sp|Q9SR02|MED14_ARATH ----> Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14


Intron 1 GTAAGTCACA ... CATCTTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A639.5916.82.211
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A935.56294.416
A1026.423912.314



>TRINITY_DN131600_c0_g4_i5 from sample A1 / Example spliced isoform
TCGGTAGTTAGTTCGTTGTAGTTGCAATTATTTAATTTTATATCGCTCGTTCTTGAGAGTCGCACTCGTTCCACTTCGTGCAGAATGCAATTGAATACAAAAGGAAGGAACCCGAGTTGACTCTGTTCACTTGTCGTTTATGTGCATCCCCATCTTCTCTCGCATTCAGCGGAGGACGGCGTTGCGAAAGCCAAATAACG
CGGTAAGATAAGCGGAGCTCGAATCCCACCCGGACCAACCTTGAAAGAAATGTCCTCTTGATCGGCTTTATTTCATCATCAGAAGAAGAAGACGGCGAGAGGCTTGTGGAGAGGTCGGAAAGGAAGGAAACAATGGCGGAGTTGGGGCAGCAGACGGTGCGGTTGTCAGAGCTAGTGAAGAGGGCGGCAGAGGAATCGTA
CGTCGCACTCGAAGAACTCATCAACAAGTCCCACGAGCAGTCTGATTCTGAGAAGAAAATCGGCATCCTCAAATATATTAACAAAACCAGACAGCGATTGCTTCGTCTACACGTTCTTACAAAGTGGTGCACGCAGATCCCCTTGGTTCAATACTGCCAGCAGCTTGAAGGGAGTTTGTCAAGTCATGACATGTGTTTTA
CTCAAGCTGCTGATTCTCTATTCTTTACACATGAGGGGCTACAGCAAGCACGTGCACCTGTTTATGATGTCCCATCTGCTCTTGATATTCTCCTCACGGGAACTTATCATCGTTTGCCTAAATGTATTGAAGATATGGGTATGCAAACAGTGCTTTCTGGAGAAGAGCGAGAGCTAGCCTTGCCAAAGCTGGACACACTG
TTACGATCACGATTGCTTGAAGTATCTCTTCCAAAAGAAATTTCTAATGTAACTATATCTGATGGTAGAGTGGTACTTCATGTTGAAGGGGAATTCAAAGTTCAGCTTACATTGGGCTATCGTGGGCATTTATCTCTGTGGAGAATACTGCATCTAGAATTGCTTGTAGGTGAGAGGAGCGGACCCCTGAAACTCACTGA
AATGCAAAGGTTTAGTGTTGGAGATGATCTGGAACGCAGAATGGCTGCAGTGGAAAATCCATTTGCAATATTATATTCTGTCTTGCATGAGTTCTGCATTGCATTAGTAATGGATACTGTGTTAAGACAGGTAAAGACTTTAAGACAAGGTAGGTGGAAAGATGCGATCCGCTTTGACCTTATATCTGACAGTAGCTCAG
GGCAAGGATCCAATATTGGTCATTCTCAGGTCCCTCCTGATGGGGATACTGATACGAGTGGGACGAAAACTCCAGGTATAAAAATAATGTACTGGCTTGATCCTATTAAAGGGATTGGAGGGACTGATTCAGGCTGCATACCTTTTCTCAAAATTGAACCAGGACATGACCAGCATATTACCTGTTCTCACAATGATAAT
ATATTTGTGATAGATCCCATGACTGGGAATGAAGCTGAGTTTGTGCTCGACCAAAGTTGTATAGATGTAGAGCGTTTATTGCTGAGGGCTATCTCTTTCAATATACATACTCGTCTTTTGGAAGTTCAGAGAGTGCTCAAGAGTAACAATCAGCTTTGCCAGGCTGAGGATGATATTATTTTGAAGCATCATGAAAATGA
TTCTGATACAGCATTGAATAAGATATTAGACCGTTCTCAAGAAAGCACTAAAGCTGATGTTGGGGAACTTGGCGAAGAAGTATTATGTGTTCGAGCCTATGGACTGTGTTATGTGGCTCTTGGAATCAACATCAGGAATGGACGTTTTCTTCTGCCTTCTTCTAGGAATCTGAATTTGTCATCTGCGATTACAGAATGTG
AGGAGGCACTGAATCAGGGCAGTCTGTCACCTACTGAAGTGTTCATCAGTCTCCGTAACAAGAGCATTTTGCAACTTTTTGCATCTATTGGAAGATTCTTGGGCCTAAAGGTGTATGAAAAGGGTCTTGCTACAGCCAAAATACCAAAGTCAATTATTCTGGGATCAGATTTGTTGCTCATGGGTTTTCCAAATTGTGGT
