NA ----> NA

Intron 1 GTAAGACTGC ... CATATTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	29.89	86.6	13	36
A2	8.53	69.4	1	6
A3	20.63	78.9	6	20
A4	11.68	64.7	7	8
A5	33.46	28.2	0	14
A6	18.61	297.7	0	66
A7	19.43	319	2	75
A8	16.58	303.5	2	59
A9	16.23	259.7	2	49
A10	14.31	248.1	0	40

>TRINITY_DN114105_c0_g2_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

CCACAAGGATGCCCTGCCAGCAACTGGTGGGACGAGGAATTGAGCTTGTATTTTGGCCGATTTAATGTATAAATGGCACCATTTTATGCATTATATGTTTCCATTTTCTGCATATTCATGGCTGCTGGTTAACGGTATTGTTAGTCAGCGGAGTGGAGATGCAGTAACTGTTCGGAGATCCCGCTTGAAAAACTATCTGA
AGAATCCTGTTGTATGGTTTCAGTAATAGTTTCATTGCATGCATAGTTAATTGTGGCAGAAAACAATGCCGCGCTGCTCAAATTTGCAGCAAATTACAGTACCAAAGTGCTGCCAGCAACGCAGGAGTGGGAGGGTAAAACGGCGTAAGCAGTATGCCGGCTTTAAATGGATTAATTTCAGCTGTGATAGGCCTTGGCAA
GGTGGCATGTCTCACTTCTCAAGTTGCAAGGACGATCAACCTGGCACTACTGGAAGAAGAATGGATCTGATTGATGGGACTCTGATTTCAGGACATTCCAGGAGAGGCCGTGATAATTTCCAGATTGAGAATTCACTGTCTACAGATACAGAACATGAAACAAAATTTTTGAAAAGATTACAGAGGCCTATTACTGAGTT
AGAATCATTAGCTCAGAGTACAATTTCTGATTCCACAGAAAATGGTGGATGGGTGGATCCTTTGCGAGACCTATCTGATTTTGATGAAGGCTTTGAGGAGAAAAACTGTAATCTCCAGATGGATTTTAAAGAGGCTTTGAAAGAGGCTTTAATTAAAAGAAGTTGTCTAAATCATCATCAGCATTGGGATAGTAGATATC
TAAATTGTGTTCCATCTCAGCTAAATCCATCTGCTGATGAGGGAGCATGGAAAGCATCTAGTTCAAGCAGAGAAAAAGGTGATGAAACTCAACAACGCAGGGGTAAAAGAAAGCGTAAACCAAAAGTTCATTTTGATGAGGAGGTGCCATTTTCCATCAGGTCTCTAAGGAGGATGCGTCGATTGAGAATCATGCGCCAT
CTCGGTCTTGTTGCACCACCTGGTTCTCCTTTCATTCTTAATCCTTCTGTAAGAACTACTGCTTAAATACATGGTAGATTTTTCTGTTTTTTATTTTAGGCATGATATTTGTAGTTTGGTCCTATGCATACCTTTTTTTGTGATAAAGACATGTAAATGCATAAACAAGTACTCAATGAAGGTGAGAAAGGAATCTCATA
AAATATTCATGTAACTTTTTTTTTTGATATCAAATAAAATATCATATTCGGGGTTTCGCTAGAAGTCTTATGATTTATCACAGGTAATGGTTTTTCCAGATACCTTTAGCTGTGGCATTTCCGTTCTGTCTGTTTAACTCTTATAAGGATGCGCAGAGACCAATATGCTGTTATTTCTATAAACAACTTTCCTCTGGTTT
TAGAGGAGTCAACTTTCTTG

