sp|Q8GWE1|UCH3_ARATH ----> Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3

Intron 1 GTATAGCACA ... TATGAGTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	80.25	48	22	195
A2	86.31	49	19	309
A3	87.5	38	32	266
A4	89.66	33	31	286
A5	79.73	30	11	118
A6	83.88	222	103	1155
A7	84.3	198	116	1063
A8	84.5	115	49	627
A9	84.16	220	111	1169
A10	85.61	173	76	1029

>TRINITY_DN41792_c0_g3_i5 from sample A8 / Example spliced isoform

TATCACTACCTAAAAGTCCTCGAAACAATAGACCCCTTTCGAAGGCTAAAGGAATTGGAATGCAACTCAAAGCTTTTGTAAAAAAAATATAACTAAATTTTTTTTGCTGATTATTGTGCTCCCTCTCACGCCAAGTAAGGAATAACAGAATCGAATACAAACTCTATATATAATACAGCCAAACCACACCTATGATCGCA
CTCAGTTTGCGTGGGGCCTTGGTATACCTGAAGAAGAAGCGGAGTTCTATGATGTTTATGGTTACGATGACGAGTTATTGGATATGGTGCCAAAACCTGTGTTAGCTGTAATCTTCCTTTATCCGCTTAATGACGCTACTGAAGTTAAGAAATCAGCTGAGGAGGAACAAGTTGTTGAAGATGGACAGAAGGGAGTGAGC
AGCAATGTTTATTTCATGCAACAAACTGTTGGAAATGCCTGTGGAACAGTTGCTATCCTCCATGCAGTAGGCAATATTCTGCCACAACTACATCTCCGTAATGGATCCTTTTTTGAAAGATTCTTTACATCCACTGCAGAGATGACGCCAGCAGAGCGGGCTGAATTCCTTGAAAAGGATACAGAATTAGAGAGTGCACA
TTCTGTTGCAGCCACTGCAGGTCATACTGCTGCTCCTGATCTGAGCGTTAATGTGGATCTGCATTTTGTTTGCTTAACTTGTGTTGATGGAAAATTATATGAACTAGATGGAAGGTGGACTTCTCCTACATGCCATGGACCTAGTTCACCGGAAACCTTATTGAAGGATTCTGTAAGAGTCGTTCAAAATGTTAGCAAGA
AAATTCCTGATTCAGTGAATTTCAGTGTCATAGCCCTTTCCAAGAAAACCTGAGCTTGTACCATACTAATCATTATTCCGGAGTGCTCATCTTGAGAATTTTGAGACATGGAGGGCGGGGTTCTTCTGTGGATAGCTTCATCTTTTGAGATAAATGTTCAGATGTTGTGGTTGGGAGGTCGAATTGAGATACAAAATCAA
GAATTCTTTCATCTACTGAAACTTAAATGCCAGTGCTATTCACAAACAGATGTTTTGAAGTCAATAGATGCTTAATGAGTAATTGCATTAGTTGGATAAGTTTACATCTGCTGTCTTGTAGTGTTGCGTGTTTAAAACACATAATTTTGCAGTCTTGGCTGTGTAATTACTTTTTAGGTTTATCCTATATTTTCAAGGCC
CACAGAACATTATGCAAATGAATACATATTCCATATATTTTCAAGGCCTACAGAACGTTATGCAAATGAATACATATTCCATATATTTTCAAGGCCTACAGAACGTTATGCAAATGAATACATATTCCGCTTATCACACCGATATACGGGAATATAATCGTGGTCCTTGTTTTTGAGTAAGTTTTGCGAACTTCTAATTG
AGTATTGATTGTAAATGCTTGATCTAAGAAATGATTGTAATTCCAAGTTAAAGCAAGGAAACCAATTGGTAATGAATCCTTAAATCACTTGTCCATTTTGAAAATTTCCAAATAGGAATATGGTATTATGTTTCTTTGTGAAGGGTAAAATGATAGCACCAAGATTATGCATTTATTGACTAAACCGGATATTGATTGAT
GATAGTGGAAGTCTCACCGTTTACAATGTACTACTCATAAAAGTGGGCTGAATATCTAATTGCACCAAGATAAGCAATTACAAAAGATTACAAAAATTACATTTGCAACTTTGAGGCCTTTTATCTCAAGGATGTCTCAACTTGTAATATACTCAATTTTGGTGGTGCTCTAAAAACATCTTTAATGCGATTACGTATTT
CTTGTTTGCAAATTCAACAAGCTATGTAAGCTACTCAACTTTTCATATTGAATTAAGTGCA

