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>TRINITY_DN126123_c0_g1_i12 from sample A1 / Example spliced isoform
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CCGCCGCCCTGCAGCAGCTCAAGAACCTCCGTCAACAGGGCGGGCGCCGAGTCGACACCTTCGAGATAAAAGTAGATGAAAAAATATATGATTCTGTGGCAGAAGATGACTACGCCAAGCTCGTCGCAAAGCGTCGCGCGGCCGTCAAGGATTTCGTGGTGGACGATGCTGGCCTCGGCTACAATGACGACGGCGAGGAA
GATGATTGGGAGGTCGGTGATCGCCCTTACTCTTCATCAGAAGAGGCAGAAGCAGATGGCGGATCTGCGAGAAGAAAGAAATCGGCGAAGGATTCATCGGAAAATCGGAAGAGGGACGGGGGAAATCCATCAAAGAAAGCGTCGGCTCTGTCAGCCGCAGCGGCATTGATGGGGAAGCAGAAAGTTTCGTCGATGTTTGC
CTCAGCGTCAATGTTCCGGAAGAATAAAGAGGACAAGAGCGGGCAAATAAAGGGGTTTTCGACGGACAGTATTCTCGAAGATGTTCTTGCAGAGATTACTCCTGATGCAGCCGATAGGGAAAAGCGAAGGAGGCGAACAGGCTTAAAAAATGCAGCAGCTGTAGGGAATGCTTTTGCTAATAGTATTAAGAGTTCTCCCC
GAGATTTTTCTTCAAGCCTGCCAGAATATCAAGTTAGTGAAGTCTCCTGGGAACCGTGTATTAATTTGGAAAGCAGGCAGAAACTTCCCACTGTTGAAACCGTACATGAATCTGCACCGTCTGAAACAACAGAATCCCAAAATTCTAAGTCAGCAATGGAGGATCAGTGTGCTTCGGTTCAATCTCCAATTAATCTCGCT
GAAGATCCAAGCTGCAAGGAGGATGACTTAAAGCCCAAGGTTATGCTATCTGACAATGGCGAGGCAATTTCAGCTGATGGCGAGTTGAAAGCAAAAGCTGGGAAGGATGATAATGATAAATGTGTATTGAATGCTCTAATTGGCCGAGAAAATTCATCTGCCAAAGCAACTGCCGACTGGCAAGCAGTGTGGCAGGGTGG
AGATGAAAAAGTGGCAAAAATTGAAGAGACTGATGACCGTTTAACTTCTGAAGATGTGAATGATCTACCATTGGAGTCAGATGGAGCTTTACTTTTTTACCTTATTGATGCATATGAGGAAGCTTATGGAGCTCATCCTGGTACAATATATCTATTTGGCAAGGTAAAATTCAGAAACTCATATGCTAGCTGTTGTGTGG
TGGTACAAAACATGCAACGGTGTGTTTTTGCTGTACCAACTCCTTCAGTCTTCCCAGATAAAGTGATTGCAGAGCTTGAGCAAGGTGCAAAAGATGGTGTAGTTGAACAATCTACATTGCGGAAAAAGTTGCAGGAGATGGCATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAATGGATCTGAATGTGACTAATTTC
AGTATGGTACCAGTCAAGCGTAACTATGCATTTGAGCGGTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGAGCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAATTAAAAGAAGAATACGAGGCCC
AACATGGCTTTCAATTTCCAATGCTGTCTGCTGCCCAAGTTCATCTCGAATAAGCTGGTGCAAGTTTGAAGCTATTGTAGGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAATGACAAACACAATGTGAATGAAA
TTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGTTGTCACAAAACAAAGGGTTAAGGCTTTAGCATAAAGGTTGCTCAGTTCTCACTTTTTGTCTGTGATTGTATGCCATTGAAAAGGGGCAGAATTCTACCAGCTCAGTATTTCTTATAACTATATCTTTGTGTAATGTAGAATTTATTTTTCAAAGGTGAAACAAGTCTATCTTATTAG
ATTAGATGTCCTTTATTCCTCCATGCAGATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGGCATATTTCCGATGGGATTCACAAAGGAGGTTGCCAACAGAAATACTAAAGCTGGGTCTAATATCTTGAACTATGAGAGCAGTGAAAGAG
CTTTGCTGAATCGCCTGATGATCAAACTTCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTGGCCACAATATTTCAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTTGCAAGGTGCCCAGCAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCTGTGATGCCTAAGCTTAGCAAAGGAACTGGTAACTTTGGG
ACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCATGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCCCGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGACACAGCTCGCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTACAAAACATCGGCATCTCTAATGGAACT
GGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTGGTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAAAACCCTACAGGGGGCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATGAGTTCCATGGTAGAAAGTATATTTTACCAGACAAGATGT
CAGCTCGAGAGAAAGAACTTAAAGCATCAAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCTGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGCTCCCAACACATGGCAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTGGTGCTGGAACCAAAGAAAGGACTCTATGACAAATATATT
TTACTTCTTGACTTCAACAGTCTTTACCCTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGCTTTACAACTGTTGAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTACCAACCTGCAACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAGTTATGGCTAAAAAACACGTCAGATCC
TCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGCAGAGCTCATCACCTCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCAAAACCACCTAAATCTTGAGGTCATTTATGGAG
ATACAGATTCGATCATGATCCATACTGGTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAGATCTAGATGGGATATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAGTTAAGGTGCAGTTTAACAAGGATGGGACCATC
TATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTTGATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGTGAAGATGTTGTGGAAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGAAATGCGAAATGGTCAAGTGGAGCTTGAGAAGTATGTCAT
TACCAAATCATTGACTAAACCTCCAGAAGAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACATGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGTTGGTGATACAGTCCCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGGATCTGGAGTGGGATCAACAACAGGCATTGCTGAAAGGGCAAGACATCCAG
ATGAGTTGAAAAGGGACAGTGGAAACTGGATGGTTGACATTGATTATTATCTATCTCAGCAGATTCATCCTGTTGTATCAAGATTATGTGCACCTATCCAAGGCACAAGCCCAGGACGTCTTGCAGATTGTCTTGGACTGGATTCGTCAAGGTTTGAACAAAAAATGAGTTTTGAAGCTGTTGCTAAAGAGCCAGCTACT
GCATTTCTGTCGAGTATTGATGATAATGAAAGATACCAATACTGCGAGCCATTCTGGATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAGTGTGGCAAGCATGATTGAAAGTTCTGAAAACCATACAACAAACTCAGGAGATCATGAAGAAGATGAAACATTACGGAAGACATCAAGGGATGCAACTGAGAA
GTTTTGGTGCTCACTCAGTTGTCCGAAATGTCAAGATGAGGGTGTTGAAAGTTTAATTTCTCCTGCCATATTGGCTAATCAGGTGAAAAGGCAGGCAGAAAAATTCATTGCACTATACTATACAGGGTTAATGATTTGTGATGACGAACTATGCAAGCTCCAAACTAGGAACTTGAACTTGCGGATTATCGGTGATACTG
GAAGGGGAACAGTTTGTCCAAATTATCCTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAGTACACTGAGGTAGACCTATACAAGCAGCTTACATACTTCTGCCGCATACTTGACATTCCGCGTGTAATTCAAAAGTTGGAGTATAATGCAAGGGTGCCTGTAGAGAAACGCCTTGCCAAAATACGACCCGCAATTGATGCTGCA
GCTATGACAGTCCGCAAAATAAGAGATCGTTGTGCATATGGATGGGTGAAACTAAGTGACCTTGTAGTCAGTGTCTAACTCGTTGAAATCCATCCTATCGTTTGTCCTTACAAGGGCATGCACATGTTATTATCATTAAGTATTTCATGTGCATATGGGTCTCACTACACTCGGCATTTAGCTGATAGATTTTTAGAGGT
ACCCCTCCATGCTGATGAGTGGATCTTTTCCTTTATGCCCTTAAAGTGAATGAATATTGAAGAAATTAGTTACTGTCACCGGAGCTTCAATGCTAAAATTCTGCTTGTTGCTGTGTTGTATTATAGTGATTTGTATACACAGGTCAATGTAATTGAAATTTTGACCATATAAGCCTTGGATGGCAAAGGTGGTTGGTGAT
ACATGTCTATTATTATTCCTTATCCTGTGGATGTCTAATAATTCTTAAAATAAATATAGTTCAATATATGACTCAATTGATGGAT


>TRINITY_DN126123_c0_g1_i10 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CCCGGGGGCGCCATTGAGTTTTTGCATCTTCCCGCCATATTACACCGCAAAGAAAAAAAAACCAAAACTCAACCTTCGCCTTCTATTCTCCGGTCACTACTCTACGCACAGAGAAGCAAAAATGGAGACGGGAGGAATCAGCAGCAGTAGGCGGAGGAATGGCGGAGCCGCGGCGGCGGGCTCTGAGAACTCCACTCGGT
CCGCCGCCCTGCAGCAGCTCAAGAACCTCCGTCAACAGGGCGGGCGCCGAGTCGACACCTTCGAGATAAAAGTAGATGAAAAAATATATGATTCTGTGGCAGAAGATGACTACGCCAAGCTCGTCGCAAAGCGTCGCGCGGCCGTCAAGGATTTCGTGGTGGACGATGCTGGCCTCGGCTACAATGACGACGGCGAGGAA
GATGATTGGGAGGTCGGTGATCGCCCTTACTCTTCATCAGAAGAGGCAGAAGCAGATGGCGGATCTGCGAGAAGAAAGAAATCGGCGAAGGATTCATCGGAAAATCGGAAGAGGGACGGGGGAAATCCATCAAAGAAAGCGTCGGCTCTGTCAGCCGCAGCGGCATTGATGGGGAAGCAGAAAGTTTCGTCGATGTTTGC
CTCAGCGTCAATGTTCCGGAAGAATAAAGAGGACAAGAGCGGGCAAATAAAGGGGTTTTCGACGGACAGTATTCTCGAAGATGTTCTTGCAGAGATTACTCCTGATGCAGCCGATAGGGAAAAGCGAAGGAGGCGAACAGGCTTAAAAAATGCAGCAGCTGTAGGGAATGCTTTTGCTAATAGTATTAAGAGTTCTCCCC
GAGATTTTTCTTCAAGCCTGCCAGAATATCAAGTTAGTGAAGTCTCCTGGGAACCGTGTATTAATTTGGAAAGCAGGCAGAAACTTCCCACTGTTGAAACCGTACATGAATCTGCACCGTCTGAAACAACAGAATCCCAAAATTCTAAGTCAGCAATGGAGGATCAGTGTGCTTCGGTTCAATCTCCAATTAATCTCGCT
GAAGATCCAAGCTGCAAGGAGGATGACTTAAAGCCCAAGGTTATGCTATCTGACAATGGCGAGGCAATTTCAGCTGATGGCGAGTTGAAAGCAAAAGCTGGGAAGGATGATAATGATAAATGTGTATTGAATGCTCTAATTGGCCGAGAAAATTCATCTGCCAAAGCAACTGCCGACTGGCAAGCAGTGTGGCAGGGTGG
AGATGAAAAAGTGGCAAAAATTGAAGAGACTGATGACCGTTTAACTTCTGAAGATGTGAATGATCTACCATTGGAGTCAGATGGAGCTTTACTTTTTTACCTTATTGATGCATATGAGGAAGCTTATGGAGCTCATCCTGGTACAATATATCTATTTGGCAAGGTAAAATTCAGAAACTCATATGCTAGCTGTTGTGTGG
TGGTACAAAACATGCAACGGTGTGTTTTTGCTGTACCAACTCCTTCAGTCTTCCCAGATAAAGTGATTGCAGAGCTTGAGCAAGGTGCAAAAGATGGTGTAGTTGAACAATCTACATTGCGGAAAAAGTTGCAGGAGATGGCATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAATGGATCTGAATGTGACTAATTTC
AGTATGGTACCAGTCAAGCGTAACTATGCATTTGAGCGGTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGAGCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAATTAAAAGAAGAATACGAGGCCC
AACATGGCTTTCAATTTCCAATGCTGTCTGCTGCCCAAGTTCATCTCGAATAAGCTGGTGCAAGTTTGAAGCTATTGTAGGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAATGACAAACACAATGTGAATGAAA
TTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGTTGTCACAAAACAAAGgtatgcatgttttgtatatagctatttatttggttcttaatgtctattgtttaaacctgtttgatcttcttttgggatgatattctcagGGTTAAGGCTTTAGCATAAAGGTTGCTCAGTTCTCACTTTTTGTCTGTGATTGTATGCCATTGAAAAGGGGCA
GAATTCTACCAGCTCAGTATTTCTTATAACTATATCTTTGTGTAATGTAGAATTTATTTTTCAAAGGTGAAACAAGTCTATCTTATTAGATTAGATGTCCTTTATTCCTCCATGCAGATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGG
CATATTTCCGATGGGATTCACAAAGGAGGTTGCCAACAGAAATACTAAAGCTGGGTCTAATATCTTGAACTATGAGAGCAGTGAAAGAGCTTTGCTGAATCGCCTGATGATCAAACTTCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTGGCCACAATATTTCAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTT
GCAAGGTGCCCAGCAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCTGTGATGCCTAAGCTTAGCAAAGGAACTGGTAACTTTGGGACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCATGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCCCGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGACACAGCTC
GCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTACAAAACATCGGCATCTCTAATGGAACTGGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTGGTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAA
AACCCTACAGGGGGCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATGAGTTCCATGGTAGAAAGTATATTTTACCAGACAAGATGTCAGCTCGAGAGAAAGAACTTAAAGCATCAAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCTGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGC
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AACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAGTTATGGCTAAAAAACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGC
AGAGCTCATCACCTCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCAAAACCACCTAAATCTTGAGGTCATTTATGGAGATACAGATTCGATCATGATCCATACTGGTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAG
ATCTAGATGGGATATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAGTTAAGGTGCAGTTTAACAAGGATGGGACCATCTATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTTGATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGT
GAAGATGTTGTGGAAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGAAATGCGAAATGGTCAAGTGGAGCTTGAGAAGTATGTCATTACCAAATCATTGACTAAACCTCCAGAAGAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACATGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGT
TGGTGATACAGTCCCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGGATCTGGAGTGGGATCAACAACAGGCATTGCTGAAAGGGCAAGACATCCAGATGAGTTGAAAAGGGACAGTGGAAACTGGATGGTTGACATTGATTATTATCTATCTCAGCAGATTCATCCTGTTGTATCAAGATTATGTGCACCTATCCAAGGCACAAGCC
CAGGACGTCTTGCAGATTGTCTTGGACTGGATTCGTCAAGGTTTGAACAAAAAATGAGTTTTGAAGCTGTTGCTAAAGAGCCAGCTACTGCATTTCTGTCGAGTATTGATGATAATGAAAGATACCAATACTGCGAGCCATTCTGGATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAGTGTGGCAAGCATG
ATTGAAAGTTCTGAAAACCATACAACAAACTCAGGAGATCATGAAGAAGATGAAACATTACGGAAGACATCAAGGGATGCAACTGAGAAGTTTTGGTGCTCACTCAGTTGTCCGAAATGTCAAGATGAGGGTGTTGAAAGTTTAATTTCTCCTGCCATATTGGCTAATCAGGTGAAAAGGCAGGCAGAAAAATTCATTGC
ACTATACTATACAGGGTTAATGATTTGTGATGACGAACTATGCAAGCTCCAAACTAGGAACTTGAACTTGCGGATTATCGGTGATACTGGAAGGGGAACAGTTTGTCCAAATTATCCTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAGTACACTGAGGTAGACCTATACAAGCAGCTTACATACTTCTGCCGCATACTTGACA
TTCCGCGTGTAATTCAAAAGTTGGAGTATAATGCAAGGGTGCCTGTAGAGAAACGCCTTGCCAAAATACGACCCGCAATTGATGCTGCAGCTATGACAGTCCGCAAAATAAGAGATCGTTGTGCATATGGATGGGTGAAACTAAGTGACCTTGTAGTCAGTGTCTAACTCGTTGAAATCCATCCTATCGTTTGTCCTTAC
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TGTGTTGTATTATAGTGATTTGTATACACAGGTCAATGTAATTGAAATTTTGACCATATAAGCCTTGGATGGCAAAGGTGGTTGGTGATACATGTCTATTATTATTCCTTATCCTGTGGATGTCTAATAATTCTTAAAATAAATATAGTTCAATATATGACTCAATTGATGGAT



