sp|O48916|FAH1_ARATH ----> Dihydroceramide fatty acyl 2-hydroxylase FAH1

Intron 1 GTAAAGAACT ... GTTGCAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	22.81	44	2	13
A2	20.75	42	0	11
A3	31.96	66	0	31
A4	23.26	33	0	10
A5	4.17	23	0	1
A6	22.55	340	0	99
A7	24.66	391	1	128
A8	22.55	237	0	69
A9	23.24	294	0	89
A10	23.65	326	0	101

>TRINITY_DN44713_c0_g1_i6 from sample A8 / Example spliced isoform

ATTCCCACCTCAGCTAGGCCAAGCTGTCATATCTCAAAGGCTACACCTAGAATTCAAAGTAACGAAGTTTACTCGTTTCTGCTCTAAATAATATCCCGTATATAAACTACACCCACGCACTATGAGTGCATGATTGTTGATTCGCAAGGTCGACTCAAGGTCTCAGTTCGTCTCAAGCTCTCAGATCCTTGGCGAACATG
TTTAGGGTTTGATCCTATAAAACAAATCCAGGGAAGGAAAGGTTTGAGGCACAAAACAAATCCAGGGACGGGAAGGTTTGAGGCACAAAACAAATCCAGGGAAGGGAAGGGAAGGATTGAGGCTCCACCACTGCCTTGAACAATTCATTGCTTGCCATAAGCATAAGCAGAGTGTGCTAACATTGGAGTTAAGAATGGTT
GTCAAAGCTTTCTCTGTGGACCTGAACCAGCCTCTTGTTTTTCAGGTTGGCCATTTAGGAGATGCTTATCAGGAATGGGTGCATCAGCCAATTGTCAGTAGGGAAGGTCCTCGTTTTTTCAAAAGTGAATTCTGGGAGTTCCTCACCCGCACTGCATGGTGGGTTATACCTCTAGTATGGTTACCTGTTGTTTCTTGGTC
TATATGGACGGCAATTCAAAGAGGTTTGTCACCTACCAAGGCAGCTTATGTGGTGCTAATCGGAATCTTAATCTGGTCATTAATGGAATATAGCCTGCATCGATTTCTTTTTCATATCAAGACAAGTAGTTACTGGGGAAATACTTTGCATTATCTGCTACATGGATGCCATCATAAGCATCCAATGGATGGGTATAGAC
TTGTTTTCCCACCTGCCGCAACAGCAATACTATGTATACCGTTTTGGTCCCTGGTGAAACTGCTATCGCCTTACACTGTTGCTCCTGCTGTTTTTGGTGGAGGCATGCTTGGATATGTAATGTATGATGTTACCCATTACTATTTACATCATGGACGGCCTTCGCAAACAGTGGCACACAATCTGAAGAAATATCATTTG
AACCACCATTTTAGAAATCAGACAAGTGGGTTTGGAATTACTTCATCTCTATGGGACTGTGTATTCGGTACCCTGCCTCCCAAAAAGGTGTAAGGAAACAATGGTGACTTTTCCTGTTAGTCACTTTTGGCAACCAATCATGTAATGTAAAGTCAGTGGGAAAAAATACTAAAGTCAGTGGGAAAAAATACTTCTTTCTC
ATCAGTTATTTTGAAGTCAAAGGAAGTATTGGTTCATTTCGGCAAGATTAAGCTAGAGATTGCTTCTTGGTTTGTCAAATTCGATTCCAAGTTCGAGGCCAAATTTGTTTTGTCCAGTTGCGCATCAATTCTTGTCAGCGGTTTATTACACGAACTTCTCTGCGGGGGGGAAACTGTTGGCTGATTTTCTGACATTCATT
TTCTTACCAGACTATTGTCTGCAGAACCTAGTCTTGTTTTGCGACTTAGTAGTACTAGTGTATACCATAATTAACATAAATTTCTATCGATTCTTAATTTATTCTGGGTTTGCTTAGTTTTCTTTTGCCTAATACCATCATGATTTTTATTTTGGGCTGGGGGTTAAAATGTAACTCCGTGTTTGGGTTTATTACGTGTT
TACATTGACCTCGGGCCCAAATGTAACTCCATGTCTGTGTTTTGATGTGTTCACATTCAATTAGAACATCATGGAGGGACAAACTAAAATAATAAAATACAATATTTCTATTCACTTGTATGTCTGGTATGTTTGGAAAACATTTTTGGGTTTGTGGTTGTTATTTATGTGATATCCAT