>TRINITY_DN114105_c0_g2_i10 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CTAATCTTCAGCCCAAAACTTTCCAATGATTCTTTGTTGAATGCATTCCTATTTGCTGTTCTTTAAGTCTCTTCTATGGGCATTTCTTGTAGCAAGTCTTACTATTGGCCAAAGCATGTACATAATAGAGTCATTCTCACCAGATTATTGTATAGTATTTAGCTATAACTTTCACATCCTTCACAGATTAGAATGAGATT
AGTTGTCGAAAACAGCATCTTTAACAACAGATTTCATATGGACTTTTATATGCTTATGTGGGTAATATCACTTGTTTGTATTCCAGCCATTTTGCTTTTCTCACTGATTCTGTAGCTTAGCAGTATTTTCCTATTATGAGGTCTACTGTGAATTCCAATATAATTGTCTTAATCACCACCTGTTTCCGACTTTTGACTGC
AGTGGATGGGTGGATCCTTTGCGAGACCTATCTGATTTTGATGAAgtaagactgcaattatttgaatctgttgtctttttggagctatgagtgaattgcattttgtaaatcacatacactataatctggaagctatgaaaacctttgatttaagcatgttcttttaaatactcccactttcccttaatcatattgcagGG
CTTTGAGGAGAAAAACTGTAATCTCCAGATGGATTTTAAAGAGGCTTTGAAAGAGGCTTTAATTAAAAGAAGTTGTCTAAATCATCATCAGCATTGGGATAGTAGATATCTAAATTGTGTTCCATCTCAGCTAAATCCATCTGCTGATGAGGGAGCATGGAAAGCATCTAGTTCAAGCAGAGAAAAAGGTGATGAAACTC
AACAACGCAGGGGTAAAAGAAAGCGTAAACCAAAAGTTCATTTTGATGAGGAGGTGCCATTTTCCATCAGGTCTCTAAGGAGGATGCGTCGATTGAGAATCATGCGCCATCTCGGTCTTGTTGCACCACCTGGTTCTCCTTTCATTCTTAATCCTTCTGTAAGAACTACTGCTTAAATACATGGTAGATTTTTCTGTTTT
TTATTTTAGGCATGATATTTGTAGTTTGGTCCTATGCATACCTTTTTTTGTGATAAAGACATGTAAATGCATAAACAAGTACTCAATGAAGGTGAGAAAGGAATCTCATAAAATATTCATGTAACTTTTTTTTTTGATATCAAATAAAATATCATATTCGGGGTTTCGCTAGAAGTCTTATGATTTATCACAGGTAATGG
TTTTTCCAGATACCTTTAGCTGTGGCATTTCCGTTCTGTCTGTTTAACTCTTATAAGGATGCGCAGAGACCAATATGCTGTTATTTCTATAAACAACTTTCCTCTGGTTTTAGAGGAGTCAACTTTCTTG

Intron 2 GTGATGAAAC ... TCAAATTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	93.1	2	0	27
A2	100	0	0	7
A3	100	0	1	16
A4	55.56	4	3	5
A5	100	0	2	14
A6	99.07	1	7	107
A7	88.99	12	5	97
A8	91.19	14	9	145
A9	92.91	9	4	118
A10	90.67	7	4	68

>TRINITY_DN38939_c0_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoform

AGGATGCCCTGCCAGCAACTGGTGGGACGAGGAATTGAGCTTGTATTTTGGCCGATTTAATGTATAAATGGCACCATTTTATGCATTATATGTTTCCATTTTCTGCATATTCATGGCTGCTGGTTAACGGTATTGTTAGTCAGCGGAGTGGAGATGCAGTAACTGTTCGGAGATCCCGCTTGAAAAACTATCTGAAGAAT
CCTGTTGTATGGTTTCAGTAATAGTTTCATTGCATGCATAGTTAATTGTGGCAGAAAACAATGCCGCGCTGCTCAAATTTGCAGCAAATTACAGTACCAAAGTGCTGCCAGCAACGCAGGAGTGGGAGGGTAAAACGGCGTAAGCAGTATGCCGGCTTTAAATGGATTAATTTCAGCTGTGATAGGCCTTGGCAAGGTGG
CATGTCTCACTTCTCAAGTTGCAAGGACGATCAACCTGGCACTACTGGAAGAAGAATGGATCTGATTGATGGGACTCTGATTTCAGGACATTCCAGGAGAGGCCGTGATAATTTCCAGATTGAGAATTCACTGTCTACAGATACAGAACATGAAACAAAATTTTTGAAAAGATTACAGAGGCCTATTACTGAGTTAGAAT
CATTAGCTCAGAGTACAATTTCTGATTCCACAGAAAATGGTGGATGGGTGGATCCTTTGCGAGACCTATCTGATTTTGATGAAGGCTTTGAGGAGAAAAACTGTAATCTCCAGATGGATTTTAAAGAGGCTTTGAAAGAGGCTTTAATTAAAAGAAGTTGTCTAAATCATCATCAGCATTGGGATAGTAGATATCTAAAT
TGTGTTCCATCTCAGCTAAATCCATCTGCTGGTGTTAATCAAATTTTCAATGAAAGAGACAAAATTTTGTGCTTCATTTTTCATTTGACATTTACGAGACAGATGAGGGAGCATGGAAAGCATCTAGTTCAAGCAGAGAAAAAGGAGGAGGTGCCATTTTCCATC