Intron 2 GTAAGTGAAA ... GTCTGTGCAG

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>TRINITY_DN105454_c1_g1_i20 from sample A4 / Example spliced isoform
GGCGTTTTTACATTTATAGACATGTCATGCCAACTATTTAGTGATTTCAGAGAATAGTTGAACGCGTTGGGTGGAATTATAAGAAAAATAAAAAAACTCAGAAACTAGAATACCACTGTGGTTTTCATTTCTAGAACTTAACATTTACTTAATATATTTGCTACAGGAATTATGGTAGTAGACATAGATTTTGGGAGAGT
TTTTTTTTTTGTCCTTGAAAAAGTGAAAGTTAGCTACAGAAAATCGTGACTACAGAAACCCATGCCGATAAGAACTATTGGTTTGTAATAAGTGTTGGAGAGTATATGGAACCGTGTATGTTGAGAGCTTAGTGAATGAGTTGCTGTGTATTTTCTCCTGAAGTCTGCACCAATCAGTGTGCTTCGGTTCAATCTCCAAT
TAATCTCGTTGAATATTCAAGCTGTAAGGAGGATGACTTAAAGCCCAAGGTTATGCTATCTGACAATGGCGAGGCAATTTCAGCTGATGGCGAGTTGAAAGCAAAAGCTGGGAAGGATGATAATGAGAAATGTGTATTGAATGCTCTAATTGGCCGAGAAAATTCATCTGCCAAAGCAACTGCCGACTGGCAAGCAGTGT
GGCAGGGTGGAGATGAAAAAGTGGCAAAAATTGAAGAGACTGATGACCGTTTAACTTCTGAAGATGTGAATGATCTACCATTGGAGTCAGATGGAGCTTTACTTTTTTACCTTATTGATGCATATGAGGAAGCTTATGGAGCTCATCCTGGTACAATATATCTATTTGGCAAGGTAAAATTCAGAAACTCATATGCTAGC
TGTTGTGTGGTGGTACAAAACATGCAACGGTGTGTTTTTGCTGTACCAACTCCTTCAGTCTTCCCAGATAAAGTGATTGCAGAGCTTGAGCAAGGTGCAAAAGATGGTGTAGTTGAACAATCTACATTGCGGAAAAAGTTGCAGGAGATGGCATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAATGGATCTGAATGT
GACTAATTTCAGTATGGTACCAGTCAAGCGTAACTATGCATTTGAGCGGTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGAGCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAATTAAAAGAAGAA
TACGAGGCCCAACATGGCTTTCAATTTCCAATGCTGTCTGCTGCCCAAGTTCATCTCGAATAAGCTGGTGCAAGTTTGAAGCTATTGTAGGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAATGACAAACACAAT
GTGAATGAAATTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGTTGTCACAAAACAAAGATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGGCATATTTCCGATGGGATTCACAAAGGAGGTTGCCAACAGAAATACTAAAGCTGGGTCTAATATCTTGAA
CTATGAGAGCAGTGAAAGAGCTTTGCTGAATCGCCTGATGATCAAACTTCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTGGCCACAATATTTCAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTTGCAAGGTGCCCAGCAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCTGTGATGCCTAAGCTTAGCA
AAGGAACTGGTAACTTTGGGACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCATGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCCCGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGACACAGCTCGCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTACAAAACA
TCGGCATCTCTAATGGAACTGGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTGGTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAAAACCCTACAGGGGGCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATGAGTTCCATGGTAGAAAGTA
TATTTTACCAGACAAGATGTCAGCTCGAGAGAAAGAACTTAAAGCATCAAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCTGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGCTCCCAACACATGGCAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTGGTGCTGGAACCAAAGAAAG
GACTCTATGACAAATATATTTTACTTCTTGACTTCAACAGTCTTTACCCTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGCTTTACAACTGTTGAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTACCAACCTGCAACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAGTTATGG
CTAAAAAACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGCAGAGCTCATCACCTCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCAAAACCACCTAAA
TCTTGAGGTCATTTATGGAGATACAGATTCGATCATGATCCATACTGGTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAGATCTAGATGGGATATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAGTTAAGGTGCAGT
TTAACAAGGATGGGACCATCTATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTTGATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGTGAAGATGTTGTGGAAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGAAATGCGAAATGGTCAAGTG
GAGCTTGAGAAGTATGTCATTACCAAATCATTGACTAAACCTCCAGAAGAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACATGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGTTGGTGATACAGTCCCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGGATCTGGAGTGGGATCAACAACAGGCATTGC
TGAAAGGGCAAGACATCCAGATGAGTTGAAAAGGGACAGTGGAAACTGGATGGTTGACATTGATTATTATCTATCTCAGCAGATTCATCCTGTTGTATCAAGATTATGTGCACCTATCCAAGGCACAAGCCCAGGACGTCTTGCAGATTGTCTTGGACTGGATTCGTCAAGGTTTGAACAAAAAATGAGTTTTGAAGCTG
TTGCTAAAGAGCCAGCTACTGCATTTCTGTCGAGTATTGATGATAATGAAAGATACCAATACTGCGAGCCATTCTGGATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAGTGTGGCAAGCATGATTGAAAGTTCTGAAAACCATACAACAAACTCAGGAGATCATGAAGAAGATGAAACATTACGGAAGACA
TCAAGGGATGCAACTGAGAAGTTTTGGTGCTCACTCAGTTGTCCGAAATGTCAAGATGAGGGTGTTGAAAGTTTAATTTCTCCTGCCATATTGGCTAATCAGGTGAAAAGGCAGGCAGAAAAATTCATTGCACTATACTATACAGGGTTAATGATTTGTGATGACGAACTATGCAAGCTCCAAACTAGGAACTTGAACTT
GCGGATTATCGGTGATACTGGAAGGGGAACAGTTTGTCCAAATTATCCTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAGTACACTGAGGTAGACCTATACAAGCAGCTTACATACTTCTGCCGCATACTTGACATTCCGCGTGTAATTCAAAAGTTGGAGTATAATGCAAGGGTGCCTGTAGAGAAACGCCTTGCCAAAATAC
GACCCGCAATTGATGCTGCAGCTATGACAGTCCGCAAAATAAGAGATCGTTGTGCATATGGATGGGTGAAACTAAGTGACCTTGTAGTCAGTGTCTAACTCGTTGAAATCCATCCTATCGTTTGTCCTTACAAGGGCATGCACATGTTATTATCATTAAGTATTTCATGTGCATATGGGTCTCACTACACTCGGCATTTA
GCTGATAGATTTTTAGAGGTACCCCTCCATGCTGATGAGTGGATCTTTTCCTTTATGCCCTTAAAGTGAATGAATATTGAAGAAATTAGTTACTGTCACCGGAGCTTCAATGCTAAAATTCTGCTTGTTGCTGTGTTGTATTATAGTGATTTGTATACACAGGTCAATGTAATTGAAATTTTGACCATATAAGCCTTGGA
TGGCAAAGGTGGTTGGTGATACATGTCTATTATTATTCCTTATCCTGTGGATGTCTAATAATTCTTAAAATAAATATAGTTCAATATATGACTCAATTGATGGACACTGCTTGCTTGTAAGTGGGTGATTAGAGGATTTCGACATAGGATATTATTTTGAAATCAGTCCTATTATCAATGGTGG


>TRINITY_DN105454_c1_g1_i13 from sample A4 / Example unspliced isoform:
CTTCTATTCTCCGGTCACTACTCTACGCACAGAGAAGCAAAAATGGAGACGGGAGGAATCAGCAGCAGTAGGCGGAGGAATGGCGGAGCCGCGGCGGCGGGCTCTGAGAACTCCACTCGGTCCGCCGCCCTGCAGCAGCTCAAGAACCTCCGTCAACAGGGCGGGCGCCGAGTCGACACCTTCGAGATAAAAGTAGATGA
AAAAATATATGATTCTGTGGCAGAAGATGACTACGCCAAGCTCGTCGCAAAGCGTCGCGCGGCCGTCAAGGATTTCGTGGTGGACGATGCTGGCCTCGGCTACAATGACGACGGCGAGGAAGATGATTGGGAGGTCGGTGATCGCCCTTACTCTTCATCAGAAGAGGCAGAAGCAGATGGCGGATCTGCGAGAAGAAAGA
AATCGGCGAAGGATTCATCGGAAAATCGGAAGAGGGACGGGGGAAATCCATCAAAGAAAGCGTCGGCTCTGTCAGCCGCAGCGGCATTGATGGGGAAGCAGAAAGTTTCGTCGATGTTTGCCTCAGCGTCAATGTTCCGGAAGAATAAAGAGGACAAGAGCGGGCAAATAAAGGGGTTTTCGACGGACAGTATTCTCGAA
GATGTTCTTGCAGAGATTACTCCTGATGCAGCCGATAGGGAAAAGCGAAGGAGGCGAACAGGCTTAAAAAATGCAGCAGCTGTAGGGAATGCTTTTGCTAATAGTATTAAGAGTTCTCCCCGAGATTTTTCTTCAAGCCTGCCAGAATATCAAGTTAGTGAAGTCTCCTGGGAACCGTGTATTAATTTGGAAAGCAGGCA
GAAACTTCCCACTGTTGAAACCGTACATGAATCTGCACCGTCTGAAACAACAGAATCCCAAAATTCTAAGTCAGCAATGGAGGATCAGTGTGCTTCGGTTCAATCTCCAATTAATCTCGCTGAAGATCCAAGCTGCAAGGAGGATGACTTAAAGCCCAAGGTTATGCTATCTGACAATGGCGAGGCAATTTCAGCTGATG
GCGAGTTGAAAGCAAAAGCTGGGAAGGATGATAATGAGAAATGTGTATTGAATGCTCTAATTGGCCGAGAAAATTCATCTGCCAAAGCAACTGCCGACTGGCAAGCAGTGTGGCAGGGTGGAGATGAAAAAGTGGCAAAAATTGAAGAGACTGATGACCGTTTAACTTCTGAAGATGTGAATGATCTACCATTGGAGTCA
GATGGAGCTTTACTTTTTTACCTTATTGATGCATATGAGGAAGCTTATGGAGCTCATCCTGGTACAATATATCTATTTGGCAAGGTAAAATTCAGAAACTCATATGCTAGCTGTTGTGTGGTGGTACAAAACATGCAACGGTGTGTTTTTGCTGTACCAACTCCTTCAGTCTTCCCAGATAAAGTGATTGCAGAGCTTGA
GCAAGGTGCAAAAGATGGTGTAGTTGAACAATCTACATTGCGGAAAAAGTTGCAGGAGATGGCATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAATGGATCTGAATGTGACTAATTTCAGTATGGTACCAGTCAAGCGTAACTATGCATTTGAGCGGTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGA
GCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAATTAAAAGAAGAATACGAGGCCCAACATGGCTTTCAATTTCCAATGCTGTCTGCTGCCCAAGTTCATCTCGAATAAGCTGGTGCAAGTTTGAAGCTATTGTA
GGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAATGACAAACACAATGTGAATGAAATTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGTTGTCACAAAACAAAGATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGG
CATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGGCATATTTCCGATGGGATTCACAAAGGAGGTTGCCAACAGAAATACTAAAGCTGGGTCTAATATCTTGAACTATGAGAGCAGTGAAAGAGCTTTGCTGAATCGCCTGATGATCAAACTTCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTGGCCACAATATTT
CAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTTGCAAGGTGCCCAGCAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCTGTGATGCCTAAGCTTAGCAAAGGAACTGGTAACTTTGGGACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCATGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCC
CGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGACACAGCTCGCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTACAAAACATCGGCATCTCTAATGGAACTGGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTGGTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATT
GACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAAAACCCTACAGGGGGCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATGAGTTCCATGGTAGAAAGTATATTTTACCAGACAAGATGTCAGCTCGAGAGAAAGAACTTAAAGCATCAAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCTGGGGAAGTTG
AGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGCTCCCAACACATGGCAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTGGTGCTGGAACCAAAGAAAGGACTCTATGACAAATATATTTTACTTCTTGACTTCAACAGTCTTTACCCTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGCTTTACAACTGTT
GAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTACCAACCTGCAACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAGTTATGGCTAAAAAACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTG
CTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGCAGAGCTCATCACCTCACAGgtaagtgaaagcacttcctgctttgagctattgggattttgcagcacaatatatgagtgaagtctgaaattgtctgtgcagGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCAAAACCACCTAAATCTTGAGG
TCATTTATGGAGATACAGATTCGATCATGATCCATACTGGTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAGATCTAGATGGGATATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAGTTAAGGTGCAGTTTAACAAG
GATGGGACCATCTATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTTGATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGTGAAGATGTTGTGGAAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGAAATGCGAAATGGTCAAGTGGAGCTTGA
GAAGTATGTCATTACCAAATCATTGACTAAACCTCCAGAAGAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACATGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGTTGGTGATACAGTCCCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGGATCTGGAGTGGGATCAACAACAGGCATTGCTGAAAGGG
CAAGACATCCAGATGAGTTGAAAAGGGACAGTGGAAACTGGATGGTTGACATTGATTATTATCTATCTCAGCAGATTCATCCTGTTGTATCAAGATTATGTGCACCTATCCAAGGCACAAGCCCAGGACGTCTTGCAGATTGTCTTGGACTGGATTCGTCAAGGTTTGAACAAAAAATGAGTTTTGAAGCTGTTGCTAAA
GAGCCAGCTACTGCATTTCTGTCGAGTATTGATGATAATGAAAGATACCAATACTGCGAGCCATTCTGGATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAGTGTGGCAAGCATGATTGAAAGTTCTGAAAACCATACAACAAACTCAGGAGATCATGAAGAAGATGAAACATTACGGAAGACATCAAGGGA
TGCAACTGAGAAGTTTTGGTGCTCACTCAGTTGTCCGAAATGTCAAGATGAGGGTGTTGAAAGTTTAATTTCTCCTGCCATATTGGCTAATCAGGTGAAAAGGCAGGCAGAAAAATTCATTGCACTATACTATACAGGGTTAATGATTTGTGATGACGAACTATGCAAGCTCCAAACTAGGAACTTGAACTTGCGGATTA
TCGGTGATACTGGAAGGGGAACAGTTTGTCCAAATTATCCTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAGTACACTGAGGTAGACCTATACAAGCAGCTTACATACTTCTGCCGCATACTTGACATTCCGCGTGTAATTCAAAAGTTGGAGTATAATGCAAGGGTGCCTGTAGAGAAACGCCTTGCCAAAATACGACCCGCA
ATTGATGCTGCAGCTATGACAGTCCGCAAAATAAGAGATCGTTGTGCATATGGATGGGTGAAACTAAGTGACCTTGTAGTCAGTGTCTAACTCGTTGAAATCCATCCTATCGTTTGTCCTTACAAGGGCATGCACATGTTATTATCATTAAGTATTTCATGTGCATATGGGTCTCACTACACTCGGCATTTAGCTGATAG
ATTTTTAGAGGTACCCCTCCATGCTGATGAGTGGATCTTTTCCTTTATGCCCTTAAAGTGAATGAATATTGAAGAAATTAGTTACTGTCACCGGAGCTTCAATGCTAAAATTCTGCTTGTTGCTGTGTTGTATTATAGTGATTTGTATACACAGGTCAATGTAATTGAAATTTTGACCATATAAGCCTTGGATGGCAAAG
GTGGTTGGTGATACATGTCTATTATTATTCCTTATCCTGTGGATGTCTAATAATTCTTAAAATAAATATAGTTCAATATATGACTCAATTGATGGACACTGCTTGCTTGTAAGTGGGTGATTAGAGGATTTCGACATAGGATATTATTTTGAAATCAGTCCTATTATCAATGGTGG



