sp|Q2QNK7|S40A2_ORYSJ ----> Solute carrier family 40 member 2, chloroplastic
Intron 1 GTATGAAAAA ... TATTTTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 17.91 | 10 | 2.4 | 2 |
| A2 | 54.84 | 7.4 | 14.9 | 3 |
| A3 | 57.98 | 5.4 | 6.7 | 8 |
| A4 | 27.08 | 7 | 5.5 | 0 |
| A5 | 70.3 | 2.4 | 1.7 | 9 |
| A6 | 12.53 | 10.1 | 2.1 | 1 |
| A7 | 21.37 | 19.7 | 6.8 | 4 |
| A8 | 15.26 | 14 | 2.1 | 3 |
| A9 | 30.85 | 9.4 | 4.4 | 4 |
| A10 | 17.75 | 14 | 5.1 | 1 |
>TRINITY_DN110309_c0_g1_i1 from sample A2 / Example spliced isoformATTGTGTTGGCGCAGCGATTTCATCAATCTCCTTTACATACATGATAAGGTATCTTTTATGGAAGCCTGGTGCTCACCCAGCCACTGTAGGTTTACCTGGGTTTTGGACACCTTATTAATAGCAACAAGATTTGAAATTGAATTTATGTATACATGCGGAGTGGAGATTGAGAGTCAGGTTGACAGTATGCAAGAGAAGA
GGACATTTCATCGTCGTTATTTTTGAAGCATCCATGGCTTTGGGTGCAGTTTTTGTGGGCAGTAGAACATCTGTGCGAGTGCCCTGCTTCCAACCCCAGAACAGGGCTCTTCAATTATCTTGTCGAAATGTTCACTTCAGGTTTTGTCAGACCACGCCATCAATTTTATCTATTGCTGTTACCAGAACTCCATACAGCAT
TTCCAGATGCTTTCCTAAAGACATTGACATTGAATTCAACCAGAAGGTTGCAAAAGATAAGCTGTCTAAAGACGGGCCTTCTATTGCTTCTAGTTGCCCAGTACCAGTTTTTCCATCAGATAGAGGCTGGGTTAATACTGAAGAGGCTTTTAATGAACTACCAGAAGAAGAAAACATATTTCTGGATAGCACGTTGACAG
CTTTGCCGGTGCAATCAGAGGAAGAACAAGATGCCATGGCAGCAACTCCTGCACATCCTGCAGGCCTATACGCTCTATATGCGAGTTTTTGGGTTGGAAACTTGGTGGAGCAAATTTGGAATTTTGCATGGCCTGTAACTGTTGCACTTCTGCACCCAAGTCTATTGCCGATTGCCGTTGTGAGCTTTGTTGCAAAGATT
GGAATATTTGCTGGAGGTCCCTTGGTTGGTTCACTGATGGATTCTTTTCCAAGAGTGCTTGCATTTAATTCTTTGAGCGCTGTACAGACAGCTGCCCAGTTAATATCAGCAGGAATGATTATTTATGCCTATAATAGAAGCACTCATGCAGCTGCTGCTGCTTCCGCAACTTCATTACTGTTACAACCTTGGTTTGTTGT
ATTAGTATTGGCAGGGGCTGTTGAGAGGCTTACTGGCTTGGCATCTGGGGTTGCATTTGAACGTGATTGGGTTGTATTGCTAGCTGGAACAAATCGCCCAATTGCTCTGGCCAATGCTAATGCCATGCTTAGCAGGGTAGATTTTCTGTGCGAGATTGCAGGATCATCGGTTTTTGGTATTTTATTGGCAAAATTTGGTC
CTGTGACTTCTTTGAAGCTAGCAGCTGTATTGATGATGTGTACACTTCCCATTCTGATTCTTTTGGTGCGTCTTACCAATAAACTTTCAAAAGGTGTTTTAGAACGTCCCAGGCACCATGGCATACATAATGAGTCAAATAATGCTTCTGAGCGTCGGATCCCTGAAAATTTAGTTGAAAGGGGACTGGATGCAATCAGG
TGTGGATGGGTTCAATATAAAACACAACCCGTGCTTCCTGCCAGCCTTGCCTTTGTATTTCTTTATTTCAATGTTGTTCTCTCTCCTGGAGGTCTTATGACATCTTACTTGACACACCGTGGTCTCAATCCATCAGTTATTGGTGCATTCAGCAGCATGTGTGCATTCATGGGTGTTGCAGCTACATTCACGTCAGCCAA
ATTGGTGAAGAAGCTGGGTCTTCTAAAAGCAGGAGCAGCTGGATTAATATTCCAAACTTTAGTACTTGGCATTGCGGTTGCTGTGTATTGGAGTGGTTATATAGCACACCAAAAGTCGCTTATCTTCTTTCTCTTTTTAGTAGTGTTATCAAGATTAGGTCACATGTCTTATGATATAGTGGGCGGACAGATACTTCAGA
CTGCAGTACCACCTTCACAAGCAAACCTTATAGGGACAACAGAAATTTCAATGACAAGTTTAGCAGAACTTGTTATGTTAGGGGTGGCAATTATTGCAAAGGATGTTTCACATTTTGGCTTTCTAGCACTTCTCTCTATGGCTTCCGTAGCTGGGGCTGCCTGGATTTACTGCCAGTGGATGTCAAACCCCGCCAACGAT
TCCCTGCAATTGTTCTCATGTAATCCACATTACAATTCTCCTTTATCCAGCAATGAGCAATCAGTC
>TRINITY_DN110309_c0_g1_i5 from sample A2 / Example unspliced isoform:ATTGTGTTGGCGCAGCGATTTCATCAATCTCCTTTACATACATGATAAGGTATCTTTTATGGAAGCCTGGTGCTCACCCAGCCACTGTAGGTTTACCTGGGTTTTGGACACCTTATTAATAGCAACAAGATTTGAAATTGAATTTATGTATACATGCGGAGTGGAGATTGAGAGTCAGGTTGACAGTATGCAAGAGAAGA
GGACATTTCATCGTCGTTATTTTTGAAGCATCCATGGCTTTGGGTGCAGTTTTTGTGGGCAGTAGAACATCTGTGCGAGTGCCCTGCTTCCAACCCCAGAACAGGGCTCTTCAATTATCTTGTCGAAATGTTCACTTCAGGTTTTGTCAGACCACGCCATCAATTTTATCTATTGCTGTTACCAGAACTCCATACAGCAT
TTCCAGATGCTTTCCTAAAGACATTGACATTGAATTCAACCAGAAGGTTGCAAAAGATAAGCTGTCTAAAGACGGGCCTTCTATTGCTTCTAGTTGCCCAGTACCAGTTTTTCCATCAGATAGAGGCTGGGTTAATACTGAAGAGGCTTTTAATGAACTACCAGAAGAAGAAAACATATTTCTGGATAGCACGTTGACAG
