sp|Q9C5J4|Y3210_ARATH ----> BTB/POZ domain-containing protein At3g22104

Intron 1 GTATGTGAAT ... TTTCTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	38.64	243	20.9	153
A2	33.22	205	26.6	102
A3	36.9	248	26.9	145
A4	35.76	221	26.9	123
A5	36.97	84	10.6	49.3
A6	30.76	100	11.4	44.4
A7	33.93	336	57.7	172.6
A8	31.19	133	18.9	60.3
A9	32.34	364	59.7	174
A10	29.31	357	67.4	148

>TRINITY_DN126658_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

TAAAGGCTTTCTTGTTTTCCATTTAAAGAATAACCTAATGGCTAATGAAGGTTGATGAGGATGATATATTTCTTGATTGATCAACGAGATTTGGCTGACCAGGCTATTCAAATAAAATAAGCCTTCACGCAGAGCGAAGGATGTGATTAGCCGCATGATCATGAAAAAAAGCAGTTAGTTAGCAGTTTATACGGGCGATA
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TCTTCCTGTGCCTCTGCCTCTGCCTGTGTCTTTTTGGGTTTTTTCATGGTGAAACCTGATACACAAATACAAATATAATTGCGTAAAACCTTGACAACTCCCGCTCCCGCCTGAAGTAGAGCAGCATGCACTCTGTATGTGATCTAGAGGTGAATGTCAATGGAGAAGAAACATTCTTTTTAGACAAGAAAACACTGCTT
TCCTTCTCAGGGAGGCTGATCAAGTTGTTCAACAAGACTGCAGCAGCAGCAAGATGTCAAGGAGGGCGAGTGAAGTCATACAAAGTAATACTTCATGATTTGCCAGGAGGGGCCGAGGCATTTGAGCTGGTGGGCAGGTTCTGCTACAATGGGATCGACGGTATTGAGATCACGTCCACCAACATATGCAAGCTTCGTTG
CGTGGCTGAGTATCTGGAGATGACAGAAGAGATCCAGGAAGGGAACCTGGTTGGGCGCACTGAAGATTTTCTCAAGGGCTTGGCCTTCTGGAGTTGGCGGGAATTGATAAACGCATTGAAGGACTGCGAGACCATGGTTTTGACAGCAGATGCTACAGGGATTATTCAGAGATGTATTGATGTGCTCATAGAAAGAATGA
ATGCTAACTGTGATAGCAGTCCTTCCTCGTCTTCTCCTGATAGTTTTGGGGTTCGGTATTCTTGTGATACAAGAAGCTCTGAGAACTCAAAAACTAAAACGGGTTGGTGGTTTGAAGATCTGTCGTCGTTGAGTATGTATCTTATGGAAAGAATGGTTAAAACCATGATTGCGCACAAAATGGATAACTGGGTTATCAGC
AGATTTCTTTCGCACTACCTCAAGTCTGCCTTGCCCACGCTCGGCTACAGCTCCATTTCACCCAAGAAGAAATGTGGGAGGGATGAGCAGATTATGTACCGCTATACCCAGAAAGTGCAGAGAGAGGTTGTGGAAACTGTTGTGAGTTTGCTTCATTCTTTGGAGAGAGCAGCAGTCACATGCAGGAACTTGTTTGGGAT
TCTGAGAGTGGCCACTGTGTTGAATGCCTCTAAATTGTGCAGTAAACAGCTTGAAGGGATGATTGGATCACAGTTGGACCATGCTACATTGGATAACATACTCATTCCTGCACCTCAGGGGATGGGTTGCCTCTATGATGTGGATCTTGTTCTCAGATATGTGCAGATTTTTCTCATGGATCAGGTGATGGTTTCTGTGC
CTGAATCACCCACTGGTGCAGGAGAGCCCACTTCTGGCATTTGCTGCCAGAATCGGCTGAAGAGAGTGGGTAGCCTCATGGACAAGTATATTACAGAGGTTGCCCCGGATGTAAATCTCAAGCCCTCCAAATTTCAGGCGCTCCTTGAATCTTTGCCAGATGATGCCAGAGATTCTTGTGATGTGCTTTACAGAGCATTG
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AAGTACAGATTCTTCTTCTTCCGATAGTGATGGCAGCATGCGTTTCGCCCACGAAGAAGTTACATGCAGCAGCCCAGTGATTTTGTACTCAAAAGACCTTGATTACAATTCTGTGATTTGTGAGGAAAATCAAGAGTTGAAGGCAGACCTGCAGGGAATGCAGTGGAGATTGAAGGAGTTGGAGAAAGTCTGCAAAAAAT
TGCATTCTCAAATGTCAAGAATCGGTAATCTCAAACTTACAAACAGCAGCAGCCGTACCAACCATAGATTACCAAAGTTTTGTTCATGATGAGGCGTAAAAGAAATGCAATTCAATTTCAACATGAATGGATTCTTGTACCATAAATATAACATGTGGAAACTGTTGCATTGGTTGAACAATGTATATTTGACAAAATGA
TTTTTTAACATCCTCTTCTGATCCTCTACTCACTGGAGAGATACAACTGGCTTCAGAATGCTAATGCAAACCTGGTACCTCTGATCAATATCTCAATGCCCAACTGATGGTTTCCGTTTCTTACATATTGACATGTTAGTTAACCAAAGCTTGTTGCTGATGCAGAAAATAACACAAGGAAAACTAACCTCGGGAACCGA
GGAAGGGAAGGTTGGGAATGTTGAAAAGGATTATACGCATAATTATTTCATTGTATATCTATTAAGGAAGGGAAAGCTTGGGTTTAAAGGAAAGAAAAATGTTAGAGCGCTTTGAACTGTAATTCAGAAGCTTCCAGCAAATGCACCTTAAACAAATTAATAAAATAATTCTTTTTTTGCTTTTAAACACACTAAACCTG
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TTATTAATATTTTAGTTGGATTTTGTCTTTAGCAGAGTAGAAATCTTCCATTTTAGTTCGGACCAAAAGGAGTATTTATTTATTTTTGTAAGAAGTTTGTTTTTTTAAGTTTATACATAAATCTCTATTTTGTGTATATACCGAGATTTTTATTCCAGTTTGTATATATATTTGATTGACCGATAGT

