sp|Q39247|2ABB_ARATH ----> Serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform

Intron 1 GTTGTTACAA ... CTTGGATCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	19.87	101.1	0	24
A2	12.84	68.9	0	10
A3	15.58	95.4	0	17
A4	17.99	56.9	1	12
A5	29.12	29.6	0	12
A6	15.39	249.6	0	44
A7	15.2	340.4	0	59
A8	19.84	351	0	85
A9	15.44	315	0	55
A10	23.54	290.1	0	87

>TRINITY_DN103885_c5_g1_i6 from sample A4 / Example spliced isoform

CCGGATATTAGAAAATCTACAACTCCATGCAAGCTGCCCGGCCCTCGGCGGGCAGCAACCCTTGGATTTATTATTCTGCGCTGAAATTTAATAAAACTTCGTATTTACTTGCCTTGTACGATTATCATTTCTCTCTAATTCCTTCAACTTTATTATTATTGTTTTATTTTTCCATTTTTCCTTTTCTGTCCGTGTTCGCC
GCTGCGTCTCCTGTATCTCGAGCGACATGGTCCCGCTGGGTGACTGGTGATCGGAGTCACCATTAGCATCATGCGAGGCTTATTTATCCAGAGAGCCATCGCAGAAATCTGCTTCCATGTGACCAGGGTCCGCGGATAGCAATACACCGACACCACTGCTAACATTAATAATCATAATTATCCATTCGTTATTGAGTATC
AGCAGTGATGATCGCGAATGGGGGAGGAGGAGGAGCTTCCCTCGAATGGAAGTTCTCGCAGGTTTTCGGCGAACGGGCGGCCGGAGAAGAGATTCAAGAGGTTGATATCATCTCGGCAATCGAGTTTGATAAGAGTGGCGAACATTTGGCTACGGGAGATCGTGGTGGTCGCGTTGTTCTTTTTGAAAGGATAGATGGAA
AAGATCCACATGCTGAAAAGGAGCTCGAAAGAGGAGATTGTCCAGTATCTAAACATCCTGAATATCGGTATAAGACAGAATTCCAGAGCCATGAACCTGAGTTTGATTATCTGAAGAGCTTGGAGATAGAGGAGAAAATAAATAAGATTAGGTGGTGTCCGGCTGCAAATGGTGCCCTGTTTCTCCTTTCTACAAATGAT
AAAACTATCAAACTATGGAAGGTTCAGGACAAGAAGATCAGAAGAGTATCTGAAATGAATGCAGGCCCGTCAACACGGTTGGAAAATGGAAGCTTGGTTGGAAATATTCCTGGGGCAACTTCAAGGACAATTCCTGCTTCGAATGGCATTCCTTCTCAATTGATGAGTAGATATCTGGGCAATGACTTTGTATTTCCTCC
AGGGGGCATTCCTTCACTGCGATTGCCCATGGTAGCAACCAATGAAATGACACCTGTGGCCAGATGTCGTAAAGTATACGGTCATGCTCATGATTATCACATAAACTCAATTTCAACCAACAGTGATGGTGAAACTTACATATCGGCAGATGATCTAAGAATAAATATGTGGAACTTGGAAATAAGTGACCAATGCTTCA
ATATTGTTGATATTAAGCCTGCCAATATGGAGGAACTTACTGAGGTGATAACGTCAGCAGAATTCCATCCTAGTCAATGCAACATCTTTGCATATAGCAGCTCAAAGGGCACTATTCGACTTATTGACATGCGGCAATCAGCTTTATGTGACAGACATTCAAAACTATTCGAGGAGCAGGAAGCACCTGGTTCTAGATCA
TTTTTTACAGAGATAATTGCTTCGATTTCAGATATAAAGTTTGCAAAAGATGGAAGACATATTTTAAGTCGTGATTACATGACACTTAAGCTATGGGACATAAACATGGAGGCAAGTCCAATTGCAACTTTCAAGGTTCATGAACATCTACGGCCCAAGTTATGTGATTTATATGAAAATGATTCAATTTTTGACAAGTT
CGAGTGCTCCCTTAGTGGAGACGGGCTTCATGTTGCAACTGGGTCTTATAGTAATATATTCCAAGTCTTTGGTTGTTTTGCTGGTAATGATGAAGGAACCATTTTGGAAGCTAGCAAAAGTCCAAATAGAAGACGGATTTTGCCAACACCTTCAAGGCCTGGGAGGTCTCTTGCAAGTCTTACACGTAGTCGCACTCGCC
GAGGAAATGAAAGCCCAAGTGGGGAGGTAATTGGAGGTGCTTCTGATTTCGCTTCAAAGTTACTACACTTGGCATGGCATCCAGCTGCAAATGTCATTGCATGTGCTGCTTCAAATAGTTTATACATGTATTATGCCTAAATTAAACATCTCCTGTAGAATGTAATCAAAGGGCAGGTGATACTTTTCGTTCACAATCGG
TGGAGCAATCTCAAGTTAACCTATTGTCAGAGAAGCAGCATGTATGATTATGCTCCTGAACTTGATGTGCGGGTTGTTACAGCTCGTAGCATGTTCATGTACTTTGTTCCAGGCTTTAAAAGCTACAAAGGATCTCCTTTTATTAAAGGTTGTGGTGAAGCGCCCTCTTTCCAAGCAAAAGGTGAATGTTGAGGAATCGG
GTTCTGTTGTTGATTCTTTTTAGCATGGACCAGGCTCAGCCTTAGCTGATGCGATTAATCATTATTGTATTCCTTAACAGGTATGATCATATATTATAAAGTGTTTCACCAGCAAGTAATGGCAAAAGCTCTCTGGTGTATTATCACACAAGACACGCAAGTGTCATGTAATCTGTGGCACTAACCTAGTGCAGGGGTTC
TTAGTAGTAGCCCTGATTGGCAATTAAGGGTTTTATGGTCGGTTTGCATGTAATTCTCAAATTTCATAGATGGGTTTAGCTGCTTTATCTGGTAAATCTGAAGCAGATTTCAAGCAACATCGAAGCCAAGATGTAACAATCATTCTATATTAGTGAGTCTCCC