CTTTGCCGgtatgaaaaaaggcttgcctgcaattacagcactttcctctggtttcattcttacagacaactcgatttatgattagcttgtttaagcttgctcctgaagaattccatagcatatgaaattttctgtggaagtcttattggatctgagtaacaaggtatttggaacttaggaagttgaacccttacacaagt
tcagaggatgttcagcagttttgggttattttccagGTGCAATCAGAGGAAGAACAAGATGCCATGGCAGCAACTCCTGCACATCCTGCAGGCCTATACGCTCTATATGCGAGTTTTTGGGTTGGAAACTTGGTGGAGCAAATTTGGAATTTTGCATGGCCTGTAACTGTTGCACTTCTGCACCCAAGTCTATTGCCGAT
TGCCGTTGTGAGCTTTGTTGCAAAGATTGGAATATTTGCTGGAGGTCCCTTGGTTGGTTCACTGATGGATTCTTTTCCAAGAGTGCTTGCATTTAATTCTTTGAGCGCTGTACAGACAGCTGCCCAGTTAATATCAGCAGGAATGATTATTTATGCCTATAATAGAAGCACTCATGCAGCTGCTGCTGCTTCCGCAACTT
CATTACTGTTACAACCTTGGTTTGTTGTATTAGTATTGGCAGGGGCTGTTGAGAGGCTTACTGGCTTGGCATCTGGGGTTGCATTTGAACGTGATTGGGTTGTATTGCTAGCTGGAACAAATCGCCCAATTGCTCTGGCCAATGCTAATGCCATGCTTAGCAGGGTAGATTTTCTGTGCGAGATTGCAGGATCATCGGTT
TTTGGTATTTTATTGGCAAAATTTGGTCCTGTGACTTCTTTGAAGCTAGCAGCTGTATTGATGATGTGTACACTTCCCATTCTGATTCTTTTGGTGCGTCTTACCAATAAACTTTCAAAAGGTGTTTTAGAACGTCCCAGGCACCATGGCATACATAATGAGTCAAATAATGCTTCTGAGCGTCGGATCCCTGAAAATTT
AGTTGAAAGGGGACTGGATGCAATCAGGTGTGGATGGGTTCAATATAAAACACAACCCGTGCTTCCTGCCAGCCTTGCCTTTGTATTTCTTTATTTCAATGTTGTTCTCTCTCCTGGAGGTCTTATGACATCTTACTTGACACACCGTGGTCTCAATCCATCAGTTATTGGTGCATTCAGCAGCATGTGTGCATTCATGG
GTGTTGCAGCTACATTCACGTCAGCCAAATTGGTGAAGAAGCTGGGTCTTCTAAAAGCAGGAGCAGCTGGATTAATATTCCAAACTTTAGTACTTGGCATTGCGGTTGCTGTGTATTGGAGTGGTTATATAGCACACCAAAAGTCGCTTATCTTCTTTCTCTTTTTAGTAGTGTTATCAAGATTAGGTCACATGTCTTAT
GATATAGTGGGCGGACAGATACTTCAGACTGCAGTACCACCTTCACAAGCAAACCTTATAGGGACAACAGAAATTTCAATGACAAGTTTAGCAGAACTTGTTATGTTAGGGGTGGCAATTATTGCAAAGGATGTTTCACATTTTGGCTTTCTAGCACTTCTCTCTATGGCTTCCGTAGCTGGGGCTGCCTGGATTTACTG
CCAGTGGATGTCAAACCCCGCCAACGATTCCCTGCAATTGTTCTCATGTAATCCACATTACAATTCTCCTTTATCCAGCAATGAGCAATCAGTC
Intron 2 GTGATCACTC ... GCAAGAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 12.5 | 18.7 | 2 | 3.3 |
| A2 | 4.76 | 8 | 0 | 0.7 |
| A3 | 29.05 | 15 | 9 | 3.3 |
| A4 | 20.45 | 9 | 3 | 1.7 |
| A5 | 19.45 | 4.3 | 2 | 0 |
| A6 | 17.22 | 9.7 | 2 | 1.7 |
| A7 | 4.93 | 21.7 | 0 | 2.3 |
| A8 | 1.36 | 19.7 | 0 | 0.7 |
| A9 | 5.55 | 19.3 | 1 | 1.3 |
| A10 | 1.48 | 20.7 | 0 | 0.7 |
>TRINITY_DN116202_c3_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoformCACCAATCCTCGGGCATGTGTGATTGAAATTGTGTTGGCGCAGCGATTTCATCAATCTCCTTTACATACATGATAAGGTATCTTTTATGGAAGCCTGGTGCTCACCCGGCCACTGTAGGTTTACCTGGGTTTTGGACACCAGTAACAAGATTTGAAATTGAATTTATGTATACATGCGGAGTGGAGATTGAGAGTCAGGT
TGACAGTATGCAAGAGAAGAGGACATTTCATCGTCGTTATTTTTGAAGCATCCATGGCGTTGGGTGCAGTTTTTGTGGGCAGTAGAACATCTGTGCGAGTGCCCTGCTTCCAACCCCAGAACAGGGCTCTTCAATTATCTTGTCGAAATGTTCACTTCAGGTTTTGTCAGACCACGCCATCAATTTTATCTATTGCTGTT
ACCAGAACTCCATACAGCATTTCCAGATGCTTTCCTAAAGACATTGACATTGAATTCAACCAGAAGGTTGCAAAAGATAAGCTGTCTAAAGACGGGCCTTCTATTGCTTCTAGTTGCCCAGTACCAGTTTTTCCATCAGATAGAGGCTGGGTTAATACTGAAGAGGCTTTTAATGAACTACCAGAAGAAGAAAACATATT
TCTGGATAGCACGTTGACAGCTTTGCCGGTGCAATCAGAGGAAGAACAAGATGCCATGGCAGCAACTCCTGCACATCCTGCAGGCCTATACGCTCTATATGCGAGTTTTTGGGTTGGAAACTTGGTGGAGCAAATTTGGAATTTTGCATGGCCTGTAACTGTTGCACTTCTGCACCCAAGTCTATTGCCGATTGCCGTTG
TGAGCTTTGTTGCAAAGATTGGAATATTTGCTGGAGGTCCCTTGGTTGGTTCACTGATGGATTCTTTTCCAAGAGTGCTTGCATTTAATTCTTTGAGCGCTGTACAGACAGCTGCCCAGTTAATATCAGCAGGAATGATTATTTATGCCTATAATAGAAGCACTCATGCAGCTGCTGCTGCTTCCGCAACTTCATTACTG
TTACAACCTTGGTTTGTTGTATTAGTATTGGCAGGGGCTGTTGAGAGGCTTACTGGCTTGGCATCTGGGGTTGCATTTGAACGCGATTGGGTTGTATTGCTAGCTGGAACAAATCGTCCAATTGCTCTGGCCAATGCTAATGCCATGCTTAGCAGGGTAGATTTTCTGTGCGAGATTGCAGGATCATCGGTTTTTGGTAT
