sp|Q38970|ACC1_ARATH ----> Acetyl-CoA carboxylase 1


Intron 1 GTATTGTGCT ... CTGACAAAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A145.45350
A233.33110
A3-1000
A450222
A533.33101
A662.96598
A762.965611
A863.6481612
A972.73397
A1073.33265



>TRINITY_DN44311_c0_g1_i3 from sample A10 / Example spliced isoform
AAATGAAGGAAAGTAGTAATTTACATTAATGAGAGACTTCGTCGATACCTGCGGGTTAAAGGAAGCTCAATCGCAGGTGCTCGATCCAAGTGTTGATGCCGGATTTTGATGCCAAGAGTAAATCCAGTTGGCGACAGGCCTTTTCACTTCTCAGGCTTCGACTCTTCTTGCTAAGAGAAAGGGGCATTTTGCATTTGCTT
GGGAGTTGGGAGAGAAGGAGCAGAAGGAGGCTGTCAGCAAGAGGAAGAAAGGAATCAAGCACTGGCTCGAAGAGCTACCAGGCACCCAGGATGCAGGTTTTAATCAAATTTTAAAGAGTTTTCTATACGTAGCTTGGTGCATGGAGATGAGCACTCCTGAGTTCCCTGGTGGACGGACTATTTTAGTGGTGTCAAATGAT
GTTACACATAATGCAGGTTCCTTTGGTACAAGAGAAGATGCCTTTTTTGCTTCTGTTACTGATCTTGCTTGTCAAAAGAAATTACCTTTGATTTATTTGGCAGCCAACTCTGGTGCAAGAATTGGAGTGGCAGCAGAAGTCAAAGCTTGCTTTAAAGTTGGATGGTTTGACGAGTTGTCTCCAGACCGTGGTTTTCAGTA
TCTTTATCTCAGTCCAGAAGACTATAAGCTCATTGGTCCATCTGTAATAGCACATGAGCTAAAGCTAGAATCTGGTGAAATCAGATATATTATAAATGACATCATTGGTAAGGAAGATGGACTAGGTGTGGAGAATTTATCGGGCAGTGGAGCAATTGCAGGTGCTTATTCAAGAGCGTATCAGGAAACTTTCACATTGA
CATATGTAACAGGCAGAACAGTTGGTATTGGTGCATACCTTTCGAGGTTAGGAATGCGCTGCATTCAGCGCCTTGATCAACCTATAATTCTCACTGGATACTCAGCTCTAAATAAGCTTCTTGGACGGGAAGTGTATAGTTCTCATATGCAATTAGGAGGCCCAAAAATCATGGCAACAAATGGTGTTGTTCATCTAACT
GTATCTGATGATTTAGAAGGTGTCTCGGCCATCTTGAAGTGGCTCAGCTATATTCCTCCATATATAGGAGGACCTCTTCCTATTGTGAAGAGTCTAGATCCTCCAGAAAGACTAGTTGATTATACTCCAGAGAATTCATGTGATCCTCGTGCAGCTATTCGTGGTGTAGAAGATAATGGCAGGTGGCTTGGTGGCCTCTT
TGACAAAGAGAGCTTCACAGAGACATTAGAAGGGTGGGCAAAAACAGTGGTTACTGGGCGAGCAAAGCTTGGGGGCATCCCTGTGGGTGTTATTGCTGTTGAGACCCAAACAGTGATGCAGGTGATTCCTGCAGACCCTGGTCAACTAGATTCTGCTGAGCGAGTGGTCCCTCAAGCAGGCCAGGTTTGGTTTCCAGATT
CAGCATGTAAAACAGCACAAGCCTTGCTAGATTTTAACAAGGAAGAGCTTCCTCTGTTTATCTTGGCAAACTGGAGAGGGTTCTCAGGTGGTCAAAGGGATCTTTTTGAAGGAATTCTGCAGGCTGGATCCACCATTGTAGAGAATCTCCGCACGTATAAGCAACCTGTGTTTGTTTACATACCAAAAACAGGTGAACTG
CGAGGAGGAGCATGGGTGGTAGTTGACAGCAAGATTAATTCAGATGAAATTGAAATGTATGCAGAAACAACAGCAAAAGGTGGTGTACTAGAACCAGAGGGAATGGTTGAAATTAAATTCCGTGCAAAAGATCTGCTTGAATGCATGCATAGGCTTGACCAGAATCTCATTTCACTTAAAATAAAGCTACAGGAAGCCAA
