sp|Q8LPQ6|AB28B_ARATH ----> ABC transporter B family member 28
Intron 1 GTCGATTTTT ... AATTCAAAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 58.49 | 11 | 11 | 20 |
| A2 | 70.59 | 5 | 8 | 16 |
| A3 | 54.05 | 17 | 14 | 26 |
| A4 | 54.09 | 14 | 19 | 14 |
| A5 | 43.48 | 13 | 13 | 7 |
| A6 | 53.85 | 3 | 5 | 2 |
| A7 | 38.46 | 8 | 6 | 4 |
| A8 | 42.86 | 2 | 0 | 3 |
| A9 | 55.56 | 2 | 4 | 1 |
| A10 | 48.15 | 7 | 3 | 10 |
>TRINITY_DN94835_c0_g1_i3 from sample A4 / Example spliced isoformGGATAGAGCAACACAGAGCAGTGTCCATGGCATCACCTCTACCGTTACCATGGTCATCCTTGCCATTCCGCAATTTTTATGGACCATCCCGCGGGAAATCAGCTCACGCTATCTCAATACCATCCTCCACCAAATTACGCTCTCTAAGGCGCAGGCAAAGTTCGTGTCCGTCTAGACCTGGTTCGGTGGAGATTCGAACC
CGCAGCTTCAGAGGAGTAGGAGGTGTTGGAGAATATCGTATCCACGTCCAGGCGGCTTACATTTCTCCGCCGGCTGTGGATCCTCATTTTGAATTGGAGAGCTCTAAAACTGCGTTAACAAATAATGGTATTGAGGGTGCGAAAACGGTACCAATAAGATGGAGCCTCATTGGGGCTCTGGTATTCAGGCACAAGCTGCG
CGTCGCTCTATCTGCCTTCGCCCTCGTTGGTTCCACGGTTTGTACGCTTACCATGCCCATTTTTACGGGTGGAGTTCTTTGACCGACATAAGGTTGGCGAGCTGACAGGATTGCTCACATCTGACTTGGGTGCTCTCAAGGATGTTGTGAATGAAAATATTTCTAGAGACCGTGGCCTTAGAGCATTTTCAGAGTTGGTA
GGAACACTAGTTATACTTTTTTCATTGTCAGCTCAGCTTGCTCCACTCTTTGGTGTGCTCATGCTTTCTGTATCAATTCTTGTGGCTGTATACAAACGCACCACAGTAACTGTCTTCAAATCACATGGGAATGCTCAAGCACGCATATCTGATTGTGCAGCTGAAACATTTTCAGCAATTCGGACAGTGAGATCCTTTGG
TGGAGAAGTGAGACAAATGTTCACATTTTCTGAGCAGGTTCTTTCTTATCAGAGGAGTGGAATTAAACTGGGATGGCTGAAATCTATTAATGAATCATTAACCAGAATCATGGTTTACATCTCATTGATGGCTCTGTACAGTATTGGTGGAAGCAAAGTGAAAATGGGTGAACTGTCTGTTGGAACCATGGCATCTTTTA
TTGGCTATACTTTCACATTGACATTTGCAGTGCAAGGCGTTGTGAACACACTGGGTGATTTTCGTGGGACACTTGCTGCAGTTGATCGGATCAATTCTGTCATATCTGGGACAGAGATTGATGAGTCGTTGGCTTTTGGATTAGAAAGACAGGCTCAAGTTGAACATGTAAGTTCTGGGGAGTATGAGAATGTTGCTGGC
ATGAATTTCAAGATTAGACGTTTCATGTCAGGGCTGAAATCAAAATCTAGTGTTCGCGAGCTAGCGTGGGCTGGAGATGTTGCTCTTGAAGATGTCTACTTTGCTTACCCACTGAGGCCTGATGTGCAAGTCTTGAATGGATTTACTCTTAACTTGAACCGCGGCTCAGTAACAGCTCTTGTGGGTTCAAGTGGTTCTGG
