATGCAAAATCTGTGTGTGCTAGCGTAATAAAAATGTGGATGATAATATGATGCCATTGCAAAAAAAAAGATTTTTTTTTTCCTATTATAAAGGTCAA
ATATAATGGGTAATGATGAAGCCATGTGATGGCTTGATCACCGTATCCTATATTGGTTCAGCTCTTAATGCGTGGCAAAGATACGATTGTTGATCACGATCCTCAGGATTGTAATCGGTTTCCCTCTAGGGTTTAGTCAAGTGACGAGGTAAGGTAATCTTCATTGTTCCTTCGGCAGTGCAGTGTTATGCTGCTGCGAT
GAAGGGTGGCTCTGTGTAGAGCTTGCCCATCCTGCTGTCGCCATGGTGAAATGTTACAACCACTTGATCTCAGGAATGCTTGCAAGGGTTTTCCTCCAGACCATAAGGTCTTTAGTGCTAACAGTTTGAGTCTGTGATTTCGTCGTTTGGATGTCTTGGGCTCTATTAGAAGTGTTCGTTGTTTAAACTTAAATGCCGAA
GGGATTTGTTGGAAGCCCATGCTGACAGTGAGCAATGGAGCTCTCGGCATCTCTGTTCGACCTTCAGGGTAAGTAAAGAAAACGTTTAAACCTTTACTGTGTTTATTATGCAAAGTCACGATGCCTTTGGTAACTTGTCTTTCGTAGAGCTTTGCTTTGTTGTTCGTTATTTATTTTGAATATAACCTTACTCTTTGTAT
TGTGTGTTTTGTAGGGAGAACGTGCTACACCGTAAACTTAGGGGACAAGCCAACCACCATGGCTCAgtaaacattctcccattaacatgttatggtttatttaatacttataagttccttagacccaaacttactcgttaacgctctttgcagGTGGTATTGAGGTCGTGGCTACTATTTGGGCGTTTAAGTCGGTACAT
GTAACTGGAACCTCCACAAGAGTGTTTATTGCTCACTGATTCAAGCTTACGCATGGGCTGAGACACCCATAACGAAATTAACGATTTGCTTGTTTAATCTCTGAGCCGGTTGGCTCTGTTAATTATTTACCACCTTGTTTTAATGAAGGAAGTGCTTGTCGGCTTATTCTATTTCTTGTATTAAACAATACTTTGAATAC
TTTCAACCTATGGAACCCTTACGGCTCTGTATTTGTGATTTTATTTATACAATGTTATTAAAAGATTGATGCCCTTCGGCATTCAAACTCTGCATTGAATTTATGCAAAGCCATTCAGCTTGGTTGCTTAAGTCTTGTTTTATA



Intron 9 GTGGTGGCCT ... TATGTTGCAG

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>TRINITY_DN125672_c0_g1_i23 from sample A1 / Example spliced isoform
CTGAAATAAAACGGTTGATGGGTAAGTGATATAATCATCTTTTTCCCTGGCATAAATATAGTATCATATTTCTCGTTTCATTCTGCCATGGAAATATGATATTTAGCAAATCTTAACCCATGCAGCAGATGGTCAAGCTCCAAATCATTTCCAAGGTTCTGATTATCTGTTAAGCTTTGAAAATATTTGAGATGTGAAGA
GTTTTTGTTTGTATGGCCATCCAGGTGAGCTGGAGGAAACGATGGCAGAGCTTGAAGAAAGTAAATGTAAGCTTGCACGTTTGAAATCACAGAAGGATGCATCACTTGGAGCATCTTTCCCAAACATACATTTAGGAAATAAAAATGACTTAGACAAATCTGGGGATAAGTCGAGAAAATTGAGAGAGATAGAAGCTGCA
TTGGAAGAACTTAAGGTACTTATTGGTCTGTGGCAATGTTTCACTTTGTTTACTACTATCATCTATTAACAGTTATCAATCTGGATGTTGGATTACAAGATTAGGAATCTATATCAGAGATATGGATACTGAACATAAAGTCTAAACTGGTTTGGCTTTTATATTTCTTCAGACATTAGCGGAAAATCGACTAATAGAGC
