NA ----> NA

Intron 1 GTGAACTTTC ... TGTTTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	18.75	26	1	6
A2	25	18	0	6
A3	0	8	0	0
A4	21.43	11	0	3
A5	40	3	0	2
A6	21.82	43	0	12
A7	22.05	49.5	0	14
A8	18.33	49	2	11
A9	15.1	67.5	0	12
A10	3.18	30.5	0	1

>TRINITY_DN42769_c0_g1_i2 from sample A9 / Example spliced isoform

TATACATTTTCATGCATAGTACTTTTTTGTTAACATAACGAGAAATTTCCGTTCCTAAAATTACAGTAGTGGGGATAAAATTATGATGAAAGCGTTTAGACCATTTTTTTTTTCGAAATATTTGGAGGGAATCCCTTTTTCCTGGAGACAGACGCGCTTTCAATGTGAAAACGAAACCTCACGTACAGACAAAAAAAATT
CTTTTGAATTGATTACCAAAAAATTACACAAGACACAAAGCCTAAAGGCCGCCGCATTTGTCCAGAGGACAGATGTGGAGCATTATTAGACTTGGAATGTGAAAAGACTGAAATAATCCTGTAACTGCTCACATCGCTACAGGCCGGGGATATTTCGGGGCTAGGGTTTGGAGAACTGTTTTCGAATATTAAAATCCAAG
CAAAGAATGACAAACTTTTAAAAACTTGAACGTGCGCCTCCTCTGTGAAAGTAAAACGTGCGCCGCGGTTTTCACAGAGTGCTGCTTTCAAGCCTAAACGAGTTCAAAGAGCACTTCTTAGCTTGCAGCACACGCTGACCGTTGGTTCGAGGCCTGTGGAGCAGAGAGAGTAATTCTTAGCTTGCAGTATACGCTGACGG
TTGATTGAGTCCCGTGGAGCAGGCAATCCAACTTCATTCGCATTTGTAAGAGGTAGAGGGTACTTTTACTGGTTGATCCATGGCATTACGGTTTGAGGTGCTGGGAAACTTCAACCGAGCTCGTGCAGCCAGACTCACACTTCCTCATTTTCGATGTCAGACTCCTCTATTTATGCCGGTTGGAACCAAAGGTGCAGTAA
AGGGACTCGCAAGTGACCAATTGGAGGATATTGGCTGCCAAATTATTCTTGGAAACACATACCATTTGGAACTTTGTCCTGGTTCTGATTTAATTGATGAGCTGGGTGGTCTTCACAAGTTCATGAATTGGCCAAGGGGCTTGCTTACGGATTCTGGTGGTTTTCAGATGGTCTCTTTATTGCACTTGGCTGACATCACA