>TRINITY_DN44713_c0_g1_i2 from sample A8 / Example unspliced isoform:

TTTTCAAAAGTGAATTCTGGGAGgtaaagaacttcctatgtttgcattatggtcaaagttacagtaaaatgcattggccttcccagatggcagttttgctgatttaatatgccatgtatattgttcacttcactaatttattggctctatgttgcaacagTTCCTCACCCGCACTGCATGGTGGGTTATACCTCTAGTAT
GGTTACCTGTTGTTTCTTGGTCTATATGGACGGCAATTCAAAGAGGTTTGTCACCTACCAAGGCAGCTTATGTGGTGCTAATCGGAATCTTAATCTGGTCATTAATGGAATATAGCCTGCATCGATTTCTTTTTCATATCAAGACAAGTAGTTACTGGTATGTATGATAATTCTTTTTAAAATTTACATTATGGTTTTAT
TATGTTGTTTATTCTCTAGTGCTGGATATTGTGTTTAGAGGATGGACAAGTGCATTCCTCAGAGTTAGGATGACTTATTTATTTCATTGAATGTTTTGGGACACCACTGTGTGTAAAGCATTTGAAATCATTATTAAAAAAATACAGGGGAAATACTTTGCATTATCTGCTACATGGATGCCATCATAAGCATCCAATGG
ATGGGTATAGACTTGTTTTCCCACCTGCCGCAACAGCAATACTATGTATACCGGTACTTTTCAACTTTCTATTTGTCTTCCGAGTTACCTATTAGTTTATTTCAATGTCTTCTCTCTAGAGTAAACATGCACGTAATGCAAAATTAACATAAGAACGTAAAGAGCCTGACCTAAATCCATGAATAGATAGATATACAGAA
ATCCTTGCTGAATTATATTTACTATGAACAGTTTTGGTCCCTGGTGAAACTGCTATCGCCTTACACTGTTGCTCCTGCTGTTTTTGGTGGAGGCATGCTTGGATATGTAATGTATGATGTTACCCATTACTATTTACATCATGGACGGCCTTCGCAAACAGTGGCACACAATCTGAAGAAATATCATTTGAACCACCATT
TTAGAAATCAGACAAGTGGGTTTGGAATTACTTCATCTCTATGGGACTGTGTATTCGGTACCCTGCCTCCCAAAAAGGTGTAAGGAAACAATGGTGACTTTTCCTGTTAGTCACTTTTGGCAACCAATCATGTAATGTAAAGTCAGTGGGAAAAAATACTAAAGTCAGTGGGAAAAAATACTTCTTTCTCATCAGTTATT
TTGAAGTCAAAGGAAGTATTGGTTCATTTCGGCAAGATTAAGCTAGAGATTGCTTCTTGGTTTGTCAAATTCGATTCCAAGTTCGAGGCCAAATTTGTTTTGTCCAGTTGCGCATCAATTCTTGTCAGCGGTTTATTACACGAACTTCTCTGCGGGGGGGAAACTGTTGGCTGATTTTCTGACATTCATTTTCTTACCAG
ACTATTGTCTGCAGAACCTAGTCTTGTTTTGCGACTTAGTAGTACTAGTGTATACCATAATTAACATAAATTTCTATCGATTCTTAATTTATTCTGGGTTTGCTTAGTTTTCTTTTGCCTAATACCATCATGATTTTTATTTTGGGCTGGGGGTTAAAATGTAACTCCGTGTTTGGGTTTATTACGTGTTTACATTGACC
TCGGGCCCAAATGTAACTCCATGTCTGTGTTTTGATGTGTTCACATTCAATTAGAACATCATGGAGGGACAAACTAAAATAATAAAATACAATATTTCTATTCACTTGTATGTCTGGTATGTTTGGAAAACATTTTTGGGTTTGTGGTTGTTATTTATGTGATATCCAT

Intron 2 GTATGTATGA ... AAAAATACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	19.79	77	19	4
A2	28.13	69	27	1
A3	25.33	56	19	6
A4	26.79	41	15	2
A5	16.67	30	6	2
A6	20.59	405	105	8
A7	20.21	383	97	7
A8	23.13	304	91.5	9
A9	19.51	359	87	6
A10	25.1	276	92.5	3