>TRINITY_DN103885_c5_g1_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:

GTCGCACTCGCCGAGgttgttacaatattcattcatgttttgaatttcattcctttcatatttttaggtgcttgctttgaggttgcaaattagtttcaaatattctgggctttttagtgtgctttttcccactgattgtctgagtttctccctccattgttgtacttggatcagGAAATGAAAGCCCAAGTGGGGAGGTA
ATTGGAGGTGCTTCTGATTTCGCTTCAAAGTTACTACACTTGGCATGGCATCCAGCTGCAAATGTCATTGCATGTGCTGCTTCAAATAGTTTATACATGTATTATGCCTAAATTAAACATCTCCTGTAGAATGTAATCAAAGGGCAGGTGATACTTTTCGTTCACAATCGGTGGAGCAATCTCAAGTTAACCTATTGTCA
GAGAAGCAGCATGTATGATTATGCTCCTGAACTTGATGTGCGGGTTGTTACAGCTCGTAGCATGTTCATGTACTTTGTTCCAGGCTTTAAAAGCTACAAAGGATCTCCTTTTATTAAAGGTTGTGGTGAAGCGCCCTCTTTCCAAGCAAAAGGT

Intron 2 GTAGCTGTAC ... ATGTGAATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	22.28	86.2	27.3	7.6
A2	18.15	70.9	18	10.2
A3	20.9	80.3	25.6	5.5
A4	18.42	60.6	14.4	7.1
A5	23.27	31.8	10	9.9
A6	16.56	69.7	15.3	8.3
A7	18.08	104.5	24.2	11.6
A8	14.62	84.2	15.8	12.3
A9	14.94	107.9	20.7	8.7
A10	15.23	110.3	21.8	11.4