TTTATTGGCAAAATTTGGTCCTGTGACTTCTTTGAAGCTAGCAGCTGTATTGATGATGTGTACACTTCCCATTCTGATTCTTTTGGTGCGTCTTACCAATAAACTTTCAAAAGGTGTTTTAGAACGTCCCAGGCACCATGGCATACATAATGAGTCAAATAATGCTTCTGAGCGTCGGATCCCTGAAAATTTAGTTGAAA
GGGGACTGGATGCAATCAGGTGTGGATGGGTTCAATATAAAACACAACCCGTGCTTCCTGCCAGCCTTGCCTTTGTATTTCTTTATTTCAATGTTGTTCTCTCTCCTGGAGGTCTTATGACATCTTACTTGACACACCGTGGTCTCAATCCATCAGTTATTGGTGCATTCAGCAGCATGTGTGCATTCATGGGTGTTGCA
GCTACATTCACGTCAGCCAAATTGGTGAAGAAGCTGGGTCTTCTAAAAGTTAGTTTAGTTGCAGCCAGTCATTTCTCTCCAGTTCAAAGTTAATTCTTTTGTTTGGAGATTTTATAGTTGATGGTTATATTTTGTGATCCAGGGTTATTTCTTAACCATTGGTTTATGTTATTGTCTGTCTGTAGGCAGGAGCAGCTGGA
TTAATATTCCAAACTTTAGTACTTGGCATTGCGGTTGCTGTGTATTGGAGTGGTTATATAGCACACCAAAAGTCGCTTATATTCTTTCTCTTTTTAGTAGTAAGCAGTTTGCGCTGTTTCTAGACTTAATTTTTCAAGATAGCATGATTCTAATATTACATGGAAATATACAAAGTGCATGATGAAGAAGAATGAAGGGA
TAAGGGACTTCCCTGTCTGACCA
>TRINITY_DN116202_c3_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:TGTGTGTGAGTTTACCTCTTTCTCATCTCTACCTGCTCCATTCATGGACTTCATTTTGTTCTCTGCAGCTAGCTGGAACAAATCGTCCAATTGCTCTGGCCAATGCTAATGCCATGCTTAGCAGGGTAGATTTTCTGTGCGAGgtgatcactcggagaaactaagtgctactattattgatggttttatgcacacattga
taagccctctaattcaaattgtctctggatggcaagagcagATTGCAGGATCATCGGTTTTTGATTCTTTTGGTGCGTCTTACCAATAAACTTTCAAAAGGTGTTTTAGAACGTCCCAGGCACCATGGCATACATAATGAGTCAAATAATGCTTCTGAGCGTCGGATCCCTGAAAATTTAGTTGAAAGGGGACTGGATGC
AATCAGGTGTGGATGGGTTCAATATAAAACACAACCCGTGCTTCCTGCCAGCCTTGCCTTTGTATTTCTTTATTTCAATGTTGTTCTCTCTCCTGGAGGTCTTATGACATCTTACTTGACACACCGTGGTCTCAATCCATCAGTTATTGGTGCATTCAGCAGCATGTGTGCATTCATGGGTGTTGCAGCTACATTCACGT
CAGCCAAATTGGTGAAGAAGCTGGGTCTTCTAAAAGCAGGAGCAGCTGGATTAATATTCCAAACTTTAGTACTTGGCATTGCGGTTGCTGTGTATTGGAGTGGTTATATAGCACACCAAAAGTCGCTTATCTTCTTTCTGTTTTTAGTAGTGTTATCAAGATTAGGTCACATGTCTTATGATATAGTGGGCGGACAGATA
CTTCAGACTGCAGTACCACCTTCACAAGCAAACCTTATAGGGACAACAGAAATTTCAATGACAAGTTTAGCAGAACTTGTTATGTTAGGGGTGGCAATTATTGCAAAGGATGTTTCACATTTTGGCTTTCTAGCACTTCTCTCTATGGCTTCCGTAGCTGGGGCTGCCTGGATTTACTGCCAGTGGATGTCAAACCCCGC
CAACGATTCCCTGCAATTGTTCTCATGTAATCCACATTACAATTCTCCTTTATCCAGCAATGAGCAATCAGTCACCACGGATATTGGTTCCAAACCCTCTTCTCCTGTAATGTAGAAGAAATTTAATTTATTTTTCTATCTCGATAATTTCCCCAAGCTTATTCTTATGTTATACTCGGG
Intron 3 GTAGGAAGCA ... TTCTCTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 33.33 | 22 | 1 | 11 |
| A2 | 12.5 | 14 | 0.8 | 2 |
| A3 | 33.33 | 4 | 1.4 | 2 |
| A4 | 50 | 10 | 4 | 10 |
| A5 | 25 | 3 | 0 | 1 |
| A6 | 16.67 | 15 | 1.2 | 3 |
| A7 | 39.29 | 17 | 6.4 | 11 |
| A8 | 37.5 | 15 | 1.8 | 9 |
| A9 | 35.71 | 18 | 3 | 10 |
| A10 | 26.47 | 25 | 3.2 | 9 |
>TRINITY_DN44762_c0_g2_i8 from sample A8 / Example spliced isoformCGGGCATGTGTGATTGAAATTGTGTTGGCGCAGCGATTTCACCAATCTCCTTTACATACATGATAAGGTATCTTTTATGGAAGCCTGGTGCTCACCCGGCCACTGTAGGTTTACCTGGGTTTTGGACACCTTATTAATAGTAACAAGATTTGAAATTGAATTTATGTATACATGCGGAGTGGAGATTGAGAGTCAGGTTG
ACAGTATGCAAGAGAAGAGGACATTTCATCGTCGTTATTTTTGAAGCATCCATGGCTTTGGGTGCAGTTTTTGTGGGCAGTAGAACATCTGTGCGAGTGCCCTGCTTCCAACCCCAGAACAGGGCTCTTCAATTATCTTGTCGAAATGTTCACTTCAGGTTTTGTCAGACCACGCCATCAATTTTATCTATTGCTGTTAC
CAGAACTCCATACAGCATTTCCAGATGCTTTCCTAAAGACATTGACATTGAATTCAACCAGAAGGTTGCAAAAGATAAGCTGTCTAAAGACGGGCCTTCTATTGCTTCTAGTTGCCCAGTACCAGTTTTTCCATCAGATAGAGGCTGGGTTAATACTGAAGAGGCTTTTAATGAACTACCAGAAGAAGAAAACATATTTC
TGGATAGCACGTTGACAGCTTTGCCGGTGCAATCAGAGGAAGAACAAGATGCCATGGCAGCAACTCCTGCACATCCTGCAGCCCTATATGCTCTATATGCGAGTTTTTGGGTTGGAAACTTGGTGGAGCAAATTTGGAATTTTGCATGGCCTGTAACTGTTGCACTTCTGCACCCAAGTCTATTGCCGATTGCCGTTGTG