GAAGAGGGCGTAACTTTCCAGTCACCAGTGGATGGAAAATCAATGCTTCTTACACCTGAGGAGTCAATTCAAATTCAAAATAAAATTGGAGCAGACATAATCATGGCGCTTGATGATGTTGTGAAAACCACTATAACTGGACCTAGAGTTGAGGAGGCAATGTATCGTACTCTTCGATGGATTGATCGATGCATAGCTGC
CCATCAAAGACCAGCGGATCAAAATTTATTTGGTATTGTACAAGGAGGATTGGATCCTGTTTTAAGAGATATTTGCGTCAAAGGTCTTGTGGAACGTGACCTACCTGGCTATGCTATTGGCGGGCTTTCAGGGGGAGAAGAAAAGGATTCGTTTTGGCGTGTTGTTGCACAATGTACAGCTGCTTTGCCAGAGGATAAAC
CACGTTATGTAATGGGTGTGGGCTATCCCCTTGATATTGTTGTTTGCAGTGCTTTAGGTGCTGACATGTACGATTGTGTTTACCCCACTCGTACTGCCCGTTTTGGTACAGCTCTTGTGCCTGAGGGAGTTCTCAAGTTGAAGCATGCAGCAATGGCAAGTGATTGCCGGCCAGTAGACCCAACATGTTCCTGTATGGTT
TGCAAGCGCTATTCAAGGGCATATATTCATACCCTTGTAACAAAGGATGCAATGGGCTCTCAACTGCTGTCATATCACAATTTGGCTTATATGATGAGGCTGAGCAAGGAGTTGCACAATTCTATTATTGAGGGCCGTTTTCCAGAATTTGTGCAGGGATTTCTCCAGACCCAGTTCCCAAAAGGTGATGTTCCACAGTG
GGTCTGTAATGCCATGGAAGCTGCAGGCATAGATATTTCCATGTGCTGCTCACCATTTACGTTTTCTGGAAACAGCTAGTTTATTAGGCTTTGATGCAGTGTAAAACTGGAAGGTCCACTGAAATGTGTCCTTGTCCCTATGCCACAGTCATAGAGCTTAAAGTGACCATTGGACTTCAAACTGAGCTTATAGCTTTTGG
TTTTCTATTGTATTCCAAAACTGAGGCTACATTCCCTGCCTAGTTAAGTATATAGGATCTGGTTGACAGCATACGGTCTCAAACATGAGACCACATCAGTGTAATAGTTTTGTTTGGCTCTGCAATTTTGGTCCATAAATATGTGGAAGTAAGTATGAGCCTGTCTAATTCATGACAAGATTTACATTCTTTATTCTTTA
GTTCTCTCTCTATTAACAACATTATTGTATGAGATCAAAGTTCTTTGCAATGGATGCCAAGAAATTGGTGCAGAGAACATGCATGATATTTTCCTGAGGATGATCAGTATAACATAAAATTAAACGGTTGCCTCTTCACATTCTATAATAGAATGCAATGTTACTGAATCCTACATGACCATATCTTTTCTTTATGAATG
AATATTTTATTTTGGCAATGCCCTGGTGTCCTAAAGTGTTGTGTTGGGCCA