>TRINITY_DN38939_c0_g1_i9 from sample A6 / Example unspliced isoform:

ATGAGGGAGCATGGAAAGCATCTAGTTCAAGCAGAGAAAAAGgtgatgaaactcaacaacgcaggggtaaaagaaagcgtaaaccaaaagttcattttgatgtaagctataaattttattttgtctcaagtaggtcttacataaaaatatgttattgctgcatgtttacttggttttatatggaatctttactttggaac
atgatgtctgattccttcttcctttcaaatttagGAGGAGGTGCCATTTTCCATCAGGTCTCTAAGGAGGATGCGTCGATTGAGAATCATGCGCCATCTCGGTCTTGTTGCACCACCTGGTTCTCCTTTCATTCTTAATCCTTCTGTAAGAACTACTGCTTAAATACATGGTAGATTTTTCTGTTTTTTATTTTAGGCAT
GATATTTGTAGTTTGGTCCTATGCATACCTTTTTTTGTGATAAAGACATGTAAATGCATAAACAAGTACTCAATGAAGGTGAGAAAGGAATCTCATAAAATATTCATGTAACTTTTTTTTTTGATATCAAATAAAATATCATATTCGGGGTTTCGCTAGAAGTCTTATGATTTATCACAGGTAATGGTTTTTCCAGATAC
CTTTAGCTGTGGCATTTCCGTTCTGTCTGTTTAACTCTTATAAGGATGCGCAGAGACCAATATGCTGTTATTTCTATAAACAACTTTCCTCTGGTTTTAGAGGAGTCAACTTTCTTGATTTGTGGGATAATTGCTTTTATTATTTCTCAGATAAAATGGATCTGACAGGATCTGATAATTCTCACATTAGTACCATAACC
CTGTTTTTGAATGTTTCGGTGTGAGCATAATGATGTTGATTTTTTATCGGTGTGCATACCTTACAGATTGTGACATCTTTCAAAACATTGGTTAGAACTGACAACTGTTTATAGGGATGCTCCTTTTTTATCAGATACACTCTCAAGTAGAGGTGGTTCTATTATTTTCTATAGGAGTTACTTGGTTTATTATTTGTGTG
ATCTGAATGCACAACATTGGTAGTGAACTATAATTGAGCTGTATTATGAAGTCTTTTTTCCTTTTAACCGTAACTGGTTACTAATATCCAAGATTGTTCACTGACATGCCATCTTGTTAGTTCCCTATAGTATACCATTTTATTTAATTGATGTAGCATGGGTA

Intron 3 GTGTTAATCA ... TACGAGACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	22.81	85.1	24.8	15.6
A2	22.57	83.1	24	5.3
A3	20.98	94.4	24.7	14.3
A4	32.71	57.6	27.9	10.9
A5	21.31	26.6	7	9.8
A6	21.22	420.2	111	54.1
A7	25.34	475.2	158	70.7
A8	23.65	456.6	138.9	88.2
A9	24.39	427.6	135.7	68.7
A10	32.1	262	122.9	35.2

