NA ----> NA
Intron 1 GTCGGTCCGA ... GCGTTTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 100 | 0 | 1 | 4 |
| A2 | 100 | 0 | 10 | 6 |
| A3 | 100 | 0 | 8 | 6 |
| A4 | 100 | 0 | 4 | 2 |
| A5 | 100 | 0 | 3 | 0 |
| A6 | 67.16 | 11 | 21 | 24 |
| A7 | 83.87 | 5 | 31 | 21 |
| A8 | 92.59 | 1 | 14 | 11 |
| A9 | 89.04 | 4 | 37 | 28 |
| A10 | 100 | 0 | 24 | 15 |
>TRINITY_DN44700_c1_g1_i11 from sample A6 / Example spliced isoformCTCGAATTCGACCAACTAATCAGAGTTTCTCCAAGAAGGGTTTCTCCAAGAAGGTCAATTCGATTGAATTCATTTAGCTCTGTTTATATTAGATAGTACTTCCAGAATCGATCTATTGTATCAGATCTTGAGCACCTTTCTGTTAAATTCTTTTAATTTTTGTTTTTCCATTCGTCTTGGGCGTTTCCAAAGTCTTTCCA
AGAAGATCGATTCGATTTCAATTCTTTTAGCTCTGTTTTATATTAGATAGAATTCCCGGATCGATCTATTATATCAGATCTGGAATACCTCTCTGAGATCGAATAAATATGATAATTGACCAAAAAAAAAAAGACTGCATTTCTAGTTTAAAACTGACAAACTTATATCAGGATCTAGACTGCTTTCTGTCACTCAAACT
CTGTGGTTCCATCCCGATTCTTTTTGGCAAATTTATTGATAAGTGTTGCAGATACAGTGATTGTATTTAAATGCCCCAGATTTCTATATCGATAGCGATTTTATTGATAAGTGTTTGCAGATCTTGTGTTTGTGTTTAAATGACCCAACATTTCAATTCGATAGCGATTTTATTGACAAGTGTTTGTAGATCTGGTGATT
GTGTTTAAATGTCCCAGCATTTCAATTCGATAGCGAATTCCCTATCATGTTTCGCTTAGTATAGACTTCTGCAACGGAAATGAAATTCTTATAGCCTGTATTATAAGCCATTGGATTATATTTGTTTGTGTATGCGTTCATTTCGAAATGGCCAGGGATGTGTAATAGACTTCGGCAACTCACAAAAAGGGCGTTGAGCT
GTACATGCAGTGAGTATGCAGGTGGATACCCTTTATGCTAAATTAAATACATTATAATCAAACAACTGTTAAGCTTTCGACCTTCTTTTTGATGTCGAACCATAGTTTGACGAGATGGAAGTCTTAGTCAGTTGCTGGGTTTCCTTGGCTCTATTAAAAAGGTATTGTATTAACTCTTGCTGGAACATGGTAGCTTAGAC
ACCCCATAAAAATGGCAAATGGAATTCCTAGGAGTGAAAAGGCACCATTCGTCAATTCACCATTCCATGGAATTGAAAAGAAACAATAGAATTAATGTAATGTTTATTTATGATAGAATACATTTCATAGAATTGAAACAATAGATTTGAAATATATTATTTGCCATTGAAAGTTGTTAATATTGAGTATTTTTATATTC
CACATAGAATAATAGGCCTTCCATACAAATATTTACCTGAGTTAAAAAGTGGATAACGTATGGTTTATATAATACATTCCATCTGG
>TRINITY_DN44700_c1_g1_i5 from sample A6 / Example unspliced isoform:CTAATGTTGGATGGTCATCATAATCTCGGATTATGTCATGATCCTTGGAGTTGGGATTAGCCGGAACGAGGATTGGGAGATCCTTTCGGAAGGCTATTGTGTGCGTTCTTACGACCCCATGAGCTCGGGGGCTCGAGGTGAAGAAAATTAACCTCGATATGATAGGGTGGTCAACCGAGAGGTTGTCGGTAACTTTGTCC
GCAGCTGGATCAGCCATTGCTACAACAACTTACCTCATCTCGAATTCGACCAACTAATCAGCTAATGTTGGATGGTCATCATAATCTCGGATTATGTTATGATTCTTGGAGTTGGGATTAGTCGGAACGGGGATTGGGAGATCATTTCGAGATGCTAGCTATACGTGTTCTTACGACCCCATTAGCTCGGGGGTTGTTCA