>TRINITY_DN42769_c0_g1_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:

ACAATTTGGCTTATATGATGAGGgtgaactttctcattaatttgcagaatattgagctctaatattcaatgattaaaatgtgtttgataaaatttgctgtgttttgcagCTGAGCAAGGAGTTGCACAATTCTATTATTGAGGGCCGTTTTCCAGAATTTGTGCAGGGATTTCTCCGGACCCAGTTCCCAAAAGGTGATG
TTCCACAGTGGGTCTGTAATGCCATGGAAGCTGCAGGCATAGATATTTCCATGTGCTGCTCACCATTTACGTTTTCTGGAAACAGCTAGTTTATTAGGCTTTGATGCAGTGTAAAACTGGAAGGTCCACTGAAATGTGTCCTTGTCCCTATGCCACAGTCATAGAGCTTAAAGTGACCATTGGACTTCAAACTGAGCTTA
TAGCTTTTGGTTTTCTATTGTATTCCAAAACTGAGGCTACATTCCCTGCCTAGTTAAGTATATAGGATCTGGTTGACAGCATACGGTCTCAAACATGAGACCACATCAGTGTAATAGTTTTGTTTGGCTCTGCAATTTTGGTCCATAAATATGTGGAAGTAAGTATGAGCCTGTCTAATTCATGACAAGATTTACATTCT
TTATTCTTTAGTTCTCTCTCTATTAACAACATTATTGTATGAGATCAAAGTTCTTTGCAATGGATGCCAAGAAATTGGTGCAGAGAACATGCATGATATTTTCCTGAGGATGATCAGTATAACATAAAATTAAACGGTTGCCTCTTCACATTCTATAATAGAATGCAATGTTACTGAATCCTACATGACCATATCTTTTC
TTTATGAATGAATATTTTATTTTGGCAATGCCCTGGTGTCCTAAAGTGTTGTGTTGGGCCA