>TRINITY_DN41792_c0_g3_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:

TATCACTACCTAAAAGTCCTCGAAACAATAGACCCCTTTCGAAGGCTAAAGGAATTGGAATGCAACTCAAAGCTTTTGTAAAAAAAATATAACTAAATTTTTTTTGCTGATTATTGTGCTCCCTCTCACGCCAAGTAAGGAATAACAGAATCGAATACAAACTCTATATATAATACAGCCAAACCACACCTATGATCGCA
CTCAGgtatagcacaatttttcaggtttgattttcatcctcgaagcagagtttatagcgtacataggtttacaatcaatagtgtgtttatcggtatcatagattacatttcaacaatggaggtgtctgaaagtactggtgctaagcgatggattcctctcgaagccaatcctgaagttatgagtcagTTTGCGTGGGGCC
TTGGTATACCTGAAGAAGAAGCGGAGTTCTATGATGTTTATGGTTACGATGACGAGTTATTGGATATGGTGCCAAAACCTGTGTTAGCTGTAATCTTCCTTTATCCGCTTAATGACGCTACTGAAGTTAAGAAATCAGCTGAGGAGGAACAAGTTGTTGAAGATGGACAGAAGGGAGTGAGCAGCAATGTTTATTTCATG
CAACAAACTGTTGGAAATGCCTGTGGAACAGTTGCTATCCTCCATGCAGTAGGCAATATTCTGCCACAACTACATCTCCGTAATGGATCCTTTTTTGAAAGATTCTTTACATCCACTGCAGAGATGACGCCAGCAGAGCGGGCTGAATTCCTTGAAAAGGATACAGAATTAGAGAGTGCACATTCTGTTGCAGCCACTGC
AGGTCATACTGCTGCTCCTGATCTGAGCGTTAATGTGGATCTGCATTTTGTTTGCTTAACTTGTGTTGATGGAAAATTATATGAACTAGATGGAAGGTGGACTTCTCCTACATGCCATGGACCTAGTTCACCGGAAACCTTATTGAAGGATTCTGTAAGAGTCGTTCAAAATGTTAGCAAGAAAATTCCTGATTCAGTGA
ATTTCAGTGTCATAGCCCTTTCCAAGAAAACCTGAGCTTGTACCATACTAATCATTATTCCGGAGTGCTCATCTTGAGAATTTTGAGACATGGAGGGCGGGGTTCTTCTGTGGATAGCTTCATCTTTTGAGATAAATGTTCAGATGTTGTGGTTGGGAGGTCGAATTGAGATACAAAATCAAGAATTCTTTCATCTACTG
AAACTTAAATGCCAGTGCTATTCACAAACAGATGTTTTGAAGTCAATAGATGCTTAATGAGTAATTGCATTAGTTGGATAAGTTTACATCTGCTGTCTTGTAGTGTTGCGTGTTTAAAACACATAATTTTGCAGTCTTGGCTGTGTAATTACTTTTTAGGTTTATCCTATATTTTCAAGGCCCACAGAACATTATGCAAA
TGAATACATATTCCATATATTTTCAAGGCCTACAGAACGTTATGCAAATGAATACATATTCCATATATTTTCAAGGCCTACAGAACGTTATGCAAATGAATACATATTCCGCTTATCACACCGATATACGGGAATATAATCGTGGTCCTTGTTTTTGAGTAAGTTTTGCGAACTTCTAATTGAGTATTGATTGTAAATGC
TTGATCTAAGAAATGATTGTAATTCCAAGTTAAAGCAAGGAAACCAATTGGTAATGAATCCTTAAATCACTTGTCCATTTTGAAAATTTCCAAATAGGAATATGGTATTATGTTTCTTTGTGAAGGGTAAAATGATAGCACCAAGATTATGCATTTATTGACTAAACCGGATATTGATTGATGATAGTGGAAGTCTCACC
GTTTACAATGTACTACTCATAAAAGTGGGCTGAATATCTAATTGCACCAAGATAAGCAATTACAAAAGATTACAAAAATTACATTTGCAACTTTGAGGCCTTTTATCTCAAGGATGTCTCAACTTGTAATATACTCAATTTTGGTGGTGCTCTAAAAACATCTTTAATGCGATTACGTATTTCTTGTTTGCAAATTCAAC
AAGCTATGTAAGCTACTCAACTTTTCATATTGAATTAAGTGCA

