sp|Q7XSR9|ICMT_ORYSJ ----> Probable protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase

Intron 1 GTATATACGT ... AGCGAATTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	66.6	83	180	151
A2	66.07	76	173	123
A3	66.33	89	183	167.7
A4	75.38	61	182	191.7
A5	68.81	34	82	68
A6	71.78	108	250	299.3
A7	69.79	233	483.3	593.3
A8	71.36	158	331	456.3
A9	71.4	229	508.3	635
A10	67.19	242	471	520.3

>TRINITY_DN114900_c4_g3_i1 from sample A3 / Example spliced isoform

TTCTTCCTTTTTTTTCTTTTTTTATTCCCCTGCTTTAAAGTTTAATGGTATTCTGACTCAAAATATCTATGTAGGTAAGGCTGACTGCTGAAACTTCCTATCCGAATTCCAGATTGTGGTAGTTGATGCCTTGTTACTGAACTCATTCTTAGTTTTGTAAACTTACCGCTGATGTTTTCTGAATTTTGATTGCAGCATTT
CTTATCAGCAAGGAATATGTTTTTGCTATGATATGTGGCTTGATAGAATATGCCATAGAATATACCTTTTATCCAGAGTTGAAGATGCAGTGGTGGTTATGCAACATAGGTCTTGTAATGGTTGTGACTGGAGAATTGGTACGTAAAAGTGGTATACTTACTGCTCGCCTCAGCTTTACACATGATATTAAAGTGTACCT
CCGAGATGACCATGAGTTGGTCACTTATGGCATTTACAGATACGAGGAATTCTTCTTGCGACAGTTCTTTCATCAGGACTATGAAGAGTATGCAAAGAGAGTACCTTCTGGAATACCTTTCATAAAGGGACAAAAACACTGGACTTAAGAAGTGGATTTTGGGGCTGAACATGAATGAGCAGATACCCAATTGTTTCCTT
TTGACATACATGGTTTACCAAGCATAGAAGGGAACATAACTGGCTTATGTTCTCCAAAGGTGACAACCATTTGTCTCCTTTAACAAGTAGATTATGAACTATGCCACCTGTGCAAGTTAAACAGTGACAATGATATTGGATTCCAGATCGCTGCCCCTGGTTGGCTGTTGCAGTCAACTAAGAAATGGATCAAACAAAAT
ATGTCAAGTATCATAGGCTTGGGAAGGGTTCTTCCATAGTTTTACACATTCAATTTCGTGTAGCAGTATTGGAAGAAATAAATCTGAAAGGAGACATGCTGTTTATATTTTGATGTGGAATGCTTCATTGCCTCTTACAGTATACTGTTTATCAAAAACTTAGGTGTCTCCATTCCCTGTTGAGAAGAAAAGTACTGATC
AAATATATACCATGGAAACAGAGAATTCAGATGACTGCAAATGGTTTATGGAATTTATCGTTTATGGTTCAAATCTAAGTGGATCAGTGAATCCATTGTATGCTGCAAGATTTGATTATGAACTCTCTGGCTTGGGACATGATATATGTTCAGGTTACAGTTTCAAGTCCATATAATCTATTATGAATGTGGAAAGGCAT
TATGGTCTTGGTCACAATTGGATAGTGATCAAGGATCTGTGTGGAAAGCTTGAAATCTTTGGGTAGTTGTTAATCACAAGCATCTGTTAACCATGAGTTTATGTGAAATAACACAGC

>TRINITY_DN114900_c4_g3_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:

GCTTTGATGACGTAGAATTCAAGCTACAGTTATTCAGGCCTCTTGAACTCGGCAACTGTCCATGATCATTCCATTGCAGGGGATGTCTGATTTCTATAGCAATTTTTTTGAACAGTTTTTGCATTTGGATAGCAAAATCTTCCAGACAAACCCCATGGGATTAATGGGTTCAGTTGCTACTAGACAGTTAGGCCAGTTGT
TAATAGCTGTGCTGTTCTTCCACGTCTCCGAGTTTGTATTGGCTGTCATCATTCATGGAGCATCCAGAGTAAATCTAACCTCATTTCTTATCAGCAAGGAATATGTTTTTGCTATGATATGTGGCTTGATAGAATATGCCATAGAATATACCTTTTATCCAGAGTTGAAGATGCAGTGGTGGTTATGCAACATAGGTCTT
GTAATGGTTGTGACTGGAGAATTGGTACGTAAAAGTGGTATACTTACTGCTCGCCTCAGCTTTACACATGATATTAAAGTGTACCTCCGAGATGACCATGAGTTGGTCACTTATGGCATTTACAGgtatatacgtcatccaggatattctgggtttttcatttggtctgttggaactcaaatgatgctgtgtaacccatt
gtgcacaattggctatgcacttgttacatggcgtttctttgaaaagcgaattagATACGAGGAATTCTTCTTGCGACAGTTCTTTCATCAGGACTATGAAGAGTATGCAAAGAGAGTACCTTCTGGAATACCTTTCATAAAGTGAGGCTTTCTGGAACTCGGGACAAAAACACTGGACTTAAGAAGTGGATTTTGGGGCT
GAACATGAATGAGCAGATACCCAATTGTTTCCTTTTGACATACATGGTTTACCAAGCATAGAAGGGAACATAACTGGCTTATGTTCTCCAAAGGTGACAACCATTTGTCTCCTTTAACAAGTAGATTATGAACTATGCCACCTGTGCAAGTTAAACAGTGACAATGATATTGGATTCCAGATCGCTGCCCCTGGTTGGCT
GTTGCAGTCAACTAAGAAATGGATCAAACAAAATATGTCAAGTATCATAGGCTTGGGAAGGGTTCTTCCATAGTTTTACACATTCAATTTCGTGTAGCAGTATTGGAAGAAATAAATCTGAAAGGAGACATGCTGTTTATATTTTGATGTGGAATGCTTCATTGCCTCTTACAGTATACTGTTTATCAAAAACTTAGGTG
TCTCCATTCCCTGTTGAGAAGAAAAGTACTGATCAAATATATACCATGGAAACAGAGAATTCAGATGACTGCAAATGGTTTATGGAATTTATCGTTTATGGTTCAAATCTAAGTGGATCAGTGAATCCATTGTATGCTGCAAGATTTGATTATGAACTCTCTGGCTTGGGACATGATATATGTTCAGGTTACAGTTTCAA
GTCCATATAATCTATTATGAATGTGGAAAGGCATTATGGTCTTGGTCACAATTGGATAGTGATCAAGGATCTGTGTGGAAAGCTTGAAATCTTTGGGTAGTTGTTAATCACAAGCATCTGTTAACCATGAGTTTATGTGAAATAACACAGC