sp|Q9LW49|ERF4_NICSY ----> Ethylene-responsive transcription factor 4

Intron 1 GTATGTAAGT ... ATGTTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	61.54	5	9	7
A2	65.96	8	23	8
A3	65.52	5	17	2
A4	59.18	10	23	6
A5	53.85	6	13	1
A6	66.84	32	100	29
A7	62.64	17	37	20
A8	60.23	35	52	54
A9	54.64	22	39	14
A10	58.67	31	56	32

>TRINITY_DN41395_c0_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoform

CCTTATTTCACGCACGCTTCTCCACAGGTCTGCGTGTTGATTCCCGCCGCGTTAATCAAAGCTCGGCCGCGGAGTTTCTAAAAATCCTTCCTACCAAGGGTTTCAAAAACTGCGAATAAATACCTCGTTTTTGGTTGAAATTTACACCGAAGTGGGGGTTTCCATACAGATGCCGTATTGTAAGGCGTCCCCGATCGTTT
CCCTGCGAGAAGACTGAAGATTATTGTGTTATTCAGCTTCAGAGATCTGCCGCTGGAGCTTAGCCCGAACCCTGTATTCTGGATGCTCGTCCGGCCTCAGATCGTTCAGTTTACCCCGATCTTTTAATGCTGGAAAAAATGTTTTAATCGGCGAAGTATTTGGAGGTCATCGGGTTTAAATATTGAAGCCGTTTTGGAGT
CCTGTGAAATTCGCTTTCGAAGGGGCGGATTTTCGGTTTGCTGAAGATTATTGTTTAGTTTTTAGTTCGCTTTTGCAGGGGCAAATATTCTGTTTTCGCCGGTTCTCGGCGTTTGCTATATTGAAAGCATAGGGTTAGGGTTTCAAAGCATTGACCTGCGTATTATTGAAAATACAGGGATCTAAAACCTATTTTGTTAA
TTTTTGTGTTTGGCCCTTGCGTCTGTCAGATAAGGTGTATTTTTTAGATTTGCAGGAAGAAACCTGTAAATCTCTGATTTAAACCTTAGGGTTTGTATCTGGCTATCTGTTTCCTAAAATGCTCAGGCAGCAAGCAAAAAATGCCTGGCAAGACGTCGAAAACGTCACCAAAGTCAAGGAAGTGAAATTTAGAGGTGTTC
GGAAGCGTCCCTGGGGAAGATTTGCTGCGGAGATCAGAGATCCGGTGAAAAAGGCGAGAGTTTGGCTCGGCACATTTGATACGGCCGAAGAAGCGGCCTATGCTTACGATGAAGCTGCTAGAGCTCTGAGAGGTGCCAAGGCGAAGACAAATTTCGCTGTTCCCTGCGATGATCAGAGTACAAGCCATAGCAGTACCGTG
GAGTCTTCAAGCGGTCCCAGAAATCAGAGCATTTCGAAGAAAGCTTTTAATTTGAACGGGAGTGGAAGCAGCTTTGGCGAAACTAGCGTTCGAAACCCTCGAAATAGAAGGGTTAAAGACGCATTGCGGTGTGGCAGCGATATTTATAAAAGATATAGACGAAGCAGGGTTTCTGAAGTGCGGGATTTGTCTAACGGTCC
TGTACAGCAGCCAGGGTGTGATGCCGGTCCTTGCCACAGCGACTGCGATTCGTCGTCGTCTGTAGTAGTGGACAATGATGTTAATTCTGGCGAAGATTTGCCGTGTGATGTGAAACCCTCGCAGGAAACGAGTTTTGATCTCAATCTTTACAAGGAATGGAGAAGCCCGGAGCGACAAGAGCGGAAAATGTTGCCAGATT
TGAACCTTCCTCCCTCTGATGATGATGCGGAAGATTACCGGGATTTGCTGGCCATATCGTTGCGGATCTGATAACTGACGGTAATTTTCTTGTTTTCGTCTCCTCATATTGACAGGAGTTTGTTTGTGATCGCAAACGTCAATTGCAGTCAATTTGCCGTGCTCGAGCGTGTGATCGGTTTTCTTAGAAGTAATCCTTCC
GAGTATTCGACTGATCCTCCTGATTTCTCTGCCACAAGTCACATTTTGTTATTTGGTGGATGATTTGTAGGAATCTGTCCGATTAGTCTGAAGAGCGGACATTTTTTTTAATTGGCTATGAACATGGGAAGATTATATATAGCCGATGCAGAATCATCTTAATAATGAGACATTGGTTTATTTCTTGTAAAGAAGTAGAT
TTCCCAATGTTCTTATTTGTCAGAAGAAACATTTGCTGTCTGTTTTCATCTTGGGGTACTCCCGGGGATGCTATCCCCACACATTTCTTGCAACCTTGTCATGATAATATATGTATTTGAAGTTGTATTTCACTCTTAGGATGTTCCAAATCTTACAGGTTAGTAATCTTAAGATGAGTAAACTTAACCTCATCTTCCAA
CACAATTACCCACATTGATCCCTTTTGATGCTTGATGCTTAACTGGTTCCAAAGGTGGATGGATTGGAAACTAACATAGATTCATCTTGGATTGGAAAATAAACTAACATGGATTCATCTTAACCTTCAGATCAGATCTATTTAACATAGCTTCATCTTAACCTTAAACATAGCTTCATCTTAACCTTTGTATAAGCACT
GATACTGAAATGAATAAAAAACAGGCCTAGATCTCTTGCTGCATAATAAAATCTAACATAGATTCATCTTAACCTTCAGATCA