>TRINITY_DN44713_c0_g1_i6 from sample A8 / Example spliced isoform

ATTCCCACCTCAGCTAGGCCAAGCTGTCATATCTCAAAGGCTACACCTAGAATTCAAAGTAACGAAGTTTACTCGTTTCTGCTCTAAATAATATCCCGTATATAAACTACACCCACGCACTATGAGTGCATGATTGTTGATTCGCAAGGTCGACTCAAGGTCTCAGTTCGTCTCAAGCTCTCAGATCCTTGGCGAACATG
TTTAGGGTTTGATCCTATAAAACAAATCCAGGGAAGGAAAGGTTTGAGGCACAAAACAAATCCAGGGACGGGAAGGTTTGAGGCACAAAACAAATCCAGGGAAGGGAAGGGAAGGATTGAGGCTCCACCACTGCCTTGAACAATTCATTGCTTGCCATAAGCATAAGCAGAGTGTGCTAACATTGGAGTTAAGAATGGTT
GTCAAAGCTTTCTCTGTGGACCTGAACCAGCCTCTTGTTTTTCAGGTTGGCCATTTAGGAGATGCTTATCAGGAATGGGTGCATCAGCCAATTGTCAGTAGGGAAGGTCCTCGTTTTTTCAAAAGTGAATTCTGGGAGTTCCTCACCCGCACTGCATGGTGGGTTATACCTCTAGTATGGTTACCTGTTGTTTCTTGGTC
TATATGGACGGCAATTCAAAGAGGTTTGTCACCTACCAAGGCAGCTTATGTGGTGCTAATCGGAATCTTAATCTGGTCATTAATGGAATATAGCCTGCATCGATTTCTTTTTCATATCAAGACAAGTAGTTACTGGGGAAATACTTTGCATTATCTGCTACATGGATGCCATCATAAGCATCCAATGGATGGGTATAGAC
TTGTTTTCCCACCTGCCGCAACAGCAATACTATGTATACCGTTTTGGTCCCTGGTGAAACTGCTATCGCCTTACACTGTTGCTCCTGCTGTTTTTGGTGGAGGCATGCTTGGATATGTAATGTATGATGTTACCCATTACTATTTACATCATGGACGGCCTTCGCAAACAGTGGCACACAATCTGAAGAAATATCATTTG
AACCACCATTTTAGAAATCAGACAAGTGGGTTTGGAATTACTTCATCTCTATGGGACTGTGTATTCGGTACCCTGCCTCCCAAAAAGGTGTAAGGAAACAATGGTGACTTTTCCTGTTAGTCACTTTTGGCAACCAATCATGTAATGTAAAGTCAGTGGGAAAAAATACTAAAGTCAGTGGGAAAAAATACTTCTTTCTC
ATCAGTTATTTTGAAGTCAAAGGAAGTATTGGTTCATTTCGGCAAGATTAAGCTAGAGATTGCTTCTTGGTTTGTCAAATTCGATTCCAAGTTCGAGGCCAAATTTGTTTTGTCCAGTTGCGCATCAATTCTTGTCAGCGGTTTATTACACGAACTTCTCTGCGGGGGGGAAACTGTTGGCTGATTTTCTGACATTCATT
TTCTTACCAGACTATTGTCTGCAGAACCTAGTCTTGTTTTGCGACTTAGTAGTACTAGTGTATACCATAATTAACATAAATTTCTATCGATTCTTAATTTATTCTGGGTTTGCTTAGTTTTCTTTTGCCTAATACCATCATGATTTTTATTTTGGGCTGGGGGTTAAAATGTAACTCCGTGTTTGGGTTTATTACGTGTT
TACATTGACCTCGGGCCCAAATGTAACTCCATGTCTGTGTTTTGATGTGTTCACATTCAATTAGAACATCATGGAGGGACAAACTAAAATAATAAAATACAATATTTCTATTCACTTGTATGTCTGGTATGTTTGGAAAACATTTTTGGGTTTGTGGTTGTTATTTATGTGATATCCAT

>TRINITY_DN44713_c0_g1_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:

ATTCCCACCTCAGCTAGGCCAAGCTGTCATATCTCAAAGGCTACACCTAGAATTCAAAGTAACGAAGTTTACTCGTTTCTGCTCTAAATAATATCCCGTATATAAACTACACCCACGCACTATGAGTGCATGATTGTTGATTCGCAAGGTCGACTCAAGGTCTCAGTTCGTCTCAAGCTCTCAGATCCTTGGCGAACATG
TTTAGGGTTTGATCCTATAAAACAAATCCAGGGAAGGAAAGGTTTGAGGCACAAAACAAATCCAGGGACGGGAAGGTTTGAGGCACAAAACAAATCCAGGGAAGGGAAGGGAAGGATTGAGGCTCCACCACTGCCTTGAACAATTCATTGCTTGCCATAAGCATAAGCAGAGTGTGCTAACATTGGAGTTAAGAATGGTT
GTCAAAGCTTTCTCTGTGGACCTGAACCAGCCTCTTGTTTTTCAGGTTGGCCATTTAGGAGATGCTTATCAGGAATGGGTGCATCAGCCAATTGTCAGTAGGGAAGGTCCTCGTTTTTTCAAAAGTGAATTCTGGGAGTTCCTCACCCGCACTGCATGGTGGGTTATACCTCTAGTATGGTTACCTGTTGTTTCTTGGTC
TATATGGACGGCAATTCAAAGAGGTTTGTCACCTACCAAGGCAGCTTATGTGGTGCTAATCGGAATCTTAATCTGGTCATTAATGGAATATAGCCTGCATCGATTTCTTTTTCATATCAAGACAAGTAGTTACTGgtatgtatgataattctttttaaaatttacattatggttttattatgttgtttattctctagtgc
tggatattgtgtttagaggatggacaagtgcattcctcagagttaggatgacttatttatttcattgaatgttttgggacaccactgtgtgtaaagcatttgaaatcattattaaaaaaatacagGGGAAATACTTTGCATTATCTGCTACATGGATGCCATCATAAGCATCCAATGGATGGGTATAGACTTGTTTTCCC
ACCTGCCGCAACAGCAATACTATGTATACCGGTACTTTTCAACTTTCTATTTGTCTTCCGAGTTACCTATTAGTTTATTTCAATGTCTTCTCTCTAGAGTAAACATGCACGTAATGCAAAATTAACATAAGAACGTAAAGAGCCTGACCTAAATCCATGAATAGATAGATATACAGAAATCCTTGCTGAATTATATTTAC
TATGAACAGTTTTGGTCCCTGGTGAAACTGCTATCGCCTTACACTGTTGCTCCTGCTGTTTTTGGTGGAGGCATGCTTGGATATGTAATGTATGATGTTACCCATTACTATTTACATCATGGACGGCCTTCGCAAACAGTGGCACACAATCTGAAGAAATATCATTTGAACCACCATTTTAGAAATCAGACAAGTGGGTT
TGGAATTACTTCATCTCTATGGGACTGTGTATTCGGTACCCTGCCTCCCAAAAAGGTGTAAGGAAACAATGGTGACTTTTCCTGTTAGTCACTTTTGGCAACCAATCATGTAATGTAAAGTCAGTGGGAAAAAATACTAAAGTCAGTGGGAAAAAATACTTCTTTCTCATCAGTTATTTTGAAGTCAAAGGAAGTATTGG
TTCATTTCGGCAAGATTAAGCTAGAGATTGCTTCTTGGTTTGTCAAATTCGATTCCAAGTTCGAGGCCAAATTTGTTTTGTCCAGTTGCGCATCAATTCTTGTCAGCGGTTTATTACACGAACTTCTCTGCGGGGGGGAAACTGTTGGCTGATTTTCTGACATTCATTTTCTTACCAGACTATTGTCTGCAGAACCTAGT
CTTGTTTTGCGACTTAGTAGTACTAGTGTATACCATAATTAACATAAATTTCTATCGATTCTTAATTTATTCTGGGTTTGCTTAGTTTTCTTTTGCCTAATACCATCATGATTTTTATTTTGGGCTGGGGGTTAAAATGTAACTCCGTGTTTGGGTTTATTACGTGTTTACATTGACCTCGGGCCCAAATGTAACTCCAT
GTCTGTGTTTTGATGTGTTCACATTCAATTAGAACATCATGGAGGGACAAACTAAAATAATAAAATACAATATTTCTATTCACTTGTATGTCTGGTATGTTTGGAAAACATTTTTGGGTTTGTGGTTGTTATTTATGTGATATCCAT