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GGTCCGCCGCCCTGCAGCAGCTCAAGAACCTCCGTCAACAGGGCGGGCGCCGAGTCGACACCTTCGAGATAAAAGTAGATGAAAAAATATATGATTCTGTGGCAGAAGATGACTACGCCAAGCTCGTCGCAAAGCGTCGCGCGGCCGTCAAGGATTTCGTGGTGGACGATGCTGGCCTCGGCTACAATGACGACGGCGAG
GAAGATGATTGGGAGGTCGGTGATCGCCCTTACTCTTCATCAGAAGAGGCAGAAGCAGATGGCGGATCTGCGAGAAGAAAGAAATCGGCGAAGGATTCATCGGAAAATCGGAAGAGGGACGGGGGAAATCCATCAAAGAAAGCGTCGGCTCTGTCAGCCGCAGCGGCATTGATGGGGAAGCAGAAAGTTTCGTCGATGTT
TGCCTCAGCGTCAATGTTCCGGAAGAATAAAGAGGACAAGAGCGGGCAAATAAAGGGGTTTTCGACGGACAGTATTCTCGAAGATGTTCTTGCAGAGATTACTCCTGATGCAGCCGATAGGGAAAAGCGAAGGAGGCGAACAGGCTTAAAAAATGCAGCAGCTGTAGGGAATGCTTTTGCTAATAGTATTAAGAGTTCTC
CCCGAGATTTTTCTTCAAGCCTGCCAGAATATCAAGTTAGTGAAGTCTCCTGGGAACCGTGTATTAATTTGGAAAGCAGGCAGAAACTTCCCACTGTTGAAACCGTACATGAATCTGCACCGTCTGAAACAACAGAATCCCAAAATTCTAAGTCAGCAATGGAGGATCAGTGTGCTTCGGTTCAATCTCCAATTAATCTC
GCTGAAGATCCAAGCTGCAAGGAGGATGACTTAAAGCCCAAGGTTATGCTATCTGACAATGGCGAGGCAATTTCAGCTGATGGCGAGTTGAAAGCAAAAGCTGGGAAGGATGATAATGATAAATGTGTATTGAATGCTCTAATTGGCCGAGAAAATTCATCTGCCAAAGCAACTGCCGACTGGCAAGCAGTGTGGCAGGG
TGGAGATGAAAAAGTGGCAAAAATTGAAGAGACTGATGACCGTTTAACTTCTGAAGATGTGAATGATCTACCATTGGAGTCAGATGGAGCTTTACTTTTTTACCTTATTGATGCATATGAGGAAGCTTATGGAGCTCATCCTGGTACAATATATCTATTTGGCAAGGTAAAATTCAGAAACTCATATGCTAGCTGTTGTG
TGGTGGTACAAAACATGCAACGGTGTGTTTTTGCTGTACCAACTCCTTCAGTCTTCCCAGATAAAGTGATTGCAGAGCTTGAGCAAGGTGCAAAAGATGGTGTAGTTGAACAATCTACATTGCGGAAAAAGTTGCAGGAGATGGCATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAATGGATCTGAATGTGACTAAT
TTCAGTATGGTACCAGTCAAGCGTAACTATGCATTTGAGCGGTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGAGCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAATTAAAAGAAGAATACGAGG
CCCAACATGGCTTTCAATTTCCAATGCTGTCTGCTGCCCAAGTTCATCTCGAATAAGCTGGTGCAAGTTTGAAGCTATTGTAGGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAATGACAAACACAATGTGAATG
AAATTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGTTGTCACAAAACAAAGATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGGCATATTTCCGATGGGATTCACAAAGGAGGTTGCCAACAGAAATACTAAAGCTGGGTCTAATATCTTGAACTATGAG
AGCAGTGAAAGAGCTTTGCTGAATCGCCTGATGATCAAACTTCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTGGCCACAATATTTCAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTTGCAAGGTGCCCAGCAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCTGTGATGCCTAAGCTTAGCAAAGGAAC
TGGTAACTTTGGGACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCATGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCCCGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGACACAGCTCGCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTACAAAACATCGGCAT
CTCTAATGGAACTGGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTGGTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAAAACCCTACAGGGGGCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATGAGTTCCATGGTAGAAAGTATATTTTA
CCAGACAAGATGTCAGCTCGAGAGAAAGAACTTAAAGCATCAAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCGGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGCTCCCAACACATGGCAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTGGTGCTGGAACCAAAGAAAGGACTCTA
TGACAAATATATTTTACTTCTTGACTTCAACAGTCTTTACCCTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGCTTTACAACTGTTGAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTACCAACCTGCAACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAGTTATGGCTAAAAA
ACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGCAGAGCTCATCACCTCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCAAAACCACCTAAATCTTGAG
GTCATTTATGGAGATACAGATTCGATCATGATCCATACTGGTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAGATCTAGATGGGATATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAGTTAAGGTGCAGTTTAACAA
GGATGGGACCATCTATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTTGATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGTGAAGATGTTGTGGAAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGAAATGCGAAATGGTCAAGTGGAGCTTG
AGAAGTATGTCATTACCAAATCATTGACTAAACCTCCAGAAGAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACATGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGTTGGTGATACAGTCCCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGTGCGCACCTTTTCTATTGTTTTATAAATGCTGACCTTG
ATGTGTACTTTCTAAATCTTTCAAACTTTACCAGCATTTTGCCAATTCAAGTGACAAACAGAATGGGCTTTCAACTCATATCTGCCATTACTAATGATGGTGTTAGATTTTATAGCAGCATAACCAGGATCACTAAAAGAATGGCAAAGGACAAAATGAGTGTGGATCTTGTTTAACCATGATGATAAGAACAATAATCT
AC


>TRINITY_DN115653_c6_g1_i10 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CAAAGGTATGCATGTTTTGTATATAGCTATTTATTTGGTTCTTAATGTCTATTGTTTAAACCTGTTTGATCTTCTTTTGGGATGATATTCTCAGGGTTAAGGCTTTAGCATAAAGGTTGCTCAGTTCTCACTTTTTGTCTGTGATTGTATGCCATTGAAAAGGGGCAGAATTCTACCAGCTCAGTATTTCTTATAACTAT
ATCTTTGTGTAATGTAGAATTTATTTTTCAAAGGTGAAACAAGTCTATCTTATTAGATTAGATGTCCTTTATTCCTCCATGCAGATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGGCATATTTCCGATGGGATTCACAAAGGAGGTTGC
CAACAGAAATACTAAAGCTGGGTCTAATATCTTGAACTATGAGAGCAGgtccgtttctgaatgcgcatttatcttaaggacttactgttcagatattgtgtttgcttgactgaacgatggatcagaagattgtaaatgcccatatattgaatcaatagattacatattacattacagttgtatatttttatatacatggc
tgacaaaagtgaccatttactttacaagcagTGAAAGAGCTTTGCTGAATCGCCTGATGATCAAACTTCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTGGCCACAATATTTCAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTTGCAAGGTGCCCAGCAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCT
GTGATGCCTAAGCTTAGCAAAGGAACTGGTAACTTTGGGACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCATGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCCCGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGACACAGCTCGCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATAT
ACCTACAATGTACAAAACATCGGCATCTCTAATGGAACTGGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTGGTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAAAACCCTACAGGGGGCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATG
AGTTCCATGGTAGAAAGTATATTTTACCAGACAAGATGTCAGCTCGAGAGAAAGAACTTAAAGCATCAAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCGGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGCTCCCAACACATGGCAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTG
GTGCTGGAACCAAAGAAAGGACTCTATGACAAATATATTTTACTTCTTGACTTCAACAGTCTTTACCCTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGCTTTACAACTGTTGAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTACCAACCTGCAACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAG
GAGACAAGTGAAGTTATGGCTAAAAAACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGCAGAGCTCATCACCTCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACC
TTGTTCAAAACCACCTAAATCTTGAGGTCATTTATGGAGATACAGATTCGATCATGATCCATACTGGTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAGATCTAGATGGGATATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATAT
GCAGCAGTTAAGGTGCAGTTTAACAAGGATGGGACCATCTATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTTGATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGTGAAGATGTTGTGGAAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGA
AATGCGAAATGGTCAAGTGGAGCTTGAGAAGTATGTCATTACCAAATCATTGACTAAACCTCCAGAAGAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACATGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGTTGGTGATACAGTCCCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGGATCTGGAGTGG
GATCAACAACAGGCATTGCTGAAAGGGCAAGACATCCAGATGAGTTGAAAAGGGACAGTGGAAACTGGATGGTTGACATTGATTATTATCTATCTCAGCAGATTCATCCTGTTGTATCAAGATTATGTGCACCTATCCAAGGCACAAGCCCAGGACGTCTTGCAGATTGTCTTGGACTGGATTCGTCAAGGTTTGAACAA
AAAATGAGTTTTGAAGCTGTTGCTAAAGAGCCAGCTACTGCATTTCTGTCGAGTATTGATGATAATGAAAGATACCAATACTGCGAGCCATTCTGGATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAGTGTGGCAAGCATGATTGAAAGTTCTGAAAACCATACAACAAACTCAGGAGATCATGAAGAAGA
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AAACTAGGAACTTGAACTTGCGGATTATCGGTGATACTGGAAGGGGAACAGTTTGTCCAAATTATCCTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAGTACACTGAGGTAGACCTATACAAGCAGCTTACATACTTCTGCCGCATACTTGACATTCCGCGTGTAATTCAAAAGTTGGAGTATAATGCAAGGGTGCCTGTAGAG
AAACGCCTTGCCAAAATACGACCCGCAATTGATGCTGCAGCTATGACAGTCCGCAAAATAAGAGATCGTTGTGCATATGGATGGGTGAAACTAAGTGACCTTGTAGTCAGTGTCTAACTCGTTGAAATCCATCCTATCGTTTGTCCTTACAAGGGCATGCACATGTTATTATCATTAAGTATTTCATGTGCATATGGGTC
TCACTACACTCGGCATTTAGCTGATAGATTTTTAGAGGTACCCCTCCATGCTGATGAGTGGATCTTTTCCTTTATGCCCTTAAAGTGAATGAATATTGAAGAAATTAGTTACTGTCACCGGAGCTTCAATGCTAAAATTCTGCTTGTTGCTGTGTTGTATTATAGTGATTTGTATACACAGGTCAATGTAATTGAAATTT
TGACCATATAAGCCTTGGATGGCAAAGGTGGTTGGTGATACATGTCTATTATTATTCCTTATCCTGTGGATGTCTAATAATTCTTAAAATAAATATAGTTCAATATATGACTCAATTGATGGACACTGCTTGCTTGTAAGTGGGTGATTAGAGGATTTCGACATAGGATATTATTTTGAAATCAGTCCTATTATCAATGG
TGGAAAAAATTTAATTTGATTTTGGTGTATTATATTTTTATTATTTGTTGATTTTTTAATAAAATATTTTAATAATAGTGATATAATTGTGTTGAGAGGCAATTTCTACTGCTAACTTGTGGGTGAGATGTGTTATGTTTGTAATGATCATGTGATACATGTAGACTCTAAACAATAAATATATATATATATTTTTAAAA
CCAAGTACATTTAGAT



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>TRINITY_DN115653_c6_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoform
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GGTCCGCCGCCCTGCAGCAGCTCAAGAACCTCCGTCAACAGGGCGGGCGCCGAGTCGACACCTTCGAGATAAAAGTAGATGAAAAAATATATGATTCTGTGGCAGAAGATGACTACGCCAAGCTCGTCGCAAAGCGTCGCGCGGCCGTCAAGGATTTCGTGGTGGACGATGCTGGCCTCGGCTACAATGACGACGGCGAG
GAAGATGATTGGGAGGTCGGTGATCGCCCTTACTCTTCATCAGAAGAGGCAGAAGCAGATGGCGGATCTGCGAGAAGAAAGAAATCGGCGAAGGATTCATCGGAAAATCGGAAGAGGGACGGGGGAAATCCATCAAAGAAAGCGTCGGCTCTGTCAGCCGCAGCGGCATTGATGGGGAAGCAGAAAGTTTCGTCGATGTT
TGCCTCAGCGTCAATGTTCCGGAAGAATAAAGAGGACAAGAGCGGGCAAATAAAGGGGTTTTCGACGGACAGTATTCTCGAAGATGTTCTTGCAGAGATTACTCCTGATGCAGCCGATAGGGAAAAGCGAAGGAGGCGAACAGGCTTAAAAAATGCAGCAGCTGTAGGGAATGCTTTTGCTAATAGTATTAAGAGTTCTC
CCCGAGATTTTTCTTCAAGCCTGCCAGAATATCAAGTTAGTGAAGTCTCCTGGGAACCGTGTATTAATTTGGAAAGCAGGCAGAAACTTCCCACTGTTGAAACCGTACATGAATCTGCACCGTCTGAAACAACAGAATCCCAAAATTCTAAGTCAGCAATGGAGGATCAGTGTGCTTCGGTTCAATCTCCAATTAATCTC
GCTGAAGATCCAAGCTGCAAGGAGGATGACTTAAAGCCCAAGGTTATGCTATCTGACAATGGCGAGGCAATTTCAGCTGATGGCGAGTTGAAAGCAAAAGCTGGGAAGGATGATAATGATAAATGTGTATTGAATGCTCTAATTGGCCGAGAAAATTCATCTGCCAAAGCAACTGCCGACTGGCAAGCAGTGTGGCAGGG
TGGAGATGAAAAAGTGGCAAAAATTGAAGAGACTGATGACCGTTTAACTTCTGAAGATGTGAATGATCTACCATTGGAGTCAGATGGAGCTTTACTTTTTTACCTTATTGATGCATATGAGGAAGCTTATGGAGCTCATCCTGGTACAATATATCTATTTGGCAAGGTAAAATTCAGAAACTCATATGCTAGCTGTTGTG
TGGTGGTACAAAACATGCAACGGTGTGTTTTTGCTGTACCAACTCCTTCAGTCTTCCCAGATAAAGTGATTGCAGAGCTTGAGCAAGGTGCAAAAGATGGTGTAGTTGAACAATCTACATTGCGGAAAAAGTTGCAGGAGATGGCATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAATGGATCTGAATGTGACTAAT
TTCAGTATGGTACCAGTCAAGCGTAACTATGCATTTGAGCGGTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGAGCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAATTAAAAGAAGAATACGAGG
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TGGTAACTTTGGGACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCATGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCCCGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGACACAGCTCGCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTACAAAACATCGGCAT
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ACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGCAGAGCTCATCACCTCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCAAAACCACCTAAATCTTGAG
GTCATTTATGGAGATACAGATTCGATCATGATCCATACTGGTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAGATCTAGATGGGATATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAGTTAAGGTGCAGTTTAACAA
GGATGGGACCATCTATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTTGATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGTGAAGATGTTGTGGAAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGAAATGCGAAATGGTCAAGTGGAGCTTG
AGAAGTATGTCATTACCAAATCATTGACTAAACCTCCAGAAGAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACATGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGTTGGTGATACAGTCCCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGTGCGCACCTTTTCTATTGTTTTATAAATGCTGACCTTG
ATGTGTACTTTCTAAATCTTTCAAACTTTACCAGCATTTTGCCAATTCAAGTGACAAACAGAATGGGCTTTCAACTCATATCTGCCATTACTAATGATGGTGTTAGATTTTATAGCAGCATAACCAGGATCACTAAAAGAATGGCAAAGGACAAAATGAGTGTGGATCTTGTTTAACCATGATGATAAGAACAATAATCT
AC


>TRINITY_DN115653_c6_g1_i11 from sample A3 / Example unspliced isoform:
AGTTCATCTCGAgtaagatgtgcagctgaaaattattttgcttaatttgtatttctacatttgatatggattgagaagtatcactgaattttgattatttctgtttttgagaactttggatatttgaggttgtcatccagttacatttgcagtttgactaaacaatcctatgttggaaccagATAAGCTGGTGCAAGTTT
GAAGCTATTGTAGGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAATGACAAACACAATGTGAATGAAATTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGTTGTCACAAAACAAAGATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATG
GAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGGCATATTTCCGATGGGATTCACAAAGGAGGTTGCCAACAGAAATACTAAAGCTGGGTCTAATATCTTGAACTATGAGAGCAGTGAAAGAGCTTTGCTGAATCGCCTGATGATCAAACTTCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTG
GCCACAATATTTCAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTTGCAAGGTGCCCAGCAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCTGTGATGCCTAAGCTTAGCAAAGGAACTGGTAACTTTGGGACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCATGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACC
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CGGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGCTCCCAACACATGGCAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTGGTGCTGGAACCAAAGAAAGGACTCTATGACAAATATATTTTACTTCTTGACTTCAACAGTCTTTACCCTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGC
TTTACAACTGTTGAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTACCAACCTGCAACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAGTTATGGCTAAAAAACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAG
TATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGCAGAGCTCATCACCTCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCAAAACCACCTAAATCTTGAGGTCATTTATGGAGATACAGATTCGATCATGATCCATACTGGTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGG
TAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAGATCTAGATGGGATATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAGTTAAGGTGCAGTTTAACAAGGATGGGACCATCTATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTTGATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTA
TCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGTGAAGATGTTGTGGAAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGAAATGCGAAATGGTCAAGTGGAGCTTGAGAAGTATGTCATTACCAAATCATTGACTAAACCTCCAGAAGAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACA
TGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGTTGGTGATACAGTCCCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGGATCTGGAGTGGGATCAACAACAGGCATTGCTGAAAGGGCAAGACATCCAGATGAGTTGAAAAGGGACAGTGGAAACTGGATGGTTGACATTGATTATTATCTATCTC
AGCAGATTCATCCTGTTGTATCAAGATTATGTGCACCTATCCAAGGCACAAGCCCAGGACGTCTTGCAGATTGTCTTGGACTGGATTCGTCAAGGTTTGAACAAAAAATGAGTTTTGAAGCTGTTGCTAAAGAGCCAGCTACTGCATTTCTGTCGAGTATTGATGATAATGAAAGATACCAATACTGCGAGCCATTCTGG
ATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAGTGTGGCAAGCATGATTGAAAGTTCTGAAAACCATACAACAAACTCAGGAGATCATGAAGAAGATGAAACATTACGGAAGACATCAAGGGATGCAACTGAGAAGTTTTGGTGCTCACTCAGTTGTCCGAAATGTCAAGATGAGGGTGTTGAAAGTTTAAT
TTCTCCTGCCATATTGGCTAATCAGGTGAAAAGGCAGGCAGAAAAATTCATTGCACTATACTATACAGGGTTAATGATTTGTGATGACGAACTATGCAAGCTCCAAACTAGGAACTTGAACTTGCGGATTATCGGTGATACTGGAAGGGGAACAGTTTGTCCAAATTATCCTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAGT
ACACTGAGGTAGACCTATACAAGCAGCTTACATACTTCTGCCGCATACTTGACATTCCGCGTGTAATTCAAAAGTTGGAGTATAATGCAAGGGTGCCTGTAGAGAAACGCCTTGCCAAAATACGACCCGCAATTGATGCTGCAGCTATGACAGTCCGCAAAATAAGAGATCGTTGTGCATATGGATGGGTGAAACTAAGT
GACCTTGTAGTCAGTGTCTAACTCGTTGAAATCCATCCTATCGTTTGTCCTTACAAGGGCATGCACATGTTATTATCATTAAGTATTTCATGTGCATATGGGTCTCACTACACTCGGCATTTAGCTGATAGATTTTTAGAGGTACCCCTCCATGCTGATGAGTGGATCTTTTCCTTTATGCCCTTAAAGTGAATGAATAT
TGAAGAAATTAGTTACTGTCACCGGAGCTTCAATGCTAAAATTCTGCTTGTTGCTGTGTTGTATTATAGTGATTTGTATACACAGGTCAATGTAATTGAAATTTTGACCATATAAGCCTTGGATGGCAAAGGTGGTTGGTGATACATGTCTATTATTATTCCTTATCCTGTGGATGTCTAATAATTCTTAAAATAAATAT
AGTTCAATATATGACTCAATTGATGGACACTGCTTGCTTGTAAGTGGGTGATTAGAGGATTTCGACATAGGATATTATTTTGAAATCAGTCCTATTATCAATGGTGGAAAAAATTTAATTTGATTTTGGTGTATTATATTTTTATTATTTGTTGATTTTTTAATAAAATATTTTAATAATAGTGATATAATTGTGTTGAG
AGGCAATTTCTACTGCTAACTTGTGGGTGAGATGTGTTATGTTTGTAATGATCATGTGATACATGTAGACTCTAAACAATAAATATATATATATATTTTTAAAACCAAGTACATTTAGAT