TTGCTTCCTTCTTTGTTAAATTCTTTCAGTATTCAGTATTCAGGATTAATAATGTATTTCTTTATGTATATATGAATCATTCTAGTTTCGTGAGAATACAGAACACAATTATGATTGAAGACTGATATAATTCTAGAAAATTAAATTCAGTCTTAGTATGAAAATAATTTGCAAAATCTAGGTTCGGCATACATGTGATA
TTTCTTGAAATTGGAATTTTTATAGATCTGAGACATAGGCTCATTACATACAGGGTTAGAGGCATAATAAATAAGAAAACTGATCAGAGATCTAATTTTATGTAAATTCGGTTGTATCCCACTTAGCCTTCTGAAAAGAATTGTTTCTTGAGGTTAAGTTTAATTATTTTTGCCATTCATCTTGGGCGTTTCCAGAGTTT
CTCCAAGAAGgtcggtccgattgaattcattcagctctgttctatattagatagtatttccagaatcaatctattgtatcagatcttgagcaccattctgctaaattcttttaaattttatttgtcattcgtcttgggcgtttccagGGTTTCTCCAAGAAGGTCAATTCGATTGAATTCATTTAGCTCTGTTTATATTA
GATAGTACTTCCAGAATCGATCTATTGTATCAGATCTTGAGCACCTTTCTGTTAAATTCTTTTAATTTTTGTTTTGCCATTCGTCTTGGGCGTTTCCAGAGTCTCTCCAAGAAGACGATTCTCTGTTAAATTCTTTTAATTTTTGTTTTTCCATTCGTCTTGGGCGTTTCCAGAGTCTCTCCAAGAAGACGATTCTCTGT
TAAATTCTTTTAATTTTTGTTTTGCCATTCGTCTTGGGCGTTTCTAGAGCCTCTCCAAGAAGATCGATTCTCTGTTAAATTCCTTTAATTTTTGTTTTGCCATTTGTCTTGGGCGTTTCCAGAGTCTCTCCAAGAAGATCGATTATCTGTTAAATTCCTTTAATTTTTGTTTTGCCATTTGTCTTGGGCGTTTCCAGAGT
CTCTCCAAGAAGATCGACGATTTCAATTCTTTTAGCTCTGTTTATCAATTTGGGCGTTTCCAGAGTTTCTCCAAGAGGGCCGATTTGATTGAACTCATTTAACTCTGTTTTATATTAGATAGAATTCCCGGAATCGATCTATTATATCAGATCTGGAATACCTCTCTGAGATCGAATAAATATGATAATTGACCAAAAAA
AAAAAGACTGCATTTCTAGTTTAAAACTGACAAACTTATATCAGGATCTAGACTGCTTTCTGTCACTCAAACTCTGTGGTTCCATCCCGATTCTTTTTGGCAAATTTATTGATAAGTGTTGCAGATACAGTGATTGTATTTAAATGCCCCAGATTTCTATATCGATAGCGATTTTATTGATAAGTGTTTGCAGATCTTGT
GTTTGTGTTTAAATGACCCAACATTTCAATTCGATAGCGATTTTATTGACAAGTGTTTGTAGATCTGGTGATTGTGTTTAAATGTCCCAGCATTTCAATTCGATAGCGAATTCCCTATCATGTTTCGCTTAGTATAGACTTCTGCAACGGAAATGAAATTCTTATAGCCTGTATTATAAGCCATTGGATTATATTTGTTT
GTGTATGCGTTCATTTCGAAATGGCCAGGGATGTGTAATAGACTTCGGCAACTCACAAAAAGGGCGTTGAGCTGTACATGCAGTGAGTATGCAGGTGGATACCCTTTATGCTAAATTAAATACATTATAATCAAACAACTGTTAAGCTTTCGACCTTCTTTTTGATGTCGAACCATAGTTTGACGAGATGGAAGTCTTAG
TCAGTTGCTGGGTTTCCTTGGCTCTATTAAAAAGGTATTGTATTAACTCTTGCTGGAACATGGTAGCTTAGACACCCCATAAAAATGGCAAATGGAATTCCTAGGAGTGAAAAGGCACCATTCGTCAATTCACCATTCCATGGAATTGAAAAGAAACAATAGAATTAATGTAATGTTTATTTATGATAGAATACATTTCA
TAGAATTGAAACAATAGATTTGAAATATATTATTTGCCATTGAAAGTTGTTAATATTGAGTATTTTTATATTCCACATAGAATAATAGGCCTTCCATACAAATATTTACCTGAGTTAAAAAGTGGATAACGTATGGTTTATATAATACATTCC