Intron 3 GTACTTTTCA ... CTATGAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	5.88	48	8.2	3
A2	11.63	38	0	5
A3	20	56	2.4	14
A4	10.81	33	1.6	4
A5	6.67	14	0	1
A6	21.86	243	5.6	68
A7	20.97	245	10.6	65
A8	24.49	259	5.6	84
A9	19.53	272	2.4	66
A10	20.96	230	10.2	61

>TRINITY_DN38680_c0_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoform

GAATATTAAAAGTACCGACCTCGACCTGTAGCTAGGCTCCAGCTATGTTTTAAATTCCCACCTCAGCTAGGCCAAGCTGTCATATCTCAAAGGCTACACCTAGAATTCAAAGTAACGAAGTTTACTCGTTTCTGCTCTAAATAATATCCCGTATATAAACTACACCCACGCACTATGAGTGCATGATTGTTGATTCGCAA
GGTCGACTCAAGGTCTCAGTTCGTCTCAAGCTCTCAGATCCTTGGCGAACATGTTTAGGGTTTGATCCTATAAAACAAATCCAGGGAAGGAAAGGTTTGAGGCACAAAACAAATCCAGGGAAGGGAAGGTTTGAGGCACAAAACAAATCCAGGGAAGGGAAGGGAAGGATTGAGGCTCCACCACTGCCTTGAACAATTCA
TTGCTTGCCATAAGCATAAGCAGAGTGTGCTAACATTGGAGTTAAGAATGGTTGTCAAAGCTTTCTCTGTGGACCTGAACCAGCCTCTTGTTTTTCAGGTTGGCCATTTAGGAGATGCTTATCAGGAATGGGTGCATCAGCCAATTGTCAGTAGGGAAGGTCCTCGTTTTTTCAAAAGTGAATTCTGGGAGTTCCTCACC
CGCACTGCATGGTGGGTTATACCTCTAGTATGGTTACCTGTTGTTTCTTGGTCTATATGGACGGCAATTCAAAGAGGTTTGTCACCTACCAAGGCAGCTTATGTGGTGCTAATCGGAATCTTAATCTGGTCATTAATGGAATATAGCCTGCATCGATTTCTTTTTCATATCAAGACAAGTAGTTACTGGGGAAATACTTT
GCATTATCTGCTACATGGATGCCATCATAAGCATCCAATGGATGGGTATAGACTTGTTTTCCCACCTGCCGCAACAGCAATACTATGTATACCGTTTTGGTCCCTGGTGAAACTGCTATCGCCTTACACTGTTGCTCCTGCTGTTTTTGGTGGAGGCATGCTTGGATATGTAATGTATGATGTTACCCATTACTATTTAC
ATCATGGACGGCCTTCGCAAACAGTGGCACACAATCTGAAGAAATATCATTTGAACCACCATTTTAGAAATCAGACAAGTGGGTTTGGAATTACTTCATCTCTATGGGACTGTGTATTCGGTACCCTGCCTCCCAAAAAGGTGTAAGGAAACAATGGTGACTTTTCCTGTTAGTCACTTTTGGCAACCAATCATGTAATG
TAAAGTCAGTGGGAAAAAATACTAAAGTCAGTGGGAAAAAATACTTCTTTCTCATCAGTTATTTTGAAGTCAAAGGAAGTATTGGTTCATTTCGGCAAGATTAAGCTAGAGATTGCTTCTTGGTTTGTCAAATTCGATTCCAAGTTCGAGGCCAAATTTGTTTTGTCCAGTTGCGCATCAATTCTTGTCAGCGGTTTATT
ACACGAACTTCTCTGCGGGGGGGAAACTGTTGGCTGATTTTCTGACATTCATTTTCTTACCAGACTATTGTCTGCAGAACCTAGTCTTGTTTTGCGACTTAGTAGTACTAGTGTATACCATAATTAACATAAATTTCTATCGATTCTTAATTTATTCTGGGTTTGCTTAGTTTTCTTTTGCCTAATACCATCATGATTTT
TATTTTGGGCTGGGGGTTAAAATGTAACTCCGTGTTTGGGTTTATTACGTGTTTACATTGACCTCGGGCCCAAATGTAACTCCATGTCTGTGTTTTGATGTGTTCACATTCAATTAGAACATCATGGAGGGACAAACTAAAATAATAAAATACAATACTTCTATTCACTTGTATGTCTGTTATGTTTGGAAAACATTTTT
GGGTTTGT