>TRINITY_DN114105_c0_g2_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

CCACAAGGATGCCCTGCCAGCAACTGGTGGGACGAGGAATTGAGCTTGTATTTTGGCCGATTTAATGTATAAATGGCACCATTTTATGCATTATATGTTTCCATTTTCTGCATATTCATGGCTGCTGGTTAACGGTATTGTTAGTCAGCGGAGTGGAGATGCAGTAACTGTTCGGAGATCCCGCTTGAAAAACTATCTGA
AGAATCCTGTTGTATGGTTTCAGTAATAGTTTCATTGCATGCATAGTTAATTGTGGCAGAAAACAATGCCGCGCTGCTCAAATTTGCAGCAAATTACAGTACCAAAGTGCTGCCAGCAACGCAGGAGTGGGAGGGTAAAACGGCGTAAGCAGTATGCCGGCTTTAAATGGATTAATTTCAGCTGTGATAGGCCTTGGCAA
GGTGGCATGTCTCACTTCTCAAGTTGCAAGGACGATCAACCTGGCACTACTGGAAGAAGAATGGATCTGATTGATGGGACTCTGATTTCAGGACATTCCAGGAGAGGCCGTGATAATTTCCAGATTGAGAATTCACTGTCTACAGATACAGAACATGAAACAAAATTTTTGAAAAGATTACAGAGGCCTATTACTGAGTT
AGAATCATTAGCTCAGAGTACAATTTCTGATTCCACAGAAAATGGTGGATGGGTGGATCCTTTGCGAGACCTATCTGATTTTGATGAAGGCTTTGAGGAGAAAAACTGTAATCTCCAGATGGATTTTAAAGAGGCTTTGAAAGAGGCTTTAATTAAAAGAAGTTGTCTAAATCATCATCAGCATTGGGATAGTAGATATC
TAAATTGTGTTCCATCTCAGCTAAATCCATCTGCTGATGAGGGAGCATGGAAAGCATCTAGTTCAAGCAGAGAAAAAGGTGATGAAACTCAACAACGCAGGGGTAAAAGAAAGCGTAAACCAAAAGTTCATTTTGATGAGGAGGTGCCATTTTCCATCAGGTCTCTAAGGAGGATGCGTCGATTGAGAATCATGCGCCAT
CTCGGTCTTGTTGCACCACCTGGTTCTCCTTTCATTCTTAATCCTTCTGTAAGAACTACTGCTTAAATACATGGTAGATTTTTCTGTTTTTTATTTTAGGCATGATATTTGTAGTTTGGTCCTATGCATACCTTTTTTTGTGATAAAGACATGTAAATGCATAAACAAGTACTCAATGAAGGTGAGAAAGGAATCTCATA
AAATATTCATGTAACTTTTTTTTTTGATATCAAATAAAATATCATATTCGGGGTTTCGCTAGAAGTCTTATGATTTATCACAGGTAATGGTTTTTCCAGATACCTTTAGCTGTGGCATTTCCGTTCTGTCTGTTTAACTCTTATAAGGATGCGCAGAGACCAATATGCTGTTATTTCTATAAACAACTTTCCTCTGGTTT
TAGAGGAGTCAACTTTCTTG

>TRINITY_DN114105_c0_g2_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CCACAAGGATGCCCTGCCAGCAACTGGTGGGACGAGGAATTGAGCTTGTATTTTGGCCGATTTAATGTATAAATGGCACCATTTTATGCATTATATGTTTCCATTTTCTGCATATTCATGGCTGCTGGTTAACGGTATTGTTAGTCAGCGGAGTGGAGATGCAGTAACTGTTCGGAGATCCCGCTTGAAAAACTATCTGA
AGTTAATTGTGGCAGAAAACAATGCCGCGCTGCTCAAATTTGCAGCAAATTACAGTACCAAAGTGCTGCCAGCAACGCAGGAGTGGGAGGGTAAAACGGCGTAAGCAGTATGCCGGCTTTAAATGGATTAATTTCAGCTGTGATAGGCCTTGGCAAGGTGGCATGTCTCACTTCTCAAGTTGCAAGGACGATCAACCTGG
CACTACTGGAAGAAGAATGGATCTGATTGATGGGACTCTGATTTCAGGACATTCCAGGAGAGGCCGTGATAATTTCCAGATTGAGAATTCACTGTCTACAGATACAGAACATGAAACAAAATTTTTGAAAAGATTACAGAGGCCTATTACTGAGTTAGAATCATTAGCTCAGAGTACAATTTCTGATTCCACAGAAAATG
GTGGATGGGTGGATCCTTTGCGAGACCTATCTGATTTTGATGAAGGCTTTGAGGAGAAAAACTGTAATCTCCAGATGGATTTTAAAGAGGCTTTGAAAGAGGCTTTAATTAAAAGAAGTTGTCTAAATCATCATCAGCATTGGGATAGTAGATATCTAAATTGTGTTCCATCTCAGCTAAATCCATCTGCTGgtgttaat
caaattttcaatgaaagagacaaaattttgtgcttcatttttcatttgacatttacgagacagATGAGGGAGCATGGAAAGCATCTAGTTCAAGCAGAGAAAAAGGTGATGAAACTCAACAACGCAGGGGTAAAAGAAAGCGTAAACCAAAAGTTCATTTTGATGAGGAGGTGCCATTTTCCATCAGGTCTCTAAGGAGG
ATGCGTCGATTGAGAATCATGCGCCATCTCGGTCTTGTTGCACCACCTGGTTCTCCTTTCATTCTTAATCCTTCTGTAAGAACTACTGCTTAAATACATGGTAGATTTTTCTGTTTTTTATTTTAGGCATGATATTTGTAGTTTGGTCCTATGCATACCTTTTTTTGTGATAAAGACATGTAAATGCATAAACAAGTACT
CAATGAAGGTGAGAAAGGAATCTCATAAAATATTCATGTAACTTTTTTTTTTGATATCAAATAAAATATCATATTCGGGGTTTCGCTAGAAGTCTTATGATTTATCACAGGTAATGGTTTTTCCAGATACCTTTAGCTGTGGCATTTCCGTTCTGTCTGTTTAACTCTTATAAGGATGCGCAGAGACCAATATGCTGTTA
TTTCTATAAACAACTTTCCTCTGGTTTTAGAGGAGTCAACTTTCTTG