AGCTTTGTTGCAAAGATTGGAATATTTGCTGGGGGTCCCTTGGTTGGTTCACTGATGGATTCTTTTCCAAGAGTGCTTGCATTTAATTCTTTGAGCGCTGTACAGACAGCTGCCCAGTTAATATCAGCAGGAATGATTATTTATGCCTATAATAGAAGCACTCATGCAGCTGCTGCTGCTTCCGCAACTTCATTACTGTT
ACAACCTTGGTTTGTTGTATTAGTATTGGCAGGGGCTGTTGAGAGGCTTACTGGCTTGGCATCTGGGGTTGCATTTGAACGTGATTGGGTTGTATTGCTAGCTGGAACAAATCGCCCAATTGCTCTGGCCAATGCTAATGCCATGCTTAGCAGGGTAGATTTTCTGTGCGAGATTGCAGGATCATCGGTTTTTGGTATTT
TATTGGCAAAATTTGGTCCTGTGACTTCTTTGAAGCTAGCAGCTGTATTGATGATGTGTACACTTCCCATTCTGATTCTTTTGGTGCGTCTTACCAATAAACTTTCAAAAGGTGTTTTAGAACGTCCCAGGCACCATGGCATACATAATGAGTCAAATAATGCTTCTGAGCGTCGGATCCCTGAAAATTTAGTTGAAAGG
GGACTGGATGCAATCAGGTGTGGATGGGTTCAATATAAAACACAACCCGTGCTTCCTGCCAGCCTTGCCTTTGTATTTCTTTATTTCAACGTTGTTCTCTCTCCTGGAGGTCTTATGACATCTTACTTGACACACCGTGGTCTCAATCCATCAGTTATTGGTGCATTCAGCAGCATGTGTGCATTCATGGGTGTTGCAGC
TACATTCACGTCAGCCAAATTGGTGAAGAAGCTGGGTCTTCTAAAAGCAGGAGCAGCTGGATTAATATTCCAAACTTTAGTACTTGGCATTGCGGTTGCTGTGTATTGGAGTGGTTATATAGCACACCAAAAGTCGCTTATCTTCTTTCTCTTTTTAGTAGTGTTATCAAGATTAGGTCACATGTCTTATGATATAGTGG
GCGGACAGATACTTCAGACTGCAGTACCACCTTCACAAGCAAACCTTATAGGGACAACAGAAATTTCAATGACAAGTTTAGCAGAACTTGTTATGTTAGGGGTGGCAATTATTGCAAAGGATGTTTCACATTTTGGCTTTCTAGCACTTCTCTCTATGGCTTCCGTAGCTGGGGCTGCCTGGATTTACTGCCAGTGGATG
TCAAACCCCGCCAACGATTCCCTGCAATTGTTCTCATGTAATCCACATTACAATTCTCCTTTATCCAGCAATGAGCAATCAGTCACCACGGATATTGGTTCCAAACCCTCTTCTCCTGTAATGTAGAAGAAATTTAATTTATTTTTCTATCTTGATAATTTCCCCAAGCTTATTCTTATGTTATACTCGGGAATTGGGAT
TTTTTAATTTAATTTAATTTTTTTGCAAATATTGCCCATTTTTGTCTACAAACTCACAGCTAATCATACGAAGGTCAGAACCATATGTGCCATTGTTTTGGTCAACATGGTCTGACAGAATAGCATTGCAGATAATGCTCAAGTAGAGTTTTTCTTGTCGGAACCTGCCATTGAAGAGAGAAGGAAAACCTATATAAATG
CAATTCGTGAATTAACATTCACATCTTTCGAAAGTATGGATGTTCTTTTCATATCTTCCGTGACTTTGTATCCAAAAGCTACAATTGAGAAATTCCCAGAATGAAATGATGCTTGTGATATTAATTGTGCTTTGTCTGGTAGACCTAGCAGGGAACTGGAATTCCCATTATCTTCATTTTATAACTTTTATGGGTTACTA
ACCCCATACTTTCGTTGAGAGTATGCATTTACAAAAAAGTAGTAGTATGCA
>TRINITY_DN44762_c0_g2_i2 from sample A8 / Example unspliced isoform:CGGGCATGTGTGATTGAAATTGTGTTGGCGCAGCGATTTCACCAATCTCCTTTACATACATGATAAGGTATCTTTTATGGAAGCCTGGTGCTCACCCGGCCACTGTAGGTTTACCTGGGTTTTGGACACCTTATTAATAGTAACAAGATTTGAAATTGAATTTATGTATACATGCGGAGTGGAGATTGAGAGTCAGGTTG
ACAGTATGCAAGAGAAGAGGACATTTCATCGTCGTTATTTTTGAAGCATCCATGGCTTTGGGTGCAGTTTTTGTGGGCAGTAGAACATCTGTGCGAGTGCCCTGCTTCCAACCCCAGAACAGGGCTCTTCAATTATCTTGTCGAAATGTTCACTTCAGGTTTTGTCAGACCACGCCATCAATTTTATCTATTGCTGTTAC
CAGAACTCCATACAGCATTTCCAGATGCTTTCCTAAAGACATTGACATTGAATTCAACCAGAAGGTTGCAAAAGATAAGCTGTCTAAAGACGGGCCTTCTATTGCTTCTAGTTGCCCAGTACCAGTTTTTCCATCAGATAGAGGCTGGGTTAATACTGAAGAGGCTTTTAATGAACTACCAGAAGAAGAAAACATATTTC
TGGATAGCACGTTGACAGCTTTGCCGGTGCAATCAGAGGAAGAACAAGATGCCATGGCAGCAACTCCTGCACATCCTGCAGCCCTATATGCTCTATATGCGAGTTTTTGGGTTGGAAACTTGGTGGAGCAAATTTGGAATTTTGCATGGCCTGTAACTGTTGCACTTCTGCACCCAAGTCTATTGCCGATTGCCGTTGTG
AGCTTTGTTGCAAAGATTGGAATATTTGCTGGGGGTCCCTTGGTTGGTTCACTGATGGATTCTTTTCCAAGAGTGCTTGCATTTAATTCTTTGAGCGCTGTACAGACAGCTGCCCAGTTAATATCAGCAGGAATGATTATTTATGCCTATAATAGAAGCACTCATGCAGCTGCTGCTGCTTCCGCAACTTCATTACTGTT
ACAACCTTGGTTTGTTGTATTAGTATTGGCAGGGGCTGTTGAGAGGCTTACTGGCTTGGCATCTGGGGTTGCATTTGAACGCGATTGGGTTGTATTGgtaggaagcaaattttttaattgttggacataaacatgtgtgtgagtttacctctttctcatctctacctgctccattcatggacttcattttgttctctgca
gCTAGCTGGAACAAATCGTCCAATTGCTCTGGCCAATGCTAATGCCATGCTTAGCAGGGTAGATTTTCTGTGCGAGATTGCAGGATCATCGGTTTTTGGTATTTTATTGGCAAAATTTGGTCCTGTGACTTCTTTGAAGCTAGCAGCTGTATTGATGATGTGTACACTTCCCATTCTGATTCTTTTGGTGCGTCTTACCA