>TRINITY_DN110805_c5_g2_i8 from sample A2 / Example spliced isoform

CAACTTTATTATTATTGTTTTATTTTTCCATTTTTCCTTTTCTGTCCGTGTTCGCCGCTGCGTCTCCTGTATCTCGAGCGACATGGTCCCGCTGGGTGACTGGTGATCGGAGTCACCATTAGCATCATGCGAGGCTTATTTATCCAGAGAGCCATCGCAGAAATCTGCTTCCATGTGACCAGGGTCCGCGGATAGCAATA
CACCGACACCACTGCTAACATTAATAATCATAATTATCCATTCGTTATTGAGTATCAGCAGTGATGATCGCGAATGGGGGAGGAGGAGGAGCTTCCCTCGAATGGAAGTTCTCGCAGGTTTTCGGCGAACGGGCGGCCGGAGAAGAGATTCAAGAGGTTGATATCATCTCGGCAATCGAGTTTGATAAGAGTGGCGAACA
TTTGGCTACGGGAGATCGTGGTGGTCGCGTTGTTCTTTTTGAAAGGATAGATGGAAAAGATCCACATGCTGAAAAGGAGCTCGAAAGAGGAGATTGTCCAGTATCTAAACATCCTGAATATCGGTATAAGACAGAATTCCAGAGCCATGAACCTGAGTTTGATTATCTGAAGAGCTTGGAGATAGAGGAGAAAATAAATA
AGATTAGGTGGTGTCCGGCTGCAAATGGTGCCCTGTTTCTCCTTTCTACAAATGATAAAACTATCAAACTATGGAAGGTTCAGGACAAGAAGATCAGAAGAGTATCTGAAATGAATGCAGGCCCGTCAACACGGTTGGAAAATGGAAGCTTGGTTGGAAATATTCCTGGGGCAACTTCAAGGACAATTCCTGCTTCGAAT
GGCATTCCTTCTCAATTGATGAGTAGATATCTGGGCAATGACTTTGTATTTCCTCCAGGGGGCATTCCTTCACTGCGATTGCCCATGGTAGCAACCAATGAAATGACACCTGTGGCCAGATGTCGTAAAGTATACGGTCATGCTCATGATTATCACATAAACTCAATTTCAACCAACAGTGATGGTGAAACTTACATATC
GGCAGATGATCTAAGAATAAATATGTGGAACTTGGAAATAAGTGACCAATGCTTCAATATTGTTGATATTAAGCCTGCCAATATGGAGGAACTTACTGAGGTGATAACGTCAGCAGAATTCCATCCTAGTCAATGCAACATCTTTGCATATAGCAGCTCAAAGGGCACTATTCGACTTATTGACATGCGGCAATCAGCTT
TATGTGACAGACATTCAAAACTATTCGAGGAGCAGGAAGCACCTGGTTCTAGATCATTTTTTACAGAGATAATTGCTTCGATTTCAGATATAAAGTTTGCAAAAGATGGAAGACATATTTTAAGTCGTGATTACATGACACTTAAGCTATGGGACATAAACATGGAGGCAAGTCCAATTGCAACTTTCAAGGTTCATGAA
CATCTACGGCCCAAGTTATGTGATTTATATGAAAATGATTCAATTTTTGACAAGTTCGAGTGCTCCCTTAGTGGAGACGGGCTTCATGTTGCAACTGGGTCTTATAGTAATATATTCCAAGTCTTTGGTTGTTTTGCTGGTAATGATGAAGGAACCATTTTGGAAGCTAGCAAAAGTCCAAATAGAAGACGGATTTTGCC
AACACCTTCAAGGCCTGGGAGGTCTCTTGCAAGTCTTACACGTAGTCGCACTCGCCGAGGAAATGAAAGCCCAAGTGGGGAGGTAATTGGAGGTGCTTCTGATTTCGCTTCAAAGTTACTACACTTGGCATGGCATCCAGCTGCAAATGTCATTGCATGTGCTGCTTCAAATAGTTTATACATGTATTATGCCTAAATTA
AACATCTCCTGTAGAATGTAATCAAAGGGCAGGTGATACTTTTCGTTCACAATCGGTGGAGCAATCTCAAGTTAACCTATTGTCAGAGAAGCAGCATGTATGATTATGCTCCTGAACTTGATGTGCGGGTTGTTACAGCTCGTAGCATGTTCATGTACTTTGTTCCAGGCTTTAAAAGCTACAAAGGATCTCCTTTTAGT
AAAGGTTGTGGTGAAGCGCCCTCTTTCCAAGCAAAAGGTGAATGTTGAGGAATCGGGTTCTGTTGTTGATTCTTTTTAGCATGGACCAGGCTCAGCCTTAGCTGATGCGATTAATCATTATTGTATTCCTTAACAGGTATGATCATATATTATAAAGTGTTTCACCAGCAAGTAATGGCAAAAGCTCTCTGGTGTATTAT
CACACAAGACACGCAAGTGTCATGTAATCTGTGGCACTAACCTAGTGCAGGGGTTCTTAGTAGTAGCCCTGATTGGCAATTAAGGGTTTTATGGTCGGTTTGCATGTAATTCTCAAATTTCATAGATGGGTTTAGCTGCTTTATCTGGTAAATCTGAAGCAGATTTCAAGCAACATCGAAGCCAAGATGTAACAATCATT
CTATATTAGTGAGTCTCCCTTTAATTTAGAATAATGTCTTATTCTTCTGTTTATCCTGTTCTTAATAGTCAATACCTGTGCTCTGAAGTCTTT