Intron 4 GTGGCATGGA ... ATGTCAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	30.64	140	57.1	61.9
A2	26.89	128	51.6	47.1
A3	18.18	135	57.6	30.1
A4	22.35	112	39.9	32.3
A5	34.01	61	37.4	31.7
A6	27.13	427	161.4	159.2
A7	26.55	488	161	176.5
A8	26.52	397	117.9	143.4
A9	28.86	432	152.2	175.4
A10	24.29	422	149.4	135.6

>TRINITY_DN114105_c0_g2_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

CCACAAGGATGCCCTGCCAGCAACTGGTGGGACGAGGAATTGAGCTTGTATTTTGGCCGATTTAATGTATAAATGGCACCATTTTATGCATTATATGTTTCCATTTTCTGCATATTCATGGCTGCTGGTTAACGGTATTGTTAGTCAGCGGAGTGGAGATGCAGTAACTGTTCGGAGATCCCGCTTGAAAAACTATCTGA
AGAATCCTGTTGTATGGTTTCAGTAATAGTTTCATTGCATGCATAGTTAATTGTGGCAGAAAACAATGCCGCGCTGCTCAAATTTGCAGCAAATTACAGTACCAAAGTGCTGCCAGCAACGCAGGAGTGGGAGGGTAAAACGGCGTAAGCAGTATGCCGGCTTTAAATGGATTAATTTCAGCTGTGATAGGCCTTGGCAA
GGTGGCATGTCTCACTTCTCAAGTTGCAAGGACGATCAACCTGGCACTACTGGAAGAAGAATGGATCTGATTGATGGGACTCTGATTTCAGGACATTCCAGGAGAGGCCGTGATAATTTCCAGATTGAGAATTCACTGTCTACAGATACAGAACATGAAACAAAATTTTTGAAAAGATTACAGAGGCCTATTACTGAGTT
AGAATCATTAGCTCAGAGTACAATTTCTGATTCCACAGAAAATGGTGGATGGGTGGATCCTTTGCGAGACCTATCTGATTTTGATGAAGGCTTTGAGGAGAAAAACTGTAATCTCCAGATGGATTTTAAAGAGGCTTTGAAAGAGGCTTTAATTAAAAGAAGTTGTCTAAATCATCATCAGCATTGGGATAGTAGATATC
TAAATTGTGTTCCATCTCAGCTAAATCCATCTGCTGATGAGGGAGCATGGAAAGCATCTAGTTCAAGCAGAGAAAAAGGTGATGAAACTCAACAACGCAGGGGTAAAAGAAAGCGTAAACCAAAAGTTCATTTTGATGAGGAGGTGCCATTTTCCATCAGGTCTCTAAGGAGGATGCGTCGATTGAGAATCATGCGCCAT
CTCGGTCTTGTTGCACCACCTGGTTCTCCTTTCATTCTTAATCCTTCTGTAAGAACTACTGCTTAAATACATGGTAGATTTTTCTGTTTTTTATTTTAGGCATGATATTTGTAGTTTGGTCCTATGCATACCTTTTTTTGTGATAAAGACATGTAAATGCATAAACAAGTACTCAATGAAGGTGAGAAAGGAATCTCATA
AAATATTCATGTAACTTTTTTTTTTGATATCAAATAAAATATCATATTCGGGGTTTCGCTAGAAGTCTTATGATTTATCACAGGTAATGGTTTTTCCAGATACCTTTAGCTGTGGCATTTCCGTTCTGTCTGTTTAACTCTTATAAGGATGCGCAGAGACCAATATGCTGTTATTTCTATAAACAACTTTCCTCTGGTTT
TAGAGGAGTCAACTTTCTTG