Intron 2 GTATAGCACA ... GGTATCATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	76.04	75	22	238
A2	78.2	97	19	348
A3	77.09	107	32	360
A4	78.25	92	31	331
A5	76.24	43	11	138
A6	79.8	360	103	1422
A7	79.92	344	116	1369
A8	79.89	216	49	858
A9	78.31	400	111	1444
A10	77.46	367	76	1261

>TRINITY_DN106422_c0_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoform

AGGAATTGGAATGCAACTCAAAGCTTTTGTAAAAAAAATATAACTAAATTTTTTTTGCTGATTATTGTGCTCCCTCTCACGCCAAGTAAGGAATAACAGAATCGAATACAAACTCTATATATAATACAGCCAAACCACACCTATGATCGCACTCAGATTACATTTCAACAATGGAGGTGTCTGAAAGTACTGGTGCTAAG
CGATGGATTCCTCTCGAAGCCAATCCTGAAGTTATGAGTCAGTTTGCGTGGGGCCTTGGTATACCTGAAGAAGAAGCGGAGTTCTATGATGTTTATGGTTACGATGACGAGTTATTGGATATGGTGCCAAAACCTGTGTTAGCTGTAATCTTCCTTTATCCGCTTAATGACGCTACTGAAGTTAAGAAATCAGCTGAGGA
GGAACAAGTTGTTGAAGATGGACAGAAGGGAGTGAGCAGCAATGTTTATTTCATGCAACAAACTGTTGGAAATGCCTGTGGAACAGTTGCTATCCTCCATGCAGTAGGCAATATTCTGCCACAACTACATCTCCGTAATGGATCCTTTTTTGAAAGATTCTTTACATCCACTGCAGAGATGACGCCAGCAGAGCGGGCTG
AATTCCTTGAAAAGGATACAGAATTAGAGAGTGCACATTCTGTTGCAGCCACTGCAGGTCATACTGCTGCTCCTGATCTGAGCGTTAATGTGGATCTGCATTTTGTTTGCTTAACTTGTGTTGATGGAAAATTATATGAACTAGATGGAAGGTGGACTTCTCCTACATGCCATGGACCTAGTTCACCGGAAACCTTATTG
AAGGATTCTGTAAGAGTCGTTCAAAATGTTAGCAAGAAAATTCCTGATTCAGTGAATTTCAGTGTCATAGCCCTTTCCAAGAAAACCTGAGCTTGTACCATACTAATCATTATTCCGGAGTGCTCATCTTGAGAATTTTGAGACATGGAGGGCGGGGTTCTTCTGTGGATAGCTTCATCTTTTGAGATAAATGTTCAGAT
GTTGTGGTTGGGAGGTCGAATTGAGATACAAAATCAAGAATTCTTTCATCTACTGAAACTTAAATGCCAGTGCTATTCACAAACAGATGTTTTGAAGTCAATAGATGCTTAATGAGTAATTGCATTAGTTGGATAAGTTTACATCTGCTGTCTTGTAGTGTTGCGTGTTTAAAACACATAATTTTGCAGTCTTGGCTGTG
TAATTACTTTTTAGGTTTATCCTATATTTTCAAGGCCCACAGAACATTATGCAAATGAATACATATTCCATATATTTTCAAGGCCTACAGAACGTTATGCAAATGAATACATATTCCATGCTTATCACACCGATATACGGGAATATAATCGTGGTCCTTGTTTTTGAGTAAGTTTTGCGAACTTCTAATTGAGTATTGAT
TGTAAATGCTTGATCTAAGAAATGATTGTAATTCCAAGTTAAAGCAAGGAAACCAATTGGTAATGAATCCCG