ATAAACTTTCAAAAGGTGTTTTAGAACGTCCCAGGCACCATGGCATACATAATGAGTCAAATAATGCTTCTGAGCGTCGGATCCCTGAAAATTTAGTTGAAAGGGGACTGGATGCAATCAGGTGTGGATGGGTTCAATATAAAACACAACCCGTGCTTCCTGCCAGCCTTGCCTTTGTATTTCTTTATTTCAACGTTGTT
CTCTCTCCTGGAGGTCTTATGACATCTTACTTGACACACCGTGGTCTCAATCCATCAGTTATTGGTGCATTCAGCAGCATGTGTGCATTCATGGGTGTTGCAGCTACATTCACGTCAGCCAAATTGGTGAAGAAGCTGGGTCTTCTAAAAGCAGGAGCAGCTGGATTAATATTCCAAACTTTAGTACTTGGCATTGCGGT
TGCTGTGTATTGGAGTGGTTATATAGCACACCAAAAGTCGCTTATCTTCTTTCTCTTTTTAGTAGTGTTATCAAGATTAGGTCACATGTCTTATGATATAGTGGGCGGACAGATACTTCAGACTGCAGTACCACCTTCACAAGCAAACCTTATAGGGACAACAGAAATTTCAATGACAAGTTTAGCAGAACTTGTTATGT
TAGGGGTGGCAATTATTGCAAAGGATGTTTCACATTTTGGCTTTCTAGCACTTCTCTCTATGGCTTCCGTAGCTGGGGCTGCCTGGATTTACTGCCAGTGGATGTCAAACCCCGCCAACGATTCCCTGCAATTGTTCTCATGTAATCCACATTACAATTCTCCTTTATCCAGCAATGAGCAATCAGTCACCACGGATATT
GGTTCCAAACCCTCTTCTCCTGTAATGTAGAAGAAATTTAATTTATTTTTCTATCTCGA
Intron 4 GTAAGCAGTT ... CTGTGTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 41.8 | 11 | 6.8 | 9 |
| A2 | 49.74 | 10 | 13.8 | 6 |
| A3 | 34.58 | 11.4 | 2 | 10 |
| A4 | 42.86 | 8 | 4 | 8 |
| A5 | 44.29 | 10.3 | 9.4 | 7 |
| A6 | 30.5 | 36 | 8.6 | 23 |
| A7 | 30.2 | 39.4 | 11.2 | 23 |
| A8 | 27.46 | 39 | 9.6 | 20 |
| A9 | 38.82 | 22.7 | 11.8 | 17 |
| A10 | 36.55 | 26 | 15 | 15 |
>TRINITY_DN43957_c1_g1_i3 from sample A6 / Example spliced isoformTTTATCGAAAGTTAAACTACACCAATCCTCGGGCATGTGTGATTGAAATTGTGTTGGCGCAGCGATTTCATCAATCTCCTTTACATACATGATAAGGTATCTTTTATGGAAGCCTGGTGCTCACCCGGCCACTGTAGGTTTACCTGGGTTTTGGACACCAGTAACAAGATTTGAAATTGAATTTATGTATACATGCGGAG
TGGAGATTGAGAGTCAGGTTGACAGTATGCAAGAGAAGAGGACATTTCATCGTCGTTATTTTTGAAGCATCCATGGCGTTGGGTGCAGTTTTTGTGGGCAGTAGAACATCTGTGCGAGTGCCCTGCTTCCAACCCCAGAACAGGGCTTTTCAATTATCTTGTCGAAATGTTCACTTCAGGTTTTGTCAGACCACGCCATC
AATTTTATCTATTGCTGTTACCAGAACTCCATACAGCATTTCCAGATGCTTTCCTAAAGACATTGACATTGAATTCAACCAGAAGGTTGCAAAAGATAAGCTGTCTAAAGACGGGCCTTCTATTGCTTCTAGTTGCCCAGTACCAGTTTTTCCATCAGATAGAGGCTGGGTTAATACTGAAGAGGCTTTTAATGAACTAC
CAGAAGAAGAAAACATATTTCTGGATAGCACGTTGACAGCTTTGCCGGTGCAATCAGAGGAAGAACAAGATGCCATGGCAGCAACTCCTGCACATCCTGCAGGCCTATACGCTCTATATGCGAGTTTTTGGGTTGGAAACTTGGTGGAGCAAATTTGGAATTTTGCATGGCCTGTAACTGTTGCACTTCTGCACCCAAGT
CTATTGCCGATTGCCGTTGTGAGCTTTGTTGCAAAGATTGGAATATTTGCTGGGGGTCCCTTGGTTGGTTCACTGATGGATTCTTTTCCAAGAGTGCTTGCATTTAATTCTTTGAGCGCTGTACAGACAGCTGCCCAGTTAATATCAGCAGGAATGATTATTTATGCCTATAATAGAAGCACTCATGCAGCTGCTGCTGC
TTCCGCAACTTCATTACTGTTACAACCTTGGTTTGTTGTATTAGTATTGGCAGGGGCTGTTGAGAGGCTTACTGGCTTGGCATCTGGGGTTGCATTTGAACGTGATTGGGTTGTATTGCTAGCTGGAACAAATCGTCCAATTGCTCTGGCCAATGCTAATGCCATGCTTAGCAGGGTAGATTTTCTGTGCGAGGTGATCA
CTCGGAGAAACTAAGTGCTACTATTATTGATGGTTTTATGCACACATTGATAAGCCCTCTAATTCAAATTGTCTCTGGATGGCAAGAGCAGATTGCAGGATCATCGGTTTTTGATTCTTTTGGTGCGTCTTACCAATAAACTTTCAAAAGGTGTTTTAGAACGTCCCAGGCACCATGGCATACATAATGAGTCAAATAAT
GCTTCTGAGCGTCGGATCCCTGAAAATTTAGTTGAAAGGGGACTGGATGCAATCAGGTGTGGATGGGTTCAATATAAAACACAACCCGTGCTTCCTGCCAGCCTTGCCTTTGTATTTCTTTATTTCAATGTTGTTCTCTCTCCTGGAGGTCTTATGACATCTTACTTGACACACCGTGGTCTCAATCCATCAGTTATTGG
TGCATTCAGCAGCATGTGTGCATTCATGGGTGTTGCAGCTACATTCACGTCAGCCAAATTGGTGAAGAAGCTGGGTCTTCTAAAAGCAGGAGCAGCTGGATTAATATTCCAAACTTTAGTACTTGGCATTGCGGTTGCTGTGTATTGGAGTGGTTATATAGCACACCAAAAGTCGCTTATCTTCTTTCTGTTTTTAGTAG
TGTTATCAAGATTAGGTCACATGTCTTATGATATAGTGGGCGGACAGATACTTCAGACTGCAGTACCACCTTCACAAGCAAACCTTATAGGGACAACAGAAATTTCAATGACAAGTTTAGCAGAACTTGTTATGTTAGGGGTGGCAATTATTGCAAAGGATGTTTCACATTTTGGCTTTCTAGCACTTCTCTCTATGGCT