GGATGATCGTCCTGGGTCTGAAGTAATACGACAGCAAATTAAAGCCCGCGAAAAACAGTTGCTTCCTTTTTATAAGCAGATTGCCATCAGATTTGCTGAGTTGCATGACACGTCCTTCAGAATGGCAGCAAAAGGGGTTGTGCAAAAAGTTATTAAATGGGAAGAGTCACGGATCTTTTTCTACAAGAGATTGAACCGAA
GATTGGCAGAGTCTTCTTTGATTAAGAATATAAGAGATGCTGCTGGAAACAACCTATCTCATAAATCAGCTTTGCATTTGATTAAGGACTGGTTTTTGGCTTCAAAGGTTGGTGATTCTGGAGAGGAATTATGGAAAGATGATGCTGCTTTCTTGGCTTGGAAAGATGATCCCAGCAAGTTCGAGTCCCATTTACAAGCA
TTAAGAGCGCAGAAAGTGTGCAGACAGCTATTAGAACTTGGAAGCTCTGAGACAGAGTTGCAAGCATTGCCTGAAGGTCTAGCTGCTCTTCTAAAAGAGGTTCAACCATCAATGAAGTCAGAGTTGGTGGAAAAGCTTCGAGAAGTTCTCAACTCGTGAGACTGATGTTCATGCCAGTACACAGTTTGACTACTTTTGGG
ATCCTTTATTTTCTTTCTTTGTAATTAATAATTATGAATGACGAGGAATTATTTTGGCAATAGAATTTGAATGCATTTGTGGAGTGGTCATAATGCTTTTCCATGGGGCTGCCAAGATATACTAATTTGTATTTGGTTTATTCCCCAATATGATTATGATTACAATATTTGTGTTTTCTTGCAATGGCAAAACCAAACCT
CCTGTTGTTTTCTTTCGAATCTAGTTGACGTAGCAGATGGAGATCCGATGGAACACCTGTATTCTCCATTGAGTTGGAAGAGTTTGATTTTGTGGCCTTATTGGAAAAGATTCAGTTCTCTTACCATGTGTAAGAAAATAAATGGCAAGGATATAAATAAGAAGTGATATTGGCTAG


>TRINITY_DN44311_c0_g1_i1 from sample A10 / Example unspliced isoform:
AAATGAAGGAAAGTAGTAATTTACATTAATGAGAGACTTCGTCGATACCTGCGGGTTAAAGGAAGCTCAATCGCAGGTGCTCGATCCAAGTGTTGATGCCGGATTTTGATGCCAAGAGTAAATCCAGTTGGCGACAGGCCTTTTCACTTCTCAGGCTTCGACTCTTCTTGCTAAGAGAAAGGGGCATTTTGCATTTGCTT
GGGAGTTGGGAGAGAAGGAGCAGAAGGAGGCTGTCAGCAAGAGGAAGAAAGGAATCAAGCACTGGCTCGAAGAGCTACCAGGCACCCAGgtattgtgctcccgaactcttgttgcaatatccaacatacactactgcaattgacatgtgggaagttggggcaaaactggcagaactattcactttgcatcctccctttcc
tgacaaaag
GATGCAGGTTTTAATCAAATTTTAAAGAGTTTTCTATACGTAGCTTGGTGCATGGAGATGAGCACTCCTGAGTTCCCTGGTGGACGGACTATTTTAGTGGTGTCAAATGATGTTACACATAATGCAGGTTCCTTTGGTACAAGAGAAGATGCCTTTTTTGCTTCTGTTACTGATCTTGCTTGTCAAAAGAA
ATTACCTTTGATTTATTTGGCAGCCAACTCTGGTGCAAGAATTGGAGTGGCAGCAGAAGTCAAAGCTTGCTTTAAAGTTGGATGGTTTGACGAGTTGTCTCCAGACCGTGGTTTTCAGTATCTTTATCTCAGTCCAGAAGACTATAAGCTCATTGGTCCATCTGTAATAGCACATGAGCTAAAGCTAGAATCTGGTGAAA