>TRINITY_DN41395_c0_g1_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:

CCTTATTTCACGCACGCTTCTCCACAGGTCTGCGTGTTGATTCCCGCCGCGTTAATCAAAGCTCGGCCGCGGAGTTTCTAAAAATCCTTCCTACCAAGGGTTTCAAAAACTGCGAATAAATACCTCGTTTTTGGTTGAAATTTACACCGAAGTGGGGGTTTCCATACAGATGCCGTATTGTAAGGCGTCCCCGATCGTTT
CCCTGCGAGAAGACTGAAGATTATTGTGTTATTCAGCTTCAGAGATCTGCCGCTGGAGCTTAGCCCGAACCCTGTATTCTGGATGCTCGTCCGGCCTCAGATCGTTCAGTTTACCCCGATCTTTTAATGCTGGAAAAAATGTTTTAATCGGCGAAGTATTTGGAGGTCATCGGGTTTAAATATTGAAGCCGTTTTGGAGT
CCTGTGAAATTCGCTTTCGAAGGGGCGGATTTTCGGTTTGCTGAAGATTATTGTTTAGTTTTTAGTTCGCTTTTGCAGGGGCAAATATTCTGTTTTCGCCGGTTCTCGGCGTTTGCTATATTGAAAGCATAGGGTTAGGGTTTCAAAGCATTGACCTGCGTATTATTGAAAATACAGGGATCTAAAACCTATTTTGTTAA
TTTTTGTGTTTGGCCCTTGCGTCTGTCAGATAAGGTGTATTTTTTAGATTTGCAGGAAGAAACCTGTAAATCTCTGATTTAAACCTTAGGGTTTGTATCTGGCTATCTGTTTCCTAAAATGCTCAGGCAGCAAGCAAAAAATGCCTGGCAAGACGTCGAAAACGTCACCAAAGTCAAGGAAGTGAAATTTAGAGGTGTTC
GGAAGCGTCCCTGGGGAAGATTTGCTGCGGAGATCAGAGATCCGGTGAAAAAGGCGAGAGTTTGGCTCGGCACATTTGATACGGCCGAAGAAGCGGCCTATGCTTACGATGAAGCTGCTAGAGCTCTGAGAGGTGCCAAGGCGAAGACAAATTTCGCTGTTCCCTGCGATGATCAGAGTACAAGCCATAGCAGTACCGTG
GAGTCTTCAAGCGGTCCCAGAAATCAGAGCATTTCGAAGAAAGCTTTTAATTTGAACGGGAGTGGAAGCAGCTTTGGCGAAACTAGCGTTCGAAACCCTCGAAATAGAAGGGTTAAAGACGCATTGCGGTGTGGCAGCGATATTTATAAAAGATATAGACGAAGCAGGGTTTCTGAAGTGCGGGATTTGTCTAACGGTCC
TGTACAGCAGCCAGGGTGTGATGCCGGTCCTTGCCACAGCGACTGCGATTCGTCGTCGTCTGTAGTAGTGGACAATGATGTTAATTCTGGCGAAGATTTGCCGTGTGATGTGAAACCCTCGCAGGAAACGAGTTTTGATCTCAATCTTTACAAGGAATGGAGAAGCCCGGAGCGACAAGAGCGGAAAATGTTGCCAGATT
TGAACCTTCCTCCCTCTGATGATGATGCGGAAGATTACCGGGATTTGCTGGCCATATCGTTGCGGATCTGATAACTGACGGTAATTTTCTTGTTTTCGTCTCCTCATATTGACAGGAGTTTGTTTGTGATCGCAAACGTCAATTGCAGTCAATTTGCCGTGCTCGAGCGTGTGATCGGTTTTCTTAGAAGTAATCCTTCC
GAGTATTCGACTGATCCTCCTGgtatgtaagttggtgctcaaggatttttccttttagcttaaaaaattggcgaaaaagctctagcttttaccacaatggtaatcttatttttgtgactctggattgcgagttgctctttcaatttacatttgagacctgcgaggccaaatggtccctatttatttattagggtcctcct
ttttggcgataatatatattagattgtacagagaagaaatgggtaatgtagtatgctagtagcagtttatggtcaattagatttgattcatggccattcagatttaatgaaacaggtaatggaattgactacagctatttttgttagcaagatctcatacgtttttgtttacgaatgtttgcagATTTCTCTGCCACAAG
TCACATTTTGTTATTTGGTGGATGATTTGTAGGAATCTGTCCGATTAGTCTGAAGAGCGGACATTTTTTTTAATTGGCTATGAACATGGGAAGATTATATATAGCCGATGCAGAATCATCTTAATAATGAGACATTGGTTTATTTCTTGTAAAGAAGTAGATTTCCCAATGTTCTTATTTGTCAGAAGAAACATTTGCTG
TCTGTTTTCATCTTGGGGTACTCCCGGGGATGCTATCCCCACACATTTCTTGCAACCTTGTCATGATAATATATGTATTTGAAGTTGTATTTCACTCTTAGGATGTTCCAAATCTTACAGGTTAGTAATCTTAAGATGAGTAAACTTAACCTCATCTTCCAACACAATTACCCACATTGATCCCTTTTGATGCTTGATGC
TTAACTGGTTCCAAAGGTGGATGGATTGGAAACTAACATAGATTCATCTTGGATTGGAAAATAAACTAACATGGATTCATCTTAACCTTCAGATCAGATCTATTTAACATAGCTTCATCTTAACCTTAAACATAGCTTCATCTTAACCTTTGTATAAGCACTGATACTGAAATGAATAAAAAACAGGCCTAGATCTCTTG
CTGCATAATAAAATCTAACATAGATTCATCTTAACCTTCAGATCA

Intron 2 ATAGCTTCAT ... AACCTTAAAC

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	50	22	20	24
A2	46.67	8	6	8
A3	57.89	4	5	6
A4	61.9	8	13	13
A5	53.33	7	8	8
A6	-1	0	0	0
A7	50	2	2	2
A8	-1	0	0	0
A9	-1	0	0	0
A10	45.45	3	2	3