TCCGTAGCTGGGGCTGCCTGGATTTACTGCCAGTGGATGTCAAACCCCGCCAACGATTCCCTGCAATTGTTCTCATGTAATCCACATTACAATTCTCCTTTATCCAGCAATGAGCAATCAGTCACCACGGATATTGGTTCCAAACCCTCTTCTCCTGTAATGTAGAAGAAATTTAATTTATTTTTCTATCTCGATAATTT
CCCCAAGCTTATTCTTATGTTATACTCGGGAATTGGGATTTTTTAATTTAATTTAATTTTTTTGCAAATATTGCCCATTTTTGTCTACAAACTCACAGCTAATCATACGAAGGTCAGAACCATATGTGCCATTGTTTTGGTCAACATGGTCTGACAGAATAGCATTGCAGATAATGCTCAAGTAGAGTTTTTCTTGTCGG
AACCTGCCATTGAAGAGAGAAGGAAAACCTATATAAATGCAATTCGTGAATTAACATTCACATCTTTCGAAAGTATGGATGTTCTTTTCATATCTTCCGTGACTTTGTATCCAAAAGCTACAATTGAGAAATTCCCAGAATGAAATGATGCTTGTGATATTAATTGTGCTTTGTCTGGTAGACCTAGCAGGGAACTGGAA
TTCCCATTATCTTCATTTTATAACTTTTATGGGTTACTAACCCCATACTTTCGTTGAGAGTATGCATTTACA
>TRINITY_DN43957_c1_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:TTTATCGAAAGTTAAACTACACCAATCCTCGGGCATGTGTGATTGAAATTGTGTTGGCGCAGCGATTTCATCAATCTCCTTTACATACATGATAAGGTATCTTTTATGGAAGCCTGGTGCTCACCCGGCCACTGTAGGTTTACCTGGGTTTTGGACACCAGTAACAAGATTTGAAATTGAATTTATGTATACATGCGGAG
TGGAGATTGAGAGTCAGGTTGACAGTATGCAAGAGAAGAGGACATTTCATCGTCGTTATTTTTGAAGCATCCATGGCGTTGGGTGCAGTTTTTGTGGGCAGTAGAACATCTGTGCGAGTGCCCTGCTTCCAACCCCAGAACAGGGCTTTTCAATTATCTTGTCGAAATGTTCACTTCAGGTTTTGTCAGACCACGCCATC
AATTTTATCTATTGCTGTTACCAGAACTCCATACAGCATTTCCAGATGCTTTCCTAAAGACATTGACATTGAATTCAACCAGAAGGTTGCAAAAGATAAGCTGTCTAAAGACGGGCCTTCTATTGCTTCTAGTTGCCCAGTACCAGTTTTTCCATCAGATAGAGGCTGGGTTAATACTGAAGAGGCTTTTAATGAACTAC
CAGAAGAAGAAAACATATTTCTGGATAGCACGTTGACAGCTTTGCCGGTGCAATCAGAGGAAGAACAAGATGCCATGGCAGCAACTCCTGCACATCCTGCAGGCCTATACGCTCTATATGCGAGTTTTTGGGTTGGAAACTTGGTGGAGCAAATTTGGAATTTTGCATGGCCTGTAACTGTTGCACTTCTGCACCCAAGT
CTATTGCCGATTGCCGTTGTGAGCTTTGTTGCAAAGATTGGAATATTTGCTGGGGGTCCCTTGGTTGGTTCACTGATGGATTCTTTTCCAAGAGTGCTTGCATTTAATTCTTTGAGCGCTGTACAGACAGCTGCCCAGTTAATATCAGCAGGAATGATTATTTATGCCTATAATAGAAGCACTCATGCAGCTGCTGCTGC
TTCCGCAACTTCATTACTGTTACAACCTTGGTTTGTTGTATTAGTATTGGCAGGGGCTGTTGAGAGGCTTACTGGCTTGGCATCTGGGGTTGCATTTGAACGTGATTGGGTTGTATTGCTAGCTGGAACAAATCGTCCAATTGCTCTGGCCAATGCTAATGCCATGCTTAGCAGGGTAGATTTTCTGTGCGAGATTGCAG
GATCATCGGTTTTTGGTATTTTATTGGCAAAATTTGGTCCTGTGACTTCTTTGAAGCTAGCAGCTGTATTGATGATGTGTACACTTCCCATTCTGATTCTTTTGGTGCGTCTTACCAATAAACTTTCAAAAGGTGTTTTAGAACGTCCCAGGCACCATGGCATACATAATGAGTCAAATAATGCTTCTGAGCGTCGGATC
CCTGAAAATTTAGTTGAAAGGGGACTGGATGCAATCAGGTGTGGATGGGTTCAATATAAAACACAACCCGTGCTTCCTGCCAGCCTTGCCTTTGTATTTCTTTATTTCAATGTTGTTCTCTCTCCTGGAGGTCTTATGACATCTTACTTGACACACCGTGGTCTCAATCCATCAGTTATTGGTGCATTCAGCAGCATGTG
TGCATTCATGGGTGTTGCAGCTACATTCACGTCAGCCAAATTGGTGAAGAAGCTGGGTCTTCTAAAAGTTAGTTTAGTTGCAGCCAGTCATTTCTCTCCAGTTCAAAGTTAATTCTTTTGTTTGGAGATTTTATAGTTGATGGTTATATTTTGTGATCCAGGGTTATTTCTTAACCATTGGTTTATGTTATTGTCTGTCT
GTAGGCAGGAGCAGCTGGATTAATATTCCAAACTTTAGTACTTGGCATTGCGGTTGCTGTGTATTGGAGTGGTTATATAGCACACCAAAAGTCGCTTATCTTCTTTCTGTTTTTAGTAgtaagcagtttgcgctgtttctagacttaatttttcaagatagcatgattctaatattacatggaaatatacaaagtgcatg
atgaagaagaatgaagggataagggacttccctttctgaccaagcaacaaggcaagcatctccatttgagctccataattagaatctaagttatacatcctaagcaatacgagcttactgtaaacttgagtctctaagtcgttgagaaatctacgagagtcaactacaaagctctttcttggaaccacaaatggtttcat
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cctaggtccccaagggactagattgggtttgaacctgtgacctatggtctccctgttggcaaaatgccttgggaagatggttcaaccaattgagctaaaccttggggctcattagagtgtctataaaaccagggattatcaaataagacttccctcaaatggacaggcctgcaaaagatgccatggaaccattggccaat
atgaagtcaaaactgcctgacaaacttaaaatcctagaagatatgatttagttttttttttctgccacattatacaggtcatctgagaggccatctctggtatgtggtgtgcttgctagagagaccctgcgccaatgcctgccagtgaaggcatcttaaacttaaaagcactgtgtggaccttatagtttaatgtagccc