>TRINITY_DN114105_c0_g2_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CCACAAGGATGCCCTGCCAGCAACTGGTGGGACGAGGAATTGAGCTTGTATTTTGGCCGATTTAATGTATAAATGGCACCATTTTATGCATTATATGTTTCCATTTTCTGCATATTCATGGCTGCTGGTTAACGGTATTGTTAGTCAGCGGAGTGGAGATGCAGTAACTGTTCGGAGATCCCGCTTGAAAAACTATCTGA
AGAATCCTGTTGTATGGTTTCAGTAATAGTTTCATTGCATGCATAGTTAATTGTGGCAGAAAACAATGCCGCGCTGCTCAAATTTGCAGCAAATTACAGTACCAAAGTGCTGCCAGCAACGCAGGAGTGGGAGGGTAAAACGGCGTAAGCAGTATGCCGGCTTTAAATGGATTAATTTCAGCTGTGATAGGCCTTGGCAA
GgtggcatggatttctaaatgttgatgtcaacagGTGGCATGTCTCACTTCTCAAGTTGCAAGGACGATCAACCTGGCACTACTGGAAGAAGAATGGATCTGATTGATGGGACTCTGATTTCAGGACATTCCAGGAGAGGCCGTGATAATTTCCAGATTGAGAATTCACTGTCTACAGATACAGAACATGAAACAAAATT
TTTGAAAAGATTACAGAGGCCTATTACTGAGTTAGAATCATTAGCTCAGAGTACAATTTCTGATTCCACAGAAAATGGGTTTGTACATGATCTTTTTCTAAGATGCTTGTCCTTCACTTTTCCATGTTTGGAAATG

Intron 5 GTAAGCTATA ... TCAAATTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	23.67	87.2	0	27
A2	9.18	69.3	3.5	7
A3	14	98.3	0.8	16
A4	12.8	34.1	4.3	5
A5	25.04	41.9	1.5	14
A6	17.75	496.3	7.3	107
A7	16	509.9	8.8	97
A8	19.56	596.7	11.3	145
A9	19.71	481.3	5.5	118
A10	17.04	331.3	5	68

>TRINITY_DN38939_c0_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoform

AGGATGCCCTGCCAGCAACTGGTGGGACGAGGAATTGAGCTTGTATTTTGGCCGATTTAATGTATAAATGGCACCATTTTATGCATTATATGTTTCCATTTTCTGCATATTCATGGCTGCTGGTTAACGGTATTGTTAGTCAGCGGAGTGGAGATGCAGTAACTGTTCGGAGATCCCGCTTGAAAAACTATCTGAAGTTA
ATTGTGGCAGAAAACAATGCCGCGCTGCTCAAATTTGCAGCAAATTACAGTACCAAAGTGCTGCCAGCAACGCAGGAGTGGGAGGGTAAAACGGCGTAAGCAGTATGCCGGCTTTAAATGGATTAATTTCAGCTGTGATAGGCCTTGGCAAGGTGGCATGTCTCACTTCTCAAGTTGCAAGGACGATCAACCTGGCACTA
CTGGAAGAAGAATGGATCTGATTGATGGGACTCTGATTTCAGGACATTCCAGGAGAGGCCGTGATAATTTCCAGATTGAGAATTCACTGTCTACAGATACAGAACATGAAACAAAATTTTTGAAAAGATTACAGAGGCCTATTACTGAGTTAGAATCATTAGCTCAGAGTACAATTTCTGATTCCACAGAAAATGGTGGA
TGGGTGGATCCTTTGCGAGACCTATCTGATTTTGATGAAGGCTTTGAGGAGAAAAACTGTAATCTCCAGATGGATTTTAAAGAGGCTTTGAAAGAGGCTTTAATTAAAAGAAGTTGTCTAAATCATCATCAGCATTGGGATAGTAGATATCTAAATTGTGTTCCATCTCAGCTAAATCCATCTGCTGATGAGGGAGCATG
GAAAGCATCTAGTTCAAGCAGAGAAAAAGGTGATGAAACTCAACAACGCAGGGGTAAAAGAAAGCGTAAACCAAAAGTTCATTTTGATGAGGAGGTGCCATTTTCCATCAGGTCTCTAAGGAGGATGCGTCGATTGAGAATCATGCGCCATCTCGGTCTTGTTGCACCACCTGGTTCTCCTTTCATTCTTAATCCTTCTG
TAAGAACTACTGCTTAAATACATGGTAGATTTTTCTGTTTTTTATTTTAGGCATGATATTTGTAGTTTGGTCCTATGCATACCTTTTTTTGTGATAAAGACATGTAAATGCATAAACAAGTACTCAATGAAGGTGAGAAAGGAATCTCATAAAATATTCATGTAACTTTTTTTTTTGATATCAAATAAAATATCATATTC
GGGGTTTCGCTAGAAGTCTTATGATTTATCACAGGTAATGGTTTTTCCAGATACCTTTAGCTGTGGCATTTCCGTTCTGTCTGTTTAACTCTTATAAGGATGCGCAGAGACCAATATGCTGTTATTTCTATAAACAACTTTCCTCTGGTTTTAGAGGAGTCAACTTTCTTGATTTGTGGGATAATTGCTTTTATTATTTC
TCAGATAAAATGGATCTGACAGGATCTGATAATTCTCACATTAGTACCATAACCCTGTTTTTGAATGTTTCGGTGTGAGCATAATGATGTTGATTTTTTATCGGTGTGCATACCTTACAGATTGTGACATCTTTCAAAACATTGGTTAGAACTGACAACTGTTTATAGGGATGCTCCTTTTTTATCAGATACACTCTCAA
GTAGAGGTGGTTCTATTATTTTCTATAGGAGTTACTTGGTTTATTATTTGTGTGATCTGAATGCACAACATTGGTAGTGAACTATAATTGAGCTGTATTATGAAGTCTTTTTTCCTTTTAACCGTAACTGGTTACTAATATCCAAGATTGTTCACTGACATGCCATCTTGTTAGTTCCCTATAGTATACCATTTTATTTA
ATTGATGTAGCATGGGTA