>TRINITY_DN95110_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

CGCCGCGTTAATCAAAGCTCGGCCGCGGAGTTTCTAAAAATCCTTCCTACCAAGGGTTTCAAAAACTGCGAATAAATACCTCGTTTTTGGTTGAAATTTACACCGAAGTGGGGGTTTCCATACAGATGCCGTATTGTAAGGCGTCCCCGATCGTTTCCCTGCGAGAAGACTGAAGATTATTGTGTTATTCAGCTTCAGAG
ATCTGCCGCTGGAGCTTAGCCCGAACCCTGTATTCTGGATGCTCGTCCGGCCTCAGATCGTTCAGTTTACCCCGATCTTTTAATGCTGGAAAAAATGTTTTAATCGGCGAAGTATTTGGAGGTCATCGGGTTTAAATATTGAAGCCGTTTTGGAGTCCTGTGAAATTCGCTTTCGAAGGGGCGGATTTTCGGTTTGCTGA
AGATTATTGTTTAGTTTTTAGTTCGCTTTTGCAGGGGCAAATATTCTGTTTTCGCCGGTTCTCGGCGTTTGCTATATTGAAAGCATAGGGTTAGGGTTTCAAAGCATTGACCTGCGTATTATTGAAAATACAGGGATCTAAAACCTATTTTGTTAATTTTTGTGTTTGGCCCTTGCGTCTGTCAGATAAGGTGTATTTTT
TAGATTTGCAGGAAGAAACCTGTAAATCTCTGATTTAAACCTTAGGGTTTGTATCTGGCTATCTGTTTCCTAAAATGCTCAGGCAGCAAGCAAAAAATGCCTGGCAAGACGTCGAAAACGTCACCAAAGTCAAGGAAGTGAAATTTAGAGGTGTTCGGAAGCGTCCCTGGGGAAGATTTGCTGCGGAGATCAGAGATCCG
GTGAAAAAGGCGAGAGTTTGGCTCGGCACATTTGATACGGCCGAAGAAGCGGCCTATGCTTACGATGAAGCTGCTAGAGCTCTGAGAGGTGCCAAGGCGAAGACAAATTTCGCTGTTCCCTGCGATGATCAGAGTACAAGCCATAGCAGTACCGTGGAGTCTTCAAGCGGTCCCAGAAATCAGAGCATTTCGAAGAAAGC
TTTTAATTTGAACGGGAGTGGAAGCAGCTTTGGCGAAACTAGCGTTCGAAACCCTCGAAATAGAAGGGTTAAAGACGCATTGCGGTGTGGCAGCGATATTTATAAAAGATATAGACGAAGCAGGGTTTCTGAAGTGCGGGATTTGTCTAACGGTCCTGTACAGCAGCCAGGGTGTGATGCCGGTCCTTGCCACAGCGACT
GCGATTCGTCGTCGTCTGTAGTAGTGGACAATGATGTTAATTCTGGCGAAGATTTGCCGTGTGATGTGAAACCCTCGCAGGAAACGAGTTTTGATCTCAATCTTTACAAGGAATGGAGAAGCCCGGAGCGACAAGAGCGGAAAATGTTGCCAGATTTGAACCTTCCTCCCTCTGATGATGATGCGGAAGATTACCGGGAT