Intron 5 GTGCAACTTC ... TGCCCCATAG

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>TRINITY_DN48729_c0_g1_i24 from sample A7 / Example spliced isoform
GCATCTTCCCGCCATATTACACCGCAAAGAAAAAAAAACCAAAACTCAACCTTCGCCTTCTATTCTCCGGTCACTACTCTACGCACAGAGAAGCAAAAATGGAGACGGGAGGAATCAGCAGCAGTAGGCGGAGGAATGGCGGAGCCGCGGCGGCGGGCTCTGAGAACTCCACTCGGTCCGCCGCCCTGCAGCAGCTCAAG
AACCTCCGTCAACAGGGCGGGCGCCGAGTCGACACCTTCGAGATAAAAGTAGATGAAAAAATATATGATTCTGTGGCAGAAGATGACTACGCCAAGCTCGTCGCAAAGCGTCGCGCGGCCGTCAAGGATTTCGTGGTGGACGATGCTGGCCTCGGCTACAATGACGACGGCGAGGAAGATGATTGGGAGGTCGGTGATCG
CCCTTACTCTTCATCAGAAGAGGCAGAAGCAGATGGCGGATCTGCGAGAAGAAAGAAATCGGCGAAGGATTCATCGGAAAATCGGAAGAGGGACGGGGGAAATCCATCAAAGAAAGCGTCGGCTCTGTCAGCCGCAGCGGCATTGATGGGGAAGCAGAAAGTTTCGTCGATGTTTGCCTCAGCGTCAATGTTCCGGAAGA
ATAAAGAGGACAAGAGCGGGCAAATAAAGGGGTTTTCGACGGACAGTATTCTCGAAGATGTTCTTGCAGAGATTACTCCTGATGCAGCCGATAGGGAAAAGCGAAGGAGGCGAACAGGCTTAAAAAATGCAGCAGCTGTAGGGAATGCTTTTGCTAATAGTATTAAGAGTTCTCCCCGAGATTTTTCTTCAAGCCTGCCA
GAATATCAAGTTAGTGAAGTCTCCTGGGAACCGTGTATTAATTTGGAAAGCAGGCAGAAACTTCCCACTGTTGAAACCGTACATGAATCTGCACCGTCTGAAACAACAGAATCCCAAAATTCTAAGTCAGCAATGGAGGATCAGTGTGCTTCGGTTCAATCTCCAATTAATCTCGCTGAAGATCCAAGCTGCAAGGAGGA
TGACTTAAAGCCCAAGGTTATGCTATCTGACAATGGCGAGGCAATTTCAGCTGATGGCGAGTTGAAAGCAAAAGCTGGGAAGGATGATAATGATAAATGTGTATTGAATGCTCTAATTGGCCGAGAAAATTCATCTGCCAAAGCAACTGCCGACTGGCAAGCAGTGTGGCAGGGTGGAGATGAAAAAGTGGCAAAAATTG
AAGAGACTGATGACCGTTTAACTTCTGAAGATGTGAATGATCTACCATTGGAGTCAGATGGAGCTTTACTTTTTTAGCTTATTGATGCATATGAGGAAGCTTATGGAGCTCATCCTGGTACAATATATCTATTTGGCAAGGTAAAATTCAGAAACTCATATGCTAGCTGTTGTGTGGTGGTACAAAACATGCAACGGTGT
GTTTTTGCTGTACCAACTCCTTCAGTCTTCCCAGATAAAGTGATTGCAGAGCTTGAGCAAGGTGCAAAAGATGGTGTAGTTGAACAATCTACATTGCGGAAAAAGTTGCAGGAGATGGCATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAATGGATCTGAATGTGACTAATTTCAGTATGGTACCAGTCAAGCGTAA
CTATGCATTTGAGCGGTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGAGCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAATTAAAAGAAGAATACGAGGCCCAACATGGCTTTCAATTTCCAATG
CTGTCTGCTGCCCAAGTTCATCTCGAATAAGCTGGTGCAAGTTTGAAGCTATTGTAGGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAATGACAAACACAATGTGAATGAAATTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGT
TGTCACAAAACAAAGGGTTAAGGCTTTAGCATAAAGGTTGCTCAGTTCTCACTTTTTGTCTGTGATTGTATGCCATTGAAAAGGGGCAGAATTCTACCAGCTCAATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGGCATATTTCCGATG
GGATTCACAAAGGAGGTTGCCAACAGAAATACTAAAGCTGGGTCTAATATCTTGAACTATGAGAGCAGTGAAAGAGCTTTGCTGAATCGCCTGATGATCAAACTTCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTGGCCACAATATTTCAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTTGCAAGGTGCCCAG
CAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCTGTGATGCCTAAGCTTAGCAAAGGAACTGGTAACTTTGGGACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCATGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCCCGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGACACAGCTCGCAAAGAATCAAC
TGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTACAAAACATCGGCATCTCTAATGGAACTGGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTGGTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAAAACCCTACAGGGG
GCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATGAGTTCCATGGTAGAAAGTATATTTTACCAGACAAGATGTCAGCTCGAGAGAAAGAACTTAAAGCATCAAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCTGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGCTCCCAACACATGG
CAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTGGTGCTGGAACCAAAGAAAGGACTCTATGACAAATATATTTTACTTCTTGACTTCAACAGTCTTTACCCTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGCTTTACAACTGTTGAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTACCAACCTGCAACTTATCTGGAG
TTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAGTTATGGCTAAAAAACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGCAGAGCTCATCACC
TCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCAAAACCACCTAAATCTTGAGGTCATTTATGGAGATACAGATTCGATCATGATCCATACTGGTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAGATCTAGATGGGAT
ATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAGTTAAGGTGCAGTTTAACAAGGATGGGACCATCTATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTTGATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGTGAAGATGTTGTGG
AAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGAAATGCGAAATGGTCAAGTGGAGCTTGAGAAGTATGTCATTACCAAATCATTGACTAAACCTCCAGAAGAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACATGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGTTGGTGATACAGTC
CCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGGATCTGGAGTGGGATCAACAACAGGCATTGCTGAAAGGGCAAGACATCCAGATGAGTTGAAAAGGGACAGTGGAAACTGGATGGTTGACATTGATTATTATCTATCTCAGCAGATTCATCCTGTTGTATCAAGATTATGTGCACCTATCCAAGGCACAAGCCCAGGACGTCTTGC
AGATTGTCTTGGACTGGATTCGTCAAGGTTTGAACAAAAAATGAGTTTTGAAGCTGTTGCTAAAGAGCCAGCTACTGCATTTCTGTCGAGTATTGATGATAATGAAAGATACCAATACTGCGAGCCATTCTGGATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAGTGTGGCAAGCATGATTGAAAGTTCTG
AAAACCATACAACAAACTCAGGAGATCATGAAGAAGATGAAACATTACGGAAGACATCAAGGGATGCAACTGAGAAGTTTTGGTGCTCACTCAGTTGTCCGAAATGTCAAGATGAGGGTGTTGAAAGTTTAATTTCTCCTGCCATATTGGCTAATCAGGTGAAAAGGCAGGCAGAAAAATTCATTGCACTATACTATACA
GGGTTAATGATTTGTGATGACGAACTATGCAAGCTCCAAACTAGGAACTTGAACTTGCGGATTATCGGTGATACTGGAAGGGGAACAGTTTGTCCAAATTATCCTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAGGTAATGATTGGTTAAATTCTCATGGTATGTGTATTTTGCAAATAAATGATTGGTTAAATTCTCATCGT
ATGTGTTCTTTGCAAATAAGTTCTTCGGATTGAACTAAATAACTGAATTGTTCATTTGTGAGAGCAGTACACTGAGGTAGACCTATACAAGCAGCTTACATACTTCTGCCGCATACTTGACATTCCGCGTGTAATTCAAAAGTTGGAGTATAATGCAAGGGTGCCTGTAGAGAAACGCCTTGCCAAAATACGACCCGCAA
TTGATGCTGCAGCTATGACAGTCCGCAAAATAAGAGATCGTTGTGCATATGGATGGGTGAAACTAAGTGACCTTGTAGTCAGTGTCTAACTCGTTGAAATCCATCCTATCGTTTGTCCTTACAAGGGCATGCACATGTTATTATCATTAAGTATTTCATGTGCATATGGGTCTCACTACACTCGGCATTTAGCTGATAGA
TTTTTAGAGGTACCCCTCCATGCTGATGAGTGGATCTTTTCCTTTATGCCCTTAAAGTGAATGAATATTGAAGAAATTAGTTACTGTCACCGGAGCTTCAATGCTAAAATTCTGCTTGTTGCTGTGTTGTATTATAGTGATTTGTATACACAGGTCAATGTAATTGAAATTTTGACCATATAAGCCTTGGATGGCAAAGG
TGGTTGGTGATACATGTCTATTATTATTCCTTATCCTGTGGATGTCTAATAATTCTTAAAATAAATATAGTTCAATATATGACTCAATTGATGGACACTGCTTGCTTGTAAGTGGGTGATTAGAGGATTTCGACATAGGATATTATTTTGAAATCAGTCCTATTATCAATGGTGG


>TRINITY_DN48729_c0_g1_i23 from sample A7 / Example unspliced isoform:
TTGATGATAATGAAAGgtgcaacttcagctatttggttttgttcattgaatttcttattaattcttatgtctgtgtgtactttgttatattgcattttgttttattctataacatcgtttgtgttgccccatagATACCAATACTGCGAGCCATTCTGGATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAG
TGTGGCAAGCATGATTGAAAGTTCTGAAAACCATACAACAAACTCAGGAGATCATGAAGAAGATGAAACATTACGGAAGACATCAAGGGATGCAACTGAGAAGTTTTGGTGCTCACTCAGTTGTCCGAAATGTCAAGATGAGGGTGTTGAAAGTTTAATTTCTCCTGCCATATTGGCTAATCAGGTGAAAAGGCAGGCAG
AAAAATTCATTGCACTATACTATACAGGGTTAATGATTTGTGATGACGAACTATGCAAGCTCCAAACTAGGAACTTGAACTTGCGGATTATCGGTGATACTGGAAGGGGAACAGTTTGTCCAAATTATCCTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAG



Intron 6 GTTTATGCTC ... TATATTTCAG

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>TRINITY_DN126123_c0_g1_i10 from sample A1 / Example spliced isoform
CCCGGGGGCGCCATTGAGTTTTTGCATCTTCCCGCCATATTACACCGCAAAGAAAAAAAAACCAAAACTCAACCTTCGCCTTCTATTCTCCGGTCACTACTCTACGCACAGAGAAGCAAAAATGGAGACGGGAGGAATCAGCAGCAGTAGGCGGAGGAATGGCGGAGCCGCGGCGGCGGGCTCTGAGAACTCCACTCGGT
CCGCCGCCCTGCAGCAGCTCAAGAACCTCCGTCAACAGGGCGGGCGCCGAGTCGACACCTTCGAGATAAAAGTAGATGAAAAAATATATGATTCTGTGGCAGAAGATGACTACGCCAAGCTCGTCGCAAAGCGTCGCGCGGCCGTCAAGGATTTCGTGGTGGACGATGCTGGCCTCGGCTACAATGACGACGGCGAGGAA
GATGATTGGGAGGTCGGTGATCGCCCTTACTCTTCATCAGAAGAGGCAGAAGCAGATGGCGGATCTGCGAGAAGAAAGAAATCGGCGAAGGATTCATCGGAAAATCGGAAGAGGGACGGGGGAAATCCATCAAAGAAAGCGTCGGCTCTGTCAGCCGCAGCGGCATTGATGGGGAAGCAGAAAGTTTCGTCGATGTTTGC
CTCAGCGTCAATGTTCCGGAAGAATAAAGAGGACAAGAGCGGGCAAATAAAGGGGTTTTCGACGGACAGTATTCTCGAAGATGTTCTTGCAGAGATTACTCCTGATGCAGCCGATAGGGAAAAGCGAAGGAGGCGAACAGGCTTAAAAAATGCAGCAGCTGTAGGGAATGCTTTTGCTAATAGTATTAAGAGTTCTCCCC
GAGATTTTTCTTCAAGCCTGCCAGAATATCAAGTTAGTGAAGTCTCCTGGGAACCGTGTATTAATTTGGAAAGCAGGCAGAAACTTCCCACTGTTGAAACCGTACATGAATCTGCACCGTCTGAAACAACAGAATCCCAAAATTCTAAGTCAGCAATGGAGGATCAGTGTGCTTCGGTTCAATCTCCAATTAATCTCGCT
GAAGATCCAAGCTGCAAGGAGGATGACTTAAAGCCCAAGGTTATGCTATCTGACAATGGCGAGGCAATTTCAGCTGATGGCGAGTTGAAAGCAAAAGCTGGGAAGGATGATAATGATAAATGTGTATTGAATGCTCTAATTGGCCGAGAAAATTCATCTGCCAAAGCAACTGCCGACTGGCAAGCAGTGTGGCAGGGTGG
AGATGAAAAAGTGGCAAAAATTGAAGAGACTGATGACCGTTTAACTTCTGAAGATGTGAATGATCTACCATTGGAGTCAGATGGAGCTTTACTTTTTTACCTTATTGATGCATATGAGGAAGCTTATGGAGCTCATCCTGGTACAATATATCTATTTGGCAAGGTAAAATTCAGAAACTCATATGCTAGCTGTTGTGTGG
TGGTACAAAACATGCAACGGTGTGTTTTTGCTGTACCAACTCCTTCAGTCTTCCCAGATAAAGTGATTGCAGAGCTTGAGCAAGGTGCAAAAGATGGTGTAGTTGAACAATCTACATTGCGGAAAAAGTTGCAGGAGATGGCATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAATGGATCTGAATGTGACTAATTTC
AGTATGGTACCAGTCAAGCGTAACTATGCATTTGAGCGGTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGAGCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAATTAAAAGAAGAATACGAGGCCC
AACATGGCTTTCAATTTCCAATGCTGTCTGCTGCCCAAGTTCATCTCGAATAAGCTGGTGCAAGTTTGAAGCTATTGTAGGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAATGACAAACACAATGTGAATGAAA
TTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGTTGTCACAAAACAAAGGTATGCATGTTTTGTATATAGCTATTTATTTGGTTCTTAATGTCTATTGTTTAAACCTGTTTGATCTTCTTTTGGGATGATATTCTCAGGGTTAAGGCTTTAGCATAAAGGTTGCTCAGTTCTCACTTTTTGTCTGTGATTGTATGCCATTGAAAAGGGGCA
GAATTCTACCAGCTCAGTATTTCTTATAACTATATCTTTGTGTAATGTAGAATTTATTTTTCAAAGGTGAAACAAGTCTATCTTATTAGATTAGATGTCCTTTATTCCTCCATGCAGATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGG
CATATTTCCGATGGGATTCACAAAGGAGGTTGCCAACAGAAATACTAAAGCTGGGTCTAATATCTTGAACTATGAGAGCAGTGAAAGAGCTTTGCTGAATCGCCTGATGATCAAACTTCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTGGCCACAATATTTCAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTT
GCAAGGTGCCCAGCAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCTGTGATGCCTAAGCTTAGCAAAGGAACTGGTAACTTTGGGACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCATGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCCCGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGACACAGCTC
GCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTACAAAACATCGGCATCTCTAATGGAACTGGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTGGTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAA
AACCCTACAGGGGGCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATGAGTTCCATGGTAGAAAGTATATTTTACCAGACAAGATGTCAGCTCGAGAGAAAGAACTTAAAGCATCAAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCTGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGC
TCCCAACACATGGCAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTGGTGCTGGAACCAAAGAAAGGACTCTATGACAAATATATTTTACTTCTTGACTTCAACAGTCTTTACCCTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGCTTTACAACTGTTGAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTACCAACCTGC
AACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAGTTATGGCTAAAAAACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGC
AGAGCTCATCACCTCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCAAAACCACCTAAATCTTGAGGTCATTTATGGAGATACAGATTCGATCATGATCCATACTGGTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAG
ATCTAGATGGGATATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAGTTAAGGTGCAGTTTAACAAGGATGGGACCATCTATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTTGATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGT
GAAGATGTTGTGGAAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGAAATGCGAAATGGTCAAGTGGAGCTTGAGAAGTATGTCATTACCAAATCATTGACTAAACCTCCAGAAGAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACATGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGT
TGGTGATACAGTCCCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGGATCTGGAGTGGGATCAACAACAGGCATTGCTGAAAGGGCAAGACATCCAGATGAGTTGAAAAGGGACAGTGGAAACTGGATGGTTGACATTGATTATTATCTATCTCAGCAGATTCATCCTGTTGTATCAAGATTATGTGCACCTATCCAAGGCACAAGCC
CAGGACGTCTTGCAGATTGTCTTGGACTGGATTCGTCAAGGTTTGAACAAAAAATGAGTTTTGAAGCTGTTGCTAAAGAGCCAGCTACTGCATTTCTGTCGAGTATTGATGATAATGAAAGATACCAATACTGCGAGCCATTCTGGATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAGTGTGGCAAGCATG
ATTGAAAGTTCTGAAAACCATACAACAAACTCAGGAGATCATGAAGAAGATGAAACATTACGGAAGACATCAAGGGATGCAACTGAGAAGTTTTGGTGCTCACTCAGTTGTCCGAAATGTCAAGATGAGGGTGTTGAAAGTTTAATTTCTCCTGCCATATTGGCTAATCAGGTGAAAAGGCAGGCAGAAAAATTCATTGC
ACTATACTATACAGGGTTAATGATTTGTGATGACGAACTATGCAAGCTCCAAACTAGGAACTTGAACTTGCGGATTATCGGTGATACTGGAAGGGGAACAGTTTGTCCAAATTATCCTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAGTACACTGAGGTAGACCTATACAAGCAGCTTACATACTTCTGCCGCATACTTGACA
TTCCGCGTGTAATTCAAAAGTTGGAGTATAATGCAAGGGTGCCTGTAGAGAAACGCCTTGCCAAAATACGACCCGCAATTGATGCTGCAGCTATGACAGTCCGCAAAATAAGAGATCGTTGTGCATATGGATGGGTGAAACTAAGTGACCTTGTAGTCAGTGTCTAACTCGTTGAAATCCATCCTATCGTTTGTCCTTAC
AAGGGCATGCACATGTTATTATCATTAAGTATTTCATGTGCATATGGGTCTCACTACACTCGGCATTTAGCTGATAGATTTTTAGAGGTACCCCTCCATGCTGATGAGTGGATCTTTTCCTTTATGCCCTTAAAGTGAATGAATATTGAAGAAATTAGTTACTGTCACCGGAGCTTCAATGCTAAAATTCTGCTTGTTGC
TGTGTTGTATTATAGTGATTTGTATACACAGGTCAATGTAATTGAAATTTTGACCATATAAGCCTTGGATGGCAAAGGTGGTTGGTGATACATGTCTATTATTATTCCTTATCCTGTGGATGTCTAATAATTCTTAAAATAAATATAGTTCAATATATGACTCAATTGATGGAT