>TRINITY_DN110805_c5_g2_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:

TCACTGCGATTGCCCATGgtagctgtacctatatccctgccttatcttaattctcatgtgcactgaagccatcagaagcactgattacatcatttccctttggcatatttcctaagtatgtgttacttttgaagacaacgtgtttgaatggctactttgaagccaatatgaaggaacttactagtgtggcatattctatg
gttggtatgactgcggatgcactttatttagcaatgggcctcaaaagctaatttgtgaaaccttttatgtgaatagGTAGCAACCAATGAAATGACACCTGTGGCCAGATGTCGTAAAGTATACGGTCATGCTCATGATTATCACATAAACTCAATTTCAACCAACAGTGATGGTGAAACTTACATATCGGCAGATGATC
TAAGAATAAATATGTGGAACTTGGAAATAAGTGACCAATGCTTCAATATTGTTGATATTAAGCCTGCCAATATGGAGGAACTTACTGAGGTGATAACGTCAGCAGAATTCCATCCTAGTCAATGCAACATCTTTGCATATAGCAGCTCAAAGGGCACTATTCGACTTATTGACATGCGGCAATCAGCTTTATGTGACAGA
CATTCAAAACTGTAAGACATTTTCTTGTAATTTCCTTGTTAATTATTTCAGGGCAAAGTTTGTTTT

Intron 3 GTGAATGTTG ... TCCTTAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	73.68	28.4	81	78
A2	70.08	19	40	49
A3	71.88	27	63	75
A4	55.84	37.4	54.6	40
A5	64.36	18	33	32
A6	70.03	123.4	257	319.6
A7	66.96	157.8	285.6	354
A8	68.46	219.6	409.2	544
A9	69.17	148.4	271	395
A10	66.64	107.6	188	242