>TRINITY_DN126658_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

AAGAAACATTCTTTTTAGACAAGgtatgtgaatcacatccttctgttttgctttgatgtccgtttattgcgcagagaaaaagcaagatgctctgcaacttgctttacttgcatttcaagttttcttcagctcttggggcttcatagattgagagttaagatggggtttatgtcagttgtgcttttttgggttgtgggtat
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GGCCGAGGCATTTGAGCTGGTGGGCAGGTTCTGCTACAATGGGATCGACGGTATTGAGATCACGTCCACCAACATATGCAAGCTTCGTTGCGTGGCTGAGTATCTGGAGATGACAGAAGAGATCCAGGAAGGGAACCTGGTTGGGCGCACTGAAGATTTTCTCAAGGGCTTGGCCTTCTGGAGTTGGCGGGAATTGATAA
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TTTGAAGATCTGTCGTCGTTGAGTATGTATCTTATGGAAAGAATGGTTAAAACCATGATTGCGCACAAAATGGATAACTGGGTTATCAGCAGATTTCTTTCGCACTACCTCAAGTCTGCCTTGCCCACGCTCGGCTACAGCTCCATTTCACCCAAGAAGAAATGTGGGAGGGATGAGCAGATTATGTACCGCTATACCCA
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CACCTCAGGGGATGGGTTGCCTCTATGATGTGGATCTTGTTCTCAGATATGTGCAGATTTTTCTCATGGATCAGGTGATGGTTTCTGTGCCTGAATCACCCACTGGTGCAGGAGAGCCCACTTCTGGCATTTGCTGCCAGAATCGGCTGAAGAGAGTGGGTAGCCTCATGGACAAGTATATTACAGAGGTTGCCCCGGAT
GTAAATCTCAAGCCCTCCAAATTTCAGGCGCTCCTTGAATCTTTGCCAGATGATGCCAGAGATTCTTGTGATGTGCTTTACAGAGCATTGGACATGTATCTTGAGGTACACCCAACATTGTCTGAAGAAGAAGAAATGGGACTTTGCAAATCAATCAATTACCAGAAGCTTTCCTTTGAAGCAAGCAAACACGTTGCAAA
AAATTCCCGATTTCCATCAAAAATAGCAATACAGGTCCTGTTGTTGCAACAAGCAAAGCTCAGAAGCACACTTAACAGTTATTATATGAAAAGTACAGATTCTTCTTCTTCCGATAGTGATGGCAGCATGCGTTTCGCCCACGAAGAAGTTACATGCAGCAGCCCAGTGATTTTGTACTCAAAAGACCTTGATTACAATT
CTGTGATTTGTGAGGAAAATCAAGAGTTGAAGGCAGACCTGCAGGGAATGCAGTGGAGATTGAAGGAGTTGGAGAAAGTCTGCAAAAAATTGCATTCTCAAATGTCAAGAATCGGTAATCTCAAACTTACAAACAGCAGCAGCCGTACCAACCATAGATTACCAAAGTTTTGTTCATGATGAGGCGTAAAAGAAATGCAA
TTCAATTTCAACATGAATGGATTCTTGTACCATAAATATAACATGTGGAAACTGTTGCATTGGTTGAACAATGTATATTTGACAAAATGATTTTTTAACATCCTCTTCTGATCCTCTACTCACTGGAGAGATACAACTGGCTTCAGAATGCTAATGCAAACCTGGTACCTCTGATCAATATCTCAATGCCCAACTGATGG
TTTCCGTTTCTTACATATTGACATGTTAGTTAACCAAAGCTTGTTGCTGATGCAGAAAATAACACAAGGAAAACTAACCTCGGGAACCGAGGAAGGGAAGGTTGGGAATGTTGAAAAGGATTATACGCATAATTATTTCATTGTATATCTATTAAGGAAGGGAAAGCTTGGGTTTAAAGGAAAGAAAAATGTTAGAGCGC
TTTGAACTGTAATTCAGAAGCTTCCAGCAAATGCACCTTAAACAAATTAATAAAATAATTCTTTTTTTGCTTTTAAACACACTAAACCTGTTCACGGCTCTCCTTTCTGAGAAGTTTTAAGAGAAATTGGACAATATTTGGAGAGAAATGGAGAGGAACCTAAATAAAAAAGTATAAATCTTAATTATTAGCATAGATTT
ATTGGCTTCAGAAAACGAGAGAGGTGTAAACCTGATCCGGGCACTGTTTAAAATGATGAGGGTTTAAAATAGATTTAGTCTAATATATTTTTATTAATATTTTAGTTGGATTTTGTCTTTAGCAGAGTAGAAATCTTCCATTTTAGTTCGGACCAAAAGGAGTATTTATTTATTTTTGTAAGAAGTTTGTTTTTTTAAGT
TTATACATAAATCTCTATTTTGTGTATATACCGAGATTTTTATTCCAGTTTGTATATATATTTGATTGACCGATAGT