Intron 2 GTTCATTGCT ... GCGTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 75 | 2 | 1 | 6 |
| A2 | 50 | 3 | 0 | 3 |
| A3 | 80 | 1 | 1 | 4 |
| A4 | 91.67 | 1 | 0 | 11 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | 67.35 | 16 | 7 | 33 |
| A7 | 88.46 | 3 | 1 | 23 |
| A8 | 93.55 | 2 | 1 | 29 |
| A9 | 68.57 | 11 | 4 | 24 |
| A10 | 65.52 | 10 | 5 | 19 |
>TRINITY_DN44700_c1_g1_i9 from sample A6 / Example spliced isoformCTAATGTTGGATGGTCATCATAATCTCGGATTATGTCATGATCCTTGGAGTTGGGATTAGCCGGAACGAGGATTGGGAGATCCTTTCGGAAGGCTATTGTGTGCGTTCTTACGACCCCATGAGCTCGGGGGCTCGAGGTGAAGAAAATTAACCTCGATATGATAGGGTGGTCAACCGAGAGGTTGTCGGTAACTTTGTCC
GCAGCTGGATCAGCCATTGCTACAACAACTTACCTCATCTCGAATTCGACCAACTAATCAGCTAATGTTGGATGGTCATCATAATCTCGGATTATGTTATGATTCTTGGAGTTGGGATTAGTCGGAACGGGGATTGGGAGATCATTTCGAGATGCTAGCTATACGTGTTCTTACGACCCCATTAGCTCGGGGGTTATCTG
GCGATTGTGCTAAATTTCCCAACATTCCAAATCGATAGCAATTCCATTGATAGCGTTTGCAGATCTGGTGATTAAGTTTAAATTTTCCCTCAGCATTTTATATCAATAGCATTTCGAAACTGTGCAGTAGCGTTGTATATTTGCTTAGACTTCAAATCTGTGTGTAGACAGAAATGAAATTTTTATAATCTGTATTATAA
CCCAAGGGATGTCTCCCCTTTCTTCTCTGAGCATCGATCTCTTGTCGAACATCTCCAAAATTATAATGTAGATTCCCTTGCATCTATTTGATCGTTCATTGACATTGTTTCCAATTTTTGAAACGAATTTTGTCTGTACATTATTTGAAAATTTAATGACTATTACTATATTTCGAACTAGC
>TRINITY_DN44700_c1_g1_i7 from sample A6 / Example unspliced isoform:CTAATGTTGGATGGTCATCATAATCTCGGATTATGTCATGATCCTTGGAGTTGGGATTAGCCGGAACGAGGATTGGGAGATCCTTTCGGAAGGCTATTGTGTGCGTTCTTACGACCCCATGAGCTCGGGGGCTCGAGGTGAAGAAAATTAACCTCGATATGATAGGGTGGTCAACCGAGAGGTTGTCGGTAACTTTGTCC
GCAGCTGGATCAGCCATTGCTACAACAACTTACCTCATCTCGAATTCGACCAACTAATCAGCTAATGTTGGATGGTCATCATAATCTCGGATTATGTTATGATTCTTGGAGTTGGGATTAGTCGGAACGGGGATTGGGAGATCATTTCGAGATGCTAGCTATACGTGTTCTTACGACCCCATTAGCTCGGGGGTTgttca
ttgcttccttctttgttaaattctttcagtattcagtattcaggattaataatgtatttctttatgtatatatgaatcattctagtttcgtgagaatacagaacacaattatgattgaagactgatataattctagaaaattaaattcagtcttagtatgaaaataatttgcaaaatctaggttcggcatacatgtgata
tttcttgaaattggaatttttatagatctgagacataggctcattacatacagggttagaggcataataaataagaaaactgatcagagatctaattttatgtaaattcggttgtatcccacttagccttctgaaaagaattgtttcttgaggttaagtttaattatttttgccattcatcttgggcgtttccagagttt