>TRINITY_DN126123_c0_g1_i9 from sample A1 / Example unspliced isoform:
ACAGGCTTGCAAGGTGCCCAGCAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCTGTGATGCCTAAGCTTAGCAAAGGAACTGGTAACTTTGGGACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCATGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCCCGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGA
CACAGCTCGCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTACAAAACATCGGCATCTCTAATGGAACTGGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTGGTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTT
TGGAGTAAAACCCTACAGGGGGCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATGAGTTCCATGGTAGAAAGTATATTTTACCAGACAAGATGTCAGCTCGAGAGAAAGAACTTAAAGCATCAAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCTGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCA
GGCTGAGCTCCCAACACATGGCAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTGGTGCTGGAACCAAAGAAAGGACTCTATGACAAATATATTTTACTTCTTGACTTCAACAGTCTTTACCCTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGCTTTACAACTGTTGAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTAC
CAACCTGCAACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAGTTATGGCTAAAAAACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGgtttatgctctcttccgattttcaagtcataccacctttgcattga
agttcttttgtaagattgattggtgaggtcacttccttgaagttgacacgttcaatgttttcacatgctgtatatttcagTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGCAGAGCTCATCACCTCACAGGTAAGTGAAAGCACTTCCTGCTTTGAGCTATTGGGATTTTGCAGCAC
AATATATGAGTGAAGT



Intron 7 GTATGCATGT ... CTCCATGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A929.41602518.9
A1022.381113231.4



>TRINITY_DN126123_c0_g1_i13 from sample A1 / Example spliced isoform
CCCGGGGGCGCCATTGAGTTTTTGCATCTTCCCGCCATATTACACCGCAAAGAAAAAAAAACCAAAACTCAACCTTCGCCTTCTATTCTCCGGTCACTACTCTACGCACAGAGAAGCAAAAATGGAGACGGGAGGAATCAGCAGCAGTAGGCGGAGGAATGGCGGAGCCGCGGCGGCGGGCTCTGAGAACTCCACTCGGT
CCGCCGCCCTGCAGCAGCTCAAGAACCTCCGTCAACAGGGCGGGCGCCGAGTCGACACCTTCGAGATAAAAGTAGATGAAAAAATATATGATTCTGTGGCAGAAGATGACTACGCCAAGCTCGTCGCAAAGCGTCGCGCGGCCGTCAAGGATTTCGTGGTGGACGATGCTGGCCTCGGCTACAATGACGACGGCGAGGAA
GATGATTGGGAGGTCGGTGATCGCCCTTACTCTTCATCAGAAGAGGCAGAAGCAGATGGCGGATCTGCGAGAAGAAAGAAATCGGCGAAGGATTCATCGGAAAATCGGAAGAGGGACGGGGGAAATCCATCAAAGAAAGCGTCGGCTCTGTCAGCCGCAGCGGCATTGATGGGGAAGCAGAAAGTTTCGTCGATGTTTGC
CTCAGCGTCAATGTTCCGGAAGAATAAAGAGGACAAGAGCGGGCAAATAAAGGGGTTTTCGACGGACAGTATTCTCGAAGATGTTCTTGCAGAGATTACTCCTGATGCAGCCGATAGGGAAAAGCGAAGGAGGCGAACAGGCTTAAAAAATGCAGCAGCTGTAGGGAATGCTTTTGCTAATAGTATTAAGAGTTCTCCCC
GAGATTTTTCTTCAAGCCTGCCAGAATATCAAGTTAGTGAAGTCTCCTGGGAACCGTGTATTAATTTGGAAAGCAGGCAGAAACTTCCCACTGTTGAAACCGTACATGAATCTGCACCGTCTGAAACAACAGAATCCCAAAATTCTAAGTCAGCAATGGAGGATCAGTGTGCTTCGGTTCAATCTCCAATTAATCTCGCT
GAAGATCCAAGCTGCAAGGAGGATGACTTAAAGCCCAAGGTTATGCTATCTGACAATGGCGAGGCAATTTCAGCTGATGGCGAGTTGAAAGCAAAAGCTGGGAAGGATGATAATGATAAATGTGTATTGAATGCTCTAATTGGCCGAGAAAATTCATCTGCCAAAGCAACTGCCGACTGGCAAGCAGTGTGGCAGGGTGG
AGATGAAAAAGTGGCAAAAATTGAAGAGACTGATGACCGTTTAACTTCTGAAGATGTGAATGATCTACCATTGGAGTCAGATGGAGCTTTACTTTTTTACCTTATTGATGCATATGAGGAAGCTTATGGAGCTCATCCTGGTACAATATATCTATTTGGCAAGGTAAAATTCAGAAACTCATATGCTAGCTGTTGTGTGG
TGGTACAAAACATGCAACGGTGTGTTTTTGCTGTACCAACTCCTTCAGTCTTCCCAGATAAAGTGATTGCAGAGCTTGAGCAAGGTGCAAAAGATGGTGTAGTTGAACAATCTACATTGCGGAAAAAGTTGCAGGAGATGGCATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAATGGATCTGAATGTGACTAATTTC
AGTATGGTACCAGTCAAGCGTAACTATGCATTTGAGCGGTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGAGCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAATTAAAAGAAGAATACGAGGCCC
AACATGGCTTTCAATTTCCAATGCTGTCTGCTGCCCAAGTTCATCTCGAATAAGCTGGTGCAAGTTTGAAGCTATTGTAGGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAATGACAAACACAATGTGAATGAAA
TTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGTTGTCACAAAACAAAGATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGGCATATTTCCGATGGGATTCACAAAGGAGGTTGCCAACAGAAATACTAAAGCTGGGTCTAATATCTTGAACTATGAGAGC
AGTGAAAGAGCTTTGCTGAATCGCCTGATGATCAAACTTCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTGGCCACAATATTTCAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTTGCAAGGTGCCCAGCAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCTGTGATGCCTAAGCTTAGCAAAGGAACTGG
TAACTTTGGGACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCATGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCCCGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGACACAGCTCGCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTACAAAACATCGGCATCTC
TAATGGAACTGGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTGGTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAAAACCCTACAGGGGGCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATGAGTTCCATGGTAGAAAGTATATTTTACCA
GACAAGATGTCAGCTCGAGAGAAAGAACTTAAAGCATCAAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCTGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGCTCCCAACACATGGCAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTGGTGCTGGAACCAAAGAAAGGACTCTATGA
CAAATATATTTTACTTCTTGACTTCAACAGTCTTTACCCTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGCTTTACAACTGTTGAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTACCAACCTGCAACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAGTTATGGCTAAAAAACA
CGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGCAGAGCTCATCACCTCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCAAAACCACCTAAATCTTGAGGTC
ATTTATGGAGATACAGATTCGATCATGATCCATACTGGTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAGATCTAGATGGGATATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAGTTAAGGTGCAGTTTAACAAGGA
TGGGACCATCTATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTTGATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGTGAAGATGTTGTGGAAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTATTTACTACTGTTTCCCCTGGGCTAAAGTTTCTATGAT
TGCTTTATAATTGTCGAAGAAATATTGCCAGGCCTCATGCATCACATCTCCATTTGTTGTTGCCAATAACATACTTTAAAAGGCAGAGATACTGCAATGTTGCTTTGCCTGAAATGGAACTACTACTGCAACTGTTGAAGTGATAACAAGTATCAAAAGTGTTAATGAG


>TRINITY_DN126123_c0_g1_i10 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CCCGGGGGCGCCATTGAGTTTTTGCATCTTCCCGCCATATTACACCGCAAAGAAAAAAAAACCAAAACTCAACCTTCGCCTTCTATTCTCCGGTCACTACTCTACGCACAGAGAAGCAAAAATGGAGACGGGAGGAATCAGCAGCAGTAGGCGGAGGAATGGCGGAGCCGCGGCGGCGGGCTCTGAGAACTCCACTCGGT
CCGCCGCCCTGCAGCAGCTCAAGAACCTCCGTCAACAGGGCGGGCGCCGAGTCGACACCTTCGAGATAAAAGTAGATGAAAAAATATATGATTCTGTGGCAGAAGATGACTACGCCAAGCTCGTCGCAAAGCGTCGCGCGGCCGTCAAGGATTTCGTGGTGGACGATGCTGGCCTCGGCTACAATGACGACGGCGAGGAA
GATGATTGGGAGGTCGGTGATCGCCCTTACTCTTCATCAGAAGAGGCAGAAGCAGATGGCGGATCTGCGAGAAGAAAGAAATCGGCGAAGGATTCATCGGAAAATCGGAAGAGGGACGGGGGAAATCCATCAAAGAAAGCGTCGGCTCTGTCAGCCGCAGCGGCATTGATGGGGAAGCAGAAAGTTTCGTCGATGTTTGC
CTCAGCGTCAATGTTCCGGAAGAATAAAGAGGACAAGAGCGGGCAAATAAAGGGGTTTTCGACGGACAGTATTCTCGAAGATGTTCTTGCAGAGATTACTCCTGATGCAGCCGATAGGGAAAAGCGAAGGAGGCGAACAGGCTTAAAAAATGCAGCAGCTGTAGGGAATGCTTTTGCTAATAGTATTAAGAGTTCTCCCC
GAGATTTTTCTTCAAGCCTGCCAGAATATCAAGTTAGTGAAGTCTCCTGGGAACCGTGTATTAATTTGGAAAGCAGGCAGAAACTTCCCACTGTTGAAACCGTACATGAATCTGCACCGTCTGAAACAACAGAATCCCAAAATTCTAAGTCAGCAATGGAGGATCAGTGTGCTTCGGTTCAATCTCCAATTAATCTCGCT
GAAGATCCAAGCTGCAAGGAGGATGACTTAAAGCCCAAGGTTATGCTATCTGACAATGGCGAGGCAATTTCAGCTGATGGCGAGTTGAAAGCAAAAGCTGGGAAGGATGATAATGATAAATGTGTATTGAATGCTCTAATTGGCCGAGAAAATTCATCTGCCAAAGCAACTGCCGACTGGCAAGCAGTGTGGCAGGGTGG
AGATGAAAAAGTGGCAAAAATTGAAGAGACTGATGACCGTTTAACTTCTGAAGATGTGAATGATCTACCATTGGAGTCAGATGGAGCTTTACTTTTTTACCTTATTGATGCATATGAGGAAGCTTATGGAGCTCATCCTGGTACAATATATCTATTTGGCAAGGTAAAATTCAGAAACTCATATGCTAGCTGTTGTGTGG
TGGTACAAAACATGCAACGGTGTGTTTTTGCTGTACCAACTCCTTCAGTCTTCCCAGATAAAGTGATTGCAGAGCTTGAGCAAGGTGCAAAAGATGGTGTAGTTGAACAATCTACATTGCGGAAAAAGTTGCAGGAGATGGCATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAATGGATCTGAATGTGACTAATTTC
AGTATGGTACCAGTCAAGCGTAACTATGCATTTGAGCGGTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGAGCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAATTAAAAGAAGAATACGAGGCCC
AACATGGCTTTCAATTTCCAATGCTGTCTGCTGCCCAAGTTCATCTCGAATAAGCTGGTGCAAGTTTGAAGCTATTGTAGGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAATGACAAACACAATGTGAATGAAA
TTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGTTGTCACAAAACAAAGgtatgcatgttttgtatatagctatttatttggttcttaatgtctattgtttaaacctgtttgatcttcttttgggatgatattctcagggttaaggctttagcataaaggttgctcagttctcactttttgtctgtgattgtatgccattgaaaaggggca
gaattctaccagctcagtatttcttataactatatctttgtgtaatgtagaatttatttttcaaaggtgaaacaagtctatcttattagattagatgtcctttattcctccatgcagATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGG
CATATTTCCGATGGGATTCACAAAGGAGGTTGCCAACAGAAATACTAAAGCTGGGTCTAATATCTTGAACTATGAGAGCAGTGAAAGAGCTTTGCTGAATCGCCTGATGATCAAACTTCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTGGCCACAATATTTCAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTT
GCAAGGTGCCCAGCAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCTGTGATGCCTAAGCTTAGCAAAGGAACTGGTAACTTTGGGACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCATGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCCCGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGACACAGCTC
GCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTACAAAACATCGGCATCTCTAATGGAACTGGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTGGTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAA
AACCCTACAGGGGGCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATGAGTTCCATGGTAGAAAGTATATTTTACCAGACAAGATGTCAGCTCGAGAGAAAGAACTTAAAGCATCAAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCTGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGC
TCCCAACACATGGCAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTGGTGCTGGAACCAAAGAAAGGACTCTATGACAAATATATTTTACTTCTTGACTTCAACAGTCTTTACCCTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGCTTTACAACTGTTGAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTACCAACCTGC
AACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAGTTATGGCTAAAAAACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGC
AGAGCTCATCACCTCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCAAAACCACCTAAATCTTGAGGTCATTTATGGAGATACAGATTCGATCATGATCCATACTGGTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAG
ATCTAGATGGGATATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAGTTAAGGTGCAGTTTAACAAGGATGGGACCATCTATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTTGATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGT
GAAGATGTTGTGGAAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGAAATGCGAAATGGTCAAGTGGAGCTTGAGAAGTATGTCATTACCAAATCATTGACTAAACCTCCAGAAGAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACATGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGT
TGGTGATACAGTCCCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGGATCTGGAGTGGGATCAACAACAGGCATTGCTGAAAGGGCAAGACATCCAGATGAGTTGAAAAGGGACAGTGGAAACTGGATGGTTGACATTGATTATTATCTATCTCAGCAGATTCATCCTGTTGTATCAAGATTATGTGCACCTATCCAAGGCACAAGCC
CAGGACGTCTTGCAGATTGTCTTGGACTGGATTCGTCAAGGTTTGAACAAAAAATGAGTTTTGAAGCTGTTGCTAAAGAGCCAGCTACTGCATTTCTGTCGAGTATTGATGATAATGAAAGATACCAATACTGCGAGCCATTCTGGATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAGTGTGGCAAGCATG
ATTGAAAGTTCTGAAAACCATACAACAAACTCAGGAGATCATGAAGAAGATGAAACATTACGGAAGACATCAAGGGATGCAACTGAGAAGTTTTGGTGCTCACTCAGTTGTCCGAAATGTCAAGATGAGGGTGTTGAAAGTTTAATTTCTCCTGCCATATTGGCTAATCAGGTGAAAAGGCAGGCAGAAAAATTCATTGC
ACTATACTATACAGGGTTAATGATTTGTGATGACGAACTATGCAAGCTCCAAACTAGGAACTTGAACTTGCGGATTATCGGTGATACTGGAAGGGGAACAGTTTGTCCAAATTATCCTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAGTACACTGAGGTAGACCTATACAAGCAGCTTACATACTTCTGCCGCATACTTGACA
TTCCGCGTGTAATTCAAAAGTTGGAGTATAATGCAAGGGTGCCTGTAGAGAAACGCCTTGCCAAAATACGACCCGCAATTGATGCTGCAGCTATGACAGTCCGCAAAATAAGAGATCGTTGTGCATATGGATGGGTGAAACTAAGTGACCTTGTAGTCAGTGTCTAACTCGTTGAAATCCATCCTATCGTTTGTCCTTAC
AAGGGCATGCACATGTTATTATCATTAAGTATTTCATGTGCATATGGGTCTCACTACACTCGGCATTTAGCTGATAGATTTTTAGAGGTACCCCTCCATGCTGATGAGTGGATCTTTTCCTTTATGCCCTTAAAGTGAATGAATATTGAAGAAATTAGTTACTGTCACCGGAGCTTCAATGCTAAAATTCTGCTTGTTGC
TGTGTTGTATTATAGTGATTTGTATACACAGGTCAATGTAATTGAAATTTTGACCATATAAGCCTTGGATGGCAAAGGTGGTTGGTGATACATGTCTATTATTATTCCTTATCCTGTGGATGTCTAATAATTCTTAAAATAAATATAGTTCAATATATGACTCAATTGATGGAT