TAAAAGTACAATTGTACAACTCTTGGCACGCTTCTATGAGCCAACACAAGGTCGAATAACAATAGCTGGAGAAGATGTTCGGATGTTTGACAAAACTGAATGGGCACGTACTGTTTCCATTGTGAACCAGGAGCCAGTGTTATTTGCAATGTCAGTTGCGGAAAATATTGCCTATGGATTACCAAATGAGCAAATTGCAC
AAGAAGATATTGTTTCTGTCGCTAAATCTGCAAATGCCCATGACTTCATTGTTGCTCTTCCACAGGGTTATGACACATTAGTTGGTGAACGTGGAAGCCTCTTAAGTGGAGGCCAACGTCAGAGAGTTGCCATAGCCAGGGCTCTGTTGAAGAATGCTCCACTGTTGATACTTGATGAGGCAACCAGTGCTTTGGATGCT
GTTAGTGAGCGCCTTGTACAAGAAGCCCTTGACCATTTGATGAAGGGACGAACTACTTTGGTGATTGCACATAGGCTGAGCACTGTGCAAAATGCTAATCAAATAGCTGTAGTTTCAGA
>TRINITY_DN94835_c0_g1_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:GGATAGAGCAACACAGAGCAGTGTCCATGGCATCACCTCTACCGTTACCATGGTCATCCTTGCCATTCCGCAATTTTTATGGACCATCCCGCGGGAAATCAGCTCACGCTATCTCAATACCATCCTCCACCAAATTACGCTCTCTAAGGCGCAGGCAAAGTTCGTGTCCGTCTAGACCTGGTTCGGTGGAGATTCGAACC
CGCAGCTTCAGAGGAGTAGGAGGTGTTGGAGAATATCGTATCCACGTCCAGGCGGCTTACATTTCTCCGCCGGCTGTGGATCCTCATTTTGAATTGGAGAGCTCTAAAACTGCGTTAACAAATAATGGTATTGAGGGTGCGAAAACGGTACCAATAAGATGGAGCCTCATTGGGGCTCTGGTATTCAGGCACAAGCTGCG
CGTCGCTCTATCTGCCTTCGCCCTCGTTGGTTCCACGGTTTGTACGCTTACCATGCCCATTTTTACGGgtcgattttttgaaatccttattggtgggccaaactcagagcaactatgggggttgctcagtaaaataggtactctttatttattggaaccaatttttaccattatttttgtaacaaatatgagtacaatct
gggagaaggtgatggcaatattgcgttcagaactattcaggcgtatcttaattcaaaagGTGGAGTTCTTTGACCGACATAAGGTTGGCGAGCTGACAGGATTGCTCACATCTGACTTGGGTGCTCTCAAGGATGTTGTGAATGAAAATATTTCTAGAGACCGTGGCCTTAGAGCATTTTCAGAGTTGGTAGGAACACTA
GTTATACTTTTTTCATTGTCAGCTCAGCTTGCTCCACTCTTTGGTGTGCTCATGCTTTCTGTATCAATTCTTGTGGCTGTATACAAACGCACCACAGTAACTGTCTTCAAATCACATGGGAATGCTCAAGCACGCATATCTGATTGTGCAGCTGAAACATTTTCAGCAATTCGGACAGTGAGATCCTTTGGTGGAGAAGT
GAGACAAATGTTCACATTTTCTGAGCAGGTTCTTTCTTATCAGAGGAGTGGAATTAAACTGGGATGGCTGAAATCTATTAATGAATCATTAACCAGAATCATGGTTTACATCTCATTGATGGCTCTGTACAGTATTGGTGGAAGCAAAGTGAAAATGGGTGAACTGTCTGTTGGAACCATGGCATCTTTTATTGGCTATA