ctccaagaaggtcggtccgattgaattcattcagctctgttctatattagatagtatttccagaatcaatctattgtatcagatcttgagcaccattctgctaaattcttttaaattttatttgtcattcgtcttgggcgtttccagggtttctccaagaaggtcaattcgattgaattcatttagctctgtttatatta
gatagtacttccagaatcgatctattgtatcagatcttgagcacctttctgttaaattcttttaatttttgttttgccattcgtcttgggcgtttccagagtctctccaagaagacgattctctgttaaattcttttaatttttgtttttccattcgtcttgggcgtttccagagtctctccaagaagacgattctctgt
taaattcttttaatttttgttttgccattcgtcttgggcgtttctagagcctctccaagaagatcgattctctgttaaattcctttaatttttgttttgccatttgtcttgggcgtttccagagtctctccaagaagatcgattatctgttaaattcctttaatttttgttttgccatttgtcttgggcgtttccagagt
ctctccaagaagatcgacgatttcaattcttttagctctgtttatcaatttgggcgtttccagagtttctccaagagggccgatttgattgaactcatttaactctgttttatattagatagaattcccggaatcgatctattatatcagatctggaatacctctctgagatcgaataaatatgataattgacctacaaa
aaaactctgcgtttctagtttaaaactgacaaagttatctcaggatctaacctgctttctgtcactcaaactctgtggttccattccgattctttttagcaaatttattgataagtgttgcagatctggtgattgtgtttaaatgtcccagcatttcaattcgatagcaaatttattgataagtgttgcagatctggtga
ctgtgtttaaatgccccagcattccaaatcgatagcgaattcagtgataagcgtttgcagatctagcgattgtgctaattttcccagcatctcaaatcgatagcaatttcatttgacaagtgtttgcaaatctgatgattgtttctaaatttcccagcatctcaaatcgttagcgatttcagtgataagcgtttgcagat
ctggcgattgtgctaatttttccagcatctcaaatcgatagcaatttcatttgacaagtgtttgcaaatgtgatgattgtttctaaatctcccagcatctcaaatcgataatgatttcagtgataagcgtttgcagATCTGGCGATTGTGCTAAATTTCCCAACATTCCAAATCGATAGCAATTCCATTGATAGCGTTTG
CAGATCTGGTGATTAAGTTTAAATTTTCCCTCAGCATTTTATATCAATAGCATTTCGAAACTGTGCAGTAGCGTTGTATATTTGCTTAGACTTCAAATCTGTGTGTAGACAGAAATGAAATTTTTATAATCTGTATTATAACCCAAGGGATGTCTCCCCTTTCTTCTCTGAGCATCGATCTCTTGTCGAACATCTCCAAA
ATTATAATGTAGATTCCCTTGCATCTATTTGATCGTTCATTGACATTGTTTCCAATTTTTGAAACGAATTTTGTCTGTACATTATTTGAAAATTTAATGACTATTACTATATTTCGAACTAGC
Intron 3 GTTCATTGCT ... AGTGTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 83.33 | 1 | 1 | 5 |
| A2 | 100 | 0 | 0 | 2 |
| A3 | 66.67 | 1 | 1 | 2 |
| A4 | 100 | 0 | 0 | 1 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | 53.85 | 12 | 7 | 14 |
| A7 | 86.67 | 2 | 1 | 13 |
| A8 | 60 | 4 | 1 | 6 |
| A9 | 58.33 | 10 | 4 | 14 |
| A10 | 66.67 | 5 | 5 | 10 |
