sp|W0RYD3|SSG4_ORYSJ ----> Protein SUBSTANDARD STARCH GRAIN 4, chloroplastic
Intron 1 GCTTTAAATG ... TATGTGCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 62.17 | 56 | 86 | 98.1 |
| A2 | 63.71 | 47 | 82 | 83 |
| A3 | 58.03 | 62 | 87 | 84.4 |
| A4 | 51.36 | 63 | 52 | 81.1 |
| A5 | 67.8 | 19 | 32 | 48 |
| A6 | 60 | 5 | 5 | 10 |
| A7 | 53.57 | 13 | 9 | 21 |
| A8 | 75 | 1 | 4 | 2 |
| A9 | 56.36 | 12 | 15 | 16 |
| A10 | 70.37 | 8 | 24 | 14 |
>TRINITY_DN127869_c0_g1_i7 from sample A1 / Example spliced isoformAATTGAAAAAACTTGATAATATGACACTTTTCGCAGTTCACTTCTAGATATTTGTCCAGCTCTTCGATCCTGGATATTATCTCCAAATTTCGCGATTAGCCGCGCTGTAATTTCTCTCGAGAGTCAGGTGCTTCACGGACTTGAAATGGCGTGCCGATTAGAGCTCAACATCATCTTATTTGGTGCAGATTCGGACTCAT
TTTGGCGGCTTTTTTCGATTAAATGAATGACAACTTGTCATGAAGAAATTACAGAGGTAAGGAGCTAAATATTGAAATTTTCACGGAGAAATTTGATTTACAGTAATAAATATATATTTACAGAGAGAGAGAGAGCCCGAAATCCAATTTTCAGAAAGGTGCAGACGGTGAAACTTAAATTCCAGGGAACATTCGGGTTT
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ACAATGCCCTCCCGTGGTCAGAGTTCATGCCTAGGGCAGCCTGTTAATTTAGCTGATTTCAGAACTTGTAGCAGAAGAGCGAGGGGATTTGAGCAGTTAGATAATCAGTTTCTTGGGATTCCAATAAGGAAGTTTCAATCTCCGCTGAAACATATAGTTTTCGAACATAAGAGGCAAACATCAAACACGTTTATGGACCA
TGTAAGCAAAGTGAGGATCTTTCGCTGCGAGCGAAAATCCCCATTTTTACTGAACTATACGAAATTCAACGTGATAGGGAAATTTATGGGAAGAAAACTAAATTTGCAGAACAGATTACAATGCCATTGCCGCCGAGATAAAGACAGTATTAAGGCTCGTGTTTCTGAATGGAAGGCTCCCTTTTCTCAATGGAGGGAAG
GAATATTTTTTGTCCGTTGTTCTGCATTTGTCGCGACAATCGCCGTTCTTGGAATGTTGTTTTTCTATGGACAAGTCAGAGCCCAAGCGTATATTAATGAAAGAATATTACCTTCTGTGGCGACTGTCATGGGCGATTACCTTGGGAGGAAACTTAACCTTGGAAGGGTTCATAGGATTTCTCCTCTTGGGTTTGCATTG
GAATCCTGTTCCTTAGGTCCTCATTCTGAAGAGTTTTCTTGCGGGGAGCTTCCAAATGTTAAAGTTCGCATTCGGCCTTGGGCCAGCCTACAGCGGGGACAGGTAGTAGTTGATGCTGTTTTGTTACAACCGCATGTTTTGATTGCCCAGAAAGAGGACTGGTCATGGCTTGGTATCCCAACCCCCTTAGAAAAACCTGT
GGTGAAGCATAAATCGAATGAGGAGGGTATCGATCCTCGTACAAAAGCTAGGAGGCTTGCAAGAGAGCAAGCTGCTATTCGTTGGGCAGAAGAAAGGAATGAGGCAGCAAGGAAATGGGCACAAAAAGGCTATAACTTTGTTGGTGTTGAGGAGACAAGGTCCCCAGGAAAGGTTGACGCAGTGCACACAGAAGACATGG
TAAACTGTGATTACATGAATTGCTTCAAGGAAGAGATTACAATAGAAAGTTGTTTTGGAGGCAAACCAGGTAGACAAGAACACTTGCATCATAAATGTACAGAAGGTGTCTGTAGTAAGAGTGCGATGGAGAGGTCTGAGTTTGATAGGGCCTTTGAGCACAGTACTCTAAATAGGCCTTTTAGTTTGAGAAGTCCTGTT
CCAGTTGTAAGAACTTGGTTAAAGGAAAATATGGTGAAACCTATACGACACCGATTCAAGAGGTCAATCCAAAAGAGTGCACCTTTGTCTCAGAAAGCGACAATGCAGAGAAGAAACCTTGATCGCAGTGCTGCAGCAGCAAGGAAATACTTTGATGAAATGGACAAGAAGCAGAATTCTGGTGCAGACAAAGGAAAGGG
TTATATTGGAAATTCTGGAGCATTTGTAAATCCAGAGCTGGTCTCTTCCTTTATAAGTGTGAGAGAGGACAGTCAGAAGGGTGTGATGGAAGAGCAGGATAAAGATTGTAGTGAGCATATTGTCATGAATGTGGACAAATATAATTGCCCACCAACTATTCACAGAAATGAAGAACTTTCAGCTTGTCCCATTTCAATGG
ACAAAGGGGATCTATCAAAGTTTGTCAAGATGGATTGTAAGAATCATATAATCATGGGCATTGAGCATCCACCTTACGATTATGATATTGCTTCAAGGAGAATTCAGGATGTTCTACTGTTAGATAAAGTTAGTTTAGAACAGGAAACGATCTCAGAAGATCAGTCTTCACAGCACCTTTCAATGAATGGCACAGATAAT
GAAAAAGGTTCAGTCTATGAAGCTTTAGTTGAGGCTATTCACAATTCATGTGAAACAAATGAAAGCTGTAAATCTTCAAATCATCTTGGGAAACAAGGCGATAAATCGGTGTACATGAAAAGCAAGAGCAATGGAGCTTCTGCTCATACCTGTGATACTATGGGAGGTTCCTTGCAAAATATAGCTGAAGACCAAAGTAG
CAATCATTCAGGAGACATTGGTGCTGCAAGAATTGGGAAGCTTCCTGTTTTCCATGGGAGCATTGTGATGGCTTTTTCAGATACGTTTATCAAATCAATGGAGAGAATGAGTGGATACTTAAGAAGAAAGTTTAAGCAACTTGCTAATGAATTTGTAGCAGGTGCACAGGAAAAAGCACATGTTGCAGGCTCAGAGCACC
TATTTCCTGTTATCTTAGATTCTGTCTACTTCAAGAATGGAACTCTAATGCTGTTAGGCTATGGGGATGAAGAACCCAGGGTCATGGAGAATATCAATGGGCACCTAAAATTTCATAGTAGATACGAACGTTTATATGCACAACTAAGTGGGAGGCCAAAGGAGTGGCGAACTGGAATGCCATTAAAAGATGGGGGAGAG
TTGTTTTTAAATGTATTTGTTGACCACACACAACAGAAGTGGCATGTCAACATCAAAGGGAAGAATCTCTTTGCTCCGCTTTTTGAAAACTTGCTGGAGATTCCAATTGTTTGGTCTAATGGCAGGGCCAGCGGAGAGGTCCACATTTGTTTATCAAGGGGTGAACATTTTCCCAACTTGCACGGGCAGATTGATGTGAG
AGGATTGGAGTTTCAAATTTTGGATACACCCTCATCCTTTTCTGTTCCAAATGTTGAAGTCAATGCTCTTATGAGGACCCTTGATGCAAAGCCTCTGTTGTTTCCTTTGGCGGGTTCACTGAAAGCTGTTTTCAATTGTCAAGGCCCATTGGATATTCCTGTATTCGTAGGTGGTGGCATAATGTCAAAAAAAAACAATC
ATTTCATATCAAACATGCCTTCCTCTGCCGCAGCTGAAGCACTCATGCGAAACAAGGAGGCTGGGGCAGTAGCGGCTATAGGTCATGTGCCATTCTCATATGTCTCAGCGAATTTTACTTTCAACACTGATAATCGCGTGAGTTTCAATGATCACTTTTTTGAAAATTTTTGTTTGTCAAAAGAAGCTTTTAGTTAGAAG
TGAATTGTAGGTGACTAGAAGCAGAGTTTTTATGGGTGAATTGGTGAAGTGCTTCTATATGATCTGTTGAAGTTGTGGTTCTTTATGAAAAGTAATTTCTCATTGTGTTCAAGTATTCTATTCATTCAAAGCCATTGGAGGGTATTGCAACCTGCTTAATGTTGACTTCGATAAAACTTGTTAGATGCTCTGTGGGAAGT
TGTGTGTTGGCCAAGGAGAATCTAATGCCAAAAGAATTTTAACTTCCTACTATTTTGCAGATCACAGACTTGTATGGTATTCGAGCAACACTAATAGATGGTGGCGAAATACGCGGTGCTGGAAATGCTTGGATTTGTCCAGAGGTTTATGAATCTATGGGTTTTATTTTTATTTTATTCATTTATGGTTGATAGCAATA
GAGGCTTGTACATTTTGAAATGTTTATATGTTGTGCAATATGCAATCAGAATTAAAGGTATCCAATAAAAGAGGTTTTTTTTTCTGTTTAAAAATCATTCAAATTTTTATAGGTTTCTTTAGAAAAGATAACAATGAAACTTGTGAGTAGTTGAGAACATAGATGAAATAATCTCTGATTATTCGAATTAGCCCCAGTGC
AATCAACAAAATGATTACATCTAAATGATTAATTCGTTTAACACTACAGGTGTGCTAAGGTTGCCTGACTTTTCCTGATTATTTCTGATTATTTCCCAATTCTTGCCGATTTAATCTTTTTGGAACCTTCACTGATTAATTGCTGGTTACGATTATTTCATCTATGGTTGAGATATTGTTGTCAGGAAAAAGAATTAGGA
TCAATTGTTACAAGCATATGATAACTTTTTGCTCTTATCTTTTGTTTAAGCTGTAAATATAGATGCTCTAATGTTCCATTAGGGTGAAAATAGAAGGAAAACCAATATAATATTATAATCTTTTGTGGGCAAATGTTTTCACAGACTATCGTTATTATAATTTATAGGTGTAGTTTAGGTGCACTTTGTTGCCTGAAAAA
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>TRINITY_DN127869_c0_g1_i14 from sample A1 / Example unspliced isoform:AATTGAAAAAACTTGATAATATGACACTTTTCGCAGTTCACTTCTAGATATTTGTCCAGCTCTTCGATCCTGGATATTATCTCCAAATTTCGCGATTAGCCGCGCTGTAATTTCTCTCGAGAGTCAGGTGCTTCACGGACTTGAAATGGCGTGCCGATTAGAGCTCAACATCATCTTATTTGGTGCAGATTCGGACTCAT
TTTGGCGGCTTTTTTCGATTAAATGAATGACAACTTGTCATGAAGAAATTACAGAGGTAAGGAGCTAAATATTGAAATTTTCACGGAGAAATTTGATTTACAGTAATAAATATATATTTACAGAGAGAGAGAGAGCCCGAAATCCAATTTTCAGAAAGGTGCAGACGGTGAAACTTAAATTCCAGGGAACATTCGGGTTT
TCATTGGCACCTGATGGATAGGAAAACCGTTAATGGACTGCAATTTGGGCGTCCTTATGCAACGGGGTAATCTGATATTTAGTAAGCTTGATATACATGGAAATTTAAATTTCGGTGCGTGTTAGGGTTTTCTGAGAAGTGTGGCACTGGTGTTCAGAGATATTTAATTTAGTTCTGTATCTGCGGGGCTTCATGTAATA
AAACAAATCTGAAGATGAAATTGGAAATGCGGGATTTGGGATAGTTGGAGGCATGCGAATGGACTTTCACGCCTCCGGTCAGGGTTTCCAGGAATAAGTTCCAGTAGTTATGGTGTTTTGATTGTTCTTTTCGATTATAAGATGTCCGGGAGGGCGACATGTCAGTTCTCAACGGTAATTTGATGTTTTATTTGAATGCA
ACAATGCCCTCCCGTGGTCAGAGTTCATGCCTAGGGCAGCCTGTTAATTTAGCTGATTTCAGAACTTGTAGCAGAAGAGCGAGGGGATTTGAGCAGTTAGATAATCAGTTTCTTGGGATTCCAATAAGGAAGTTTCAATCTCCGCTGAAACATATAGTTTTCGAACATAAGAGGCAAACATCAAACACGTTTATGGACCA
TGTAAGCAAAGTGAGGATCTTTCGCTGCGAGCGAAAATCCCCATTTTTACTGAACTATACGAAATTCAACGTGATAGGGAAATTTATGGGAAGAAAACTAAATTTGCAGAACAGATTACAATGCCATTGCCGCCGAGATAAAGACAGTATTAAGGCTCGTGTTTCTGAATGGAAGGCTCCCTTTTCTCAATGGAGGGAAG
GAATATTTTTTGTCCGTTGTTCTGCATTTGTCGCGACAATCGCCGTTCTTGGAATGTTGTTTTTCTATGGACAAGTCAGAGCCCAAGCGTATATTAATGAAAGAATATTACCTTCTGTGGCGACTGTCATGGGCGATTACCTTGGGAGGAAACTTAACCTTGGAAGGGTTCATAGGATTTCTCCTCTTGGGTTTGCATTG
GAATCCTGTTCCTTAGGTCCTCATTCTGAAGAGTTTTCTTGCGGGGAGCTTCCAAATGTTAAAGTTCGCATTCGGCCTTGGGCCAGCCTACAGCGGGGACAGGTAGTAGTTGATGCTGTTTTGTTACAACCGCATGTTTTGATTGCCCAGAAAGAGGACTGGTCATGGCTTGGTATCCCAACCCCCTTAGAAAAACCTGT
GGTGAAGCATAAATCGAATGAGGAGGGTATCGATCCTCGTACAAAAGCTAGGAGGCTTGCAAGAGAGCAAGCTGCTATTCGTTGGGCAGAAGAAAGGAATGAGGCAGCAAGGAAATGGGCACAAAAAGGCTATAACTTTGTTGGTGTTGAGGAGACAAGGTCCCCAGGAAAGGTTGACGCAGTGCACACAGAAGACATGG
TAAACTGTGATTACATGAATTGCTTCAAGGAAGAGATTACAATAGAAAGTTGTTTTGGAGGCAAACCAGGTAGACAAGAACACTTGCATCATAAATGTACAGAAGGTGTCTGTAGTAAGAGTGCGATGGAGAGGTCTGAGTTTGATAGGGCCTTTGAGCACAGTACTCTAAATAGGCCTTTTAGTTTGAGAAGTCCTGTT
CCAGTTGTAAGAACTTGGTTAAAGGAAAATATGGTGAAACCTATACGACACCGATTCAAGAGGTCAATCCAAAAGAGTGCACCTTTGTCTCAGAAAGCGACAATGCAGAGAAGAAACCTTGATCGCAGTGCTGCAGCAGCAAGGAAATACTTTGATGAAATGGACAAGAAGCAGAATTCTGGTGCAGACAAAGGAAAGGG
TTATATTGGAAATTCTGGAGCATTTGTAAATCCAGAGCTGGTCTCTTCCTTTATAAGTGTGAGAGAGGACAGTCAGAAGGGTGTGATGGAAGAGCAGGATAAAGATTGTAGTGAGCATATTGTCATGAATGTGGACAAATATAATTGCCCACCAACTATTCACAGAAATGAAGAACTTTCAGCTTGTCCCATTTCAATGG
ACAAAGGGGATCTATCAAAGTTTGTCAAGATGGATTGTAAGAATCATATAATCATGGGCATTGAGCATCCACCTTACGATTATGATATTGCTTCAAGGAGAATTCAGGATGTTCTACTGTTAGATAAAGTTAGTTTAGAACAGGAAACGATCTCAGAAGATCAGTCTTCACAGCACCTTTCAATGAATGGCACAGATAAT
GAAAAAGGTTCAGTCTATGAAGCTTTAGTTGAGGCTATTCACAATTCATGTGAAACAAATGAAAGCTGTAAATCTTCAAATCATCTTGGGAAACAAGGCGATAAATCGGTGTACATGAAAAGCAAGAGCAATGGAGCTTCTGCTCATACCTGTGATACTATGGGAGGTTCCTTGCAAAATATAGCTGAAGACCAAAGTAG
CAATCATTCAGGAGACATTGGTGCTGCAAGAATTGGGAAGCTTCCTGTTTTCCATGGGAGCATTGTGATGGCTTTTTCAGATACGTTTATCAAATCAATGGAGAGAATGAGTGGATACTTAAGAAGAAAGTTTAAGCAACTTGCTAATGAATTTGTAGCAGGTGCACAGGAAAAAGCACATGTTGCAGGCTCAGAGCACC