ttcaaaagattgagcctaggtggagagattgtgtctggctgaatggtaaatcaatgttaagttttcattctcatgctatgtacaatcatatccaacttaacaatgttgaattccaggtggttgactatggattattggggggactgtttctagattttttactttgtatgcagcttggctgtttctaatatagagcatat
gataatatctgtatgtatattgaagggatacaatctacattggatgacctttcatgttagacctacatagctgtattgtttcctgtgtgcagGTGTTATCAAGATTAGGTCACATGTCTTATGATATAGTGGGCGGACAGATACTTCAGACTGCAGTACCACCTTCACAAGCAAACCTTATAGGGACAACAGAAATTTCA
ATGACAAGTTTAGCAGAACTTGTTATGTTAGGGGTGGCAATTATTGCAAAGGATGTTTCACATTTTGGCTTTCTAGCACTTCTCTCTATGGCTTCCGTAGCTGGGGCTGCCTGGATTTACTGCCAGTGGATGTCAAACCCCGCCAACGATTCCCTGCAATTGTTCTCATGTAATCCACATTACAATTCTCCTTTATCCAG
CAATGAGCAATCAGTCACCACGGATATTGGTTCCAAACCCTCTTCTCCTGTAATGTAGAAGAAATTTAATTTATTTTTCTATCTCGATAATTTCCCCAAGCTTATTCTTATGTTATACTCGGGAATTGGGATTTTTTAATTTAATTTAATTTTTTTGCAAATATTGCCCATTTTTGTCTACAAACTCACAGCTAATCATA
CGAAGGTCAGAACCATATGTGCCATTGTTTTGGTCAACATGGTCTGACAGAATAGCATTGCAGATAATGCTCAAGTAGAGTTTTTCTTGTCGGAACCTGCCATTGAAGAGAGAAGGAAAACCTATATAAATGCAATTCGTGAATTAACATTCACATCTTTCGAAAGTATGGATGTTCTTTTCATATCTTCCGTGACTTTG
TATCCAAAAGCTACAATTGAGAAATTCCCAGAATGAAATGATGCTTGTGATATTAATTGTGCTTTGTCTGGTAGACCTAGCAGGGAACTGGAATTCCCATTATCTTCATTTTATAACTTTTATGGGTTACTAACCCCATACTTTCGTTGAGAGTATGCATTTACA
Intron 5 GTCTTTCCTT ... TTGTATACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.67 | 10 | 1 | 2 |
| A2 | 13.83 | 18.7 | 2.1 | 3 |
| A3 | 22.22 | 14 | 3.9 | 4 |
| A4 | 39.48 | 12.3 | 1.1 | 8 |
| A5 | 20.71 | 3.9 | 0.3 | 1 |
| A6 | 32 | 17 | 0 | 8 |
| A7 | 29.26 | 33.9 | 3.1 | 14 |
| A8 | 17.24 | 24 | 0.6 | 5 |
| A9 | 27.73 | 20.9 | 0.6 | 8 |
| A10 | 26.92 | 19 | 2.3 | 7 |
>TRINITY_DN47732_c2_g1_i5 from sample A7 / Example spliced isoformCGGAGAAACTAAGTGCTACTATTATTGATAGTTTTATGCACACATTCATAAGCCCTCTAATTCAAATTGTCTCTGGATGGCAAGAGCAGATTGCAGGATCATCGGTTTTTGGTATTTTATTGGCAAAATTTGGTCCTGTGACTTCTTTGAAGCTAGCAGCTGTATTGATGATGTGTACACTTCCCATTCTGATTCTTTTG
GTGCGTCTTACCAATAAACTTTCAAAAGGTGTTTTAGAACGTCCCAGGCACCATGGCATACATAATGAGTCAAATAATGCTTCTGAGCGTCGGATCCCTGAAAATTTAGTTGAAAGGGGACTGGATGCAATCAGGTGTGGATGGGTTCAATATAAAACACAACCCGTGCTTCCTGCCAGCCTTGCCTTTGTATTTCTTTA
TTTCAACGTTGTTCTCTCTCCTGGAGGTCTTATGACATCTTACTTGACACACCGTGGTCTCAATCCATCAGTTATTGGTGCATTCAGCAGCATGTGTGCATTCATGGGTGTTGCAGCTACATTCACGTCAGCCAAATTGGTGAAGAAGCTGGGTCTTCTAAAA
>TRINITY_DN47732_c2_g1_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:GTGTACACTTCCCATTCTGgtctttccttttgtccactgcctgttttctgttcttttttaagatgaattttgaagaagcatttttaacattgctgttcatttgtatacagATTCTTTTGGTGCGTCTTACCAATAAACTTTCAAAAGGTGTTTTAGAACGTCCCAGGCACCATGGCATACATAATGAGTCAAATAATGCT
TCTGAGCGTCGGATCCCTGAAAATTTAGTTGAAAGGGGACTGGATGCAATCAGGTGTGGATGGGTTCAATATAAAACACAACCCGTGCTTCCTGCCAGCCTTGCCTTTGTATTTCTTTATTTCAACGTTGTTCTCTCTCCTGGAGGTCTTATGACATCTTACTTGACACACCGTGGTCTCAATCCATCAGTTATTGGTGC
ATTCAGCAGCATGTGTGCATTCATGGGTGTTGCAGCTACATTCACGTCAGCCAAATTGGTGAAGAAGCTGGGTCTTCTAAAAGCAGGAGCAGCTGGATTAATATTCCAAACTTTAGTACTTGGCATTGCGGTTGCTGTGTATTGGAGTGGTTATATAGCACACCAAAAGTCGCTTATCTTCTTTCTGTTTTTAGTAGT
Intron 6 GTTAGTTTAG ... CTGTCTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 35.85 | 13 | 8.4 | 7.3 |
| A2 | 3.64 | 9 | 3.6 | 0.4 |
| A3 | 18.52 | 15 | 10.2 | 3.5 |
| A4 | 63.64 | 4 | 1 | 7 |
| A5 | 40.71 | 11.3 | 5 | 7.8 |
| A6 | 10.88 | 36.7 | 13.6 | 4.5 |
| A7 | 18.74 | 51 | 4.5 | 11.9 |
| A8 | 19 | 28.7 | 10.2 | 7.1 |
| A9 | 7.41 | 25 | 7.3 | 2 |
| A10 | 6.56 | 25 | 1.8 | 1.8 |