>TRINITY_DN44700_c1_g1_i6 from sample A6 / Example spliced isoformCTAATGTTGGATGGTCATCATAATCTCGGATTATGTCATGATCCTTGGAGTTGGGATTAGCCGGAACGAGGATTGGGAGATCCTTTCGGAAGGCTATTGTGTGCGTTCTTACGACCCCATGAGCTCGGGGGCTCGAGGTGAAGAAAATTAACCTCGATATGATAGGGTGGTCAACCGAGAGGTTGTCGGTAACTTTGTCC
GCAGCTGGATCAGCCATTGCTACAACAACTTACCTCATCTCGAATTCGACCAACTAATCAGCTAATGTTGGATGGTCATCATAATCTCGGATTATGTTATGATTCTTGGAGTTGGGATTAGTCGGAACGGGGATTGGGAGATCATTTCGAGATGCTAGCTATACGTGTTCTTACGACCCCATTAGCTCGGGGGTTATCTG
GTGACTGTGTTTAAATGCCCCAGCATTCCAAATCGATAGCGAATTCAGTGATAAGCGTTTGCAGATCTAGCGATTGTGCTAATTTTCCCAGCATCTCAAATCGATAGCAATTTCATTTGACAAGTGTTTGCAAATCTGATGATTGTTTCTAAATTTCCCAGCATCTCAAATCGTTAGCGATTTCAGTGATAAGCGTTTGC
AGATCTGGCGATTGTGCTAATTTTTCCAGCATCTCAAATCGATAGCAATTTCATTTGACAAGTGTTTGCAAATGTGATGATTGTTTCTAAATCTCCCAGCATCTCAAATCGATAATGATTTCAGTGATAAGCGTTTGCAGATCTGGCGATTGTGCTAAATTTCCCAACATTCCAAATCGATAGCAATTCCATTGATAGCG
TTTGCAGATCTGGTGATTAAGTTTAAATTTTCCCTCAGCATTTTATATCAATAGCATTTCGAAACTGTGCAGTAGCGTTGTATATTTGCTTAGACTTCAAATCTGTGTGTAGACAGAAATGAAATTTTTATAATCTGTATTATAACCCAAGGGATGTCTCCCCTTTCTTCTCTGAGCATCGATCTCTTGTCGAACATCTC
CAAAATTATAATGTAGATTCCCTTGCATCTATTTGATCGTTCATTGACATTGTTTCCAATTTTTGAAACGAATTTTGTCTGTACATTATTTGAAAATTTAATGACTATTACTATATTTCGAACTAGC
>TRINITY_DN44700_c1_g1_i7 from sample A6 / Example unspliced isoform:CTAATGTTGGATGGTCATCATAATCTCGGATTATGTCATGATCCTTGGAGTTGGGATTAGCCGGAACGAGGATTGGGAGATCCTTTCGGAAGGCTATTGTGTGCGTTCTTACGACCCCATGAGCTCGGGGGCTCGAGGTGAAGAAAATTAACCTCGATATGATAGGGTGGTCAACCGAGAGGTTGTCGGTAACTTTGTCC
GCAGCTGGATCAGCCATTGCTACAACAACTTACCTCATCTCGAATTCGACCAACTAATCAGCTAATGTTGGATGGTCATCATAATCTCGGATTATGTTATGATTCTTGGAGTTGGGATTAGTCGGAACGGGGATTGGGAGATCATTTCGAGATGCTAGCTATACGTGTTCTTACGACCCCATTAGCTCGGGGGTTgttca
ttgcttccttctttgttaaattctttcagtattcagtattcaggattaataatgtatttctttatgtatatatgaatcattctagtttcgtgagaatacagaacacaattatgattgaagactgatataattctagaaaattaaattcagtcttagtatgaaaataatttgcaaaatctaggttcggcatacatgtgata
tttcttgaaattggaatttttatagatctgagacataggctcattacatacagggttagaggcataataaataagaaaactgatcagagatctaattttatgtaaattcggttgtatcccacttagccttctgaaaagaattgtttcttgaggttaagtttaattatttttgccattcatcttgggcgtttccagagttt
ctccaagaaggtcggtccgattgaattcattcagctctgttctatattagatagtatttccagaatcaatctattgtatcagatcttgagcaccattctgctaaattcttttaaattttatttgtcattcgtcttgggcgtttccagggtttctccaagaaggtcaattcgattgaattcatttagctctgtttatatta