TCCAAGAAGCACATCAAGAAAAGCTGAAAATTTCACAGCAGATGGATCGCATACAGGTTAATGTTTTTGTCAGGACCATAGTACACACTAATGGGGCAAAAAACTATCTGTTTTCTGGTGTATTTTGCATCTGTGCTATGCCACTTCCTAAACATATTTTTATTCATGCTAGTGTTAATATTTTTTGTACCATGCAAAAC
AGGACTCTTTAAACAATGAAAAGCACATTCTGTCATCTAGACCCTACCTTTTACTGAACGACCAACTTCAACGCCTGAAAGCTGAAGTGGATCATTATCAGTCTGAAGTTGAATCCTTGCAGGCCGAAAGGGATAGTCTTTTGCGTCGTGAGAAGGAAATGAATTTGAAACTTGAATCATCTGAGGTTTCAAGGAGGGCA
GCTGCAGTTGCTGATGCTAGAATAGCTGAGTTAGAGTTGGATTTGCGAGAGTGCATGACTGAAAGAAATTTATTTGAGACCAGGCTTGAAAAGGCTTTACAGGAGTCAGGAAGGAAAGACATCATTGGTGAATTTAAAGTCATGGTTTCAACTCTACATAAAGAGATGGGCATGATGCAAGCACATTTAACTAAATTTAA
AGAGACAGCTTTTGAAGTTCATTCGTTGCGGGCGGAGGTCCATTCCCTCTCAACTATACTTAACAGAAAGTCAAGTGAATACAAAAAACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGGT


>TRINITY_DN125672_c0_g1_i15 from sample A1 / Example unspliced isoform:
TCTGAGACTATATTGTCGTTTGCCTTAGTATTCTTTCCTACTTTATTTCCTCTTGTATGGATGGAAGTTTGTGCGGTCATGGTTGACCCTGTGTTCTCGAATTCCATGCGGAAATAAGCGCTTCGATTTCGATCCAGGGCGGTCAGGGCTCCAGGCTGCGAGGGAGTCGTCATCGAAGGCAATCAAATTCCTATTTTTTG
CTGTGAATTTTATTTATTTCGGGTTACGAATGGCGAGAAGTTAGCCAGGTAGGGTTGCAGAAGACTGAAGGCCTGTAGAAATGTGTTACGCGGCTGGACTCGAACTTATAACGTGACTCAGGTGAAGATCGAGGCGCAATGGGAAGTACCGGGGAGCCAGAGCGCAAAAGGCGCCATTTGAACTCCATAAGCCCTACTGT
GAAGAAGCAGCCACCCGCTCCCTCTTCGGACGAAAATAAAGTTGATGCAGCAGTTCTTCAGTATCAGAATCAGAAGCTTGCTCAGCAGTTAGAAGCTCAAAGAAGTGAATTTCATGCATTAGAGAGCAAGTTCAATCAATTAAAAAACAAACAGGCTAAATATGATGACACATTGATAGTAGTTAATAGAACTTGGAAAG
AGTTGGTAGATGACTTGGAGTTGCTATCAATACGAGCTGGAGGATGCACAAATGGAGTTAAGGTTTTGGACCTTTCTCAAACTTTGGAAGATGGAAAAAGTGGATCATGTCCTCCAGAAGAGACCTTTTTGTGTCGGATTTTAGAACCCAGTACAACGGAAAGCAAAGTTGCAAATGCTTCTGTCAACATTGTAGAGAAT
GGCCTTCTGACAAGGCGTGAATCCACATTAAAAATAATGGATTATTTATTAAAAGCAATTGATGATCAGCGAGCTAAAAATCAGGAACTGTCCTCTATTCTTTGTGAGAGGCTGACTGAAGATGAAGTTAGAAAACAACTCCAAAGTAATCATGACAACTTAAGGGAAGAGGTCCAGAATTTACGGGCTGCAATGGATGC
ACATCACTTGAAGCATAAGCAATATTCAAATGAGGTTCAAATTCTTCAAGACAGTCATGCAAAGGATCAATCTGAAATAAAACGGTTGATGGGTGAGCTGGAGGAAACGATGGCAGAGCTTGAAGAAAGTAAATGTAAGCTTGCACGTTTGAAATCACAGAAGGATGCATCACTTGGAGCATCTTTCCCAAACATACATT