GACTCTTACTTCTTACTAACACAACTAGATGTGGATTTCAAGCCTCTTTTTACACTGCTGGAATCCCAGCAAGACTCGACTGGAAGGTCTGGTCTGCTCTGTGGTGCCCTCCAAATTTTTCGCTTCAGCAAAATAGATGTTGGAAGGATCCAAATGGTTGAAGACGAAGTGAATTTGAGTCTCTTAGACAATGAATGGTC
TCTCTTTTCTGCAAAAGAAACTGGAGGTTCAGGTATAATTTCAGAATCAGGGCCTAATTCTGATTCATGCACTGATGCTGTCATTCAAGGCCAAGAAGGATTACAGTCATCATTTTTGTCTGTGGTAGATGATATATTTGAATTTGACAAGCGAATTCCATTAACTCGGTATTTACCTAAGCAAAACAGTTCATTTTCAT
CAGCCGAACCTTCTCCATTAAGTCATCTATGTGCTGGGCAGGGTATTCAGCAAAGTGGAAAGTTTGGTCTGTCAATGTCTAGGTGGGATGGAACCTCACAGTTTTCCCCGACTAAAAATACTGGAAATGTTTCTGTTGGAGGCTCCTCTTTTAATAACAAGTTGATGCCTGAATTGAATCAGAAGAATGTACGGCAGACT
GGCTCAAGTCCCCTATCTGGTGGGCATAGCTATGGACTGAATATGACCAGCCCTGCAAGAAGTCCATCTTTTCAGAAATTGTTACCAGTTTCAAAGAATTATGCAGATCAAGAGCTCATTTCTTCAAGATCCCCGATGCACCTGGCAGACAGTGCAGGTTATCCTACCATAGATGAAGATCAGCTAAGAAAAGTAATTGA
TTCTCCTAAAGATGGACTTCCTATATATTCTGGTTATAGGCAACCCCGTGTTCCTTCTCTCCGAACTTCTCCAGCATCCAGGAGTCCTATCCCAAATTCAAGATCATCTCTTAAAAGTTCACCAACTGGTCAACCAGCAACTACACTCAGGAGTCCTATCCCAAATTCAAGATCATCTCTTAAAAGTTCACCAACTGGTC
AACCAGCAACTACACTCAGGAGTCCTGGAAGTGGCTTGTGTGTGATCTCCCCCGTGTGTCAAACATCAGACTCTGGAACTTCCCAAGGTACCATTTCTGTTGCAATGCCTAAACACGAAATGTGCAGTAGAAAGCGTTGCCTTTCAGATATTGTCCACTCAATTCCGTCGTTGCAACGAATAGCAGCTCCTGGAGAAAAT
CAAAAGAAAAGGAAGACTGTGTGTGAATCGGGAAGCCCTCAACCTATTAGTGCTCAGTTAAAGACTCAGAGCAATTTGGGGCGGTTTATAGGCCGTTCATATGGGAACATTCTTATGGAAGCTAATCATGGGAAGGCACCTTCAAGGATACATGTTTCCGTTCTTCTTCAAGTGGTTAGGCATTGTTCTCTGTGTATTAA
GCATGCCCGTCTTACAAGCCAAATGGAAGCTCTTGGCATTCCATATGTTGAAGATGTGGGTTTCCGAAAGCCATCCGCAAACTTGTGGTTTCGACTACCTTCCTCTAGAGAAGATGCATGGCAACATATTTGCTTATGTCTTGGTAAACCTGGCAGCACTTACTGGGATGTCAAAGTAAATGATGAGCATTTCAGGGATT
TGTGGGAACTTCAAAAAAGTAAAACTGGGGCCCCATGGGGTTCTTGTGTGCGTATTGCTAATACTTCAGATGTGGATTCTCATATTCGTTATGGCCCTGAAGGTGTAGTCTTGAGTTATAGGACTGTGGAGGAAGACAGTATTGAGAAATTGGTGGCAGATCTACAAAGGCTATCAAATGCGCACTCTTTTGCCATGGGC
ATGAGAAAATTGCTCGAAATGAAACCAGATGAGAGAATAGACACAGGAAAGGTGAAATGCAACATTAAAATACAGAGTTCAGTGAAAATGGGTGTTGGTGAAGGAGGGGATAGGATGCGAGACCAAATGAGGAAAACATTTAGGATAGAAGCCGTAGGACTTATGAGTTTATGGTTCAGTTATTTTGGGTCGATGCCAGG
AATCATTGCACGTTTTGTTGTTGAATGGGAGCCGGGCAAAGAAGGTTGCACAATGCATGTTTCTCCTGATCAGTTATGGCCCCACACAAAGTTTCTGGAGGATTTTATCAATGGAGGTCAAGTTGAATCACTTCTTGATTGCATTCGGTTGACTGCTGGACCATTACATGCTCTTGGTGGTGCTATCCGGCCTGCAAGAA