Intron 2 GTAACTGCTC ... GAACATGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	66.04	9	18	17
A2	69.23	12	27	27
A3	52.94	20	23	22
A4	61.76	13	26	16
A5	69.23	6	6	21
A6	50.68	18	8	29
A7	54.55	15	15	21
A8	60	4	9	3
A9	55.1	11	14	13
A10	58.33	15	18	24

>TRINITY_DN44407_c0_g1_i4 from sample A6 / Example spliced isoform

GCGTTTAGACCATTTTTTTTTTCGAAATATTTGGAGGGAATCCCTTTTTCCTGGAGACAGACGCGCTTTCAATGTGAAAACGAAACCTCACGTACAGACAAAAAAAATTCTTTTGAATTGATTACCAAAAAATTACACAAGACACAAAGCCTAAAGGCTGCCGCATTTGTCCAGAGGACAGATGTGGAGCATTATTAGAC
TTGGAATGTGAAAAGACTGAAATAATCCTAAACTTGAACGTGCGCCTCCTCTGTGAAAGTAAAACGTGCGCCGCGGTTTTCACAGAGTGCTGCTTTCAAGCCTAAACGAGTTCAAAGAGCACTTCTTAGCTTGCAGCACACGCTGACCGTTGGTTCGAGGCCTGTGGAGCAGAGAGAGTAATTCTTAGCTTGCAGTATAC
GCTGACGGTTGATTGAGTCCCGTGGAGCAGGCAATCCAACTTCATTCGCATTTGTAAGAGGTAGAGGGTACTTTTACTGGTTGATCCATGGCATTACGGTTTGAGGTGCTGGGAAACTTCAACCGAGCTCGTGCAGCCAGACTCACACTTCCTCATTTTCGATGTCAGACTCCTCTATTTATGCCGGTTGGAACCAAAGG
TGCAGTAAAGGGACTCGCAAGTGACCAATTGGAGGATATTGGCTGCCAAATTATTCTTGGAAACACTTACCATTTGGAACTTTGTCCTGGTTCTGATTTAATTGATGAGCTAGGTGGTCTTCACAAGTTCATGAATTGGCCAAGGGGCCTGCTTACGGATTCTGGTGGTTTTCAGATGGTCTCTTTATTGCACTTGGCTG
ACATCACAGAAGAGGGCGTAACTTTCCAGTCACCAGTGGATGGAAAATCAATGCTTCTTACACCTGAGGAGTCAATTCAAATTCAAAATAAAATTGGAGCAGACATAATCATGGCGCTTGATGATGTTGTGAAAACCACTATAACTGGACCTAGAGTTGAGGAGGCAATGTATCGTACACTTCGATGGATTGATCGATGC
ATAGCTGCCCATCAAAGACCAGCGGATCAAAATTTATTTGGTATTGTACAAGGAGGATTGGATCCTGTTTTAAGAGATATTTGCGTCAAAGGTCTTGTGGAACGTGACCTACCTGGCTATGCTATTGGCGGGCTTTCAGGGGGAGAAGAAAAGGATTCCTTTTGGCGTGTTGTTGCACAATGTACAGCTGCTTTGCCAGA
GGATAAACCACGTTATGTAATGGGTGTGGGCTATCCCCTTGATATTGTTGTTTGCAGTGCTTTAGGTGCTGACATGTACGATTGTGTTTACCCCACTCGTACTGCCCGTTTTGGTACAGCTCTTGTGCCTGAGGGAGTTCTCAAGTTGAAGCATGCAGCAATGGCAAGTGATTGCCGGCCAGTAGACCCAACATGTTCCT
GTATGGTTTGCAAGCGCTATTCAAGGGCATATATTCATACCCTTGTAACAAAGGATGCAATGGGCTCTCAACTGCTGTCATATCACAATTTGGCTTATATGATGAGGCTGAGCAAGGAGTTGCACAATTCTATTATTGAGGGCCGTTTTCCAGAATTTGTGCAGGGATTTCTCCAGACCCAGTTCCCAAAAGGTGATGTT
CCACAGTGGGTCTGTAATGCCATGGAAGCTGCAGGCATAGATATTTCCATGTGCTGCTCACCATTTACATTTTCTGGAAACAGCTAGTTTATTAGGCTTTGATGCAGTGTAAAACTGGAAGGTCCACTGAAATGTGTCCTTGTCCCTATGCCACAGTCATAGAGCTTAAAGTGACCATTGGACTTCAAACTGAGCTTATA
GCTTTTGGTTTTCTATTGTATTCCAAAACTGAGGCTACATTCCCTGCCTAGTTAAGTATATAGGATCTGGTTGACAGCATACGGTCTCAAACATGAGACCACATCAGTGTAATAGTTTTGTTTGGCTCTGCAATTTTGGTCCATAAATATGTGGAAGTAAGTATGAGCCTGTCTAATTCATGACAAGATTTACATTCTTT
ATTCTTTAGTTCTCTCTCTATTAACAACATTATTGTATGAGATCAAAGTTCTTTGCAATGGATGCCAAGAAATTGGTGCAGAGAACATGCATGATATTTTCCTGAGGATGATCAGTATAACATAAAATTAAAGGGTTGCCTCTTCACATTCTATAATAGAATGCAATGTTACTGAATCCTACATGACCATATCTTTTCTT
TATGAATGAATATTTTATTTTGGCAA