CTTTCACATTGACATTTGCAGTGCAAGGCGTTGTGAACACACTGGGTGATTTTCGTGGGACACTTGCTGCAGTTGATCGGATCAATTCTGTCATATCTGGGACAGAGATTGATGAGTCGTTGGCTTTTGGATTAGAAAGACAGGCTCAAGTTGAACATGTAAGTTCTGGGGAGTATGAGAATGTTGCTGGCATGAATTTC
AAGATTAGACGTTTCATGTCAGGGCTGAAATCAAAATCTAGTGTTCGCGAGCTAGCGTGGGCTGGAGATGTTGCTCTTGAAGATGTCTACTTTGCTTACCCACTGAGGCCTGATGTGCAAGTCTTGAATGGATTTACTCTTAACTTGAACCGCGGCTCAGTAACAGCTCTTGTGGGTTCAAGTGGTTCTGGTAAAAGTAC
AATTGTACAACTCTTGGCACGCTTCTATGAGCCAACACAAGGTCGAATAACAATAGCTGGAGAAGATGTTCGGATGTTTGACAAAACTGAATGGGCACGTACTGTTTCCATTGTGAACCAGGAGCCAGTGTTATTTGCAATGTCAGTTGCGGAAAATATTGCCTATGGATTACCAAATGAGCAAATTGCACAAGAAGATA
TTGTTTCTGTCGCTAAATCTGCAAATGCCCATGACTTCATTGTTGCTCTTCCACAGGGTTATGACACATTAGTTGGTGAACGTGGAAGCCTCTTAAGTGGAGGCCAACGTCAGAGAGTTGCCATAGCCAGGGCTCTGTTGAAGAATGCTCCACTGTTGATACTTGATGAGGCAACCAGTGCTTTGGATGCTGTTAGTGAG
CGCCTTGTACAAGAAGCCCTTGACCATTTGATGAAGGGACGAACTACTTTGGTGATTGCACATAGGCTGAGCACTGTGCAAAATGCTAATCAAATAGCTGTAGTTTCAGA
Intron 2 GTACTCTTTA ... AATTCAAAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 77.27 | 5 | 14 | 20 |
| A2 | 76.74 | 5 | 17 | 16 |
| A3 | 58.73 | 13 | 11 | 26 |
| A4 | 54.62 | 11.7 | 15 | 13 |
| A5 | 38.89 | 11 | 7 | 7 |
| A6 | 60 | 2 | 4 | 2 |
| A7 | 57.14 | 3 | 4 | 4 |
| A8 | 60 | 2 | 3 | 3 |
| A9 | 42.86 | 2 | 2 | 1 |
| A10 | 55.56 | 6 | 5 | 10 |
>TRINITY_DN44431_c2_g1_i4 from sample A9 / Example spliced isoformAGGGGATAGAGCAACACAGAGCAGTGTCCATGGCATCACCTCTACCGTTACCATGGTCATCCTTGCCATTCCGCAATTTTTATGGACCATCCCGCGGGAAATCAGCTCACGCTATCTCAATACCATCCTCCACCAAATTACGCTCTCTAAGGCGCAGGCAAAGTTCGTGTCCGTCTAGACCTGGTTCGGTGGAGATTCGA
ACCCGCAGCTTCAGAGGAGTAGGAGGTGTTGGAGAATATCGTATCCACGTCCAGGCGGCTTACATTTCTCCGCCGGCTGTGGATCCTCATTTTGAATTGGAGAGCTCTAAAACTGCGTTAACAAATAATGGTATTGAGGGTGCGAAAACGGTACCAATAAGATGGAGCCTCATTGGGGCTCTGGTATTCAGGCACAAGCT