>TRINITY_DN106422_c0_g1_i5 from sample A2 / Example unspliced isoform:

AGGAATTGGAATGCAACTCAAAGCTTTTGTAAAAAAAATATAACTAAATTTTTTTTGCTGATTATTGTGCTCCCTCTCACGCCAAGTAAGGAATAACAGAATCGAATACAAACTCTATATATAATACAGCCAAACCACACCTATGATCGCACTCAGgtatagcacaatttttcaggtttgattttcatcctcgaagcaga
gtttatagcgtacataggtttacaatcaatagtgtgtttatcggtatcatagATTACATTTCAACAATGGAGGTGTCTGAAAGTACTGGTGCTAAGCGATGGATTCCTCTCGAAGCCAATCCTGAAGTTATGAGTCAGTTTGCGTGGGGCCTTGGTATACCTGAAGAAGAAGCGGAGTTCTATGATGTTTATGGTTACGA
TGACGAGTTATTGGATATGGTGCCAAAACCTGTGTTAGCTGTAATCTTCCTTTATCCGCTTAATGACGCTACTGAAGTTAAGAAATCAGCTGAGGAGGAACAAGTTGTTGAAGATGGACAGAAGGGAGTGAGCAGCAATGTTTATTTCATGCAACAAACTGTTGGAAATGCCTGTGGAACAGTTGCTATCCTCCATGCAG
TAGGCAATATTCTGCCACAACTACATCTCCGTAATGGATCCTTTTTTGAAAGATTCTTTACATCCACTGCAGAGATGACGCCAGCAGAGCGGGCTGAATTCCTTGAAAAGGATACAGAATTAGAGAGTGCACATTCTGTTGCAGCCACTGCAGGTCATACTGCTGCTCCTGATCTGAGCGTTAATGTGGATCTGCATTTT
GTTTGCTTAACTTGTGTTGATGGAAAATTATATGAACTAGATGGAAGGTGGACTTCTCCTACATGCCATGGACCTAGTTCACCGGAAACCTTATTGAAGGATTCTGTAAGAGTCGTTCAAAATGTTAGCAAGAAAATTCCTGATTCAGTGAATTTCAGTGTCATAGCCCTTTCCAAGAAAACCTGAGCTTGTACCATACT
AATCATTATTCCGGAGTGCTCATCTTGAGAATTTTGAGACATGGAGGGCGGGGTTCTTCTGTGGATAGCTTCATCTTTTGAGATAAATGTTCAGATGTTGTGGTTGGGAGGTCGAATTGAGATACAAAATCAAGAATTCTTTCATCTACTGAAACTTAAATGCCAGTGCTATTCACAAACAGATGTTTTGAAGTCAATAG
ATGCTTAATGAGTAATTGCATTAGTTGGATAAGTTTACATCTGCTGTCTTGTAGTGTTGCGTGTTTAAAACACATAATTTTGCAGTCTTGGCTGTGTAATTACTTTTTAGGTTTATCCTATATTTTCAAGGCCCACAGAACATTATGCAAATGAATACATATTCCATATATTTTCAAGGCCTACAGAACGTTATGCAAAT
GAATACATATTCCATGCTTATCACACCGATATACGGGAATATAATCGTGGTCCTTGTTTTTGAGTAAGTTTTGCGAACTTCTAATTGAGTATTGATTGTAAATGCTTGATCTAAGAAATGATTGTAATTCCAAGTTAAAGCAAGGAAACCAATTGGTAATGAATCCCG