>TRINITY_DN103885_c5_g1_i7 from sample A4 / Example spliced isoform

CCGGATATTAGAAAATCTACAACTCCATGCAAGCTGCCCGGCCCTCGGCGGGCAGCAACCCTTGGATTTATTATTCTGCGCTGAAATTTAATAAAACTTCGTATTTACTTGCCTTGTACGATTATCATTTCTCTCTAATTCCTTCAACTTTATTATTATTGTTTTATTTTTCCATTTTTCCTTTTCTGTCCGTGTTCGCC
GCTGCGTCTCCTGTATCTCGAGCGACATGGTCCCGCTGGGTGACTGGTGATCGGAGTCACCATTAGCATCATGCGAGGCTTATTTATCCAGAGAGCCATCGCAGAAATCTGCTTCCATGTGACCAGGGTCCGCGGATAGCAATACACCGACACCACTGCTAACATTAATAATCATAATTATCCATTCGTTATTGAGTATC
AGCAGTGATGATCGCGAATGGGGGAGGAGGAGGAGCTTCCCTCGAATGGAAGTTCTCGCAGGTTTTCGGCGAACGGGCGGCCGGAGAAGAGATTCAAGAGGTTGATATCATCTCGGCAATCGAGTTTGATAAGAGTGGCGAACATTTGGCTACGGGAGATCGTGGTGGTCGCGTTGTTCTTTTTGAAAGGATAGATGGAA
AAGATCCACATGCTGAAAAGGAGCTCGAAAGAGGAGATTGTCCAGTATCTAAACATCCTGAATATCGGTATAAGACAGAATTCCAGAGCCATGAACCTGAGTTTGATTATCTGAAGAGCTTGGAGATAGAGGAGAAAATAAATAAGATTAGGTGGTGTCCGGCTGCAAATGGTGCCCTGTTTCTCCTTTCTACAAATGAT
AAAACTATCAAACTATGGAAGGTTCAGGACAAGAAGATCAGAAGAGTATCTGAAATGAATGCAGGCCCGTCAACACGGTTGGAAAATGGAAGCTTGGTTGGAAATATTCCTGGGGCAACTTCAAGGACAATTCCTGCTTCGAATGGCATTCCTTCTCAATTGATGAGTAGATATCTGGGCAATGACTTTGTATTTCCTCC
AGGGGGCATTCCTTCACTGCGATTGCCCATGGTAGCAACCAATGAAATGACACCTGTGGCCAGATGTCGTAAAGTATACGGTCATGCTCATGATTATCACATAAACTCAATTTCAACCAACAGTGATGGTGAAACTTACATATCGGCAGATGATCTAAGAATAAATATGTGGAACTTGGAAATAAGTGACCAATGCTTCA
ATATTGTTGATATTAAGCCTGCCAATATGGAGGAACTTACTGAGGTGATAACGTCAGCAGAATTCCATCCTAGTCAATGCAACATCTTTGCATATAGCAGCTCAAAGGGCACTATTCGACTTATTGACATGCGGCAATCAGCTTTATGTGACAGACATTCAAAACTATTCGAGGAGCAGGAAGCACCTGGTTCTAGATCA
TTTTTTACAGAGATAATTGCTTCGATTTCAGATATAAAGTTTGCAAAAGATGGAAGACATATTTTAAGTCGTGATTACATGACACTTAAGCTATGGGACATAAACATGGAGGCAAGTCCAATTGCAACTTTCAAGGTTCATGAACATCTACGGCCCAAGTTATGTGATTTATATGAAAATGATTCAATTTTTGACAAGTT
CGAGTGCTCCCTTAGTGGAGACGGGCTTCATGTTGCAACTGGGTCTTATAGTAATATATTCCAAGTCTTTGGTTGTTTTGCTGGTAATGATGAAGGAACCATTTTGGAAGCTAGCAAAAGTCCAAATAGAAGACGGATTTTGCCAACACCTTCAAGGCCTGGGAGGTCTCTTGCAAGTCTTACACGTAGTCGCACTCGCC
GAGGAAATGAAAGCCCAAGTGGGGAGGTAATTGGAGGTGCTTCTGATTTCGCTTCAAAGTTACTACACTTGGCATGGCATCCAGCTGCAAATGTCATTGCATGTGCTGCTTCAAATAGTTTATACATGTATTATGCCTAAATTAAACATCTCCTGTAGAATGTAATCAAAGGGCAGGTGATACTTTTCGTTCACAATCGG
TGGAGCAATCTCAAGTTAACCTATTGTCAGAGAAGCAGCATGTATGATTATGCTCCTGAACTTGATGTGCGGGTTGTTACAGCTCGTAGCATGTTCATGTACTTTGTTCCAGGCTTTAAAAGCTACAAAGGATCTCCTTTTATTAAAGGTTGTGGTGAAGCGCCCTCTTTCCAAGCAAAAGGTATGATCATATATTATAA
AGTGTTTCACCAGCAAGTAATGGCAAAAGCTCTCTGGTGTATTATCACACAAGACACGCAAGTGTCATGTAATCTGTGGCACTAACCTAGTGCAGGGGTTCTTAGTAGTAGCCCTGATTGGCAATTAAGGGTTTTATGGTCGGTTTGCATGTAATTCTCAAATTTCATAGATGGGTTTAGCTGCTTTATCTGGTAAATCT
GAAGCAGATTTCAAGCAACATCGAAGCCAAGATGTAACAATCATTCTATATTAGTGAGTCTCCC

>TRINITY_DN103885_c5_g1_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:

TTTGAACTAACCCTTTTTGTAAATATACAACACACATGCGTATAAATTTTGGAAGTTTGTTTCTTCCAAGATCTGCACTGATTATCTAGATTGAGCTGTTTTAGACATTGTGGATTTTTCTGATTTAACTTTTTAAGCATTCTTCTGCACTGATAAAAACATGCTTTGCATTGTGGCCACAGTAATATATTCCAAGTCTT
TGGTTGTTTTGCTGGTAATGATGAAGGAACCATTTTGGAAGCTAGCAAAAGTCCAAATAGAAGACGGATTTTGCCAACACCTTCAAGGCCTGGGAGGTCTCTTGCAAGTCTTACACGTAGTCGCACTCGCCGAGGAAATGAAAGCCCAAGTGGGGAGGTAATTGGAGGTGCTTCTGATTTCGCTTCAAAGTTACTACACT
TGGCATGGCATCCAGCTGCAAATGTCATTGCATGTGCTGCTTCAAATAGTTTATACATGTATTATGCCTAAATTAAACATCTCCTGTAGAATGTAATCAAAGGGCAGGTGATACTTTTCGTTCACAATCGGTGGAGCAATCTCAAGTTAACCTATTGTCAGAGAAGCAGCATGTATGATTATGCTCCTGAACTTGATGTG
CGGGTTGTTACAGCTCGTAGCATGTTCATGTACTTTGTTCCAGGCTTTAAAAGCTACAAAGGATCTCCTTTTATTAAAGGTTGTGGTGAAGCGCCCTCTTTCCAAGCAAAAGgtgaatgttgaggaatcgggttctgttgttgattctttttagcatggaccaggctcagccttagctgatgcgattaatcattattgta
ttccttaacagGTATGATCATATATTATAAAGTGTTTCACCAGCAAGTAATGGCAAAAGCTCTCTGGTGTATTATCACACAAGACACGCAAGTGTCATGTAATCTGTGGCACTAACCTAGTGCAGGGGTTCTTAGTAGTAGCCCTGATTGGCAATTAAGGGTTTTATGGTCGGTTTGCATGTAATTCTCAAATTTCATAG
ATGGGTTTAGCTGCTTTATCTGGTAAATCTGAAGCAGATTTCAAGCAACATCGAAGCCAAGATGTAACAATCATTCTATATTAGTGAGTCTCCC

Intron 4 GTAAGTTTGA ... TTATTTGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	16.74	164.2	2	33
A2	21.88	171.7	2	48
A3	14.87	172	1	30
A4	17.63	168.3	1	36
A5	25.25	65.2	0	22
A6	21.68	126.5	0	35
A7	16.08	303	4	58
A8	18.58	114	0	26
A9	17.61	267	0	57
A10	17.63	294.5	0	63