TATTTCCTGTTATCTTAGATTCTGTCTACTTCAAGAATGGAACTCTAATGCTGTTAGGCTATGGGGATGAAGAACCCAGGGTCATGGAGAATATCAATGGGCACCTAAAATTTCATAGTAGATACGAACGTTTATATGCACAACTAAGTGGGAGGCCAAAGGAGTGGCGAACTGGAATGCCATTAAAAGATGGGGGAGAG
TTGTTTTTAAATGTATTTGTTGACCACACACAACAGAAGTGGCATGTCAACATCAAAGGGAAGAATCTCTTTGCTCCGCTTTTTGAAAACTTGCTGGAGATTCCAATTGTTTGGTCTAATGGCAGGGCCAGCGGAGAGGTCCACATTTGTTTATCAAGGGGTGAACATTTTCCCAACTTGCACGGGCAGATTGATGTGAG
AGGATTGGAGTTTCAAATTTTGGATACACCCTCATCCTTTTCTgctttaaatggaagcctatgttttcgtggtcagagaatattcttgcacaatgcaagttgtttctttggtgaagtgccgttggatgtttcaggagattttggaataaatcccgaggatggagagtatcaccttatgtgccagGTTCCAAATGTTGAAG
TCAATGCTCTTATGAGGACCCTTGATGCAAAGCCTCTGTTGTTTCCTTTGGCGGGTTCACTGAAAGCTGTTTTCAATTGTCAAGGCCCATTGGATATTCCTGTATTCGTAGGTGGTGGCATAATGTCAAAAAAAAACAATCATTTCATATCAAACATGCCTTCCTCTGCCGCAGCTGAAGCACTCATGCGAAACAAGGAG
GCTGGGGCAGTAGCGGCTATAGGTCATGTGCCATTCTCATATGTCTCAGCGAATTTTACTTTCAACACTGATAATCGCATCACAGACTTGTATGGTATTCGAGCAACACTAATAGATGGTGGCGAAATACGCGGTGCTGGAAATGCTTGGATTTGTCCAGAGGGTGAGATAGATGACTCTGCAGTTGATTTTAATTTTTC
GGGAAATGTTGATTTTGACAATGTGGTTCGACACTACCTTCCTAATGGAATCCAAGCAATGCCTATGAAACTTGGCTATGTAAATGGGGAGGCCAAAGTATATGGTTCGATTTCGAGAATGCGGTATGACGTCAAATGGACAGCACCAAAGGCTGAAGGCTCTTTCACTGATGCACGTGGCGACATTATAATATCTGATG
AAGCCATTACTATCAGCTCTTCCTCGATTACGTTTGATCTTCTGACAAAAATCAAAATATCATACCCTAATGGACGCTATTTAAAAAAAGAGGGTTCAGATCTCATCATTGCTGTTGCCCCAGATATCCTGGGTGTTGATGCTGATTTACGTTTGCAAAGATTTGATATTCTTAGTTTGACTCCATTTAGTCCCATTGGT
TCTCCAAAGCTTATGCATATGAAACTGACCGGCAGGGCTAAATTTCATGGATCTGTAGTGGATTCCCTAGATAGATCAGTCGATGAGAACATTGCAGTTCGAGAGGAGATATTGAGTACTGATGAGTTTAGTAGGACGAAAGCATCGGGACTTGTTGGAGATGTACAGTTATCTGGAATAAAATTGAATCAACTTCTTGT
GGCACCAAATTCGTCAGGGACGTTGGCTATTTTCCCGCAAAATTTCAAGTTAAATGCCACAGGAAGACCAGATGAGAATCTTCTCATTGAAGTTGTCTGTGGTTCAAATCCTCCCAGCTCAGAAACTTCACTTTATGATCTGATGATGAGAAAAGTATACCTTTGTTTACAAAAGGGCCAGCTTAGAACCAGCATCTCCT
TTCAACCTGGACATTCAGCAAGTTTGGAGGTACGACACTTGGAACTTGATGAACTGGAGCTTGCCTCATTGCGCGGAATGGTACAGAAGGCAGAACTCGAACTTAATTTTCACAAAAGGAAAGGTCAAGGAAATGTATCTGTTATGCGGCCAAGGTTCAGTGGTGTGCAAGGTGAATCCTTGGATGTTTCTGCTCGTTGG
TCAGGTGATGTGATTACACTTGAGAAGTCTGTACTCGAACAAGCTTGTAGCAAGTATGAACTGCAGGGTGAATATGTGCTGCCGGGAACACGTGATCGTAGTCCTGGTGAAAGAGAAAAAGGAGGAATGCTGAAGAGGGCAATGGCTGGACAGCTTGGAAGCCTTATTACATCTTTGGGAAGGTGGCGACTACGATTAGA
AGTTCCTGTGGCTGAAGTCGCTGAGATGCTGCCATTTGCTCGTCTGCTTTCCAGGAGCAGTGATCCCGCAGTTCTTTCTAGGTCGAAGGAGTTATTTATTCAAGGTGTACAAAATGTTGGGTTCTTTGCTGAGAATCTCCAAAAACAATTAGAGGATACAAAAGGGAGCACTGAATATCTTCCTTTTGAGGAAGGAGCCC
CAGAGGCAATACCTCTTCCAGGGTTAGCTGAATTAAAGGGCCGTTGGCATGGAAGTCTGGATGCTAGTGGAGGCGGCAATGGAGATACTACAGCAGACTTCGACCTCCATGGTGAAGAATGGGAGTGGGGAGCTTATAAGTCTCAACAGGTTATTGCAGTTGGAAGCTACAGTAATAACAATGGTTTGCGTCTTGATAAG
ATCTTGATACAAAGAGACAAAGCAACTATTCATGCAGATGGGACGTTATTAGGACCGAGGACTAATCTTCATTTTGCTGTTCTAAATTTTCCTGTTGGATTAGTTCCTTATTTATTACAGGCATTTGAGTCTTCAACTATGGATCCTATGCCTTCTTCATGGACACCTCTAACACCTCTGAAAGGGATTTTACATATGGA
AGGAGATCTAAGAGGAAGTCTTGCAAAGCCACAATGTGATGTACAAGTAAGACTTTTAGACGGAGCTATTGGAGGTGTTGACCTTGAACGAGCTGAAGTGGTTGCTTGTATTACATCAGCAAATCGCTTTGTATTTGATGCAAACTTTAGACCTGTAATCCAGAGTGGGCATGTGCATGTTATTGGAAGTCTTCCTGTGC
CTCCTTTGGGAAATGATATGCTAGTAGAAGAGAATATGGAGATGGAGCCAGATCAGCCAATTTGGTCAAGGGAATGGGTACGTGATAAGGGAGATCTTACTATTAAAAATGATATCAATGTAAAAAAATTTGGGAGAGAGAGAGGAGATAAAGGCTGGGAAGTTCAATTGACAGAAAGTTTAAAGGGTTTGGATTGGAAC
CTAATGGAGACAGGTGCAGTTAAGGTGGATGCAACTGTTAAAGATGGTGGGATGATGTTAATTACTGCACTGTCTCCTTATGTCCGTTGGCTACATGGCAGTGCTGACATTGTTTTGCAGGTAAGAGGAACTGCAGATCAGCCCATATTTGATGGAGCTGCAACATTTCATAGGGCATCTGTATCTTCACCGGTGCTTCC
AACACCACTTTCAAATTTTGGAGGCACGATTAATGTCAGGAGTAATGAGTTATCAATTAATGGCTTGGAAGGACGAGTTGGTAGAAAAGGACGCTTGTTAGTCAAAGGGAATTTGCCTCTCAGAACAAGAAAAATTTCTTTGGGAGATAAGATTGAGATGAAGTCAGAGAGCCTGGAAGTGCGAGCCAAAAATATATTCA
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AGTACACAATCTGCTTTTTTGCCTGTCAATGTGCCTGTCAAGACATCAGCCATTTGATTGTTTTCCACGCACAGATACACAGGAAAAAGTTGAGAAAACTAAAGAGCAAAGCAAAAGCAACCCAAAAATAGCTGTCCACATGAGGGACCTCAAACGCCATCTTGGACCTGAATTGAGAATTTGTTTATCCTGCGATACTG
TACTTTGCTATTTGTGGTGGGCTTGAGCTCAGTGGCCGGGCTG
Intron 2 GTGAGTTTCA ... TATTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 31.33 | 57 | 26 | 9 |
| A2 | 15.52 | 49 | 9 | 0 |
| A3 | 31.37 | 35 | 16 | 0 |
| A4 | 24.53 | 40 | 13 | 2 |
| A5 | 31.43 | 24 | 11 | 0 |
| A6 | 0 | 4 | 0 | 0 |
| A7 | 25 | 9 | 3 | 0 |
| A8 | 0 | 2 | 0 | 0 |
| A9 | 0 | 4 | 0 | 0 |
| A10 | 33.33 | 8 | 4 | 0 |
>TRINITY_DN127869_c0_g1_i14 from sample A1 / Example spliced isoformAATTGAAAAAACTTGATAATATGACACTTTTCGCAGTTCACTTCTAGATATTTGTCCAGCTCTTCGATCCTGGATATTATCTCCAAATTTCGCGATTAGCCGCGCTGTAATTTCTCTCGAGAGTCAGGTGCTTCACGGACTTGAAATGGCGTGCCGATTAGAGCTCAACATCATCTTATTTGGTGCAGATTCGGACTCAT
TTTGGCGGCTTTTTTCGATTAAATGAATGACAACTTGTCATGAAGAAATTACAGAGGTAAGGAGCTAAATATTGAAATTTTCACGGAGAAATTTGATTTACAGTAATAAATATATATTTACAGAGAGAGAGAGAGCCCGAAATCCAATTTTCAGAAAGGTGCAGACGGTGAAACTTAAATTCCAGGGAACATTCGGGTTT
TCATTGGCACCTGATGGATAGGAAAACCGTTAATGGACTGCAATTTGGGCGTCCTTATGCAACGGGGTAATCTGATATTTAGTAAGCTTGATATACATGGAAATTTAAATTTCGGTGCGTGTTAGGGTTTTCTGAGAAGTGTGGCACTGGTGTTCAGAGATATTTAATTTAGTTCTGTATCTGCGGGGCTTCATGTAATA
AAACAAATCTGAAGATGAAATTGGAAATGCGGGATTTGGGATAGTTGGAGGCATGCGAATGGACTTTCACGCCTCCGGTCAGGGTTTCCAGGAATAAGTTCCAGTAGTTATGGTGTTTTGATTGTTCTTTTCGATTATAAGATGTCCGGGAGGGCGACATGTCAGTTCTCAACGGTAATTTGATGTTTTATTTGAATGCA
ACAATGCCCTCCCGTGGTCAGAGTTCATGCCTAGGGCAGCCTGTTAATTTAGCTGATTTCAGAACTTGTAGCAGAAGAGCGAGGGGATTTGAGCAGTTAGATAATCAGTTTCTTGGGATTCCAATAAGGAAGTTTCAATCTCCGCTGAAACATATAGTTTTCGAACATAAGAGGCAAACATCAAACACGTTTATGGACCA
TGTAAGCAAAGTGAGGATCTTTCGCTGCGAGCGAAAATCCCCATTTTTACTGAACTATACGAAATTCAACGTGATAGGGAAATTTATGGGAAGAAAACTAAATTTGCAGAACAGATTACAATGCCATTGCCGCCGAGATAAAGACAGTATTAAGGCTCGTGTTTCTGAATGGAAGGCTCCCTTTTCTCAATGGAGGGAAG
GAATATTTTTTGTCCGTTGTTCTGCATTTGTCGCGACAATCGCCGTTCTTGGAATGTTGTTTTTCTATGGACAAGTCAGAGCCCAAGCGTATATTAATGAAAGAATATTACCTTCTGTGGCGACTGTCATGGGCGATTACCTTGGGAGGAAACTTAACCTTGGAAGGGTTCATAGGATTTCTCCTCTTGGGTTTGCATTG
GAATCCTGTTCCTTAGGTCCTCATTCTGAAGAGTTTTCTTGCGGGGAGCTTCCAAATGTTAAAGTTCGCATTCGGCCTTGGGCCAGCCTACAGCGGGGACAGGTAGTAGTTGATGCTGTTTTGTTACAACCGCATGTTTTGATTGCCCAGAAAGAGGACTGGTCATGGCTTGGTATCCCAACCCCCTTAGAAAAACCTGT
GGTGAAGCATAAATCGAATGAGGAGGGTATCGATCCTCGTACAAAAGCTAGGAGGCTTGCAAGAGAGCAAGCTGCTATTCGTTGGGCAGAAGAAAGGAATGAGGCAGCAAGGAAATGGGCACAAAAAGGCTATAACTTTGTTGGTGTTGAGGAGACAAGGTCCCCAGGAAAGGTTGACGCAGTGCACACAGAAGACATGG
TAAACTGTGATTACATGAATTGCTTCAAGGAAGAGATTACAATAGAAAGTTGTTTTGGAGGCAAACCAGGTAGACAAGAACACTTGCATCATAAATGTACAGAAGGTGTCTGTAGTAAGAGTGCGATGGAGAGGTCTGAGTTTGATAGGGCCTTTGAGCACAGTACTCTAAATAGGCCTTTTAGTTTGAGAAGTCCTGTT
CCAGTTGTAAGAACTTGGTTAAAGGAAAATATGGTGAAACCTATACGACACCGATTCAAGAGGTCAATCCAAAAGAGTGCACCTTTGTCTCAGAAAGCGACAATGCAGAGAAGAAACCTTGATCGCAGTGCTGCAGCAGCAAGGAAATACTTTGATGAAATGGACAAGAAGCAGAATTCTGGTGCAGACAAAGGAAAGGG
TTATATTGGAAATTCTGGAGCATTTGTAAATCCAGAGCTGGTCTCTTCCTTTATAAGTGTGAGAGAGGACAGTCAGAAGGGTGTGATGGAAGAGCAGGATAAAGATTGTAGTGAGCATATTGTCATGAATGTGGACAAATATAATTGCCCACCAACTATTCACAGAAATGAAGAACTTTCAGCTTGTCCCATTTCAATGG
ACAAAGGGGATCTATCAAAGTTTGTCAAGATGGATTGTAAGAATCATATAATCATGGGCATTGAGCATCCACCTTACGATTATGATATTGCTTCAAGGAGAATTCAGGATGTTCTACTGTTAGATAAAGTTAGTTTAGAACAGGAAACGATCTCAGAAGATCAGTCTTCACAGCACCTTTCAATGAATGGCACAGATAAT
GAAAAAGGTTCAGTCTATGAAGCTTTAGTTGAGGCTATTCACAATTCATGTGAAACAAATGAAAGCTGTAAATCTTCAAATCATCTTGGGAAACAAGGCGATAAATCGGTGTACATGAAAAGCAAGAGCAATGGAGCTTCTGCTCATACCTGTGATACTATGGGAGGTTCCTTGCAAAATATAGCTGAAGACCAAAGTAG
CAATCATTCAGGAGACATTGGTGCTGCAAGAATTGGGAAGCTTCCTGTTTTCCATGGGAGCATTGTGATGGCTTTTTCAGATACGTTTATCAAATCAATGGAGAGAATGAGTGGATACTTAAGAAGAAAGTTTAAGCAACTTGCTAATGAATTTGTAGCAGGTGCACAGGAAAAAGCACATGTTGCAGGCTCAGAGCACC
TATTTCCTGTTATCTTAGATTCTGTCTACTTCAAGAATGGAACTCTAATGCTGTTAGGCTATGGGGATGAAGAACCCAGGGTCATGGAGAATATCAATGGGCACCTAAAATTTCATAGTAGATACGAACGTTTATATGCACAACTAAGTGGGAGGCCAAAGGAGTGGCGAACTGGAATGCCATTAAAAGATGGGGGAGAG
TTGTTTTTAAATGTATTTGTTGACCACACACAACAGAAGTGGCATGTCAACATCAAAGGGAAGAATCTCTTTGCTCCGCTTTTTGAAAACTTGCTGGAGATTCCAATTGTTTGGTCTAATGGCAGGGCCAGCGGAGAGGTCCACATTTGTTTATCAAGGGGTGAACATTTTCCCAACTTGCACGGGCAGATTGATGTGAG
AGGATTGGAGTTTCAAATTTTGGATACACCCTCATCCTTTTCTGCTTTAAATGGAAGCCTATGTTTTCGTGGTCAGAGAATATTCTTGCACAATGCAAGTTGTTTCTTTGGTGAAGTGCCGTTGGATGTTTCAGGAGATTTTGGAATAAATCCCGAGGATGGAGAGTATCACCTTATGTGCCAGGTTCCAAATGTTGAAG
TCAATGCTCTTATGAGGACCCTTGATGCAAAGCCTCTGTTGTTTCCTTTGGCGGGTTCACTGAAAGCTGTTTTCAATTGTCAAGGCCCATTGGATATTCCTGTATTCGTAGGTGGTGGCATAATGTCAAAAAAAAACAATCATTTCATATCAAACATGCCTTCCTCTGCCGCAGCTGAAGCACTCATGCGAAACAAGGAG