gatagtacttccagaatcgatctattgtatcagatcttgagcacctttctgttaaattcttttaatttttgttttgccattcgtcttgggcgtttccagagtctctccaagaagacgattctctgttaaattcttttaatttttgtttttccattcgtcttgggcgtttccagagtctctccaagaagacgattctctgt
taaattcttttaatttttgttttgccattcgtcttgggcgtttctagagcctctccaagaagatcgattctctgttaaattcctttaatttttgttttgccatttgtcttgggcgtttccagagtctctccaagaagatcgattatctgttaaattcctttaatttttgttttgccatttgtcttgggcgtttccagagt
ctctccaagaagatcgacgatttcaattcttttagctctgtttatcaatttgggcgtttccagagtttctccaagagggccgatttgattgaactcatttaactctgttttatattagatagaattcccggaatcgatctattatatcagatctggaatacctctctgagatcgaataaatatgataattgacctacaaa
aaaactctgcgtttctagtttaaaactgacaaagttatctcaggatctaacctgctttctgtcactcaaactctgtggttccattccgattctttttagcaaatttattgataagtgttgcagatctggtgattgtgtttaaatgtcccagcatttcaattcgatagcaaatttattgataagtgttgcagATCTGGTGA
CTGTGTTTAAATGCCCCAGCATTCCAAATCGATAGCGAATTCAGTGATAAGCGTTTGCAGATCTAGCGATTGTGCTAATTTTCCCAGCATCTCAAATCGATAGCAATTTCATTTGACAAGTGTTTGCAAATCTGATGATTGTTTCTAAATTTCCCAGCATCTCAAATCGTTAGCGATTTCAGTGATAAGCGTTTGCAGAT
CTGGCGATTGTGCTAATTTTTCCAGCATCTCAAATCGATAGCAATTTCATTTGACAAGTGTTTGCAAATGTGATGATTGTTTCTAAATCTCCCAGCATCTCAAATCGATAATGATTTCAGTGATAAGCGTTTGCAGATCTGGCGATTGTGCTAAATTTCCCAACATTCCAAATCGATAGCAATTCCATTGATAGCGTTTG
CAGATCTGGTGATTAAGTTTAAATTTTCCCTCAGCATTTTATATCAATAGCATTTCGAAACTGTGCAGTAGCGTTGTATATTTGCTTAGACTTCAAATCTGTGTGTAGACAGAAATGAAATTTTTATAATCTGTATTATAACCCAAGGGATGTCTCCCCTTTCTTCTCTGAGCATCGATCTCTTGTCGAACATCTCCAAA
ATTATAATGTAGATTCCCTTGCATCTATTTGATCGTTCATTGACATTGTTTCCAATTTTTGAAACGAATTTTGTCTGTACATTATTTGAAAATTTAATGACTATTACTATATTTCGAACTAGC
Intron 4 GTTCATTGCT ... AGTGTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 52.94 | 4 | 4 | 5 |
| A2 | 21.74 | 9 | 3 | 2 |
| A3 | 25 | 6 | 2 | 2 |
| A4 | 45.45 | 3 | 4 | 1 |
| A5 | 33.33 | 2 | 2 | 0 |
| A6 | 25.77 | 36 | 11 | 14 |
| A7 | 35.42 | 31 | 21 | 13 |
| A8 | 25.27 | 34 | 17 | 6 |
| A9 | 21.74 | 36 | 6 | 14 |
| A10 | 35.38 | 21 | 13 | 10 |
>TRINITY_DN46952_c2_g2_i5 from sample A10 / Example spliced isoformCCTAATGTTGGATGGTCATCATAATCTCGGATTATGTCATGATCCTTGGAGTTGGGATTAGCCGGAACGAGGATTGGGAGATCCTTTCGGAAGGCTATTGTGTGCGTTCTTACGACCCCATGAGCTCGGGGGCTCGAGGTGAAGAAAATTAACCTCGATATGATAGGGTGGTCAACCGAGAGGTTGTCGGTAACTTTGTC