Intron 3 GTATCTAGAT ... TCTATAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	22.1	282	3	80
A2	16.83	331	0	67
A3	22.45	266	0	77
A4	18.25	215	0	48
A5	15.3	155	0	28
A6	21.29	2074	0	561
A7	21.06	1810	0	483
A8	24.35	1274	0	410
A9	20.38	1813	0	464
A10	21.58	1446	0	398

>TRINITY_DN112192_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

CCTATCACTACCTAAAAGTCCTCGAAACAATAGACCCCTTTCGAAGGCTAAAGGAATTGGAATGCAACTCAAAGCTTTTGTAAAAAAAATATAACTAAATTTTTTTTGCTGATTATTGTGCTCCCTCTCACGCCAAGTAAGGAATAACAGAATCGAATACAAACTCTATATATAATACAGCCAAACCACACCTATGATCG
CACTCAGGTATAGCACAATTTTTCAGGTTTGATTTTCATCCTCGAAGCAGAGTTTATAGCGTACATAGGTTTACAATCAATAGTGTGTTTATCGGTATCATAGATTACATTTCAACAATGGAGGTGTCTGAAAGTACTGGTGCTAAGCGATGGATTCCTCTCGAAGCCAATCCTGAAGTTATGAGTCAGTTTGCGTGGGG
CCTTGGTATACCTGAAGAAGAAGCGGAGTTCTATGATGTTTATGGTTACGATGACGAGTTATTGGATATGGTGCCAAAACCTGTGTTAGCTGTAATCTTCCTTTATCCGCTTAATGACGCTACTGAAGTTAAGAAATCAGCTGAGGAGGAACAAGTTGTTGAAGATGGACAGAAGGGAGTGAGCAGCAATGTTTATTTCA
TGCAACAAACTGTTGGAAATGCCTGTGGAACAGTTGCTATCCTCCATGCAGTAGGCAATATTCTGCCACAACTACATCTCCGTAATGGATCCTTTTTTGAAAGATTCTTTACATCCACTGCAGAGATGACGCCAGCAGAGCGGGCTGAATTCCTTGAAAAGGATACAGAATTAGAGAGTGCACATTCTGTTGCAGCCACT
GCAGGTCATACTGCTGCTCCTGATCTGAGCGTTAATGTGGATCTGCATTTTGTTTGCTTAACTTGTGTTGATGGAAAATTATATGAACTAGATGGAAGGTGGACTTCTCCTACATGCCATGGACCTAGTTCACCGGAAACCTTATTGAAGGATTCTGTAAGAGTCGTTCAAAATGTTAGCAAGAAAATTCCTGATTCAGT
GAATTTCAGTGTCATAGCCCTTTCCAAGAAAACCTGAGCTTGTACCATACTAATCATTATTCCGGAGTGCTCATCTTGAGAATTTTGAGACATGGAGGGCGGGGTTCTTCTGTGGATAGCTTCATCTTTTGAGATAAATGTTCAGATGTTGTGGTTGGGAGGTCGAATTGAGATACAAAATCAAGAATTCTTTCATCTAC
TGAAACTTAAATGCCAGTGCTATTCACAAACAGATGTTTTGAAGTCAATAGATGCTTAATGAGTAATTGCATTAGTTGGATAAGTTTACATCTGCTGTCTTGTAGTGTTGCGTGTTTAAAACACATAATTTTGCAGTCTTGGCTGTGTAATTACTTTTTAGGTTTATCCTATATTTTCAAGGCCCACAGAACATTATGCA
AATGAATACATATTCCATATATTTTCAAGGCCTACAGAACGTTATGCAAATGAATACATATTCCATGCTTATCACACCGATATACGGGAATATAATCGTGGTCCTTGTTTTTGAGTAAGTTTTGCGAACTTCTAATTGAGTATTGATTGTAAATGCTTGATCTAAGAAATGATTGTAATTCCAAGTTAAAGCAAGGAAAC
CAATTGGTAATGAATCCTTAAATCACTTGTCCATTTTGAAAATTTCCAAATAGGAATATGGTATTATGTTTCTTTGTGAAGGGTAAAATGATAGCACCAAGATTATGCATTTATTGACTAAACCGGATATTGATTGATGATAGTGGAAGTCTCACCGTTTACAATGTAC