GCTGGGGCAGTAGCGGCTATAGGTCATGTGCCATTCTCATATGTCTCAGCGAATTTTACTTTCAACACTGATAATCGCATCACAGACTTGTATGGTATTCGAGCAACACTAATAGATGGTGGCGAAATACGCGGTGCTGGAAATGCTTGGATTTGTCCAGAGGGTGAGATAGATGACTCTGCAGTTGATTTTAATTTTTC
GGGAAATGTTGATTTTGACAATGTGGTTCGACACTACCTTCCTAATGGAATCCAAGCAATGCCTATGAAACTTGGCTATGTAAATGGGGAGGCCAAAGTATATGGTTCGATTTCGAGAATGCGGTATGACGTCAAATGGACAGCACCAAAGGCTGAAGGCTCTTTCACTGATGCACGTGGCGACATTATAATATCTGATG
AAGCCATTACTATCAGCTCTTCCTCGATTACGTTTGATCTTCTGACAAAAATCAAAATATCATACCCTAATGGACGCTATTTAAAAAAAGAGGGTTCAGATCTCATCATTGCTGTTGCCCCAGATATCCTGGGTGTTGATGCTGATTTACGTTTGCAAAGATTTGATATTCTTAGTTTGACTCCATTTAGTCCCATTGGT
TCTCCAAAGCTTATGCATATGAAACTGACCGGCAGGGCTAAATTTCATGGATCTGTAGTGGATTCCCTAGATAGATCAGTCGATGAGAACATTGCAGTTCGAGAGGAGATATTGAGTACTGATGAGTTTAGTAGGACGAAAGCATCGGGACTTGTTGGAGATGTACAGTTATCTGGAATAAAATTGAATCAACTTCTTGT
GGCACCAAATTCGTCAGGGACGTTGGCTATTTTCCCGCAAAATTTCAAGTTAAATGCCACAGGAAGACCAGATGAGAATCTTCTCATTGAAGTTGTCTGTGGTTCAAATCCTCCCAGCTCAGAAACTTCACTTTATGATCTGATGATGAGAAAAGTATACCTTTGTTTACAAAAGGGCCAGCTTAGAACCAGCATCTCCT
TTCAACCTGGACATTCAGCAAGTTTGGAGGTACGACACTTGGAACTTGATGAACTGGAGCTTGCCTCATTGCGCGGAATGGTACAGAAGGCAGAACTCGAACTTAATTTTCACAAAAGGAAAGGTCAAGGAAATGTATCTGTTATGCGGCCAAGGTTCAGTGGTGTGCAAGGTGAATCCTTGGATGTTTCTGCTCGTTGG
TCAGGTGATGTGATTACACTTGAGAAGTCTGTACTCGAACAAGCTTGTAGCAAGTATGAACTGCAGGGTGAATATGTGCTGCCGGGAACACGTGATCGTAGTCCTGGTGAAAGAGAAAAAGGAGGAATGCTGAAGAGGGCAATGGCTGGACAGCTTGGAAGCCTTATTACATCTTTGGGAAGGTGGCGACTACGATTAGA
AGTTCCTGTGGCTGAAGTCGCTGAGATGCTGCCATTTGCTCGTCTGCTTTCCAGGAGCAGTGATCCCGCAGTTCTTTCTAGGTCGAAGGAGTTATTTATTCAAGGTGTACAAAATGTTGGGTTCTTTGCTGAGAATCTCCAAAAACAATTAGAGGATACAAAAGGGAGCACTGAATATCTTCCTTTTGAGGAAGGAGCCC
CAGAGGCAATACCTCTTCCAGGGTTAGCTGAATTAAAGGGCCGTTGGCATGGAAGTCTGGATGCTAGTGGAGGCGGCAATGGAGATACTACAGCAGACTTCGACCTCCATGGTGAAGAATGGGAGTGGGGAGCTTATAAGTCTCAACAGGTTATTGCAGTTGGAAGCTACAGTAATAACAATGGTTTGCGTCTTGATAAG
ATCTTGATACAAAGAGACAAAGCAACTATTCATGCAGATGGGACGTTATTAGGACCGAGGACTAATCTTCATTTTGCTGTTCTAAATTTTCCTGTTGGATTAGTTCCTTATTTATTACAGGCATTTGAGTCTTCAACTATGGATCCTATGCCTTCTTCATGGACACCTCTAACACCTCTGAAAGGGATTTTACATATGGA
AGGAGATCTAAGAGGAAGTCTTGCAAAGCCACAATGTGATGTACAAGTAAGACTTTTAGACGGAGCTATTGGAGGTGTTGACCTTGAACGAGCTGAAGTGGTTGCTTGTATTACATCAGCAAATCGCTTTGTATTTGATGCAAACTTTAGACCTGTAATCCAGAGTGGGCATGTGCATGTTATTGGAAGTCTTCCTGTGC
CTCCTTTGGGAAATGATATGCTAGTAGAAGAGAATATGGAGATGGAGCCAGATCAGCCAATTTGGTCAAGGGAATGGGTACGTGATAAGGGAGATCTTACTATTAAAAATGATATCAATGTAAAAAAATTTGGGAGAGAGAGAGGAGATAAAGGCTGGGAAGTTCAATTGACAGAAAGTTTAAAGGGTTTGGATTGGAAC
CTAATGGAGACAGGTGCAGTTAAGGTGGATGCAACTGTTAAAGATGGTGGGATGATGTTAATTACTGCACTGTCTCCTTATGTCCGTTGGCTACATGGCAGTGCTGACATTGTTTTGCAGGTAAGAGGAACTGCAGATCAGCCCATATTTGATGGAGCTGCAACATTTCATAGGGCATCTGTATCTTCACCGGTGCTTCC
AACACCACTTTCAAATTTTGGAGGCACGATTAATGTCAGGAGTAATGAGTTATCAATTAATGGCTTGGAAGGACGAGTTGGTAGAAAAGGACGCTTGTTAGTCAAAGGGAATTTGCCTCTCAGAACAAGAAAAATTTCTTTGGGAGATAAGATTGAGATGAAGTCAGAGAGCCTGGAAGTGCGAGCCAAAAATATATTCA
GTGGTCAGGTGGACAGCCAAATACAGGTCGCGGGTTCAATACTGGAGCCAGAGGTCTCAGGAATGATTAAGCTTAGTGGTGGAGTGGCATTCTTGCCACAAGAAAAGGGCACAGGACCCGCTATCCCTCGTTTGGCTTCAAATCCGAAGAGCCTTTCAACTGGCCGTATTACAGCTGCAGGAAATATTGCTCGCTTTTAC
AGTACACAATCTGCTTTTTTGCCTGTCAATGTGCCTGTCAAGACATCAGCCATTTGATTGTTTTCCACGCACAGATACACAGGAAAAAGTTGAGAAAACTAAAGAGCAAAGCAAAAGCAACCCAAAAATAGCTGTCCACATGAGGGACCTCAAACGCCATCTTGGACCTGAATTGAGAATTTGTTTATCCTGCGATACTG
TACTTTGCTATTTGTGGTGGGCTTGAGCTCAGTGGCCGGGCTG
>TRINITY_DN127869_c0_g1_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:AATTGAAAAAACTTGATAATATGACACTTTTCGCAGTTCACTTCTAGATATTTGTCCAGCTCTTCGATCCTGGATATTATCTCCAAATTTCGCGATTAGCCGCGCTGTAATTTCTCTCGAGAGTCAGGTGCTTCACGGACTTGAAATGGCGTGCCGATTAGAGCTCAACATCATCTTATTTGGTGCAGATTCGGACTCAT
TTTGGCGGCTTTTTTCGATTAAATGAATGACAACTTGTCATGAAGAAATTACAGAGGTAAGGAGCTAAATATTGAAATTTTCACGGAGAAATTTGATTTACAGTAATAAATATATATTTACAGAGAGAGAGAGAGCCCGAAATCCAATTTTCAGAAAGGTGCAGACGGTGAAACTTAAATTCCAGGGAACATTCGGGTTT
TCATTGGCACCTGATGGATAGGAAAACCGTTAATGGACTGCAATTTGGGCGTCCTTATGCAACGGGGTAATCTGATATTTAGTAAGCTTGATATACATGGAAATTTAAATTTCGGTGCGTGTTAGGGTTTTCTGAGAAGTGTGGCACTGGTGTTCAGAGATATTTAATTTAGTTCTGTATCTGCGGGGCTTCATGTAATA
AAACAAATCTGAAGATGAAATTGGAAATGCGGGATTTGGGATAGTTGGAGGCATGCGAATGGACTTTCACGCCTCCGGTCAGGGTTTCCAGGAATAAGTTCCAGTAGTTATGGTGTTTTGATTGTTCTTTTCGATTATAAGATGTCCGGGAGGGCGACATGTCAGTTCTCAACGGTAATTTGATGTTTTATTTGAATGCA
ACAATGCCCTCCCGTGGTCAGAGTTCATGCCTAGGGCAGCCTGTTAATTTAGCTGATTTCAGAACTTGTAGCAGAAGAGCGAGGGGATTTGAGCAGTTAGATAATCAGTTTCTTGGGATTCCAATAAGGAAGTTTCAATCTCCGCTGAAACATATAGTTTTCGAACATAAGAGGCAAACATCAAACACGTTTATGGACCA
TGTAAGCAAAGTGAGGATCTTTCGCTGCGAGCGAAAATCCCCATTTTTACTGAACTATACGAAATTCAACGTGATAGGGAAATTTATGGGAAGAAAACTAAATTTGCAGAACAGATTACAATGCCATTGCCGCCGAGATAAAGACAGTATTAAGGCTCGTGTTTCTGAATGGAAGGCTCCCTTTTCTCAATGGAGGGAAG
GAATATTTTTTGTCCGTTGTTCTGCATTTGTCGCGACAATCGCCGTTCTTGGAATGTTGTTTTTCTATGGACAAGTCAGAGCCCAAGCGTATATTAATGAAAGAATATTACCTTCTGTGGCGACTGTCATGGGCGATTACCTTGGGAGGAAACTTAACCTTGGAAGGGTTCATAGGATTTCTCCTCTTGGGTTTGCATTG
GAATCCTGTTCCTTAGGTCCTCATTCTGAAGAGTTTTCTTGCGGGGAGCTTCCAAATGTTAAAGTTCGCATTCGGCCTTGGGCCAGCCTACAGCGGGGACAGGTAGTAGTTGATGCTGTTTTGTTACAACCGCATGTTTTGATTGCCCAGAAAGAGGACTGGTCATGGCTTGGTATCCCAACCCCCTTAGAAAAACCTGT
GGTGAAGCATAAATCGAATGAGGAGGGTATCGATCCTCGTACAAAAGCTAGGAGGCTTGCAAGAGAGCAAGCTGCTATTCGTTGGGCAGAAGAAAGGAATGAGGCAGCAAGGAAATGGGCACAAAAAGGCTATAACTTTGTTGGTGTTGAGGAGACAAGGTCCCCAGGAAAGGTTGACGCAGTGCACACAGAAGACATGG
TAAACTGTGATTACATGAATTGCTTCAAGGAAGAGATTACAATAGAAAGTTGTTTTGGAGGCAAACCAGGTAGACAAGAACACTTGCATCATAAATGTACAGAAGGTGTCTGTAGTAAGAGTGCGATGGAGAGGTCTGAGTTTGATAGGGCCTTTGAGCACAGTACTCTAAATAGGCCTTTTAGTTTGAGAAGTCCTGTT
CCAGTTGTAAGAACTTGGTTAAAGGAAAATATGGTGAAACCTATACGACACCGATTCAAGAGGTCAATCCAAAAGAGTGCACCTTTGTCTCAGAAAGCGACAATGCAGAGAAGAAACCTTGATCGCAGTGCTGCAGCAGCAAGGAAATACTTTGATGAAATGGACAAGAAGCAGAATTCTGGTGCAGACAAAGGAAAGGG
TTATATTGGAAATTCTGGAGCATTTGTAAATCCAGAGCTGGTCTCTTCCTTTATAAGTGTGAGAGAGGACAGTCAGAAGGGTGTGATGGAAGAGCAGGATAAAGATTGTAGTGAGCATATTGTCATGAATGTGGACAAATATAATTGCCCACCAACTATTCACAGAAATGAAGAACTTTCAGCTTGTCCCATTTCAATGG
ACAAAGGGGATCTATCAAAGTTTGTCAAGATGGATTGTAAGAATCATATAATCATGGGCATTGAGCATCCACCTTACGATTATGATATTGCTTCAAGGAGAATTCAGGATGTTCTACTGTTAGATAAAGTTAGTTTAGAACAGGAAACGATCTCAGAAGATCAGTCTTCACAGCACCTTTCAATGAATGGCACAGATAAT
GAAAAAGGTTCAGTCTATGAAGCTTTAGTTGAGGCTATTCACAATTCATGTGAAACAAATGAAAGCTGTAAATCTTCAAATCATCTTGGGAAACAAGGCGATAAATCGGTGTACATGAAAAGCAAGAGCAATGGAGCTTCTGCTCATACCTGTGATACTATGGGAGGTTCCTTGCAAAATATAGCTGAAGACCAAAGTAG
CAATCATTCAGGAGACATTGGTGCTGCAAGAATTGGGAAGCTTCCTGTTTTCCATGGGAGCATTGTGATGGCTTTTTCAGATACGTTTATCAAATCAATGGAGAGAATGAGTGGATACTTAAGAAGAAAGTTTAAGCAACTTGCTAATGAATTTGTAGCAGGTGCACAGGAAAAAGCACATGTTGCAGGCTCAGAGCACC
TATTTCCTGTTATCTTAGATTCTGTCTACTTCAAGAATGGAACTCTAATGCTGTTAGGCTATGGGGATGAAGAACCCAGGGTCATGGAGAATATCAATGGGCACCTAAAATTTCATAGTAGATACGAACGTTTATATGCACAACTAAGTGGGAGGCCAAAGGAGTGGCGAACTGGAATGCCATTAAAAGATGGGGGAGAG
TTGTTTTTAAATGTATTTGTTGACCACACACAACAGAAGTGGCATGTCAACATCAAAGGGAAGAATCTCTTTGCTCCGCTTTTTGAAAACTTGCTGGAGATTCCAATTGTTTGGTCTAATGGCAGGGCCAGCGGAGAGGTCCACATTTGTTTATCAAGGGGTGAACATTTTCCCAACTTGCACGGGCAGATTGATGTGAG
AGGATTGGAGTTTCAAATTTTGGATACACCCTCATCCTTTTCTGTTCCAAATGTTGAAGTCAATGCTCTTATGAGGACCCTTGATGCAAAGCCTCTGTTGTTTCCTTTGGCGGGTTCACTGAAAGCTGTTTTCAATTGTCAAGGCCCATTGGATATTCCTGTATTCGTAGGTGGTGGCATAATGTCAAAAAAAAACAATC
ATTTCATATCAAACATGCCTTCCTCTGCCGCAGCTGAAGCACTCATGCGAAACAAGGAGGCTGGGGCAGTAGCGGCTATAGGTCATGTGCCATTCTCATATGTCTCAGCGAATTTTACTTTCAACACTGATAATCGCgtgagtttcaatgatcacttttttgaaaatttttgtttgtcaaaagaagcttttagttagaag
tgaattgtaggtgactagaagcagagtttttatgggtgaattggtgaagtgcttctatatgatctgttgaagttgtggttctttatgaaaagtaatttctcattgtgttcaagtattctattcattcaaagccattggagggtattgcaacctgcttaatgttgacttcgataaaacttgttagatgctctgtgggaagt
tgtgtgttggccaaggagaatctaatgccaaaagaattttaacttcctactattttgcagATCACAGACTTGTATGGTATTCGAGCAACACTAATAGATGGTGGCGAAATACGCGGTGCTGGAAATGCTTGGATTTGTCCAGAGGTTTATGAATCTATGGGTTTTATTTTTATTTTATTCATTTATGGTTGATAGCAATA
GAGGCTTGTACATTTTGAAATGTTTATATGTTGTGCAATATGCAATCAGAATTAAAGGTATCCAATAAAAGAGGTTTTTTTTTCTGTTTAAAAATCATTCAAATTTTTATAGGTTTCTTTAGAAAAGATAACAATGAAACTTGTGAGTAGTTGAGAACATAGATGAAATAATCTCTGATTATTCGAATTAGCCCCAGTGC
AATCAACAAAATGATTACATCTAAATGATTAATTCGTTTAACACTACAGGTGTGCTAAGGTTGCCTGACTTTTCCTGATTATTTCTGATTATTTCCCAATTCTTGCCGATTTAATCTTTTTGGAACCTTCACTGATTAATTGCTGGTTACGATTATTTCATCTATGGTTGAGATATTGTTGTCAGGAAAAAGAATTAGGA
TCAATTGTTACAAGCATATGATAACTTTTTGCTCTTATCTTTTGTTTAAGCTGTAAATATAGATGCTCTAATGTTCCATTAGGGTGAAAATAGAAGGAAAACCAATATAATATTATAATCTTTTGTGGGCAAATGTTTTCACAGACTATCGTTATTATAATTTATAGGTGTAGTTTAGGTGCACTTTGTTGCCTGAAAAA