TTGCTGGCCATATCGTTGCGGATCTGATAACTGACGGTAATTTTCTTGTTTTCGTCTCCTCATATTGACAGGAGTTTGTTTGTGATCGCAAACGTCAATTGCAGTCAATTTGCCGTGCTCGAGCGTGTGATCGGTTTTCTTAGAAGTAATCCTTCCGAGTATTCGACTGATCCTCCTGGTATGTAAGTTGGTGCTCAAGG
ATTTTTCCTTTTAGCTTAAAAAATTGGCGAAAAAGCTCTAGCTTTTACCACAATGGTAATCTTATTTTTGTGACTCTGGATTGCGAGTTGCTCTTTCAATTTACATTTGAGACCTGCGAGGCCAAATGGTCCCTATTTATTTATTAGGGTCCTCCTTTTTGGCGATAATATATATTAGATTGTACAGAGAAGAAATGGGT
AATGTAGTATGCTAGTAGCAGTTTATGGTCAATTAGATTTGATTCATGGCCATTCAGATTTAATGAAACAGGTAATGGAATTGACTACAGCTATTTTTGTTAGCAAGATCTCATACGTTTTTGTTTACGAATGTTTGCAGATTTCTCTGCCACAAGTCACATTTTGTTATTTGGTGGATGATTTGTAGGAATCTGTCCGA
TTAGTCTGAAGAGCGGACATTTTTTTTAATTGGCTATGAACATGGGAAGATTATATATAGCCGATGCAGAATCATCTTAATAATGAGACATTGGTTTATTTCTTGTAAAGAAGTAGATTTCCCAATGTTCTTATTTGTCAGAAGAAACATTTGCTGTCTGTTTTCATCTTGGGGTACTCCCGGGGATGCTATCCCCACAC
ATTTCTTGCAACCTTGTCATGATAATATATGTATTTGAAGTTGTATTTCACTCTTAGGATGTTCCAAATCTTACAGGTTAGTAATCTTAAGATGAGTAAACTTAACCTCATCTTCCAACACAATTACCCACATTGATCCCTTTTGATGCTTGATGCTTAACTGGTTCCAAAGGTGGATGGATTGGAAACTAACATAGATT
CATCTTGGATTGGAAAATAAACTAACATGGATTCATCTTAACCTTCAGATCAGATCTATTTAACATAGATTCATCTTAACCTTTGTATAAGCACTGATACTGAAAGGAATAAAAAACAGGCCTAGATCTCTTGCTGGAGAATAAAATGGGTTCCTTTTCTTACCAATCTTGTTTATTAGCATTATCCCTGGCATCCAGTC
TTGAATGTGATGTATCTCTTCCACCTGGGCTTTAGAGTCTGCCTTGCGTGATTTGGTGTAAAAATTTAGCATAAATCCAAGTTTCAGTCTTGAATGTGATGTATCTC