TGGTTGGTACTGCTTCAACAAACATTGCTTTAGTACCGTCAGGATTTTCAACAGCTGCGAAGACAAATGTATTGATGGTGTCTCAAGGATTGGCTCAAAGCACAGCATCTTCATCTGTTCCTCAAGTGACAGGGGGGATATCTGGGGGACCACCCACAGGTGGGGCTAGTGGAAATCTGAACACACAGAATGGATCTGTT
GTATCAAGTGCAGGTAGAGGAGGGCCAGGGATAGTGCCGAGCTCCCTGTTGCCTACTGATGTTTCAGTTGTATTGCGAAGTCCCTATTGGATTCGTATAATTTATCGCAAGAATTTTGCAGTTGATATGCGCTGCTTTGCTGGTGACCAAGTGTGGCTGCAGCCTGCCACACCACCCAAGGGTGGTCCTACCATAGGGGG
TTCAATGCCGTGTCCACAATTTCGGCCATTTATCATGGAGCATGTCGCCTTGGGATTAAATACTATGGAAACTTCTCTTAATCCATATTCAGGGGGCCCAGCAACCTCAAATAATACAAATACAAACATTGGGCAGTCTCCTGCTGGCAGTGGAAATCGAGTTGGCACTAGTTCTCCTGGAGTTTCTCGAGCAACAACGT
TACCTGGAAATCAGAGCACTATTTTAAATAGAGTGACTAATGTAAGCAATGTATTGGGAGCGCACAATGTGGTGGCACTTAATTCAGGAATGCCTTTGGCTGGGCGTCCTATGGCTCCAGGAACTGGTGTGCCAGTGCATGTCAGAGGAGAGCTGAACACTACATTTATTGGACTTGGAGACGATGGTGGCTATGGAGGT
GGGTGGGTCCCTCTTGCTGCTCTTAAGAAAGTCTTACGTGGAATTCTGAAGTATCTTGGAGTTCTATGGTTATTTTCCCAGTTACCAGAACTTTTAACAGTCATTCTGCGCTCGATTTTGAAAGAGAATGAAGGATCGCTTCTTAACTTGGACAATGAGCAACCGGCCTTGCGTTTCTTTGTTGGGGGCTATGTCTTTGC
TGTAAGTGTGCATCGTGTGCAACTTCTTTTACAAGTTTTGAGTGTAAAGCGCTTTCACCAGCAACAGCAACAGCAGCAGCAACAGCAACAACAAAACCAAACAAATATCCAAGATGAACTTAGCTCTCATGAAATTGGTGAAATATGTGACTTTTTTAGCAGGCGAGTTGCATCTGAACCGTATGATGCATCTAGAGTTG
CATCCTTTATCACTCTGCTAACACTGCCAATATCAGTTCTTCGGGAATTTTTGAAGTTAATTGCATGGAAGAAGGGGACAGCACAAGGGCAATGTGCTGAGACAGCTCCCTCACAAAGACCCCGTGTTGAATTATGTTTAGAAAGCCACATGGGATCAAATGCAGATGGATTAGTCCCTCTAGACAATGCAGGTCAGTGT
GTTTCAGACAAAGCAACCAGTACTGTGGCAAAGAGCAACATTCATTATGATCGTCCACATAAAGCAGTGGATTTTGGGCTTACTGTCGTCCTTGATCCTGCTTCTATACCTCATGTAAATGCTGCTGGTGGTGCAGCTTGGTTGCCTCATTGTGTTTCGGTAAGATTGAAATACGCTTTTGGTGAAAATCCTCATATGTC
TCTCCTAAGCATGGAAGGCAGTCATGGTGGACGTGCCTGCTGGCCTCGTACTGAGGATTGGGGGCCTCGTACTGAGGATTGGGAGCGCTGTAAACAGAGAGTAGCTAAAGCAGTGGAGAGTGCTGGAAGTTCAGTGGACATTAGTCAAGGAAGACTACGAGTTGTGGCTGAAAAATTACAACATTCCTTGCAAGCTTCTT
TGCTTCTGCTCCGAAAGGGTGCAACTGGCAATGCTCCCTCTGTTGGTGGCTTCACCGTTTGATTTTTTATCAGTGTACTATATCCCTGTTCGTGGCTTCTTGATCTTCAGAATGCACCATTTGGCTAGCTGTGGAATCTACTACTGTCAGAAAGCTTGACAAAAGGATGGAAAATTGGATAGGATTTTCTCTGGCAGAAT
ACATACCATTAGCCTGCCAATATTGTTACATAATCGATTGTAACTTTTTGTTACATGTAATCTATCTTATTTATGGCATGGTCTCATTTTTTAGACACAACTTTGTCTAATAGCAATTGCATTCTTTTACCCAGAAGTGTCAACAATGTGAGTTTTCCTGCCACCTTGTTCCTGTACAGCAAAATGATTGCAGATTGGAC
TGTAGTTTAATTTCGTGTAGATTGGACTTGGTGATCCTTCATCTCTCCTGTGTGAATTATACTAGGTTAAGAAATTTTGTAAAGATATCATTTTGTGCTACAAGTTGAGTATTCTTTGCAATGCGTCAAAGTTTTACCATTCCTTGCATCTTCATAAACTTCACTAGATGAATGGCATGCTAAGCAAATTCAGTAACAAG