Intron 8 GTAATGATTG ... GTGAGAGCAG

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>TRINITY_DN48729_c0_g1_i12 from sample A7 / Example spliced isoform
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CCCTTACTCTTCATCAGAAGAGGCAGAAGCAGATGGCGGATCTGCGAGAAGAAAGAAATCGGCGAAGGATTCATCGGAAAATCGGAAGAGGGACGGGGGAAATCCATCAAAGAAAGCGTCGGCTCTGTCAGCCGCAGCGGCATTGATGGGGAAGCAGAAAGTTTCGTCGATGTTTGCCTCAGCGTCAATGTTCCGGAAGA
ATAAAGAGGACAAGAGCGGGCAAATAAAGGGGTTTTCGACGGACAGTATTCTCGAAGATGTTCTTGCAGAGATTACTCCTGATGCAGCCGATAGGGAAAAGCGAAGGAGGCGAACAGGCTTAAAAAATGCAGCAGCTGTAGGGAATGCTTTTGCTAATAGTATTAAGAGTTCTCCCCGAGATTTTTCTTCAAGCCTGCCA
GAATATCAAGTTAGTGAAGTCTCCTGGGAACCGTGTATTAATTTGGAAAGCAGGCAGAAACTTCCCACTGTTGAAACCGTACATGAATCTGCACCGTCTGAAACAACAGAATCCCAAAATTCTAAGTCAGCAATGGAGGATCAGTGTGCTTCGGTTCAATCTCCAATTAATCTCGCTGAAGATCCAAGCTGCAAGGAGGA
TGACTTAAAGCCCAAGGTTATGCTATCTGACAATGGCGAGGCAATTTCAGCTGATGGCGAGTTGAAAGCAAAAGCTGGGAAGGATGATAATGATAAATGTGTATTGAATGCTCTAATTGGCCGAGAAAATTCATCTGCCAAAGCAACTGCCGACTGGCAAGCAGTGTGGCAGGGTGGAGATGAAAAAGTGGCAAAAATTG
AAGAGACTGATGACCGTTTAACTTCTGAAGATGTGAATGATCTACCATTGGAGTCAGATGGAGCTTTACTTTTTTAGCTTATTGATGCATATGAGGAAGCTTATGGAGCTCATCCTGGTACAATATATCTATTTGGCAAGGTAAAATTCAGAAACTCATATGCTAGCTGTTGTGTGGTGGTACAAAACATGCAACGGTGT
GTTTTTGCTGTACCAACTCCTTCAGTCTTCCCAGATAAAGTGATTGCAGAGCTTGAGCAAGGTGCAAAAGATGGTGTAGTTGAACAATCTACATTGCGGAAAAAGTTGCAGGAGATGGCATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAATGGATCTGAATGTGACTAATTTCAGTATGGTACCAGTCAAGCGTAA
CTATGCATTTGAGCGGTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGAGCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAATTAAAAGAAGAATACGAGGCCCAACATGGCTTTCAATTTCCAATG
CTGTCTGCTGCCCAAGTTCATCTCGAATAAGCTGGTGCAAGTTTGAAGCTATTGTAGGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAATGACAAACACAATGTGAATGAAATTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGT
TGTCACAAAACAAAGATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGGCATATTTCCGATGGGATTCACAAAGGAGGTTGCCAACAGAAATACTAAAGCTGGGTCTAATATCTTGAACTATGAGAGCAGTGAAAGAGCTTTGCTGAATCG
CCTGATGATCAAACTTCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTGGCCACAATATTTCAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTTGCAAGGTGCCCAGCAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCTGTGATGCCTAAGCTTAGCAAAGGAACTGGTAACTTTGGGACTGGAGCAAGCC
CAGGAGTAATGTCATGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCCCGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGACACAGCTCGCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTACAAAACATCGGCATCTCTAATGGAACTGGTTGAGTGTGCA
GAAACAGATGCTTGGTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAAAACCCTACAGGGGGCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATGAGTTCCATGGTAGAAAGTATATTTTACCAGACAAGATGTCAGCTCGAGAGAA
AGAACTTAAAGCATCAAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCTGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGCTCCCAACACATGGCAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTGGTGCTGGAACCAAAGAAAGGACTCTATGACAAATATATTTTACTTCTTGACT
TCAACAGTCTTTACCCTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGCTTTACAACTGTTGAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTACCAACCTGCAACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAGTTATGGCTAAAAAACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAA
CAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGCAGAGCTCATCACCTCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCAAAACCACCTAAATCTTGAGGTCATTTATGGAGATACAGATTCGAT
CATGATCCATACTGGTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAGATCTAGATGGGATATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAGTTAAGGTGCAGTTTAACAAGGATGGGACCATCTATGAGGTCATTG
AACAAAAAGGACTTGATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGTGAAGATGTTGTGGAAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGAAATGCGAAATGGTCAAGTGGAGCTTGAGAAGTATGTCATTACCAAATCATTG
ACTAAACCTCCAGAAGAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACATGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGTTGGTGATACAGTCCCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGGATCTGGAGTGGGATCAACAACAGGCATTGCTGAAAGGGCAAGACATCCAGATGAGTTGAAAAG
GGACAGTGGAAACTGGATGGTTGACATTGATTATTATCTATCTCAGCAGATTCATCCTGTTGTATCAAGATTATGTGCACCTATCCAAGGCACAAGCCCAGGACGTCTTGCAGATTGTCTTGGACTGGATTCGTCAAGGTTTGAACAAAAAATGAGTTTTGAAGCTGTTGCTAAAGAGCCAGCTACTGCATTTCTGTCGA
GTATTGATGATAATGAAAGATACCAATACTGCGAGCCATTCTGGATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAGTGTGGCAAGCATGATTGAAAGTTCTGAAAACCATACAACAAACTCAGGAGATCATGAAGAAGATGAAACATTACGGAAGACATCAAGGGATGCAACTGAGAAGTTTTGGTGCTCA
CTCAGTTGTCCGAAATGTCAAGATGAGGGTGTTGAAAGTTTAATTTCTCCTGCCATATTGGCTAATCAGGTGAAAAGGCAGGCAGAAAAATTCATTGCACTATACTATACAGGGTTAATGATTTGTGATGACGAACTATGCAAGCTCCAAACTAGGAACTTGAACTTGCGGATTATCGGTGATACTGGAAGGGGAACAGT
TTGTCCAAATTATCCTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAGTACACTGAGGTAGACCTATACAAGCAGCTTACATACTTCTGCCGCATACTTGACATTCCGCGTGTAATTCAAAAGTTGGAGTATAATGCAAGGGTGCCTGTAGAGAAACGCCTTGCCAAAATACGACCCGCAATTGATGCTGCAGCTATGACAGTCC
GCAAAATAAGAGATCGTTGTGCATATGGATGGGTGAAACTAAGTGACCTTGTAGTCAGTGTCTAACTCGTTGAAATCCATCCTATCGTTTGTCCTTACAAGGGCATGCACATGTTATTATCATTAAGTATTTCATGTGCATATGGGTCTCACTACACTCGGCATTTAGCTGATAGATTTTTAGAGGTACCCCTCCATGCT
GATGAGTGGATCTTTTCCTTTATGCCCTTAAAGTGAATGAATATTGAAGAAATTAGTTACTGTCACCGGAGCTTCAATGCTAAAATTCTGCTTGTTGCTGTGTTGTATTATAGTGATTTGTATACACAGGTCAATGTAATTGAAATTTTGACCATATAAGCCTTGGATGGCAAAGGTGGTTGGTGATACATGTCTATTAT
TATTCCTTATCCTGTGGATGTCTAATAATTCTTAAAATAAATATAGTTCAATATATGACTCAATTGATGGACACTGCTTGCTTGTAAGTGGGTGATTAGAGGATTTCGACATAGGATATTATTTTGAAATCAGTCCTATTATCAATGGTGG


>TRINITY_DN48729_c0_g1_i24 from sample A7 / Example unspliced isoform:
GCATCTTCCCGCCATATTACACCGCAAAGAAAAAAAAACCAAAACTCAACCTTCGCCTTCTATTCTCCGGTCACTACTCTACGCACAGAGAAGCAAAAATGGAGACGGGAGGAATCAGCAGCAGTAGGCGGAGGAATGGCGGAGCCGCGGCGGCGGGCTCTGAGAACTCCACTCGGTCCGCCGCCCTGCAGCAGCTCAAG
AACCTCCGTCAACAGGGCGGGCGCCGAGTCGACACCTTCGAGATAAAAGTAGATGAAAAAATATATGATTCTGTGGCAGAAGATGACTACGCCAAGCTCGTCGCAAAGCGTCGCGCGGCCGTCAAGGATTTCGTGGTGGACGATGCTGGCCTCGGCTACAATGACGACGGCGAGGAAGATGATTGGGAGGTCGGTGATCG
CCCTTACTCTTCATCAGAAGAGGCAGAAGCAGATGGCGGATCTGCGAGAAGAAAGAAATCGGCGAAGGATTCATCGGAAAATCGGAAGAGGGACGGGGGAAATCCATCAAAGAAAGCGTCGGCTCTGTCAGCCGCAGCGGCATTGATGGGGAAGCAGAAAGTTTCGTCGATGTTTGCCTCAGCGTCAATGTTCCGGAAGA
ATAAAGAGGACAAGAGCGGGCAAATAAAGGGGTTTTCGACGGACAGTATTCTCGAAGATGTTCTTGCAGAGATTACTCCTGATGCAGCCGATAGGGAAAAGCGAAGGAGGCGAACAGGCTTAAAAAATGCAGCAGCTGTAGGGAATGCTTTTGCTAATAGTATTAAGAGTTCTCCCCGAGATTTTTCTTCAAGCCTGCCA
GAATATCAAGTTAGTGAAGTCTCCTGGGAACCGTGTATTAATTTGGAAAGCAGGCAGAAACTTCCCACTGTTGAAACCGTACATGAATCTGCACCGTCTGAAACAACAGAATCCCAAAATTCTAAGTCAGCAATGGAGGATCAGTGTGCTTCGGTTCAATCTCCAATTAATCTCGCTGAAGATCCAAGCTGCAAGGAGGA
TGACTTAAAGCCCAAGGTTATGCTATCTGACAATGGCGAGGCAATTTCAGCTGATGGCGAGTTGAAAGCAAAAGCTGGGAAGGATGATAATGATAAATGTGTATTGAATGCTCTAATTGGCCGAGAAAATTCATCTGCCAAAGCAACTGCCGACTGGCAAGCAGTGTGGCAGGGTGGAGATGAAAAAGTGGCAAAAATTG
AAGAGACTGATGACCGTTTAACTTCTGAAGATGTGAATGATCTACCATTGGAGTCAGATGGAGCTTTACTTTTTTAGCTTATTGATGCATATGAGGAAGCTTATGGAGCTCATCCTGGTACAATATATCTATTTGGCAAGGTAAAATTCAGAAACTCATATGCTAGCTGTTGTGTGGTGGTACAAAACATGCAACGGTGT
GTTTTTGCTGTACCAACTCCTTCAGTCTTCCCAGATAAAGTGATTGCAGAGCTTGAGCAAGGTGCAAAAGATGGTGTAGTTGAACAATCTACATTGCGGAAAAAGTTGCAGGAGATGGCATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAATGGATCTGAATGTGACTAATTTCAGTATGGTACCAGTCAAGCGTAA
CTATGCATTTGAGCGGTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGAGCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAATTAAAAGAAGAATACGAGGCCCAACATGGCTTTCAATTTCCAATG
CTGTCTGCTGCCCAAGTTCATCTCGAATAAGCTGGTGCAAGTTTGAAGCTATTGTAGGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAATGACAAACACAATGTGAATGAAATTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGT
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GGATTCACAAAGGAGGTTGCCAACAGAAATACTAAAGCTGGGTCTAATATCTTGAACTATGAGAGCAGTGAAAGAGCTTTGCTGAATCGCCTGATGATCAAACTTCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTGGCCACAATATTTCAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTTGCAAGGTGCCCAG
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TGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTACAAAACATCGGCATCTCTAATGGAACTGGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTGGTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAAAACCCTACAGGGG
GCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATGAGTTCCATGGTAGAAAGTATATTTTACCAGACAAGATGTCAGCTCGAGAGAAAGAACTTAAAGCATCAAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCTGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGCTCCCAACACATGG
CAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTGGTGCTGGAACCAAAGAAAGGACTCTATGACAAATATATTTTACTTCTTGACTTCAACAGTCTTTACCCTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGCTTTACAACTGTTGAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTACCAACCTGCAACTTATCTGGAG
TTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAGTTATGGCTAAAAAACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGCAGAGCTCATCACC
TCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCAAAACCACCTAAATCTTGAGGTCATTTATGGAGATACAGATTCGATCATGATCCATACTGGTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAGATCTAGATGGGAT
ATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAGTTAAGGTGCAGTTTAACAAGGATGGGACCATCTATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTTGATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGTGAAGATGTTGTGG
AAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGAAATGCGAAATGGTCAAGTGGAGCTTGAGAAGTATGTCATTACCAAATCATTGACTAAACCTCCAGAAGAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACATGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGTTGGTGATACAGTC
CCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGGATCTGGAGTGGGATCAACAACAGGCATTGCTGAAAGGGCAAGACATCCAGATGAGTTGAAAAGGGACAGTGGAAACTGGATGGTTGACATTGATTATTATCTATCTCAGCAGATTCATCCTGTTGTATCAAGATTATGTGCACCTATCCAAGGCACAAGCCCAGGACGTCTTGC
AGATTGTCTTGGACTGGATTCGTCAAGGTTTGAACAAAAAATGAGTTTTGAAGCTGTTGCTAAAGAGCCAGCTACTGCATTTCTGTCGAGTATTGATGATAATGAAAGATACCAATACTGCGAGCCATTCTGGATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAGTGTGGCAAGCATGATTGAAAGTTCTG
AAAACCATACAACAAACTCAGGAGATCATGAAGAAGATGAAACATTACGGAAGACATCAAGGGATGCAACTGAGAAGTTTTGGTGCTCACTCAGTTGTCCGAAATGTCAAGATGAGGGTGTTGAAAGTTTAATTTCTCCTGCCATATTGGCTAATCAGGTGAAAAGGCAGGCAGAAAAATTCATTGCACTATACTATACA
GGGTTAATGATTTGTGATGACGAACTATGCAAGCTCCAAACTAGGAACTTGAACTTGCGGATTATCGGTGATACTGGAAGGGGAACAGTTTGTCCAAATTATCCTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAGgtaatgattggttaaattctcatggtatgtgtattttgcaaataaatgattggttaaattctcatcgt
atgtgttctttgcaaataagttcttcggattgaactaaataactgaattgttcatttgtgagagcagTACACTGAGGTAGACCTATACAAGCAGCTTACATACTTCTGCCGCATACTTGACATTCCGCGTGTAATTCAAAAGTTGGAGTATAATGCAAGGGTGCCTGTAGAGAAACGCCTTGCCAAAATACGACCCGCAA
TTGATGCTGCAGCTATGACAGTCCGCAAAATAAGAGATCGTTGTGCATATGGATGGGTGAAACTAAGTGACCTTGTAGTCAGTGTCTAACTCGTTGAAATCCATCCTATCGTTTGTCCTTACAAGGGCATGCACATGTTATTATCATTAAGTATTTCATGTGCATATGGGTCTCACTACACTCGGCATTTAGCTGATAGA
TTTTTAGAGGTACCCCTCCATGCTGATGAGTGGATCTTTTCCTTTATGCCCTTAAAGTGAATGAATATTGAAGAAATTAGTTACTGTCACCGGAGCTTCAATGCTAAAATTCTGCTTGTTGCTGTGTTGTATTATAGTGATTTGTATACACAGGTCAATGTAATTGAAATTTTGACCATATAAGCCTTGGATGGCAAAGG
TGGTTGGTGATACATGTCTATTATTATTCCTTATCCTGTGGATGTCTAATAATTCTTAAAATAAATATAGTTCAATATATGACTCAATTGATGGACACTGCTTGCTTGTAAGTGGGTGATTAGAGGATTTCGACATAGGATATTATTTTGAAATCAGTCCTATTATCAATGGTGG