>TRINITY_DN44407_c0_g1_i10 from sample A6 / Example unspliced isoform:

GCGTTTAGACCATTTTTTTTTTCGAAATATTTGGAGGGAATCCCTTTTTCCTGGAGACAGACGCGCTTTCAATGTGAAAACGAAACCTCACGTACAGACAAAAAAAATTCTTTTGAATTGATTACCAAAAAATTACACAAGACACAAAGCCTAAAGGCTGCCGCATTTGTCCAGAGGACAGATGTGGAGCATTATTAGAC
TTGGAATGTGAAAAGACTGAAATAATCCTgtaactgctcacatcgctactggccggggatatttcggggctagggtttggagaactgttttcgaatattaaaatccaagcaaagaatgacaaacttttaagtatataatttcaaattaaataatggctaccttggaagtgtataatttcaaggcggataaccgagactct
gatggcttgcctttgaacatgtagAAACTTGAACGTGCGCCTCCTCTGTGAAAGTAAAACGTGCGCCGCGGTTTTCACAGAGTGCTGCTTTCAAGCCTAAACGAGTTCAAAGAGCACTTCTTAGCTTGCAGCACACGCTGACCGTTGGTTCGAGGCCTGTGGAGCAGAGAGAGTAATTCTTAGCTTGCAGTATACGCTGA
CGGTTGATTGAGTCCCGTGGAGCAGGCAATCCAACTTCATTCGCATTTGTAAGAGGTAGAGGGTACTTTTACTGGTTGATCCATGGCATTACGGTTTGAGGTGCTGGGAAACTTCAACCGAGCTCGTGCAGCCAGACTCACACTTCCTCATTTTCGATGTCAGACTCCTCTATTTATGCCGGTTGGAACCAAAGGTGCAG
TAAAGGGACTCGCAAGTGACCAATTGGAGGATATTGGCTGCCAAATTATTCTTGGAAACACTTACCATTTGGAACTTTGTCCTGGTTCTGATTTAATTGATGAGCTAGGTGGTCTTCACAAGTTCATGAATTGGCCAAGGGGCCTGCTTACGGATTCTGGTGGTTTTCAGATGGTCTCTTTATTGCACTTGGCTGACATC
ACAGAAGAGGGCGTAACTTTCCAGTCACCAGTGGATGGAAAATCAATGCTTCTTACACCTGAGGAGTCAATTCAAATTCAAAATAAAATTGGAGCAGACATAATCATGGCGCTTGATGATGTTGTGAAAACCACTATAACTGGACCTAGAGTTGAGGAGGCAATGTATCGTACACTTCGATGGATTGATCGATGCATAGC
TGCCCATCAAAGACCAGCGGATCAAAATTTATTTGGTATTGTACAAGGAGGATTGGATCCTGTTTTAAGAGATATTTGCGTCAAAGGTCTTGTGGAACGTGACCTACCTGGCTATGCTATTGGCGGGCTTTCAGGGGGAGAAGAAAAGGATTCCTTTTGGCGTGTTGTTGCACAATGTACAGCTGCTTTGCCAGAGGATA
AACCACGTTATGTAATGGGTGTGGGCTATCCCCTTGATATTGTTGTTTGCAGTGCTTTAGGTGCTGACATGTACGATTGTGTTTACCCCACTCGTACTGCCCGTTTTGGTACAGCTCTTGTGCCTGAGGGAGTTCTCAAGTTGAAGCATGCAGCAATGGCAAGTGATTGCCGGCCAGTAGACCCAACATGTTCCTGTATG
GTTTGCAAGCGCTATTCAAGGGCATATATTCATACCCTTGTAACAAAGGATGCAATGGGCTCTCAACTGCTGTCATATCACAATTTGGCTTATATGATGAGGCTGAGCAAGGAGTTGCACAATTCTATTATTGAGGGCCGTTTTCCAGAATTTGTGCAGGGATTTCTCCAGACCCAGTTCCCAAAAGGTGATGTTCCACA
GTGGGTCTGTAATGCCATGGAAGCTGCAGGCATAGATATTTCCATGTGCTGCTCACCATTTACATTTTCTGGAAACAGCTAGTTTATTAGGCTTTGATGCAGTGTAAAACTGGAAGGTCCACTGAAATGTGTCCTTGTCCCTATGCCACAGTCATAGAGCTTAAAGTGACCATTGGACTTCAAACTGAGCTTATAGCTTT
TGGTTTTCTATTGTATTCCAAAACTGAGGCTACATTCCCTGCCTAGTTAAGTATATAGGATCTGGTTGACAGCATACGGTCTCAAACATGAGACCACATCAGTGTAATAGTTTTGTTTGGCTCTGCAATTTTGGTCCATAAATATGTGGAAGTAAGTATGAGCCTGTCTAATTCATGACAAGATTTACATTCTTTATTCT
TTAGTTCTCTCTCTATTAACAACATTATTGTATGAGATCAAAGTTCTTTGCAATGGATGCCAAGAAATTGGTGCAGAGAACATGCATGATATTTTCCTGAGGATGATCAGTATAACATAAAATTAAAGGGTTGCCTCTTCACATTCTATAATAGAATGCAATGTTACTGAATCCTACATGACCATATCTTTTCTTTATGA
ATGAATATTTTATTTTGGCAA

Intron 3 GTATATAATT ... GAACATGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	46.07	24	24	17
A2	53.54	23	26	27
A3	43.43	33	28.7	22
A4	50	12	8	16
A5	62.86	13	23	21
A6	52.58	23	22	29
A7	48.84	22	21	21
A8	44.83	8	10	3
A9	42.61	22	19.7	13
A10	37.5	30	12	24