TAATACACATA


>TRINITY_DN131600_c0_g4_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GATCATCTCTTAAAAGTTCACCAACTGGTCAACCAGCAACTACACTCAGGAGTCCTATCCCAAATTCAAGATCATCTCTTAAAAGTTCACCAACTGGTCAACCAGCAACTACACTCAGGAGTCCTGGAAGTGGCTTGTGTGTGATCTCCCCCGTGTgtaagtcacaatatatagttcactatggttgtgttagtgaaggt
ggtaacatgctgggttggatgattacatgtatttatacattctgcttagataaagtgcatcctctaattgatctggtattcatctttcagGTCAAACATCAGACTCTGGAACTTCCCAAGGTACCATTTCTGTTGCAATGCCTAAACACGAAATGTGCAGTAGAAAGCGTTGCCTTTCAGATATTGTCCACTCAATTCCG
TCGTTGCAACGAATAGCAGCTCCTGGAGAAAATCAAAAGAAAAGGAAGACTGTGTGTGAATCGGGAAGCCCTCAACCTATTAGTGCTCAGTTAAAGACTCAGAGCAATTTGGGGCGGTTTATAGGCCGTTCATATGGGAACATTCTTATGGAAGCTAATCATGGGAAGGCACCTTCAAGGATACATGTTTCCGTTCTTCT
TCAAGTGGTTAGGCATTGTTCTCTGTGTATTAAGCATGCCCGTCTTACAAGCCAAATGGAAGCTCTTGGCATTCCATATGTTGAAGATGTGGGTTTCCGAAAGCCATCCGCAAACTTGTGGTTTCGACTACCTTCCTCTAGAGAAGATGCATGGCAACATATTTGCTTATGTCTTGGTAAACCTGGCAGCACTTACTGGG
ATGTCAAAGTAAATGATGAGCATTTCAGGGATTTGTGGGAACTTCAAAAAAGTAAAACTGGGGCCCCATGGGGTTCTTGTGTGCGTATTGCTAATACTTCAGATGTGGATTCTCATATTCGTTATGGCCCTGAAGGTGTAGTCTTGAGTTATAGGACTGTGGAGGAAGACAGTATTGAGAAATTGGTGGCAGATCTACAA
AGGCTATCAAATGCGCACTCTTTTGCCATGGGCATGAGAAAATTGCTCGAAATGAAACCAGATGAGAGAATAGACACAGGAAAGGTGAAATGCAACATTAAAATACAGAGTTCAGTGAAAATGGGTGTTGGTGAAGGAGGGGATAGGATGCGAGACCAAATGAGGAAAACATTTAGGATAGAAGCCGTAGGACTTATGAG
TTTATGGTTCAGTTATTTTGGGTCGATGCCAGGAATCATTGCACGTTTTGTTGTTGAATGGGAGCCGGGCAAAGAAGGTTGCACAATGCATGTTTCTCCTGATCAGTTATGGCCCCACACAAAGTTTCTGGAGGATTTTATCAATGGAGGTCAAGTTGAATCACTTCTTGATTGCATTCGGTTGACTGCTGGACCATTAC
ATGCTCTTGGTGGTGCTATCCGGCCTGCAAGAATGGTTGGTACTGCTTCAACAAACATTGCTTTAGTACCGTCAGGATTTTCAACAGCTGCGAAGACAAATGTATTGATGGTGTCTCAAGGATTGGCTCAAAGCACAGCATCTTCATCTGTTCCTCAAGTGACAGGGGGGATATCTGGGGGACCACCCACAGGTGGGGCT
AGTGGAAATCTGAACACACAGAATGGATCTGTTGTATCAAGTGCAGGTAGAGGAGGGCCAGGGATAGTGCCGAGCTCCCTGTTGCCTACTGATGTTTCAGTTGTATTGCGAAGTCCCTATTGGATTCGTATAATTTATCGCAAGAATTTTGCAGTTGATATGCGCTGCTTTGCTGGTGACCAAGTGTGGCTGCAGCCTGC
CACACCACCCAAGGGTGGTCCTACCATAGGGGGTTCAATGCCGTGTCCACAATTTCGGCCATTTATCATGGAGCATGTCGCCTTGGGATTAAATACTATGGAAACTTCTCTTAATCCATATTCAGGGGGCCCAGCAACCTCAAATAATACAAATACAAACATTGGGCAGTCTCCTGCTGGCAGTGGAAATCGAGTTGGCA