TAGGAAATAAAAATGACTTAGACAAATCTGGGGATAAGTCGAGAAAATTGAGAGAGATAGAAGCTGCATTGGAAGAACTTAAGGTACTTATTGGTCTGTGGCAATGTTTCACTTTGTTTACTACTATCATCTATTAACAGTTATCAATCTGGATGTTGGATTACAAGATTAGGAATCTATATCAGAGATATGGATACTGA
ACATAAAGTCTAAACTGGTTTGGCTTTTATATTTCTTCAGACATTAGCGGAAAATCGACTAATAGAGCTCCAAGAAGCACATCAAGAAAAGCTGAAAATTTCACAGCAGATGGATCGCATACAGGTTAATGTTTTTGTCAGGACCATAGTACACACTAATGGGGCAAAAAACTATCTGTTTTCTGGTGTATTTTGCATCT
GTGCTATGCCACTTCCTAAACATATTTTTATTCATGCTAGTGTTAATATTTTTTGTACCATGCAAAACAGGACTCTTTAAACAATGAAAAGCACATTCTGTCATCTAGACCCTACCTTTTACTGAACGACCAACTTCAACGCCTGAAAGCTGAAGTGGATCATTATCAGTCTGAAGTTGAATCCTTGCAGgtggtggcct
atatggtgccttgttgaacaatattaactgaatatcaaatcattttcgttcaaattgaagtttgaatttcaatattgtggtaaaatcatttctattcaaactgaatgttaaggttgaaagatttgtccttccaatttgcaatttgcaaaatttatgttgcagGCCGAAAGGGATAGTCTTTTGCGTCGTGAGAAGGAAAT
GAATTTGAAACTTGAATCATCTGAGGTTTCAAGGAGGGCAGCTGCAGTTGCTGATGCTAGAATAGCTGAGTTAGAGTTGGATTTGCGAGAGTGCATGACTGAAAGAAATTTATTTGAGACCAGGCTTGAAAAGGCTTTACAGGAGTCAGGTATAACTGCTATATAGATGCTGTAGTGATGCAAGCAAATTGAGATATGAT
ATTATCTTAGGTGCTCCTTTTGCATTATGTGATCTTAAAATGGAATCTCTTAAGACAAATGCATTTGGAACTTTTACAGGAAGGAAAGACATCATTGGTGAATTTAAAGTCATGGTTTCAACTCTACATAAAGAGATGGGCATGATGCAAGCACATTTAACTAAATTTAAAGAGACAGCTTTTGAAGTTCATTCGTTGCG
GGCGGAGGTCCATTCCCTCTCAACTATACTTAACAGAAAGTCAAGTGAATACAAAAAACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGGTTACAGATCTAAGAGAGACTGAACAAGAGTTAAAGTTAATTCTGGAGATGTATGGACGGGAAACCACAGATTCAAGGGATGTCATGG
AAGCAAGGCAAGCAGAATGCAAAGCTTGGGCACAAGTGCATAAGCTAAAGTCTGCCCTTGATGAACACAGTTTGGAATTGCGGGTCAAAGCAGCCAATGAAGCTGAGGCAGTCTGCCAACAGAGACTTGCTGTTGCTGAAGCCGAGATAGCTGACTCAAGGCAAAAGCTTGATGCTGCAGAGAGGGACATATTGGAGTTC
ACTGAAGCTCTGAGAGCTAAAAATGAAGAAGGAGAAGCCTATATAGCTGAAATTGAGACTATTGGGCAAGCATATGAAGATATGCAAACTCAAAATCAACGATTACTTCAGCAGATAACAGAGAGAGATGATTACAATATCAAGCTTGTGTCAGAGAGTGTGAAAACAAAACAGGTTCAAAATGCTCTTCTTATGGAGAA