CTAACACCCCTACGTGTAAGCTTCTCACCAGGATGTAGTCAAGTGCACTATTGAAATTTCACCACTGTCAGTAACTAAAATTTACCTTCACTTCAGCACTTAAATAAAATAATCCAAGTGCTAAGGGGGATTCCCTTGTTAGCATGTTTGTAGCTTGGAGGCACT
Intron 3 GTATGTTGTT ... TTGTTTCAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 69.7 | 5 | 13 | 10 |
| A2 | 82.61 | 2 | 10 | 9 |
| A3 | 80.49 | 4 | 18 | 15 |
| A4 | 75 | 3 | 7 | 11 |
| A5 | 100 | 0 | 4 | 4 |
| A6 | 86.52 | 6 | 38 | 39 |
| A7 | 72 | 14 | 39 | 33 |
| A8 | 78.13 | 14 | 52 | 48 |
| A9 | 74 | 13 | 40 | 34 |
| A10 | 87.76 | 3 | 23 | 20 |
>TRINITY_DN41512_c0_g1_i5 from sample A6 / Example spliced isoformGGCGGATACTTCTGAGGAATCAAGGAGATCTTGGAATCATGCGAAGAGGTGAAGTTCAGTGAATTTGTGGCAAGACACATTGGTGAGATGGAAGGCATACTGTTAGAAGCAGAGACAGGAGATTTTCTTGGGAAGCACAGAGGATTTTGGTTTTATACAATTGGGCAGCGCCAAGGTCTCCACCTTTCCGGAGGACCATG
GAATTATTTTTCTATCGACAAGAAGAGGAGCTTATTTCATGTCAGCTCATTAAAATGGATTTTAGGTGCTCCTCCAGAAGATTTTGACCGGCTACAATGCAAGGTGCGTCATGGACCAAAATTTTATGACTGTCATCTGGAGCTTGTAAAAGGAAACCTTTCTAAAGAAAATGAACATCAGATCTTGGGAGAGACCGCTC
AAGAGATAGCTATTGTTAGGCTATCAGAAGATGATCAAGGACTTGCAGCAGGACAATATGTAGCTTTCTACAAGCGAAATATTTGTTTAGGTTCAGGGATTATTATTGATTCTTGGGGAGACCATAATTTCCCAGTTTGCTCCAAGGCTCTTGAGATAGCAAGAATGAAAGACAAATCTGAACTAAGGAAGCCAGTTAAA
ATAAAAACTCTCCCCGATAACACTTCCAAGAGGAACCCAAACAATGGAAATATTTTGCAGTCAAGTGGACGGACCGAATTCTGTAAAATTTCTTAGCAATTCATTAACTGTAGTAGGTCAGAAAGCAAATTTTGGTCGGTGTCAAGCACATAATAAACTTGGTTTCTCCTTGTTTCAAAATCTTCAATAGAATGTCCTAA
ATGTAAAAGAAATTATTTTGTTCACCTGATCAAATTTTAAAGCGATAGCAGTTGGGTAAAAATATCTGGGAATCTCTTCCTCCCGCTTAACACCTTTGCTGCTATGTGGTAAATGTATTATTTCAACATCCAATTAAACGTGTTTTGTCATTTTAAGGCGGA
>TRINITY_DN41512_c0_g1_i10 from sample A6 / Example unspliced isoform:TGTGTCTTTCTTGAGTCTGGACGTCGATGTTTACGTCTTAGTCTGCGTCTGCTTGCTGAGGACGGTGGTCAAGCAGCCCCGCCATTGTACACCCTGTAAGAGACCATAGCTCACGCTTCCATTCTTCAATTTTTTCTCTGTTATAATTGTGGCTCTCTTGAAAAACACGGCTGCAACCACGACAGACAATAGAACCAGAG
TGGCCACTGTAACACTGGCAATCCATCCGAGTTTGTAACACCGGCAATCCATCCTCGACTCGAACTCTTGGAACACAATTTAGCAAACGAAAGGGTGAAGCGAGATATCGAGGGGAGCGCCATGCCTTCTGTGGTGAAGCATCTTCTCCTGTAGATGACTCTGTAGATCGATTTTCTGAGATATGAGCGGCTTCTGTGGG
ATCAGCAAGCCGGCCATCACTCGGAGGGGAAAATGACGTTTGCTATGGAAGGACATCTACAGGATGCTGCTCGAACGCCCTTTCTAATTTAAAGACCTCTGGAAGGACCTCTACCGGTGAAGTTCAGTGAATTTGTGGCAAGACACATTGGTGAGATGGAAGGCATACTGTTAGAAGCAGAGACAGGAGATTTTCTTGGG
AAGCACAGAGGATTTTGGTTTTATACAATTGGGCAGCGCCAAGGTCTCCACCTTTCCGGAGGACCATGgtatgttgttgcaaaagatgttgagaacaatgtcgtatttgtttcaagGAATTATTTTTCTATCGACAAGAAGAGGAGCTTATTTCATGTCAGCTCATTAAAATGGATTTTAGGTGCTCCTCCAGAAGATTT
TGACCGGCTACAATGCAAGGTGCGTCATGGACCAAAATTTTATGACTGTCATCTGGAGCTTGTAAAAGGAAACCTTTCTAAAGAAAATGAACATCAGATCTTGGGAGAGACCGCTCAAGAGATAGCTATTGTTAGGCTATCAGAAGATGATCAAGGACTTGCAGCAGGACAATATGTAGCTTTCTACAAGCGAAATATTT
GTTTAGGTTCAGGGATTATTATTGATTCTTGGGGAGACCATAATTTCCCAGTTTGCTCCAAGGCTCTTGAGATAGCAAGAATGAAAGACAAATCTGAACTAAGGAAGCCAGTTAAAATAAAAACTCTCCCCGATAACACTTCCAAGAGGAACCCAAACAATGGAAATATTTTGCAGTCAAGTGGACGGACCGAATTCTGT
AAAATTTCTTAGCAATTCATTAACTGTAGTAGGTCAGAAAGCAAATTTTGGTCGGTGTCAAGCACATAATAAACTTGGTTTCTCCTTGTTTCAAAATCTTCAATAGAATGTCCTAAATGTAAAAGAAATTATTTTGTTCACCTGATCAAATTTTAAAGCGATAGCAGTTGGGTAAAAATATCTGGGAATCTCTTCCTCCC
GCTTAACACCTTTGCTGCTATGTGGTAAATGTATTATTTCAACATCCAATTAAACGTGTTTTGTCATTTTAAGGCGGA
Intron 4 GTCCACATTT ... TATGTGCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 58.91 | 62 | 80 | 97.8 |
| A2 | 73.4 | 27 | 66 | 83 |
| A3 | 55.04 | 63 | 70 | 84.3 |
| A4 | 49.1 | 74 | 62 | 80.8 |
| A5 | 58.9 | 30 | 38 | 48 |
| A6 | 66.67 | 3 | 2 | 10 |
| A7 | 62.96 | 10 | 13 | 21 |
| A8 | 42.86 | 4 | 4 | 2 |
| A9 | 60.98 | 8 | 9 | 16 |
| A10 | 52.38 | 10 | 8 | 14 |
>TRINITY_DN110670_c0_g1_i6 from sample A3 / Example spliced isoformATTGAAGAAACATGACAATATTATTTTACTTTTCCTTTTAATTTATGTTTCATTTGACGAATTGAAAAAACTTGATAATATGACACTTTTCGCAGTTCACTTCTAGATATTTGTCCAGCTCTTCGATCCTGGATATTATCTCCAAATTTCGCGATTAGCCGCGCTGTAATTTCTCTCGAGAGTCAGGTGCTTCACGGACT
TGAAATGGCGTGCCGATTAGAGCTCAACATCATCTTATTTGGTGCAGATTCGGACTCATTTTGGCGGCTTTTTTCGATTAAATGAATGACAACTTGTCATGAAGAAATTACAGAGGTAAGGAGCTAAATATTGAAATTTTCACGGAGAAATTTGATTTACAGTAATAAATATATATTTACAGAGAGAGAGAGAGCCCGAA
ATCCAATTTTCAGAAAGGTGCAGACGGTGAAACTTAAATTCCAGGGAACATTCGGGTTTTCATTGGCACCTGATGGATAGGAAAACCGTTAATGGACTGCAATTTGGGCGTCCTTATGCAACGGGGTAATCTGATATTTAGTAAGCTTGATATACATGGAAATTTAAATTTCGGTGCGTGTTAGGGTTTTCTGAGAAGTG
TGGCACTGGTGTTCAGAGATATTTAATTTAGTTCTGTATCTGCGGGGCTTCATGTAATAAAACAAATCTGAAGATGAAATTGGAAATGCGGGATTTGGGATAGTTGGAGGCATGCGAATGGACTTTCACGCCTCCGGTCAGGGTTTCCAGGAATAAGTTCCAGTAGTTATGGTGTTTTGATTGTTCTTTTCGATTATAAG
ATGTCCGGGAGGGCGACATGTCAGTTCTCAACGGTAATTTGATGTTTTATTTGAATGCAACAATGCCCTCCCGTGGTCAGAGTTCATGCCTAGGGCAGCCTGTTAATTTAGCTGATTTCAGAACTTGTAGCAGAAGAGCGAGGGGATTTGAGCAGTTAGATAATCAGTTTCTTGGGATTCCAATAAGGAAGTTTCAATCT
CCGCTGAAACATATAGTTTTCGAACATAAGAGGCAAACATCAAACACGTTTATGGACCATGTAAGCAAAGTGAGGATCTTTCGCTGCGAGCGAAAATCCCCATTTTTACTGAACTATACGAAATTCAACGTGATAGGGAAATTTATGGGAAGAAAACTAAATTTGCAGAACAGATTACAATGCCATTGCCGCCGAGATAA
AGACAGTATTAAGGCTCGTGTTTCTGAATGGAAGGCTCCCTTTTCTCAATGGAGGGAAGGAATATTTTTTGTCCGTTGTTCTGCATTTGTCGCGACAATCGCCGTTCTTGGAATGTTGTTTTTCTATGGACAAGTCAGAGCCCAAGCGTATATTAATGAAAGAATATTACCTTCTGTGGCGACTGTCATGGGCGATTACC
TTGGGAGGAAACTTAACCTTGGAAGGGTTCATAGGATTTCTCCTCTTGGGTTTGCATTGGAATCCTGTTCCTTAGGTCCTCATTCTGAAGAGTTTTCTTGCGGGGAGCTTCCAAATGTTAAAGTTCGCATTCGGCCTTGGGCCAGCCTACAGCGGGGACAGGTAGTAGTTGATGCTGTTTTGTTACAACCGCATGTTTTG
ATTGCCCAGAAAGAGGACTGGTCATGGCTTGGTATCCCAACCCCCTTAGAAAAACCTGTGGTGAAGCATAAATCGAATGAGGAGGGTATCGATCCTCGTACAAAAGCTAGGAGGCTTGCAAGAGAGCAAGCTGCTATTCGTTGGGCAGAAGAAAGGAATGAGGCAGCAAGGAAATGGGCACAAAAAGGCTATAACTTTGT
TGGTGTTGAGGAGACAAGGTCCCCAGGAAAGGTTGACGCAGTGCACACAGAAGACATGGTAAACTGTGATTACATGAATTGCTTCAAGGAAGAGATTACAATAGAAAGTTGTTTTGGAGGCAAACCAGGTAGACAAGAACACTTGCATCATAAATGTACAGAAGGTGTCTGTAGTAAGAGTGCGATGGAGAGGTCTGAGT
TTGATAGGGCCTTTGAGCACAGTACTCTAAATAGGCCTTTTAGTTTGAGAAGTCCTGTTCCAGTTGTAAGAACTTGGTTAAAGGAAAATATGGTGAAACCTATACGACACCGATTCAAGAGGTCAATCCAAAAGAGTGCACCTTTGTCTCAGAAAGCGACAATGCAGAGAAGAAACCTTGATCGCAGTGCTGCAGCAGCA
AGGAAATACTTTGATGAAATGGACAAGAAGCAGAATTCTGGTGCAGACAAAGGAAAGGGTTATATTGGAAATTCTGGAGCATTTGTAAATCCAGAGCTGGTCTCTTCCTTTATAAGTGTGAGAGAGGACAGTCAGAAGGGTGTGATGGAAGAGCAGGATAAAGATTGTAGTGAGCATATTGTCATGAATGTGGACAAATA
TAATTGCCCACCAACTATTCACAGAAATGAAGAACTTTCAGCTTGTCCCATTTCAATGGACAAAGGGGATCTATCAAAGTTTGTCAAGATGGATTGTAAGAATCATATAATCATGGGCATTGAGCATCCACCTTACGATTATGATATTGCTTCAAGGAGAATTCAGGATGTTCTACTGTTAGATAAAGTTAGTTTAGAAC
AGGAAACGATCTCAGAAGATCAGTCTTCACAGCACCTTTCAATGAATGGCACAGATAATGAAAAAGGTTCAGTCTATGAAGCTTTAGTTGAGGCTATTCACAATTCATGTGAAACAAATGAAAGCTGTAAATCTTCAAATCATCTTGGGAAACAAGGCGATAAATCGGTGTACATGAAAAGCAAGAGCAATGGAGCTTCT
GCTCATACCTGTGATACTATGGGAGGTTCCTTGCAAAATATAGCTGAAGACCAAAGTAGCAATCATTCAGGAGACATTGGTGCTGCAAGAATTGGGAAGCTTCCTGTTTTCCATGGGAGCATTGTGATGGCTTTTTCAGATACGTTTATCAAATCAATGGAGAGAATGAGTGGATACTTAAGAAGAAAGTTTAAGCAACT
TGCTAATGAATTTGTAGCAGGTGCACAGGAAAAAGCACATGTTGCAGGCTCAGAGCACCTATTTCCTGTTATCTTAGATTCTGTCTACTTCAAGAATGGAACTCTAATGCTGTTAGGCTATGGGGATGAAGAACCCAGGGTCATGGAGAATATCAATGGGCACCTAAAATTTCATAGTAGATACGAACGTTTATATGCAC
AACTAAGTGGGAGGCCAAAGGAGTGGCGAACTGGAATGCCATTAAAAGATGGGGGAGAGTTGTTTTTAAATGTATTTGTTGACCACACACAACAGAAGTGGCATGTCAACATCAAAGGGAAGAATCTCTTTGCTCCGCTTTTTGAAAACTTGCTGGAGATTCCAATTGTTTGGTCTAATGGCAGGGCCAGCGGAGAGGTT
CCAAATGTTGAAGTCAATGCTCTTATGAGGACCCTTGATGCAAAGCCTCTGTTGTTTCCTTTGGCGGGTTCACTGAAAGCTGTTTTCAATTGTCAAGGCCCATTGGATATTCCTGTATTCGTAGGTGGTGGCATAATGTCAAAAAAAAACAATCATTTCATATCAAACATGCCTTCCTCTGCCGCAGCTGAAGCACTCAT
GCGAAACAAGGAGGCTGGGGCAGTAGCGGCTATAGGTCATGTGCCATTCTCATATGTCTCAGCGAATTTTACTTTCAACACTGATAATCGCATCACAGACTTGTATGGTATTCGAGCAACACTAATAGATGGTGGCGAAATACGCGGTGCTGGAAATGCTTGGATTTGTCCAGAGGGTGAGATAGATGACTCTGCAGTTG
ATTTTAATTTTTCGGGAAATGTTGATTTTGACAATGTGGTTCGACACTACCTTCCTAATGGAATCCAAGCAATGCCTATGAAACTTGGCTATGTAAATGGGGAGGCCAAAGTATATGGTTCGATTTCGAGAATGCGGTATGACGTCAAATGGACAGCACCAAAGGCTGAAGGCTCTTTCACTGATGCACGTGGCGACATT
ATAATATCTGATGAAGCCATTACTATCAGCTCTTCCTCGATTACGTTTGATCTTCTGACAAAAATCAAAATATCATACCCTAATGGACGCTATTTAAAAAAAGAGGGTTCAGATCTCATCATTGCTGTTGCCCCAGATATCCTGGGTGTTGATGCTGATTTACGTTTGCAAAGATTTGATATTCTTAGTTTGACTCCATT
TAGTCCCATTGGTTCTCCAAAGCTTATGCATATGAAACTGACCGGCAGGGCTAAATTTCATGGATCTGTAGTGGATTCCCTAGATAGATCAGTCGATGAGAACATTGCAGTTCGAGAGGAGATATTGAGTACTGATGAGTTTAGTAGGACGAAAGCATCGGGACTTGTTGGAGATGTACAGTTATCCGGAATAAAATTGA