CTAGTTCTCCTGGAGTTTCTCGAGCAACAACGTTACCTGGAAATCAGAGCACTATTTTAAATAGAGTGACTAATGTAAGCAATGTATTGGGAGCGCACAATGTGGTGGCACTTAATTCAGGAATGCCTTTGGCTGGGCGTCCTATGGCTCCAGGAACTGGTGTGCCAGTGCATGTCAGAGGAGAGCTGAACACTACATTT
ATTGGACTTGGAGACGATGGTGGCTATGGAGGTGGGTGGGTCCCTCTTGCTGCTCTTAAGAAAGTCTTACGTGGAATTCTGAAGTATCTTGGAGTTCTATGGTTATTTTCCCAGTTACCAGAACTTTTAACAGTCATTCTGCGCTCGATTTTGAAAGAGAATGAAGGATCGCTTCTTAACTTGGACAATGAGCAACCGGC
CTTGCGTTTCTTTGTTGGGGGCTATGTCTTTGCTGTAAGTGTGCATCGTGTGCAACTTCTTTTACAAGTTTTGAGTGTAAAGCGCTTTCACCAGCAACAGCAACAGCAGCAGCAACAGCAACAACAAAACCAAACAAATATCCAAGATGAACTTAGCTCTCATGAAATTGGTGAAATATGTGACTTTTTTAGCAGGCGAG
TTGCATCTGAACCGTATGATGCATCTAGAGTTGCATCCTTTATCACTCTGCTAACACTGCCAATATCAGTTCTTCGGGAATTTTTGAAGTTAATTGCATGGAAGAAGGGGACAGCACAAGGGCAATGTGCTGAGACAGCTCCCTCACAAAGACCCCGTGTTGAATTATGTTTAGAAAGCCACATGGGATCAAATGCAGAT
GGATTAGTCCCTCTAGACAATGCAGGTCAGTGTGTTTCAGACAAAGCAACCAGTACTGTGGCAAAGAGCAACATTCATTATGATCGTCCACATAAAGCAGTGGATTTTGGGCTTACTGTCGTCCTTGATCCTGCTTCTATACCTCATGTAAATGCTGCTGGTGGTGCAGCTTGGTTGCCTCATTGTGTTTCGGTAAGATT
GAAATACGCTTTTGGTGAAAATCCTCATATGTCTCTCCTAAGCATGGAAGGCAGTCATGGTGGACGTGCCTGCTGGCCTCGTACTGAGGATTGGGGGCCTCGTACTGAGGATTGGGAGCGCTGTAAACAGAGAGTAGCTAAAGCAGTGGAGAGTGCTGGAAGTTCAGTGGACATTAGTCAAGGAAGACTACGAGTTGTGG
CTGAAAAATTACAACATTCCTTGCAAGCTTCTTTGCTTCTGCTCCGAAAGGGTGCAACTGGCAATGCTCCCTCTGTTGGTGGCTTCACCGTTTGATTTTTTATCAGTGTACTATATCCCTGTTCGTGGCTTCTTGATCTTCAGAATGCACCATTTGGCTAGCTGTGGAATCTACTACTGTCAGAAAGCTTGACAAAAGGA
TGGAAAATTGGATAGGATTTTCTCTGGCAGAATACATACCATTAGCCTGCCAATATTGTTACATAATCGATTGTAACTTTTTGTTACATGTAATCTATCTTATTTATGGCATGGTCTCATTTTTTAGACACAACTTTGTCTAATAGCAATTGCATTCTTTTACCCAGAAGTGTCAACAATGTGAGTTTTCCTGCCACCTT
GTTCCTGTACAGCAAAATGATTGCAGATTGGACTGTAGTTTAATTTCGTGTAGATTGGACTTGGTGATCCTTCATCTCTCCTGTGTGAATTATACTAGGTTAAGAAATTTTGTAAAGATATCATTTTGTGCTACAAGTTGAGTATTCTTTGCAATGCGTCAAAGTTTTACCATTCCTTGCATCTTCATAAACTTCACTAG
ATGAATGGCATGCTAAGCAAATTCAGTAACAAGTAATACACATA



Intron 2 GTAAATATTT ... TTCTCTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A119.8393231
A221.8593264
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A722.18214610
A821.03154419
A921.21182492
A1019.491573814



>TRINITY_DN43678_c1_g1_i4 from sample A9 / Example spliced isoform
AGTCGCACTCGTTCCACTTCGTGCAGAATGCAATTGAATACAAAAGGAAGGAACCCGAGTTGACTCTGTTCACTTGTCGTTTATGTGCATCCCCATCTTCTCTCGCATTCAGCGGAGGACGGCGTTGCGAAAGCCAAATAACGCGGTAAGATAAGCGGAGCTCGAATCCCACCCGGACCAACCTTGAAAGAAATGTCCTC