>TRINITY_DN112192_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

AGTTGTTGAAGATGGACAGAAGgtatctagatactgttggtaacttttttagttgtggagatattcaatatatgtgtgtctgtttttctttagtgaggacttgagctatttcccaagtatctgagataaacatccattatctataacagGGAGTGAGCAGCAATGTTTATTTCATGCAACAAACTGTTGGAAATGCCTGT
GGAACAGTTGCTATCCTCCATGCAGTAGGCAATATTCTGCCACAACTACATCTCCGTAATGGATCCTTTTTTGAAAGATTCTTTACATCCACTGCAGAGATGACGCCAGCAGAGCGGGCTGAATTCCTTGAAAAGGATACAGAATTAGAGAGTGCACATTCTGTTGCAGCCACTGCAGGTCATACTGCTGTAAGGCACAA
ATCACCTTGCTGCCACAGCATCAATTGTTTAATTAATGTTGAATTCTATAAAAGGCCAGACAGTCAAGTGCATTTTTCAATATTTTGTCTAGCTTTAAATTTGTATTTATTTCATCAACCTTTGCTTGTTTTAGAACCTTCC

Intron 4 GTGACAACAT ... TTGCTGACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	15.81	195.2	0	33
A2	21.84	144.8	1.6	35
A3	19.07	153.4	1.4	31
A4	15.89	104	0	17
A5	15.88	60.8	0	10
A6	15.93	1353.2	0	222
A7	17.45	1044.6	0	191
A8	19.33	941.2	0	201
A9	17.05	1129.4	0	203
A10	14.63	848.2	0	120

>TRINITY_DN106422_c0_g1_i5 from sample A2 / Example spliced isoform

AGGAATTGGAATGCAACTCAAAGCTTTTGTAAAAAAAATATAACTAAATTTTTTTTGCTGATTATTGTGCTCCCTCTCACGCCAAGTAAGGAATAACAGAATCGAATACAAACTCTATATATAATACAGCCAAACCACACCTATGATCGCACTCAGGTATAGCACAATTTTTCAGGTTTGATTTTCATCCTCGAAGCAGA
GTTTATAGCGTACATAGGTTTACAATCAATAGTGTGTTTATCGGTATCATAGATTACATTTCAACAATGGAGGTGTCTGAAAGTACTGGTGCTAAGCGATGGATTCCTCTCGAAGCCAATCCTGAAGTTATGAGTCAGTTTGCGTGGGGCCTTGGTATACCTGAAGAAGAAGCGGAGTTCTATGATGTTTATGGTTACGA
TGACGAGTTATTGGATATGGTGCCAAAACCTGTGTTAGCTGTAATCTTCCTTTATCCGCTTAATGACGCTACTGAAGTTAAGAAATCAGCTGAGGAGGAACAAGTTGTTGAAGATGGACAGAAGGGAGTGAGCAGCAATGTTTATTTCATGCAACAAACTGTTGGAAATGCCTGTGGAACAGTTGCTATCCTCCATGCAG
TAGGCAATATTCTGCCACAACTACATCTCCGTAATGGATCCTTTTTTGAAAGATTCTTTACATCCACTGCAGAGATGACGCCAGCAGAGCGGGCTGAATTCCTTGAAAAGGATACAGAATTAGAGAGTGCACATTCTGTTGCAGCCACTGCAGGTCATACTGCTGCTCCTGATCTGAGCGTTAATGTGGATCTGCATTTT
GTTTGCTTAACTTGTGTTGATGGAAAATTATATGAACTAGATGGAAGGTGGACTTCTCCTACATGCCATGGACCTAGTTCACCGGAAACCTTATTGAAGGATTCTGTAAGAGTCGTTCAAAATGTTAGCAAGAAAATTCCTGATTCAGTGAATTTCAGTGTCATAGCCCTTTCCAAGAAAACCTGAGCTTGTACCATACT
AATCATTATTCCGGAGTGCTCATCTTGAGAATTTTGAGACATGGAGGGCGGGGTTCTTCTGTGGATAGCTTCATCTTTTGAGATAAATGTTCAGATGTTGTGGTTGGGAGGTCGAATTGAGATACAAAATCAAGAATTCTTTCATCTACTGAAACTTAAATGCCAGTGCTATTCACAAACAGATGTTTTGAAGTCAATAG
ATGCTTAATGAGTAATTGCATTAGTTGGATAAGTTTACATCTGCTGTCTTGTAGTGTTGCGTGTTTAAAACACATAATTTTGCAGTCTTGGCTGTGTAATTACTTTTTAGGTTTATCCTATATTTTCAAGGCCCACAGAACATTATGCAAATGAATACATATTCCATATATTTTCAAGGCCTACAGAACGTTATGCAAAT
GAATACATATTCCATGCTTATCACACCGATATACGGGAATATAATCGTGGTCCTTGTTTTTGAGTAAGTTTTGCGAACTTCTAATTGAGTATTGATTGTAAATGCTTGATCTAAGAAATGATTGTAATTCCAAGTTAAAGCAAGGAAACCAATTGGTAATGAATCCCG