>TRINITY_DN95110_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CGCCGCGTTAATCAAAGCTCGGCCGCGGAGTTTCTAAAAATCCTTCCTACCAAGGGTTTCAAAAACTGCGAATAAATACCTCGTTTTTGGTTGAAATTTACACCGAAGTGGGGGTTTCCATACAGATGCCGTATTGTAAGGCGTCCCCGATCGTTTCCCTGCGAGAAGACTGAAGATTATTGTGTTATTCAGCTTCAGAG
ATCTGCCGCTGGAGCTTAGCCCGAACCCTGTATTCTGGATGCTCGTCCGGCCTCAGATCGTTCAGTTTACCCCGATCTTTTAATGCTGGAAAAAATGTTTTAATCGGCGAAGTATTTGGAGGTCATCGGGTTTAAATATTGAAGCCGTTTTGGAGTCCTGTGAAATTCGCTTTCGAAGGGGCGGATTTTCGGTTTGCTGA
AGATTATTGTTTAGTTTTTAGTTCGCTTTTGCAGGGGCAAATATTCTGTTTTCGCCGGTTCTCGGCGTTTGCTATATTGAAAGCATAGGGTTAGGGTTTCAAAGCATTGACCTGCGTATTATTGAAAATACAGGGATCTAAAACCTATTTTGTTAATTTTTGTGTTTGGCCCTTGCGTCTGTCAGATAAGGTGTATTTTT
TAGATTTGCAGGAAGAAACCTGTAAATCTCTGATTTAAACCTTAGGGTTTGTATCTGGCTATCTGTTTCCTAAAATGCTCAGGCAGCAAGCAAAAAATGCCTGGCAAGACGTCGAAAACGTCACCAAAGTCAAGGAAGTGAAATTTAGAGGTGTTCGGAAGCGTCCCTGGGGAAGATTTGCTGCGGAGATCAGAGATCCG
GTGAAAAAGGCGAGAGTTTGGCTCGGCACATTTGATACGGCCGAAGAAGCGGCCTATGCTTACGATGAAGCTGCTAGAGCTCTGAGAGGTGCCAAGGCGAAGACAAATTTCGCTGTTCCCTGCGATGATCAGAGTACAAGCCATAGCAGTACCGTGGAGTCTTCAAGCGGTCCCAGAAATCAGAGCATTTCGAAGAAAGC
TTTTAATTTGAACGGGAGTGGAAGCAGCTTTGGCGAAACTAGCGTTCGAAACCCTCGAAATAGAAGGGTTAAAGACGCATTGCGGTGTGGCAGCGATATTTATAAAAGATATAGACGAAGCAGGGTTTCTGAAGTGCGGGATTTGTCTAACGGTCCTGTACAGCAGCCAGGGTGTGATGCCGGTCCTTGCCACAGCGACT
GCGATTCGTCGTCGTCTGTAGTAGTGGACAATGATGTTAATTCTGGCGAAGATTTGCCGTGTGATGTGAAACCCTCGCAGGAAACGAGTTTTGATCTCAATCTTTACAAGGAATGGAGAAGCCCGGAGCGACAAGAGCGGAAAATGTTGCCAGATTTGAACCTTCCTCCCTCTGATGATGATGCGGAAGATTACCGGGAT