TTGATCGGCTTTATTTCATCATCAGAAGAAGAAGACGGCGAGAGGCTTGTGGAGAGGTCGGAAAGGAAGGAAACAATGGCGGAGTTGGGGCAGCAGACGGTGCGGTTGTCAGAGCTAGTGAAGAGGGCGGCAGAGGAATCGTACGTCGCACTCGAAGAACTCATCAACAAGTCCCACGAGCAGTCTGATTCTGAGAAGAA
AATCGGCATCCTCAAATATATTAACAAAACCAGACAGCGATTGCTTCGTCTACACGTTCTTACAAAGTGGTGCACGCAGATCCCCTTGGTTCAATACTGCCAGCAGCTTGAAGGGAGTTTGTCAAGTCATGACATGTGTTTTACTCAAGCTGCTGATTCTCTATTCTTTACACATGAGGGGCTACAGCAAGCACGTGCAC
CTGTTTATGATGTCCCATCTGCTCTTGATATTCTCCTCACGGGAACTTATCATCGTTTGCCTAAATGTATTGAAGATATGGGTATGCAAACAGTGCTTTCTGGAGAAGAGCGAGAGCTAGCCTTGCCAAAGCTGGACACACTGTTACGATCACGATTGCTTGAAGTATCTCTTCCAAAAGAAATTTCTAATGTAACTATA
TCTGATGGTAGAGTGGTACTTCATGTTGAAGGGGAATTCAAAGTTCAGCTTACATTGGGCTATCGTGGGCATTTATCTCTGTGGAGAATACTGCATCTAGAATTGCTTGTAGGTGAGAGGAGCGGACCCCTGAAACTCACTGAAATGCAAAGGTTTAGTGTTGGAGATGATCTGGAACGCAGAATGGCTGCAGTGGAAAA
TCCATTTGCAATATTATATTCTGTCTTGCATGAGTTCTGCATTGCATTAGTAATGGATACTGTGTTAAGACAGGTAAAGACTTTAAGACAAGGTAGGTGGAAAGATGCGATCCGCTTTGACCTTATATCTGACAGTAGCTCAGGGCAAGGATCCAATATTGGTCATTCTCAGGTCCCTCCTGATGGGGATACTGATACGA
GTGGGACGAAAACTCCAGGTATAAAAATAATGTACTGGCTTGATCCTATTAAAGGGATTGGAGGGACTGATTCAGGCTGCATACCTTTTCTCAAAATTGAACCAGGACAAGATCAGCATATTATCTGTTCTCATAATACCTTCGTGATAGACCCCATGACTGGGAATGAAGCTGAGTTTGTGCTCGACCAAAGTTGTATA
GATGTAGAGCGTTTATTGCTGAGGGCTATCTCTTTCAATATACATACTCGTCTTTTGGAAGTTCAGAGAGTGCTCAAGAGTAACAATCAGCTTTGCCAGGCTGAGGATGATATTATTTTGAAGCATCATGAAAATGATTCTGATACAGCATTGAATAAGATATTAGACCGTTCTCAAGAAAGCACTAAAGCTGATGTTGG
GGAACTTGGCGAAGAAGTATTATGTGTTCGAGCCTATGGACTGTGTTATGTGGCTCTTGGAATCAACATCAGGAATGGACGTTTTCTTCTGCCTTCTTCTAGGAATCTGAATTTGTCATCTGCGATTACAGAATGTGAGGAGGCACTGAATCAGGGCAGTCTGTCACCTACTGAAGTGTTCATCAGTCTCCGTAACAAGA
GCATTTTGCAACTTTTTGCATCTATTGGAAGATTCTTGGGCCTAAAGGTGTATGAAAAGGGTCTTGCTACAGCCAAAATACCAAAGTCAATTATTCTGGGATCAGATTTGTTGCTCATGGGTTTTCCAAATTGTGGTGACTCTTACTTCTTACTAACACAACTAGATGTGGATTTCAAGCCTCTTTTTACACTGCTGGAA
TCCCAGCAAGACTCGACTGGAAGGTCTGGTCTGCTCTGTGGTGCCCTCCAAATTTTTCGCTTCAGCAAAATAGATGTTGGAAGGATCCAAATGGTTGAAGACGAAGTGAATTTGAGTCTCTTAGACAATGAATGGTCTCTCTTTTCTGCAAAAGAAACTGGAGGTTCAGGTATAATTTCAGAATCAGGGCCTAATTCTGA
TTCATGCACTGATGCTGTCATTCAAGGCCAAGAAGGATTACAGTCATCATTTTTGTCTGTGGTAGATGATATATTTGAATTTGACAAGCGAATTCCATTAACTCGGTATTTACCTAAGCAAAACAGTTCATTTTCATCAGCCGAACCTTCTCCATTAAGTCATCTATGTGCTGGGCAGGGTATTCAGCAAAGTGGAAAGT
TTGGTCTGTCAATGTCTAGGTGGGATGGAACCTCACAGTTTTCCCCGACTAAAAATACTGGAAATGTTTCTGTTGGAGGCTCCTCTTTTAATAACAAGTTGATGCCTGAATTGAATCAGAAGAATGTACGGCAGACTGGCTCAAGTCCCCTATCTGGTGGGCATAGCTATGGACTGAATATGACCAGCCCTGCAAGAAGT