ATCAACTTCTTGTGGCACCAAATTCGTCAGGGACGTTGGCTATTTTCCCGCAAAATTTCAAGTTAAATGCCACAGGAAGACCAGATGAGAATCTTCTCATTGAAGTTGTCTGTGGTTCAAATCCTCCCAGCTCAGAAACTTCACTTTATGATCTGATGATGAGAAAAGTATACCTTTGTTTACAAAAGGGCCAGCTTAGA
ACCAGCATCTCCTTTCAACCTGGACATTCAGCAAGTTTGGAGGTACGACACTTGGAACTTGATGAACTGGAGCTTGCCTCATTGCGCGGAATGGTACAGAAGG
>TRINITY_DN110670_c0_g1_i9 from sample A3 / Example unspliced isoform:ATTGAAGAAACATGACAATATTATTTTACTTTTCCTTTTAATTTATGTTTCATTTGACGAATTGAAAAAACTTGATAATATGACACTTTTCGCAGTTCACTTCTAGATATTTGTCCAGCTCTTCGATCCTGGATATTATCTCCAAATTTCGCGATTAGCCGCGCTGTAATTTCTCTCGAGAGTCAGGTGCTTCACGGACT
TGAAATGGCGTGCCGATTAGAGCTCAACATCATCTTATTTGGTGCAGATTCGGACTCATTTTGGCGGCTTTTTTCGATTAAATGAATGACAACTTGTCATGAAGAAATTACAGAGGTAAGGAGCTAAATATTGAAATTTTCACGGAGAAATTTGATTTACAGTAATAAATATATATTTACAGAGAGAGAGAGAGCCCGAA
ATCCAATTTTCAGAAAGGTGCAGACGGTGAAACTTAAATTCCAGGGAACATTCGGGTTTTCATTGGCACCTGATGGATAGGAAAACCGTTAATGGACTGCAATTTGGGCGTCCTTATGCAACGGGGTAATCTGATATTTAGTAAGCTTGATATACATGGAAATTTAAATTTCGGTGCGTGTTAGGGTTTTCTGAGAAGTG
TGGCACTGGTGTTCAGAGATATTTAATTTAGTTCTGTATCTGCGGGGCTTCATGTAATAAAACAAATCTGAAGATGAAATTGGAAATGCGGGATTTGGGATAGTTGGAGGCATGCGAATGGACTTTCACGCCTCCGGTCAGGGTTTCCAGGAATAAGTTCCAGTAGTTATGGTGTTTTGATTGTTCTTTTCGATTATAAG
ATGTCCGGGAGGGCGACATGTCAGTTCTCAACGGTAATTTGATGTTTTATTTGAATGCAACAATGCCCTCCCGTGGTCAGAGTTCATGCCTAGGGCAGCCTGTTAATTTAGCTGATTTCAGAACTTGTAGCAGAAGAGCGAGGGGATTTGAGCAGTTAGATAATCAGTTTCTTGGGATTCCAATAAGGAAGTTTCAATCT
CCGCTGAAACATATAGTTTTCGAACATAAGAGGCAAACATCAAACACGTTTATGGACCATGTAAGCAAAGTGAGGATCTTTCGCTGCGAGCGAAAATCCCCATTTTTACTGAACTATACGAAATTCAACGTGATAGGGAAATTTATGGGAAGAAAACTAAATTTGCAGAACAGATTACAATGCCATTGCCGCCGAGATAA
AGACAGTATTAAGGCTCGTGTTTCTGAATGGAAGGCTCCCTTTTCTCAATGGAGGGAAGGAATATTTTTTGTCCGTTGTTCTGCATTTGTCGCGACAATCGCCGTTCTTGGAATGTTGTTTTTCTATGGACAAGTCAGAGCCCAAGCGTATATTAATGAAAGAATATTACCTTCTGTGGCGACTGTCATGGGCGATTACC
TTGGGAGGAAACTTAACCTTGGAAGGGTTCATAGGATTTCTCCTCTTGGGTTTGCATTGGAATCCTGTTCCTTAGGTCCTCATTCTGAAGAGTTTTCTTGCGGGGAGCTTCCAAATGTTAAAGTTCGCATTCGGCCTTGGGCCAGCCTACAGCGGGGACAGGTAGTAGTTGATGCTGTTTTGTTACAACCGCATGTTTTG
ATTGCCCAGAAAGAGGACTGGTCATGGCTTGGTATCCCAACCCCCTTAGAAAAACCTGTGGTGAAGCATAAATCGAATGAGGAGGGTATCGATCCTCGTACAAAAGCTAGGAGGCTTGCAAGAGAGCAAGCTGCTATTCGTTGGGCAGAAGAAAGGAATGAGGCAGCAAGGAAATGGGCACAAAAAGGCTATAACTTTGT
TGGTGTTGAGGAGACAAGGTCCCCAGGAAAGGTTGACGCAGTGCACACAGAAGACATGGTAAACTGTGATTACATGAATTGCTTCAAGGAAGAGATTACAATAGAAAGTTGTTTTGGAGGCAAACCAGGTAGACAAGAACACTTGCATCATAAATGTACAGAAGGTGTCTGTAGTAAGAGTGCGATGGAGAGGTCTGAGT
TTGATAGGGCCTTTGAGCACAGTACTCTAAATAGGCCTTTTAGTTTGAGAAGTCCTGTTCCAGTTGTAAGAACTTGGTTAAAGGAAAATATGGTGAAACCTATACGACACCGATTCAAGAGGTCAATCCAAAAGAGTGCACCTTTGTCTCAGAAAGCGACAATGCAGAGAAGAAACCTTGATCGCAGTGCTGCAGCAGCA
AGGAAATACTTTGATGAAATGGACAAGAAGCAGAATTCTGGTGCAGACAAAGGAAAGGGTTATATTGGAAATTCTGGAGCATTTGTAAATCCAGAGCTGGTCTCTTCCTTTATAAGTGTGAGAGAGGACAGTCAGAAGGGTGTGATGGAAGAGCAGGATAAAGATTGTAGTGAGCATATTGTCATGAATGTGGACAAATA
TAATTGCCCACCAACTATTCACAGAAATGAAGAACTTTCAGCTTGTCCCATTTCAATGGACAAAGGGGATCTATCAAAGTTTGTCAAGATGGATTGTAAGAATCATATAATCATGGGCATTGAGCATCCACCTTACGATTATGATATTGCTTCAAGGAGAATTCAGGATGTTCTACTGTTAGATAAAGTTAGTTTAGAAC
AGGAAACGATCTCAGAAGATCAGTCTTCACAGCACCTTTCAATGAATGGCACAGATAATGAAAAAGGTTCAGTCTATGAAGCTTTAGTTGAGGCTATTCACAATTCATGTGAAACAAATGAAAGCTGTAAATCTTCAAATCATCTTGGGAAACAAGGCGATAAATCGGTGTACATGAAAAGCAAGAGCAATGGAGCTTCT
GCTCATACCTGTGATACTATGGGAGGTTCCTTGCAAAATATAGCTGAAGACCAAAGTAGCAATCATTCAGGAGACATTGGTGCTGCAAGAATTGGGAAGCTTCCTGTTTTCCATGGGAGCATTGTGATGGCTTTTTCAGATACGTTTATCAAATCAATGGAGAGAATGAGTGGATACTTAAGAAGAAAGTTTAAGCAACT
TGCTAATGAATTTGTAGCAGGTGCACAGGAAAAAGCACATGTTGCAGGCTCAGAGCACCTATTTCCTGTTATCTTAGATTCTGTCTACTTCAAGAATGGAACTCTAATGCTGTTAGGCTATGGGGATGAAGAACCCAGGGTCATGGAGAATATCAATGGGCACCTAAAATTTCATAGTAGATACGAACGTTTATATGCAC
AACTAAGTGGGAGGCCAAAGGAGTGGCGAACTGGAATGCCATTAAAAGATGGGGGAGAGTTGTTTTTAAATGTATTTGTTGACCACACACAACAGAAGTGGCATGTCAACATCAAAGGGAAGAATCTCTTTGCTCCGCTTTTTGAAAACTTGCTGGAGATTCCAATTGTTTGGTCTAATGGCAGGGCCAGCGGAGAGgtc
cacatttgtttatcaaggggtgaacattttcccaacttgcacgggcagattgatgtgagaggattggagtttcaaattttggatacaccctcatccttttctgctttaaatggaagcctatgttttcgtggtcagagaatattcttgcacaatgcaagttgtttctttggtgaagtgccgttggatgtttcaggagattt
tggaataaatcccgaggatggagagtatcaccttatgtgccagGTTCCAAATGTTGAAGTCAATGCTCTTATGAGGACCCTTGATGCAAAGCCTCTGTTGTTTCCTTTGGCGGGTTCACTGAAAGCTGTTTTCAATTGTCAAGGCCCATTGGATATTCCTGTATTCGTAGGTGGTGGCATAATGTCAAAAAAAAACAATC
ATTTCATATCAAACATGCCTTCCTCTGCCGCAGCTGAAGCACTCATGCGAAACAAGGAGGCTGGGGCAGTAGCGGCTATAGGTCATGTGCCATTCTCATATGTCTCAGCGAATTTTACTTTCAACACTGATAATCGCATCACAGACTTGTATGGTATTCGAGCAACACTAATAGATGGTGGCGAAATACGCGGTGCTGGA
AATGCTTGGATTTGTCCAGAGGGTGAGATAGATGACTCTGCAGTTGATTTTAATTTTTCGGGAAATGTTGATTTTGACAATGTGGTTCGACACTACCTTCCTAATGGAATCCAAGCAATGCCTATGAAACTTGGCTATGTAAATGGGGAGGCCAAAGTATATGGTTCGATTTCGAGAATGCGGTATGACGTCAAATGGAC
AGCACCAAAGGCTGAAGGCTCTTTCACTGATGCACGTGGCGACATTATAATATCTGATGAAGCCATTACTATCAGCTCTTCCTCGATTACGTTTGATCTTCTGACAAAAATCAAAATATCATACCCTAATGGACGCTATTTAAAAAAAGAGGGTTCAGATCTCATCATTGCTGTTGCCCCAGATATCCTGGGTGTTGATG
CTGATTTACGTTTGCAAAGATTTGATATTCTTAGTTTGACTCCATTTAGTCCCATTGGTTCTCCAAAGCTTATGCATATGAAACTGACCGGCAGGGCTAAATTTCATGGATCTGTAGTGGATTCCCTAGATAGATCAGTCGATGAGAACATTGCAGTTCGAGAGGAGATATTGAGTACTGATGAGTTTAGTAGGACGAAA
GCATCGGGACTTGTTGGAGATGTACAGTTATCCGGAATAAAATTGAATCAACTTCTTGTGGCACCAAATTCGTCAGGGACGTTGGCTATTTTCCCGCAAAATTTCAAGTTAAATGCCACAGGAAGACCAGATGAGAATCTTCTCATTGAAGTTGTCTGTGGTTCAAATCCTCCCAGCTCAGAAACTTCACTTTATGATCT
GATGATGAGAAAAGTATACCTTTGTTTACAAAAGGGCCAGCTTAGAACCAGCATCTCCTTTCAACCTGGACATTCAGCAAGTTTGGAGGTACGACACTTGGAACTTGATGAACTGGAGCTTGCCTCATTGCGCGGAATGGTACAGAAGGCAGAACTCGAACTTAATTTTCACAAAAGGAAAGGTCAAGGAAATGTATCTG
TTATGCGGCCAAGGTTCAGTGGTGTGCAAGGTGAATCCTTGGATGTTTCTGCTCGTTGGTCAGGTGATGTGATTACACTTGAGAAGTCTGTACTCGAACAAGCTTGTAGCAAGTATGAACTGCAGGGTGAATATGTGCTGCCGGGAACACGTGATCGTAGTCCTGGTGAAAGAGAAAAAGGAGGAATGCTGAAGAGGGCA
ATGGCTGGACAGCTTGGAAGCCTTATTACATCTTTGGGAAGGTGGCGACTACGATTAGAAGTTCCTGTGGCTGAAGTCGCTGAGATGCTGCCATTTGCTCGTCTGCTTTCCAGGAGCAGTGATCCCGCAGTTCTTTCTAGGTCGAAGGAGTTATTTATTCAAGGTGTACAAAATGTTGGGTTCTTTGCTGAGAATCTCCA
AAAACAATTAGAGGATACAAAAGGGAGCACTGAATATCTTCCTTTTGAGGAAGGAGCCCCAGAGGCAATACCTCTTCCAGGGTTAGCTGAATTAAAGGGCCGTTGGCATGGAAGTCTGGATGCTAGTGGAGGCGGCAATGGAGATACTACAGCAGACTTCGACCTCCATGGTGAAGAATGGGAGTGGGGAGCTTATAAGT
CTCAACAGGTTATTGCAGTTGGAAGCTACAGTAATAACAATGGTTTGCGTCTTGATAAGATCTTGATACAAAGAGACAAAGCAACTATTCATGCAGATGGGACGTTATTAGGACCGAGGACTAATCTTCATTTTGCTGTTCTAAATTTTCCTGTTGGATTAGTTCCTTATTTATTACAGGCATTTGAGTCTTCAACTATG
GATCCTATGCCTTCTTCATGGACACCTCTAACACCTCTGAAAGGGATTTTACATATGGAAGGAGATCTAAGAGGAAGTCTTGCAAAGCCACAATGTGATGTACAAGTAAGACTTTTAGACGGAGCTATTGGAGGTGTTGACCTTGAACGAGCTGAAGTGGTTGCTTGTATTACATCAGCAAATCGCTTTGTATTTGATGC
AAACTTTAGACCTGTAATCCAGAGTGGGCATGTGCATGTTATTGGAAGTCTTCCTGTGCCTCCTTTGGGAAATGATATGCTAGTAGAAGAGAATATGGAGATGGAGCCAGATCAGCCAATTTGGTCAAGGGAATGGGTACGTGATAAGGGAGATCTTACTATTAAAAATGATATCAATGTAAAAAAATTTGGGAGAGAGA
GAGGAGATAAAGGCTGGGAAGTTCAATTGACAGAAAGTTTAAAGGGTTTGGATTGGAACCTAATGGAGACAGGTGCAGTTAAGGTGGATGCAACTGTTAAAGATGGTGGGATGATGTTAATTACTGCACTGTCTCCTTATGTCCGTTGGCTACATGGCAGTGCTGACATTGTTTTGCAGGTAAGAGGAACTGCAGATCAG
CCCATATTTGATGGAGCTGCAACATTTCATAGGGCATCTGTATCTTCACCGGTGCTTCCAACACCACTTTCAAATTTTGGAGGCACGATTAATGTCAGGAGTAATGAGTTATCAATTAATGGCTTGGAAGGACGAGTTGGTAGAAAAGGACGCTTGTTAGTCAAAGGGAATTTGCCTCTCAGAACAAGAAAAATTTCTTT
GGGAGATAAGATTGAGATGAAGTCAGAGAGCCTGGAAGTGCGAGCCAAAAATATATTCAGTGGTCAGGTGGACAGCCAAATACAGGTCGCGGGTTCAATACTGGAGCCAGAGGTCTCAGGAATGATTAAGCTTAGTGGTGGAGTGGCATTCTTGCCACAAGAAAAGGGCACAGGACCCGCTATCCCTCGTTTGGCTTCAA
ATCCGAAGAGCCTTTCAACTGGCCGTATTACAGCTGCAGGAAATATTGCTCGCTTTTACAGTACACAATCTGCTTTTTTGCCTGTCAATGTGCCTGTCAAGACATCAGATACACAGGAAAAAGTTGAGAAAACTAAAGAGCAAAGCAAAAGCAACCCAAAAATAGCTGTCCACATGAGGGACCTTAAACTTCATCTTGGA
CCTGAGTTGAGAATTGTTTATCCTTTGATACTGAACTTTGCTGTTAGCGGTGAACTTGAGCTTAGTGGCTTGGCTGATCCTAAGCTCATCAAACCCAAAGGGACTCTTACATTTGAAAATGGAGATGTAAATCTTGTTGCTACTCAGGTGAGGCTCAAACGAGATCATCCAAATAGAGCCAAATTTGAACCTGATGAGGG
CTTGGATCCAACTTTGGACTTAGCCTTGGTTGGAGCAGATTGGCAACTAAAGATTCAGGGTCGTGCAAGTAACTGGCAGGACAACTTGGTTGTGACTTCAACACGTTCTGGAGAGCAAGATGTGCTTTCACCTATCGAGGCTGCTCGTGTCTTTGAAAGTCAGCTAGCAGAATCCTTGTTGGAAGGTGATGGCCAACTTG
CCTTCAAAAAGTTGGCAGCGGCTACTCTTGAAACCTTGATGCCAAGAATAGAAGGAAAGGGAGAATTTGGACAAGCACGGTGGAGAATTGTATCTGCTCCTCAGATCCCAAATCTTTCCCTTGATCCCCAAGTTGACCCATTGAAATTGTTGTCCAATATTGCCGTTGGAGCTGAAGTGGAAGTGCAGTTTGGTAAACAT
TTGCAGGCTTCAGTTGTAAGGCAGCTAAAGGAATCAGAAATGGCCACACATTGGACTTTGCTCTACCAGCTTAGCAGTAGGTTGAGGATTCTCTTTCAATCTATCCCCTCTGGTGACAAGCGTTTGCTATTTGAGTACTCCGCAACCTCACAAAGTTGATTTCCTTAGCAGCTTCTCTGAAGTTTACTCGTGTTGTTGCA