>TRINITY_DN116202_c3_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoformTGTGTGTGAGTTTACCTCTTTCTCATCTCTACCTGCTCCATTCATGGACTTCATTTTGTTCTCTGCAGCTAGCTGGAACAAATCGTCCAATTGCTCTGGCCAATGCTAATGCCATGCTTAGCAGGGTAGATTTTCTGTGCGAGGTGATCACTCGGAGAAACTAAGTGCTACTATTATTGATGGTTTTATGCACACATTGA
TAAGCCCTCTAATTCAAATTGTCTCTGGATGGCAAGAGCAGATTGCAGGATCATCGGTTTTTGATTCTTTTGGTGCGTCTTACCAATAAACTTTCAAAAGGTGTTTTAGAACGTCCCAGGCACCATGGCATACATAATGAGTCAAATAATGCTTCTGAGCGTCGGATCCCTGAAAATTTAGTTGAAAGGGGACTGGATGC
AATCAGGTGTGGATGGGTTCAATATAAAACACAACCCGTGCTTCCTGCCAGCCTTGCCTTTGTATTTCTTTATTTCAATGTTGTTCTCTCTCCTGGAGGTCTTATGACATCTTACTTGACACACCGTGGTCTCAATCCATCAGTTATTGGTGCATTCAGCAGCATGTGTGCATTCATGGGTGTTGCAGCTACATTCACGT
CAGCCAAATTGGTGAAGAAGCTGGGTCTTCTAAAAGCAGGAGCAGCTGGATTAATATTCCAAACTTTAGTACTTGGCATTGCGGTTGCTGTGTATTGGAGTGGTTATATAGCACACCAAAAGTCGCTTATCTTCTTTCTGTTTTTAGTAGTGTTATCAAGATTAGGTCACATGTCTTATGATATAGTGGGCGGACAGATA
CTTCAGACTGCAGTACCACCTTCACAAGCAAACCTTATAGGGACAACAGAAATTTCAATGACAAGTTTAGCAGAACTTGTTATGTTAGGGGTGGCAATTATTGCAAAGGATGTTTCACATTTTGGCTTTCTAGCACTTCTCTCTATGGCTTCCGTAGCTGGGGCTGCCTGGATTTACTGCCAGTGGATGTCAAACCCCGC
CAACGATTCCCTGCAATTGTTCTCATGTAATCCACATTACAATTCTCCTTTATCCAGCAATGAGCAATCAGTCACCACGGATATTGGTTCCAAACCCTCTTCTCCTGTAATGTAGAAGAAATTTAATTTATTTTTCTATCTCGATAATTTCCCCAAGCTTATTCTTATGTTATACTCGGG
>TRINITY_DN116202_c3_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:CACCAATCCTCGGGCATGTGTGATTGAAATTGTGTTGGCGCAGCGATTTCATCAATCTCCTTTACATACATGATAAGGTATCTTTTATGGAAGCCTGGTGCTCACCCGGCCACTGTAGGTTTACCTGGGTTTTGGACACCAGTAACAAGATTTGAAATTGAATTTATGTATACATGCGGAGTGGAGATTGAGAGTCAGGT
TGACAGTATGCAAGAGAAGAGGACATTTCATCGTCGTTATTTTTGAAGCATCCATGGCGTTGGGTGCAGTTTTTGTGGGCAGTAGAACATCTGTGCGAGTGCCCTGCTTCCAACCCCAGAACAGGGCTCTTCAATTATCTTGTCGAAATGTTCACTTCAGGTTTTGTCAGACCACGCCATCAATTTTATCTATTGCTGTT
ACCAGAACTCCATACAGCATTTCCAGATGCTTTCCTAAAGACATTGACATTGAATTCAACCAGAAGGTTGCAAAAGATAAGCTGTCTAAAGACGGGCCTTCTATTGCTTCTAGTTGCCCAGTACCAGTTTTTCCATCAGATAGAGGCTGGGTTAATACTGAAGAGGCTTTTAATGAACTACCAGAAGAAGAAAACATATT
TCTGGATAGCACGTTGACAGCTTTGCCGGTGCAATCAGAGGAAGAACAAGATGCCATGGCAGCAACTCCTGCACATCCTGCAGGCCTATACGCTCTATATGCGAGTTTTTGGGTTGGAAACTTGGTGGAGCAAATTTGGAATTTTGCATGGCCTGTAACTGTTGCACTTCTGCACCCAAGTCTATTGCCGATTGCCGTTG
TGAGCTTTGTTGCAAAGATTGGAATATTTGCTGGAGGTCCCTTGGTTGGTTCACTGATGGATTCTTTTCCAAGAGTGCTTGCATTTAATTCTTTGAGCGCTGTACAGACAGCTGCCCAGTTAATATCAGCAGGAATGATTATTTATGCCTATAATAGAAGCACTCATGCAGCTGCTGCTGCTTCCGCAACTTCATTACTG
TTACAACCTTGGTTTGTTGTATTAGTATTGGCAGGGGCTGTTGAGAGGCTTACTGGCTTGGCATCTGGGGTTGCATTTGAACGCGATTGGGTTGTATTGCTAGCTGGAACAAATCGTCCAATTGCTCTGGCCAATGCTAATGCCATGCTTAGCAGGGTAGATTTTCTGTGCGAGATTGCAGGATCATCGGTTTTTGGTAT
TTTATTGGCAAAATTTGGTCCTGTGACTTCTTTGAAGCTAGCAGCTGTATTGATGATGTGTACACTTCCCATTCTGATTCTTTTGGTGCGTCTTACCAATAAACTTTCAAAAGGTGTTTTAGAACGTCCCAGGCACCATGGCATACATAATGAGTCAAATAATGCTTCTGAGCGTCGGATCCCTGAAAATTTAGTTGAAA
GGGGACTGGATGCAATCAGGTGTGGATGGGTTCAATATAAAACACAACCCGTGCTTCCTGCCAGCCTTGCCTTTGTATTTCTTTATTTCAATGTTGTTCTCTCTCCTGGAGGTCTTATGACATCTTACTTGACACACCGTGGTCTCAATCCATCAGTTATTGGTGCATTCAGCAGCATGTGTGCATTCATGGGTGTTGCA
GCTACATTCACGTCAGCCAAATTGGTGAAGAAGCTGGGTCTTCTAAAAgttagtttagttgcagccagtcatttctctccagttcaaagttaattcttttgtttggagattttatagttgatggttatattttgtgatccagggttatttcttaaccattggtttatgttattgtctgtctgtagGCAGGAGCAGCTGGA
TTAATATTCCAAACTTTAGTACTTGGCATTGCGGTTGCTGTGTATTGGAGTGGTTATATAGCACACCAAAAGTCGCTTATATTCTTTCTCTTTTTAGTAGTAAGCAGTTTGCGCTGTTTCTAGACTTAATTTTTCAAGATAGCATGATTCTAATATTACATGGAAATATACAAAGTGCATGATGAAGAAGAATGAAGGGA
TAAGGGACTTCCCTGTCTGACCA