GCGCGTCGCTCTATCTGCCTTCGCCCTCGTTGGTTCCACGGTTTGTACGCTTACCATGCCCATTTTTACGGGTCGATTTTTTGAAATCCTTATTGGTGGGCCAAACTCAGAGCAACTATGGGGGTTGCTCAGTAAAATAGGTGGAGTTCTTTGACCGACATAAGGTTGGCGAGCTGACAGGATTGCTCACATCTGACTTG
GGTGCTCTCAAGGATGTTGTGAATGAAAATATTTCTAGAGACCGTGGCCTTAGAGCATTTTCAGAGTTGGTAGGAACACTAGTTATACTTTTTTCATTGTCAGCTCAGCTTGCTCCACTCTTTGGTGTGCTCATGCTTTCTGTATCAATTCTTGTGGCTGTATACAAACGCACCACAGTAACTGTCTTCAAATCACATGG
GAATGCTCAAGCACGCATATCTGATTGTGCAGCTGAAACATTTTCAGCAATTCGGACAGTGAGATCCTTTGGTGGAGAAGTGAGACAAATGTTCACATTTTCTGAGCAGGTTCTTTCTTATCAGAGGAGTGGAATTAAACTGGGATGGCTGAAATCTATTAATGAATCATTAACCAGAATCATGGTTTACATCTCATTGA
TGGCTCTGTACAGTATTGGTGGAAGCAAAGTGAAAATGGGTGAACTGTCTGTTGGAACCATGGCATCTTTTATTGGCTATACTTTCACATTGACATTTGCAGTGCAAGGCGTTGTGAACACACTGGGTGATTTTCGTGGGACACTTGCTGCAGTTGATCGGATCAATTCTGTCATATCTGGGACAGAGATTGATGAGTCG
TTGGCTTTTGGATTAGAAAGACAGGCTCAAGTTGAACATGTAAGTTCTGGGGAGTATGAGAATGTTGCTGGCATGAATTTCAAGATTAGACGTTTCATGTCAGGGCTGAAATCAAAATCTAGTGTTCGCGAGCTAGCTTGGGCTGGAGATGTTGCTCTTGAAGATGTCTACTTTGCTTACCCACTGAGGCCTGATGTGCA
AGTCTTGAATGGATTTACTCTTAACTTGAACCGCGGCTCAGTAACAGCTCTTGTGGGTTCAAGTGGTTCTGGTAAAAGTACAATTGTACAACTCTTGGCACGCTTCTATGAGCCAACACAAGGTCGAATAACAATAGCTGGAGAAGATGTTCGGATGTTTGACAAAACTGAATGGGCACGTACTGTTTCCATTGTGAACC
AGGAGCCAGTGTTATTTGCAATGTCAGTTGCGGAAAATATTGCCTATGGATTACCAAATGAGCAAATTGCACAAGAAGATATTGTTTCTGTCGCTAAATCTGCAAATGCCCATGACTTCATTGTTGCTCTTCCACAGGGTTATGACACATTAGTTGGTGAACGTGGAAGCCTCTTAAGTGGAGGCCAACGTCAGAGAGTT
GCCATAGCCAGGGCTCTGTTGAAGAATGCTCCACTGTTGATACTTGATGAGGCAACCAGTGCTTTGGATGCTGTTAGTGAGCGCCTTGTACAAGAAGCCCTTGACCATTTGATGAAGGGACGAACTACTTTGGTGATTGCACATAGGCTGAGCACTGTGCAAAATGCTAATCAAATAGCTGTAGTTTCAGAGGGAAAAGT
GGTTGAATTGGGTCAGCACTCTGAGTTGTTGGCCCAAGGAGGTCTGTATTCTTCATTGGTGGATACTCAAAGGCTTGGATTTGAGTAATTTAATTTTTAACATGTCCAAATATGCGCTGCTGTACCTTATCCTTGGTGACACTAGGGACTTAATATGAAAAGCATGATTGAATTCTTTCCCCAAGGTTTTGGTCTCAATA