AACGATGGCATTGCATTTCTTGTACATTATGGAACGATATACAACTGTAATATGGAAGGAATATTTTAATAAAGATGTGACACTAGCTACAGGATTCATTAGGTGCAGGGTGTATATAGCCCATTCTGTCCCAGAGCTCAAAGCAGGGCTTACATACATGTAACATAGCTTTATGCAATGGATCTACAAGTGAAACAACT
ATTTTTATTACCAAATTCAATGGTTCTTTCCTACTGTCAAATTG
Intron 5 GCAGACTTCG ... TGTTTTGCAG
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| A5 | 65.43 | 14 | 23 | 30 |
| A6 | 73.17 | 11 | 23 | 37 |
| A7 | 78.4 | 23 | 62 | 105 |
| A8 | 69.84 | 19 | 11 | 77 |
| A9 | 68.28 | 23 | 26 | 73 |
| A10 | 79.31 | 15 | 35 | 80 |
>TRINITY_DN112736_c0_g6_i5 from sample A2 / Example spliced isoformGTTTCATTTGACGAATTGAAAAAACTTGATAATATGACACTTTTCGCAGTTCACTTCTAGATATTTGTCCAGCTCTTCGATCCTGGATATTATCTCCAAATTTCGCGATTAGCCGCGCTGTAATTTCTCTCGAGAGTCAGGTGCTTCACGGACTTGAAATGGCGTGCCGATTAGAGCTCAACATCATCTTATTTGGTGCA
GATTCGGACTCATTTTGGCGGCTTTTTTCGATTAAATGAATGACAACTTGTCATGAAGAAATTACAGAGGTAAGGAGCTAAATATTGAAATTTTCACGGAGAAATTTGATTTACAGTAATAAATATATATTTACAGAGAGAGAGAGAGCCCGAAATCCAATTTTCAGAAAGGTGCAGACGGTGAAACTTAAATTCCAGGG
AACATTCGGGTTTTCATTGGCACCTGATGGATAGGAAAACCGTTAATGGACTGCAATTTGGGCGTCCTTATGCAACGGGGTAATCTGATATTTAGTAAGCTTGATATACATGGAAATTTAAATTTCGGTGCGTGTTAGGGTTTTCTGAGAAGTGTGGCACTGGTGTTCAGAGATATTTAATTTAGTTCTGTATCTGCGGG
GCTTCATGTAATAAAACAAATCTGAAGATGAAATTGGAAATGCGGGATTTGGGATAGTTGGAGGCATGCGAATGGACTTTCACGCCTCCGGTCAGGGTTTCCAGGAATAAGTTCCAGTAGTTATGGTGTTTTGATTGTTCTTTTCGATTATAAGATGTCCGGGAGGGCGACATGTCAGTTCTCAACGGTAATTTGATGTT
TTATTTGAATGCAACAATGCCCTCCCGTGGTCAGAGTTCATGCCTAGGGCAGCCTGTTAATTTAGCTGATTTCAGAACTTGTAGCAGAAGAGCGAGGGGATTTGAGCAGTTAGATAATCAGTTTCTTGGGATTCCAATAAGGAAGTTTCAATCTCCGCTGAAACATATAGTTTTCGAACATAAGAGGCAAACATCAAACA
CGTTTATGGACCATGTAAGCAAAGTGAGGATCTTTCGCTGCGAGCGAAAATCCCCATTTTTACTGAACTATACGAAATTCAACGTGATAGGGAAATTTATGGGAAGAAAACTAAATTTGCAGAACAGATTACAATGCCATTGCCGCCGAGATAAAGACAGTATTAAGGCTCGTGTTTCTGAATGGAAGGCTCCCTTTTCT
CAATGGAGGGAAGGAATATTTTTTGTCCGTTGTTCTGCATTTGTCGCGACAATCGCCGTTCTTGGAATGTTGTTTTTCTATGGACAAGTCAGAGCCCAAGCGTATATTAATGAAAGAATATTACCTTCTGTGGCGACTGTCATGGGCGATTACCTTGGGAGGAAACTTAACCTTGGAAGGGTTCATAGGATTTCTCCTCT
TGGGTTTGCATTGGAATCCTGTTCCTTAGGTCCTCATTCTGAAGAGTTTTCTTGCGGGGAGCTTCCAAATGTTAAAGTTCGCATTCGGCCTTGGGCCAGCCTACAGCGGGGACAGGTAGTAGTTGATGCTGTTTTGTTACAACCGCATGTTTTGATTGCCCAGAAAGAGGACTGGTCATGGCTTGGTATCCCAACCCCCT
TAGAAAAACCTGTGGTGAAGCATAAATCGAATGAGGAGGGTATCGATCCTCGTACAAAAGCTAGGAGGCTTGCAAGAGAGCAAGCTGCTATTCGTTGGGCAGAAGAAAGGAATGAGGCAGCAAGGAAATGGGCACAAAAAGGCTATAACTTTGTTGGTGTTGAGGAGACAAGGTCCCCAGGAAAGGTTGACGCAGTGCAC
ACAGAAGACATGGTAAACTGTGATTACATGAATTGCTTCAAGGAAGAGATTACAATAGAAAGTTGTTTTGGAGGCAAACCAGGTAGACAAGAACACTTGCATCATAAATGTACAGAAGGTGTCTGTAGTAAGAGTGCGATGGAGAGGTCTGAGTTTGATAGGGCCTTTGAGCACAGTACTCTAAATAGGCCTTTTAGTTT
GAGAAGTCCTGTTCCAGTTGTAAGAACTTGGTTAAAGGAAAATATGGTGAAACCTATACGACACCGATTCAAGAGGTCAATCCAAAAGAGTGCACCTTTGTCTCAGAAAGCGACAATGCAGAGAAGAAACCTTGATCGCAGTGCTGCAGCAGCAAGGAAATACTTTGATGAAATGGACAAGAAGCAGAATTCTGGTGCAG
ACAAAGGAAAGGGTTATATTGGAAATTCTGGAGCATTTGTAAATCCAGAGCTGGTCTCTTCCTTTATAAGTGTGAGAGAGGACAGTCAGAAGGGTGTGATGGAAGAGCAGGATAAAGATTGTAGTGAGCATATTGTCATGAATGTGGACAAATATAATTGCCCACCAACTATTCACAGAAATGAAGAACTTTCAGCTTGT
CCCATTTCAATGGACAAAGGGGATCTATCAAAGTTTGTCAAGATGGATTGTAAGAATCATATAATCATGGGCATTGAGCATCCACCTTACGATTATGATATTGCTTCAAGGAGAATTCAGGATGTTCTACTGTTAGATAAAGTTAGTTTAGAACAGGAAACGATCTCAGAAGATCAGTCTTCACAGCACCTTTCAATGAA
TGGCACAGATAATGAAAAAGGTTCAGTCTATGAAGCTTTAGTTGAGGCTATTCACAATTCATGTGAAACAAATGAAAGCTGTAAATCTTCAAATCATCTTGGGAAACAAGGCGATAAATCGGTGTACATGAAAAGCAAGAGCAATGGAGCTTCTGCTCATACCTGTGATACTATGGGAGGTTCCTTGCAAAATATAGCTG
AAGACCAAAGTAGCAATCATTCAGGAGACATTGGTGCTGCAAGAATTGGGAAGCTTCCTGTTTTCCATGGGAGCATTGTGATGGCTTTTTCAGATACGTTTATCAAATCAATGGAGAGAATGAGTGGATACTTAAGAAGAAAGTTTAAGCAACTTGCTAATGAATTTGTAGCAGGTGCACAGGAAAAAGCACATGTTGCA
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AGATGGGGGAGAGTTGTTTTTAAATGTATTTGTTGACCACACACAACAGAAGTGGCATGTCAACATCAAAGGGAAGAATCTCTTTGCTCCGCTTTTTGAAAACTTGCTGGAGATTCCAATTGTTTGGTCTAATGGCAGGGCCAGCGGAGAGGTCCACATTTGTTTATCAAGGGGTGAACATTTTCCCAACTTGCACGGGC
AGATTGATGTGAGAGGATTGGAGTTTCAAATTTTGGATACACCCTCATCCTTTTCTGCTTTAAATGGAAGCCTATGTTTTCGTGGTCAGAGAATATTCTTGCACAATGCAAGTTGTTTCTTTGGTGAAGTGCCGTTGGATGTTTCAGGAGATTTTGGAATAAATCCCGAGGATGGAGAGTATCACCTTATGTGCCAGGTT
CCAAATGTTGAAGTCAATGCTCTTATGAGGACCCTTGATGCAAAGCCTCTGTTGTTTCCTTTGGCGGGTTCACTGAAAGCTGTTTTCAATTGTCAAGGCCCATTGGATATTCCTGTATTCGTAGGTGGTGGCATAATGTCAAAAAAAAACAATCATTTCATATCAAACATGCCTTCCTCTGCCGCAGCTGAAGCACTCAT
GCGAAACAAGGAGGCTGGGGCAGTAGCGGCTATAGGTCATGTGCCATTCTCATATGTCTCAGCGAATTTTACTTTCAACACTGATAATCGCATCACAGACTTGTATGGTATTCGAGCAACACTAATAGATGGTGGCGAAATACGCGGTGCTGGAAATGCTTGGATTTGTCCAGAGGGTGAGATAGATGACTCTGCAGTTG
ATTTTAATTTTTCGGGAAATGTTGATTTTGACAATGTGGTTCGACACTACCTTCCTAATGGAATCCAAGCAATGCCTATGAAACTTGGCTATGTAAATGGGGAGGCCAAAGTATATGGTTCGATTTCGAGAATGCGGTATGACGTCAAATGGACAGCACCAAAGGCTGAAGGCTCTTTCACTGATGCACGTGGCGACATT
ATAATATCTGATGAAGCCATTACTATCAGCTCTTCCTCGATTACGTTTGATCTTCTGACAAAAATCAAAATATCATACCCTAATGGACGCTATTTAAAAAAAGAGGGTTCAGATCTCATCATTGCTGTTGCCCCAGATATCCTGGGTGTTGATGCTGATTTACGTTTGCAAAGATTTGATATTCTTAGTTTGACTCCATT
TAGTCCCATTGGTTCTCCAAAGCTTATGCATATGAAACTGACCGGCAGGGCTAAATTTCATGGATCTGTAGTGGATTCCCTAGATAGATCAGTCGATGAGAACATTGCAGTTCGAGAGGAGATATTGAGTACTGATGAGTTTAGTAGGACGAAAGCATCGGGACTTGTTGGAGATGTACAGTTATCCGGAATAAAATTGA
ATCAACTTCTTGTGGCACCAAATTCGTCAGGGACGTTGGCTATTTTCCCGCAAAATTTCAAGTTAAATGCCACAGGAAGACCAGATGAGAATCTTCTCATTGAAGTTGTCTGTGGTTCAAATCCTCCCAGCTCAGAAACTTCACTTTATGATCTGATGATGAGAAAAGTATACCTTTGTTTACAAAAGGGCCAGCTTAGA
ACCAGCATCTCCTTTCAACCTGGACATTCAGCAAGTTTGGAGGTACGACACTTGGAACTTGATGAACTGGAGCTTGCCTCATTGCGCGGAATGGTACAGAAGGCAGAACTCGAACTTAATTTTCACAAAAGGAAAGGTCAAGGAAATGTATCTGTTATGCGGCCAAGGTTCAGTGGTGTGCAAGGTGAATCCTTGGATGT
TTCTGCTCGTTGGTCAGGTGATGTGATTACACTTGAGAAGTCTGTACTCGAACAAGCTTGTAGCAAGTATGAACTGCAGGGTGAATATGTGCTGCCGGGAACACGTGATCGTAGTCCTGGTGAAAGAGAAAAAGGAGGAATGCTGAAGAGGGCAATGGCTGGACAGCTTGGAAGCCTTATTACATCTTTGGGAAGGTGGC
GACTACGATTAGAAGTTCCTGTGGCTGAAGTCGCTGAGATGCTGCCATTTGCTCGTCTGCTTTCCAGGAGCAGTGATCCCGCAGTTCTTTCTAGGTCGAAGGAGTTATTTATTCAAGGTGTACAAAATGTTGGGTTCTTTGCTGAGAATCTCCAAAAACAATTAGAGGATACAAAAGGGAGCACTGAATATCTTCCTTTT
GAGGAAGGAGCCCCAGAGGCAATACCTCTTCCAGGGTTAGCTGAATTAAAGGGCCGTTGGCATGGAAGTCTGGATGCTAGTGGAGGCGGCAATGGAGATACTACAGTAAGAGGAACTGCAGATCAGCCCATATTTGATGGAGCTGCAACATTTCATAGGGCATCTGTATCTTCACCGGTGCTTCCAACACCACTTTCAAA
TTTTGGAGGCACGATTAATGTCAGGAGTAATGAGTTATCAATTAATGGCTTGGAAGGACGAGTTGGTAGAAAAGGACGCTTGTTAGTCAAAGGGAATTTGCCTCTCAGAACAAGAAAAATTTCTTTGGGAGATAAGATTGAGATGAAGTCAGAGAGCCTGGAAGTGCGAGCCAAAAATATATTCAGTGGTCAGGTGGACA
GCCAAATACAGGTCGCGGGTTCAATACTGGAGCCAGAGGTCTCAGGAATGATTAAGCTTAGTGGTGGAGTGGCATTCTTGCCACAAGAAAAGGGCACAGGACCCGCTATCCCTCGTTTGGCTTCAAATCCGAAGAGCCTTTCAACTGGCCGTATTACAGCTGCAGGAAATATTGCTCGCTTTTACAGTACACAATCTGCT
TTTTTGCCTGTCAATGTGCCTGTCAAGACATCAGATACACAGGAAAAAGTTGAGAAAACTAAAGAGCAAAGCAAAAGCAACCCAAAAATAGCTGTCCACATGAGGGACCTTAAACTTCATCTTGGACCTGAGTTGAGAATTGTTTATCCTTTGATACTGAACTTTGCTGTTAGCGGTGAACTTGAGCTTAGTGGCTTGGC
TGATCCTAAGCTCATCAAACCCAAAGGGACTCTTACATTTGAAAATGGAGATGTAAATCTTGTTGCTACTCAGGTGAGGCTCAAACGAGATCATCCAAATAGAGCCAAATTTGAACCTGATGAGGGCTTGGATCCAACTTTGGACTTAGCCTTGGTTGGAGCAGATTGGCAACTAAAGATTCAGGGTCGTGCAAGTAACT
GGCAGGACAACTTGGTTGTGACTTCAACACGTTCTGGAGAGCAAGATGTGCTTTCACCTATCGAGGCTGCTCGTGTCTTTGAAAGTCAGCTAGCAGAATCCTTGTTGGAAGGTGATGGCCAACTTGCCTTCAAAAAGTTGGCAGCGGCTACTCTTGAAACCTTGATGCCAAGAATAGAAGGAAAGGGAGAATTTGGACAA
GCACGGTGGAGAATTGTATCTGCTCCTCAGATCCCAAATCTTTCCCTTGATCCCCAAGTTGACCCATTGAAATTGTTGTCCAATATTGCCGTTGGAGCTGAAGTGGAAGTGCAGTTTGGTAAACATTTGCAGGCTTCAGTTGTAAGGCAGCTAAAGGAATCAGAAATGGCCACACATTGGACTTTGCTCTACCAGCTTAG
CAGTAGGTTGAGGATTCTCTTTCAATCTATCCCCTCTGGTGACAAGCGTTTGCTATTTGAGTACTCCGCAACCTCACAAAGTTGATTTCCTTAGCAGCTTCTCTGAAGTTTACTCGTGTTGTTGCAAACGATGGCATTGCATTTCTTGTACATTATGGAACGATATACAACTGTAATATGGAAGGAATATTTTAATAAAG
ATGTGACACTAGCTACAGGATTCATTAGGTGCAGGGTGTATATAGCCCATTCTGTCCCAGAGCTCAAAGCAGGGCTTACATACATGTAACATAGCTTTATGCAATGGATCTACAAGTGAAACAACTATTTTTATTACCAAATTCAATGGTTCTTTCCTACTGTCAAATTGTTCTCCACTTTTATTGCCATTGCTGTTGGA
GGAGCAGACTACAATCCACTCTGCTATTAATGATATGTAATGTTACCACTATTAAAGTGGTAAAGAAATATTGATGTTAAGTGGTTAGTAGATACGTAGCCAATGTAATAGGTTAATTTTGAAGTTAGGGTTTAGGTGGGTAAACCACCATAACCATGTTGTGAGCAAATATAATTAAGATGAATCAAAT
>TRINITY_DN112736_c0_g6_i6 from sample A2 / Example unspliced isoform:GTTTCATTTGACGAATTGAAAAAACTTGATAATATGACACTTTTCGCAGTTCACTTCTAGATATTTGTCCAGCTCTTCGATCCTGGATATTATCTCCAAATTTCGCGATTAGCCGCGCTGTAATTTCTCTCGAGAGTCAGGTGCTTCACGGACTTGAAATGGCGTGCCGATTAGAGCTCAACATCATCTTATTTGGTGCA