>TRINITY_DN106422_c0_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:

GTTTATACTAATAGATTTAATTTTTATTTTTCCTCTTTAATCTACTGAAGTGATTCCTATTTCTTACACAATATTTGCAGGTAATGGATCCTTTTTTGAAAGATTCTTTACATCCACTGCAGAGATGACGCCAGCAGAGgtgacaacatctaacttgatttttcttttcttaatcccagttttgccatggacaatatttt
tctgtatttatttgctaacattttaatattgatattctttgctgacagCGGGCTGAATTCCTTGAAAAGGATACAGAATTAGAGAGTGCACATTCTGTTGCAGCCACTGCAGGTCATACTGCTGCTCCTGATCTGAGCGTTAATGTGGATCTGCATTTTGTTTGCTTAACTTGTGTTGATGGAAAATTATATGAACTAGA
TGGAAGGTGGACTTCTCCTACATGCCATGGACCTAGTTCACCGGAAACCTTATTGAAGGATTCTGTAAGAGTCGTTCAAAATGTTAGCAAGAAAATTCCTGATTCAGTGAATTTCAGTGTCATAGCCCTTTCCAAGAAAACCTGAGCTTGTACCATACTAATCATTATTCCGGAGTGCTCATCTTGAGAATTTTGAGACA
TGGAGGGCGGGGTTCTTCTGTGGATAGCTTCATCTTTTGAGATAAATGTTCAGATGTTGTGGTTGGGAGGTCGAATTGAGATACAAAATCAAGAATTCTTTCATCTACTGAAACTTAAATGCCAGTGCTATTCACAAACAGATGTTTTGAAGTCAATAGATGCTTAATGAGTAATTGCATTAGTTGGATAAGTTTACATC
TGCTGTCTTGTAGTGTTGCGTGTTTAAAACACATAATTTTGCAGTCTTGGCTGTGTAATTACTTTTTAGGTTTATCCTATATTTTCAAGGCCCACAGAACATTATGCAAATGAATACATATTCCATATATTTTCAAGGCCTACAGAACGTTATGCAAATGAATACATATTCCATGCTTATCACACCGATATACGGGAATA
TAATCGTGGTCCTTGTTTTTGAGTAAGTTTTGCGAACTTCTAATTGAGTATTGATTGTAAATGCTTGATCTAAGAAATGATTGTAATTCCAAGTTAAAGCAAGGAAACCAATTGGTAATGAATCCCG