>TRINITY_DN38680_c0_g1_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:

GTTAGGATGACTTATTTATTTCATTGAATGTTTTGGGACACCACTGTGTGTAAAGCATTTGAAATCATTATTAAAAAAATACAGGGGAAATACTTTGCATTATCTGCTACATGGATGCCATCATAAGCATCCAATGGATGGGTATAGACTTGTTTTCCCACCTGCCGCAACAGCAATACTATGTATACCGgtacttttca
actttctatttgtcttccgagttacctattagtttatttcaatgtcttctctctagagtaaacatgcacgtaatgcaaaattaacataagaacgtaaagagcctgacctaaatccatgaatagatagatatacagaaatccttgctgaattatatttactatgaacagTTTTGGTCCCTGGTGAAACTGCTATCGCCTTA
CACTGTTGCTCCTGCTGTTTTTGGTGGAGGCATGCTTGGATATGTAATGTATGATGTTACCCATTACTATTTACATCATGGACGGCCTTCGCAAACAGTGGCACACAATCTGAAGAAATATCATTTGAACCACCATTTTAGAAATCAGACAAGTGGGTTTGGAATTACTTCATCTCTATGGGACTGTGTATTCGGTACCC
TGCCTCCCAAAAAGGTGTAAGGAAACAATGGTGACTTTTCCTGTTAGTCACTTTTGGCAACCAATCATGTAATGTAAAGTCAGTGGGAAAAAATACTAAAGTCAGTGGGAAAAAATACTTCTTTCTCATCAGTTATTTTGAAGTCAAAGGAAGTATTGGTTCATTTCGGCAAGATTAAGCTAGAGATTGCTTCTTGGTTT
GTCAAATTCGATTCCAAGTTCGAGGCCAAATTTGTTTTGTCCAGTTGCGCATCAATTCTTGTCAGCGGTTTATTACACGAACTTCTCTGCGGGGGGGAAACTGTTGGCTGATTTTCTGACATTCATTTTCTTACCAGACTATTGTCTGCAGAACCTAGTCTTGTTTTGCGACTTAGTAGTACTAGTGTATACCATAATTA
ACATAAATTTCTATCGATTCTTAATTTATTCTGGGTTTGCTTAGTTTTCTTTTGCCTAATACCATCATGATTTTTATTTTGGGCTGGGGGTTAAAATGTAACTCCGTGTTTGGGTTTATTACGTGTTTACATTGACCTCGGGCCCAAATGTAACTCCATGTCTGTGTTTTGATGTGTTCACATTCAATTAGAACATCATG
GAGGGACAAACTAAAATAATAAAATACAATACTTCTATTCACTTGTATGTCTGTTATGTTTGGAAAACATTTTTGGGTTTGT

Intron 4 GTATCAGTTA ... TTCTCTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	16.67	80	0	16
A2	24.36	59	0	19
A3	23.62	55	0	17
A4	17.86	46	1	10
A5	26.92	38	0	14
A6	12.18	497.5	2	69
A7	16.55	408.5	0	81
A8	20	428	0	107
A9	14.79	380.5	2	66
A10	14.25	331	0	55