>TRINITY_DN120556_c0_g1_i7 from sample A1 / Example spliced isoform

CTTTCTTGGTTTTTAGCCCAGCAGCTTATACATTTCCATGCATAGTACTTTTTTGTTAACATAACGAGAAATTTCCGATCCTAAAATTACAGTAGTGGGGATAAAATTATGATGAAAGCGTTTAGACCATTTTTTTTTCGAAATATTTGGAGGGAATCCCTTTTCCCTGGAGACAGACGCGCTTTCAATGTGAAAACGAA
ACCTCACGTACAGACAAAAAAAATTCTTTTGAATTGATTACCAAAAAATTACACAAGACACAAAGCCTAAAGGCCGCCGCATTTGTCCAGAGGACAGATGTGGAGCATTATTAGACTTGGAATGTGAAAAGACTGAAATAATCCTGTAACTGCTCACATCGCTACAGGCCGGGGATATTTCGGGGCTAGGGTTTGGAGAA
CTGTTTTCGAATATTAAAATCCAAGCAAAGAATGACAAACTTTTAAAAACTTGAACGTGCGCCTCCTCTGTGAAAGTAAAACGTGCGCCGCGGTTTTCACAGAGTGCTGCTTTCAAGCCTAAACGAGTTCAAAGAGCACTTCTTAGCTTGCAGCACACGCTGACCGTTGGTTCGAGGCCTGTGGAGCAGAGAGAGTAATT
CTTAGCTTGCAGTATACGCTGACGGTTGATTGAGTCCCGTGGAGCAGGCAATCCAACTTCATTCGCATTTGTAAGAGGTAGAGGGTACTTTTACTGGTTGATCCATGGCATTACGGTTTGAGGTGCTGGGAAACTTCAACCGAGCTCGTGCAGCCAGACTCACACTTCCTCATTTTCGATGTCAGACTCCTCTATTTATG
CCGGTTGGAACCAAAGGTGCAGTAAAGGGACTCGCAAGTGACCAATTGGAGGATATTGGCTGCCAAATTATTCTTGGAAACACATACCATTTGGAACTTTGTCCTGGTTCTGATTTAATTGATGAGCTGGGTGGTCTTCACAAGTTCATGAATTGGCCAAGGGGCTTGCTTACGGATTCTGGTGGTTTTCAGATGGTCTC
TTTATTGCACTTGGCTGACATCACAGAAGAGGGCGTAACTTTCCAGTCACCCGTGGATGGAAAATCAATGCTTCTTACACCTGAGGAGTCAATTCAAATTCAAGTAAGAGCCTTTGAGTAATATTTTTCAATCCTTTAATATCTTTCCTTTCTTATTTACTAGAAAGAAACTTTATGATATCTTGATGAAATTAAATTGG
TTTGGGTAACTTTAGAATGCACACTTATGTCTTAG

>TRINITY_DN120556_c0_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CTTTCTTGGTTTTTAGCCCAGCAGCTTATACATTTCCATGCATAGTACTTTTTTGTTAACATAACGAGAAATTTCCGATCCTAAAATTACAGTAGTGGGGATAAAATTATGATGAAAGCGTTTAGACCATTTTTTTTTCGAAATATTTGGAGGGAATCCCTTTTCCCTGGAGACAGACGCGCTTTCAATGTGAAAACGAA
ACCTCACGTACAGACAAAAAAAATTCTTTTGAATTGATTACCAAAAAATTACACAAGACACAAAGCCTAAAGGCCGCCGCATTTGTCCAGAGGACAGATGTGGAGCATTATTAGACTTGGAATGTGAAAAGACTGAAATAATCCTGTAACTGCTCACATCGCTACAGGCCGGGGATATTTCGGGGCTAGGGTTTGGAGAA
CTGTTTTCGAATATTAAAATCCAAGCAAAGAATGACAAACTTTTAAgtatataatttcaaattaaataatggctaccttggaagtgtataatttcaaggcggataaccgagactctgatggcttgcctttgaacatgtagAAACTTGAACGTGCGCCTCCTCTGTGAAAGTAAAACGTGCGCCGCGGTTTTCACAGAGTG
CTGCTTTCAAGCCTAAACGAGTTCAAAGAGCACTTCTTAGCTTGCAGCACACGCTGACCGTTGGTTCGAGGCCTGTGGAGCAGAGAGAGTAATTCTTAGCTTGCAGTATACGCTGACGGTTGATTGAGTCCCGTGGAGCAGGCAATCCAACTTCATTCGCATTTGTAAGAGGTAGAGGGTACTTTTACTGGTTGATCCAT
GGCATTACGGTTTGAGGTGCTGGGAAACTTCAACCGAGCTCGTGCAGCCAGACTCACACTTCCTCATTTTCGATGTCAGACTCCTCTATTTATGCCGGTTGGAACCAAAGGTGCAGTAAAGGGACTCGCAAGTGACCAATTGGAGGATATTGGCTGCCAAATTATTCTTGGAAACACATACCATTTGGAACTTTGTCCTG
GTTCTGATTTAATTGATGAGCTGGGTGGTCTTCACAAGTTCATGAATTGGCCAAGGGGCTTGCTTACGGATTCTGGTGGTTTTCAGATGGTCTCTTTATTGCACTTGGCTGACATCACAGAAGAGGGCGTAACTTTCCAGTCACCCGTGGATGGAAAATCAATGCTTCTTACACCTGAGGAGTCAATTCAAATTCAAGTA
AGAGCCTTTGAGTAATATTTTTCAATCCTTTAATATCTTTCCTTTCTTATTTACTAGAAAGAAACTTTATGATATCTTGATGAAATTAAATTGGTTTGGGTAACTTTAGAATGCACACTTATGTCTTAG