>TRINITY_DN122612_c0_g1_i9 from sample A1 / Example spliced isoform

GTGGAGAATTCAAATTTGGGATAAACAAAAATATGAGACTTGAGTAGTTTTAAGTTTTTACAGTTTGAAGAAAATGACTCGAAGACCAAAGTGAAAAATATAAGATCTCTTCTTTTTTTTTCTCTACCTCCATGTTATTTGTTTGGACCTGTTTTCCTCTTGTTAGAGCCTAGAGGACTGCCTGTTTTGGTCTGTATCAT
AATCAACTAGAAAGAAATGCTCTTTTTATGTAATATTTTCCAGCTATACTGTGTGCCAATGGATGTTTTTGATGGCATATTTATTTTGAATAGTTGATATCATCTCGGCAATCGAGTTTGATAAGAGTGGCGAACATTTGGCTACGGGAGATCGTGGTGGTCGCGTTGTTCTTTTTGAAAGGATAGATGGAAAAGATCCA
CATGCTGAAAAGGAGCTCGAAAGAGGAGATTGTCCAGTATCTAAACATCCTGAATATCGGTATAAGACAGAATTCCAGAGCCATGAACCTGAGTTTGATTATCTGAAGAGCTTGGAGATAGAGGAGAAAATAAATAAGATTAGGTGGTGTCCGGCTGCAAATGGTGCCCTGTTTCTCCTTTCTACAAATGATAAAACTAT
CAAACTATGGAAGGTTCAGGACAAGAAGATCAGAAGAGTATCTGAAATGAATGCAGGCCCGTCAACACGGTTGGAAAATGGAAGCTTGGTTGGAAATATTCCTGGGGCAACTTCAAGGACAATTCCTGCTTCGAATGGCATTCCTTCTCAATTGATGAGTAGATATCTGGGCAATGACTTTGTATTTCCTCCAGGGGGCA
TTCCTTCACTGCGATTGCCCATGGTAGCAACCAATGAAATGACACCTGTGGCCAGATGTCGTAAAGTATACGGTCATGCTCATGATTATCACATAAACTCAATTTCAACCAACAGTGATGGTGAAACTTACATATCGGCAGATGATCTAAGAATAAATATGTGGAACTTGGAAATAAGTGACCAATGCTTCAATATTGTT
GATATTAAGCCTGCCAATATGGAGGAACTTACTGAGGTGATAACGTCAGCAGAATTCCATCCTAGTCAATGCAACATCTTTGCATATAGCAGCTCAAAGGGCACTATTCGACTTATTGACATGCGGCAATCAGCTTTATGTGACAGACATTCAAAACTATTCGAGGAGCAGGAAGCACCTGGTTCTAGATCATTTTTTAC
AGAGATAATTGCTTCGATTTCAGATATAAAGTTTGCAAAAGATGGAAGACATATTTTAAGTCGTGATTACATGACACTTAAGCTATGGGACATAAACATGGAGGCAAGTCCAATTGCAACTTTCAAGGTTCATGAACATCTACGGCCCAAGTTATGTGATTTATATGAAAATGATTCAATTTTTGACAAGTTCGAGTGCT
CCCTTAGTGGAGACGGGCTTCATGTTGCAACTGGGTCTTATAGTAATATATTCCAAGTCTTTGGTTGTTTTGCTGGTAATGATGAAGGAACCATTTTGGAAGCTAGCAAAAGTCCAAATAGAAGACGGATTTTGCCAACACCTTCAAGGCCTGGGAGGTCTCTTGCAAGTCTTACACGTAGTCGCACTCGCCGAGGAAAT
GAAAGCCCAAGTGGGGAGGTAATTGGAGGTGCTTCTGATTTCGCTTCAAAGTTACTACACTTGGCATGGCATCCAGCTGCAAATGTCATTGCATGTGCTGCTTCAAATAGTTTATACATGTATTATGCCTAAATTAAACATCTCCTGTAGAATGTAATCAAAGGGCAGGTGATACTTTTCGTTCACAATCGGTGGAGCAA
TCTCAAGTTAACCTATTGTCAGAGAAGCAGCATGTATGATTATGCTCCTGAACTTGATGTGCGGGTTGTTACAGCTCGTAGCATGTTCATGTACTTTGTTCCAGGCTTTAAAAGCTACAAAGGATCTCCTTTTAGTAAAGGTTGTGGTGAAGCGCCCTCTTTCCAAGCAAAAGGTGAATGTTGAGGAATCGGGTTCTGTT
GTTGATTCTTTTTAGCATGGACCAGGCTCAGCCTTAGCTGATGCGATTAATCATTATTGTATTCCTTAACAGGTATGATCATATATTATAAAGTGTTTCACCAGCAAGTAATGGCAAAAGCTCTCTGGTGTATTATCACACAAGACACGCAAGTGTCATGTAATCTGTGGCACTAACCTAGTGCAGGGGTTCTTAGTAGT
AGCCCTGATTGGCAATTAAGGGTTTTATGGTCGGTTTGCATGTAATTCTCAAATTTCATAGATGGGTTTAGCTGCTTTATCTGGTAAATCTGAAGCAGATTTCAAGCAACATCGAAGCCAAGATGTAACAATCATTCTATATTAGTGAGTCTCCCTTTAATTTAGAATAATGTCTTATTCTTCTGTTTATCCTGTTCTTA
ATAGTCAATACCTGTGCTCTGAAGTCTTTACTTACCTTATTTATGGCAGCTGTGTTTCTTCTAAATCTGTTTCAACAGTAAATGACAGTATGTTACTGTTCACCTGAGCACGTTGTTATTAATTGAACGAATTCTGAAGGCAGGCATTTCTTGAGGCTA