TTGCTGGCCATATCGTTGCGGATCTGATAACTGACGGTAATTTTCTTGTTTTCGTCTCCTCATATTGACAGGAGTTTGTTTGTGATCGCAAACGTCAATTGCAGTCAATTTGCCGTGCTCGAGCGTGTGATCGGTTTTCTTAGAAGTAATCCTTCCGAGTATTCGACTGATCCTCCTGGTATGTAAGTTGGTGCTCAAGG
ATTTTTCCTTTTAGCTTAAAAAATTGGCGAAAAAGCTCTAGCTTTTACCACAATGGTAATCTTATTTTTGTGACTCTGGATTGCGAGTTGCTCTTTCAATTTACATTTGAGACCTGCGAGGCCAAATGGTCCCTATTTATTTATTAGGGTCCTCCTTTTTGGCGATAATATATATTAGATTGTACAGAGAAGAAATGGGT
AATGTAGTATGCTAGTAGCAGTTTATGGTCAATTAGATTTGATTCATGGCCATTCAGATTTAATGAAACAGGTAATGGAATTGACTACAGCTATTTTTGTTAGCAAGATCTCATACGTTTTTGTTTACGAATGTTTGCAGATTTCTCTGCCACAAGTCACATTTTGTTATTTGGTGGATGATTTGTAGGAATCTGTCCGA
TTAGTCTGAAGAGCGGACATTTTTTTTAATTGGCTATGAACATGGGAAGATTATATATAGCCGATGCAGAATCATCTTAATAATGAGACATTGGTTTATTTCTTGTAAAGAAGTAGATTTCCCAATGTTCTTATTTGTCAGAAGAAACATTTGCTGTCTGTTTTCATCTTGGGGTACTCCCGGGGATGCTATCCCCACAC
ATTTCTTGCAACCTTGTCATGATAATATATGTATTTGAAGTTGTATTTCACTCTTAGGATGTTCCAAATCTTACAGGTTAGTAATCTTAAGATGAGTAAACTTAACCTCATCTTCCAACACAATTACCCACATTGATCCCTTTTGATGCTTGATGCTTAACTGGTTCCAAAGGTGGATGGATTGGAAACTAACATAGATT
CATCTTGGATTGGAAAATAAACTAACATGGATTCATCTTAACCTTCAGATCAGATCTATTTAACatagcttcatcttaaccttaaacATAGATTCATCTTAACCTTTGTATAAGCACTGATACTGAAAGGAATAAAAAACAGGCCTAGATCTCTTGCTGGAGAATAAAATGGGTTCCTTTTCTTACCAATCTTGTTTATT
AGCATTATCCCTGGCATCCAGTCTTGAATGTGATGTATCTCTTCCACCTGGGCTTTAGAGTCTGCCTTGCGTGATTTGGTGTAAAAATTTAGCATAAATCCAAGTTTCAGTCTTGAATGTGATGTATCTC