Intron 9 GTATGGTTCT ... TATTTTTCAG

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>TRINITY_DN44552_c0_g1_i13 from sample A9 / Example spliced isoform
GCAAAATTGGGGACGGGAGGAATCAATAGCATCAGGCAGAGGAATGGTGGAGCCGCGACGCTGGGATTTGAGAACTCCACTCGGGATGAGATAGGTAAAATTTAGAAACTCATATGATAGCTGTTGTGCGGTGGTACAAAACATGCAACGGAGATGGAATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAATGGATCT
GAATGTGACTAATTTCAGTATGGTACCAGTCAAGCGTAACTATGCATTTGAGCGGTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGAGCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAATTAAAA
GAAGAATACGAGGCCCAACATGGCTTTCAATTTCCAATGCTGTCTGCTGCCCAAGTTCATCTCGAATAAGCTGGTGCAAGTTTGAAGCTATTGTAGGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAATGACAAA
CACAATGTGAATGAAATTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGTTGTCACAAAACAAAGATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGGCATATTTCCGATGGGATTCACAAAGGAGGTTGCCAACAGAAATACTAAAGCTGGGTCTAATAT
CTTGAACTATGAGAGCAGTGAAAGAGCTTTGCTGAATCGCCTGATGATCAAACTTCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTGGCCACAATATTTCAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTTGCAAGGTGCCCAGCAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCTGTGATGCCTAAGC
TTAGCAAAGGAACTGGTAACTTTGGGACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCATGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCCCGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGACACAGCTCGCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTAC
AAAACATCGGCATCTCTAATGGAACTGGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTGGTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAAAACCCTACAGGGGGCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATGAGTTCCATGGTAG
AAAGTATATTTTACCAGACAAGATGTCAGCTCGAGAGAAAGAACTTAAAGCATCAAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCTGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGCTCCCAACACATGGCAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTGGTGCTGGAACCAA
AGAAAGGACTCTATGACAAATATATTTTACTTCTTGACTTCAACAGTCTTTACCCTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGCTTTACAACTGTTGAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTACCAACCTGCAACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAG
TTATGGCTAAAAAACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGCAGAGCTCATCACCTCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCAAAACCA
CCTAAATCTTGAGGTCATTTATGGAGATACAGATTCGATCATGATCCATACTGGTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAGATCTAGATGGGATATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAGTTAAGG
TGCAGTTTAACAAGGATGGGACCATCTATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTTGATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGTGAAGATGTTGTGGAAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGAAATGCGAAATGGT
CAAGTGGAGCTTGAGAAGTATGTCATTACCAAATCATTGACTAAACCTCCAGAAGAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACATGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGTTGGTGATACAGTCCCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGGATCTGGAGTGGGATCAACAACAGG
CATTGCTGAAAGGGCAAGACATCCAGATGAGTTGAAAAGGGACAGTGGAAACTGGATGGTTGACATTGATTATTATCTATCTCAGCAGATTCATCCTGTTGTATCAAGATTATGTGCACCTATCCAAGGCACAAGCCCAGGACGTCTTGCAGATTGTCTTGGACTGGATTCGTCAAGGTTTGAACAAAAAATGAGTTTTG
AAGCTGTTGCTAAAGAGCCAGCTACTGCATTTCTGTCGAGTATTGATGATAATGAAAGATACCAATACTGCGAGCCATTCTGGATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAGTGTGGCAAGCATGATTGAAAGTTCTGAAAACCATACAACAAACTCAGGAGATCATGAAGAAGATGAAACATTACGG
AAGACATCAAGGGATGCAACTGAGAAGTTTTGGTGCTCACTCAGTTGTCCGAAATGTCAAGATGAGGGTGTTGAAAGTTTAATTTCTCCTGCCATATTGGCTAATCAGGTGAAAAGGCAGGCAGAAAAATTCATTGCACTATACTATACAGGGTTAATGATTTGTGATGACGAACTATGCAAGCTCCAAACTAGGAACTT
GAACTTGCGGATTATCGGTGATACTGGAAGGGGAACAGTTTGTCCAAATTATCCTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAGTACACTGAGGTAGACCTATACAAGCAGCTTACATACTTCTGCCGCATACTTGACATTCCGCGTGTAATTCAAAAGTTGGAGTATAATGCAAGGGTGCCTGTAGAGAAACGCCTTGCCA
AAATACGACCCGCAATTGATGCTGCAGCTATGACAGTCCGCAAAATAAGAGATCGTTGTGCATATGGATGGGTGAAACTAAGTGACCTTGTAGTCAGTGTCTAACTCGTTGAAATCCATCCTATCGTTTGTCCTTACAAGGGCATGCACATGTTATTATCATTAAGTATTTCATGTGCATATGGGTCTCACTACACTCGG
CATTTAGCTGATAGATTTTTAGAGGTACCCCTCCATGCTGATGAGTGGATCTTTTCCTTTATGCCCTTAAAGTGAATGAATATTGAAGAAATTAGTTACTGTCACCGGAGCTTCAATGCTAAAATTCTGCTTGTTGCTGTGTTGTATTATAGTGATTTGTATACACAGGTCAATGTAATTGAAATTTTGACCATATAAGC
CTTGGATGGCAAAGGTGGTTGGTGATACATGTCTATTATTATTCCTTATCCTGTGGATGTCTAATAATTCTTAAAATAAATATAGTTCAATATATGACTCAATTGATGGACACTGCTTGCTTGTAAGTGGGTGATTAGAGGATTTCGACATAGGATATTATTTTGAAATCAGTCCTATTATCAATGGTGGAAAAAATTTA
ATTTGATTTTGGTG


>TRINITY_DN44552_c0_g1_i11 from sample A9 / Example unspliced isoform:
ATTACACCGCAAAGAAAAAAAAACCAAAACTCAACCTTCGCCTTCTATTCTCCGGTCACTACTCTACGCACAGAGAAGCAAAAATGGAGACGGGAGGAATCAGCAGCAGTAGGCGGAGGAATGGCGGAGCCGCGGCGGCGGGCTCTGAGAACTCCACTCGGTCCGCCGCCCTGCAGCAGCTCAAGAACCTCCGTCAACAG
GGCGGGCGCCGAGTCGACACCTTCGAGATAAAAGTAGATGAAAAAATATATGATTCTGTGGCAGAAGATGACTACGCCAAGCTCGTCGCAAAGCGTCGCGCGGCCGTCAAGGATTTCGTGGTGGACGATGCTGGCCTCGGCTACAATGACGACGGCGAGGAAGATGATTGGGAGGTCGGTGATCGCCCTTACTCTTCATC
AGAAGAGGCAGAAGCAGATGGCGGATCTGCGAGAAGAAAGAAATCGGCGAAGGATTCATCGGAAAATCGGAAGAGGGACGGGGGAAATCCATCAAAGAAAGCGTCGGCTCTGTCAGCCGCAGCGGCATTGATGGGGAAGCAGAAAGTTTCGTCGATGTTTGCCTCAGCGTCAATGTTCCGGAAGAATAAAGAGGACAAGA
GCGGGCAAATAAAGGGGTTTTCGACGGACAGTATTCTCGAAGATGTTCTTGCAGAGATTACTCCTGATGCAGCCGATAGGGAAAAGCGAAGGAGGCGAACAGGCTTAAAAAATGCAGCAGCTGTAGGGAATGCTTTTGCTAATAGTATTAAGAGTTCTCCCCGAGATTTTTCTTCAAGCCTGCCAGAATATCAAGTTAGT
GAAGTCTCCTGGGAACCGTGTATTAATTTGGAAAGCAGGCAGAAACTTCCCACTGTTGAAACCGTACATGAATCTGCACCGTCTGAAACAACAGAATCCCAAAATTCTAAGTCAGCAATGGAGGATCAGTGTGCTTCGGTTCAATCTCCAATTAATCTCGCTGAAGATCCAAGCTGCAAGGAGGATGACTTAAAGCCCAA
GGTTATGCTATCTGACAATGGCGAGGCAATTTCAGCTGATGGCGAGTTGAAAGCAAAAGCTGGGAAGGATGATAATGATAAATGTGTATTGAATGCTCTAATTGGCCGAGAAAATTCATCTGCCAAAGCAACTGCCGACTGGCAAGCAGTGTGGCAGGGTGGAGATGAAAAAGTGGCAAAAATTGAAGAGACTGATGACC
GTTTAACTTCTGAAGATGTGAATGATCTACCATTGGAGTCAGATGGAGCTTTACTTTTTTAGCTTATTGATGCATATGAGGAAGCTTATGGAGCTCATCCTGGTACAATATATCTATTTGGCAAGGTAAAATTCAGAAACTCATATGCTAGCTGTTGTGCGGTGGTACAAAACATGCAACGGTGTGTTTTTGCTGTACCA
ACTCCTTCAGTCTTCCCAGATAAAGTGATTGCAGAGCTTGAGCAAGGTGCAAAAGATGGTGTAGTTGAACAATCTACATTGCGGAAAAAGTTGCAGGAGATGGCATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAATGGATCTGAATGTGACTAATTTCAGTATGGTACCAGTCAAGCGTAACTATGCATTTGAGCG
GTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGAGCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAATTAAAAGAAGAATACGAGGCCCAACATGGCTTTCAATTTCCAATGCTGTCTGCTGCCCAA
GTTCATCTCGAATAAGCTGGTGCAAGTTTGAAGCTATTGTAGGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAATGACAAACACAATGTGAATGAAATTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGTTGTCACAAAACAAAG
ATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGGCATATTTCCGATGGGATTCACAAAGGAGGTTGCCAACAGAAATACTAAAGCTGGGTCTAATATCTTGAACTATGAGAGCAGTGAAAGAGCTTTGCTGAATCGCCTGATGATCAAACT
TCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTGGCCACAATATTTCAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTTGCAAGGTGCCCAGCAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCTGTGATGCCTAAGCTTAGCAAAGGAACTGGTAACTTTGGGACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCAT
GTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCCCGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGACACAGCTCGCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTACAAAACATCGGCATCTCTAATGGAACTGGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTGG
TTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAAAACCCTACAGGGGGCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATGAGTTCCATGGTAGAAAGTATATTTTACCAGACAAGATGTCAGCTCGAGAGAAAGAACTTAAAGCATC
AAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCTGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGCTCCCAACACATGGCAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTGGTGCTGGAACCAAAGAAAGGACTCTATGACAAATATATTTTACTTCTTGACTTCAACAGTCTTTACC
CTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGCTTTACAACTGTTGAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTACCAACCTGCAACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAGTTATGGCTAAAAAACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAA
CAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGCAGAGCTCATCACCTCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCAAAACCACCTAAATCTTGAGGTCATTTATGGAGATACAGATTCGATCATGATCCATACTGG
TATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAGATCTAGATGGGATATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAGTTAAGGTGCAGTTTAACAAGGATGGGACCATCTATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTTG
ATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGTGAAGATGTTGTGGAAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGAAATGCGAAATGGTCAAGTGGAGCTTGAGAAGTATGTCATTACCAAATCATTGACTAAACCTCCAGAA
GAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACATGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGTTGGTGATACAGTCCCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGGATCTGGAGTGGGATCAACAACAGGCATTGCTGAAAGGGCAAGACATCCAGATGAGTTGAAAAGGGACAGTGGAAACTG
GATGGTTGACATTGATTATTATCTATCTCAGCAGATTCATCCTGTTGTATCAAGATTATGTGCACCTATCCAAGGCACAAGCCCAGGACGTCTTGCAGATTGTCTTGGACTGGATTCGTCAAGGTTTGAACAAAAAATGAGTTTTGAAGCTGTTGCTAAAGAGCCAGCTACTGCATTTCTGTCGAGTATTGATGATAATG
AAAGATACCAATACTGCGAGCCATTCTGGATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAGTGTGGCAAGCATGATTGAAAGTTCTGAAAACCATACAACAAACTCAGGAGATCATGAAGAAGATGAAACATTACGGAAGACATCAAGGGATGCAACTGAGAAGTTTTGGTGCTCACTCAGTTGTCCGAAA
TGTCAAGATGAGGGTGTTGAAAGTTTAATTTCTCCTGCCATATTGGCTAATCAGGTGAAAAGGCAGGCAGAAAAATTCATTGCACTATACTATACAGGGTTAATGATTgtatggttctttcccaatctcatttagactcctttcattaactataacattataagattacaaggacgaatttttttatgatgaactgaatt
ttcttggttgattctgttctaatcttgtatttttcagTGTGATGACGAACTATGCAAGCTCCAAACTAGGAACTTGAACTTGCGGATTATCGGTGATACTGGAAGGGGAACAGTTTGTCCAAATTATCCTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAGTACACTGAGGTAGACCTATACAAGCAGCTTACATACTTCTGCC
GCATACTTGACATTCCGCGTGTAATTCAAAAGTTGGAGTATAATGCAAGGGTGCCTGTAGAGAAACGCCTTGCCAAAATACGACCCGCAATTGATGCTGCAGCTATGACAGTCCGCAAAATAAGAGATCGTTGTGCATATGGATGGGTGAAACTAAGTGACCTTGTAGTCAGTGTCTAACTCGTTGAAATCCATCCTATC
GTTTGTCCTTACAAGGGCATGCACATGTTATTATCATTAAGTATTTCATGTGCATATGGGTCTCACTACACTCGGCATTTAGCTGATAGATTTTTAGAGGTACCCCTCCATGCTGATGAGTGGATCTTTTCCTTTATGCCCTTAAAGTGAATGAATATTGAAGAAATTAGTTACTGTCACCGGAGCTTCAATGCTAAAAT
TCTGCTTGTTGCTGTGTTGTATTATAGTGATTTGTATACACAGGTCAATGTAATTGAAATTTTGACCATATAAGCCTTGGATGGCAAAGGTGGTTGGTGATACATGTCTATTATTATTCCTTATCCTGTGGATGTCTAATAATTCTTAAAATAAATATAGTTCAATATATGACTCAATTGATGGACACTGCTTGCTTGTA
AGTGGGTGATTAGAGGATTTCGACATAGGATATTATTTTGAAATCAGTCCTATTATCAATGGTGGAAAAAATTTAATTTGATTTTGGTG