ACAGCATATGGCAAAGCAATTGCAGCAGGCTGGTACTTCAGCTGAGATGTATAAGCAGAAGATTATGCGCCTTGAAGAACAGGTGAGGGTTTACTTGGATCAAATTGGAAAGGTTACTGAAGATGGTAAGCAGCATGCACTTACGCTAGATAGTACAAAGCGAAAATTGGTAGATGTAGAGAAAGAGTTACAATCTCTCA
AGGTCCGTCTTGAGGCTGTGCAAAAGGAGGCTGAACAGTGCAAACACAGAATTACTGATCTGCAAGTGGAGTTGAAGAATGAGAGGTTTGGGAAAAAGAGACTTGAGGAAGAACTGGTTGCTTTGAACACAAAATTTACGTGCATCAGTTCCCTTAATGATGGTGAAACAGTTGTAGGAAGACTTCAAGAAGAAATCAAA
GAGTACAAGGCAATTTTAAAATGCAGTGTTTGCCATGATAGGCCCAAAGAAGTTGTGATTACCAAGTGCTTCCACTTGTTTTGTGGCCCTTGTATTCAACGAAACTTGGAGACCCGGCACCGCAAATGCCCAGGATGTGGTACAGGTTTTGGACAGAATGATGTGCGGACTGTATACATATGATTTGCATGGTCAATATA
ATCTGGTTTTCTAACAATGGAGAACAATGTAGAGGTCTAAGAACAAAGTTGGAGTTTACAACCAGATTTTATTGGTAAAGATGTACCCAAAAATAATTCATTGGGTAGAGCAGGTCCGAGGACATTCTTTTGTGTCTTAAGACCATCTCCTGTTGAAAGTCATGTAAAGTACTAACTGAAAACAGTGATTCATGGTTTAG
TGTAACCTTCCCCCATTTTAGGAGGGTTTTGTTTTACTGCTAGTCTTTTTTTTCTCTTCCTGACATGCCGAGAACTGGTGTAAATACCATCCATCCTTTATAGTAAAATCTTGGCATTGTAGGTGTAATATGTTTCAGGTTTCAACATTAGACTTGCTGGGGTGGATTTGCTTGCTCTGTATTGTTATCTGTAACTGACT
GCATATTTAACAAATTAATCAAACCAGTTGATGGGATTAAGAAAAACTATTGTACAGACCATTGCTTGTATGAGAGGTGCCATATCCCAAAGGTTGGTCATACTCATTGGAGGCTTCAAGGGAAACTCACCCGGAGCTTTATGATTTCAGAAAAAATGTTCTCTACTTTATGATATGATGGTGACTTGTGAGAAACAAGT
GTGGAGTTTGTCATACTGTTGCAGAGAATAGCAGTGTTAGAGACACGCATCTTATGCTGCACTCTTGAATCATTGGATCACAGATATTTTGGAAGCTCACGTGAATTAGGGAATTGGTATTGTGACCATAGACCTTTCTTCACAGATCACATTGTAGGGGAACGGGGTCATAATTATTTATATGGCTGTTGTCTTTCTCA
AAAAATTCCCCATTGTTGCAAGAAAGTACCTTTTTTGATCTTCGTGCTTTCTGGAGAATATGCATATGTGCCCTCGTTTTTGTTTCAAGGTATGATAGTTAATCTTATATCTGGTTGACAAAGTGATTTTATTGTAGATTTTATGTAGTTTGAAGCATTGAGGCTTGTTTGATTGTATGGCGATCTTAAAATTTTTACTC
ATTATGTTACTCCTGAAGTGTTGCCTTGATTTCATGTGAGTCTCTAGAATTGACAAGTTTATAGGAGGTTTGACAATTAGATTTAGTGACCCATTGAGCTATTTGAGAAACTTGTATTCACTGAAGGTTGAGGAAGAAATGCATATATATTGAAAATTCAAATTATGTGTAGTGGACTGCATTTTCATGAAAATAATTTA
TGTATATAAGTGTGTGTAGAGTTGCATTGGCAGTTTGTGAAATATATTGGAATTTCTGAAACAGCTAAGTAAATTAAATTCTGAATTTGGAGCTGCATGCTGCAGATAATTGTCCATCTGAAGGTGACATGTACCTGGACAACTGAGCATGTTAGCTTCACACCTGCAAAAACCAAATGTAAGTTGTGAGCATTGTGTTC