CGCAGCTGGATCAGCCATTGCTACAACAACTTACCTCATCTCGAATTCGACCAACTAATCAGATCTGGTGACTGTGTTTAAATGCCCCAGCATTCCAAATCGATAGCGAATTCAGTGATAAGCGTTTGCAGATCTAGCGATTGTGCTAATTTTCCCAGCATCTCAAATCGATAGCAATTTCATTTGACAAGTGTTTGCAA
ATCTGATGATTGTTTCTAAATTTCCCAGCATCTCAAATCGTTAGCGATTTCAGTGATAAGCGTTTGCAGATCTGGCGATTGTGCTAATTTTTCCAGCATCTCAAATCGATAGCAATTTCATTTGACAAGTGTTTGCAAATGTGATGATTGTTTCTAAATCTCCCAGCATCTCAAATCGATAATGATTTCAGTGATAAGCG
TTTGCAGATCTAGCGATTGTGCTAATTTTCCCAGCATCTCAAATCGATAGCAATTTCATTTGACAAGTGTTTGCAAAT
>TRINITY_DN46952_c2_g2_i3 from sample A10 / Example unspliced isoform:GCAGCTGGATCAACCATTGCTACAACAACTTACTTCATCTCGGATTCGACCAACTAATCAGgttcattgcttccttctttgttaaattctttcagtattcagtattcaggattaataatgtatttctttatgtatatatgaatcattctagtttcgtgagaatacagaacacaattatgattgaagactgatataattct
agaaaattaaattcagtcttagtatgaaaataatttgcaaaatctaggttcggcatacatgtgatatttcttgaaattggaatttttatagatctgagacataggctcattacatacagggttagaggcataataaataagaaaactgatcagagatctaattttatgtaaattcggttgtatcccacttagccttctga
aaagaattgtttcttgaggttaagtttaattatttttgccattcatcttgggcgtttccagagtttctccaagaaggtcggtccgattgaattcattcagctctgttctatattagatagtatttccagaatcaatctattgtatcagatcttgagcaccattctgctaaattcttttaaattttatttgtcattcgtct
tgggcgtttccagggtttctccaagaaggtcaattcgattgaattcatttagctctgtttatattagatagtacttccagaatcgatctattgtatcagatcttgagcacctttctgttaaattcttttaatttttgttttgccattcgtcttgggcgtttccagagtctctccaagaagatcgattcgatttcaattct
tttagctctgtttatcaatttgggcgtttccagagtttctccaagagggccgatttgattgaactcatttaactctgttttatattagatagaattcccggaatcgatctattatatcagatctggaatacctctctgagatcgaataaatatgataattgacctacaaaaaaactctgcgtttctagtttaaaactgac
aaagttatctcaggatctaacctgctttctgtcactcaaactctgtggttccattccgattctttttagcaaatttattgataagtgttgcagatctggtgattgtgtttaaatgtcccagcatttcaattcgatagcaaatttattgataagtgttgcagATCTGGTGACTGTGTTTAAATGCCCCAGCATTCCAAATC
GATAGCGAATTCAGTGATAAGCGTTTGCAGATCTAGCGATTGTGCTAATTTTCCCAGCATCTCAAATCGATAGCAATTTCATTTGACAAGTGTTTGCAAATCTGATGATTGTTTCTAAATTTCCCAGCATCTCAAATCGTTAGCGATTTCAGTGATAAGCGTTTGCAGATCTGGCGATTGTGCTAATTTTTCCAGCATCT
CAAATCGATAGCAATTTCATTTGACAAGTGTTTGCAAATGTGATGATTGTTTCTAAATCTCCCAGCATCTCAAATCGATAATGATTTCAGTGATAAGCGTTTGCAGATCTAGCGATTGTGCTAATTTTCCCAGCATCTCAAATCGATAGCAATTTCATTTGACAAGTGTTTGCAAAT