>TRINITY_DN122612_c0_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TTGAAAGGATAGATGGAAAAGATgtaagtttgataatgcaatgacggtatatgtacatttcaacttttatgcttatcactcttgccttgttcattttattcaaatgaacaggggatctttgaactttgttccttggtttagatcaatacccctttcagctatcttcgtagatattgttttccttggtcattcatgtttgt
gatgattatgaccaaaagtcctctaattttatttctcttacaaaattatttgtagCCACATGCTGAAAAGGAGCTCGAAAGAGGAGATTGTCCAGTATCTAAACATCCTGAATATCGGTATAAGACAGAATTCCAGAGCCATGAACCTGAGTTTGATTATCTGAAGAGCTTGGAGATAGAGGAGAAAATAAATAAGATTA
GGTGGTGTCCGGCTGCAAATGGTGCCCTGTTTCTCCTTTCTACAAATGATAAAACTATCAAACTATGGAAGGTTCAGGACAAGAAGATCAGAAGAGTATCTGAAATGAATGCAGGCCCGTCAACACGGTTGGAAAATGGAAGCTTGGTTGGAAATATTCCTGGGGCAACTTCAAGGACAATTCCTGCTTCGAATGGCATT
CCTTCTCAATTGATGAGTAGATATCTGGGCAATGACTTTGTATTTCCTCCAGGGGGCATTCCTTCACTGCGATTGCCCATGGTAGCAACCAATGAAATGACACCTGTGGCCAGATGTCGTAAAGTATACGGTCATGCTCATGATTATCACATAAACTCAATTTCAACCAACAGTGATGGTGAAACTTACATATCGGCAGA
TGATCTAAGAATAAATATGTGGAACTTGGAAATAAGTGACCAATGCTTCAATATTGTTGATATTAAGCCTGCCAATATGGAGGAACTTACTGAGGTGATAACGTCAGCAGAATTCCATCCTAGTCAATGCAACATCTTTGCATATAGCAGCTCAAAGGGCACTATTCGACTTATTGACATGCGGCAATCAGCTTTATGTG
ACAGACATTCAAAACTATTCGAGGAGCAGGAAGCACCTGGTTCTAGATCATTTTTTACAGAGATAATTGCTTCGATTTCAGATATAAAGTTTGCAAAAGATGGAAGACATATTTTAAGTCGTGATTACATGACACTTAAGCTATGGGACATAAACATGGAGGCAAGTCCAATTGCAACTTTCAAGGTTCATGAACATCTA
CGGCCCAAGTTATGTGATTTATATGAAAATGATTCAATTTTTGACAAGTTCGAGTGCTCCCTTAGTGGAGACGGGCTTCATGTTGCAACTGGGTCTTATAGTAATATATTCCAAGTCTTTGGTTGTTTTGCTGGTAATGATGAAGGAACCATTTTGGAAGCTAGCAAAAGTCCAAATAGAAGACGGATTTTGCCAACACC
TTCAAGGCCTGGGAGGTCTCTTGCAAGTCTTACACGTAGTCGCACTCGCCGAGGAAATGAAAGCCCAAGTGGGGAGGTAATTGGAGGTGCTTCTGATTTCGCTTCAAAGTTACTACACTTGGCATGGCATCCAGCTGCAAATGTCATTGCATGTGCTGCTTCAAATAGTTTATACATGTATTATGCCTAAATTAAACATC
TCCTGTAGAATGTAATCAAAGGGCAGGTGATACTTTTCGTTCACAATCGGTGGAGCAATCTCAAGTTAACCTATTGTCAGAGAAGCAGCATGTATGATTATGCTCCTGAACTTGATGTGCGGGTTGTTACAGCTCGTAGCATGTTCATGTACTTTGTTCCAGGCTTTAAAAGCTACAAAGGATCTCCTTTTAGTAAAGGT
TGTGGTGAAGCGCCCTCTTTCCAAGCAAAAGGTGAATGTTGAGGAATCGGGTTCTGTTGTTGATTCTTTTTAGCATGGACCAGGCTCAGCCTTAGCTGATGCGATTAATCATTATTGTATTCCTTAACAGGTATGATCATATATTATAAAGTGTTTCACCAGCAAGTAATGGCAAAAGCTCTCTGGTGTATTATCACACA
AGACACGCAAGTGTCATGTAATCTGTGGCACTAACCTAGTGCAGGGGTTCTTAGTAGTAGCCCTGATTGGCAATTAAGGGTTTTATGGTCGGTTTGCATGTAATTCTCAAATTTCATAGATGGGTTTAGCTGCTTTATCTGGTAAATCTGAAGCAGATTTCAAGCAACATCGAAGCCAAGATGTAACAATCATTCTATAT
TAGTGAGTCTCCCTTTAATTTAGAATAATGTCTTATTCTTCTGTTTATCCTGTTCTTAATAGTCAATACCTGTGCTCTGAAGTCTTTACTTACCTTATTTATGGCAGCTGTGTTTCTTCTAAATCTGTTTCAACAGTAAATGACAGTATGTTACTGTTCACCTGAGCACGTTGTTATTAATTGAACGAATTCTGAAGGCA
GGCATTTCTTGAGGCTA