Intron 4 GTGCAGACTC ... GCGTGAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	29.05	14.7	7	5
A2	34.21	21.3	11	11
A3	15.94	24	1	8
A4	22.02	26.7	6	9
A5	29.98	15.3	6	7
A6	12.57	31.3	3	6
A7	21.72	48.7	8	19
A8	6.67	7	1	0
A9	12.22	14.7	0	4
A10	19.87	28.3	6	8

>TRINITY_DN113159_c0_g1_i5 from sample A2 / Example spliced isoform

GTTTAGACCATTTTTTTTTCGAAATATTTGGAGGGAATCCCTTTTCCCTGGAGACAGACGCGCTTTCAATGTGAAAACGAAACCTCACGTACAGACAAAAAAAATTCTTTTGAATTGATTACCAAAAAATTACACAAGACACAAAGCCTAAAGGCCGCCGCATTTGTCCAGAGGACAGATGTGGAGCATTATTAGACTTG
GAATGTGAAAAGACTGAAATAATCCTGTAACTGCTCACATCGCTACAGGCCGGGGATATTTCGGGGCTAGGGTTTGGAGAACTGTTTTCGAATATTAAAATCCAAGCAAAGAATGACAAACTTTTAAAAACTTGAACGTGCGCCTCCTCTGTGAAAGTAAAACGTGCGCCGCGGTTTTCACAGAGTGCTGCTTTCAAGCC
TAAACGAGTTCAAAGAGCACTTCTTAGCTTGCAGCACACGCTGACCGTTGGTTCGAGGCCTGTGGAGCAGGGAGAGTAATTCTTAGCTTGCAGTATACGCTGACGGTTGATTGAGTCCCGTGGAGCAGGCAATCCAACTTCATTCGCATTTGTAAGAGGTAGAGGGTACTTTTACTGGTTGATCCATGGCATTACGGTTT
GAGGTGCTGGGAAACTTCAACCGAGCTCGTGCAGCCAGACTCACACTTCCTCATTTTCGATGTCAGACTCCTCTATTTATGCCGGTTGGAACCAAAGGTGCAGTAAAGGGACTCGCAAGTGACCAATTGGAGGATATTGGCTGCCAAATTATTCTTGGAAACACTTACCATTTGGAACTTTGTCCTGGTTCTGATTTAAT
TGATGAGCTAGGTGGTCTTCACAAGTTCATGAATTGGCCAAGGGGCCTGCTTACGGATTCTGGTGGTTTTCAGATGGTCTCTTTATTGCACTTGGCTGACATCACAGAAGAGGGCGTAACTTTCCAGTCACCCGTGGATGGAAAATCAATGCTTCTTACACCTGAGGAGTCAATTCAAATTCAAAATAAAATTGGAGCAG
ACATAATCATGGCGCTTGATGATGTTGTGAAAACCACTATAACTGGACCTAGAGTTGAGGAGGCAATGTATCGTACTCTTCGATGGATTGATCGATGCATAGCTGCCCATCAAAGACCAGCGGATCAAAATTTATTTGGTATTGTACAAGGAGGATTGGATCCTGTTTTAAGAGATATTTGCGTCAAAGGTCTTGTGGAA
CGTGACCTACCTGGCTATGCTATTGGCGGGCTTTCAGGGGGAGAAGAAAAGGATTCGTTTTGGCGTGTTGTTGCACAATGTACAGCTGCTTTGCCAGAGGATAAACCACGTTATGTAATGGGTGTGGGCTATCCCCTTGATATTGTTGTTTGCAGTGCTTTAGGTGCTGACATGTACGATTGTGTTTACCCCACTCGTAC
TGCCCGTTTTGGTACAGCTCTTGTGCCTGAGGGAGTTCTCAAGTTGAAGCATGCAGCAATGGCAAGTGATTGCCGGCCAGTAGACCCAACATGTTCCTGTATGGTTTGCAAGCGCTATTCAAGGGCATATATTCATACCCTTGTAACAAAGGATGCAATGGGCTCTCAACTGCTGTCATATCACAATTTGGCTTATATGA
TGAGGCTGAGCAAGGAGTTGCACAATTCTATTATTGAGGGCCGTTTTCCAGAATTTGTGCAGGGATTTCTCCAGACCCAGTTCCCAAAAGGTGATGTTCCACAGTGGGTCTGTAATGCCATGGAAGCTGCAGGCATAGATATTTCCATGTGCTGCTCACCATTTACATTTTCTGGAAACAGCTAGTTTATTAGGCTTTGA
TGCAGTGTAAAACTGGAAGGTCCACTGAAATGTGTCCTTGTCCCTATGCCACAGTCATAGAGCTTAAAGTGACCATTGGACTTCAAACTGAGCTTATTAGCTTTTGGTTTTCTATTGTATTCCAAAACTGAGGCTACATTCCCTGCCTAGTTAAGTATATAGGATCTGGTTGACAGCATACGGTCTCAAACATGAGACCA
CATCAGTGTAATAGTTTTGTTTGGCTCTGCAATTTTGGTCCATAAATATGTGGAAGTAAGTATGAGCCTGTCTAATTCATGACAAGATTTACATTCTTTATTCTTTAGTTCTCTCTCTATTAACAACATTATTGTATGAGATCAAAGTTCTTTGCAATGGATGCCAAGAAATTGGTGCAGAGAACATGCATAATATTTTC
CCGAGGATGATCAGTATAACATAAAATTAAACGGTTGCCTCTTCACATTCTATAATAGAATGCAATGTTACTGAATCCTACATGACCATATCTTTTCTTTATGAATGAATATTTTATTTTGGCAATGCCCTG