TCAGATATATTATAAATGACATCATTGGTAAGGAAGATGGACTAGGTGTGGAGAATTTATCGGGCAGTGGAGCAATTGCAGGTGCTTATTCAAGAGCGTATCAGGAAACTTTCACATTGACATATGTAACAGGCAGAACAGTTGGTATTGGTGCATACCTTTCGAGGTTAGGAATGCGCTGCATTCAGCGCCTTGATCAA
CCTATAATTCTCACTGGATACTCAGCTCTAAATAAGCTTCTTGGACGGGAAGTGTATAGTTCTCATATGCAATTAGGAGGCCCAAAAATCATGGCAACAAATGGTGTTGTTCATCTAACTGTATCTGATGATTTAGAAGGTGTCTCGGCCATCTTGAAGTGGCTCAGCTATATTCCTCCATATATAGGAGGACCTCTTCC
TATTGTGAAGAGTCTAGATCCTCCAGAAAGACTAGTTGATTATACTCCAGAGAATTCATGTGATCCTCGTGCAGCTATTCGTGGTGTAGAAGATAATGGCAGGTGGCTTGGTGGCCTCTTTGACAAAGAGAGCTTCACAGAGACATTAGAAGGGTGGGCAAAAACAGTGGTTACTGGGCGAGCAAAGCTTGGGGGCATCC
CTGTGGGTGTTATTGCTGTTGAGACCCAAACAGTGATGCAGGTGATTCCTGCAGACCCTGGTCAACTAGATTCTGCTGAGCGAGTGGTCCCTCAAGCAGGCCAGGTTTGGTTTCCAGATTCAGCATGTAAAACAGCACAAGCCTTGCTAGATTTTAACAAGGAAGAGCTTCCTCTGTTTATCTTGGCAAACTGGAGAGGG
TTCTCAGGTGGTCAAAGGGATCTTTTTGAAGGAATTCTGCAGGCTGGATCCACCATTGTAGAGAATCTCCGCACGTATAAGCAACCTGTGTTTGTTTACATACCAAAAACAGGTGAACTGCGAGGAGGAGCATGGGTGGTAGTTGACAGCAAGATTAATTCAGATGAAATTGAAATGTATGCAGAAACAACAGCAAAAGG
TGGTGTACTAGAACCAGAGGGAATGGTTGAAATTAAATTCCGTGCAAAAGATCTGCTTGAATGCATGCATAGGCTTGACCAGAATCTCATTTCACTTAAAATAAAGCTACAGGAAGCCAAGGATGATCGTCCTGGGTCTGAAGTAATACGACAGCAAATTAAAGCCCGCGAAAAACAGTTGCTTCCTTTTTATAAGCAGA
TTGCCATCAGATTTGCTGAGTTGCATGACACGTCCTTCAGAATGGCAGCAAAAGGGGTTGTGCAAAAAGTTATTAAATGGGAAGAGTCACGGATCTTTTTCTACAAGAGATTGAACCGAAGATTGGCAGAGTCTTCTTTGATTAAGAATATAAGAGATGCTGCTGGAAACAACCTATCTCATAAATCAGCTTTGCATTTG
ATTAAGGACTGGTTTTTGGCTTCAAAGGTTGGTGATTCTGGAGAGGAATTATGGAAAGATGATGCTGCTTTCTTGGCTTGGAAAGATGATCCCAGCAAGTTCGAGTCCCATTTACAAGCATTAAGAGCGCAGAAAGTGTGCAGACAGCTATTAGAACTTGGAAGCTCTGAGACAGAGTTGCAAGCATTGCCTGAAGGTCT
AGCTGCTCTTCTAAAAGAGGTTCAACCATCAATGAAGTCAGAGTTGGTGGAAAAGCTTCGAGAAGTTCTCAACTCGTGAGACTGATGTTCATGCCAGTACACAGTTTGACTACTTTTGGGATCCTTTATTTTCTTTCTTTGTAATTAATAATTATGAATGACGAGGAATTATTTTGGCAATAGAATTTGAATGCATTTGT
GGAGTGGTCATAATGCTTTTCCATGGGGCTGCCAAGATATACTAATTTGTATTTGGTTTATTCCCCAATATGATTATGATTACAATATTTGTGTTTTCTTGCAATGGCAAAACCAAACCTCCTGTTGTTTTCTTTCGAATCTAGTTGACGTAGCAGATGGAGATCCGATGGAACACCTGTATTCTCCATTGAGTTGGAAG
AGTTTGATTTTGTGGCCTTATTGGAAAAGATTCAGTTCTCTTACCATGTGTAAGAAAATAAATGGCAAGGATATAAATAAGAAGTGATATTGGCTAG