GATTCGGACTCATTTTGGCGGCTTTTTTCGATTAAATGAATGACAACTTGTCATGAAGAAATTACAGAGGTAAGGAGCTAAATATTGAAATTTTCACGGAGAAATTTGATTTACAGTAATAAATATATATTTACAGAGAGAGAGAGAGCCCGAAATCCAATTTTCAGAAAGGTGCAGACGGTGAAACTTAAATTCCAGGG
AACATTCGGGTTTTCATTGGCACCTGATGGATAGGAAAACCGTTAATGGACTGCAATTTGGGCGTCCTTATGCAACGGGGTAATCTGATATTTAGTAAGCTTGATATACATGGAAATTTAAATTTCGGTGCGTGTTAGGGTTTTCTGAGAAGTGTGGCACTGGTGTTCAGAGATATTTAATTTAGTTCTGTATCTGCGGG
GCTTCATGTAATAAAACAAATCTGAAGATGAAATTGGAAATGCGGGATTTGGGATAGTTGGAGGCATGCGAATGGACTTTCACGCCTCCGGTCAGGGTTTCCAGGAATAAGTTCCAGTAGTTATGGTGTTTTGATTGTTCTTTTCGATTATAAGATGTCCGGGAGGGCGACATGTCAGTTCTCAACGGTAATTTGATGTT
TTATTTGAATGCAACAATGCCCTCCCGTGGTCAGAGTTCATGCCTAGGGCAGCCTGTTAATTTAGCTGATTTCAGAACTTGTAGCAGAAGAGCGAGGGGATTTGAGCAGTTAGATAATCAGTTTCTTGGGATTCCAATAAGGAAGTTTCAATCTCCGCTGAAACATATAGTTTTCGAACATAAGAGGCAAACATCAAACA
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TAGAAAAACCTGTGGTGAAGCATAAATCGAATGAGGAGGGTATCGATCCTCGTACAAAAGCTAGGAGGCTTGCAAGAGAGCAAGCTGCTATTCGTTGGGCAGAAGAAAGGAATGAGGCAGCAAGGAAATGGGCACAAAAAGGCTATAACTTTGTTGGTGTTGAGGAGACAAGGTCCCCAGGAAAGGTTGACGCAGTGCAC
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AAGACCAAAGTAGCAATCATTCAGGAGACATTGGTGCTGCAAGAATTGGGAAGCTTCCTGTTTTCCATGGGAGCATTGTGATGGCTTTTTCAGATACGTTTATCAAATCAATGGAGAGAATGAGTGGATACTTAAGAAGAAAGTTTAAGCAACTTGCTAATGAATTTGTAGCAGGTGCACAGGAAAAAGCACATGTTGCA
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AACTGGAATGCCATTAAAAGATGGGGGAGAGTTGTTTTTAAATGTATTTGTTGACCACACACAACAGAAGTGGCATGTCAACATCAAAGGGAAGAATCTCTTTGCTCCGCTTTTTGAAAACTTGCTGGAGATTCCAATTGTTTGGTCTAATGGCAGGGCCAGCGGAGAGGTCCACATTTGTTTATCAAGGGGTGAACATT
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CACCTTATGTGCCAGGTTCCAAATGTTGAAGTCAATGCTCTTATGAGGACCCTTGATGCAAAGCCTCTGTTGTTTCCTTTGGCGGGTTCACTGAAAGCTGTTTTCAATTGTCAAGGCCCATTGGATATTCCTGTATTCGTAGGTGGTGGCATAATGTCAAAAAAAAACAATCATTTCATATCAAACATGCCTTCCTCTGC
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TCTTAGTTTGACTCCATTTAGTCCCATTGGTTCTCCAAAGCTTATGCATATGAAACTGACCGGCAGGGCTAAATTTCATGGATCTGTAGTGGATTCCCTAGATAGATCAGTCGATGAGAACATTGCAGTTCGAGAGGAGATATTGAGTACTGATGAGTTTAGTAGGACGAAAGCATCGGGACTTGTTGGAGATGTACAGT
TATCCGGAATAAAATTGAATCAACTTCTTGTGGCACCAAATTCGTCAGGGACGTTGGCTATTTTCCCGCAAAATTTCAAGTTAAATGCCACAGGAAGACCAGATGAGAATCTTCTCATTGAAGTTGTCTGTGGTTCAAATCCTCCCAGCTCAGAAACTTCACTTTATGATCTGATGATGAGAAAAGTATACCTTTGTTTA
CAAAAGGGCCAGCTTAGAACCAGCATCTCCTTTCAACCTGGACATTCAGCAAGTTTGGAGGTACGACACTTGGAACTTGATGAACTGGAGCTTGCCTCATTGCGCGGAATGGTACAGAAGGCAGAACTCGAACTTAATTTTCACAAAAGGAAAGGTCAAGGAAATGTATCTGTTATGCGGCCAAGGTTCAGTGGTGTGCA
AGGTGAATCCTTGGATGTTTCTGCTCGTTGGTCAGGTGATGTGATTACACTTGAGAAGTCTGTACTCGAACAAGCTTGTAGCAAGTATGAACTGCAGGGTGAATATGTGCTGCCGGGAACACGTGATCGTAGTCCTGGTGAAAGAGAAAAAGGAGGAATGCTGAAGAGGGCAATGGCTGGACAGCTTGGAAGCCTTATTA
CATCTTTGGGAAGGTGGCGACTACGATTAGAAGTTCCTGTGGCTGAAGTCGCTGAGATGCTGCCATTTGCTCGTCTGCTTTCCAGGAGCAGTGATCCCGCAGTTCTTTCTAGGTCGAAGGAGTTATTTATTCAAGGTGTACAAAATGTTGGGTTCTTTGCTGAGAATCTCCAAAAACAATTAGAGGATACAAAAGGGAGC
ACTGAATATCTTCCTTTTGAGGAAGGAGCCCCAGAGGCAATACCTCTTCCAGGGTTAGCTGAATTAAAGGGCCGTTGGCATGGAAGTCTGGATGCTAGTGGAGGCGGCAATGGAGATACTACAgcagacttcgacctccatggtgaagaatgggagtggggagcttataagtctcaacaggttattgcagttggaagcta
cagtaataacaatggtttgcgtcttgataagatcttgatacaaagagacaaagcaactattcatgcagatgggacgttattaggaccgaggactaatcttcattttgctgttctaaattttcctgttggattagttccttatttattacaggcatttgagtcttcaactatggatcctatgccttcttcatggacacctc
taacacctctgaaagggattttacatatggaaggagatctaagaggaagtcttgcaaagccacaatgtgatgtacaagtaagacttttagacggagctattggaggtgttgaccttgaacgagctgaagtggttgcttgtattacatcagcaaatcgctttgtatttgatgcaaactttagacctgtaatccagagtggg
catgtgcatgttattggaagtcttcctgtgcctcctttgggaaatgatatgctagtagaagagaatatggagatggagccagatcagccaatttggtcaagggaatgggtacgtgataagggagatcttactattaaaaatgatatcaatgtaaaaaaatttgggagagagagaggagataaaggctgggaagttcaatt
gacagaaagtttaaagggtttggattggaacctaatggagacaggtgcagttaaggtggatgcaactgttaaagatggtgggatgatgttaattactgcactgtctccttatgtccgttggctacatggcagtgctgacattgttttgcagGTAAGAGGAACTGCAGATCAGCCCATATTTGATGGAGCTGCAACATTTC
ATAGGGCATCTGTATCTTCACCGGTGCTTCCAACACCACTTTCAAATTTTGGAGGCACGATTAATGTCAGGAGTAATGAGTTATCAATTAATGGCTTGGAAGGACGAGTTGGTAGAAAAGGACGCTTGTTAGTCAAAGGGAATTTGCCTCTCAGAACAAGAAAAATTTCTTTGGGAGATAAGATTGAGATGAAGTCAGAG
AGCCTGGAAGTGCGAGCCAAAAATATATTCAGTGGTCAGGTGGACAGCCAAATACAGGTCGCGGGTTCAATACTGGAGCCAGAGGTCTCAGGAATGATTAAGCTTAGTGGTGGAGTGGCATTCTTGCCACAAGAAAAGGGCACAGGACCCGCTATCCCTCGTTTGGCTTCAAATCCGAAGAGCCTTTCAACTGGCCGTAT
TACAGCTGCAGGAAATATTGCTCGCTTTTACAGTACACAATCTGCTTTTTTGCCTGTCAATGTGCCTGTCAAGACATCAGATACACAGGAAAAAGTTGAGAAAACTAAAGAGCAAAGCAAAAGCAACCCAAAAATAGCTGTCCACATGAGGGACCTTAAACTTCATCTTGGACCTGAGTTGAGAATTGTTTATCCTTTGA
TACTGAACTTTGCTGTTAGCGGTGAACTTGAGCTTAGTGGCTTGGCTGATCCTAAGCTCATCAAACCCAAAGGGACTCTTACATTTGAAAATGGAGATGTAAATCTTGTTGCTACTCAGGTGAGGCTCAAACGAGATCATCCAAATAGAGCCAAATTTGAACCTGATGAGGGCTTGGATCCAACTTTGGACTTAGCCTTG
GTTGGAGCAGATTGGCAACTAAAGATTCAGGGTCGTGCAAGTAACTGGCAGGACAACTTGGTTGTGACTTCAACACGTTCTGGAGAGCAAGATGTGCTTTCACCTATCGAGGCTGCTCGTGTCTTTGAAAGTCAGCTAGCAGAATCCTTGTTGGAAGGTGATGGCCAACTTGCCTTCAAAAAGTTGGCAGCGGCTACTCT
TGAAACCTTGATGCCAAGAATAGAAGGAAAGGGAGAATTTGGACAAGCACGGTGGAGAATTGTATCTGCTCCTCAGATCCCAAATCTTTCCCTTGATCCCCAAGTTGACCCATTGAAATTGTTGTCCAATATTGCCGTTGGAGCTGAAGTGGAAGTGCAGTTTGGTAAACATTTGCAGGCTTCAGTTGTAAGGCAGCTAA
AGGAATCAGAAATGGCCACACATTGGACTTTGCTCTACCAGCTTAGCAGTAGGTTGAGGATTCTCTTTCAATCTATCCCCTCTGGTGACAAGCGTTTGCTATTTGAGTACTCCGCAACCTCACAAAGTTGATTTCCTTAGCAGCTTCTCTGAAGTTTACTCGTGTTGTTGCAAACGATGGCATTGCATTTCTTGTACATT
ATGGAACGATATACAACTGTAATATGGAAGGAATATTTTAATAAAGATGTGACACTAGCTACAGGATTCATTAGGTGCAGGGTGTATATAGCCCATTCTGTCCCAGAGCTCAAAGCAGGGCTTACATACATGTAACATAGCTTTATGCAATGGATCTACAAGTGAAACAACTATTTTTATTACCAAATTCAATGGTTCTT
TCCTACTGTCAAATTGTTCTCCACTTTTATTGCCATTGCTGTTGGAGGAGCAGACTACAATCCACTCTGCTATTAATGATATGTAATGTTACCACTATTAAAGTGGTAAAGAAATATTGATGTTAAGTGGTTAGTAGATACGTAGCCAATGTAATAGGTTAATTTTGAAGTTAGGGTTTAGGTGGGTAAACCACCATAAC
CATGTTGTGAGCAAATATAATTAAGATGAATCAAAT
Intron 6 GTGAGTATTG ... TTGTCCAGAG
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| A4 | 60.71 | 22 | 31 | 37 |
| A5 | 43.53 | 24 | 13 | 24 |
| A6 | 37.93 | 9 | 4 | 7 |
| A7 | 45.45 | 9 | 8 | 7 |
| A8 | 100 | 0 | 2 | 1 |
| A9 | 56.52 | 5 | 7 | 6 |
| A10 | 45 | 11 | 7 | 11 |
>TRINITY_DN110888_c0_g2_i4 from sample A5 / Example spliced isoformTTTATGTTTCATTTGACGAATTGAAAAAACTTGATAATATGACACTTTTCGCAGTTCACTTCTAGATATTTGTCCAGCTCTTCGATCCTGGATATTATCTCCAAATTTCGCGATTAGCCGCGCTGTAATTTCTCTCGAGAGTCAGGTGCTTCACGGACTTGAAATGGCGTGCCGATTAGAGCTCAACATCATCTTATTTG
GTGCAGATTCGGACTCATTTTGGCGGCTTTTTTCGATTAAATGAATGACAACTTGTCATGAAGAAATTACAGAGGTAAGGAGCTAAATATTGAAATTTTCACGGAGAAATTTGATTTACAGTAATAAATATATATTTACAGAGAGAGAGAGAGCCCGAAATCCAATTTTCAGAAAGGTGCAGACGGTGAAACTTAAATTC
CAGGGAACATTCGGGTTTTCATTGGCACCTGATGGATAGGAAAACCGTTAATGGACTGCAATTTGGGCGTCCTTATGCAACGGGGTAATCTGATATTTAGTAAGCTTGATATACATGGAAATTTAAATTTCGGTGCGTGTTAGGGTTTTCTGAGAAGTGTGGCACTGGTGTTCAGAGATATTTAATTTAGTTCTGTATCT
GCGGGGCTTCATGTAATAAAACAAATCTGAAGATGAAATTGGAAATGCGGGATTTGGGATAGTTGGAGGCATGCGAATGGACTTTCACGCCTCCGGTCAGGGTTTCCAGGAATAAGTTCCAGTAGTTATGGTGTTTTGATTGTTCTTTTCGATTATAAGATGTCCGGGAGGGCGACATGTCAGTTCTCAACGGTAATTTG
ATGTTTTATTTGAATGCAACAATGCCCTCCCGTGGTCAGAGTTCATGCCTAGGGCAGCCTGTTAATTTAGCTGATTTCAGAACTTGTAGCAGAAGAGCGAGGGGATTTGAGCAGTTAGATAATCAGTTTCTTGGGATTCCAATAAGGAAGTTTCAATCTCCGCTGAAACATATAGTTTTCGAACATAAGAGGCAAACATC
AAACACGTTTATGGACCATGTAAGCAAAGTGAGGATCTTTCGCTGCGAGCGAAAATCCCCATTTTTACTGAACTATACGAAATTCAACGTGATAGGGAAATTTATGGGAAGAAAACTAAATTTGCAGAACAGATTACAATGCCATTGCCGCCGAGATAAAGACAGTATTAAGGCTCGTGTTTCTGAATGGAAGGCTCCCT
TTTCTCAATGGAGGGAAGGAATATTTTTTGTCCGTTGTTCTGCATTTGTCGCGACAATCGCCGTTCTTGGAATGTTGTTTTTCTATGGACAAGTCAGAGCCCAAGCGTATATTAATGAAAGAATATTACCTTCTGTGGCGACTGTCATGGGCGATTACCTTGGGAGGAAACTTAACCTTGGAAGGGTTCATAGGATTTCT
CCTCTTGGGTTTGCATTGGAATCCTGTTCCTTAGGTCCTCATTCTGAAGAGTTTTCTTGCGGGGAGCTTCCAAATGTTAAAGTTCGCATTCGGCCTTGGGCCAGCCTACAGCGGGGACAGGTAGTAGTTGATGCTGTTTTGTTACAACCGCATGTTTTGATTGCCCAGAAAGAGGACTGGTCATGGCTTGGTATCCCAAC
CCCCTTAGAAAAACCTGTGGTGAAGCATAAATCGAATGAGGAGGGTATCGATCCTCGTACAAAAGCTAGGAGGCTTGCAAGAGAGCAAGCTGCTATTCGTTGGGCAGAAGAAAGGAATGAGGCAGCAAGGAAATGGGCACAAAAAGGCTATAACTTTGTTGGTGTTGAGGAGACAAGGTCCCCAGGAAAGGTTGACGCAG
TGCACACAGAAGACATGGTAAACTGTGATTACATGAATTGCTTCAAGGAAGAGATTACAATAGAAAGTTGTTTTGGAGGCAAACCAGGTAGACAAGAACACTTGCATCATAAATGTACAGAAGGTGTCTGTAGTAAGAGTGCGATGGAGAGGTCTGAGTTTGATAGGGCCTTTGAGCACAGTACTCTAAATAGGCCTTTT