>TRINITY_DN113159_c0_g1_i6 from sample A2 / Example unspliced isoform:

GTATATAATTTCAAATTAAATAATGGCTACCTTGGAAGTGTATAATTTCAAGGCGGATAACCGAGACTCTGATGGCTTGCCTTTGAACATGTAGAAACTTGAACGTGCGCCTCCTCTGTGAAAGTAAAACGTGCGCCGCGGTTTTCACAGAGTGCTGCTTTCAAGCCTAAACGAGTTCAAAGgtgcagactccatgctcg
aatctccggagcaaggatttttgtccgagctatagaaattttgttgtaaaagagccggtgtttatttatttctacaattttatttgagcttcttcgtgtttattcatggaattcgttgcaaattatttatattttgttgttttgtgataattgcggtttgtaatgcgtgaacagAGCACTTCTTAGCTTGCAGCACACGC
TGACCGTTGGTTCGAGGCCTGTGGAGCAGGGAGAGTAATTCTTAGCTTGCAGTATACGCTGACGGTTGATTGAGTCCCGTGGAGCAGGCAATCCAACTTCATTCGCATTTGTAAGAGGTGAGCTGTTTTCTCTTCGATTTACAGCTGCCGAGTTTAATAAAAATGCAGAAGACATAAATATATACGCATATTTGTTTTTC
TTGGGGGAGTCCTGTGTCAAAAACTCTTAAAATATCGC