GTTGTAATAGTTACTGTCTACTCACACATGAATGAGCTCATGTCAAATAGTATTTTTTTTGGTGAGATGCTTCATATATTCACACAAAATATTTACATCAAGGGAAAACAAAAAGCGGAAGGGTATACACAATGATATTTATGTCCTCTTAAAGCAACAAGCCTGGCAATAATATCTGAATAGGCACTAGAGTCTAACAA
CTTGGAAACCTTGATCAACAAAAACCGTTTTGGAAGCAGTTACATACATACCCCTTCTCTCCAGAAAAGGTAAGAGGTAGACAAAAGCTAATCTCGTTCTTAAAAACATATTTGCATCGAAGCTTCCGGAGATGTAATATGCCAAGTAGTGGATTATGCCTACTGCATGTGTTTTCTTTCCTTGTTTTACTGTAGCTTCT
AGTTCTTTGGGTTTATTGATGGAGTGCAAGGTTTTGTATGACAGTTTGATTAGTCAAAGACTAATTGCATGTCATAAATAAAGATCATAAACCCAATAATATCAAGCTTGAGAACCCTGGTATATAGATCTGAATATTCATGTCTGATAATAAAGTGTACTTCAAATTAATCAGTGATAAGCATATATCAGAGATGTAGT
ATTTCTGGCCTTAAATAGAGATGACAGT
>TRINITY_DN44431_c2_g1_i2 from sample A9 / Example unspliced isoform:AGGGGATAGAGCAACACAGAGCAGTGTCCATGGCATCACCTCTACCGTTACCATGGTCATCCTTGCCATTCCGCAATTTTTATGGACCATCCCGCGGGAAATCAGCTCACGCTATCTCAATACCATCCTCCACCAAATTACGCTCTCTAAGGCGCAGGCAAAGTTCGTGTCCGTCTAGACCTGGTTCGGTGGAGATTCGA
ACCCGCAGCTTCAGAGGAGTAGGAGGTGTTGGAGAATATCGTATCCACGTCCAGGCGGCTTACATTTCTCCGCCGGCTGTGGATCCTCATTTTGAATTGGAGAGCTCTAAAACTGCGTTAACAAATAATGGTATTGAGGGTGCGAAAACGGTACCAATAAGATGGAGCCTCATTGGGGCTCTGGTATTCAGGCACAAGCT
GCGCGTCGCTCTATCTGCCTTCGCCCTCGTTGGTTCCACGGTTTGTACGCTTACCATGCCCATTTTTACGGGTCGATTTTTTGAAATCCTTATTGGTGGGCCAAACTCAGAGCAACTATGGGGGTTGCTCAGTAAAATAGgtactctttatttattggaaccaatttttaccattatttttgtaacaaatatgagtacaa
tctgggagaaggtgatggcaatattgcgttcagaactattcaggcgtatcttaattcaaaagGTGGAGTTCTTTGACCGACATAAGGTTGGCGAGCTGACAGGATTGCTCACATCTGACTTGGGTGCTCTCAAGGATGTTGTGAATGAAAATATTTCTAGAGACCGTGGCCTTAGAGCATTTTCAGAGTTGGTAGGAACA
CTAGTTATACTTTTTTCATTGTCAGCTCAGCTTGCTCCACTCTTTGGTGTGCTCATGCTTTCTGTATCAATTCTTGTGGCTGTATACAAACGCACCACAGTAACTGTCTTCAAATCACATGGGAATGCTCAAGCACGCATATCTGATTGTGCAGCTGAAACATTTTCAGCAATTCGGACAGTGAGATCCTTTGGTGGAGA
AGTGAGACAAATGTTCACATTTTCTGAGCAGGTTCTTTCTTATCAGAGGAGTGGAATTAAACTGGGATGGCTGAAATCTATTAATGAATCATTAACCAGAATCATGGTTTACATCTCATTGATGGCTCTGTACAGTATTGGTGGAAGCAAAGTGAAAATGGGTGAACTGTCTGTTGGAACCATGGCATCTTTTATTGGCT