AGTTTGAGAAGTCCTGTTCCAGTTGTAAGAACTTGGTTAAAGGAAAATATGGTGAAACCTATACGACACCGATTCAAGAGGTCAATCCAAAAGAGTGCACCTTTGTCTCAGAAAGCGACAATGCAGAGAAGAAACCTTGATCGCAGTGCTGCAGCAGCAAGGAAATACTTTGATGAAATGGACAAGAAGCAGAATTCTGG
TGCAGACAAAGGAAAGGGTTATATTGGAAATTCTGGAGCATTTGTAAATCCAGAGCTGGTCTCTTCCTTTATAAGTGTGAGAGAGGACAGTCAGAAGGGTGTGATGGAAGAGCAGGATAAAGATTGTAGTGAGCATATTGTCATGAATGTGGACAAATATAATTGCCCACCAACTATTCACAGAAATGAAGAACTTTCAG
CTTGTCCCATTTCAATGGACAAAGGGGATCTATCAAAGTTTGTCAAGATGGATTGTAAGAATCATATAATCATGGGCATTGAGCATCCACCTTACGATTATGATATTGCTTCAAGGAGAATTCAGGATGTTCTACTGTTAGATAAAGTTAGTTTAGAACAGGAAACGATCTCAGAAGATCAGTCTTCACAGCACCTTTCA
ATGAATGGCACAGATAATGAAAAAGGTTCAGTCTATGAAGCTTTAGTTGAGGCTATTCACAATTCATGTGAAACAAATGAAAGCTGTAAATCTTCAAATCATCTTGGGAAACAAGGCGATAAATCGGTGTACATGAAAAGCAAGAGCAATGGAGCTTCTGCTCATACCTGTGATACTATGGGAGGTTCCTTGCAAAATAT
AGCTGAAGACCAAAGTAGCAATCATTCAGGAGACATTGGTGCTGCAAGAATTGGGAAGCTTCCTGTTTTCCATGGGAGCATTGTGATGGCTTTTTCAGATACGTTTATCAAATCAATGGAGAGAATGAGTGGATACTTAAGAAGAAAGTTTAAGCAACTTGCTAATGAATTTGTAGCAGGTGCACAGGAAAAAGCACATG
TTGCAGGCTCAGAGCACCTATTTCCTGTTATCTTAGATTCTGTCTACTTCAAGAATGGAACTCTAATGCTGTTAGGCTATGGGGATGAAGAACCCAGGGTCATGGAGAATATCAATGGGCACCTAAAATTTCATAGTAGATACGAACGTTTATATGCACAACTAAGTGGGAGGCCAAAGGAGTGGCGAACTGGAATGCCA
TTAAAAGATGGGGGAGAGTTGTTTTTAAATGTATTTGTTGACCACACACAACAGAAGTGGCATGTCAACATCAAAGGGAAGAATCTCTTTGCTCCGCTTTTTGAAAACTTGCTGGAGATTCCAATTGTTTGGTCTAATGGCAGGGCCAGCGGAGAGGTCCACATTTGTTTATCAAGGGGTGAACATTTTCCCAACTTGCA
CGGGCAGATTGATGTGAGAGGATTGGAGTTTCAAATTTTGGATACACCCTCATCCTTTTCTGCTTTAAATGGAAGCCTATGTTTTCGTGGTCAGAGAATATTCTTGCACAATGCAAGTTGTTTCTTTGGTGAAGTGCCGTTGGATGTTTCAGGAGATTTTGGAATAAATCCCGAGGATGGAGAGTATCACCTTATGTGCC
AGGTTCCAAATGTTGAAGTCAATGCTCTTATGAGGACCCTTGATGCAAAGCCTCTGTTGTTTCCTGGTGAGATAGATGACTCTGCAGTTGATTTTAATTTTTCGGGAAATGTTGATTTTGACAATGTGGTTCGACACTACCTTCCTAATGGAATCCAAGCAATGCCTATGAAACTTGGCTATGTAAATGGGGAGGCCAAA
GTATATGGTTCGATTTCGAGAATGCGGTATGACGTCAAATGGACAGCACCAAAGGCTGAAGGCTCTTTCACTGATGCACGTGGCGACATTATAATATCTGATGAAGCCATTACTATCAGCTCTTCCTCGATTACGTTTGATCTTCTGACAAAAATCAAAATATCATACCCTAATGGACGCTATTTAAAAAAAGAGGGTTC
AGATCTCATCATTGCTGTTGCCCCAGATATCCTGGGTGTTGATGCTGATTTACGTTTGCAAAGATTTGATATTCTTAGTTTGACTCCATTTAGTCCCATTGGTTCTCCAAAGCTTATGCATATGAAACTGACCGGCAGGGCTAAATTTCATGGATCTGTAGTGGATTCCCTAGATAGATCAGTCGATGAGAACATTGCAG
TTCGAGAGGAGATATTGAGTACTGATGAGTTTAGTAGGACGAAAGCATCGGGACTTGTTGGAGATGTACAGTTATCTGGAATAAAATTGAATCAACTTCTTGTGGCACCAAATTCGTCAGGGACGTTGGCTATTTTCCCGCAAAATTTCAAGTTAAATGCCACAGGAAGACCAGATGAGAATCTTCTCATTGAAGTTGTC
TGTGGTTCAAATCCTCCCAGCTCAGAAACTTCACTTTATGATCTGATGATGAGAAAAGTATACCTTTGTTTACAAAAGGGCCAGCTTAGAACCAGCATCTCCTTTCAACCTGGACATTCAGCAAGTTTGGAGGTACGACACTTGGAACTTGATGAACTGGAGCTTGCCTCATTGCGCGGAATGGTACAGAAGGCAGAACT
CGAACTTAATTTTCACAAAAGGAAAGGTCAAGGAAATGTATCTGTTATGCGGCCAAGGTTCAGTGGTGTGCAAGGTGAATCCTTGGATGTTTCTGCTCGTTGGTCAGGTGATGTGATTACACTTGAGAAGTCTGTACTCGAACAAGCTTGTAGCAAGTATGAACTGCAGGGTGAATATGTGCTGCCGGGAACACGTGATC
GTAGTCCTGGTGAAAGAGAAAAAGGAGGAATGCTGAAGAGGGCAATGGCTGGACAGCTTGGAAGCCTTATTACATCTTTGGGAAGGTGGCGACTACGATTAGAAGTTCCTGTGGCTGAAGTCGCTGAGATGCTGCCATTTGCTCGTCTGCTTTCCAGGAGCAGTGATCCCGCAGTTCTTTCTAGGTCGAAGGAGTTATTT
ATTCAAGGTGTACAAAATGTTGGGTTCTTTGCTGAGAATCTCCAAAAACAATTAGAGGATACAAAAGGGAGCACTGAATATCTTCCTTTTGAGGAAGGAGCCCCAGAGGCAATACCTCTTCCAGGGTTAGCTGAATTAAAGGGCCGTTGGCATGGAAGTCTGGATGCTAGTGGAGGCGGCAATGGAGATACTACAGCAGA
CTTCGACCTCCATGGTGAAGAATGGGAGTGGGGAGCTTATAAGTCTCAACAGGTTATTGCAGTTGGAAGCTACAGTAATAACAATGGTTTGCGTCTTGATAAGATCTTGATACAAAGAGACAAAGCAACTATTCATGCAGATGGGACGTTATTAGGACCGAGGACTAATCTTCATTTTGCTGTTCTAAATTTTCCTGTTG
GATTAGTTCCTTATTTATTACAGGCATTTGAGTCTTCAACTATGGATCCTATGCCTTCTTCATGGACACCTCTAACACCTCTGAAAGGGATTTTACATATGGAAGGAGATCTAAGAGGAAGTCTTGCAAAGCCACAATGTGATGTACAAGTAAGACTTTTAGACGGAGCTATTGGAGGTGTTGACCTTGAACGAGCTGAA
GTGGTTGCTTGTATTACATCAGCAAATCGCTTTGTATTTGATGCAAACTTTAGACCTGTAATCCAGAGTGGGCATGTGCATGTTATTGGAAGTCTTCCTGTGCCTCCTTTGGGAAATGATATGCTAGTAGAAGAGAATATGGAGATGGAGCCAGATCAGCCAATTTGGTCAAGGGAATGGGTACGTGATAAGGGAGATCT
TACTATTAAAAATGATATCAATGTAAAAAAATTTGGGAGAGAGAGAGGAGATAAAGGCTGGGAAGTTCAATTGACAGAAAGTTTAAAGGGTTTGGATTGGAACCTAATGGAGACAGGTGCAGTTAAGGTGGATGCAACTGTTAAAGATGGTGGGATGATGTTAATTACTGCACTGTCTCCTTATGTCCGTTGGCTACATG
GCAGTGCTGACATTGTTTTGCAGGTAAGAGGAACTGCAGATCAGCCCATATTTGATGGAGCTGCAACATTTCATAGGGCATCTGTATCTTCACCGGTGCTTCCAACACCACTTTCAAATTTTGGAGGCACGATTAATGTCAGGAGTAATGAGTTATCAATTAATGGCTTGGAAGGACGAGTTGGTAGAAAAGGACGCTTG
TTAGTCAAAGGGAATTTGCCTCTCAGAACAAGAAAAATTTCTTTGGGAGATAAGATTGAGATGAAGTCAGAGAGCCTGGAAGTGCGAGCCAAAAATATATTCAGTGGTCAGGTGGACAGCCAAATACAGGTCGCGGGTTCAATACTGGAGCCAGAGGTCTCAGGAATGATTAAGCTTAGTGGTGGAGTGGCATTCTTGCC
ACAAGAAAAGGGCACAGGACCCGCTATCCCTCGTTTGGCTTCAAATCCGAAGAGCCTTTCAACTGGCCGTATTACAGCTGCAGGAAATATTGCTCGCTTTTACAGTACACAATCTGCTTTTTTGCCTGTCAATGTGCCTGTCAAGACATCAGATACACAGGAAAAAGTTGAGAAAACTAAAGAGCAAAGCAAAAGCAACC
CAAAAATAGCTGTCCACATGAGGGACCTTAAACTTCATCTTGGACCTGAGTTGAGAATTGTTTATCCTTTGATACTGAACTTTGCTGTTAGCGGTGAACTTGAGCTTAGTGGCTTGGCTGATCCTAAGCTCATCAAACCCAAAGGGACTCTTACATTTGAAAATGGAGATGTAAATCTTGTTGCTACTCAGGTGAGGCTC
AAACGAGATCATCCAAATAGAGCCAAATTTGAACCTGATGAGGGCTTGGATCCAACTTTGGACTTAGCCTTGGTTGGAGCAGATTGGCAACTAAAGATTCAGGGTCGTGCAAGTAACTGGCAGGACAACTTGGTTGTGACTTCAACACGTTCTGGAGAGCAAGATGTGCTTTCACCTATCGAGGCTGCTCGTGTCTTTGA
AAGTCAGCTAGCAGAATCCTTGTTGGAAGGTGATGGCCAACTTGCCTTCAAAAAGTTGGCAGCGGCTACTCTTGAAACCTTGATGCCAAGAATAGAAGGAAAGGGAGAATTTGGACAAGCACGGTGGAGAATTGTATCTGCTCCTCAGATCCCAAATCTTTCCCTTGATCCCCAAGTTGACCCATTGAAATTGTTGTCCA
ATATTGCCGTTGGAGCTGAAGTGGAAGTGCAGTTTGGTAAACATTTGCAGGCTTCAGTTGTAAGGCAGCTAAAGGAATCAGAAATGGCCACACATTGGACTTTGCTCTACCAGCTTAGCAGTAGGTTGAGGATTCTCTTTCAATCTATCCCCTCTGGTGACAAGCGTTTGCTATTTGAGTACTCCGCAACCTCACAAAGT
TGATTTCCTTAGCAGCTTCTCTGAAGTTTACTCGTGTTGTTGCAAACGATGGCATTGCATTTCTTGTACATTATGGAACGATATACAACTGTAATATGGAAGGAATATTTTAATAAAGATGTGACACTAGCTACAGGATTCATTAGGTGCAGGGTGTATATAGCCCATTCTGTCCCAGAGCTCAAAGCAGGGCTTACATA
CATGTAACATAGCTTTATGCAATGGATCTACAAGTGAAACAACTATTTTTATTACCAAATTCAATGGTTCTTTCCTACTGTCAAATTGTTCTCCACTTTTATTGCCATTGCTGTTGGAGGAGCAGACTACAATCCACTCTGCTATTAATGATATGTAATGTTACCACTATTAAAGTGGTAAAGAAATATTGATGTTAAGT
GGTTAGTAGATACGTAGCCA
>TRINITY_DN110888_c0_g2_i5 from sample A5 / Example unspliced isoform:GCACAATGCAAGTTGTTTCTTTGGTGAAGTGCCGTTGGATGTTTCAGGAGATTTTGGAATAAATCCCGAGGATGGAGAGTATCACCTTATGTGCCAGGTCCACATTTGTTTATCAAGGGGTGAACATTTTCCCAACTTGCACGGGCAGATTGATGTGAGAGGATTGGAGTTTCAAATTTTGGATACACCCTCATCCTTTT
CTGTTCCAAATGTTGAAGTCAATGCTCTTATGAGGACCCTTGATGCAAAGCCTCTGTTGTTTCCTgtgagtattgtatgttggcgggttcactgaaagctgttttcaattgtcaaggcccattggatattcctgtattcgtaggtggtggcataatgtcaaaaaaaaacaatcatttcatatcaaacatgccttcctctg
ccgcagctgaagcactcatgcgaaacaaggaggctggggcagtagcggctataggtcatgtgccattctcatatgtctcagcgaattttactttcaacactgataatcgcatcacagacttgtatggtattcgagcaacactaatagatggtggcgaaatacgcggtgctggaaatgcttggatttgtccagagGGTGAG
ATAGATGACTCTGCAGTTGATTTTAATTTTTCGGGAAATGTTGATTTTGACAATGTGGTTCGACACTACCTTCCTAATGGAATCCAAGCAATGCCTATGAAACTTGGCTATGTAAATGGGGAGGCCAAAGTATATGGTTCGATTTCGAGAATGCGGTATGACGTCAAATGGACAGCACCAAAGGCTGAAGGCTCTTTCAC
TGATGCACGTGGCGACATTATAATATCTGATGAAGCCATTACTATCAGCTCTTCCTCGATTACGTTTGATCTTCTGACAAAAATCAAAATATCATACCCTAATGGACGCTATTTAAAAAAAGAGGGTTCAGATCTCATCATTGCTGTTGCCCCAGATATCCTGGGTGTTGATGCTGATTTACGTTTGCAAAGATTTGATA
TTCTTAGTTTGACTCCATTTAGTCCCATTGGTTCTCCAAAGCTTATGCATATGAAACTGACCGGCAGGGCTAAATTTCATGGATCTGTAGTGGATTCCCTAGATAGATCAGTCGATGAGAACATTGCAGTTCGAGAGGAGATATTGAGTACTGATGAGTTTAGTAGGACGAAAGCATCGGGACTTGTTGGAGATGTACAG
TTATCTGGAATAAAATTGAATCAACTTCTTGTGGCACCAAATTCGTCAGGGACGTTGGCTATTTTCCCGCAAAATTTCAAGTTAAATGCCACAGGAAGACCAGATGAGAATCTTCTCATTGAAGTTGTCTGTGGTTCAAATCCTCCCAGCTCAGAAACTTCACTTTATGATCTGATGATGAGAAAAGTATACCTTTGTTT
ACAAAAGGGCCAGCTTAGAACCAGCATCTCCTTTCAACCTGGACATTCAGCAAGTTTGGAGGTACGACACTTGGAACTTGATGAACTGGAGCTTGCCTCATTGCGCGGAATGGTACAGAAGGCAGAACTCGAACTTAATTTTCACAAAAGGAAAGGTCAAGGAAATGTATCTGTTATGCGGCCAAGGTTCAGTGGTGTGC
AAGGTGAATCCTTGGATGTTTCTGCTCGTTGGTCAGGTGATGTGATTACACTTGAGAAGTCTGTACTCGAACAAGCTTGTAGCAAGTATGAACTGCAGGGTGAATATGTGCTGCCGGGAACACGTGATCGTAGTCCTGGTGAAAGAGAAAAAGGAGGAATGCTGAAGAGGGCAATGGCTGGACAGCTTGGAAGCCTTATT
ACATCTTTGGGAAGGTGGCGACTACGATTAGAAGTTCCTGTGGCTGAAGTCGCTGAGATGCTGCCATTTGCTCGTCTGCTTTCCAGGAGCAGTGATCCCGCAGTTCTTTCTAGGTCGAAGGAGTTATTTATTCAAGGTGTACAAAATGTTGGGTTCTTTGCTGAGAATCTCCAAAAACAATTAGAGGATACAAAAGGGAG
CACTGAATATCTTCCTTTTGAGGAAGGAGCCCCAGAGGCAATACCTCTTCCAGGGTTAGCTGAATTAAAGGGCCGTTGGCATGGAAGTCTGGATGCTAGTGGAGGCGGCAATGGAGATACTACAG