Intron 10 GTCCTTCAGA ... GACATCACAG

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>TRINITY_DN114618_c0_g2_i3 from sample A2 / Example spliced isoform
TATTACACCGCAAAGAAAAAAAAACCAAAACTCAACCTTCGCCTTCTATTCTCCGGTCACTACTCTACGCACAGAGAAGCAAAAATGGAGACGGGAGGAATCAGCAGCAGTAGGCGGAGGAATGGCGGAGCCGCGGCGGCGGGCTCTGAGAACTCCACTCGGTCCGCCGCCCTGCAGCAGCTCAAGAACCTCCGTCAACA
GGGCGGGCGCCGAGTCGACACCTTCGAGATAAAAGTAGATGAAAAAATATATGATTCTGTGGCAGAAGATGACTACGCCAAGCTCGTCGCAAAGCGTCGCGCGGCCGTCAAGGATTTCGTGGTGGACGATGCTGGCCTCGGCTACAATGACGACGGCGAGGAAGATGATTGGGAGGTCGGTGATCGCCCTTACTCTTCAT
CAGAAGAGGCAGAAGCAGATGGCGGATCTGCGAGAAGAAAGAAATCGGCGAAGGATTCATCGGAAAATCGGAAGAGGGACGGGGGAAATCCATCAAAGAAAGCGTCGGCTCTGTCAGCCGCAGCGGCATTGATGGGGAAGCAGAAAGTTTCGTCGATGTTTGCCTCAGCGTCAATGTTCCGGAAGAATAAAGAGGACAAG
AGCGGGCAAATAAAGGGGTTTTCGACGGACAGTATTCTCGAAGATGTTCTTGCAGAGATTACTCCTGATGCAGCCGATAGGGAAAAGCGAAGGAGGCGAACAGGCTTAAAAAATGCAGCAGCTGTAGGGAATGCTTTTGCTAATAGTATTAAGAGTTCTCCCCGAGATTTTTCTTCAAGCCTGCCAGAATATCAAGTTAG
TGAAGTCTCCTGGGAACCGTGTATTAATTTGGAAAGCAGGCAGAAACTTCCCACTGTTGAAACCGTACATGAATCTGCACCGTCTGAAACAACAGAATCCCAAAATTCTAAGTCAGCAATGGAGGATCAGTGTGCTTCGGTTCAATCTCCAATTAATCTCGCTGAAGATCCAAGCTGCAAGGAGGATGACTTAAAGCCCA
AGGTTATGCTATCTGACAATGGCGAGGCAATTTCAGCTGATGGCGAGTTGAAAGCAAAAGCTGGGAAGGATGATAATGATAAATGTGTATTGAATGCTCTAATTGGCCGAGAAAATTCATCTGCCAAAGCAACTGCCGACTGGCAAGCAGTGTGGCAGGGTGGAGATGAAAAAGTGGCAAAAATTGAAGAGACTGATGAC
CGTTTAACTTCTGAAGATGTGAATGATCTACCATTGGAGTCAGATGGAGCTTTACTTTTTTACCTTATTGATGCATATGAGGAAGCTTATGGAGCTCATCCTGGTACAATATATCTATTTGGCAAGGTAAAATTCAGAAACTCATATGCTAGCTGTTGTGTGGTGGTACAAAACATGCAACGGTGTGTTTTTGCTGTACC
AACTCCTTCAGTCTTCCCAGATAAAGTGATTGCAGAGCTTGAGCAAGGTGCAAAAGATGGTGTAGTTGAACAATCTACATTGCGGAAAAAGTTGCAGGAGATGGCATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAATGGATCTGAATGTGACTAATTTCAGTATGGTACCAGTCAAGCGTAACTATGCATTTGAGC
GGTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGAGCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAATTAAAAGAAGAATACGAGGCCCAACATGGCTTTCAATTTCCAATGCTGTCTGCTGCCCA
AGTTCATCTCGAATAAGCTGGTGCAAGTTTGAAGCTATTGTAGGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAATGACAAACACAATGTGAATGAAATTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGTTGTCACAAAACAAA
GATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGGCATATTTCCGATGGGATTCACAAAGGAGGTTGCCAACAGAAATACTAAAGCTGGGTCTAATATCTTGAACTATGAGAGCAGTGAAAGAGCTTTGCTGAATCGCCTGATGATCAAAC
TTCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTGGCCACAATATTTCAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTTGCAAGGTGCCCAGCAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCTGTGATGCCTAAGCTTAGCAAAGGAACTGGTAACTTTGGGACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCA
TGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCCCGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGACACAGCTCGCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTACAAAACATCGGCATCTCTAATGGAACTGGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTG
GTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAAAACCCTACAGGGGGCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATGAGTTCCATGGTAGAAAGTATATTTTACCAGACAAGATGTCAGCTCGAGAGAAAGAACTTAAAGCAT
CAAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCTGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGCTCCCAACACATGGCAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTGGTGCTGGAACCAAAGAAAGGACTCTATGACAAATATATTTTACTTCTTGACTTCAACAGTCTTTAC
CCTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGCTTTACAACTGTTGAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTACCAACCTGCAACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAGTTATGGCTAAAAAACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCA
ACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGCAGAGCTCATCACCTCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCAAAACCACCTAAATCTTGAGGTCATTTATGGAGATACAGATTCGATCATGATCCATACTG
GTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAGATCTAGATGGGATATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAGTTAAGGTGCAGTTTAACAAGGATGGGACCATCTATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTT
GATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGTGAAGATGTTGTGGAAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGAAATGCGAAATGGTCAAGTGGAGCTTGAGAAGTATGTCATTACCAAATCATTGACTAAACCTCCAGA
AGAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACATGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGTTGGTGATACAGTCCCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGGATCTGGAGTGGGATCAACAACAGGCATTGCTGAAAGGGCAAGACATCCAGATGAGTTGAAAAGGGACAGTGGAAACT
GGATGGTTGACATTGATTATTATCTATCTCAGCAGATTCATCCTGTTGTATCAAGATTATGTGCACCTATCCAAGGCACAAGCCCAGGACGTCTTGCAGATTGTCTTGGACTGGATTCGTCAAGGTTTGAACAAAAAATGAGTTTTGAAGCTGTTGCTAAAGAGCCAGCTACTGCATTTCTGTCGAGTATTGATGATAAT
GAAAGATACCAATACTGCGAGCCATTCTGGATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAGTGTGGCAAGCATGATTGAAAGTTCTGAAAACCATACAACAAACTCAGGAGATCATGAAGAAGATGAAACATTACGGAAGACATCAAGGGATGCAACTGAGAAGTTTTGGTGCTCACTCAGTTGTCCGAA
ATGTCAAGATGAGGGTGTTGAAAGTTTAATTTCTCCTGCCATATTGGCTAATCAGGTGAAAAGGCAGGCAGAAAAATTCATTGCACTATACTATACAGGGTTAATGATTTGTGATGACGAACTATGCAAGCTCCAAACTAGGAACTTGAACTTGCGGATTATCGGTGATACTGGAAGGGGAACAGTTTGTCCAAATTATC
CTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAGTACACTGAGGTAGACCTATACAAGCAGCTTACATACTTCTGCCGCATACTTGACATTCCGCGTGTAATTCAAAAGTTGGAGTATAATGCAAGGGTGCCTGTAGAGAAACGCCTTGCCAAAATACGACCCGCAATTGATGCTGCAGCTATGACAGTCCGCAAAATAAGAGAT
CGTTGTGCATATGGATGGGTGAAACTAAGTGACCTTGTAGTCAGTGTCTAACTCGTTGAAATCCATCCTATCGTTTGTCCTTACAAGGGCATGCACATGTTATTATCATTAAGTATTTCATGTGCATATGGGTCTCACTACACTCGGCATTTAGCTGATAGATTTTTAGAGGTACCCCTCCATGCTGATGAGTGGATCTT
TTCCTTTATGCCCTTAAAGTGAATGAATATTGAAGAAATTAGTTACTGTCACCGGAGCTTCAATGCTAAAATTCTGCTTGTTGCTGTGTTGTATTATAGTGATTTGTATACACAGGTCAATGTAATTGAAATTTTGACCATATAAGCCTTGGATGGCAAAGGTGGTTGGTGATACATGTCTATTATTATTCCTTATCCTG
TGGATGTCTAATAATTCTTAAAATAAATATAGTTCAATATATGACTCAATTGATGGACACTGCTTGCTTGTAAGTGGGTGATTAGAGGATTTCGACATAGGATATTATTTTGAAATCAGTCCTATTATCAATGGTGGAAAAAATTTAATTTGATTTTGG


>TRINITY_DN114618_c0_g2_i12 from sample A2 / Example unspliced isoform:
TACATTGCGGAAAAAGTTGCAGgtccttcagaatcttttatgtacctactattaatattctagaaatgccattaatattttcttgattagattatgatttccaataatatactgactaagcagggtcactgtttttactgtttattgacatcacagGAGATGGCATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAAT
GGATCTGAATGTGACTAATTTCAGTATGGTACCAGTCAAGCGTAACTATGCATTTGAGCGGTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGAGCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAA
TTAAAAGAAGAATACGAGGCCCAACATGGCTTTCAATTTCCAATGCTGTCTGCTGCCCAAGTTCATCTCGAATAAGCTGGTGCAAGTTTGAAGCTATTGTAGGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAAT
GACAAACACAATGTGAATGAAATTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGTTGTCACAAAACAAAGATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGGCATATTTCCGATGGGATTCACAAAGGAGGTTGCCAACAGAAATACTAAAGCTGGGTC
TAATATCTTGAACTATGAGAGCAGTGAAAGAGCTTTGCTGAATCGCCTGATGATCAAACTTCACCAGCTAGATCCCGATGTGCTGGTTGGCCACAATATTTCAGGGTTTGACCTTGATGTTGTTCTGCACAGAGCACAGGCTTGCAAGGTGCCCAGCAACATGTGGTCCAAAACTGGCCGGCTGAAGCGCTCTGTGATGC
CTAAGCTTAGCAAAGGAACTGGTAACTTTGGGACTGGAGCAAGCCCAGGAGTAATGTCATGTATTGCAGGTCGGCTACTATGTGATACCTATTTGTCTTCCCGTGAGCTCTTGAAAGAGGTGAGCTATTCTTTGACACAGCTCGCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACA
ATGTACAAAACATCGGCATCTCTAATGGAACTGGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTGGTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAAAACCCTACAGGGGGCCAGGGCCCAAAGAGTTGAGTACCTCCTATTGCATGAGTTCCA
TGGTAGAAAGTATATTTTACCAGACAAGATGTCAGCTCGAGAGAAAGAACTTAAAGCATCAAAAAGAAAATACACTTCAGAAAGTGGGGCTGGGGAAGTTGAGGAACTAGTTACAGATGGTATTGTTGAGGATCAGGCTGAGCTCCCAACACATGGCAAGTACAAGAAAGGTCCAGCTTATTCAGGGGGTTTGGTGCTGG
AACCAAAGAAAGGACTCTATGACAAATATATTTTACTTCTTGACTTCAACAGTCTTTACCCTTCCATTATACAGGAATATAATGTTTGCTTTACAACTGTTGAGCGTCCTTCTGATGGCTCTATACCTAATTTACCAACCTGCAACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAA
GTGAAGTTATGGCTAAAAAACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGCAGAGCTCATCACCTCACAGGGACGGGAGATCTTACAGAGTACTGTAGACCTTGTTCA
AAACCACCTAAATCTTGAGGTCATTTATGGAGATACAGATTCGATCATGATCCATACTGGTATGGATGATGTAACAGATTCCAAAATGGTAGCAGTCAAGGTCATCAAAGAGGTTAACAAGAAGTATAAATGCTTGGAAATAGATCTAGATGGGATATATAAGCGCATGCTTCTGCTCAAGAAAAAGAAATATGCAGCAG
TTAAGGTGCAGTTTAACAAGGATGGGACCATCTATGAGGTCATTGAACAAAAAGGACTTGATATAGTTCGTCGTGACTGGAGCTTATTATCAAAAGAAATAGGCAACTTTTGTTTGGAACAGATATTGTCTGGAGGGTCATGTGAAGATGTTGTGGAAGCTATTCATAGCAAACTGCAGAAGGTGCAAGAGGAAATGCGA
AATGGTCAAGTGGAGCTTGAGAAGTATGTCATTACCAAATCATTGACTAAACCTCCAGAAGAATATTCGGATTCCAAAAACCAGCCACATGTCCAGGTGGCATTAAGAATGAAGCAGAGTGGCCATCATATTGGTTGCTCTGTTGGTGATACAGTCCCTTATATAATTTGTTTTGAGCAGGGATCTGGAGTGGGATCAAC
AACAGGCATTGCTGAAAGGGCAAGACATCCAGATGAGTTGAAAAGGGACAGTGGAAACTGGATGGTTGACATTGATTATTATCTATCTCAGCAGATTCATCCTGTTGTATCAAGATTATGTGCACCTATCCAAGGCACAAGCCCAGGACGTCTTGCAGATTGTCTTGGACTGGATTCGTCAAGGTTTGAACAAAAAATGA
GTTTTGAAGCTGTTGCTAAAGAGCCAGCTACTGCATTTCTGTCGAGTATTGATGATAATGAAAGATACCAATACTGCGAGCCATTCTGGATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAGTGTGGCAAGCATGATTGAAAGTTCTGAAAACCATACAACAAACTCAGGAGATCATGAAGAAGATGAAACA
TTACGGAAGACATCAAGGGATGCAACTGAGAAGTTTTGGTGCTCACTCAGTTGTCCGAAATGTCAAGATGAGGGTGTTGAAAGTTTAATTTCTCCTGCCATATTGGCTAATCAGGTGAAAAGGCAGGCAGAAAAATTCATTGCACTATACTATACAGGGTTAATGATTTGTGATGACGAACTATGCAAGCTCCAAACTAG
GAACTTGAACTTGCGGATTATCGGTGATACTGGAAGGGGAACAGTTTGTCCAAATTATCCTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAGTACACTGAGGTAGACCTATACAAGCAGCTTACATACTTCTGCCGCATACTTGACATTCCGCGTGTAATTCAAAAGTTGGAGTATAATGCAAGGGTGCCTGTAGAGAAACGCC
TTGCCAAAATACGACCCGCAATTGATGCTGCAGCTATGACAGTCCGCAAAATAAGAGATCGTTGTGCATATGGATGGGTGAAACTAAGTGACCTTGTAGTCAGTGTCTAACTCGTTGAAATCCATCCTATCGTTTGTCCTTACAAGGGCATGCACATGTTATTATCATTAAGTATTTCATGTGCATATGGGTCTCACTAC
ACTCGGCATTTAGCTGATAGATTTTTAGAGGTACCCCTCCATGCTGATGAGTGGATCTTTTCCTTTATGCCCTTAAAGTGAATGAATATTGAAGAAATTAGTTACTGTCACCGGAGCTTCAATGCTAAAATTCTGCTTGTTGCTGTGTTGTATTATAGTGATTTGTATACACAGGTCAATGTAATTGAAATTTTGACCAT
ATAAGCCTTGGATGGCAAAGGTGGTTGGTGATACATGTCTATTATTATTCCTTATCCTGTGGATGTCTAATAATTCTTAAAATAAATATAGTTCAATATATGACTCAATTGATGGACACTGCTTGCTTGTAAGTGGGTGATTAGAGGATTTCGACATAGGATATTATTTTGAAATCAGTCCTATTATCAATGGTGGAAAA
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GATGATTGGGAGGTCGGTGATCGCCCTTACTCTTCATCAGAAGAGGCAGAAGCAGATGGCGGATCTGCGAGAAGAAAGAAATCGGCGAAGGATTCATCGGAAAATCGGAAGAGGGACGGGGGAAATCCATCAAAGAAAGCGTCGGCTCTGTCAGCCGCAGCGGCATTGATGGGGAAGCAGAAAGTTTCGTCGATGTTTGC
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TGGTACAAAACATGCAACGGTGTGTTTTTGCTGTACCAACTCCTTCAGTCTTCCCAGATAAAGTGATTGCAGAGCTTGAGCAAGGTGCAAAAGATGGTGTAGTTGAACAATCTACATTGCGGAAAAAGTTGCAGGAGATGGCATCAGGCCTAAAGCAAGAACTCTCACAAAAATTAATGGATCTGAATGTGACTAATTTC
AGTATGGTACCAGTCAAGCGTAACTATGCATTTGAGCGGTCTGATGTACCAACTGGAGAACGTCATGTCTTGAAATTGAGCTATCCTTTTAAGGACCCACCTCTTCCAACTGATTTGAAAGGAAATCATTTCTCTGTTCTGTTTGGTACCCATTCCAGTGCGCTAGAATTATTTCTAATTAAAAGAAGAATACGAGGCCC
AACATGGCTTTCAATTTCCAATGCTGTCTGCTGCCCAAGTTCATCTCGAATAAGCTGGTGCAAGTTTGAAGCTATTGTAGGGTCTCCAAAGGAGTTAAAAGTGGCAGGGTCTGTGAATATTCCTCAAGAGATTCCTCCGCTAGTAGTTGCTGCCATCAATCTTAAAACCATAATTAATGACAAACACAATGTGAATGAAA
TTGCATCTGTGTCTGTTGTCTGTTGTCACAAAACAAAGGTATGCATGTTTTGTATATAGCTATTTATTTGGTTCTTAATGTCTATTGTTTAAACCTGTTTGATCTTCTTTTGGGATGATATTCTCAGGGTTAAGGCTTTAGCATAAAGGTTGCTCAGTTCTCACTTTTTGTCTGTGATTGTATGCCATTGAAAAGGGGCA
GAATTCTACCAGCTCAGTATTTCTTATAACTATATCTTTGTGTAATGTAGAATTTATTTTTCAAAGGTGAAACAAGTCTATCTTATTAGATTAGATGTCCTTTATTCCTCCATGCAGATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGG
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GCAAAGAATCAACTGGGTAGAGACAGAAGAGAGATTGCTCCGGTTGATATACCTACAATGTACAAAACATCGGCATCTCTAATGGAACTGGTTGAGTGTGCAGAAACAGATGCTTGGTTATCGCTGGGGCTGATGTTTCACTTGAGCGTGCTCCCATTGACACGCCAACTTACTAATATCAGTGGAAATCTTTGGAGTAA
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AACTTATCTGGAGTTCTTCCACAGTTGTTGAAAAATTTAGTTGGAAGGAGGAGACAAGTGAAGTTATGGCTAAAAAACACGTCAGATCCTCTAAAATACCAACAACTAGATATTCAACAGCAAGCATTGAAACTCACTGCTAACAGTATGTATGGCTGCTTGGGATTTGCAAACTCAAGATTTTATGCAAAGCCTCTTGC
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CAGGACGTCTTGCAGATTGTCTTGGACTGGATTCGTCAAGGTTTGAACAAAAAATGAGTTTTGAAGCTGTTGCTAAAGAGCCAGCTACTGCATTTCTGTCGAGTATTGATGATAATGAAAGATACCAATACTGCGAGCCATTCTGGATAGTATGCCCGCATTGCAGTTCAAGTTTTGCATGTCCTAGTGTGGCAAGCATG
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ACTATACTATACAGGGTTAATGATTTGTGATGACGAACTATGCAAGCTCCAAACTAGGAACTTGAACTTGCGGATTATCGGTGATACTGGAAGGGGAACAGTTTGTCCAAATTATCCTCGCTGCAATGGACATCTTGTCCAACAGTACACTGAGGTAGACCTATACAAGCAGCTTACATACTTCTGCCGCATACTTGACA
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>TRINITY_DN126123_c0_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:
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GATGATTGGGAGGTCGGTGATCGCCCTTACTCTTCATCAGAAGAGGCAGAAGCAGATGGCGGATCTGCGAGAAGAAAGAAATCGGCGAAGGATTCATCGGAAAATCGGAAGAGGGACGGGGGAAATCCATCAAAGAAAGCGTCGGCTCTGTCAGCCGCAGCGGCATTGATGGGGAAGCAGAAAGTTTCGTCGATGTTTGC
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ttatgtagtatacttaaaggaagtaaatgtatttaaatagccatatctaactgtgcttattctttggacagtttacaaactgcccttttccacttcattgctatggcttcattatcattgtcttttagctggtagcatttagtgagaatctgtgacatctgtcaagtcttaataggagatttggtattatgtgtcccatg
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GATGATTGGGAGGTCGGTGATCGCCCTTACTCTTCATCAGAAGAGGCAGAAGCAGATGGCGGATCTGCGAGAAGAAAGAAATCGGCGAAGGATTCATCGGAAAATCGGAAGAGGGACGGGGGAAATCCATCAAAGAAAGCGTCGGCTCTGTCAGCCGCAGCGGCATTGATGGGGAAGCAGAAAGTTTCGTCGATGTTTGC
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GAATTCTACCAGCTCAGTATTTCTTATAACTATATCTTTGTGTAATGTAGAATTTATTTTTCAAAGGTGAAACAAGTCTATCTTATTAGATTAGATGTCCTTTATTCCTCCATGCAGATTGACTATCCAATGCCAAAGTCTGAATGGAACAAGCCTGGCATGCTTGGTCACTTCTCTATTTTACGTAAACTTGATGGAGG
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>TRINITY_DN126123_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
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