ATACTTTCACATTGACATTTGCAGTGCAAGGCGTTGTGAACACACTGGGTGATTTTCGTGGGACACTTGCTGCAGTTGATCGGATCAATTCTGTCATATCTGGGACAGAGATTGATGAGTCGTTGGCTTTTGGATTAGAAAGACAGGCTCAAGTTGAACATGTAAGTTCTGGGGAGTATGAGAATGTTGCTGGCATGAAT
TTCAAGATTAGACGTTTCATGTCAGGGCTGAAATCAAAATCTAGTGTTCGCGAGCTAGCTTGGGCTGGAGATGTTGCTCTTGAAGATGTCTACTTTGCTTACCCACTGAGGCCTGATGTGCAAGTCTTGAATGGATTTACTCTTAACTTGAACCGCGGCTCAGTAACAGCTCTTGTGGGTTCAAGTGGTTCTGGTAAAAG
TACAATTGTACAACTCTTGGCACGCTTCTATGAGCCAACACAAGGTCGAATAACAATAGCTGGAGAAGATGTTCGGATGTTTGACAAAACTGAATGGGCACGTACTGTTTCCATTGTGAACCAGGAGCCAGTGTTATTTGCAATGTCAGTTGCGGAAAATATTGCCTATGGATTACCAAATGAGCAAATTGCACAAGAAG
ATATTGTTTCTGTCGCTAAATCTGCAAATGCCCATGACTTCATTGTTGCTCTTCCACAGGGTTATGACACATTAGTTGGTGAACGTGGAAGCCTCTTAAGTGGAGGCCAACGTCAGAGAGTTGCCATAGCCAGGGCTCTGTTGAAGAATGCTCCACTGTTGATACTTGATGAGGCAACCAGTGCTTTGGATGCTGTTAGT
GAGCGCCTTGTACAAGAAGCCCTTGACCATTTGATGAAGGGACGAACTACTTTGGTGATTGCACATAGGCTGAGCACTGTGCAAAATGCTAATCAAATAGCTGTAGTTTCAGAGGGAAAAGTGGTTGAATTGGGTCAGCACTCTGAGTTGTTGGCCCAAGGAGGTCTGTATTCTTCATTGGTGGATACTCAAAGGCTTGG
ATTTGAGTAATTTAATTTTTAACATGTCCAAATATGCGCTGCTGTACCTTATCCTTGGTGACACTAGGGACTTAATATGAAAAGCATGATTGAATTCTTTCCCCAAGGTTTTGGTCTCAATAGTTGTAATAGTTACTGTCTACTCACACATGAATGAGCTCATGTCAAATAGTATTTTTTTTGGTGAGATGCTTCATATA
TTCACACAAAATATTTACATCAAGGGAAAACAAAAAGCGGAAGGGTATACACAATGATATTTATGTCCTCTTAAAGCAACAAGCCTGGCAATAATATCTGAATAGGCACTAGAGTCTAACAACTTGGAAACCTTGATCAACAAAAACCGTTTTGGAAGCAGTTACATACATACCCCTTCTCTCCAGAAAAGGTAAGAGGT
AGACAAAAGCTAATCTCGTTCTTAAAAACATATTTGCATCGAAGCTTCCGGAGATGTAATATGCCAAGTAGTGGATTATGCCTACTGCATGTGTTTTCTTTCCTTGTTTTACTGTAGCTTCTAGTTCTTTGGGTTTATTGATGGAGTGCAAGGTTTTGTATGACAGTTTGATTAGTCAAAGACTAATTGCATGTCATAAA
TAAAGATCATAAACCCAATAATATCAAGCTTGAGAACCCTGGTATATAGATCTGAATATTCATGTCTGATAATAAAGTGTACTTCAAATTAATCAGTGATAAGCATATATCAGAGATGTAGTATTTCTGGCCTTAAATAGAGATGACAGT