AACTGATTTTCCTACTTGAAGAGGGATCTCCAAACATATTGCAGTTTGCACTTATGCTTTTAGAATCTTAATGAATAAACAGAAATAAAAGAAGTAAAAAATATCCTTGTTTTGACATCAGTGCCATTGGTGAAGAGTTTCTATTTTAGTTTTACTTTATTTATTTAATCAGTTTATTGTAGTATGCATAGGTCCAACAC
TACTATATTTTTGTAATGTCTGCAATAAAGCTAGTATCTAACCTTTTTACAGAATAACCCACTGAAAAGATAATTAACAATGTTATGATCTATAATCTTCCAGGAATCATTGATGTGTTTTTTTTTAAATTTAATTTGCAATCCATTTATTTGCATCAGTTGAAATAAGTTCGACCATCTTTAATCAAGATCTACATAGA
AAAATACAACCCAGCATCAGTCAACATGCACCTCAAAACAATTAAAGTCAATCTGGTCATGGGGCAGAATTTATCTGATCTTGTTTCAAACGTTAGTCTGTTTTATGTTAGCATGAAATGAGAATGGAACTGGCCATTTTGTTTTCATAGCATTTATGTACAATGATTTTTAAGGTCTACATTACAAATTTGTTTTCTCT
GGCCCAAGATCTTAATTGATTTTCAGGTTGATTCTATCTACAGACTACAACCACATGGTAACGAGGTCAAGAATGTCACTGGTCCTATTCTTTTCCTATAACAAATTTTGTAATAGGCTCTTAAGTTGTGACTATTATTCTATTTGGGTAAATCCCAAGCACAAAATGACAGTTTTGTGTGGCTTTGATGTCCTGAAGCC
AGGGTTTGTATGATACCATTGAAGTTGATGACTGAGTGTTACTATAATCAACATGTGCATTAGAGAACACTGACCCCGGGAATGTATAATCAGGGGTTGTACATTGCAGAAGGGAGACATCCTTATGTTTTGTTTGTAGCTCTGATAAACTTCTCCAGAGGTACAACTTAATGTTCAGTTTTGACGTAGATTTCTAATCT
GCTTAGATGTTTTTGTTTGTTAATGTAGTCACTGTCAAATAATTGCTATGGTTATAGTCTCATGCATTGCTTTAGTTGGAGG



Intron 10 GTGGTGGTTC ... TCTATCGAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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>TRINITY_DN125672_c0_g1_i16 from sample A1 / Example spliced isoform
TCTGAGACTATATTGTCGTTTGCCTTAGTATTCTTTCCTACTTTATTTCCTCTTGTATGGATGGAAGTTTGTGCGGTCATGGTTGACCCTGTGTTCTCGAATTCCATGCGGAAATAAGCGCTTCGATTTCGATCCAGGGCGGTCAGGGCTCCAGGCTGCGAGGGAGTCGTCATCGAAGGCAATCAAATTCCTATTTTTTG
CTGTGAATTTTATTTATTTCGGGTTACGAATGGCGAGAAGTTAGCCAGGTAGGGTTGCAGAAGACTGAAGGCCTGTAGAAATGTGTTACGCGGCTGGACTCGAACTTATAACGTGACTCAGGTGAAGATCGAGGCGCAATGGGAAGTACCGGGGAGCCAGAGCGCAAAAGGCGCCATTTGAACTCCATAAGCCCTACTGT
GAAGAAGCAGCCACCCGCTCCCTCTTCGGACGAAAATAAAGTTGATGCAGCAGTTCTTCAGTATCAGAATCAGAAGCTTGCTCAGCAGTTAGAAGCTCAAAGAAGTGAATTTCATGCATTAGAGAGCAAGTTCAATCAATTAAAAAACAAACAGGCTAAATATGATGACACATTGATAGTAGTTAATAGAACTTGGAAAG