CCATCTTTTCAGAAATTGTTACCAGTTTCAAAGAATTATGCAGATCAAGAGCTCATTTCTTCAAGATCCCCGATGCACCTGGCAGACAGTGCAGGTTATCCTACCATAGATGAAGATCAGCTAAGAAAAGTAATTGATTCTCCTAAAGATGGACTTCCTATATATTCTGGTTATAGGCAACCCCGTGTTCCTTCTCTCCG
AACTTCTCCAGCATCCAGGAGTCCTATCCCAAATTCAAGATCATCTCTTAAAAGTTCACCAACTGGTCAACCAGCAACTACACTCAGGAGTCCTGGAAGTGGCTTGTGTGTGATCTCCCCCGTGTGTCAAACATCAGACTCTGGAACTTCCCAAGGTACCATTTCTGTTGCAATGCCTAAACACGAAATGTGCAGTAGAA
AGCGTTGCCTTTCAGATATTGTCCACTCAATTCCGTCGTTGCAACGAATAGCAGCTCCTGGAGAAAATCAAAAGAAAAGGAAGACTGTGTGTGAATCGGGAAGCCCTCAACCTATTAGTGCTCAGTTAAAGACTCAGAGCAATTTGGGGCGGTTTATAGGCCGTTCATATGGGAACATTCTTATGGAAGCTAATCATGGG
AAGGCACCTTCAAGGATACATGTTTCCGTTCTTCTTCAAGTGGTTAGGCATTGTTCTCTGTGTATTAAGCATGCCCGTCTTACAAGCCAAATGGAAGCTCTTGGCATTCCATATGTTGAAGATGTGGGTTTCCGAAAGCCATCCGCAAACTTGTGGTTTCGACTACCTTCCTCTAGAGAAGATGCATGGCAACATATTTG
CTTATGTCTTGGTAAACCTGGCAGCACTTACTGGGATGTCAAAGTAAATGATGAGCATTTCAGGGATTTGTGGGAACTTCAAAAAAGTAAAACTGGGGCCCCATGGGGTTCTTGTGTGCGTATTGCTAATACTTCAGATGTGGATTCTCATATTCGTTATGGCCCTGAAGGTGTAGTCTTGAGTTATAGGACTGTGGAGG
AAGACAGTATTGAGAAATTGGTGGCAGATCTACAAAGGCTATCAAATGCGCACTCTTTTGCCATGGGCATGAGAAAATTGCTCGAAATGAAACCAGATGAGAGAATAGACACAGGAAAGGTGAAATGCAACATTAAAATACAGAGTTCAGTGAAAATGGGTGTTGGTGAAGGAGGGGATAGGATGCGAGACCAAATGAGG
AAAACATTTAGGATAGAAGCCGTAGGACTTATGAGTTTATGGTTCAGTTATTTTGGGTCGATGCCAGGAATCATTGCACGTTTTGTTGTTGAATGGGAGCCGGGCAAAGAAGGTTGCACAATGCATGTTTCTCCTGATCAGTTATGGCCCCACACAAAGTTTCTGGAGGATTTTATCAATGGAGGTCAAGTTGAATCACT
TCTTGATTGCATTCGGTTGACTGCTGGACCATTACATGCTCTTGGTGGTGCTATCCGGCCTGCAAGAATGGTTGGTACTGCTTCAACAAACATTGCTTTAGTACCGTCAGGATTTTCAACAGCTGCGAAGACAAATGTATTGATGGTGTCTCAAGGATTGGCTCAAAGCACAGCATCTTCATCTGTTCCTCAAGTGACAG
GGGGGATATCTGGGGGACCACCCACAGGTGGGGCTAGTGGAAATCTGAACACACAGAATGGATCTGTTGTATCAAGTGCAGGTAGAGGAGGGCCAGGGATAGTGCCGAGCTCCCTGTTGCCTACTGATGTTTCAGTTGTATTGCGAAGTCCCTATTGGATTCGTATAATTTATCGCAAGAATTTTGCAGTTGATATGCGC
TGCTTTGCTGGTGACCAAGTGTGGCTGCAGCCTGCCACACCACCCAAGGGTGGTCCTACCATAGGGGGTTCAATGCCGTGTCCACAATTTCGGCCATTTATCATGGAGCATGTCGCCTTGGGATTAAATACTATGGAAACTTCTCTTAATCCATATTCAGGGGGCCCAGCAACCTCAAATAATACAAATACAAACATTGG
GCAGTCTCCTGCTGGCAGTGGAAATCGAGTTGGCACTAGTTCTCCTGGAGTTTCTCGAGCAACAACGTTACCTGGAAATCAGAGCACTATTTTAAATAGAGTGACTAATGTAAGCAATGTATTGGGAGCGCACAATGTGGTGGCACTTAATTCAGGAATGCCTTTGGCTGGGCGTCCTATGGCTCCAGGAACTGGTGTGC