Intron 3 GTAATTTTCT ... ATGTTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	70.37	4	12	7
A2	60.71	11	26	8
A3	92.86	1	24	2
A4	85.19	2	17	6
A5	55.56	4	9	1
A6	64.47	35	98	29
A7	61.4	22	50	20
A8	59.38	39	60	54
A9	74.36	10	44	14
A10	66.67	25	68	32

>TRINITY_DN35289_c0_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoform

ACGCAATATTTGCACCGACTCTCAACCTTCCGCTTCTCCTTATTTCACGCACGCTTCTCCACAGGTCTGCGTGTTGATTCCCGCCGCGTTAATCAAAGCTCGGCCGCGGAGTTTCTAAAAATCCTTCCTACCAAGGGTTTCAAAAACTGCGAATAAATACCTCGTTTTTGGTTGAAATTTACACCGAAGTGGGGGTTTCC
ATACAGATGCCGTATTGTAAGGCGTCCCCGATCGTTTCCCTGCGAGAAGACTGAAGATTATTGTGTTATTCAGCTTCAGAGATCTGCCGCTGGAGCTTAGCCCGAACCCTGTATTCTGGATGCTCGTCCGGCCTCAGATCGTTCAGTTTACCCCGATCTTTTAATGCTGGAAAAAATGTTTTAATCGGCGAAGTATTTGG
AGGTCATCGGGTTTAAATATTGAAGCCGTTTTGGAGTCCTGTGAAATTCGCTTTCGAAGGGGCGGATTTTCGGTTTGCTGAAGATTATTGTTTAGTTTTTAGTTCGCTTTTGCAGGGGCAAATATTCTGTTTTCGCCGGTTCTCGGCGTTTGCTATATTGAAAGCATAGGGTTAGGGTTTCAAAGCATTGACCTGCGTAT
TATTGAAAATACAGGGATCTAAAACCTATTTTGTTAATTTTTGTGTTTGGCCCTTGCGTCTGTCAGATAAGGTGTATTTTTTAGATTTGCAGGAAGAAACCTGTAAATCTCTGATTTAAACCTTAGGGTTTGTATCTGGCTATCTGTTTCCTAAAATGCTCAGGCAGCAAGCAAAAAATGCCTGGCAAGACGTCGAAAAC
GTCACCAAAGTCAAGGAAGTGAAATTTAGAGGTGTTCGGAAGCGTCCCTGGGGAAGATTTGCTGCGGAGATCAGAGATCCGGTGAAAAAGGCGAGAGTTTGGCTCGGCACATTTGATACGGCCGAAGAAGCGGCCTATGCTTACGATGAAGCTGCTAGAGCTCTGAGAGGTGCCAAGGCGAAGACAAATTTCGCTGTTCC
CTGCGATGATCAGAGTACAAGCCATAGCAGTACCGTGGAGTCTTCAAGCGGTCCCAGAAATCAGAGCATTTCGAAGAAAGCTTTTAATTTGAACGGGAGTGGAAGCAGCTTTGGCGAAACTAGCGTTCGAAACCCTCGAAATAGAAGGGTTAAAGACGCATTGCGGTGTGGCAGCGATATTTATAAAAGATATAGACGAA
GCAGGGTTTCTGAAGTGCGGGATTTGTCTAACGGTCCTGTACAGCAGCCAGGGTGTGATGCCGGTCCTTGCCACAGCGACTGCGATTCGTCGTCGTCTGTAGTAGTGGACAATGATGTTAATTCTGGCGAAGATTTGCCGTGTGATGTGAAACCCTCGCAGGAAACGAGTTTTGATCTCAATCTTTACAAGGAATGGAGA
AGCCCGGAGCGACAAGAGCGGAAAATGTTGCCAGATTTGAACCTTCCTCCCTCTGATGATGATGCGGAAGATTACCGGGATTTGCTGGCCATATCGTTGCGGATCTGATAACTGACGATTTCTCTGCCACAAGTCACATTTTGTTATTTGGTGGATGATTTGTAGGAATCTGTCCGATTAGTCTGAAGAGCGGACATTTT
TTTTAATTGGCTATGAACATGGGAAGATTATATATAGCCGATGCAGAATCATCTTAATAATGAGACATTGGTTTATTTCTTGTAAAGAAGTAGATTTCCCAATGTTCTTATTTGTCAGAAGAAACATTTGCTGTCTGTTTTCATCTTGGGGTACTCCCGGGGATGCTATCCCCACACATTTCTTGCAACCTTGTCATGAT
AATATATGTATTTGAAGTTGTATTTCACCC

>TRINITY_DN35289_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:

ACGCAATATTTGCACCGACTCTCAACCTTCCGCTTCTCCTTATTTCACGCACGCTTCTCCACAGGTCTGCGTGTTGATTCCCGCCGCGTTAATCAAAGCTCGGCCGCGGAGTTTCTAAAAATCCTTCCTACCAAGGGTTTCAAAAACTGCGAATAAATACCTCGTTTTTGGTTGAAATTTACACCGAAGTGGGGGTTTCC
ATACAGATGCCGTATTGTAAGGCGTCCCCGATCGTTTCCCTGCGAGAAGACTGAAGATTATTGTGTTATTCAGCTTCAGAGATCTGCCGCTGGAGCTTAGCCCGAACCCTGTATTCTGGATGCTCGTCCGGCCTCAGATCGTTCAGTTTACCCCGATCTTTTAATGCTGGAAAAAATGTTTTAATCGGCGAAGTATTTGG
AGGTCATCGGGTTTAAATATTGAAGCCGTTTTGGAGTCCTGTGAAATTCGCTTTCGAAGGGGCGGATTTTCGGTTTGCTGAAGATTATTGTTTAGTTTTTAGTTCGCTTTTGCAGGGGCAAATATTCTGTTTTCGCCGGTTCTCGGCGTTTGCTATATTGAAAGCATAGGGTTAGGGTTTCAAAGCATTGACCTGCGTAT
TATTGAAAATACAGGGATCTAAAACCTATTTTGTTAATTTTTGTGTTTGGCCCTTGCGTCTGTCAGATAAGGTGTATTTTTTAGATTTGCAGGAAGAAACCTGTAAATCTCTGATTTAAACCTTAGGGTTTGTATCTGGCTATCTGTTTCCTAAAATGCTCAGGCAGCAAGCAAAAAATGCCTGGCAAGACGTCGAAAAC
GTCACCAAAGTCAAGGAAGTGAAATTTAGAGGTGTTCGGAAGCGTCCCTGGGGAAGATTTGCTGCGGAGATCAGAGATCCGGTGAAAAAGGCGAGAGTTTGGCTCGGCACATTTGATACGGCCGAAGAAGCGGCCTATGCTTACGATGAAGCTGCTAGAGCTCTGAGAGGTGCCAAGGCGAAGACAAATTTCGCTGTTCC
CTGCGATGATCAGAGTACAAGCCATAGCAGTACCGTGGAGTCTTCAAGCGGTCCCAGAAATCAGAGCATTTCGAAGAAAGCTTTTAATTTGAACGGGAGTGGAAGCAGCTTTGGCGAAACTAGCGTTCGAAACCCTCGAAATAGAAGGGTTAAAGACGCATTGCGGTGTGGCAGCGATATTTATAAAAGATATAGACGAA
GCAGGGTTTCTGAAGTGCGGGATTTGTCTAACGGTCCTGTACAGCAGCCAGGGTGTGATGCCGGTCCTTGCCACAGCGACTGCGATTCGTCGTCGTCTGTAGTAGTGGACAATGATGTTAATTCTGGCGAAGATTTGCCGTGTGATGTGAAACCCTCGCAGGAAACGAGTTTTGATCTCAATCTTTACAAGGAATGGAGA
AGCCCGGAGCGACAAGAGCGGAAAATGTTGCCAGATTTGAACCTTCCTCCCTCTGATGATGATGCGGAAGATTACCGGGATTTGCTGGCCATATCGTTGCGGATCTGATAACTGACGgtaattttcttgttttcgtctcctcatattgacaggagtttgtttgtgatcgcaaacgtcaattgcagtcaatttgccgtgct
cgagcgtgtgatcggttttcttagaagtaatccttccgagtattcgactgatcctcctggtatgtaagttggtgctcaaggatttttccttttagcttaaaaaattggcgaaaaagctctagcttttaccacaatggtaatcttatttttgtgactctggattgcgagttgctctttcaatttacatttgagacctgcga
ggccaaatggtccctatttatttattagggtcctcctttttggcgataatatatattagattgtacagagaagaaatgggtaatgtagtatgctagtagcagtttatggtcaattagatttgattcatggccattcagatttaatgaaacaggtaatggaattgactacagctatttttgttagcaagatctcatacgtt
tttgtttacgaatgtttgcagATTTCTCTGCCACAAGTCACATTTTGTTATTTGGTGGATGATTTGTAGGAATCTGTCCGATTAGTCTGAAGAGCGGACATTTTTTTTAATTGGCTATGAACATGGGAAGATTATATATAGCCGATGCAGAATCATCTTAATAATGAGACATTGGTTTATTTCTTGTAAAGAAGTAGATT
TCCCAATGTTCTTATTTGTCAGAAGAAACATTTGCTGTCTGTTTTCATCTTGGGGTACTCCCGGGGATGCTATCCCCACACATTTCTTGCAACCTTGTCATGATAATATATGTATTTGAAGTTGTATTTCACCC