>TRINITY_DN98457_c0_g1_i1 from sample A4 / Example spliced isoform

CCCGTATATAAACTACACCCACGCACTATGAGTGCATGATTGTTGATTCGCAAGGTCGACTCAAGGTCTCAGTTCGTCTCAAGCTCTCAGATCCTTGGCGAACATGTTTAGGGTTTGATCCTATAAAACAAATCCAGGGAAGGAAAGGTTTGAGGCACAAAACAAATCCAGGGAAGGGAAGGTTTGAGGCACAAAACAAA
TCCAGGGAAGGGAAGGGAAGGATTGAGGCTCCACCACTGCCTTGAACAATTCATTGCTTGCCATAAGCATAAGCAGAGTGTGCTAACATTGGAGTTAAGAATGGTTGTCAAAGCTTTCTCTGTGGACCTGAACCAGCCTCTTGTTTTTCAGGTTGGCCATTTAGGAGATGCTTATCAGGAATGGGTGCATCAGCCAATTG
TCAGTAGGGAAGGTCCTCGTTTTTTCAAAAGTGAATTCTGGGAGTTCCTCACCCGCACTGCATGGTGGGTTATACCTCTAGTATGGTTACCTGTTGTTTCTTGGTCTATATGGACGGCAATTCAAAGAGGTTTGTCACCTACCAAGGCAGCTTATGTGGTGCTAATCGGAATCTTAATCTGGTCATTAATGGAATATAGC
CTGCATCGATTTCTTTTTCATATCAAGACAAGTAGTTACTGGGGAAATACTTTGCATTATCTGCTACATGGATGCCATCATAAGCATCCAATGGATGGGTATAGACTTGTTTTCCCACCTGCCGCAACAGCAATACTATGTATACCGTTTTGGTCCCTGGTGAAACTGCTATCGCCTTACACTGTTGCTCCTGCTGTTTT
TGGTGGAGGCATGCTTGGATATGTAATGTATGATGTTACCCATTACTATTTACATCATGGACGGCCTTCGCAAACAGTGGCACACAATCTGAAGAAATATCATTTGAACCACCATTTTAGAAATCAGACAAGTGGGTTTGGAATTACTTCATCTCTATGGGACTGTGTATTCGGTACCCTGCCTCCCAAAAAGGTGTAAG
GAAACAATGGTGACTTTTCCTGTTAGTCACTTTTGGCAACCAATCATGTAATGTAAAGTCAGTGGGAAAAAATACTAAAGTCAGTGGGAAAAAATACTTCTTTCTCATCAGTTATTTTGAAGTCAAAGGAAGTATTGGTTCATTTCGGCAAGATTAAGCTAGAGATTGCTTCTTGGTTTGTCAAATTCGATTCCAAGTTC
GAGGCCAAATTTGTTTTGTCCAGTTGCGCATCAATTCTTGTCAGCGGTTTATTACACGAACTTCTCTGCGGGGGGGAAACTGTTGGCTGATTTTCTGACATTCATTTTCTTACCAGACTATTGTCTGCAGAACCTAGTCTTGTTTTGCGACTTAGTAGTACTAGTGTATACCATAATTAACATAAATTTCTATCGATTCT
TAATTTATTCTGGGTTTGCTTAGTTTTCTTTTGCCTAATACCATCATGATTTTTATTTTGGGCTGGGGGTTAAAATGTAACTCCGTGTTTGGGTTTATTACGTGTTTACATTGACCTCGGGCCCAAATGTAACTCCATGTCTGTGTTTTGATGTGTTCACATTCAATTAGAACATCATGGAGGGACAAACTAAAATAATA
AAATACAATATTTC

>TRINITY_DN98457_c0_g1_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:

AAACAGTGGCACACAATCTGAAGgtatcagttatctcagcatcttttccatggatcaaatactttcgtggggaaaatagcttataatcttttgcctcggatttagttggatttgttttgtttcttctaggttgatagtaacttatctgggtatgtttcgttctctgcagAAATATCATTTGAACCACCATTTTAGAAATC
AGACAAGTGGGTTTGGAATTACTTCATCTCTATGGGACTGTGTATTCGGTACCCTGCCTCCCAAAAAGGTGTAAGGAAACAATGGTGACTTTTCCTGTTAGTCACTTTTGGCAACCAATCATGTAATGTAAAGTCAGTGGGAAAAAATACTAAAGTCAGTGGGAAAAAATACTTCTTTCTCATCAGTTATTTTGAAGTCA
AAGGAAGTATTGGTTCATTTCGGCAAGATTAAGCTAGAGATTGCTTCTTGGTTTGTCAAATTCGATTCCAAGTTCGAGGCCAAATTTGTTTTGTCCAGTTGCGCATCAATTCTTGTCAGCGGTTTATTACACGAACTTCTCTGCGGGGGGGAAACTGTTGGCTGATTTTCTGACATTCATTTTCTTACCAGACTATTGTC
TGCAGAACCTAGTCTTGTTTTGCGACTTAGTAGTACTAGTGTATACCATAATTAACATAAATTTCTATCGATTCTTAATTTATTCTGGGTTTGCTTAGTTTTCTTTTGCCTAATACCATCATGATTTTTATTTTGGGCTGGGGGTTAAAATGTAACTCCGTGTTTGGGTTTATTACGTGTTTACATTGACCTCGGGCCCA
AATGTAACTCCATGTCTGTGTTTTGATGTGTTCACATTCAATTAGAACATCATGGAGGGACAAACTAAAATAATAAAATACAATATTTC