CAGTGCATGTCAGAGGAGAGCTGAACACTACATTTATTGGACTTGGAGACGATGGTGGCTATGGAGGTGGGTGGGTCCCTCTTGCTGCTCTTAAGAAAGTCTTACGTGGAATTCTGAAGTATCTTGGAGTTCTATGGTTATTTTCCCAGTTACCAGAACTTTTAACAGTCATTCTGCGCTCGATTTTGAAAGAGAATGAA
GGATCGCTTCTTAACTTGGACAATGAGCAACCGGCCTTGCGTTTCTTTGTTGGGGGCTATGTCTTTGCTGTAAGTGTGCATCGTGTGCAACTTCTTTTACAAGTTTTGAGTGTAAAGCGCTTTCACCAGCAACAGCAACAGCAGCAGCAACAGCAACAAC


>TRINITY_DN43678_c1_g1_i6 from sample A9 / Example unspliced isoform:
AGTCGCACTCGTTCCACTTCGTGCAGAATGCAATTGAATACAAAAGGAAGGAACCCGAGTTGACTCTGTTCACTTGTCGTTTATGTGCATCCCCATCTTCTCTCGCATTCAGCGGAGGACGGCGTTGCGAAAGCCAAATAACGCGGTAAGATAAGCGGAGCTCGAATCCCACCCGGACCAACCTTGAAAGAAATGTCCTC
TTGATCGGCTTTATTTCATCATCAGAAGAAGAAGACGGCGAGAGGCTTGTGGAGAGGTCGGAAAGGAAGGAAACAATGGCGGAGTTGGGGCAGCAGACGGTGCGGTTGTCAGAGCTAGTGAAGAGGGCGGCAGAGGAATCGTACGTCGCACTCGAAGAACTCATCAACAAGTCCCACGAGCAGTCTGATTCTGAGAAGAA
AATCGGCATCCTCAAATATATTAACAAAACCAGACAGCGATTGCTTCGTCTACACGTTCTTACAAAGTGGTGCACGCAGATCCCCTTGGTTCAATACTGCCAGCAGCTTGAAGGGAGTTTGTCAAGTCATGACATGTGTTTTACTCAAGCTGCTGATTCTCTATTCTTTACACATGAGGGGCTACAGCAAGCACGTGCAC
CTGTTTATGATGTCCCATCTGCTCTTGATATTCTCCTCACGGGAACTTATCATCGTTTGCCTAAATGTATTGAAGATATGGGTATGCAAACAGTGCTTTCTGGAGAAGAGCGAGAGCTAGCCTTGCCAAAGCTGGACACACTGTTACGATCACGATTGCTTGAAGTATCTCTTCCAAAAGAAATTTCTAATGTAACTATA
TCTGATGGTAGAGTGGTACTTCATGTTGAAGGGGAATTCAAAGTTCAGCTTACATTGGGCTATCGTGGGCATTTATCTCTGTGGAGAATACTGCATCTAGAATTGCTTGTAGGTGAGAGGAGCGGACCCCTGAAACTCACTGAAATGCAAAGGTTTAGTGTTGGAGATGATCTGGAACGCAGAATGGCTGCAGTGGAAAA
TCCATTTGCAATATTATATTCTGTCTTGCATGAGTTCTGCATTGCATTAGTAATGGATACTGTGTTAAGACAGGTAAAGACTTTAAGACAAGGTAGGTGGAAAGATGCGATCCGCTTTGACCTTATATCTGACAGTAGCTCAGGGCAAGGATCCAATATTGGTCATTCTCAGGTCCCTCCTGATGGGGATACTGATACGA
GTGGGACGAAAACTCCAGGTATAAAAATAATGTACTGGCTTGATCCTATTAAAGGGATTGGAGGGACTGATTCAGGCTGCATACCTTTTCTCAAAATTGAACCAGGACAAGATCAGCATATTATCTGTTCTCATAATACCTTCGTGATAGACCCCATGACTGGGAATGAAGCTGAGTTTGTGCTCGACCAAAGTTGTATA
GATGTAGAGCGTTTATTGCTGAGGGCTATCTCTTTCAATATACATACTCGTCTTTTGGAAGTTCAGAGAGTGCTCAAGAGTAACAATCAGCTTTGCCAGGCTGAGGATGATATTATTTTGAAGCATCATGAAAATGATTCTGATACAGCATTGAATAAGATATTAGACCGTTCTCAAGAAAGCACTAAAGCTGATGTTGG
GGAACTTGGCGAAGAAGTATTATGTGTTCGAGCCTATGGACTGTGTTATGTGGCTCTTGGAATCAACATCAGGAATGGACGTTTTCTTCTGCCTTCTTCTAGGAATCTGAATTTGTCATCTGCGATTACAGAATGTGAGGAGGCACTGAATCAGGGCAGTCTGTCACCTACTGAAGTGTTCATCAGTCTCCGTAACAAGA
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