AGTTGGTAGATGACTTGGAGTTGCTATCAATACGAGCTGGAGGATGCACAAATGGAGTTAAGGTTTTGGACCTTTCTCAAACTTTGGAAGATGGAAAAAGTGGATCATGTCCTCCAGAAGAGACCTTTTTGTGTCGGATTTTAGAACCCAGTACAACGGAAAGCAAAGTTGCAAATGCTTCTGTCAACATTGTAGAGAAT
GGCCTTCTGACAAGGCGTGAATCCACATTAAAAATAATGGATTATTTATTAAAAGCAATTGATGATCAGCGAGCTAAAAATCAGGAACTGTCCTCTATTCTTTGTGAGAGGCTGACTGAAGATGAAGTTAGAAAACAACTCCAAAGTAATCATGACAACTTAAGGGAAGAGGTCCAGAATTTACGGGCTGCAATGGATGC
ACATCACTTGAAGCATAAGCAATATTCAAATGAGGTTCAAATTCTTCAAGACAGTCATGCAAAGGATCAATCTGAAATAAAACGGTTGATGGGTGAGCTGGAGGAAACGATGGCAGAGCTTGAAGAAAGTAAATGTAAGCTTGCACGTTTGAAATCACAGAAGGATGCATCACTTGGAGCATCTTTCCCAAACATACATT
TAGGAAATAAAAATGACTTAGACAAATCTGGGGATAAGTCGAGAAAATTGAGAGAGATAGAAGCTGCATTGGAAGAACTTAAGACATTAGCGGAAAATCGACTAATAGAGCTCCAAGAAGCACATCAAGAAAAGCTGAAAATTTCACAGCAGATGGATCGCATACAGGACTCTTTAAACAATGAAAAGCACATTCTGTCA
TCTAGACCCTACCTTTTACTGAACGACCAACTTCAACGCCTGAAAGCTGAAGTGGATCATTATCAGTCTGAAGTTGAATCCTTGCAGGCCGAAAGGGATAGTCTTTTGCGTCGTGAGAAGGAAATGAATTTGAAACTTGAATCATCTGAGGTTTCAAGGAGGGCAGCTGCAGTTGCTGATGCTAGAATAGCTGAGTTAGA
GTTGGATTTGCGAGAGTGCATGACTGAAAGAAATTTATTTGAGACCAGGCTTGAAAAGGCTTTACAGGAGTCAGGAAGGAAAGACATCATTGGTGAATTTAAAGTCATGGTTTCAACTCTACATAAAGAGATGGGCATGATGCAAGCACATTTAACTAAATTTAAAGAGACAGCTTTTGAAGTTCATTCGTTGCGGGCGG
AGGTCCATTCCCTCTCAACTATACTTAACAGAAAGTCAAGTGAATACAAAAAACTGTCAGATAAATGTGCAGACCATGCAGCTAAAATAAAATCCATGCAAGCTTTGGTTACAGATCTAAGAGAGACTGAACAAGAGTTAAAGTTAATTCTGGAGATGTATGGACGGGAAACCACAGATTCAAGGGATGTCATGGAAGCA
AGGCAAGCAGAATGCAAAGCTTGGGCACAAGTGCATAAGCTAAAGTCTGCCCTTGATGAACACAGTTTGGAATTGCGGGTCAAAGCAGCCAATGAAGCTGAGGCAGTCTGCCAACAGAGACTTGCTGTTGCTGAAGCCGAGATAGCTGACTCAAGGCAAAAGCTTGATGCTGCAGAGAGGGACATATTGGAGTTCACTGA
AGCTCTGAGAGCTAAAAATGAAGAAGGAGAAGCCTATATAGCTGAAATTGAGACTATTGGGCAAGCATATGAAGATATGCAAACTCAAAATCAACGATTACTTCAGCAGATAACAGAGAGAGATGATTACAATATCAAGGTGAGTAGCCCATACAAGGCCTTTAAATCTAGAATCAGATCTTGGCTAATTCTTAGAGGGC
TCTAAAATTCAAGAACACCCATAGCCAAGTAGTTCAAGTAAACTGGATGTTGTTTTCATTAATGTTGTTGAATGGTGGATGATTCATTAGAGGGGAAAAGTTGAAAACATTTGATTTTGTATTTTGTTTTGTTTATTTATTTCCTTCCCTATGTTATCAAAACAAAATTTTTGTTTGATTTTCTATATTCTATTTTGCTT