>TRINITY_DN38939_c0_g1_i9 from sample A6 / Example unspliced isoform:

ATGAGGGAGCATGGAAAGCATCTAGTTCAAGCAGAGAAAAAGGTGATGAAACTCAACAACGCAGGGGTAAAAGAAAGCGTAAACCAAAAGTTCATTTTGATgtaagctataaattttattttgtctcaagtaggtcttacataaaaatatgttattgctgcatgtttacttggttttatatggaatctttactttggaac
atgatgtctgattccttcttcctttcaaatttagGAGGAGGTGCCATTTTCCATCAGGTCTCTAAGGAGGATGCGTCGATTGAGAATCATGCGCCATCTCGGTCTTGTTGCACCACCTGGTTCTCCTTTCATTCTTAATCCTTCTGTAAGAACTACTGCTTAAATACATGGTAGATTTTTCTGTTTTTTATTTTAGGCAT
GATATTTGTAGTTTGGTCCTATGCATACCTTTTTTTGTGATAAAGACATGTAAATGCATAAACAAGTACTCAATGAAGGTGAGAAAGGAATCTCATAAAATATTCATGTAACTTTTTTTTTTGATATCAAATAAAATATCATATTCGGGGTTTCGCTAGAAGTCTTATGATTTATCACAGGTAATGGTTTTTCCAGATAC
CTTTAGCTGTGGCATTTCCGTTCTGTCTGTTTAACTCTTATAAGGATGCGCAGAGACCAATATGCTGTTATTTCTATAAACAACTTTCCTCTGGTTTTAGAGGAGTCAACTTTCTTGATTTGTGGGATAATTGCTTTTATTATTTCTCAGATAAAATGGATCTGACAGGATCTGATAATTCTCACATTAGTACCATAACC
CTGTTTTTGAATGTTTCGGTGTGAGCATAATGATGTTGATTTTTTATCGGTGTGCATACCTTACAGATTGTGACATCTTTCAAAACATTGGTTAGAACTGACAACTGTTTATAGGGATGCTCCTTTTTTATCAGATACACTCTCAAGTAGAGGTGGTTCTATTATTTTCTATAGGAGTTACTTGGTTTATTATTTGTGTG
ATCTGAATGCACAACATTGGTAGTGAACTATAATTGAGCTGTATTATGAAGTCTTTTTTCCTTTTAACCGTAACTGGTTACTAATATCCAAGATTGTTCACTGACATGCCATCTTGTTAGTTCCCTATAGTATACCATTTTATTTAATTGATGTAGCATGGGTA