TTGTATGGTGTCTTTTCGGCTTTTAGCTTTTGCATTCTTCTTTATTTATAGTGCATCTTCTATATGATAATCAATATGCTAAAATGTAGTAAAAGGAATTTCGCTTAGGTCATGTTTGAATATTCACAGTGTAATGATAAATCTAGAATCAAATCTTAGCTAATTCTTAGAGGACTTTCAAATTCAAGTTTACCCCAAGT
AATTTAAGAAAGACTACTAGCTGCTGTTTTCCTTTATGTTGTTGAATGGTGGACGTTTCATCTTTTAAAGGGAGAAGATATTTCATTTTATATTTTGTTTTGTTTATTTAGTTCCTTCCATGTGCTGTCAAAACTAAAATTTATTTCAGCTTTTGATTTCTATTTTCAATTTTATTTTATGGTTTCTTTCTAGCTTTTAG
CTTTTTGCATAGTTATTCATTTATAGTGCATCTTCTGTATGACAATCAATACACTAAAATGTAGGAAACAGAATTTATCTTGGCCCATCTTTGACAATATGAATGCAGTCATCTTAATGTAAGCATGATTGCAATACTGGCTACATAGCTCTAGAAGTAGAAACGTCTGCTTAGCAACTGATTAATCTTATCATCATAAA
CACTCTTTTAGAAAATGAAAGTTGGAAGTTCCATAAATAGACAGTTCCATAAATAGATGAAAGTTGGAATTAGTCATTCTTCCAGGGAATTGAAGCTTGATACATAATGTTCTTATCAGGATCTATGACCTTTGCACTTACTTTATGCAAGTTTAAAAATGTTGGGCCACTGCGTACGTCCAGGAATTGCATTAGCCATT
AGCCTAATAATAGGAGGCAAAGTAAAGGATGTACGATTGATAAGAATAGTATCTACTACCATAAATATACAATCTTTCAGAAAACAATCTTTCACTTCTGACATAGGGAACCTGGTTATAAAGCCATGGAACTTATTCCCACTTCTGAATGGATATGTGCAATAGTTATCATAATTCTAGCTAGTCATGCTTTGTCCCCT
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>TRINITY_DN125672_c0_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:
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AGGCAAGCAGAATGCAAAGCTTGGGCACAAGTGCATAAGCTAAAGTCTGCCCTTGATGAACACAGTTTGGAATTGCGGGTCAAAGCAGCCAATGAAGCTGAGGCAGTCTGCCAACAGAGACTTGCTGTTGCTGAAGCCGAGATAGCTGACTCAAGGCAAAAGCTTGATGCTGCAGAGAGgtggtggttcttttcgtaaac
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GCCCATACAAGGCCTTTAAATCTAGAATCAGATCTTGGCTAATTCTTAGAGGGCTCTAAAATTCAAGAACACCCATAGCCAAGTAGTTCAAGTAAACTGGATGTTGTTTTCATTAATGTTGTTGAATGGTGGATGATTCATTAGAGGGGAAAAGTTGAAAACATTTGATTTTGTATTTTGTTTTGTTTATTTATTTCCTT
CCCTATGTTATCAAAACAAAATTTTTGTTTGATTTTCTATATTCTATTTTGCTTTTGTATGGTGTCTTTTCGGCTTTTAGCTTTTGCATTCTTCTTTATTTATAGTGCATCTTCTATATGATAATCAATATGCTAAAATGTAGTAAAAGGAATTTCGCTTAGGTCATGTTTGAATATTCACAGTGTAATGATAAATCTAG
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>TRINITY_DN125672_c0_g1_i14 from sample A1 / Example unspliced isoform:
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